ENZYME

Andi Mismawati, S.Pd., M.Sc

Program Studi Teknologi Hasil Perikanan

Fakultas Ilmu Perikanan dan Kelautan
Universitas Mulawarman
 Kajian Pengantar I

• Pendahuluan

• Tatanama dan penggolongan enzim

• Fungsi dan cara kerja enzim

 Pendahuluan
• Enzim memainkan peran penting dalam Metabolisme,
Diagnosis, dan Terapi.
• Semua reaksi biokimia adalah katalisis enzim dalam
organisme hidup
• Tingkat enzim dalam darah dimanfaatkan untuk kepentingan
diagnostik mis. Tingkat enzim ini adalah indikator yang baik
dalam penyakit seperti infark miokardial infarction.
• Enzim bisa digunakan secara terapeutik seperti enzim
pencernaan.
 Pendahuluan
• Enzim adalah protein jenis khusus yg terdiri dari rantai
panjang as. Amino yg terikat bersama oleh ik. Peptida dan
berperan mengontrol aktivitas sistem kehidupan melalui
katalisis biologi.
• Enzim tidak dikonsumsi atau diproduksi selama reaksi.
• Enzim tidak menyebabkan reaksi terjadi, namun sangat
meningkatkan laju reaksi yang akan berlangsung lebih lambat
saat keadaan normal (no enzyme). Mereka mengubah laju tapi
bukan konstanta kesetimbangan dari reaksi yang mereka
katalisiskan
• Enzim bersifat reusable.
 Pendahuluan
• Karakteristik enzym:
– Fungsi utama enzim adalah untuk
meningkatkan laju reaksi
– Sebagian besar enzim bertindak secara spesifik
dengan hanya satu reaktan yang disebut
"substrat" untuk menghasilkan suatu produk

– enzim diatur dari keadaan aktivitas rendah

hingga aktivitas tinggi dan sebaliknya
Syarat Penting untuk Memahami Sifat Biokimia
Dan Aktivitas Enzim

• Situs aktif:
– Area di enzim tempat substrat atau substrat
menempel disebut situs aktif.

– Enzim biasanya protein sangat besar dan situs aktif

hanyalah daerah kecil dari molekul enzim
 ACTIVE SITES

• Molekul enzim mengandung kantong khusus

atau sumbing yang disebut situs aktif
 Lock-and-Key Model
• Dalam model Lock and Key enzim:
- Situs aktif memiliki bentuk yang kaku
- Hanya substrat dengan bentuk yang sesuai yang pas
- Substrat adalah kunci yang sesuai dengan kunci situs aktif

Hal ini menjelaskan spesifisitas enzim dan aktivitas enzim saat denaturasi
 APOENZYME and HOLOENZYME
• Enzim tanpa bagian non proteinnya disebut apoenzim dan
tidak aktif.
• Holoenzyme adalah enzim aktif dengan komponen non
proteinnya.
Syarat Penting untuk Memahami Sifat Biokimia
Dan Aktivitas Enzim
• Kofaktor:
– Kofaktor adalah senyawa kimia non-protein yang terikat
(baik secara rapat atau longgar) ke enzim dan diperlukan
untuk katalisis.
• Jenis Kofaktor:
– Koenzim.
– Kelompok prostetik
 Jenis Kofaktor
• Koenzim: Komponen non-protein, terikat secara
longgar dengan apoenzyme oleh ikatan non-kovalen.
• Contohnya: vitamin atau senyawa yang berasal dari
vitamin.
• Kelompok prostetik adalah komponen non-protein,
yang terikat erat dengan apoenzyme oleh ikatan
kovalen
 Keistimewaan enzim
• Enzim memiliki berbagai tingkat kekhususan
untuk substrat
• Enzim dapat mengenali dan mengkatalisis:
- satu substrat tunggal
- sekelompok substrat yang serupa
- jenis ikatan tertentu
 Important Terms to Understand
Biochemical Nature
And Activity of Enzymes

Activation energy or Energy of Activation:

• All chemical reactions require some amount

of energy to get them started.
OR
• It is First push to start reaction.

This energy is called activation energy.

 Mechanism of Action of
Enzymes
• Enzymes increase reaction rates
by
decreasing the Activation energy:
• Enzyme-Substrate Interactions:
‒ Formation of Enzyme substrate
complex by:
‒ Lock-and-Key Model
‒ Induced Fit Model
 Tata Nama dan Penggolongan
Enzim
 Nama enzim dalam banyak kasus berakhir dalam -ase
Sebagai contoh, sucrase mengkatalisis hidrolisis sukrosa

 Nama tersebut menggambarkan fungsi enzim

Misalnya, oksidasi mengkatalisis reaksi oksidasi

 Terkadang nama umum digunakan, terutama untuk enzim pencernaan seperti

pepsin dan tripsin

 Beberapa nama menggambarkan baik substrat maupun fungsinya

Contohnya, alkohol dehidrogenase oksida etanol
 PENGGOLONGAN ENZIM :
Enzim Diklasifikasikan ke dalam enam kelas fungsional
(Klasifikasi nomor EC) oleh Persatuan Ahli Biokimia
Internasional (I.U.B.) Pada Dasar-dasar Jenis Reaksi yang
Mereka Katalisis
• EC 1. Oxidoreductase
• EC 2. Transferase
• EC 3. Hydrolase
• EC 4. Lyase
• EC 5. Isomerase
• EC 6. Ligase
 Prinsip klasifikasi internasional

• Setiap enzim memiliki nomor klasifikasi

terdiri dari empat digit:

• Contoh, EC: (2.7.1.1) HEXOKINASE

• EC: (2.7.1.1) Komponen ini menunjukkan kelompok enzim
sebagai berikut:

• 2. KELAS (TRANSFERASE)

• 7. SUB KELAS(TRANSFER OF PHOSPHATE)

• 1. SUB-SUB KELAS (ALCOHOL IS PHOSPHATE ACCEPTOR)

• 1. Nama Khusus
ATP,D-HEXOSE-6-PHOSPHOTRANSFERASE (Hexokinase)
1. Hexokinase catalyzes:
Glucose + ATP  glucose-6-P + ADP

6 CH 2 O H 6 CH O PO 2 
2 3
ATP ADP
5 O 5 O
H H H H
H H
4 1 4 H 1
OH H OH
M g 2+
OH OH OH OH
3 2 3 2
H OH H ex o kin ase H OH
gluco se glucose -6 -ph osp h ate
Oxidoreductase, Transferase and Hydrolase
Lyase, Isomerase and Ligase
 EC 1. Oxidoreductase
• Aktivitas Biokimia:
– Katalis reaksi oksidasi/ reduksi
– Bertindak pada banyak pengelompokan kimia untuk menambahkan atau
menghilangkan atom hidrogen.

• Contoh:
– Lactate dehydrogenase. - Glucose Oxidase.
– Peroxidase. - Catalase.
– Phenylalanine hydroxylase.

- oxidases
- peroxidases
- dehydrog
 EC 2. Transferase
• Aktivitas Biokimia:
– Transfer a functional groups (e.g. methyl or phosphate) antara
molekul donor and acceptor.
• Contoh:
– Transaminase (ALT & AST) - Phosphotransferase (Kinases).
– Transmethylase - Transpeptidase.
– Transacylase.
 EC 3. Hydrolase
• Aktivitas Biokimia:
– Mengkatalisis hidrolisis berbagai ikatan dengan penambahan air yang
melintasi ikatan.
• Contoh:
– Protein hydrolyzing enzymes (Peptidases).
– Carbohydrases (Amylase, Maltase, Lactase).
– Lipid hydrolyzing enzymes (Lipase).
– Deaminases.
– Phosphatases.

- esterase
- peptidase
- glycosidase
 EC 4.Lyase
• Aktivitas Biokimia:
– Membersihkan berbagai ikatan dengan cara selain hidrolisis dan oksidasi.
– Menambahkan Air, Amonia atau Karbon dioksida melalui ikatan
rangkap, atau melepaskan elemen ini untuk menghasilkan ikatan rangkap.
• Contoh:
– Fumarase
– Carbonic anhydrase.
 EC 5.Isomerase
• Aktrivitas Biokimia:
– Perubahan isomerisasi katalis dalam satu molekul tunggal.
– Melaksanakan berbagai jenis isomerisasi :
• L ke isomerisasi D.
• Reaksi mutase (Pergeseran kelompok kimia).
• Contoh:
– Isomerase.
– Mutase.
 EC 6. Ligase
• Aktivitas Biokimia:
– Bergabung dengan dua molekul dengan ikatan kovalen. Reaksi
katalis di mana dua kelompok gugus kimia bergabung (atau
diligasi) dengan penggunaan energi dari ATP.
• Examples:
– Acetyl~CoA Carboxylase - Glutamine synthetase
 Kinetika Enzim
Penting untuk :
• Memahami fungsi katalitik
• Memahami fenomena biologik, pengaruh suhu, pH dll.
• Prosudur pemurnian enzim
• Kinetika Enzim berkaitan dengan pengukuran laju:

k1 V1 = k1[A][B]
A+B P+Q V-1 = k-1[P][Q]
k-1
• Sehingga tetapan kesetimbangannya dapat dituliskan sbb:
 Kinetika Enzim
• Aktivitas enzim = kecepatan enzim untuk melakukan katalis pada
subtrat, satuannya Unit (U)

• 1 U = Jumlah enzim yang melakukan katalis sehingga terjadi

perubahan 1 mikronmol subtrat per menit pada suhu 25oC
 Model Michaelis-Menten
• Model ini menggambarkan katalis enzim
dengan konsep sebagai berikut :
k1 k3
• E+S ES E+P
k2

. Persamaan Michaelis-Menten

V max [S]
V init = K m = k 2 + k3
KM + [S] k1
• Km (Konstanta Michaelis) menggambarkan
kesetimbangan disosiasi kompleks ES menjadi enzim
dan substrat. Nilai Km kecil berarti enzim
mempunyai afinitas tinggi terhadap substrat maka
kompleks ES sangat mantap, sehingga kesetimbangan
reaksi kearah kompleks ES. Apabila nilai Km besar
berarti enzim mempunyai afinitas rendah terhadap
substrat, sehingga kesetimbangan reaksi kearah E +
S.
• Aktivitas enzim tergantung kepada
- Konsentrasi subtrat
- Suhu
Setiap jenis enzim memiliki aktivitas maksimal pada suhu tertentu
- pH
Setiap jenis enzim memiliki aktivitas maksimal pada pH tertentu
 FAKTOR-FAKTOR YG MEMPENGARUHI KERJA ENZIM :
1. KONSENTRASI SUBSTRAT
Dengan penambahan konsentrasi substrat akan menghasilkan
pertambahan kecepatan reaksi
2. pH
pH yang terlalu tinggi atau terlalu rendah akan mengakibatkan
denaturasi protein enzim sehingga enzim menjadi tidak aktif lagi.
3. TEMPERATUR
Karena enzim adalah suatu protein, maka temperatur yang tinggi (> 40
o
C) akan mengakibatkan hilangnya fungsi kerja enzim karena
mengalami denaturasi
4. Pengaruh AKTIFATOR
Kebanyakan enzim tidak akan berfungsi optimal atau tidak berfungsi
sama sekali sampai tersedianya zat kedua dalam campuran reaksi. Zat
ini disebut AKTIFATOR yang pada umumnya adalah ion logam.
Kecepatan reaksi enzimatis yang memerlukan aktifator menjadi
tergantung pula pada konsentrasi aktifator.
 Inhibitor Enzim
- Inhibitor enzim = zat atau senyawa yang dapat menghambat enzim
. Inhibitor non kompetitif
Zat-zat kimia tertentu mempunyai
afinitas yang tinggi terhadap ion logam
penyusun enzim.
Senyawa penghambat untuk enzim
yang mengandung Fe, yaitu dengan
terjadinya reaksi antara senyawa-
senyawa tersebut dengan ion Fe yang
menyebabkan enzim menjadi tidak aktif.
Merkuri (Hg) dan perak (Ag) merupakan
penghambat enzim yang mengandung
gugusan sulfhidril (-SH).
• Inhibitor irreversible
- Senyawa penghambat yang terikat kuat pada
sisi aktif enzim
- Ikatan tersebut adalah ikatan kovalen
- Enzim menjadi inaktif secara permanen
- Contoh : diisopropylfluorophosphat,
iodoacetamide, dan penicillin
• Feed Back Inhibitor
Penghambatan yang disebabkan oleh hasil akhir suatu
rangkaian reaksi enzimatik yang menghambat aktifitas enzim
pada reaksi pertama. Hasil akhir reaksi juga mempengaruhi
pembentukan enzim, yang dapat digambarkan sebagai berikut:

Enzim a Enzim b Enzim c Enzim d

A B C D
• ABCDX X

• Keterangan: A,B,C,D: substrat enzim a,b,c,d.

• X: hasil akhir reaksi enzimatik yang menghambat sintesis
enzim a.
• Inhibitor Represor
- Represor adalah hasil akhir suatu rangkaian reaksi enzimatik
yang dapat mempengaruhi atau mengatur pembentukan enzim-
enzim pada reaksi sebelumnya.
- Gambaran skematik reaksinya adalah sebagai berikut:

Enzim a Enzim b Enzim c Enzim d

A B C D X

Keterangan: A,B,C,D: substrat enzim a,b,c,d.

X: hasil akhir reaksi enzimatik yang menghambat sintesis enzim
a,b,c,d.
 Tugas
1. Klasifikasikan reaksi-reaksi katalis enzim berikut ke dalam
kelompok EC utamanya dan sarankan nama umum yang mungkin
untuk masing2 enzim dalam reaksi tersebut.

a. D-Gliseraldehid-3-fosfat + Pi + NAD+ 1,3-bifosfogloserat

O
b. H2N C NH2 + H2O NH3 + CO2
c. 2-Oksoglutarat + L-Alanin L-Glutamat + Piruvat
d. L-Alanin D-Alanin
e. L-Ribosa-5-fosfat D-Xilulosa-5-fosfat
f. ATP + L-tyrosin + tRNATyr AMP + PPi L-tirosil-tRNAtyr
g. ATP + -L-Glutamil-L-sistein + Glisin ADP + Pi + Glutation
2. Jelaskan peranan dan jenis-jenis enzim
proteolisi, enzim Chatepsin lysosomal,
calpain (protease netral) dan alkaline
protease pada autolisis ikan post mortem
3. Jelaskan sumber dan produksi enzim
skala indusri serta aplikasinya dalam
pengempukan daging dan fermentasi