Resume Manbioconte 3

IN SILICO STUDY OF SITAWAR (Hellenum Speciosa (J. Koening) INTERVE SELULAR

SIGNALING SYSTEM OF INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

Infllammatory bowel disease (IBD) adalah gangguan pada saluran cerna. Pengaruh terjadinya
penyakit radang usus ini di pengaruhi oleh pola makan, Pola makan dapat mempengaruhi
peradangan usus melalui beberapa mekanisme yang masuk akal secara biologis termasuk
presentasi antigen makanan, perubahan mikrobioma usus, sistem kekebalan mukosa dan fungsi
penghalang epitel. Cara mencegah penyakit radang usus (IBD) segala jenis pengobatan medis
untuk pasien dengan IBD ringan hingga sedang adalah pemberian aminosalisilat secara oral,
yang merupakan terapi lini pertama, pemberian obat kimia seperti aminosalisilat memiliki efek
samping seperti mual, muntah, diare, dan sakit kepala. Sehingga dibutuhkan alternative senyawa
tanpa efek samping. Senyawa antioksidan seperti berasal dari rempah rempahan, tanaman
tanaman obat banyak di gunakan untuk diambil manfaatnya dalam menangani inflamasi dan
penyakit yang disebabkan oleh kekebalan tubuh. Salah satu senyawa antioksidan seperti
Polifenol memiliki efek anti-oksidan dan antiinflamasi untuk mencegah atau mengobati penyakit
peradangan kronis. Salah satunya tanaman obat yang berasal dari sumatera barat yang di sebut
Sitawar (Hellenum speciosa)/(Costus speciosa) memiliki banyak senyawa yang didapatkan pada
daun sitawar seperti Octadecenoic Acid, Hexadecenoic Acid, Caryophyelle oxide, dan Piperine
yang memiliki efek bioaktif seperti antivirus, anti-inflamasi, kardioprotektif, antidiabetes,
antikanker, anti penuaan, antioksidan dan lain-lain. Pembuktian efektifitas senyawa yang ada
didalam suatu tumbuhan dapat di ujikan dengan pendekatan In Silico secara molekuler docking,
Penggunaan uji in silico adalah untuk memprediksi, memberikan hipotesis, dan memberikan
penemuan baru atau kemajuan baru dalam pengobatan dan terapi. Zat aktif alami dapat
berinteraksi dengan biomolekul melalui berbagai mekanisme, seperti aktivasi enzim atau proses
pembukaan saluran ion, yang mengindikasikan adanya respons biologis.

Pada penelitian ini menggunakan software untuk melakukan molekuler docking dan website
seperti : Website Lipinski’s Five rules test, Website PASS Online, PyRx, Autodock 4.0, PyMol.
Selain Software dan Website sebagai alat untuk docking ada bahan yang perlu di siapkan seperti
Ligand (Senyawa tanaman), Ligand Control dari website PubChem dan Protein reseptor dari
website Protein Data Bank (PDB). Pada tanaman Sitawar (H. speciosa) memiliki 4 senyawa
utama yaitu Methyl Palmitate/Hexadecanoic Acid Methyl Ester, Sterculic Acid/Octadecenoic
Acid Methyl Ester, Caryophyllene Oxide, Piperine, dan menggunakan ligand control dari obat
komersial untuk pencegahan Inflammatory Bowel Disease (IBD) Azathioprine.

Tahap pertama dilakukan preparasi ligan menggunakan perangkat lunak BIOVIA Discovery
Studio, selanjutnya preparasi receptor yang didapatkan dari Protein Data Bank dan dipersiapkan
di BIOVIA untuk menghilangkan molekul air, ligan, dan disimpan dengan format pdb.
Selanjutnya senyawa bioaktiv diuji kelayakannya menggunakan Lipinski’s five rules test dan
didapatkan semua senyawa bioaktif layak dan bisa dilanjytkan ke proses berikutnya. Prediksi
aksi dari aktifitas biologis dari senyawa bioaktif yang terdapat pada Sitawar (H. speciosa)
berdasarkan dari hasilnya dengan menggunakan website PASS Online menunjukan berbagai
jenis aktifitas biologis yang sangat berhubungan dengan aksi dalam menangani pensinyalan dari
Inflammatory Bowel Disease (IBD) seperti, Antiinflammatory, TNF expression inhibitor,
Antiinflammatory, Intestinal, Non steroidal antiinflammating agent. Pada senyawa Methyl
Palmitate terdapat aktifitas biologis yang tinggi sebagai Antiinflammasi, pada senyawa Sterculic
Acid tidak memiliki satupun aktifitas biologis yang tinggi namun senyawa tersebut terindikasi
sebagai antiiflamasi namun pada justifikasi aktifitas yang rendah, senyawa Caryophyelle oxide
memiliki aktifitas biologis yang tinggi sebagai antiinflammasi dan Piperine senyawa yang hanya
memiliki aktifitas aniinflammasi yang dikategorikan sangat rendah

Interaksi senyawa pada tanaman sitawa dengan receptor inflammasi pada pensinyalan
inflammatory bowel disease (IBD) TLR4 (toll like receptor 4) memiliki ikatan yang sangat yang
sangat baik. Pada senyawa Piperine dengan binding affinity tertinggi dari semua senyawa dalam
tanaman Sitawa dibandinkan dengan obat komersial Azathioprine, sehingga Piperine di jadikan
senyawa kandidat dalam menggantikan obat komersial dalam menangani inflammatory .
Kemampuan tiap tiap senyawa bioaktif yang ada didalam tanaman Sitawa (H. speciosa)
terbuktikan dengan adanya molekuler docking seperti senyawa methyl ester yang merupakan
senyawa berefek sebagai antioxidant seperti 9,12- Octadecadinoic acid dan Hexadecanoic acid,
methyl ester yang berkhasiat sebagai antioksidan, tapi juga dilaporkan berkhasiat sebagai
antiinflamasi dan antiarthritis. Senyawa CaryoPhyelle Oxide menjadi kandidat yang baik untuk
menangani inflamasi kronis dengan cara mengurangi beberapa mediator pro-inflamasi seperti IL-
1beta, IL-6, TNF-alpha, dan NF-kB serta mejadi salah satu treatment untuk neuroinflammation.
Senyawa Piperine yang merupakan senyawa yang biasa terdapat pada kelompok tanaman
piperidae, treatment dengan senyawa piperine terbukti mengurangi lipid peroxsidase dan sebagai
antioxidant melecule dan antioxidant enzyme yang memiliki efek memuaskan pada treatment
untuk penyakit Alzheimer.