ANALISIS NETWORKING DAN INTERAKSI SENYAWA FLAVONOID

PROPOLIS SEBAGAI AGEN ANTIDIABETES TIPE 2 DAN

INHIBITOR PROTEIN AKBR1B1, AMY2A, FBP1, GCK, MGAM, PDK2,
PYGL SECARA IN SILICO

LAPORAN PRAKTEK KERJA LAPANGAN

NAHDAH ASRINOVINDAH

PROGRAM STUDI KIMIA

FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
UNIVERSITAS ISLAM NEGERI SYARIF HIDAYATULLAH
JAKARTA
2021
ANALISIS NETWORKING DAN INTERAKSI SENYAWA FLAVONOID PROPOLIS
SEBAGAI AGEN ANTIDIABETES TIPE 2 DAN INHIBITOR PROTEIN AKBR1B1,
AMY2A, FBP1, GCK, MGAM, PDK2, PYGL SECARA IN SILICO

LAPORAN PRAKTEK KERJA LAPANGAN

Oleh :

Rafida Aisyah Fitri

NIM : 11180960000022

PROGRAM STUDI KIMIA

FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI

UNIVERSITAS ISLAM NEGERI SYARIF HIDAYATULLAH

JAKARTA
 2021

LEMBAR PENGESAHAN

Judul : Analisis Networking dan Interaksi Senyawa Flavonoid Propolis

Sebagai Agen Antidiabetes Tipe 2 dan Inhibitor Protein AKBR1B1,

AMY2A, FBP1, GCK, MGAM, PDK2, PYGL Secara In Silico

Nama : Nahdah Asrinovindah

NIM : 11180960000019

Program Studi : Kimia

Fakultas : Sains dan Teknologi

Universitas : UIN Syarif Hidayatullah Jakarta

Menyetujui,

Pembimbing I Pembimbing II

Putri Hawa Syaifie Siti Nurbayti, M.Si

Mengetahui,

Ketua Program Studi Kimia

 Dr. La Ode Sumarlin, M.Si

NIP. 19750918 2008 01 1 007

IDENTITAS MAHASISWA

Nama : Nahdah Asrinovindah

NIM : 11180960000019

Tempat, Tanggal Lahir : Jakarta, 1 November 2001

Program Studi : Kimia

Fakultas : Sains dan Teknologi

Universitas : UIN Syarif Hidayatullah Jakarta

Alamat : Jalan Teratai Putih I Rt 08/04 No.66

Malaka Sari, Jakarta Timur

 IDENTITAS UNIVERSITAS

Nama Universitas : UIN Syarif Hidayatullah Jakarta

Alamat : Jl. Ir. H. Juanda No. 95 Ciputat, 15412

Telepon/Fax : (021) 7401925 / (021) 7403982

Rektor Universitas : Prof. Dr. Hj. Amany Burhanuddin Umar Lubis, Lc., M.A

Dekan FST : Prof. Dr. Lily Surraya Eka Putri, M.Env.Stud

Ketua Prodi Kimia : Dr. La Ode Sumarlin, M.Si

Pembimbing PKL : Siti Nurbayti, M.Si

 IDENTITAS LEMBAGA PENELITIAN

Nama : Nano Center Indonesia

Alamat : Jl. Raya Puspiptek Serpong, Gedung Nano Center Indonesia, Setu,

Tangerang Selatan. Komplek Batan Lama No. A12

No. Telepon/Fax :

Pimpinan :

Pembimbing PKL : Putri Hawa Syaifie

Jabatan :
 KATA PENGANTAR

Puji syukur penulis panjatkan pada Allah SWT karena berkat rahmat dan hidayah-Nya

penyusun dapat menyelesaikan laporan ini. Shalawat serta salam tercurahkan kepada Baginda

Nabi Besar Muhammad SAW beserta keluarga dan sahabatnya yang setia mengorbankan

jiwa raga dan lainnya untuk tegaknya syiar Islam. Laporan Praktek Kerja Lapangan (PKL)

yang berjudul “Analisis Networking dan Interaksi Senyawa Flavonoid Propolis Sebagai

Agen Antidiabetes Tipe 2 dan Inhibitor Protein AKBR1B1, AMY2A, FBP1, GCK,

MGAM, PDK2, PYGL Secara In Silico” ini disusun untuk memenuhi mata kuliah Praktek

Kerja Lapangan (PKL). Penyusunan laporan ini didasarkan pada hasil Praktek Kerja

Lapangan (PKL) yang dilakukan di Nano Center Indonesia sejak tanggal 11 Januari 2020

sampai 09 Februari 2020.

Penulis mengalami banyak halangan dan rintangan dalam penulisan laporan ini, akan

tetapi karena adanya bantuan dan partisipasi dari berbagai pihak akhirnya laporan ini dapat

selesai tepat pada waktunya. Oleh karena itu, penulis menyampaikan ucapan terima kasih

yang sebesar-besarnya terutama kepada :

1. Putri Hawa Syaifie selaku pembimbing I yang telah membantu dan memberikan saran

serta pengarahan selama Praktek Kerja Lapangan berlangsung.

2. Siti Nurbayti, M.Si selaku pembimbing II yang telah membantu memberikan saran dan

pengarahan sehingga penulisan Laporan Praktek Kerja Lapangan ini dapat terselesaikan

dengan baik.

3. Dr. La Ode Sumarlin, M.Si selaku Ketua Program Studi Kimia Universitas Islam

Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta.

4. Prof. Dr. Lily Surraya Eka Putri, M.Env.Stud. selaku Dekan Fakultas Sains dan

Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta

5. Seluruh Staff Research and Development , Nano Center Indonesia yang membimbing

dan memberikan motivasi dan bersedia membantu baik hal teknis maupun non-teknis

selama Praktek Kerja Lapangan berlangsung.

6. Kedua Orang tua dan keluarga yang telah memberikan dukungan baik moral, material,

maupun spiritual

7. Teman-teman mahasiswa Universitas Islam Negri Syarif Hidayatullah Jakarta Program

Studi Kimia Angkatan 2018.

Penulisan laporan ini tentunya tidak terlepas dari berbagai kekurangan, baik dalam hal

penulisan maupun dalam pemaparan dan pengolahan data. Hal ini dikarenakan kurangnya

informasi dan keterbatasan ilmu yang dimiliki penulis. Semoga laporan PKL ini dapat

bermanfaat bagi para pembaca dan semua pihak.

Jakarta, Januari 2020

Penulis
 BAB I

PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Diabetes merupakan penyakit kronis dan menjadi penyebab kematian ketujuh
pada tahun 2016. Penyakit ini merupakan penyakit multi-organ yang mempengaruhi
pancreas, hati, otot, ginjal, dan susunan saraf pusat yang ditandai dengan kekurangan
insulin dan/atau ketidaksensitifan insulin. Diabetes terdiri dari 2 tipe, yaitu tipe 1 dan
tipe 2. Tipe 1 diabetes dikaitkan dengan defisiensi insulin sedangkan pada diabetes
tipe 2 kadar insulin dalam tubuh normal atau terjadi peningkatan kadar insulin dengan
resistensi insulin yang signifikan. Penelitian ini difokuskan pada diabetes tipe 2, yang
mana pada tipe 2 ini memungkinkan akan berkembang ke keadaan kekurangan insulin
setelah disfungsi sel β pancreas sebagai akibat dari produksi dan sekresi insulin yang
lengkap.
Fokus utama pada pengobatan diabetes dalam mengendalikan hiperglikemia
terkait insulin adalah penurunan dan pemeliharaan glukosa darah yang dapat dibantu
dengan mengkonsumsi obat - obatan. Dalam beberapa tahun terakhir terjadi
peningkatan dan pengembangan obat bertarget protein dan inhibitor spesifik untuk
target – target protein yang terlibat dalam regulasi diabetes. Selain penggunaan obat -
obatan, terdapat juga penggunaan tradisional yang tersebar luas dalam pengobatan
diabetes, salah satunya adalah propolis. Propolis merupakan salah satu sumber
antioksidan yang bersumber dari lebah. Saat ini banyak digunakan sebagai salah satu
altenatif pengobatan alami karena mengandung senyawa – senyawa bioaktif yang
dapat memberikan efek positif bagi tubuh. Salah satu senyawa bioaktif yang
melimpah pada propolis adalah flavonoid (Segueni, Zellagui, Moussaoui, Lahouel, &
Rhouati, 2016). Senyawa flavonoid telah terbukti memiliki efek menguntungkan
melawan diabetes, beberapa jenis senyawa flavonoid telah ditemukan dapat
melindungi sel β pancreas dari kerusakan, merangsang sekresi insulin dari β pancreas,
serta mendorong glikogenesis.
Oleh karena itu, perlu dilakukan penelitian lebih lanjut mengenai senyawa
flavonoid pada propolis yang potensial yang dapat dijadikan sebagai kandidat obat
herbal untuk pengobatan diabetes. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode
Bioinformatic secara in silico dengan menggunakan DIA-DB Web Server yang
kemudian dianalisa interaksi antara senyawa – senyawa flavonoid pada propolis
 dengan target – target protein yang terlibat dalam metabolisme glukosa pada diabetes
menggunakan Cytoscape. Hasil yang diharapkan nantinya dapat mengetahui
kesamaan potensi antara senyawa flavonoid pada propolis yang dapat dijadikan
sebagai kandidat obat dengan obat – obat yang sudah beredar di pasaran.

1.2 Tujuan Penelitian

1.2.1 Tujuan Umum Pelaksanaan PKL
1. Mememenuhi kewajiban tugas mata kuliha PKL sebagai persyaratan studi
strata satu (S1) pada Program Studi Kimia, Fakultas Sains dan Teknologi,
Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta.
2. Mengenalkan kepada mahasiswa tentang lingkungan kerja yang akan dihadapi
di masa mendatang.
3. Meningkatkan keahlian dan pengtahuan mahasiswa khususnya dalam dunia
kerja.
1.2.2 Tujuan Khusus
1. Mengetahui senyawa flavonoid pada propolis potensial yang dapat dijadikan
sebagai agen antidiabetes.
2. Mengetahui interaksi yang terjadi antara senyawa – senyawa flavonoid pada
propolis dalam menghambat target protein AKBR1B1, AMY2A, FBP1,
GCK, MGAM, PDK2, PYGL yang terlibat dalam regulasi metabolisme
glukosa pada diabetes.
3. Dapat mengetahui kesamaan potensi antara senyawa flavonoid pada propolis
yang dapat dijadikan sebagai kandidat obat dengan obat – obat yang sudah
beredar di pasaran.
1.3 Rumusan Masalah
1. Mengapa suatu senyawa flavonoid pada propolis dapat mengahambat target – target
protein yang terlibat dalam diabetes?
2. Bagaimana interaksi networking yang terjadi antara senyawa flavonoid pada propolis
dengan target – target protein yang terlibat dalam diabetes?
3. Bagaimana senyawa – senyawa flavonoid pada propolis dapat dijadikan sebagai
kandidat obat herbal untuk pengobatan diabetes?
1.4 Hipotesa
Terdapat beberapa senyawa flavonoid dalam propolis yang dapat dijadikan sebagai
kandidat obat herbal untuk pengobatan diabetes.
1.5 Manfaat
Dari kegiatan penelitian yang dilakukan dalam praktek kerja lapangan ini, yaitu
mahasiswa memperoleh pengalaman dan wawasan pengetahuan yang baru mengenai
kimia komputasi, bioinformatika, literatur jurnal-jurnal, serta komponen-komponen
senyawa kimia dari propolis asia yang ditelusuri guna sebagai subjek dari penelitian
mahasiswa dan perusahaan terkait. Serta pengetahuan baru dalam pelaksanaan
penelitian yang dilakukan diluar laboratorium yaitu secara komputasi. Dengan
mengetahui betapa pentingnya pengembangan suatu inovasi baru yang lebih baik
untuk dapat digunakan di masa depan.