1.

Karakteristik bakteri Agrobacterium tumefaciens

Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen pada tanaman yang banyak digunakan
untuk memasukkan gen asing ke dalam sel tanaman untuk menghasilkan suatu tanaman
transgenik. Secara alami, A. tumefaciens dapat menginfeksi tanaman dikotiledon melalui
bagian tanaman yang terluka sehingga menyebabkan tumor mahkota empedu (crown gall
tumor).
o Bakteri yang tergolong ke dalam gram negatif ini
o Memiliki sebuah plasmid besar yang disebut plasmid-Ti yang berisi gen penyandi faktor
virulensi penyebab infeksi bakteri ini pada tanaman.
o Menyerang tanaman dikotiledon serta naman monokotiledon seperti jagung, gandum,
dan tebutelah digunakan untuk memasukkan sel asing ke dalam genom tanaman.
o Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen pada tanaman yang banyak digunakan untuk
memasukkan gen asing ke dalam sel tanaman untuk menghasilkan suatu tanaman transgenik.
o Agrobacterium berbentuk batang, berukuran 0,6 1,0 m sampai 1,5 3,0 m, dalam bentuk
tunggal atau berpasangan.
o Agrobacterium merupakan bakteri yang mudah bergerak (motile) dan memiliki 1-6
flagela peritrichous serta merupakan bakteri tak berspora.
o Suhu optimal pertumbuhan bakteri ini adalah 25-28C.
o Kumpulan
bakteri
ini
biasanya
berbentuk
cembung,
bulat,
lembut,
dan
tak berpigmen. Agrobacterium diisolasi dari tanaman yang terinfeksi Crown Gall.
2. Agrobacterium dan Peranannya dalam Transfer Gen
Transformasi gen adalah proses dimana DNA asing dimasukkan kedalam sel tanaman,
dimanapara pemulian tanaman dapat memasukkan gen asing kedalam sel atau jaringan
tanaman, baik secara langsung maupun tak langsung tanpa merujuk kepada tingkat hubungan
genetik atau kompatibelilitas suatu jenis. Teknologi pemindahan gen atau transfer gen dapat
dibedakan menjadi dua, yaitu langsung dan tidak langsung. Contoh transfer gen secara
langsung adalah perlakuan pada protoplas tanaman dengan eletroporasi atau
dengan polyethyleneglycol (PEG), penembakan eksplan gen dengan gene gun atau di vortex
dengan karbit silikon. Teknik pemindahan gen secara tak langsung dilakukan dengan bantuan
bakteri Agrobacterium. Dari banyak teknik transfer gen yang berkembang, teknik melalui
media vektorA. tumefaciens paling sering digunakan untuk metransformasi tanaman,
terutama tanaman kelompok dikotil. Bakteri ini mampu mentransfer gen kedalam genom
tanaman melalui eksplan baik yang berupa potongan daun (leaf disc ) atau bagain lain dari
jaringan tanaman yang mempunyai potensi beregenerasi tingg.
Gen yang ditransfer terletak pada plasmid Ti (tumor inducing ). Segmen spesifik DNA
plasmid Ti disebut T-DNA (transfer DNA ) yang berpindah dari bakteri ke inti sel tanaman
dan berintegrasi kedalam genom tanamn. Karena A. tumefaciens merupakan patogen tanaman
maka Agrobacterium sebagai vektor yang digunakan untuk transformasi tanaman adalah
bakteri dari jenis plasmid Ti yang dilucuti virulensinya (disarmed), sehingga sel tanaman
yang ditransformasi oleh Agrobacterium dan yang mampu beregenerasi akan membentuk

suatu tanaman sehat hasil rekayasa genetik. Teknik transformasi melalui media
vektor Agrobacterium pada tanaman dikotil telah berhasil dengan baik tetapi sebaliknya tidak
umum digunakan pada tanaman monokotil. Namun beberapa peneliti telah melaporkan
bahwa beberapa strain Agrobacterium berhasil metransformasi tanaman monokotil seperti
jagung dan padi.
3. Mekanisme Proses Transformasi Gen oleh Agrobacterium tumefaciens
Dasar dari transformasi genetik oleh Agrobacterium adalah transfer dan integrasi TDNA ke dalam genom di dalam inti sel tanaman. T-DNA adalah suatu bagian pada tumor
inducing (Ti) plasmid yang terdapat di dalam sel Agrobacterium. Ti-plasmid berukuran
sekitar 200-800 kbp dan T-region (T-DNA)nya sendiri berukuran sekitar 10% nya (10-30
kbp). T-region ini dibatasi oleh dua sekuen pembatas (border) yaitu right border dan left border yang
mengapit T-region. Bagian lain dari Ti-plasmid yang tidak kalah pentingnya adalah vir-region
yang mengandung sejumlah gen-gen virulen (virA, virB, virC, virD, virE, virF,virG dan virH)
yang berfungsi didalam proses transfer T-DNA ke dalam sel tanaman.
Proses transformasi dimulai dengan melekatnya Agrobacteriumpada sel tanaman.
Kejadian awal ini dimediasi oleh gen-gen yang berlokasi pada kromosom bakteri (gen chvA,
chvB dan att). Langkah berikutnya adalah terinduksinya gen-gen pada vir-region oleh suatu
signal yang spesifik didalam sel bakteri sehingga dihasilkan produk dari expresi gen-gen virulen untuk
memproses T-DNA dan mentransfernya dari dalam sel bakteri. Prosesing dan transfer T-DNA
dimediasi oleh berbagai protein yang dikode pembentukannya oleh gen-gen virulen.
Prosesing T-DNA dimulai dari suatu kejadian memproduksi T-DNA untai tunggal yang
disebut T-strand yang ditransfer ke dalam sel tanaman. Kejadian ini dimediasi oleh produk
dari genvirD1 dan virD2 yang berfungsi memotong T-DNA di bagian left border dan right
border. Salah satu produk yaitu molekul VirD2 tetap melekat secara kovalen pada 5 end dari Tstrand dan membentuk apa yang disebut T-complex yang masih setengah jadi. Pembentukan Tcomplex ini dilaporkan berfungsi untuk menjaga T-DNA dalam perjalanannya menuju inti sel
tanaman inang. Tahap akhir dari transformasi genetik oleh Agrobacterium adalah integrasi TDNA ke dalam genom sel tanaman inang.

DAFTAR PUSTAKA
Buckle K A., Edwards R.A., Fleet G.H. & Wooton M.. 1986. Ilmu Pangan. Terjemahan: H.Purnomo
& Adiono. Univ. Indonesia Press. Jakarta.
Dwidjoseputro. 2005. Dasar-Dasar Mikrobiologi. Djambatan. Malang.

Jawetz, et al., 1995, Mikrobiologi Kedokteran, 218-228, Penerbit Buku Kedokteran

EGC, Jakarta
Johnson, G., et al., 1994, Mikrobiologi dan Imunologi, 32-35, Binarupa Aksara,

Jakarta
Irianto Koes. 2007. Mikrobiologi : Menguak Dunia Mikroorganisme. Yrama Widya. Bandung.
Pelczar, M.J. dan Chan, E.C.S. 1986. Dasar-Dasar Mikrobiologi. UI-Press. Jakarta.
Pelczar MJ dan Chan ECS. 2005. Dasar-Dasar Mikrobiologi (2). UI Press. Jakarta.
Volk WA and Wheeler. 1988. Mikrobiologi DasarJilid I Edisi kelima. Diterjemahkan
olehMarkham. Penerbit Erlangga. Jakarta.
Wahyuni,A.E.T.H. 2003. Karakteristik antigen protein X Spteptococcus agalitica pada sapi perah
sebagai landasan pencegahan mastitis subklinis (online:http://repository .ipb. ac.id/
bitstream/handle/123456789/ 46657/2011ehh.pdf?sequence=1) Diakses 20 Mei 2013
Manalu Yolanda Hassian, Wirawan I Gede Putu, Susrama I Gede Ketut 2014. Isolasi dan Iderntifikasi
Agrobacterium Tumefaciens dari Tanaman Wortel (Daucus carota). E. Jurnal Tropika Vol
3(3) Juli 2014. ISSN : 2301-6515.
Silitonga Nadiah, Wirawan I Gede Putu, Susrama I Gede Ketut 2014. Isolasi dan Iderntifikasi
Agrobacterium Tumefaciens dari Tanaman Mawar (Rosa sp.). E. Jurnal Tropika Vol 3(3) Juli
2014. ISSN : 2301-6515.