APLIKASI BIOTEKNOLOGI

MIKROBA
HAMLI J.S LIISE
 PENDAHULUAN
• Mikroorganisme atau yang disebut mikroba, merupakan organisme yang sangat kecil untuk
dilihat dengan menggunakan mata telanjang dan harus menggunakan bantuan mikroskop
untuk mengamatinya. Mikroorganisme yang paling melimpah adalah bakteri, namun virus,
jamur seperti ragi, dan alga juga termasuk mikroba. Hampir semua mikroba ini mempunyai
peran yang menarik dalam bioteknologi.
• Kelimpahan bakteri dan mikroba lain memberikan potensi yang besar dalam pengembangan
aplikasi di bidang bioteknologi. Sebelum perkembangan teknik kloning gen, manusia
menggunakan mikroba dalam bioteknologi. Frekuensi penggunaan mikroorganisme sebagai
“peralatan” bioteknologi tergantung dari struktur sel mikroorganisme tersebut. Maka dari itu,
banyak aplikasi bioteknologi yang menggunakan mikroorganisme sebagai bahan utama
dalam pembuatan makanan, minuman, dan obat-obatan.
•
 PERANAN MIKROBA PADA BERBAGAI APLIKASI
SEHARI-HARI

• Mikroba merupakan kebutuhan untuk fungsi normal tubuh dan

untuk berbagai macam proses alami pada lingkungan. Potensi
terbesar dalam pemanfaatan mikroba adalah dalam pembuatan
makanan dan produksi obat-obatan baru. Pada bagian ini akan
dijelaskan beberapa aplikasi modern dalam pengembangan
bioteknologi mikroba.
 PRODUKSI MAKANAN
• Mikroba digunakan untuk memproduksi makanan termasuk diantaranya
adalah roti, yoghurt, keju, dan minuman seperti bir, wine, dan sampanye.
Salah satu cara untuk membuat keju dari susu adalah dengan
memberikan asam, tetapi untuk keju yang dengan rasa terbaik adalah
dengan menggunakan enzim rennin. Pada awal produksi keju, rennin
secara tradisional diperoleh dengan mengekstraknya dari perut sapi, atau
dari spesies pemroduksi susu lainnya misalnya kambing, domba, dan
kuda. Susu beku yang mengandung rennin diperoleh dari mencerna
protein yang biasa disebut casein, yang merupakan komponen penting
dari susu.
 FERMENTASI MIKROBA
• Fermentasi merupakan proses mikrobial penting yang digunakan untuk
memproduksi berbagai macam produksi makanan dan minuman termasuk beberapa
macam roti, bir, wine, sampanye, yoghurt, dan keju. Fermentasi mikroba mempunyai
peran yang sangat penting dalam bioteknologi. Salah satu aplikasi yang
menggunakan mikroorganisme adalah proses pembuatan bir dan wine, yang
berhubungan dengan fermentasi oleh ragi.
• Sel hewan, tumbuhan, dan berbagai macam mikroba memperoleh energi dari
karbohidrat seperti glukosa dengan menggunakan elektron dari gula ini untuk
membentuk sebuah molekul yang dinamakan Adenosine triphosphate (ATP).
Produksi ATP terjadi dalam reaksi berangkai.
 PRODUKSI REKOMBINAN INSULIN
PADA BAKTERI
• Insulin merupakan hormon yang diproduksi oleh sel pada pankreas yang disebut sel
beta. Ketika insulin disekresikan ke dalam aliran darah oleh pankreas, maka insulin
akan memainkan peran yang esensial pada metabolisme karbohidrat. Salah satu
fungsi pentingnya adalah untuk menstimulasi glukosa yang diperoleh ke dalam sel-
sel tubuh seperti sel-sel otot, di mana glukosa dapat dipecah untuk memproduksi
ATP sebagai sumber energi. Diabetes mellitus tipe I disebabkan oleh produksi
insulin yang tidak mencukupi oleh sel beta. Penurunan produksi insulin pada
konsentrasi glukosa dalam aliran darah dapat menyebabkan masalah kesehatan
seperti tekanan darah tinggi, katarak, dan kerusakan otot. Diabetes mellitus tipe I
biasanya melakukan suntikan insulin secara regular untuk mengontrol gula dalam
darah.
 PERANAN MIKROBA PADA
PEMBUATAN VAKSIN
• Penggunaan antibodi dan vaksin telah terbukti efektif untuk sejumlah
kondisi infeksi penyakit yang cepat menyebar di manusia yang
disebabkan oleh mikroorganisme. Tercatat infeksi penyakit yang
disebabkan mikroba mengakibatkan lebih dari 60% anak usia sebelum 4
tahun meninggal karena infeksi penyakit. Tentu saja kemampuan untuk
mencegah, mendeteksi, dan perlakuan penyakit cepat menyebar adalah
suatu aspek bioteknologi mikrobial yang penting, dan vaksin adalah
suatu kunci di dalam proses ini.
 ENZIM MIKROBA
• Enzim mikroba telah digunakan dalam aplikasi dari produksi pangan
untuk penelitian biologi molekuler, karena mikroba adalah penghasil
enzim yang baik. Beberapa enzim yang sudah tersedia secara komersil
adalah adalah enzim DNA polimerase dan enzim restriksi dari
bakteri. Enzim tersebut diisolasi dari E. coli, sehingga DNA polimerase
tersedia dan dapat digunakan untuk berbagai teknik DNA rekombinan
untuk menyelidiki sekuen DNA dan sebagi reaktor untuk memperbanyak
sekuen DNA dalam proses polymerase chain reaction (PCR).
 TRANSFORMASI BAKTERI
• Transformasi adalah suatu proses transfer informasi genetik dengan bantuan
potongan DNA ekstraseluler. Dalam hal ini, fragmen DNA yang berasal dari bakteri
donor diambil oleh bakteri lain dalam kedudukan sebagai bakteri resipien. Jika
bakteri donor dan bakteri resipien berbeda secara genetik, maka akan dihasilkan
rekombinan yang terbentuk melalui peristiwa pindah silang yang melibatkan
fragmen DNA dari donor dan DNA atau kromosom resipien. Sel-sel yang telah
mengalami transformasi disebut sebagai transforman (Corebima, DNA target
dikenalkan ke bakteri dengan cara diinsersikan ke plasmid yang membawa satu atau
lebih gen resisten antibiotik. Plasmid vektor selanjutnya dicampur
dalam tabung dengan komponen – komponen sel dan dicampur di atas es atau pada
suhu dingin selama beberapa menit. Mekanisme yang sebenarnya masih belum
diketahui, namun yang pasti sel – sel tersebut harus tetap dalam kondisi dingin
selama DNA berada diluar dari sel bakteri untuk menghindari terjadinya kerusakan.
 PERANAN MIKROBA PADA
PROSES DIAGNOSA
• Sudah diketahui sebelumnya bahwa banyak
mikroorganisme yang dapat menyebabkan penyakit,
baik itu pada manusia, hewan, maupun tumbuhan.
Ilmuwan dapat menggunakan berbagai teknik molekuler
untuk mendeteksi dan mengetahui gejalanya yang
disebut dengan diagnosis mikroba.
 STRATEGI PENDETEKSI
MIKROBA
• Teknik molekuler seperti analisis Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP), PCR,
dan rangkaian DNA bisa digunakan untuk mengidentifikasi bakteri. Jika genom dari patogen
besar dan memproduksi banyak enzim fragmen, yang mencegah menunjukkan pita-pita pada
gel agarose, DNA mungkin diberlakukan dalam analisis blot Southern. Sebagai contoh, jika
seorang dokter menduga infeksi bakteri atau virus , sampel termasuk darah, saliva, feses, dan
cairan serebrospinal dari pasien bisa digunakan untuk mengisolasi bakteri dan viral patogen.
DNA dari dugaan patogen yang kemudian diisolasi dan digunakan dalam teknik molekuler
seperti PCR. PCR adalah alat penting dalam tes pendiagnosisan di laboratorium klinikal
mikrobiologi dan digunakan untuk mendiagnosis penyebab infeksi melalui mikroba seperti
virus Hepatitis (A, B, dan C), Chlamydia trachomatis, dan Neisseria gonorrhoeae (keduanya
adalah menyebarkan penyakit), HIV-1, dan banyak bakteri dan virus lainnya
 JEJAK MIKROORGANISME PENYEBAB
PENYAKIT

• Ahli ilmu pengetahuan menggunakan teknik biologi molekuler untuk contoh dari
mikroba penyebab penyakit dan perjangkitan penyakit yang mereka timbulkan.
Seperti yang telah ketahui, mikroba memiliki peran penting dalam produk sehari-
hari seperti yoghurt dan keju. Produk-produk tersebut juga mudah terkena
kontaminasi dengan mikroorganisme patogen. Informasi mengenai mikroba pada
susu bisa digunakan untuk mendeteksi kualitas susu dan kerusakan pada susu
tersebut. Kontaminasi bakteri pada makanan adalah masalah yang signifikan saat
ini. Salmonella dapat mengkontaminasi daging, unggas, dan juga
telur. Salmonella dapat menginfeksi pada usus manusia yang bisa menyebabkan
diare dan muntah yang serius, gejala yang biasanya disebut dengan keracunan
makanan.