Istilah bioinformatika mulai dikemukakan pada pertengahan era 1980-an untuk mengacu pada penerapan

komputer dalam biologi. Namun demikian, penerapan bidang-bidang dalam bioinformatika (seperti
pembuatan basis data dan pengembangan algoritma untuk analisis sekuens biologis) sudah dilakukan
sejak tahun 1960-an. Kemajuan teknik biologi molekuler dalam mengungkap sekuens biologis dari
protein (sejak awal 1950-an) dan asam nukleat (sejak 1960-an) mengawali perkembangan basis data dan
teknik analisis sekuens biologis. Basis data sekuens protein mulai dikembangkan pada tahun 1960-an di
Amerika Serikat dan Jerman (pada European Molekular Biology Laboratory). Kelahiran Bioinformatika
modern tak lepas dari perkembangan bioteknologi di era tahun 70-an, dimana seorang ilmuwan AS
melakukan inovasi dalam mengembangkan teknologi DNA rekombinan. Berkat penemuan ini lahirlah
perusahaan bioteknologi pertama di dunia, yaitu Genentech di AS, yang kemudian memproduksi protein
hormone insulin dalam bakteri, yang dibutuhkan penderita diabetes. Selama ini insulin hanya bias
didapatkan dalam jumlah sangat terbatas dari organ pankreas sapi. Temuan ini menjadi landasan
terjadinya ledakan sejumlah sekuens DNA yang berhasil diungkapkan pada tahun 1980-an dan 1990-an,
menjadi salah satu pembuka jalan bagi proyek-proyek pengungkapan genom, meningkatkan kebutuhan
akan pengelolaan dan analisis sekuens, dan pada akhirnya lahirlah bioinformatika.

Pada "Eart summit" Rio de Janeiro 1992, dua kesepakatan itu melahirkan United Nations Framework
Convention on Climate Change (UNFCCC), dan Konvensi biodiversitas (CBD). Implementasi keduanya
berhasil, konvensi sangat bergantung pada upaya gabungan negara dan organisasi internasional, integrasi
sistem informasi terdistribusi dan penyebaran informatika biodiversitas. Pasal 17 CBD telah membahas
kebutuhan "informasi dari semua sumber yang tersedia untuk umum, relevan dengan konservasi dan
pemanfaatan berkelanjutan biodiversitas “termasuk” hasil teknis, ilmiah dan sosial ekonomi penelitian ".
Untuk mencapai ini dan mengejar, Pasal 18 ayat 3, CBD sedang melaksanakan Mekanisme Lembaga
Kliring (CHM), dan promosi jaringan berbasis internet kerjasama teknis dan ilmiah serta pertukaran
informasi.

Pada bulan Januari 1996, OCED Science Ministers mendirikan Megascience Forum Kelompok Kerja
Informatika Biologi. kelompok kerja biodiversitas Sub kelompok informatika menyimpulkan bahwa (a)
domain informatika biodiversitas sangat luas dan kompleks, tetapi sangat penting bagi masyarakat, (b)
saat ini, keanekaragaman hayati yang ada dan informasi ekosistem tidak dapat diakses atau sepenuhnya
digunakan, dan (c) perkembangan teknologi dan politik baru-baru ini menghadirkan peluang bagi OECD
negara untuk menunjukkan kepemimpinan di bidang informatika keanekaragaman hayati. Dengan
demikian, merekomendasikan pendirian " Global Biodiversity Information Facility (GBIF)" sebagai
mekanisme internasional untuk membuat data dan informasi keanekaragaman hayati dapat diakses secara
terbuka di seluruh dunia. GBIF didirikan pada Maret 2001, dan partisipasinya terbuka untuk siapa saja
negara yang tertarik, ekonomi, atau organisasi internasional yang diakui yang setuju untuk menyediakan
informasi keanekaragaman hayati ilmiah. Sejak itulah GBIF dibuat kemajuan yang signifikan dan saat ini
portal datanya menyusun dan menyebarluaskan lebih dari 134 juta catatan kejadian spesies primer.

Pada Mei 2003 pada pertemuan di London pada "2010 - The Global Biodiversity Challenge "Diakui
bahwa tantangan sebelum Para Pihak CBD adalah bagaimana mengukur dan mengukur keanekaragaman
hayati yang ada dan bagaimana mengukur hilangnya atau konservasi dan dengan demikian menegaskan
kembali kebutuhan "untuk memalsukan data keanekaragaman hayati yang ada dengan lebih siap dapat
diakses "dan tersedia tepat waktu (CBD, 2004). Demikian pula, pada Januari 2005, selama Konferensi
Internasional tentang "Biodiversitas: Ilmu Pengetahuan dan Pemerintahan", kemudian Presiden Prancis
Jacques Chirac memberikan dukungan politik untuk pembentukannya " "International Mechanism of
Scientific Expertise on Biodiversity (IMoSEB)", yang juga telah menekankan perlunya aksesibilitas ke
data dan informasi keanekaragaman hayati. Ini diratifikasi oleh lebih dari 2000 ilmuwan yang mewakili
lebih dari 100 negara pada saat yang sama konferensi dan kemudian oleh lebih dari 600 ilmuwan pada
DIVERSITAS Open Sciecne pertama Konferensi diadakan di Oaxaca, Meksiko pada November 2005
(Loreau et al., 2006). Kegiatan ini lebih lanjut menekankan investasi dalam mekanisme seperti GBIF.

Pada Maret 2007, Menteri Lingkungan G8 + 5 mendukung " Postdam Initiative - Biological Diversity
2010 "mendorong perkembangan Spesies Global Sistem Informasi (GSIS). Kemudian dilanjutkan dengan
Rapat Koordinasi di PT Brussel pada bulan April 2007, dimana di Uni Eropa bekerjasama dengan
lembaga dari AS, Australia, Brasil, India, dan Afrika Selatan berjanji untuk berkontribusi pada upaya
GSIS di dalam bentuk SpeciesBase. SpeciesBase akan menyusun dan menyebarkan informasi tentang
spesies yang berharga bagi ilmuwan, pembuat kebijakan, petani, pengelola lahan, konservasionis, siswa,
dan bahkan publik. Lebih lanjut berjanji bahwa SpeciesBase akan menjadi inisiatif pelengkap untuk
Ensiklopedia Kehidupan (EoL) di Amerika Serikat dan Atlas of Living Australia (Siaran Pers Uni Eropa,
9 Mei 2007).

Sementara pengumuman di atas dari Uni Eropa yang berkomitmen untuk GSIS adalah dibuat pada
tanggal 9 Mei 2007 di Brussels, di Washington DC, banyak perusahaan terkemuka di dunia lembaga
ilmiah mengumumkan peluncuran Encyclopedia of Life, satu decade upaya untuk mendokumentasikan
semua 1,8 juta spesies hewan, tumbuhan dan bentuk lain yang dinamai kehidupan di Bumi menggunakan
teknologi mash-up. Berdasarkan konsep Edward O Wilson (Wilson, 2003), lebih dari US $ 50 juta telah
dijanjikan untuk upaya ini bertempat di http://www.eol.org, dan akan memberikan informasi tertulis dan
kapan tersedia, foto, video, suara, peta lokasi dan informasi multimedia lainnya pada setiap spesies.
Dibangun di atas integritas ilmiah dari ribuan pakar di sekitar globe, Ensiklopedia akan menjadi
lingkungan bergaya wiki yang dimoderasi, tersedia secara gratis kepada semua pengguna di mana pun
(Siaran Pers EoL, 9 Mei 2007).

Ini berjalan melalui sejarah sampai saat ini, mengarah pada kesimpulan bahwa keduanya skenario politik
dan teknologi menyediakan platform yang menguntungkan untuk kemajuan lebih lanjut di bidang
informatika keanekaragaman hayati.