Sintesis Protein

Rehmadanta Sitepu
Dogma Sentral

replication
Dogma Sentral Biologi Molekuler
Replikasi
Sintesis Protein

Isi informasi dari DNA adalah dalam bentuk urutan

tertentu dari nukleotida di sepanjang untai DNA
DNA diwariskan oleh organisme mengarah ke sifat-
sifat tertentu dengan mendikte sintesis protein
Proses dimana DNA mengarahkan sintesis protein,
ekspresi gen meliputi dua tahap, yang disebut
transkripsi dan translasi
Transkripsi dan Translasi
• Sel diatur oleh rantai komando seluler
• DNA RNA  protein
• Transkripsi
• Adalah sintesis RNA di bawah arahan DNA
• Menghasilkan messenger RNA (mRNA)
• Translasi
• Adalah sintesis yang sebenarnya dari polipeptida, yang
terjadi di bawah arahan mRNA
• Terjadi pada ribosom
RNA
 RNA adalah single stranded, tidak ganda beruntai seperti DNA
 RNA pendek, hanya 1 gen yang panjang, di mana DNA sangat panjang
dan mengandung banyak gen
 RNA menggunakan gula ribosa bukan deoksiribosa di DNA
 RNA menggunakan basis urasil (U) bukan timin (T) di DNA.

Table 17.1
 Sintesis Transkrip RNA

 Tahapan 5
Promoter
Transcription unit
3

trankripsi
3 5
DNA
Start point
RNA polymerase 1 Initiation. After RNA polymerase binds to
 Initiation the promoter, the DNA strands unwind, and
the polymerase initiates RNA synthesis at the
 Elongation 5
start point on the template strand.
3
3 5

 Termination Unwound RNA

Template strand of
DNA
DNA transcript
2 Elongation. The polymerase moves downstream, unwinding the
DNA and elongating the RNA transcript 5  3 . In the wake of
Rewound transcription, the DNA strands re-form a double helix.

RNA
5 3
3 3 5
5

RNA
transcript
3 Termination. Eventually, the RNA
transcript is released, and the
polymerase detaches from the DNA.

5 3
3 5

5 3
Completed RNA
transcript
 Sintesis RNA- Inisiasi
1 Eukaryotic promoters
 Promotor memberi sinyal
TRANSCRIPTION DNA
RNA PROCESSING Pre-mRNA

inisiasi sintesis RNA TRANSLATION

mRNA
Ribosome

Polypeptide

faktor transkripsi membantu

Promoter
 5 T A T A A AA 3
AT AT T T T

eukariotik RNA polimerase

3 5
TATA box Start point Template
DNA strand
mengenali urutan promotor 2 Several transcription
factors

 Urutan DNA promoter

Transcription
factors

penting disebut TATA box. 5

3
3
5
3 Additional transcription
factors

RNA polymerase II
Transcription factors

5 3
3 5 5
RNA transcript
Transcription initiation complex
Sintesis RNA - Elongasi
 RNA polimerase mensintesis untai tunggal RNA terhadap untai DNA template
(anti-sense strand), menambahkan nukleotida ke ujung 3 'dari rantai RNA
 RNA polimerase bergerak di sepanjang DNA utk menguraikan double helix,
memegang 10 sampai 20 basis DNA pada suatu waktu untuk
memasangkannys nukleotida RNA

Elongation Non-template
strand of DNA
RNA nucleotides

RNA
polymerase

T C C A A T
A
3 C T U
3 end
T

G
A U
G

G
EG A
5 C A C A C
A
T A
A G G T T

Direction of transcription
5 Template
(“downstream”)
strand of DNA

Newly made
RNA
Sintesis RNA- Terminasi
 urutan tertentu dalam pemutusan sinyal
DNA transkripsi
 Ketika salah satu dari ini yang dihadapi
oleh polimerase, transkrip RNA dilepaskan
dari DNA dan double helix dapat zip lagi.
Transcription Overview
 Translasi
 Translasi adalah Sintesis TRANSCRIPTION DNA

protein menggunakan RNA TRANSLATION

mRNA
Ribosome

Polypeptide

 Translasi melibatkan
Amino
 mRNA acids
Polypeptide
 Ribosomes - Ribosomal RNA
tRNA with
 Transfer RNA amino acid
Ribosome attached
 Genetic coding - codons Trp
Phe Gly

tRNA
C
C
GC G
A
Anticodon
A A A
U G G U U U G G C

5 Codons 3
mRNA
Kode Genetik
 informasi genetik dikodekan sebagai urutan triplet basa nonoverlapping,
atau kodon
 gen menentukan urutan basa sepanjang molekul mRNA

DNA Gene 2
molecule
Gene 1
Gene 3

DNA strand 3 5
(template) A C C A A A C C G A G T

TRANSCRIPTION

U G G U U U G G C U C A
mRNA 5 3
Codon
TRANSLATION

Protein Trp Phe Gly Ser

Amino acid
 Transfer RNA (tRNA)
 Terdiri dari untai RNA tunggal yang hanya sekitar 80 nukleotida
panjangnya
 Setiap tRNA membawa asam amino spesifik pada salah satu ujung dan
antikodon di ujung lain
 Sebuah kelompok enzim khusus dari enzim akan memasangkan
molekul tRNA yang tepat dengan asam amino yang sesuai.
 tRNA membawa asam amino ke ribosom,
3
Amino acid A
C
attachment site C
A 5
C G
The “anticodon” is the 3 RNA bases that G C
C G
matches the 3 bases of the codon on the U G
U A
mRNA molecule A U
U C A U
* C A C AG UA A G *
G * C U C
G U G U * G
*
C C G A G
* * U C * A G G
* G AG C
(a) Two-dimensional structure. The four base-paired regions and three G C Hydrogen
loops are characteristic of all tRNAs, as is the base sequence of the U A bonds
amino acid attachment site at the 3 end. The anticodon triplet is * G
A
unique to each tRNA type. (The asterisks mark bases that have been A* C
chemically modified, a characteristic of tRNA.) * U
A G
A
Anticodon
Pembentukan Polipeptida
 Kita dapat membagi terjemahan ke dalam tiga tahap
 Inisiasi
 Pemanjangan/elongasi
 Penghentian/terminasi
 The AUG kodon start dikenali oleh methionyl-tRNA atau
Met
 Setelah kodon start telah diidentifikasi, ribosom
menggabungkan asam amino menjadi rantai polipeptida
 RNA diterjemahkan oleh tRNA (transfer RNA) molekul,
yang masing-masing mentransport asam amino spesifik
 Terjemahan berakhir ketika kodon stop dikenali (UAA,
UAG, UGA)
Inisiasi Translasi

 Tahap inisiasi dari translasi menyatukan mRNA, tRNA

membawa asam amino pertama dari polipeptida, dan dua
subunit ribosom
Large
ribosomal
P site subunit
3 U A C 5
t t
Me 5 A U G 3 Me

Initiator tRNA
GTP GDP
E A
mRNA
5 3 5 3
Start codon

mRNA binding site Small Translation initiation complex

ribosomal
subunit

1 2
A small ribosomal subunit binds to a molecule of
mRNA. In a prokaryotic cell, the mRNA binding site
on this subunit recognizes a specific nucleotide
sequence on the mRNA just upstream of the start
codon. An initiator tRNA, with the anticodon UAC,
base-pairs with the start codon, AUG. This tRNA
carries the amino acid methionine (Met).
The arrival of a large ribosomal subunit completes
the initiation complex. Proteins called initiation
factors (not shown) are required to bring all the
translation components together. GTP provides
the energy for the assembly. The initiator tRNA is
in the P site; the A site is available to the tRNA
bearing the next amino acid.
Elongasi Ikatan Peptida
 Pada tahap elongasi, asam amino ditambahkan satu per
satu untuk asam amino sebelumnya

1 Codon recognition. The anticodon

TRANSCRIPTION DNA
Amino end of an incoming aminoacyl tRNA
mRNA
of polypeptide base-pairs with the complementary
Ribosome
TRANSLATION mRNA codon in the A site. Hydrolysis
Polypeptide
of GTP increases the accuracy and
E efficiency of this step.
mRNA 3
Ribosome ready for P A
next aminoacyl tRNA 5 site site
2 GTP
2 GDP

E E

P A P A

2 Peptide bond formation. An

GDP
3 Translocation. The ribosome rRNA molecule of the large
GTP
subunit catalyzes the formation
translocates the tRNA in the A
of a peptide bond between the
site to the P site. The empty tRNA new amino acid in the A site and
in the P site is moved to the E site, E
the carboxyl end of the growing
where it is released. The mRNA
polypeptide in the P site. This step
moves along with its bound tRNAs,
P A attaches the polypeptide to the
bringing the next codon to be
tRNA in the A site.
translated into the A site.
Terminasi Translasi
 Langkah akhir translasi yt terminasi. Ketika riboom mencapai kodon STOP, tidak ada tRNA yg berikatan.
 Sebaliknya, protein yg disebut “release factor” menempel pd kodon STOP.
 release factor menyebabkan seluruh kompleks terpisah: messenger RNA, dua subunit ribosom, polipeptida yg baru.
 messenger RNA dapat ditranslasi beberapa kali utk menghasilkan banyak protein kopi.

Release
factor
Free
polypeptide

5
3 3
3
5 5
Stop codon
(UAG, UAA, or UGA)
1 When a ribosome reaches a stop 2 The release factor hydrolyzes 3 The two ribosomal subunits
codon on mRNA, the A site of the the bond between the tRNA in and the other components of
ribosome accepts a protein called the P site and the last amino the assembly dissociate.
a release factor instead of tRNA. acid of the polypeptide chain.
The polypeptide is thus freed
from the ribosome.