1. Pautan Gen
2. Pindah Silang
3. Pemetaan Kromosom
Pautan Gen (Linkage gene)
• Deviation From Independent Assortment Ratios
• Pautan/Berangkai/Linkage gene :
Peristiwa beberapa gen bukan alel terdapat pada satu kromosom yang sama
• Pautan/Berangkai/Linkage gene :
- RANGKAI/PAUTAN SEMPURNA
Gen-gen yang terangkai letaknya amat berdekatan, maka selama meiosis
gen-gen itu tidak mengalami perubahan letak. Sehingga gen-gen itu
bersama-sama menuju ke gamet
Controlled
breeding, with
specific
characters
scored for
specific traits
(e.g., character
= flower color,
trait = purple vs.
white)
First Generation Offspring
1 0.00 0.02 0.15 0.46 1.07 1.64 2.71 3.84 6.64 10.83
2 0.10 0.21 0.71 1.39 2.41 3.22 4.61 5.99 9.21 13.82
3 0.35 0.58 1.42 2.37 3.67 4.64 6.25 7.82 11.35 16.27
4 0.71 1.06 2.20 3.36 4.88 5.99 7.78 9.49 13.28 18.47
5 1.15 1.61 3.00 4.35 6.06 7.29 9.24 11.07 15.09 20.52
6 1.64 2.20 3.83 5.35 7.23 8.56 10.65 12.59 16.81 22.46
menerima menolak
pada taraf 0.05
• Ketentuan :
χ2h < χ2t non signifikan = tidak berbeda nyata, hipotesis diterima
2 2
Terms Used in Linkage Analysis
Coupling – the F1 configuration where both dominant alleles reside on the
same chromosome; also called CIS
gen-gen dominan terangkai pada satu kromosom, sedangkan alel-alel
resesifnya terangkai pada kromosom homolognya
Penulisannya : AB/ab atau AB
ab
Repulsion - the F1 configuration where one dominant and one recessive allele
reside on the same chromosome; also called TRANS
Gen dominan terangkai dengan alel resesifnya pada satu kromosom,
sedangkan alel-alel resesifnya terangkai pada kromosom homolognya
Penulisannya : Ab/aB atau Ab
aB
Coupling – the F1 configuration where both dominant alleles
reside on the same chromosome; also called CIS
Thank you
Crossing Over
PINDAH SILANG
Crossing Over
• Physical crossing over is a normal meiosis event
• Crossing-over pertukaran segmen dari kromatid-
kromatid bukan non-sister kromatid dari sepasang
kromosom homolog
• The term used to describe crossing over is
recombination
• Recombination can occur between any two genes on a
chromosome
• The farther apart the two genes the more crossing over
• Recombination Occurs Less Frequently Between Closely
Linked Genes
Cross over
A B A B
meiosis I
a b
a b
A B A B gamet parental
A b gamet rekombinasi
a B gamet rekombinasi
a b a b gamet parental
Faktor-faktor yang mempengaruhi pindah silang
1. TEMPERATUR, temperatur kurang atau melebihi temperatur biasa
dapat memperbesar kemungkinan pindah silang
2. UMUR, makin tua suatu individu makin kurang mengalami pindah
silang
3. ZAT KIMIA tertentu dapat memperbesar kemungkinan terjadinya
pindah silang
4. PENYINARAN SINAR X dapat memperbesar kemungkinan pindah silang
5. JARAK ANTAR GEN YANG TERANGKAI, makin jauh letak satu gen
dengan gen lainnya, makin besar kemungkinan pindah silang
6. JENIS KELAMIN, umumnya jantan atau betina dapat mengalami pindah
silang. Namun pada ulat sutera betina dan Drosophila jantan tidak
pernah terjadi pindah silang
End of 10th lecture
Thank you
MAPPING CHROMOSOME
PEMETAAN KROMOSOM
Determining Linkage Distances
• By definition, one map unit is equal to one percent
recombinant gametes or phenotypes
• In honor of Morgan, one map unit is also called one
centimorgan (cM)
1 mu = 1% = 1 cM
Formula :
Number of recombinants x 100%
Total Number
Coupling (Cis) Data Repulsion (Trans) Data
F1 Testcross Gamete F1 Testcross Gamete
Gamete Distribution Type Gamete Distribution Type
pr vg distance pr vg distance
= ((151 +154)/2839)*100% = ((157 + 146)/2335)*100%
= 10.7 m.u = 10.7 cM = 13.0 mu = 13.0 cM
pr vg pr vg
10,7 cM 13.0 cM
Deriving Linkage Distance And Gene Order
From Three-Point Crosses
• Analyzing three genes allows us to determine gene order as well as linkage
distance
• Need to create a F1 and follow deviation from a 1:1:1:1:1:1:1:1 ratio
• What are the expected gametes when three linked genes are considered?
Analyzing Three-Point Test Cross Data
Genotype Observed What are the parental
ABC 390 genotypes?
abc 374
AbC 27
aBC 30 What is the gene
ABc 5 order?
abC 8
Abc 81
What are the linkage
aBC 85
Total 1000
distances?
Analyzing Three-Point Test Cross Data
• The genotypes most frequently found are the parental
genotypes
• ABC and abc are the parental genotypes
* Repulsion Z = a1 x a4
a2 x a3
Rumus menghitung persentase rekombinasi
apabila F1 heterosigot
• Data dari Bateson dan Punnett • Data dari Bateson dan Punnett
F1 x F1 (coupling) F1 x F1 (repulsion)
F1 : PL/pl x PL/pl
F1 : Pl/pL x Pl/pL
(Purple, long) (Purple, long)
(Purple, long) (Purple, long)
F2 : F2 :
Purple, long (P_L_): 269 (a1) Purple, long (P_L_) : (a1)
Purple, round (P_ll): 19 (a2) Purple, round (P_ll): (a2)
Red, long (ppL_) : 27 (a3) Red, long (ppL_) : (a3)
Red, round (ppll) : 85 (a4)
Red, round (ppll) : (a4)
• Coupling Z = 19 x 27 = 0,0238
269 x 85 Hitung nilai Z!
Nilai Z = 0,0238**
Tabel distribusi Z
Break for a moment
Any Question ?
Interference &
coefficient of coincidence
• Interference - the reduction in the expected number of
crossovers at two adjacent genetic intervals
• Interferensi – interaksi antar pindah silang
Pindah silang pada tempat tertentu mengurangi kemungkinan
terjadinya pindah silang pada daerah didekatnya.
Pindah silang di daerah I mengurangi terjadinya pindah silang pada
daerah II, mengakibatkan frekuensi pindah silang ganda lebih kecil dari
yang diharapkan
• coefficient of coincidence(c.o.c.) = ratio of observed to expected
double crossovers
• Koefisien koinsidensi adalah ukuran dari kekuatan interferensi
dan merupakan nisbah antara frekuensi pindah silang ganda yang
diamati dan frekuensi pindah silang ganda yang diharapkan
atau
KK = Banyaknya pindah silang ganda (DCO) yang sesungguhnya
Banyaknya pindah silang ganda (DCO) yang diharapkan
I = Interferensi = 1 – KK
• Apabila interferensi sempurna (1,0) maka tidak ada pindah silang ganda yang
dapat diamati
• Apabila semua pindah silang ganda yang diharapkan dapat diamati maka
interferensinya nol (0)
Creighton and McClintock's Proof of Chromosomal
Exchange During Crossing Over
Thank you