Mutasi Virus COVID-19 dan

Vaksinasi
Dr. dr. Erlina Burhan, M.Sc, Sp.P(K)
Departemen Pulmonologi Dan Kedokteran Respirasi
FKUI – RSUP Persahabatan
Apa itu Mutasi Virus?
• perubahan struktur dan sifat genetik virus
• Terdapat kesalahan saat memperbanyak diri, virus anakan berbeda
dengan virus induk
• Dapat terjadi ketika virus sedang memperbanyak diri dalam sel tubuh
inang
Mengapa Virus Bermutasi?

Ketika virus masuk ke

Agar virus dapat
dalam tubuh manusia
bertahan hidup  Mutasi juga membuat
dan merusak sel-sel
virus bermutasi untuk virus semakin kuat dan
dalam tubuh  sistem
mengelabui sistem lebih mudah
kekebalan tubuh
kekebalan tubuh berkembang biak
manusia menghambat
inangnya
replikasinya
Apa dampaknya
mutasi virus
terhadap
penyebaran
penyakit dan
vaksin?
Vaksin dan cara
kerjanya
• Prinsip kerja vaksin:
melatih sistem kekebalan
untuk mengenali dan
memerangi patogen, baik
virus maupun bakteri.
Prinsip Kerja
Vaksinasi
COVID-19

https://www.nature.com/articles/d41586-020-01221-y
Bagaimana vaksin mencegah terjadinya
penyakit? HERD IMMUNITY!
Pemberian vaksin Indonesia masih
dapat melindungi sedikit yang ter-
orang lain dalam vaksin  Masih jauh
suatu komunitas dari herd immunity

Penularan masih
sangat rentan terjadi

Haley E. Randolph1 and Luis B. Barreiro. Herd Immunity: Understanding COVID-19.

Elsevier Immunity 52, May 19, 2020 .
 Kondisi yang Diharapkan

Kekebalan
Permasalahan
Vaksinasi Kekebalan Kelompok
COVID-19
COVID-19 Individu (Herd
teratasi
Immunity)
 Mutasi di Indonesia
• Database: GenBank, GISAID
• Submitting institution: Lembaga Biologi Molekuler
Eijkman, Institute of Tropical Disease Universitas
Airlangga
• Ditemukan beberapa situs mutasi spesifik
• Nukleotida: JKT-EIJK2444 (224C>T), EJ-ITD3590NT (347C>G; 1841A>G; 2031G>T), JKT-EIJK01 (414T>C;
1864G>T), dan JKT-EIJK04 (1715C>T; 2464C>T)
• Asam amino: JKT-EIJK2444 (T76I), EJ-ITD3590NT (S116C; D614G; Q677H), JKT-EIJK01 (V622F), and JKT-
EIJK04 (T572I; L822F)

• Namun, tidak ada perubahan signifikan dalam sekuens

genetik gen glikoprotein SARS-CoV-2, jika dibandingkan
dengan isolat Wuhan-Hu-1 dari Cina

Muhammad Ansori A, Dhea Kharisma V, Sabilil Muttaqin S, Antonius Y, Parikesit A. Genetic Variant of SARS-CoV-2 Isolates in Indonesia: Spike Glycoprotein Gene. Journal of Pure and Applied Microbiology. 2020;14(suppl 1):9
 Mutasi D614G
• Analisis terbaru dari variasi sekuens isolat SARS-CoV-2, mengidentifikasi beberapa
daerah genom dengan peningkatan variasi genetik
• Mengkode mutasi S-protein yaitu D614G, di daerah terminal karboksi (C) dari domain
S1, pada residu 614, mengubah asam amino “D” (asam aspartat) menjadi “G” (glisin)
• Genbank: Genotipe G614 tidak terdeteksi pada Februari (di antara 33 sekuens) 
Maret (26%)  April (65) %)  Mei (70%)
• Menunjukkan transmisi yang lebih baik dibandingkan virus dengan D614

Asam Spike fungsional meningkat, fleksibilitas

Glisin
Aspartat meningkat, tidak mudah hancur, lebih
(G614)
(D614) stabil

Zhang L, Jackson C, Mou H, Ojha A, Rangarajan E, Izard T et al. The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivity. 2020
 Apa saja varian baru
COVID-19 COVID-19
Hingga saat ini, sudah banyak varian SARS-CoV-2 yang
ditemukan di berbagai negara. Beberapa varian yang
penting diketahui
Varian Baru
B.1.1.7
Varian yang ditemukan pertama kali di Inggris Raya, Apakah itu COVID-19
dilaporkan sudah masuk Indonesia beberapa waktu varian baru?
lalu
SARS-CoV-2 adalah virus yang
B.1.351
menyebabkan COVID-19.
Varian yang pertama kali ditemukan di Afrika selatan
Seperti virus-virus lainnya, SARS-CoV-2 ini
Lainnya
sangat mudah mengalami mutasi atau
B.1.1.207 di Nigeria, P.1 di Jepang, Cluster 5 di
perubahan genetik.
Denmark
N439K di Scotland
Perubahan genetik pada virus dapat
menyebabkan virus ini memiliki efek yang
berbeda terhadap tubuh manusia.

COVID-19
 SARS-CoV-2 Mutasi D614G
• Analisis terbaru dari variasi sekuens isolat SARS-CoV-2, mengidentifikasi
beberapa daerah genom dengan peningkatan variasi genetik
• Mengkode mutasi S-protein yaitu D614G “G” (glisin) spike fungsional
meningkat, fleksibilitas meningkat, tidak mudah hancur, lebih stabil
• Perubahan ini berkorelasi dengan peningkatan viral load pada pasien
COVID-19, tetapi hal ini juga terkait dengan mutasi pada protein nsp3 dan
RdRp, sehingga peran mutasi pada protein-S belum dapat disimpulkan
• Studi lebih lanjut akan diperlukan untuk menentukan dampak perubahan
ini pada sifat dan tingkat keparahan COVID-19

Zhang L, Jackson C, Mou H, Ojha A, Rangarajan E, Izard T et al. The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivity. 2020
SARS-CoV-2 Varian B.1.351(20H/501Y.V2)

• Ditemukan pertama kali di Afrika Selatan sejak Oktober 2020,

• Terdapat 3 mutasi di receptor-binding domain (RBD) pada spike glycoprotein virus :
K417N, E484K, N501Y
• Diperkirakan akan meningkatkan resiko transmisi sama seperti B.1.1.1.7
• Pada 18 Desember 2020 varian ini telah diketahui menyebar ke 3 provinsi di Afrika
Selatan (Eastern Cape, Western Cape, dan KwaZulu-Natal)
• 30 December, dilaporkan varian B.1.351 telah menyebar ke 4 negara
• 10 Febuari 2021 Lembaga Biologi Molekuler Eijkman mengatakan sejauh ini di
Indonesia belum menemukan varian tersebut
• 20 Febuari 2021 dilaporkan varian telah menyebar ke 46 Negara
 Interm
Result
Efikasi
Vaksin
terhadap
new strain

https://twitter.com/EricTopol
 Sudah menyebar ke lebih
Penyebaran dan penularan
dari 90 negara termasuk
Fakta COVID- lebih cepat
Indonesia

19 Varian B117
Experts dari UK menjelaskan
adanya kemungkinan
peningkatan risiko kematian
dibandingkan varian lainnya
(perlu penelitian lebih lanjut)

Apa antisipasi kita?

https://www.bbc.co.uk/news/amp/health-55659820
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/transmission/variant.html
• Varian COVID-19 akan terus bertambah – para ahli
akan memilah mana yang potensi berbahaya untuk
diteliti lebih lanjut
• Memetakan potensi penyebaran varian-varian
COVID-19
Vaksin tidak bisa berdiri sendiri?

• Tidak bisa mengandalkan vaksin semata

• Distribusi vaksin perlu waktu yang signifikan

https://www.nytimes.com/2020/12/05/health/coronavirus-swiss-cheese-infection-mackay.html
Vaksin yang saat ini masih bisa menangani
Varian B117?
Pfizer dan Oxford- Vaksin masih efektif
AstraZeneca sedang Pfizer dikatakan efektif melawan varian-varian
berdiskusi mengenai melawan varian B117 di baru (walau tidak se-
untuk meng-update penelitian di Israel efektif dengan varian
vaksin mereka lama)

Semakin banyak
Vaksin tetap dapat tervaksin 
mencegah perawatan di Menurunnya penularan
RS dan kematian  Berkurang timbulnya
varian-varian baru
Mahase E. Covid-19: Where are we on vaccines and variants?. BMJ. 2021;:n597.
https://www.umms.org/coronavirus/covid-vaccine/facts/strain
 Pertama kali ditemukan di Afrika
Selatan, Oktober 2020

Bagaimana Saat ini sudah menyebar ke sekitar 45

negara
kalau
varian Ditemukan lebih mudah menular

B1351? Efektivitas vaksin berkurang menghadapi

COVID varian B1.351
• Sebagian penelitian menemukan ini pada vaksin
Novavax, AstraZeneca, Pfizer dan Moderna
Duong D. What’s important to know about the new COVID-19 variants?. Canadian Medical Association Journal. 2021;193(4):E141-
E142. Kamps B, Hoffmann C. COVID Reference. 6th ed. Hamburg: Steinhäuser Verlag; 2021.
 SARS-CoV-2 Mutasi
N439K

• Terdeteksi pertama kali di Skotlandia

• Perubahan struktur protein S pada SARS-
CoV-2 dengan mutasi N439K meningkatkan
interaksi dengan reseptor ACE-2
• Mutasi ini membuat kebal terhadap
antibodi penetral (antibodi monoclonal)
untuk terapi yang sedang dikembangkan
• Tidak ada pengaruh terhadap virulensi,
kemampuan untuk menyebar, dan
keparahan penyakit

Emma C. Thomson, Laura E. Rosen, James E, et al. Circulating SARS-CoV-2 spike N439K variants maintain fitness while evading antibody-mediated immunity,
Cell, 2021; 184(5): 1171-1187.e20. https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.037.
 Penelitian virus strain lebih lanjut
Apa yang Pengembangan dan update vaksin
dilakukan
Memetakan potensi penyebaran
para ahli?
Menggalakkan protokol kesehatan