Anda di halaman 1dari 10

Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com

Jurnal Ilmu Makara

Volume 25
Pasal 3
masalah 1Berbaris

3-30-2021

Aktivitas Biologis dan Kelarutan 5-Methoxy-1,4-Benzoquinone


Memiliki Substituen Bromoheptyl dan Bromodecyl Dalam Sistem
n-Octanol/Air
Siti Mariyah Ulfa
Jurusan Kimia, Fakultas Sains, Universitas Brawijaya, Malang 65145, Indonesia,
ulfa.ms@ub.ac.id

Fath Dwisari
Jurusan Kimia, Fakultas Sains, Universitas Brawijaya, Malang 65145, Indonesia

Laras Pangesti
Jurusan Kimia, Fakultas Sains, Universitas Brawijaya, Malang 65145, Indonesia

Mohammad Farid Rahman


Sintesis dan Katalisis Kelompok Riset Produk Alam, Fakultas Sains, Universitas Brawijaya, Malang
65145, Indonesia

Ikuti ini dan karya tambahan di:https://scholarhub.ui.ac.id/science

Bagian dariBiokimia Umum,Bioinformatika Commons,Biokimia Medis Umum, danBahan Kimia


Organik Umum

Kutipan yang Direkomendasikan

Ulfa, Siti Mariyah; Dwisari, Fath; Pangesti, Laras; dan Rahman, Mohammad Farid (2021) “Aktivitas
Biologis dan Kelarutan 5-Methoxy-1,4-Benzoquinone Memiliki Substituen Bromoheptyl dan Bromodecyl
dalam Sistem n-Octanol/Air,”Jurnal Ilmu Makara: Jil. 25 : Ist. 1 , Pasal 3. DOI: 10.7454/mss.v25i1.1157

Tersedia di:https://scholarhub.ui.ac.id/science/vol25/iss1/3

Artikel ini dipersembahkan untuk Anda secara gratis dan akses terbuka oleh Universitas Indonesia di UI Scholars Hub. Telah
diterima untuk dimasukkan dalam Makara Journal of Science oleh editor resmi UI Scholars Hub.
Aktivitas Biologis dan Kelarutan 5-Methoxy-1,4-Benzoquinone Memiliki
Substituen Bromoheptyl dan Bromodecyl Dalam Sistem n-Octanol/Air

Catatan Kaki Halaman Sampul

Sebagian pendanaan keuangan didukung oleh INSINAS RISTEK No. 21/Add/SEK/INSINAS/PPK/VII/2015. Penulis
mengucapkan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada Universitas Ritsumeikan, Jepang, atas akses ke fasilitas NMR.

Artikel ini tersedia di Makara Journal of Science:https://scholarhub.ui.ac.id/science/vol25/iss1/3


Makara Journal of Science, 25/1 (2021), 13−20
doi: 10.7454/mss.v25i1.1157

Aktivitas Biologis dan Kelarutan 5-Methoxy-1,4-Benzoquinone Memiliki


Substituen Bromoheptyl dan Bromodecyln-Oktanol/Sistem Air

Siti Mariyah Ulfa1,2*, Fath Dwisari1, Laras Pangesti1, danMuhammadFarid Rahman1,2

1. Jurusan Kimia, Fakultas Sains, Universitas Brawijaya, Malang 65145, Indonesia


2. Sintesis dan Katalisis Kelompok Riset Hasil Alam, Fakultas Sains,
Universitas Brawijaya, Malang 65145, Indonesia

*
email: ulfa.ms@ub.ac.id

Diterima Februari 25, 2020 | Diterima 22 Agustus 2020

Abstrak

Aktivitas biologis dan kelarutan senyawa dipengaruhi oleh struktur kimianya. Sifat-sifat ini dapat ditingkatkan dengan
mensubstitusi alkil, alkoksi, dan/atau haloalkana dalam kerangka induk. Pada penelitian ini dilakukan sintesis 3-(7-
bromoheptyl)-2-methyl-5-methoxy-1,4-benzoquinone (3a) dan 3-(10-bromodecyl)-2-methyl-5-methoxy-1,4-benzoquinone
(3b) dicapai melalui reaksi dekarboksilasi. Kelarutan dan aktivitas biologis dari3adan3bdibandingkan dengan
thymoquinone (TQ), yang bertindak sebagai agen anti-inflamasi. senyawa3adan3bberhasil disintesis dan dianalisis
menggunakan Fourier Transform Infra-Red (FTIR) dan Nuclear Magnetic Resonance (NMR). Spektrum FTIR menunjukkan
peningkatan intensitas CHsp3dan absorpsi C-Br karena adanya substituen bromoheptil dan bromodesil.1H-NMR
menunjukkan pergeseran kimia yang menonjol dari metilen olefin padaδ 1,29–3,40 ppm. Uji kelarutan menunjukkan
perbedaan koefisien partisi (logP) dari3adan 3bdalamn-oktanol/sistem air. logPnilai-nilai dari3adan3blebih tinggi dariTQ,
menunjukkan bahwa metoksi, bromoheptil, dan bromodesil mendukung peningkatan kelarutan. Uji aktivitas biologis
dengan pendekatan in silico menunjukkan bahwa3adan3bmemiliki kecenderungan lebih tinggi untuk berikatan dengan
makromolekul translocator protein (TSPO) daripada makromolekul fosfatase dan tensin homolog (PTEN). Interaksi
pengikatan TSPO-3adan TSPO-3b, mirip dengan TSPO-TQ, menunjukkan bahwa kedua senyawa yang disintesis memiliki
aktivitas yang sebanding. Energi ikat TSPO- 3alebih rendah dari TSPO-3b, menunjukkan bahwa3amemiliki aktivitas yang
lebih tinggi untuk kandidat obat anti-inflamasi daripada3b.

Kata kunci:1,4-benzokuinon, bromoalkilasi, koefisien partisi, timokuinon, lipofilisitas

pengantar turunan kuinon, termasuk kationik teralkilasiTQ,


seperti SkQT1 dan SkQ1, juga telah dilaporkan [6].
Kuinon alami, seperti 2-isopropil-5- metil-1,4- SkQT1 dan SkQ1 adalah antioksidan potensial yang
benzokuinon, juga dikenal sebagai timokuinon (TQ), menargetkan mitokondria karena membran dalam
merupakan konstituen aktif dariNigella sativaminyak biji mitokondria bermuatan negatif. Baru-baru ini,
[1]. Efek terapeutik dariN. sativaminyak biji dengan TQ sintesis benzokuinon yang memiliki substituen
pada pengobatan beberapa penyakit kronis, seperti bromoalkil, seperti 3-(10-bromodesil)-5-isopropil-2-
kanker dan gangguan inflamasi, telah diselidiki [2,3]. metil-1,4-benzokuinon [7], 5-(7-bromoheptil)-2,3-
Namun, studi farmakokinetik TQ dengan pemberian oral [8], 2-(5-bromoamil)-3,5-
dimetil-1,4-benzokuinon dimetil-1,4-benzokuinon [9],
pada model hewan menunjukkan eliminasi yang cepat dan turunan fosfonium-1,4-benzokuinon, telah
dan penyerapan yang relatif lambat [4]. Untuk dilaporkan [10] (Gambar 1). Analisis in silico senyawa
meningkatkan bioavailabilitas dan aktivitas biologis obat ini menunjukkan bahwa substituen bromoheptil (C7)
berbasis kuinon, modifikasi struktur dengan dan bromodesil (C10) efektif meningkatkan kelarutan
memasukkan gugus fungsi polar dan/atau nonpolar, dalam n-oktanol/sistem air. Sebaliknya, metoksi (-
seperti substituen metoksi dan bromoalkil, telah menjadi OMe) yang terikat pada 5-metil-1,4-benzokuinon
topik yang menjanjikan dan menarik. tanpa substituen bromoalkil mengakibatkan
penurunan kelarutan [11]. Dalam penelitian ini,
Agen alkylating yang mengandung kuinon, seperti sintesis turunan 1,4-benzokuinon dengan substituen
mitomycin C, juga dikenal sebagai "obat alkilasi bioreduktif," metoksi dan bromoalkil diusulkan untuk
mengacu pada obat dengan substituen elektrofilik untuk meningkatkan aktivitas biologis dan kelarutan
mengikat secara kovalen ke makromolekul seluler [5]. Novel senyawa.

13 Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1


14Ulfa, dkk.

Gambar 1. Contoh Derivatif Berbasis Kuinon

Pertama, kelarutan senyawa kandidat obat menggunakan docking molekuler in silico, dengan TSPO dan
dipertimbangkan. Kemudian, aktivitas biologis senyawa PTEN sebagai makromolekul.
kandidat obat dievaluasi menggunakan docking
molekuler in silico antara makromolekul (protein atau Bahan dan metode
enzim) dan ligan [12]. Pengikatan senyawa dengan
reseptor spesifik dihitung untuk energi bebas (GHai) Bahan.2-Metil-1,4-benzokuinon (1) diperoleh dari
kompleks protein-ligan, konstanta penghambatan (Ki), Sigma-Aldrich (Singapura) dan langsung digunakan
dan konsentrasi penghambatan setengah-maksimal (IC50 untuk sintesis 2-metil-5-metoksi-1,4-benzokuinon (2).
). Data dari banyak kandidat obat telah dianalisis Bahan kimia lainnya, seperti asam 8-bromooctanoic
berdasarkan nilai Ki dan bukan IC50nilai karena Ki adalah (C8H15Kawan2), asam 11-bromondekanoat (C11H21
kuantitas intrinsik dan termodinamika yang tergantung Kawan2), dan amonium persulfat ((NH4)2S2HAI4), juga
pada enzim dan inhibitor. Sebaliknya, IC50nilainya dibeli dari Sigma-Aldrich (Singapura). Perak nitrat
tergantung pada konsentrasi makromolekul target, (AgNO3) dan natrium sulfat (Na2JADI4) diperoleh dari
inhibitor, dan ligan, bersama dengan kondisi Merck (Singapura) dan digunakan sebagai bahan
eksperimental lainnya [13]. Makromolekul target untuk pengering. Pelarut asetonitril, etil asetat, dietil eter,
desain in silico dekat dengan penyakit manusia dan dann-heksana yang dipasok oleh Merck (Singapura)
berikatan dengan molekul kecil untuk menghasilkan adalah kelas analitis.
suatu fungsi [14]. Dalam penelitian ini, kami
memperkenalkan protein translocator (TSPO) dan Instrumentasi.UV–Visible Shimadzu 1600, FTIR
phosphatase dan tensin homolog (PTEN). TSPO adalah Shimadzu 8400S, HPLC Shimadzu LC-20AD
protein transmembran 18 kDa yang terutama ditemukan Prominence dengan detektor FID, dan spektroskopi
di membran luar mitokondria, yang terutama menekan NMR JEOL ECS400 digunakan dalam penelitian ini.
gangguan inflamasi. TSPO adalah model protein
prospektif karena interaksinya dengan ligan endogen Perpaduan dari itu 5-metoksi-1,4-benzokuinon
dan eksogen, yaitu memiliki substituen metoksi, jarang turunan 3a dan 3b.2-Metil-5-metoksi-1,4- benzokuinon (
dilaporkan. Keluarga molekul heterosiklik dengan 2) dibuat dengan substitusi metoksi menjadi 2-metil-1,4-
setidaknya satu nitrogen dan/atau gugus karbonil (C=O) benzokuinon (1) menggunakan metanol sebagai
merespon TSPO [15]. Makromolekul lain adalah PTEN, nukleofil (Skema 1) menurut penelitian sebelumnya [11].
Menggabungkan2diperoleh sebagai kristal jarum kuning
dan langsung digunakan untuk sintesis3adan3b. Sintesis
Singkatnya, kami menyoroti sintesis 3-(7- dari3adan3bdicapai melalui reaksi dekarboksilasi
bromoheptyl)-2-methyl-5-methoxy-1,4-benzoquinone sebagai berikut [8]: Senyawa2(2,0 mmol, 304 mg)
(3a) dan 3-(10-bromodecyl)-2-metil-5-metoksi-1,4- digabungkan dengan asam 8-bromooctanoic (2,1 mmol,
benzokuinon (3b). Kelarutan dievaluasi menggunakan 468 mg) untuk mensintesis 3aatau asam 11-
metode shake-flask. Aktivitas biologis dievaluasi bromondekanoat (2,1 mmol, 556 mg) untuk

Makara J.Sci. Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1


Aktivitas Biologis dan Kelarutan 5-Metoksi-1,4-Benzokuinon15

mempersatukan3b. AgNO3(1,0 mmol, 169 mg) dan berasal dari daerah puncak3adan3bdin-oktanol (A
asetonitril/H2O (2:1) ditambahkan dan diaduk pada suhu Hai) dan air (Aw) dibagi dengan volumen- oktanol (V
80 °C. Selanjutnya (NH4)2S2HAI8(2 mmol, 456 mg) dalam 3 Hai) dan air (Vw) partisi.
mL H2O ditambahkan tetes demi tetes, diaduk selama
60-90 menit, dan dipertahankan pada suhu 70 °C hingga
80 °C. Campuran yang diperoleh diekstraksi dengan
(1)
dietil eter. Fasa organik dipisahkan dan dikeringkan di
atas Na2JADI4. Kelebihan pelarut diuapkan untuk
mendapatkan produk cair berwarna merah kecoklatan. Evaluasi biologis 3a dan 3b menggunakan
Produk mentah dimurnikan dengan SiO2kromatografi pendekatan in silico.Evaluasi biologis dari3adan3b
kolom menggunakann- heksana/kloroform (rasio 6:4 (v/ dilakukan dengan menggunakan AutoDock4. Struktur
v)).3adan3bdikarakterisasi menggunakan FTIR Shimadzu ligan dari 3a,3b, danTQdioptimalkan menggunakan
8400S, UV-Visible Shimadzu 1600, dan1H-NMR 400 MHz HyperChem dan disimpan dalam format .pdb. Model
dalam CDCl3dan TMS sebagai standar internal. Sifat fisik makromolekul TSPO dan PTEN diunduh dari
senyawa sintesis: 3-(7-bromoheptyl)-2-methyl-5- www.rcsb.org dan disimpan dalam format .pdb. Air dan
methoxy-1,4-benzoquinone (3a): minyak kuning (20 mg; ligan eksternal dihilangkan dari makromolekul. Proses
1,41%). Analisis kromatografi lapis tipis (KLT) docking terdiri dari dua langkah utama yaitu
menggunakann-heksana/etil asetat (7:3) menghasilkan menjalankan AutoGrid (konversi format ke .gpf) dan
Rf = 0,62; Analisis UV–Vis dihasilkan-maksimal= 264nm menjalankan AutoDock (konversi format ke .dpf).
Analisis FTIR (cm1): 2.925 (CH sp3), 1.728 (C=O), 1.649 Parameter AutoDock digunakan untuk menghitung suku
(C=C), 1.460 (CH2), 1.274 (CO), 565 (C-Br);1H-NMR (400 van der Waals dan elektrostatik. Simulasi docking
MHz, CDCl3)δ 8,09 (dtk, 1H, H-1), 3,91 (dtk, 3H, –OCH3), dilakukan dengan menggunakan algoritma genetika
3,40 (t, 2H,J=6,4 Hz, H-3), 2,41 (t, 2H,J=7.1Hz, H- Lamarckian. Kotak grid untuk makromolekul yang
4), 2,02 (dtk, 3H, H-5), 1,85 (m, 2H,J=6.4, 7.1 Hz, H-6), digunakan dalam penelitian ini dirancang menggunakan
1.56-1.28 (h, 8H,J=6.4, 7.1 Hz, H-7). 3-(10- bromodecyl)-2- AutoGrid4, dengan dimensi kotak TSPO untuk3a, 3b, dan
methyl-5-methoxy-1,4-benzoquinone (3b): minyak kuning TQdarix=32.778,kamu=17,093, danz=69.101 dan dimensi
(10 mg; 0,76%). Analisis KLT menggunakann- heksana/ kotak PTEN untuk3a,3b, danTQdarix=
etil asetat (7:3) menghasilkan Rf = 0,58; Analisis UV–Vis 268.883,kamu=19.827, danz=47.339. AutoDock4
dihasilkan-maksimal= 260nm Analisis FTIR (cm1): 2.854 (CH dijalankan untuk menentukan energi minimum untuk
sp3), 1.647 (C=O), 1.460 (C=C), 1.226 (C- setiap ikatan. Hasil interaksi pengikatan (Ki), energi
O), 636 (C-Br);1H-NMR (400 MHz, CDCl3)δ 8,09 (dtk, minimum, dan interaksi asam amino dan ligan dianalisis
1H, H-1), 3,91 (dtk, 3H, –OCH3), 3,40 (t, 2H,J=6,4 Hz, menggunakan Discovery Studio Visualizer [8].
H-3), 2,41 (t, 2H,J=6,8 Hz, H-4), 2,02 (dtk, 3H, H-5),
1,85 (m, 2H,J=6,4 Hz, H-6), 1,38-1,28 (h, 14H,J= Hasil dan Diskusi
6,4Hz, H-7).
Sintesis dari3adan3bdicapai melalui reaksi
Uji kelarutan 3a dan 3b dalamn-oktanol/sistem air. dekarboksilasi menggunakan asam 8-
Sebelum dilakukan uji kelarutan, dibuat fasa hidrofobik bromooctanoic dan asam 11-bromoundecanoic.
dan hidrofilik sesuai dengan prosedur berikut [17]: Rute sintesis ditunjukkan dalamSkema 1.senyawa
Larutan dapar fosfat (pH 7,4) dibuat dengan 3adan3bdiperoleh minyak berwarna kecoklatan
mencampurkan 67 mL NaH2PO4·H2O (0,1 M) dengan 330 dengan rendemen 1,41% dan 0,76%. Dibandingkan
mL Na2HPO4(0,1 M). Solusi ini ditunjuk sebagai sistem air. dengan reaksi serupa, produk menghasilkan3adan
Sistem air jenuh dengann-oktanol untuk mendapatkan 3bmelalui reaksi dekarboksilasi relatif rendah.
fase hidrofilik. Sementara itu, fase hidrofobik disiapkan Adanya metoksi (–OMe) padameta-posisi mungkin
dengan cara menjenuhkann-oktanol dengan sistem air. menekan reaksi alkilasi [18]. Strategi sintesis harus
Kedua larutan dicampur setidaknya selama 24 jam dan ditingkatkan untuk meningkatkan hasil reaksi
kemudian dipisahkan. senyawa3a,3b, danTQdilarutkan dengan memperpanjang waktu reaksi dan/atau
dalamn-oktanol (10 mM). Kemudian,n-oktanol yang meningkatkan suhu reaksi.
mengandung senyawa dicampur dengan air dalam
partisi 3:7 (v/v) selama 1 jam pada suhu kamar Analisis KLT menunjukkan bahwa3adan3bmemiliki faktor
menggunakan pengocok orbital. Kemudian,n-oktanol retardasi (Rf) yang sama. Dibandingkan dengan 2-metil-5-
dan air dipisahkan. Analisis HPLC air dann-oktanol metoksi-1,4-benzokuinon (2), kedua produk alkilasi 3adan3b
dilakukan dengan menginjeksikan 2 L masing-masing menunjukkan Rf yang lebih besar, yang menunjukkan
partisi dengan laju alir 0,5 mL/menit pada suhu 37 °C. bahwa penyisipan gugus alkil ke dalam 1,4-benzokuinon
Distribusi masing-masing senyawa dalamn- oktanol dan menurunkan polaritas senyawa. Analisis tambahan
air dihitung menggunakan Persamaan. 1, dimana Coktanol menggunakan UV–Vis menunjukkan bahwa pengenalan alkil
dan Cairadalah konsentrasi obat total dalamn- oktanol meningkatkan panjang gelombang3adan3b, menghasilkan
dan air. Konsentrasi obat total adalah pergeseran merah. Analisis FTIR dari3a,3b, dan2(Gambar 2)

Makara J.Sci. Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1


16Ulfa, dkk.

Skema 1. Ikhtisar Sintesis

Gambar 2. Spektrum FTIR 3a (kiri) dan 3b (kanan)

menunjukkan perbedaan yang signifikan antara puncak singlet pada 1,56 ppm (3H, s). Beberapa kotoran
senyawa tersebut. Peningkatan intensitas CHsp3 diδ 0,88 ppm dari minyak silikon juga diamati. Hasil
puncak pada 2.924 cm1(3a) dan 2.854 cm1(3b) analisis NMR konsisten dengan data yang dilaporkan
disebabkan oleh substitusi alkil pada benzokuinon. sebelumnya [7,8].
Puncak baru pada 646 dan 636 cm1sesuai dengan C-
Br dalam senyawa3adan3b, masing-masing. Analisis Uji kelarutan, dihitung sebagai logP, dilakukan dengan
keseluruhan menunjukkan bahwa penambahan menggunakan metode shake-flask dengann-oktanol dan
substitusi alkil pada proses sintesis telah berhasil [8]. air sebagai sistem partisi [17]. distribusi dari3adan 3b
dalamn-oktanol/sistem air ditentukan dengan HPLC.n
Struktur kerangka kuinon dari3adan3bserupa; oleh -Octanol umumnya digunakan sebagai model pelarut
karena itu, hanya senyawa3adibahas secara rinci sebagai untuk memahami partisi senyawa dari air ke dalam
berikut (lihatTabel 1,Gambar 3): Adanya puncak singlet membran lipid [19]. logPnilai-nilai dari3adan 3b
diδ 8,09 ppm (1H,s) menunjukkan bahwa satu proton ditampilkan dalamMeja 2. Hasilnya menunjukkan log
terikat pada cincin benzokuinon. Dari pola ini yang sedikit lebih tinggiPnilai untuk3adari itu untukTQ.
diasumsikan bahwa reaksi alkilasi hanya menggantikan Menggabungkan 3bmemiliki log tertinggiPnilai di antara
satu proton pada C-3 atau C-6. Analisis lebih lanjut senyawa lain; jadi, orde kelarutan adalah3b>3a> TQ.
menunjukkan proton muncul di daerah medan tinggi diδ Perbandingan lognyaPperhitungan menggunakan
0,85-2,41 ppm, yang menunjukkan proton alifatik. program ALOGPS 2.1 [20] dan analisis in vitro (metode
Puncaknya padaδ 2,41 ppm (2H, br) sesuai dengan HPLC) menunjukkan bahwa urutan kelarutan adalah
proton metilen yang terikat langsung pada cincin kuinon sama. Dengan demikian, peningkatan substituen alkil
dengan urutan Ar–CH2–R, dan puncaknya diδ secara bersamaan meningkatkan kelarutan senyawa
1,85 ppm (2H, m) sesuai dengan proton metilen dalamnfase -oktanol. Hasil ini mengikuti aturan lima
yang terikat langsung pada cincin kuinon dengan Lipinski, yaitu logPnilai untuk pemberian oral calon obat
urutan R–CH2-R. Kelipatan lainnya pada 1,56-1,28 tidak lebih dari 5 [21]. Dua faktor utama dapat
(8H, m) sesuai dengan metilen alifatik dalam merasionalisasi pengaruh substituen alkil terhadap
alkana jenuh. Terminal metilen, yang terikat kelarutan senyawa dalamn-oktanol/sistem air, yaitu
langsung dengan bromin R–CH2–Br, diamati diδ polaritas molekul dan kecenderungan ikatan hidrogen
3,40 ppm (t, 2H,J=6,4Hz). Proton metil bergeser ke dengan pelarut [19].
1,84 ppm (3H, s), dan metoksi terdeteksi sebagai

Makara J.Sci. Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1


Aktivitas Biologis dan Kelarutan 5-Metoksi-1,4-Benzokuinon17

Gambar 3. Penentuan Struktur Senyawa 3a dan 3b

Tabel 1.1Data Spektral H-NMR Senyawa 3a dan 3b


3a 3b
Posisi
δH(Jdalam Hz) δH(Jdalam Hz)
1 8.09 (s, 1H) 8.09 (s, 1H)
2 3,91 (s, 3H, -OCH3) 3,91 (s, 3H, -OCH3)
3 3,40 (t, 2H,J=6.4) 3,51 (t, 2H,J=6.4)
4 2,41 (t, 2H,J=7.1) 2,41 (t, 2H,J=7.1)
5 2.02 (s, 3H) 2,43 (s, 3H)
6 1,85 (m, 2H,J=6.4, 7.1) 1,85 (m, 2H,J=6.4, 7.1)
7 1.56–1.28 (m, 8HJ=7.1, 6.4) 1,29 (m, 14H,J=7.1, 6.4)

Tabel 2. Uji Kelarutan bahwa senyawa ini memiliki interaksi yang lebih kuat
dengan TSPO dibandingkan dengan PTEN. Menggabungkan
catatanP
Menggabungkan 3amemiliki nilai Ki lebih rendah dari3bsebesar 1,71 kali lipat,
In vitrosebuah Ramalanb
danTQmemiliki nilai Ki lebih rendah dari3asebesar 1,88 kali
3a 2.22 3.64
3b 3.03 5.00 lipat. Urutan penghambatan terhadap ligan TSPO adalahTQ
TQ 2.17 2.80 >3a>3b. Meskipun senyawa3adan3bmemiliki energi ikat
a) analisis HPLC lebih rendah dari TQ, keberadaan substituen 7-bromoheptil
b) Diprediksi menggunakan program ALOGPS 2.1
di3a lebih menguntungkan daripada 10-bromodecyl in3b.
Menggabungkan3bmemiliki substituen alkil yang lebih
Tabel 3. Data in silico 3a, 3b, dan TQ dengan model panjang dari3a; Namun, itu tidak memastikan
makromolekul TSPO dan PTEN penghambatan yang lebih baik terhadap makromolekul
target. Substituen alkil yang lebih panjang meningkatkan log
∆GHai Ki IC50 P(Meja 2); Namun, itu mungkin menekan aktivitas [22]. IC
Makromolekul Ligan
(kkal/mol) (µM) (µg/mL)
yang diprediksi50nilai-nilai dari 3adan3bmendukung urutan
3a 5.52 92.16 60.68
nilai Ki. Singkatnya, senyawa3amenunjukkan sifat yang lebih
TSPO 3b 5.21 157,92 117.40
TQ 5,88 49.02 16.10 baik sebagai kandidat obat daripada3buntuk interaksi
3a 5.07 214.29 141.10 dengan makromolekul TSPO.
PTEN 3b 4.59 434,77 323.22
TQ 4.77 335.29 110.11 Konfirmasi residu pengikatan substrat antara ligan3adan
3bdengan TSPO dan PTEN ditunjukkan pada Gambar 4.
Interaksi pengikatan residu asam amino pada PTEN-3a
Kegiatan dari3a,3b, danTQdianalisis menggunakan dan PTEN-3bkurang dari itu di TSPO-3adan TSPO-3b.
docking molekuler in silico. Interaksi yang mengikat dari Hasil ini mendukung prediksi bahwa aktivitas3adan3b
3a,3b, danTQdengan model makromolekul TSPO dan dengan PTEN lebih rendah dibandingkan dengan TSPO.
PTEN juga dievaluasi. Data yang dikumpulkan dari Analisis lebih lanjut mengungkapkan ikatan hidrogen
docking molekuler in silico digambarkan dalam:Tabel 3. dan interaksi van der Waals antara enzim dan substrat,
Energi ikat (∆GHai) dari3a,3b, danTQdengan TSPO yang merupakan hubungan kritis antara ligan dan
bervariasi dari 5,21 kkal/mol sampai 5,88 kkal/mol. makromolekul. Cincin kuinon aromatik menyala3atelah
Namun, energi ikat (∆GHai) dari3a,3b, danTQ dengan secara aktif berinteraksi dengan residu TRP135 dengan
PTEN sedikit lebih tinggi dibandingkan dengan TSPO. kelompok indole backbone (N- asam amino aromatik),
menunjukkan interaksi van der Waals. Selain itu, karbonil
Ketiga senyawa tersebut menunjukkan kecenderungan untuk dari kuinon terikat kuat dengan hidrogen pada rantai
menghambat model makromolekul karenaGHaimemiliki nilai peptida dari gugus amino TRP50. Sifat hidrofobik dari
negatif. nilai Ki (Tabel 3) dari3a,3b, danTQmenunjukkan

Makara J.Sci. Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1


18Ulfa, dkk.

TSPO-3a TSPO-3b

PTEN-3a PTEN-3b
Gambar 4. Visualisasi Molekuler Interaksi Pengikatan Ligan 3a dan 3b dengan TSPO dan PTEN

residu benzil dari PHE46 dan PHE92 berinteraksi kuat Kesimpulan


dengan gugus alkil dari3a. Namun, dibandingkan
dengan interaksi TSPO-3b, tidak terjadi ikatan Sintesis 5-metoksi-1,4-benzokuinon yang memiliki
hidrogen antara karbonil dan residu asam amino dari substituen bromoheptil dan bromodesil3adan3b dicapai
TRP50. Interaksi yang signifikan adalah interaksi van melalui reaksi dekarboksilasi. Evaluasi kelarutannya
der Waals antara residu alkil dan hidrofobik, seperti menunjukkan bahwa substituen bromoalkil meningkatkan
TRP135, ILE134, dan ALA49. Interaksi kuinon dengan kelarutan senyawa dalamn- oktanol. Kegiatan dari3adan3b
TRP135 pada TSPO-3bmemiliki jarak yang lebih jauh terhadap makromolekul TSPO menunjukkan bahwa TSPO-3a
(5,94 ) dari TSPO-3a (4,44 ). Ikatan hidrogen pada memiliki energi ikat yang lebih rendah dan IC50dari TSPO-3b.
TSPO-3adengan TRP50 memiliki jangkauan yang Analisis residu pengikatan substrat menunjukkan bahwa
relatif dekat, yakni 1,52 . Dengan demikian, kami TSPO-3amemiliki ikatan hidrogen yang lebih kuat dengan
menyimpulkan bahwa residu ini sangat penting untuk residu asam amino daripada TSPO-3b, menunjukkan bahwa
ikatan substrat karena lokasinya dalam jarak ikatan TSPO-3amemiliki aktivitas yang lebih baik daripada TSPO-3b.
hidrogen (<3 ) ke substrat [23]. Hasil keseluruhan Pengikatan3adan3b terhadap PTEN menunjukkan interaksi
menunjukkan bahwa penambahan residu alkil, yaitu yang lebih rendah dibandingkan dengan TSPO.
7-bromoalkil, ke cincin kuinon sebagian mendukung Penambahan bromoheptyl dan bromodecyl ke cincin 1,4-
kelarutan dan meningkatkan aktivitas dengan TSPO benzoquinone meningkatkan kelarutan. Jadi, ikatan senyawa
sebagai makromolekul target.

Makara J.Sci. Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1


Aktivitas Biologis dan Kelarutan 5-Metoksi-1,4-Benzokuinon19

dengan TSPO menunjukkan bahwa3amerupakan senyawa yang Analisis Aktivitas: Pendekatan In-silico. Prosiding
menjanjikan untuk kandidat obat anti inflamasi. Konferensi AIP. 020102. https://doi.org/
10.1063/1.4978175.
Pengakuan [9] Ulfa, SM, Dwisari, F., Sally, AC, Rahman, MF
2020. Pengaruh Substituen Metil Terhadap
Sebagian pendanaan keuangan didukung oleh INSINAS RISTEK Kelarutan Derivatif 1,4-Benzokuinon Padan-
No. 21/Add/SEK/INSINAS/PPK/VII/2015. Penulis mengucapkan Sistem Oktanol/air. J.Kim. Sains. ap. 23: 142–6.
terima kasih yang sebesar-besarnya kepada Universitas https://doi.org/10.14710/jksa.23.5.142-146.
Ritsumeikan, Jepang, atas akses ke fasilitas NMR. [10] Furoida, A., Ulfa, SM 2019. Sintesis 3-(7-
Triphenylphosphonioheptyl)-2,6-dimethyl-1,4-
Referensi benzoquinone) dan Uji Aktivitas Terhadap
Enzim Glikogen Fosforilase:Dalam silikon
[1] Amin, B., Hosseinzadeh, H. 2015. Jintan Hitam ( Mendekati. IOP Conf Ser: Mater Sci Eng 546:
Nigella sativa) dan Konstituen Aktifnya, 062008. https://doi.org/10.1088/1757-899X/
Thymoquinone: Tinjauan tentang Efek Analgesik 546/ 6/062008.
dan Anti-inflamasi. Planta Med. 82: 8– 16, https:// [11] Dwisari, F., Srihardyastuti, A., Ulfa, SM 2019.
doi.org/10.1055/s-0035-1557838. Sintesis dari 2-Metil-5-metoksi-1,4-
[2] Rashidmayvan, M., Mohammadshahi, M., benzoquinone dan Profil Aktivitas In-silico
Seyedian, SS, Haghighizadeh, MH 2019. Terhadap Sitokrom P450-3A4. IOP Conf Ser:
PengaruhNigella sativaMinyak pada Penanda Mater Sci Eng. 546: 062005. https://doi.org/
Inflamasi Kadar Serum, Enzim Hati, Profil 10.1088/1757-899X/546/6/062005.
Lipid, Insulin dan Gula Darah Puasa pada [12] Ekins, S., Mestres, J., Testa, B. 2007. Dalam
Penderita Hati Berlemak Non-alkohol. J. Farmakologi Silico untuk Penemuan Obat:
Diabetes. Meta gangguan. 18: 453–9, https:// Metode untuk Skrining dan Profil Ligan Virtual.
doi.org/10.1007/s40200-019-00439-6. sdr. J. Farmakol. 152: 9-20. https://doi.org/
[3] Johnson-Ajinwo, OR, Ullah, I., Mbye, H., 10.1038/sj. bjp.0707305.
Richardson, A., Horrocks, P., Li, WW. 2018. [13] Cer, RZ, Mudunuri, U., Stephens, R., Lebeda,
Sintesis dan Evaluasi Analog Thymoquinone FJ 2009. IC50-to-Ki: Alat Berbasis Web untuk
Sebagai Agen Anti Kanker ovarium dan Mengubah Nilai IC50 ke Ki untuk Penghambat
Antimalaria. Bioorg. Med. Kimia Lett. 28: Aktivitas Enzim dan Pengikatan Ligan. Asam
1219-1222. Nukleat Res. 37: 441-445. https://doi.org/
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2018.02.051. 10.1093/nar/gkp253.
[4] Alkhrafy, K., Ahmad, A., Khan, R., Al-Shagha, W. [14] Anderson, AC 2003. Proses Perancangan Obat
2015. Farmakokinetik Plasma Perilaku Berbasis Struktur. Kimia & Biologi. 10: 787–97.
Intravena dan Oral Bioavailabilitas https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2003.
Thymoquinone pada Model Kelinci. Eur. J. 09.002.
Obat. Meta Farmakokinet. 40: 319-323. https:// [15] Lacapere, JJ., Duma, L., Finet, S., Kassiou, M.,
doi.org/10.1007/s13318-014-0207-8. Papadopoulos, V. 2019. Wawasan Fitur
[5] Lin, J., Cosby, LA, Sartorelli, C. 1972. Agen Struktural TSPO: Implikasi untuk
Alkylating Bioreduktif Potensial. 1. Turunan Pengembangan Obat. Tren Pharmacol. Sci.
Benzokuinon. J. Med. Kimia 15: 1247-1252. S0165614719302652. https://doi.org/10.1016/
[6] Antonenko, YN, Avetisyan, AV, Bakeeva, LE, j.tips.2019.11.005.
Chernyak, BV, Chertkov, VA, Domnina, LV, dkk. [16] Arafa, E-SA., Zhu, Q., Shah, ZI, Wani, G., Barakat, BM,
2008. Derivatif Plastoquinone Bertarget Racoma, I.,dkk.2011. Thymoquinone Up-mengatur
Mitokondria sebagai Alat untuk Mengganggu Ekspresi PTEN dan Menginduksi Apoptosis pada Sel
Eksekusi Program Penuaan. 1. Turunan Kanker Payudara Manusia yang resisten terhadap
Kationik Plastokuinon: Sintesis dan Studi In Doxorubicin. mutasi. Res. 706: 28-35. https://
Vitro. Biokimia (Mosc). 73: 1273-1287. https:// doi.org/10.1016/j.mrfmmm.2010.10.007.
doi.org/10.1134/S0006297908120018. [17] Andrés, A., Rosés, M., Ràfols, C., Bosch, E.,
[7] Setyatama, NE, Ulfa, SM, Okamoto, H. 2018. Espinosa, S., Segarra, V., dkk. 2015. Pengaturan
Sintesis dan Analisis Aktivitas 3-(10- dan Validasi Prosedur Shake-flask untuk
Bromodecyl)-5-isopropil-2-metil-1,4- Penentuan Koefisien Partisi (logD) dari Jumlah
benzoquinone: Pendekatan in-silico. Prosiding Obat Rendah. Eur. J. Farmasi. Sci. 76: 181-191.
1st International Conference in One Health https://doi.org/10.1016/j.ejps.2015.05.008.
(ICOH 2017), Malang, Indonesia: Atlantis Press. [18] Xu, XL., Li, Z. 2017. Alkilasi Elektrofilik Katalitik
https://doi.org/10.2991/icoh-17.2018.24. darip-Kuinon melalui Reaksi Berantai Redoks.
[8] Ulfa, SM, Sholikhah, S., Utomo, EP 2017. Sintesis Angew. Kimia Int. Ed. 56: 8196–200. https://
Turunan Timokuinon dan Sifatnya doi.org/10.1002/anie.201702885.

Makara J.Sci. Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1


20Ulfa, dkk.

[19] Rich, PR, Harper, R. 1990. Koefisien Partisi [22] Iitsuka, Y., Tanaka, Y., Hosono-Fukao, T., Hosono,
Kuinon dan Hidrokuinon dan Hubungannya T., Seki, T., Ariga, T. 2009. Hubungan Lipofilisitas
dengan Reaktivitas Biokimia. FEBS Lett. 269: dan Aktivitas Inhibisi Terhadap Pertumbuhan Sel
139-144. https://doi.org/10.1016/0014- Kanker Sembilan Macam Alk(en)yl Trisulfida
5793(90)81139-F. Dengan Rantai Samping Yang Berbeda. Onkol.
[20] Tetko, IV, Tanchuk, V.Yu. 2002. Penerapan Res. 18: 575–82. https://doi.org/10.3727/
Jaringan Syaraf Tiruan Asosiatif untuk Prediksi 096504010X12767359113965.
Lipofilisitas pada Program ALOGPS 2.1. J. Kimia. [23] Yan, ECY, Kazmi, MA, Ganim, Z., Hou, JM., Pan, D.,
Inf. Hitung. Sci. 42: 1136-1145. https://doi.org/ Chang, BSW,dkk.2003. Sakelar counterion retina
10.1021/ci025515j. dalam fotoaktivasi reseptor rhodopsin yang
[21] Lipinski. CA, Lombardo, F., Dominy, BW, Feeney, PJ 2012. digabungkan dengan protein G. Prok. Natal
Pendekatan Eksperimental dan Komputasi untuk akad. Sci. 100: 9262-92677. https://doi.org/
Memperkirakan Kelarutan dan Permeabilitas dalam 10.1073/pnas.1531970100.
Pengaturan Penemuan dan Pengembangan Obat. Adv.
Pengiriman Obat Wahyu 64: 4-17.

Makara J.Sci. Maret 2021 - Jil. 25 - No. 1

Anda mungkin juga menyukai