Journal Of Marine Research.

Volume 2, Nomor 1, Tahun 2013, Halaman 1-6

Online di: http://ejournal-s1.undip.ac.id/index.php/jmr

Uji Penggunaan Bacillus sp. sebagai Kandidat Probiotik Untuk

Pemeliharaan Rajungan (Portunus sp.)

Kharisma Firdaus Linggarjati, Ali Djunaedi, Subagiyo *)

Program Studi Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro
Kampus Tembalang, Semarang 50275 Telp/Fax. 024-7474698

Email: kharismafirdaus@yahoo.com

Abstrak
Rajungan merupakan salah satu komoditas laut yang bernilai ekonomis dan memiliki
potensi ekspor yang tinggi. Selama ini kebutuhan rajungan banyak dipenuhi dari hasil
tangkapan alam, dikarenakan dalam budidaya rajungan belum berkembang baik.
Kelulushidupan rajungan rendah yang disebabkan oleh penyakit bakteri vibrio, selain itu
kandungan nitrogen dan fosfat juga dapat mempengaruhi kualitas media pemeliharaan
rajungan. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan pengujian pengaruh aplikasi kandidat
probiotik bacillus terhadap kualitas air dan jumlah total bakteri pada media pemeliharaan
rajungan. Penelitian dilakukan 2 tahap yaitu isolasi dan seleksi bakteri bacillus sebagai
probiotik dan pengujian pengaruh pemberian probiotik bacillus terhadap kualitas air dan
jumlah total bakteri. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pemberian kandidat probiotik
bacillus dengan kepadatan 106 cfu/ml dapat menurunkan kandungan amoniak (NH3), nitrit
(NO2) dan jumlah total bakteri. Sedangkan pemberian kandidat probiotik dengan kepadatan
105 cfu/ml dapat menurunkan jumlah total bakteri media pemeliharaan rajungan, akan tetapi
tidak menurunkan kandungan amoniak (NH3) dan nitrit (NO2).

Kata kunci : Rajungan, Bacillus, Probiotik

Abstrack
Blue crab is one of the economically marine commodities and have high potential
export. During this blue crab requirement derived from nature catches because in blue crab
aquaculture not yet good branch out. To low survival rate of blue crab caused by bacterium
vibrio disease, in addition to the content of nitrogen and phosphate can also affect the blue
crab medium. This research as a purpose to test the effect of probiotic bacillus aplication to
water quality and the total number of bacteria in the blue crab medium. the research was
conducted with 2 stages, that is isolation and selection bacillus bacteria stages as probiotic and
testing phase the effect of probiotic bacillus on water quality and the total number of bacteria.
The result showed that probiotic bacillus with density 106 cfu/ml to reduce the content of
ammonia (NH3), nitrite (NO2) and the total number of bacteria. While probiotics with density
105 cfu/ml to reduce the total number of bacteria in the blue crab medium, but have not been
able to reduce the content of ammonia (NH3) and nitrite (NO2).

Key words : Blue Crab, Bacillus, Probiotic

*)
Penulis penanggung jawab
 Journal Of Marine Research. Volume 2, Nomor 1, Tahun 2013, Halaman 2
Pendahuluan
Rajungan merupakan salah satu
komoditas laut yang bernilai ekonomis
serta memiliki potensi ekspor yang tinggi.
Produksi rajungan di Indonesia 60%
diekspor ke Amerika sedangkan sisanya
diekspor ke beberapa negara tujuan ekspor
lainnya seperti Singapura, Jepang, Belanda
dan Eropa (Susanto et al., 2004).
Disamping itu, rajungan memiliki
keunggulan nilai gizi yaitu kandungan
proteinnya cukup tinggi sekitar 16 – 17 g
per 100 g berat rajungan (Coleman, 1991
dalam Jafar, 2011).
Selama ini kebutuhan rajungan
dipenuhi dari hasil tangkapan alam
dikarenakan pengembangan budidaya
rajungan masih banyak kendala
diantaranya adalah rendahnya tingkat
kelulushidupan yang disebabkan oleh faktor
penyakit. Jenis penyakit yang sering
menyerang hewan kelas crustacea (seperti
udang, kepiting bakau dan rajungan)
adalah infeksi jamur Lagenidium sp. ,
Haliphthoros sp. serta bakteri Vibrio
harveyii (Taufik dan Zafran, 1997). Selain
disebabkan oleh faktor penyakit, parameter
kualitas air juga dapat menjadi kendala
seperti amoniak, nitrit, nitrat dan fosfat.
Berbagai upaya telah dilakukan
untuk mengendalikan penyakit dan kualitas
air, salah satunya menggunakan probiotik.
Probiotik memiliki keunggulan dibandingkan
cara – cara pengendalian yang lainnya, di
antaranya adalah : (1) menekan
pertumbuhan bakteri pathogen termasuk
diantaranya bakteri vibrio dan (2) mampu
memperbaiki kualitas air (Moriarty,1998).
Kelompok bakteri yang termasuk probiotik
antara lain Bacillus sp., Photobacterium sp.,
dan Lactobacillus sp. (Irianto, 2003).
Spesies Bacillus sangat cocok digunakan
karena tidak menghasilkan toksin, mudah
ditumbuhkan, tidak memerlukan substrat
yang mahal, kemampuan Bacillus untuk
bertahan pada temperatur tinggi, dan tidak
adanya hasil samping metabolik. Bakteri
Bacillus merupakan jenis bakteri yang
terdapat di hampir semua tempat termasuk
di dalam saluran pencernaan rajungan
(Susanti, 2002). Bairagi et al. (2000) dalam
Fitriliyani (2011) berhasil mengisolasi
bakteri bacillus dari saluran pencernaan
ikan mas dan ikan nila. Pengembangan
probiotik berbasis bakteri Bacillus untuk
budidaya rajungan mempunyai potensi dan
prospek yang baik.
Bakteri patogen bisa menginfeksi
melalui makanan, menuju sistem
pencernaan makanan dan akhirnya
menimbulkan luka kecil pada tubuh dan
disertai dengan tanda – tanda seperti
kehilangan nafsu makan dan lemah
(Batubara, 2005). Bakteri patogen
merupakan bakteri yang sangat merugikan
dalam bidang budidaya, salah satu bakteri
patogen yaitu bakteri Vibrio harveyi.
Vibrio harveyi merupakan salah satu
patogen potensial yang biasa menyerang
rajungan. Pengembangan probiotik untuk
budidaya rajungan didasarkan diantaranya
pada kemampuan menghambat
pertumbuhan V. harveyi dan memperbaiki
kualitas air.
Materi dan Metode
Materi yang digunakan dalam
penelitian ini adalah rajungan dan bakteri
Vibrio harveyi. Rajungan digunakan sebagai
sumber isolat bakteri bacillus dan sebagai
hewan uji pada skrining dan uji aplikasi
bacillus sebagai probiotik. Hewan uji ini
diperoleh dari perairan Jepara dengan
bobot berkisar antara 40 – 43 gram . V.
harveyi digunakan sebagai isolat uji pada
skrining probiotik. Bakteri ini diperoleh dari
Laboratorium Kesehatan BBPBAP Jepara
Metode yang digunakan dalam
penelitian ini adalah metode eksperimental
laboratoris. Dalam penelitian ini dilakukan
percobaan untuk membuktikan apakah
penggunaan probiotik dapat mengendalikan
jumlah bakteri yang ada pada media
pemeliharaan rajungan dan dapat
meningkatkan kualitas air budidaya seperti
Nitrat dan Fosfat.
Penelitian yang dilakukan terbagi
menjadi 2 (dua) tahap yaitu isolasi dan
seleksi bakteri Bacillus sebagai kandidat
probiotik dan pengujian pengaruh
pemberian probiotik Bacillus terhadap
kualitas air dan jumlah total bakteri. isolasi
 Journal Of Marine Research. Volume 2, Nomor 1, Tahun 2013, Halaman 3
dan seleksi bakteri Bacillus dilakukan
dengan cara sampel intestinum rajungan
dihaluskan dan ditambahkan air laut steril
kemudian disuspensikan ke dalam 4 ml air
laut steril dalam tabung reaksi, kemudian
dimasukkan ke dalam air yang sedang
mendidih dan digojog selama 3 menit
(Taufik dan Zafran, 1997). Setelah itu
dibuat seri pengenceran 104, diambil 0,1 ml
hasil pengenceran dipipetkan ke dalam
cawan petri yang berisi zobel agar dan
diratakan kemudian di inkubasi selama 48
jam. Koloni bakteri yang tumbuh
dipisahkan menurut bentuk koloni,
permukaan koloni, warna koloni, dan
ukuran koloni ke dalam cawan petri baru
yang berisi media zobel agar. Untuk
mengetahui bahwa isolat bakteri yang
diperoleh adalah bacillus maka dilakukan
verifikasi berdasarkan pengecatan gram.
Bakteri Bacillus adalah bakteri gram positif
sehingga tercat berwarna ungu. Seleksi
kandidat probiotik dilakukan melalui uji
antagonis terhadap bakteri V. Harveyii. Uji
antagonis dilakukan dengan metode difusi
agar menggunakan paper disc. Kandidat
probiotik ditunjukan oleh terbentuknya
zona hambat di sekitar (Yudiati, 2005).
Pada tahap pengujian ini ember uji
disusun secara acak dengan perlakuan
pemberian probiotik dengan kepadatan
yang berbeda yaitu 0 cfu/ml, 105 cfu/ml
dan 106 cfu/ml, masing-masing dengan
pengulangan sebanyak 3 kali. Sebelum
probiotik diaplikasikan, hewan uji
diadaptasikan terlebih dahulu selama 2
minggu, Selama proses adaptasi air media
di aerasi. Rajungan diberi pakan ikan rucah
sehari sekali dan dilakukan Penyiponan
serta penggantian air setiap 3 hari sekali.
Pengamatan kualitas air dan jumlah total
bakteri dilakukan sebanyak 2 kali yaitu
pada awal dan akhir pengujian.
Penghitungan total bakteri dilakukan
dengan metode pour plate sedangkan
kandungan amonia, nitrit, nitrat dan fosfat
dianalisis oleh Balai Besar Pengembangan
Budidaya Air Payau (BBPBAP) Jepara.
Pengujian probiotik bacillus pada media
pemeliharaan dilaksanakan selama
seminggu.
Hasil dan Pembahasan
Isolasi dan Seleksi Probiotik Bacillus
Hasil isolasi dari intestinum rajungan
diperoleh sebanyak 19 isolat yang di dapat
berdasarkan bentuk, ukuran, permukaan
dan warna koloni – koloninya yaitu SIR01,
SIR02, SIR03, SIR04, SIR11, SIR12, SIR13,
SIR14, SIR21, SIR22, SIR23, SIR24, SIR31,
SIR32, SIR33, SIR41, SIR42, SIR43, dan
SIR44. Pada penelitian yang dilakukan oleh
Nopitawati (2010) diperoleh sebanyak 30
isolat yang berasal dari saluran pencernaan
udang vanamei fase dewasa.
Pada tahap uji aktivitas antagonis
terhadap bakteri Vibrio harveyi, diperoleh
13 isolat aktif yang ditunjukkan oleh
terbentuknya zona hambat di sekitar paper
disk yaitu SIR01, SIR02, SIR04, SIR12,
SIR21, SIR23, SIR24, SIR31, SIR32, SIR33,
SIR41, SIR43, dan SIR44. Selanjutnya pada
tahap pewarnaan gram diperoleh sebanyak
8 isolat yang mengarah ke bakteri bacillus
yaitu SIR12, SIR23, SIR24, SIR31, SIR32,
SIR33, SIR43, dan SIR44.
Pada tahap uji antagonis antar isolat
probiotik diketahui bahwa isolat – isolat
bakteri yang diperoleh dari penelitian ini
bersifat saling antagonis sehingga tidak
dapat digunakan sebagai kultur campuran
Maka isolat – isolat bakteri tersebut hanya
dapat digunakan sebagai monokultur.
Pengujian Probiotik Terhadap
Parameter Kualitas Air Media
Pemeliharaan
Pengujian probiotik dengan dosis
6
10 cfu/ml dapat menurunkan kandungan
Amoniak dan Nitrit serta dapat menaikkan
kandungan nitrat dan fosfat (Gambar 1).
Menurut Poernomo (1988), Senyawa NH3
dan NO2 merupakan senyawa yang dapat
menyebabkan toksik pada air sehingga
dapat menurunkan kualitas air. Sedangkan
Rantetondok et al (2008) menyatakan
bahwa nitrit dalam air biasanya ditemukan
dalam jumlah sedikit dibanding nitrat
karena bersifat tidak stabil dengan
keberadaan oksigen. Nitrit merupakan
bentuk peralihan antara amoniak dan nitrat
yang dihasilkan melalui proses nitrifikasi
dalam kondisi aerob. Nitrat pada perlakuan
 Journal Of Marine Research. Volume 2, Nomor 1, Tahun 2013, Halaman 4

yang diberikan probiotik memiliki nitrifikasi membentuk nitrat. Boyd (1990)

kandungan yang lebih tinggi dikarenakan dalam Rajab (2006) mengatakan bahwa
kemampuan bacillus dalam merombak konsentrasi amoniak berbanding lurus
bahan organik diantaranya senyawa dengan konsentrasi nitrit.
nitrogen dan selanjutnya melalui proses

Gambar 1. Rerata hasil pengujian kualitas air media pemeliharaan rajungan

Gambar 2. Rerata total bakteri media pemeliharaan rajungan

Kandungan Amoniak dan Nitrit perlakuan C diberikan probiotik dengan

mengalami penurunan sangat besar pada dosis yang lebih tinggi (106 cfu/ml)
perlakuan C, sedangkan Nitrat dan Fosfat sehingga dapat menurunkan kandungan
mengalami kenaikan pada perlakuan C Amoniak dan Nitrit. Sedangkan pada dosis
(Gambar 1). Hal ini dikarenakan pada yang lebih rendah seperti perlakuan B (105
 Journal Of Marine Research. Volume 2, Nomor 1, Tahun 2013, Halaman 5
cfu/ml) dan A (kontrol) belum mampu
menurunkan kandungan Amoniak dan
Nitrit. Menurut Sutanti (2009) dosis
pemberian probiotik yang terbaik adalah
dengan kepadatan 106 cfu/ml. Kandungan
Nitrit mengalami penurunan pada
perlakuan B dan C (Gambar 1) sehingga
dapat dikatakan semakin padat koloni
bakteri probiotik yang diberikan maka akan
semakin berkurang pula kandungan Nitrit
yang ada pada media pemeliharaan
(Muliani et al., 2009).
Akan tetapi dalam pemberian
probiotik dengan dosis 106 cfu/ml belum
dapat menurunkan jumlah bakteri yang ada
pada media pemeliharaan rajungan
(Gambar 2). Jumlah bakteri pada media
pemeliharaan rajungan mengalami
penurunan ketika diberikan probiotik
dengan dosis 105 cfu/ml, maka dalam
pemberian probiotik dengan kepadatan
yang lebih tinggi dari 105 cfu/ml pada
media pemeliharan rajungan tidak dapat
digunakan untuk menurunkan atau
mengurangi jumlah bakteri yang ada pada
media pemeliharaan tersebut karena akan
dimungkinkan terjadi seleksi alam dan
Daftar Pustaka
Arikunto, S. 1998. Prosedur Penelitian
Suatu Pendekatan Praktek (edisi revisi
IV).
Rinika Cipta. Jakarta. hal 31
Batubara, H, W. Wiyani, S. Mulyani, H.
Rasyid, Srinawati, I. M. Suitha,
Suriana, Murniati dan Saraswati.
2005. Invitro Sensitivitas Test Mencari
Bakteri Probiotik Pengontrol
Pertumbuhan Vibrio harveyi Penyebab
Vibriosis. Departemen Kelautan dan
Perikanan, Direktorat Jendral
Perikanan Budidaya. Balai Budidaya
Air Payau Takalar. hal 51 - 55
Fitriliyani, I. 2011. Aktifitas Enzim Saluran
Pencernaan Ikan Nila (Oreohromis
niloticus) Dengan Pakan Mengandung
Tepung Daun Lamtoro (Leucaena
leucophala) Terhidrolisis Dan Tanpa
Hidrolisis Dengan Ekstrak Enzim
Cairan Rumen Domba. Bioscientiae,
vol 8, no. 2, Juli 2011: hal 16 - 31
kompetisi yang lebih ketat antar bakteri
bacillus sehingga bakteri yang kalah akan
mati atau terlepas kembali ke dalam media
pemeliharaan tersebut. Menurut
Nikoskelainen et al (2001) dalam Widanarni
(2010) bahwa penggunaan probiotik dalam
dosis tinggi ternyata tidak menjamin
perlindungan yang lebih baik terhadap
hewan inang.
Kesimpulan
Kandidat probiotik bakteri bacillus
yang berasal dari intestinum rajungan
dengan kepadatan 106 cfu/ml dapat
menurunkan kandungan amoniak (NH3) dan
Nitrit (NO2) serta jumlah total bakteri
media pemeliharaan rajungan.
Ucapan Terimakasih
Penulis menyampaikan terimakasih
kepada bapak Drs. Subagiyo, M.Si dan Ir.
Ali Djunaedi, M.Phil selaku pembimbing
yang telah memberikan pengarahan dan
saran dalam penulisan ini. Kepada reviewer
Jurnal Penelitian Kelautan disampaikan
penghargaan atas review yang sangat
berharga pada artikel ini.
Irianto, A. 2003. Probiotik Akuakultur.
Gadjah Mada University Press.
Yogyakarta. hal 125
Jafar, L. 2011. Perikanan Rajungan di Desa
Mattiro Bombang (Pulau Salemo,
Sabangko dan Sagara) Kabupaten
Pangkep. [Skripsi]. Fakultas Ilmu
Kelautan dan Perikanan Universitas
Hasanuddin, Makassar. hal 42 - 46
Moriarty, D.J.W. 1998. Control of Luminous
Vibrio Species in Penaeid Aquaculture
Ponds. Aquaculture. hal 351 – 358
Muliani, A. Suwanto dan Y. Hala. 2002.
Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Asal
Laut Sulawesi untuk Biokontrol
Penyakit Vibriosis pada Larva Udang
Windu (Penaeus monodon Fab.). Balai
Penelitian Perikanan Pantai Maros
Sulawesi Selatan. hal 6 - 11
Nopitawati, T. 2010. Seleksi Bakteri
Probiotik dari Saluran Pencernaan
untuk Meningkatkan Kinerja
Pertumbuhan Udang Vaname
 Journal Of Marine Research. Volume 2, Nomor 1, Tahun 2013, Halaman 6

Litopenaeus vannamei. Sekolah Pasca warta penelitian perikanan Indonesia.

Sarjana, Institut Pertanian Bogor. hal 10 (1). hal 6 – 11
49 - 53 Sutanti, A. 2009. Pengaruh Pemberian
Poernomo. 1988. Pembuatan Tambak di Bakteri Probiotik Vibrio SKT-b melalui
Indonesia. Departemen Pertanian. Artemia dengan Dosis yang Berbeda
Badan Penelitian dan Pengembangan Terhadap Pertumbuhan dan
Pertanian. Balai Penelitian Perikanan Kelangsungan Hidup Pasca Larva
Budidaya Pantai. Maros. hal 20 - 24 Udang Windu Penaeus monodon.
Rantetondok, A, H. Anshary dan M. B. [skripsi]. Departemen Budidaya
Galugu. 2008. Pengaruh Probiotik Perairan Fakultas Perikanan dan Ilmu
Bacillus Plus-1 Pada Dosis Berbeda Kelautan Institut Pertanian Bogor. hal
Terhadap Kualitas Air, Bakteri Vibrio 33 – 35
harveyi, Sintasan dan Total Taufik, I dan Zafran. 1997. Uji daya
Haemocyte Post Larva Udang hambat berbagai jenis bakteri
Vannamei (Litopenaeus vannamei). terhadap perkembangan Vibrio
Jurusan Perikanan Fakultas Ilmu harveyi pada pemeliharaan larva
Kelautan dan Perikanan Universitas kepiting bakau (Scylla serrata). Jurnal
Hasanuddin. Torani Vol. 18 (4) Penelitian Perikanan Indonesia 2 (1)
Desember 2008: hlm 275 – 285 hal 36-43
Rajab, F. 2006. Isolasi dan Seleksi Bakteri Widanarni, M. A. Lidaenni dan D.
Probiotik Dari Lingkungan Tambak Wahjuningrum. 2010. Pengaruh
dan Hatchery Untuk Pengendalian Pemberian Bakteri Probiotik Vibrio
Penyakit Vibriosis Pada Larva Udang SKT-b Dengan Dosis Yang Berbeda
Windu (Penaeus monodon). [Skripsi]. Terhadap Kelangsungan Hidup dan
Departemen Budidaya Perairan Pertumbuhan Larva Udang Windu
Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan (Penaeus monodon) Fab..
Institut Pertanian Bogor. hlm 43 Departemen Budidaya Perairan
Sianturi, D. C. 2008. Isolasi Bakteri dan Uji Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan
Aktivitas Amilase Termofil Kasar dari Institut Pertanian Bogor. Jurnal
Sumber Air Panas Penen Sibirubiru Akuakultur Indonesia 9 (1). Hlm 21 –
Sumatera Utara. [Tesis]. Sekolah 29
Pascasarjana Universitas Sumatera Yudiati, E. 2005. Eksplorasi Dan Aplikasi
Utara Medan. Hal 61 Marine Bakteria Antagonis Terhadap
Susanti, E.V.H. 2002. Jurnal Biodiversitas: Bakteri Patogen Dalam Upaya
Pengendalian Penyakit Ikan Dan
Isolasi dan Karakterisasi Protease dari
Udang Secara Terpadu. Fakultas
Bacillus subtilis 1012M15. Program Perikanan dan Ilmu Kelautan
studi kimia jurusan PMIPA FKIP Universitas Diponegoro. hal 38
Universitas sebelas maret. Surakarta.
hal: 12 – 17
Susanto, B. M. Marzuki, dan I.Setyadi,
2004. Pengamatan Aspek Biologi
rajungan (Portunus pelagicus) dalam
menunjang teknik pembenihannya