BIOLOGI SELULER DAN

MOLEKULER
KODE MK : 04015061
JUMLAH SKS : 2 SKS
SEMESTER : III (TIGA)

Edisi Revisi 2020

 Dogma Sentral Biologi Molekuler 2:
TRANSKRIPSI
Tatap Muka ke-5

Disusun oleh: Tim Dosen Biologi Sel Molekuler

Perbedaan Proses Aliran
Materi Genetik Pada
Prokariotik dan
Eukariotik
PENDAHULUAN
 Transkripsi merupakan bagian dari rangkaian ekspresi genetik yang nantinya akan
muncul sebagai Fenotipe.
 Fenotipe : Suatu karakteristik (baik struktural, biokimiawi, fisiologis, dan perilaku)
yang dapat diamati dari suatu organisme yang diatur oleh genotipe dan lingkungan
serta interaksi keduanya.
 Proses transkripsi dan translasi dilakukan oleh organisme prokariotik dan
eukariotik. Proses ini juga mjd bagian dari : Sintesis protein
 Secara umum mekanisme Proses Sintesis Protein pada Eukariotik tdd :
1. Transkripsi (Inisiasi, Elongasi, Terminasi)
2. Splicing molekul mRNA Transkripsi
3. Tranportasi molekul mRNA keluar inti menuju ribosom
4. Translasi mRNA mjd polipeptida Translasi
5. Modifikasi polipeptida mjd molekul protein
www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID
 Defenisi Transkripsi :
 Proses sintesis RNA menggunakan template DNA/ DNA pencetak.
 Proses penyalinan kode-kode genetika (kodon) yang ada pada sekuens
DNA menjadi molekul RNA.
 Penyalinan DNA tidak hanya menghasilkan mRNA saja, tetapi juga rRNA dan
tRNA.
 Molekul RNA disintesis oleh : Enzim polimerase RNA (disingkat : RNA pol)
 Pada Prokariotik  1 jenis RNA pol mensintesis/membentuk beberapa jenis
RNA. Pada Eukariotik  1 jenis RNA pol mensintesis 1 jenis RNA.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Transkripsi prokariotik dan eukariotik memiliki perbedaan komponen yang
terlibat, terutama karena enzim RNA polimerase (RNA pol).
 Perbedaan utama :
 Bahwa transkripsi prokariotik dilakukan oleh satu jenis RNA polimerase.
 Sebaliknya, transkripsi eukariotik dikatalisis oleh tiga jenis RNA
polimerase yang berbeda yang disebut sebagai RNA polimerase I
(transkripsi rRNA), RNA polimerase II (transkripsi mRNA) dan RNA
polimerase III (transkripsi tRNA).

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID
 Salah satu polinukleotida/untai DNA berfungsi sebagai pencetak atau sense, yang lain
sebagai gen atau antisense (Lihat pada gambar di slide sebelumnya).
 Misal : DNA pencetak memiliki urutan basa G-A-G-A-C-T, dan yang berfungsi sebagai
gen memiliki urutan basa komplemen C-T-C-T-G-A. Karena pencetaknya (DNA) 
 G-A-G-A-C-T, maka : Hasil cetakannya (RNA) : C-U-C-U-G-A. (pada RNA, Basa T tidak
ada, penggantinya adalah U, maka yang biasanya Basa A berpasangan dengan T, di RNA basa A akan
berpasangan dengan U). (Ingat kembali materi DNA & RNA)
 Contoh lain pada gambar berikut :

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

TIGA PROSES TAHAPAN TRANSKRIPSI

1. Inisiasi (Pemrakarsa/Permulaan)
2. Elongasi (Pemanjangan)
3. Terminasi
(Penghentian/Pengakhiran)

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 3 Tahap Transkripsi
1.
10
INISIASI
RNA Polimerase melekat
pada Promotor DNA, pita
ganda terpisah dan sintesis
mRNA dimulai

2. ELONGASI
mRNA memanjang sejalan
dengan enzim RNA
Polimerase yang bergerak
sepanjang pita DNA

3. TERMINASI
mRNA dilepaskan dan
enzim RNA Polimerase
lepas dari pita DNA template
www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID
Inisiasi – Promotor – Unit Transkripsi
 Inisiasi adalah tahapan awal transkripsi DNA. Proses ini terjadi saat RNA pol berikatan ke
bagian promotor dari gen. Ini merupakan sinyal bagi DNA untuk dibuka sehingga enzim bisa
membaca basa-basa pada DNA dan membuat molekul RNA dari DNA
sense/cetakan/template.
 Titik temu/pelekatan antara RNA pol dgn DNA (Titik Mulai Transkripsi) disebut dgn istilah:
Promotor. Promotor adalah bagian DNA berupa sekuens atau susunan nukleotida unik yang
menandai titik dimulainya transkripsi DNA. Fungsi promotor selain menentukan di mana
transkripsi dimulai, juga menentukan yang mana dari kedua untai ganda DNA yang
digunakan sebagai cetakan/template.
 Tidak seperti pada replikasi, transkripsi hanya terjadi pada segmen DNA yang mengandung
kelompok gen tertentu saja. Oleh karena itu, nukleotida-nukleotida pada rantai DNA template
yang akan ditranskripsi menjadi molekul RNA dikenal/disebut sebagai : Unit transkripsi.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Perbedaan antara Promotor Eukariotik dan Prokariotik

Promotor Prokariotik

Promotor terdiri dari dua urutan pendek pada posisi -10 dan -35 di hulu dari lokasi awal
transkripsi. Urutan di -10 disebut kotak Pribnow, atau elemen -10, dan biasanya terdiri dari
enam nukleotida TATAAT. Kotak Pribnow sangat penting untuk memulai transkripsi pada
prokariota. Urutan lain di - 35 (yang -35 elemen) terdiri dari TTGACA. 

Promotor Eukariotik

Promotor biasanya terletak di hulu gen dan memiliki beberapa kilobase jauhnya dari lokasi
awal transkripsi. Banyak promotor eukariotik, mengandung kotak TATA (urutan TATAAA),
yang kemudian mengikat protein pengikat TATA yang membantu pembentukan kompleks
transkripsi RNA polimerase. Kotak TATA dekat dengan situs awal transkripsi.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Promotor

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka 13 @UhamkaID

Transkripsi pada Eukariota

INISIASI (TAHAP KE-1 TRANSKRIPSI) :

1. Pengikatan awal oleh RNA pol pada molekul DNA terjadi tepat di depan
/sebelum gen yg akan disalin.
2. RNA pol terikat pd promotor.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

ELONGASI (TAHAP KE-2 TRANSKRIPSI)
1. Setelah terikat pd promotor, RNA pol membuka ikatan ganda DNA (sekitar
10 – 20 basa pada kali pertama ). Salah satu untai DNA yg sudah terbuka,
berperan sbg cetakan/template bagi pasangan basa komplemen.
2. RNA pol menambahkan nukleotida – nukleotida RNA pada ujung 3’ dari
mRNA yang mulai terbentuk. (artinya arah sintesis dari 5’ – 3’, sama spt
arah sintesis replikasi DNA)

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 TERMINASI (TAHAP KE-3 TRANSKRIPSI)
1. Transkripsi akan terjadi sampai RNA Pol mencapai suatu sekuens pada
DNA template yang disebut Terminator.
2. Akhir penyalinan ditandai dengan terlepasnya RNA pol dari DNA dan
lepasnya salinan DNA yaitu mRNA yang baru diproduksi (disebut precursor-
mRNA/ pre-mRNA).

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

RNA Splicing
 Berdasarkan hasil penelitian ternyata jumlah asam amino yg
menyusun polipeptida yg hrs disintesa di ribosom tdk sama dg
jumlah kodon yg akan ditranskripsikan  berarti akan tjd
pengurangan panjang mRNA yg akan dibawa keluar dari inti 
artinya tdk semua nukleotida diterjemahkan mjd polipeptida.
 Sebelum mRNA yang baru diproduksi ini (pre-mRNA) akan dibawa
keluar dari inti sel, dilakukanlah pemotongan penggal intron
(splicing).
 Animasi:https://www.youtube.com/watch?v=GYi5fuS-R7I

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

18

Processing mRNA eukariot

◻Ujung 5’ dimodifikasi dengan ◻ Ujung 3’ ditambahi

menambahkan Guanosin tri phosfat nukleotida adenin 50 – 250
? Mencegah degradasi (poly A tail)
? Ribosome binding site ? Mencegah degradasi
? Membantu export

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Penghilangan intron
19

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Contoh:
20

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID
 pre-mRNA terdiri dari ;
1. Intron adalah : penggalan rangkaian nukleotida yg tidak
menentukan pola susunan as.amino yg akan dirangkai.
2. Ekson adalah : penggalan rangkaian nukleotida yg menentukan
pola susunan as.amino
 Dlm 1 penggal gen, jumlah ekson yg dipisahkan dari penggal intron
tidaklah selalu sama.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Penggal-penggal ekson akan disambung kembali oleh : snRP (Small Nuclear
Ribonucleid) kemudian membentuk mRNA baru yg disebut : mRNA
fungsional / mRNA.
 mRNA keluar dari inti sel (nukleus) menuju organel ribosom di sitoplasma
untuk diterjemahkan menjadi polipeptida / protein pada tahapan : TRANSLASI
 Utk mengangkut mRNA melalui pori-pori nukleus diperlukan protein khusus utk
membawanya. Di pori-pori nukleus terdapat receptor yg akan mengarahkan
transportasi menuju ribosom.
 Disimpulkan : Splicing adalah mekanisme pemotongan intron dan
penyambungan ekson.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID
www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID
Sintesis Protein Sel Prokariotik
 Pada dasarnya, sintesis protein (transkripsi dan translasi) organisme prokariotik tidak
berbeda jauh dg sintesis protein pd eukariotik.
 Perbedaan nya :
1. Seluruh proses sintesis protein (transkripsi dan translasi) dilakukan di wilayah
sitoplasma.
2. Proses translasi dpt berjalan meskipun proses transkripsi belum selesai.
3. Menggunakan 1 jenis enzim RNA pol (pd eukariotik 3 jenis RNA pol )
4. Ekson tidak dipisahkan dari intron sehingga tidak terjadi splicing
 Pada proses inisiasi transkripsi, RNA pol dibantu oleh protein lain yang dinamakan
faktor transkripsi. Pada bakteri, terdapat satu faktor transkripsi yaitu faktor sigma (σ).
 Faktor σ membantu dalam membaca sinyal DNA di bagian promotor yang menandakan
dimulainya proses transkripsi. Enzim RNA pol bersama-sama dengan faktor σ dinamai
holoenzim RNA polimerase.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

Promotor Prokariotik

 Promotor : letak dihulu (upstream); pada

prokariotik, promotor selain sebagai tempat
pelekatan RNA polimerase dengan untai DNA
yang akan ditranskripsi, juga merupakan urutan
DNA spesifik yang berperan mengendalikan
transkripsi gen struktural.
 Terminator : letak di downstream; berperan dalam
pengakhiran (terminasi) transkripsi.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 TRANSKRIPSI PROKARIOTIK
Inisiasi : RNA pol dan faktor sigma (σ)
berikatan dengan promotor (TATA box di -10
dan sekuens inisiasi di -35)

Heliks DNA dibuka oleh RNA pol

disekitar tempat dimulainya transkripsi

Transkripsi dimulai (garis hijau

menandakan RNA yang sedang dibuat

Faktor sigma (σ) dilepas

Setelah Faktor sigma (σ) dilepas, proses

sintesis RNA menjadi lebih cepat,
menandakan proses elongasi, kemudian
dilanjutkan proses terminasi yang
ditandai dengan terbentuknya mRNA.

Sumber : Cooper GM . The Cell: A Molecular Approach. 2nd edition.. Sunderland (MA): Sinauer Associates; 2000.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Elongasi transkripsi prokariotik;
1. Setelah inisiasi, RNA polimerase bergerak
sepanjang template menuju downstream (hilir).
Arah sintesis dari 5’ – 3’,
2. Bagian upstream (hulu) yang terbuka/setelah
berhasil disintesis, akan menutup kembali.

Terminasi Transkripsi prokariotik;

3. Transkripsi akan berakhir pada saat RNA pol
mencapai ujung gen yang disebut :
terminator.Fungsi terminator adalah
memberikan sinyal pd enzim RNA polimerase
agar menghentikan proses transkripsi.
4. Proses terminasi ttd : 1) terminasi yg ditentukan
oleh urutan nukleotida tertentu (rho-
independent) dan 2) terminasi yang diatur oleh
suatu protein (faktor rho) atau disebut rho-
dependent.
www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID
Pertanyaan-Pertanyaan Seputar Transkripsi DNA :

 Apa itu proses transkripsi DNA? Transkripsi DNA adalah proses penyalinan ulang DNA ke molekul lain
yaitu RNA.
 Proses transkripsi DNA terjadi di mana? Pada prokariotik seperti bakteri, dikarenakan tidak memiliki inti
sel maka proses transkripsi DNA terjadi di stoplasma. Sedangkan pada eukariotik, transkripsi DNA
terjadi di inti sel.
 Molekul apa yang dihasilkan dari proses transkripsi DNA? Transkripsi DNA menghasilkan molekul RNA.
RNA ini terdiri dari beberapa jenis. Kebanyakan adalah mRNA yang digunakan lebih lanjut untuk
translasi RNA dan sitesis protein. RNA bentuk lain yaitu rRNA, tRNA. Transkripsi adalah penyalinan
sebagian dari DNA (biasanya satu gen) menjadi bentuk lain RNA dan berfungsi untuk ekspresi gen.
 Apa fungsi proses transkripsi DNA?Transkripsi DNA berperan dalam proses ekspresi gen. mRNA akan
memiliki hasil akhir berupa protein. rRNA dan tRNA berperan dalam membantu proses sintesis proten.
 Enzim apa yang berperan dalam proses transkripsi DNA? Enzim utama yang berperan dalam transkripsi
DNA adalah RNA polimerase.
 Apa bedanya transkripsi dengan replikasi DNA? Proses replikasi DNA adalah penggandaan DNA, jadi
DNA disalin menjadi DNA salinannya dan terjadi terutama saat terjadi pembelahan sel. Sedangkan
transkripsi adalah penyalinan sebagian dari DNA (biasanya satu gen) menjadi bentuk lain RNA dan
berfungsi untuk ekspresi gen.

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 TERIMAKASIH

Penjelasan mengenai transkripsi juga dapat dilihat di video berikut ini :

https://www.youtube.com/watch?v=Ma6Z-dDMzNg&feature=youtu.be

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 Lampiran Pendukung

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

RNA polimerase I
 Berperan dalam transkripsi gen kelas I yg menghasilkan 18S rRNA, 5,8S
rRNA & 28S rRNA
 BM 630 kD, jumlah sub unit 13
 Aktivitas : aktif pd kekuatan ionik rendah, distimulasi oleh Mn 2+ & Mg 2+
 Sangat tahan thd  amanitin
 Lokasi dalam sel : Nukleolus

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 RNA polimerase II
 Berperan dalam transkripsi gen kelas II yg menghasilkan mRNA.
 BM 567 kD, jumlah sub unit 12
 Aktivitas : aktif pd kekuatan ionik tinggi, > aktif dg adanya Mn 2+ drpd Mg 2+
 Sangat rentan thd  amanitin
 Lokasi dalam sel : Nukleoplasma

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID

 RNA polimerase III
 Berperan dalam transkripsi gen kelas III yg menghasilkan tRNA
 BM 697 kD, jumlah sub unit 14
 Aktivitas : aktif pd kekuatan ionik dg kisaran lebar, > aktif dg adanya Mn
2+

 Terhambat oleh  amanitin pd konsentrasi tinggi

 Lokasi dalam sel : Nukleoplasma

www.uhamka.ac.id info@uhamka.ac.id (021)73944451 uhamkaid Uhamka @UhamkaID