PCR
Amplifikasi DNA
Sequencing Clonning
Modifikasi Penggandaan DNA
amplifikasi DNA
COVID-19
• COVID-19 penyakit menular
infeksius yang disebabkan oleh SARS
CoV-2.
• SARS-CoV-2 family coronaviridae,
genus betacoronavirus, rantai
genom RNA positif dengan ukuran
26-32 kb.
• Genom SARS CoV-2 memiliki 6 ORF
daerah yang mengkode enzim
replikasi (ORF 1a dan 1b), gen E
(envelope protein), gen M (membran
protein), S gene (Spike protein) dan
gen N (nukleokapsid protein)
Status COVID-19 di Indonesia
Status COVID-19 di Makassar
Replikasi
Coronavirus
Mutasi
COVID-19
Real Time PCR
• Real time PCR atau sering disebut
quantitative polymerase chain
reaction (qPCR) metode biologi
molekuler berbasis reaksi rantai
polimerase.
• Mendeteksi amplifikasi gen target
selama proses PCR berlangsung, tidak
di akhir reaksi, seperti pada PCR
konvensional.
• qPCR menggunakan fluoresens
peningkatan sinyal fluoresens
terjadinya amplifikasi gen target
selama proses PCR.
Real Time
PCR COVID-
19
Tahapan PCR
PCR
Reverse
Ekstraksi transcription
Swab (RT) Run PCR Analisis
RNA
RNA cDNA
200ul digunakan untuk Manual atau Metode one-step Singleplex atau multiplex Analisis kurva amplifikasi
ekstraksi, sisanya disimpan di menggunakan alat atau two-step PCR dan Ct value
-80oC ekstraktor
Alur Pemeriksaan Swab Post-analisis
Interpretasi hasil PCR:
validinput hasil, invalid
ulang proses analisis
Input data hasil di sistem
Verifikasi hasil
Pengiriman hasil
Pre- analisis
2-3 jam
Pengecekan identitas
Pencatatan
Pengkodean
Penyimpanan Analisis
Alikuot sampel
2-3 jam Ekstraksi RNA
Pencampuran reaksi PCR
PCR
7-8 jam
Thank You for
Your Attention
-Uleng Bahrun-