KONTAN.CO.

ID - JAKARTA. Virus corona menjadi ancaman yang belum

bisa ditangani oleh dunia saat ini. Bahkan, Kelompok Penelitian Virus Corona
dan Formulasi Vaksin dari Professor Nidom Foundation (PNF) menemukan,
terjadi mutasi virus corona D614G yang sangat berbahaya.

Asal tahu saja, mutasi D614G adalah jenis virus corona yang 10 kali lebih
menular dibanding jenis lain. Diberitakan, mutasi ini juga sudah terjadi di
Indonesia.

Berikut 6 fakta terkait D614G yang telah Kompas.com himpun dari berbagai
sumber:

1. Apa itu D614G?

Dilansir Times of India, SARS-CoV-2 adalah jenis virus corona yang

menyebabkan penyakit Covid-19.

Virus SARS-CoV-2 ini bermutasi dalam jumlah sangat banyak, hingga ribuan.
Salah satunya adalah D614G.

D614G terletak di dalam protein yang membentuk spike - berupa paku di

permukaan virus corona - yang bisa menjadi pintu masuk virus membobol sel
kita.

Mutasi ini mengubah asam amino pada posisi 614, dari D (asam aspartat)
menjadi G (glisin). Sehingga disebut D-614-G.

2. Ada di Indonesia sejak Maret 2020

Tim PNF menganalisis seluruh jenis virus corona di Indonesia dari data
sekuens genom virus corona yang dimuat di Global Initiative on Sharing All
Influenza Data (GISAID).

Mereka menemukan, penyebaran virus corona jenis D614G sudah ada sejak
SARS-CoV-2 pertama kali dikonfirmasi di Indonesia.

"Mutasi D614G sudah ada sejak awal virus (corona) itu di Indonesia, sejak
Maret 2020. Perkiraan saya, sekarang lebih banyak lagi," kata Prof Chairul
Anwar Nidom yang merupakan ketua tim riset kepada Kompas.com, Sabtu
(29/8/2020).
3. Mutasi D614G terjadi di daerah motif ADE yang dapat meningkatkan
masukya virus ke dalam sel

Dari pengamatan yang dilakukan Nidom dan tim, mutasi virus jenis D614G
ada di daerah motif Antibody Dependent Enhancement (ADE).

"Yang menjadi pertanyaan tim PNF saat ini, kenapa mutasi itu terjadi pada
daerah motif ADE?" ujar Nidom.

ADE merupakan desain atau sistem pertahanan dari sebuah virus ketika
menjumpai sebuah antibodi di dalam host. "Jadi begini, ketika virus (corona)
ini mengetahui ada antibodi di dalam tubuh seseorang, maka ADE ini
berperan untuk menutup antibodi dan antibodi itu justru akan meningkatkan
masuknya virus ke dalam sel," paparnya. 

"Jadi antibodi malah diajak kolaborasi dengan virus (corona) itu (agar bisa
masuk ke sel)." Nah, di dalam motif ADE tersebut ada jenis virus corona
D614G itu tadi. "Sekarang sedang kami analisis ke mana arah virus kalau ada
mutasi itu," ujarnya. 

4. Paling dominan di dunia 

Mutasi D614G merupakan jenis mutasi yang sangat umum ada di Eropa,
Amerika Utara, Australia, dan sebagian Asia. Mutasi ini pertama kali dideteksi
di Eropa pada bulan Februari. Sejak saat itu, jenis ini menyebar dengan cepat
dan luas ke berbagai negara.

Ahli biologi komputasi dan ahli genetik Bette Korber mengatakan dalam
papernya, mutasi D614G bisa dikatakan paling dominan di dunia karena
penyebarannya yang 10 kali lipat lebih tinggi dibanding jenis lain. 

Dalam risetnya yang terbit bulan Juli, Korber mengatakan bahwa D614G
mampu mendominasi jenis mutasi virus corona di suatu daerah meski ada
jenis asli virus di sana. 

5. Lebih mudah menyebar tapi disebut tidak mematikan 

Dilansir Reuters, Paul Tambyah yang merupakan konsultan senior di National

University of Singapore dan Presiden International Society of Infectious
Diseases mengatakan bahwa bukti yang ada menunjukkan D614G di
beberapa negara sejalan dengan penurunan tingkat kematian. 
Paul menjelaskan, ini artinya mutasi D614G kurang mematikan. "Mungkin
mutasi ini lebih menular, tapi tidak terlalu mematikan," kata Paul Tambyah. 

Dia menambahkan, sebagian besar virus cenderung kurang ganas ketika

bermutasi. "Virus berkepentingan untuk menginfeksi lebih banyak orang tetapi
tidak membunuh mereka karena virus bergantung pada inang untuk makanan
dan tempat berlindung," katanya.

6. Vaksin mungkin tak efektif 

Ada spekulasi bahwa ilmuwan perlu mengembangkan vaksin Covid-19 sesuai

dengan jenis mutasinya. Namun, sebagian besar vaksin yang dikembangkan
didasarkan pada wilayah spike yang berbeda, sehingga hal ini tidak
berdampak pada perkembangannya. 

Meski mutasi D614G terjadi pada protein spike, mutasi ini tidak mengubah
domain pengikat reseptor (RBD) di ujung protein spike. RBD mengikat
reseptor ACE2 pada sel manusia. Itu merupakan target utama dari sistem
kekebalan. 

Sederhananya, mutasi D614G mengubah protein spike, tetapi tidak

mengubah bagian RBD yang kritis untuk pengembangan vaksin. 

Sebuah studi WHO di China juga menunjukkan bahwa jenis D614G tetap
rentan terhadap netralisasi oleh antibodi yang diisolisi dari pasien yang
sembuh. Di sisi lain, vaksin yang dikembangkan saat ini menargetkan protein
spike untuk mencegah virus masuk ke sel. Namun mengingat jenis D614G
yang paling dominan di seluruh dominan, para ahli mengatakan satu vaksin
mungkin dapat menangani hal ini. 

Penelitian lebih lanjut diperlukan untuk memahami D614G.

 Mengenal Mutasi Virus COVID-19 D614G : 10
Kali Lebih Ganas, Vaksin Tidak Efektif
farmasetika.com 18 Agustus 2020 Editorial Leave a comment
4 hari ago

Majalah Farmasetika – Institute of Medical Research (IMR) telah mendeteksi mutasi Covid-19 tipe D614G
dalam tes kultur sampel yang diambil dari tiga kasus yang terkait dengan cluster Sivagangga, dan satu dari
Cluster Ulu Tiram, Malaysia. Sebelumnya, pada Juli 2020 ditemukan di Eropa.

Dalam sebuah posting Facebook, direktur jenderal Kesehatan Datuk Dr Noor Hisham Abdullah mengatakan
mutasi D614G pertama kali terdeteksi pada Juli, dan penelitian kemungkinan akan mengungkapkan bahwa
vaksin apa pun yang ada tidak efektif melawan mutasi tersebut.

“Itu ditemukan 10 kali lebih mungkin untuk menginfeksi individu lain dan lebih mudah disebarkan oleh
individu penyebar super.” Jelasnya dikutip dari New Straits Times (16/8/2020).

“Selama ini, kedua cluster tersebut terkendali karena berbagai kontrol kesehatan masyarakat di lapangan.”
Lanjutnya.

Meski demikian, masyarakat harus tetap waspada dan berhati-hati karena Covid-19 dengan mutasi D614G telah
terdeteksi di Malaysia.

“Terus melakukan tindakan preventif dan patuhi standar operasional prosedur yang ditetapkan, seperti menjaga
jarak fisik, praktik kebersihan diri, dan memakai masker saat berada di tempat umum,” ujarnya.

Ia menambahkan, pengujian ini masih pendahuluan, dan ada beberapa uji lanjutan yang sedang dilakukan
terhadap kasus-kasus lain, termasuk kasus indeks kedua klaster.

Dr Noor Hisham menekankan bahwa situasi Covid-19 di negara itu terkendali dan Kementerian Kesehatan,
bersama dengan lembaga lain, masih melakukan upaya untuk mengekang penyebaran virus corona.

“Kerja sama dari masyarakat sangat dibutuhkan, agar kita bisa bersama-sama menekan penularan infeksi Covid-
19 dari segala jenis mutasi,” imbuhnya.

Daftar Isi [hide]
 Mengenal mutasi virus Covid-19 D614G
 Implikasi mutasi
 Apakah mutasi Spike D614G dikaitkan dengan kasus kematian yang lebih tinggi?
 Bisakah mutasi D614G mempengaruhi pengembangan vaksin?

Mengenal mutasi virus Covid-19 D614G

Mutasi genetik ditandai dengan perubahan permanen urutan DNA yang mungkin terjadi karena faktor
lingkungan (radiasi UV), atau karena kesalahan selama proses replikasi DNA. Mutasi genetik dapat terjadi dari
banyak jenis, termasuk missense, nonsense, insertion, deletion, duplikasi, frameshift, dan repeat expansion
mutation.

CDC China
Mutasi D614G adalah mutasi missense dimana perubahan pasangan basa DNA tunggal menyebabkan substitusi
asam aspartat (kode satu huruf: D) dengan glisin (kode huruf tunggal: G) pada protein yang dikodekan oleh gen
yang bermutasi.

Kodon RNA yang mengkode asam aspartat dan glisin dirancang masing-masing sebagai GAU / GAC dan
GGU / GGC. Jadi, mutasi tunggal pada kodon RNA yang menyebabkan pergeseran A ke G dapat menyebabkan
pergeseran asam aspartat menjadi glisin dalam urutan peptida dari protein target.

Baca :  Bio Farma Jelaskan Sistem Pre Order Vaksin COVID-19 Jalur Mandiri
Glisin adalah asam amino nonpolar dengan satu atom hidrogen sebagai rantai sampingnya; sedangkan asam
aspartat adalah asam amino polar dengan rantai samping asam. Mengingat perbedaan substansial antara sifat
dasar asam amino ini, mutasi D614G diharapkan memiliki implikasi biologis yang signifikan.

Implikasi mutasi
Secara umum, virus dapat mengalami mutasi genetik yang sering karena beberapa faktor, seperti seleksi alam
dan pergeseran genetik acak. Karena faktor-faktor ini dapat bekerja secara berurutan, seringkali sangat sulit
untuk mengidentifikasi kapan mutasi virus menjadi lebih umum.

Dalam kasus virus corona baru, mutasi D614G pada protein lonjakan virus terjadi pada tahap awal pandemi, dan
bukti terbaru menunjukkan bahwa virus yang mengandung residu glisin di posisi 614 kini telah menjadi varian
paling umum secara global.

Untuk mengidentifikasi faktor penyebab yang bertanggung jawab atas kemunculan cepat G614 yang
mengandung virus corona, para ilmuwan telah memantau secara ekstensif semua data sekuensing genom virus
corona yang tersedia secara global di database Global Initiative for Sharing All Influenza Data (GISAID).

Dengan menggunakan metode bioinformatis yang sesuai, para ilmuwan telah menemukan bahwa mutasi G614G
pada protein lonjakan virus adalah mutasi yang paling sering terjadi di banyak lokasi geografis. Sebagai virus
pseudotipe, varian G614 memiliki titer infeksi yang jauh lebih tinggi daripada varian D614. Ini menunjukkan
bahwa lonjakan mutasi D614G membuat virus korona baru lebih menular dan virus dapat ditularkan dengan
lebih mudah dan cepat dari orang ke orang.

Selain itu, para ilmuwan telah menunjukkan bahwa orang yang terinfeksi varian G614 memiliki viral load yang
lebih tinggi di saluran pernapasan bagian atas dibandingkan dengan mereka yang terinfeksi varian D614.
Namun, mutasi D614G tidak terkait dengan peningkatan keparahan penyakit.

Karena mutasi D614G terletak pada antarmuka antara protomer protein lonjakan yang berdekatan, mutasi ini
dapat memodulasi interaksi protomer-protomer dengan mengganggu pembentukan ikatan hidrogen antar-
protomer.

Menariknya, satu studi yang dilakukan pada pseudovirus yang mengandung D614 atau G614 telah mengklaim
bahwa virus yang mengandung G614 lebih rentan terhadap netralisasi yang dimediasi sera. Penemuan ini
menunjukkan bahwa mutasi D614G tidak memfasilitasi virus keluar dari respon imun host.

Apakah mutasi Spike D614G dikaitkan dengan kasus

kematian yang lebih tinggi?
Meskipun tidak ada bukti yang menunjukkan bahwa mutasi D614G dikaitkan dengan peningkatan keparahan
COVID-19, sebuah penelitian terbaru yang menggunakan pohon filogenetik lebih dari 4000 genom virus corona
telah mengklaim bahwa virus yang mengandung mutasi D614G lebih ganas, dan karenanya, dikaitkan dengan
penyakit dengan tingkat kematian yang lebih tinggi.
 Baca :  Banyak Bahan Baku dari China, Persediaan Obat Menipis Karena COVID-19

Penelitian ini berspekulasi bahwa patogenisitas virus yang lebih tinggi mungkin disebabkan oleh perubahan
konformasi yang dimediasi oleh mutasi pada protein spike, yang memfasilitasi pemaparan situs pembelahan
polibasik ke protease seluler.

Bisakah mutasi D614G mempengaruhi pengembangan

vaksin?
Protein spike mendapat banyak perhatian dari sistem kekebalan inang karena terletak di permukaan luar virus
(protein eksternal). Dengan demikian, mutasi spike D614G diharapkan memainkan peran utama dalam
memodulasi kemampuan virus untuk melarikan diri dari respons imun yang diinduksi oleh vaksin.
Namun, ada bukti yang menunjukkan bahwa kemungkinan mutasi D614G mempengaruhi kemanjuran vaksin
sangat kecil. Karena mutasi tidak berada dalam domain pengikat reseptor protein spike, mutasi kecil
kemungkinannya untuk memengaruhi kemampuan domain tersebut untuk menginduksi respons imun inang,
yang diyakini sebagai prasyarat untuk netralisasi virus yang dimediasi oleh antibodi.
Selain itu, sebagian besar vaksin yang sedang berlangsung dikembangkan untuk melawan domain pengikat
reseptor, dan dengan demikian, mutasi D614G seharusnya tidak berpengaruh pada kemanjuran vaksin.
Pengamatan penting lainnya adalah bahwa serum penyembuhan yang diperoleh orang yang terinfeksi virus
D614 telah ditemukan dapat menetralkan virus yang mengandung G614, begitu pula sebaliknya.

Ini menunjukkan bahwa mutasi D614G tidak mengubah respons imun yang dimediasi oleh antibodi.

Sumber :

 Science Translational Medicine. 2020. Mutations in the coronavirus spike

protein. blogs.sciencemag.org/…/mutations-in-the-coronavirus-spike-protein

 Korber B. 2020. Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity
of the COVID-19 Virus. Cell. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420308205
 Eaaswarkhanth M. 2020. Could the D614G substitution in the SARS-CoV-2 spike (S) protein be
associated with higher COVID-19 mortality? International Journal of Infectious
Diseases. www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1201971220303787#bib0015
 MedRxiv. 2020. D614G Spike Mutation Increases SARS CoV-2 Susceptibility to
Neutralization. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.07.22.20159905v1

 Grubaugh ND. 2020. Making Sense of Mutation: What D614G Means for the COVID-19 Pandemic
Remains Unclear. Cell.
https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(20)30817-5.pdf  
 Highly-infectious D614G Covid-19 mutation detected in Malaysia
https://www.nst.com.my/news/nation/2020/08/616944/highly-infectious-d614g-covid-19-mutation-detected-
malaysia
 D614G Mutation https://www.news-medical.net/amp/health/D614G-Mutation.aspx

 http://m.chinacdc.cn/xwzx/gwxx/202006/t20200622_217471.html
Fakta Penting dari Mutasi Virus Corona
Penyebab COVID-19 yang Wajib Diketahui
Majalah Farmasetika – Pada awal Januari 2020, urutan genom pertama Sars-CoV-2 – virus yang menyebabkan
COVID-19 – dirilis dengan nama “Wuhan-1”. Rangkaian 30.000 huruf ini (A, T, C, dan G dari kode genetik)
menandai hari pertama perlombaan untuk memahami genetika virus corona yang baru ditemukan ini.

Sekarang, 100.000 sampel genom virus corona yang diambil dari pasien COVID-19 di lebih dari 100 negara
telah bergabung dengan Wuhan-1. Ahli genetika di seluruh dunia sedang menggali data untuk mendapatkan
jawaban. Dari mana Sars-CoV-2 berasal? Kapan mulai menginfeksi manusia? Bagaimana virus bermutasi – dan
apakah itu penting? Genomik Sars-CoV-2, seperti virus itu sendiri, menjadi besar dan mendunia.

Istilah mutasi pada genetik virus

Istilah mutasi cenderung memunculkan citra virus baru yang berbahaya dengan peningkatan kemampuan yang
menyebar ke seluruh planet. Dan sementara mutasi terus-menerus muncul dan terkadang menyapu – mutasi
awal pada Sars-CoV-2 telah menyebar ke seluruh dunia karena virus menyebar hampir tanpa disadari – mutasi
adalah bagian alami yang sempurna dari organisme apa pun, termasuk virus. Sebagian besar tidak berdampak
pada kemampuan virus untuk menularkan atau menyebabkan penyakit.

Mutasi hanya berarti perbedaan; perubahan huruf dalam genom. Sementara populasi Sars-CoV-2 secara genetik
pada dasarnya tidak berubah ketika melompat ke inang manusia pertama pada akhir 2019, lebih dari 13.000
perubahan ini sekarang ditemukan dalam 100.000 Sars-CoV-2 yang diurutkan hingga saat ini. Namun dua virus
dari dua pasien mana pun di dunia ini rata-rata berbeda hanya dalam sepuluh huruf. Ini adalah sebagian kecil
dari total 30.000 karakter dalam kode genetik virus dan berarti bahwa semua Sars-CoV-2 yang beredar dapat
dianggap sebagai bagian dari satu garis keturunan klonal.

Mutasi terjadi secara perlahan

Butuh beberapa waktu bagi virus untuk memperoleh keragaman genetik yang substansial. Sars-CoV-2
bermutasi cukup lambat untuk virus, dengan garis keturunan apa pun yang memperoleh beberapa perubahan
setiap bulan; dua hingga enam kali lipat lebih rendah dari jumlah mutasi yang didapat oleh virus influenza
selama periode yang sama.

Baca :  Uji Klinik Terbaru Klaim Hidroksiklorokuin Efektif Perangi COVID-19

Namun, mutasi adalah landasan yang dapat digunakan oleh seleksi alam. Umumnya mutasi akan membuat virus
tidak berfungsi atau tidak memiliki efek apa pun. Namun potensi mutasi untuk mempengaruhi penularan Sars-
CoV-2 di inang manusia barunya ada. Akibatnya, ada upaya intens untuk menentukan mutasi mana, jika ada,
yang dapat diidentifikasi sejak genom Sars-CoV-2 pertama diurutkan di Wuhan yang dapat mengubah fungsi
virus secara signifikan.
Mutasi yang terkenal dalam konteks ini adalah perubahan asam amino pada protein lonjakan Sars-CoV-2,
protein yang memberikan ciri khas proyeksi mirip mahkota virus corona dan memungkinkannya menempel pada
sel inang.

Mutasi Virus Corona D614G

Perubahan karakter tunggal dalam genom virus – diistilahkan D614G – telah terbukti meningkatkan infektivitas
virus dalam sel yang tumbuh di laboratorium, meskipun tanpa dampak yang dapat diukur pada tingkat
keparahan penyakit. Meskipun mutasi ini juga hampir secara sistematis ditemukan dengan tiga mutasi lainnya,
dan keempatnya sekarang ditemukan pada sekitar 80% Sars-CoV-2 yang berurutan, menjadikannya kumpulan
mutasi yang paling sering beredar.

Tantangan dengan D614G, seperti halnya mutasi lainnya, adalah menguraikan apakah frekuensinya meningkat
karena kebetulan ada pada virus yang bertanggung jawab menyebarkan wabah awal yang berhasil, atau apakah
mutasi tersebut benar-benar memberi keuntungan bagi pembawa mereka. Sementara pekerjaan genomik pada
kumpulan data Inggris menunjukkan peran halus D614G dalam meningkatkan laju pertumbuhan garis keturunan
yang membawanya, pekerjaan kami sendiri tidak dapat menemukan dampak yang terukur pada transmisi.

Mutasi terjadi secara alamiah dan tidak selamanya

mengarah ke efek ganas virus
D614G bukan satu-satunya mutasi yang ditemukan pada frekuensi tinggi. Serangkaian tiga mutasi pada
cangkang protein Sars-CoV-2 juga semakin banyak muncul dalam data sekuensing dan sekarang ditemukan
pada sepertiga virus.

Baca :  Presiden Brasil Positif COVID-19, Hidkroksiklorokuin Jadi Obatnya

Perubahan tunggal pada posisi 57 dari protein Orf3a, wilayah imunogenik yang diketahui, terjadi dalam
seperempat. Mutasi lain ada pada protein lonjakan sementara banyak mutasi lainnya tampaknya disebabkan oleh
aktivitas respons kekebalan kita sendiri. Pada saat yang sama, masih belum ada konsensus bahwa ini, atau yang
lainnya, secara signifikan mengubah penularan atau keganasan virus. Kebanyakan mutasi terbawa begitu saja
karena Sars-CoV-2 terus berhasil menyebar.

Tetapi penggantian bukan satu-satunya pengeditan kecil yang dapat memengaruhi Sars-CoV-2. Penghapusan
pada gen aksesori Sars-CoV-2 Orf7b / Orf8 telah terbukti mengurangi virulensi Sars-CoV-2, berpotensi
menimbulkan infeksi yang lebih ringan pada pasien.

Penghapusan serupa mungkin berperilaku dengan cara yang sama di Sars-CoV-1, virus korona terkait yang
bertanggung jawab atas wabah Sars pada 2002-04.

Kemajuan menuju Sars-CoV-2 yang tidak terlalu ganas akan menjadi kabar baik, meskipun penghapusan di
Orf8 telah terjadi sejak hari-hari awal pandemi dan tampaknya tidak meningkat frekuensinya.
Meskipun perubahan adaptif mungkin belum terjadi, semua data yang tersedia pada tahap ini menunjukkan
bahwa kita menghadapi virus yang sama sejak awal pandemi.

Chris Whitty, kepala petugas medis untuk Inggris, menyatakan bahwa benar untuk menuangkan air dingin pada
gagasan bahwa virus telah bermutasi menjadi sesuatu yang lebih ringan daripada yang menyebabkan Inggris
memberlakukan lockdown pada bulan Maret.

Kemungkinan penurunan keparahan gejala yang terlihat selama musim panas mungkin disebabkan oleh orang
yang lebih muda terinfeksi, tindakan penahanan (seperti jarak sosial) dan pengobatan yang lebih baik daripada
perubahan pada virus itu sendiri. Namun, meski Sars-CoV-2 belum berubah secara signifikan hingga saat ini,
kami terus memperluas alat kami untuk melacak dan melacak evolusinya, siap untuk mengimbangi.

Sumber : Coronavirus mutations: what we’ve learned so far https://theconversation.com/coronavirus-mutations-

what-weve-learned-so-far-145864
Ilmuwan Ungkap Virus COVID-19 Bermutasi
Jadi Tiga Jenis Tersebar Ke Seluruh Dunia

farmasetika.com – Para peneliti yang memetakan beberapa penyebaran asli virus corona pada manusia telah
menemukan ada 3 varian virus di seluruh dunia. Mereka merekonstruksi jalur evolusi awal Covid-19 ketika
infeksi menyebar dari Wuhan, Cina, ke Eropa dan Amerika Utara.

Temuan ini diterbitkan dalam jurnal Proceeding of National Academy of Sciences (PNAS) pada 8 April 2020.

Dengan menganalisis 160 gen virus lengkap pertama yang diurutkan dari pasien manusia, para ilmuwan
menemukan varian yang paling dekat dengan yang ditemukan pada kelelawar sebagian besar ditemukan pada
pasien dari AS dan Australia, bukan Wuhan.

Dr Peter Forster, ahli genetika dan penulis utama dari University of Cambridge, mengatakan: ‘Terlalu banyak
mutasi yang cepat untuk melacak pohon keluarga Covid-19 dengan rapi. Kami menggunakan algoritma jaringan
matematika untuk memvisualisasikan semua pohon yang masuk akal secara bersamaan. Teknik-teknik ini
sebagian besar dikenal untuk memetakan pergerakan populasi manusia prasejarah melalui DNA. Kami pikir ini
adalah salah satu pertama kalinya mereka digunakan untuk melacak rute infeksi virus corona seperti Covid-19. ”

Tim menggunakan data dari sampel yang diambil dari seluruh dunia antara 24 Desember 2019 dan 4 Maret
2020. Mereka menemukan tiga varian Covid-19 yang berbeda, tetapi berkaitan erat, yang mereka sebut A, B dan
C.
Para peneliti menemukan bahwa jenis virus corona yang paling dekat dengan yang ditemukan pada kelelawar –
tipe A, genom virus manusia asli – ada di Wuhan, tetapi bukan jenis virus utama di kota itu. Versi mutasi A
terlihat di Amerika yang dilaporkan telah tinggal di Wuhan, dan sejumlah besar virus tipe A ditemukan pada
pasien dari AS dan Australia. Jenis virus utama Wuhan adalah B dan lazim pada pasien dari seluruh Asia timur,
namun tidak banyak bepergian di luar kawasan tanpa mutasi lebih lanjut.

Baca :  Sempat Dihentikan, AstraZeneca Lanjutkan Uji Klinis Vaksin COVID-19

Para peneliti mengatakan varian C adalah tipe Eropa utama, ditemukan pada pasien awal dari Perancis, Italia,
Swedia dan Inggris. Analisis ini juga menunjukkan salah satu perkenalan awal virus ke Italia datang melalui
infeksi Jerman yang pertama kali didokumentasikan pada 27 Januari, dan bahwa rute infeksi Italia awal lainnya
terkait dengan ‘cluster Singapura’. Virus ini tidak ada dalam sampel daratan Cina studi ini tetapi terlihat di
Singapura, Hong Kong, dan Korea Selatan. Para ilmuwan berpendapat metode mereka dapat diterapkan pada
sekuensing genom coronavirus terbaru untuk membantu memprediksi hotspot global masa depan dari penularan
dan penyebaran penyakit.

Sumber : metro.co.uk. Peneliti Ungkap 3 Varian Novel Coronavirus 2019

Varian A, yang paling dekat hubungannya dengan virus yang ditemukan pada kelelawar dan trenggiling,
digambarkan sebagai akar wabah oleh para peneliti. Tipe B berasal dari A, dipisahkan oleh dua mutasi,
kemudian C pada gilirannya adalah ‘anak perempuan’ dari B, penelitian menunjukkan.

Strain asli telah pindah ke AS dan Australia sementara tipe C menyebar ke Eropa (Foto: PNAS, metro.co.uk)
Metode jaringan filogenetik yang digunakan oleh para peneliti melihat hubungan evolusi di antara entitas
biologis yang memungkinkan visualisasi ratusan pohon evolusi secara bersamaan dalam satu grafik sederhana.

Sumber :

Coronavirus mutated into three distinct strains as it spread across the world
https://metro.co.uk/2020/04/10/coronavirus-mutated-three-distinct-strains-spread-across-world-12536852/

Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2

genomes. Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, Michael Forster
Proceedings of the National Academy of Sciences Apr 2020, 202004999; DOI: 10.1073/pnas.2004999117