LAPORAN PRAKTIKUM BIOTEKNOLOGI PANGAN

FAKULTAS TEKNOLOGI PERTANIAN

PROGRAM STUDI TEKNOLOGI PANGAN
UNIKA SOEGIJAPRANATA
SEMARANG

ELEKTROFORESIS SDS PAGE DAN

KUANTITATIF PROTEIN
Monica Novelia P. Gianto 16.I1.0010
Kelompok C3

Abstrak

Protein dapat ditemukan dari berbagai jenis bahan pangan. Protein dapat dipisahkan
berdasarkan berat molekuknya dengan metode elektroforesis. SDS-PAGE adalah metode
dari elektroforesis untuk memisahkan campuran protein dengan menggunakan matriks
penyangga berpori berupa polyacrylamide dan detergen SDS. Terdapat dua jenis gel yang
digunakan dalam metode tersebut yaitu running gel dan stacking gel. Bahan yang
digunakan pada praktikum ini yaitu hasil isolat protein tempe dan yoghurt cair. Setiap
bahan tersebut memiliki kandungan protein dalam jumlah besar dan berbeda satu sama
lain.

Kata kunci : SDS-PAGE, elektroforesis, isolat protein

1. TUJUAN PRAKTIKUM adalah metode memisahkan rantai

Tujuan praktikum kali ini yaitu untuk
mengidentifikasi profil protein sampel
berdasarkan berat molekulnya dengan
alat SDS PAGE, mengukur berat
molekul protein dari hasil SDS PAGE,
dan mengetahui profil protein yang telah
diketahui berat molekulnya.
2. TINJAUAN PUSTAKA
Teknik pemisahan campuran
berdasarkan pergerakan partikel koloid
bermuatan dengan medan listrik adalah
elektroforesis. Teknik ini biasanya
ditemukan pada analisa virus, asam
nukleat, enzim, dan protein. Prinsip
kerjanya yaitu gaya tarik elektrostatis
(Bio-Rad Laboratories, 2016). SDS-
PAGE (Sodium Dodecyl Sulphate
Polyacrylamide Gel Electrophoresis)
polipeptida pada protein berdasarkan
kemampuan bergeraknya pada arus
listrik dengan polyacrylamide (Oswald,
2016). Faktor-faktor yang menyebabkan
kebocoran yaitu glass plaste rusak
(chipped), pemasangan spacer glass
plate tidak sejajar, atau karet yang sudah
rusak, kotor, dan tidak dipasang dengan
benar (Chiari, 1995).
Running gel memiliki pori kecil,
kandungan akrilamid sedikit, dan pH
8,8. Running gel terdiri atas Acrylamide,
tris HCl pH 8,8, ddH2O, SDS (Sodium
Dodecyl Sulfate), APS (Amonium
Persulfat), dan TEMED (Neuhoff et al.,
1988). Stacking gel berguna untuk
mensejajarkan protein dengan BM
berbeda pada pita tipis Tegangan dan

1
arus listrik digunakan untuk tenaga
penggerak molekul bermuatan, dimana
makin tinggi tegangan dan arus yang
diberikan, maka perpindahan molekul
semakin cepat (Dolnik, 1997).
Destaining adalah proses penghilangan
warna yang tidak berikatan dengan
protein, agar pita protein terlihat jelas.
Pewarna yang biasa digunakan adalah
Coomasie Brilliant Blue R250. UniProt
menyimpan data-data mengenai protein
termasuk sumbernya, berat molekul,
sekuens, panjang, fungsi, dan masih
banyak informasi lain yang disusun oleh
ilmuan di seluruh dunia (UniProt, 2016).
3. MATERI METODE
3.1. Materi
3.1.1. Alat
Alat-alat yang digunakan dalam
praktikum ini adalah eppendorf, mikro
pipet, mikro tip, filter paper, sarung
tangan, gelas beaker, biometra Sodium
Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel
Electrophoresis, fixing box, stain,
penggaris, scanner dan destain box.
3.1.2. Bahan
Bahan yang digunakan dalam praktikum
ini adalah alkohol 75%, alkohol 95%,
ethanol 95%, acrylamide, 1,5M Tris HCl
pH 8,8; 0,5M Tris HCl pH 6,8;
aquabidest (DDH2O), SDS (Sodium
Docecyl Sulfate), APS (Ammonium
Persulfate ((NH4)2S2O8), TEMED,
AccuRuler RGB prestained protein
ladder, SDS PAGE sample buffer, tank
buffer, stain solution (Coomasie Brilliant
Blue R), dan destain solution.
3.2. Metode
3.2.1.Persiapan Gel dan Elektroforesis
2
Mula-mula glass plate dibersihkan
dengan alkohol 75% pada kedua sisi
hingga tidak meninggalkan kotoran.
Selanjutnya, karet penyangga (silicone
rubber seal) dipasangkan pada kaca yang
direkatkan dengan klip. Setelah
terpasang, dilakukan pemeriksaan pada
pemasangan kaca dengan penuangan
etanol 95% dan didiamkan beberapa saat.
Apabila terjadi kebocoran, pemasangan
karet terhadap kaca diulangi kembali
hingga tidak terjadi kebocoran. Selama
menunggu pengecekan, dilakukan
pembuatan stacking gel dan running gel.
Jika kebocoran glass plate tidak terjadi,
larutan running gel dimasukkan ke dalam
glass plate secara perlahan hingga batas
yang ditentukan (3/4 bagian). Setelah
pengisian, pastikan tidak ada gelembung
udara yang terbentuk. Jika terbentuk
gelembung, dapat ditambahkan alkohol
95%. Setelah running gel mengeras,
stacking gel ditambahkan diatasnya
hingga mencapai batas permukaan.
Setelah itu comb dipasangkan pada
stacking gel dan ditunggu hingga
mengeras. Setelah gel mengeras, karet
penyangga dilepas dan rangkaian glass
plate dipindahkan ke dalam alat
elektroforesis. Setelah dipasangkan
dengan rapat, tank buffer ditambahkan
pada bagian dalam alat hingga penuh.
Semua perangkat kemudian dipasangkan
dan disambungkan dengan power supply,
mesin dinyalakan, dan dilihat apakah
dapat bekerja dengan baik atau tidak. Jika
dapat bekerja dengan baik, mesin
dimatikan kemudian diatur kondisi arus
pada 400 mA dan tegangan 180 volt
selama 30 menit, atau hingga sampel
mencapai running gel. Sampel yang akan
digunakan untuk elektroforesis
diinkubasi terlebih dahulu didalam
waterbath (air mendidih) selama 5 menit.
Sampel yang dimasukkan ke dalam
elektroforesis sebelumnya dihitung
jumlahnya (v) berdasarkan perbandingan
dengan konsentrasi (M) masing-masing
sampel. Kemudian running dijalankan
hingga pewarna sudah mencapai bagian
bawah gel. Power supply dimatikan,
kabel dicabut, dan penutup dibuka.
Kemudian glass plate dibuka secara
perlahan serta gel dipindahkan kedalam
stain solution kemudian didiamkan pada
shaker sekitar 30 menit. Setelah itu, stain
solution dibuang dan diganti dengan
destain solution selama 4 jam – 1 malam.
Destain solution diganti sebanyak 3-4
kali atau hingga warna biru pada
background gel hilang dan pita protein
dapat terlihat jelas.
3.2.2. Kuantitatif Protein
Gel hasil SDS PAGE di scan terlebih
dahulu untuk mendapatkan gambar
digital. Setelah didapatkan gambar gel,
dilakukan pengukuran jarak pita protein
yang terbaca dari marker protein dengan
rumus pencarian Rf. Setelah mendapatkan
nilai Rf, angka tersebut dimasukkan ke
dalam persamaan regresi linear dengan
rumus 𝑦 = 𝑎𝑥 + 𝑏 dengan y = Log BM;
x = Rf; BM = anti log y. Setelah
mendapatkan persamaan regresi linear,
dilakukan pengukuran jarak protein dari
sampel pada gel, dan dicari nilai Rf-nya.
Berat molekul sampel kemudian
digunakan untuk pencarian profil protein.
Analisis data dilakukan secara
bioinformatika dengan mengakses
Protein Data Bank pada The Universal
Protein Research
(http://www.uniprot.org/). Pada bagian
3
search, nama organisme yang akan di cari
diketik. Kemudian masuk ke hasil
pencarian dan ikon pensil diklik.
Kemudian, dibagian sequences, pilihan
“mass” diberi tanda centang. Setelah itu,
kriteria pencarian di save. Pada tabel
kemudian akan muncul parameter berat
molekul dalam satuan Dalton. Protein
dengan berat molekul paling mendekati
dicatat namanya (protein names).
4. HASIL PENGAMATAN
Tabel 1. Perhitungan Rf protein ladder
gel
Berdasarkan tabel diatas, dapat dilihat
bahwa BM(kDA) yang dihasilkan secara
berurutan yaitu 180;130;100;75; dan 65.
Panjang pita (cm) yang dihasilkan yaitu
2,5; 2,9; 3,3; 3,7; dan 4,2. Log (BM)
yang dihasilkan yaitu 2,2553; 2,1139;
2,000; 1,8571; dan 1,7993. Rf yang
diperoleh yaitu 0,6098; 0,7073; 0,8049;
0,9024; dan 1,0244
Tabel 2. Hasil pengukuran berat molekul
dan profil protein
Berdasarkan hasil percobaan, setiap
kelompok mempunyai panjang pita yang
berbeda-beda. Rentang panjang pita
yaitu 2,1 cm – 3 cm. Oleh karena itu,
hasil pada Rf, Y (Log BM), dan BM
(kDa) yang didapatkan berbeda-beda
juga. Ketiga hal diatas juga
menyebabkan hasil profil protein yang
tidak sama antar kelompok.
5. PEMBAHASAN
SDS-PAGE (Sodium Dodecyl Sulphate
Polyacrylamide Gel Electrophoresis)
adalah metode untuk memisahkan rantai
polipeptida pada protein berdasarkan
kemampuan bergeraknya pada arus
listrik dengan polyacrylamide sebagai
pemisah. Elektroforesis adalah teknik
pemisahan campuran berdasarkan
pergerakan partikel koloid bermuatan
dengan pengaruh medan listrik. Teknik
elektroforesis digunakan pada analisa
virus, asam nukleat, enzim, dan protein.
Prinsip kerjanya yaitu gaya tarik
elektrostatis, dimana biomolekul
bermuatan diletakkan pada medan listrik
sehingga bergerak bebas menuju
elektroda (anoda dan katoda) yang
menjadi lawan muatannya dalam suatu
matriks. Matriks adalah penyangga
berpori ketika pemisahan molekul,
sehingga pemilihan matriks harus sesuai
dengan target molekul (Dolnik, 1997).
Matriks yang biasa digunakan adalah gel
polyacrylamide, yaitu ikatan silang dan
ukuran porinya seukuran dengan jumlah
molekul protein. Dalam mendeteksi
molekul yang terseparasi dalam gel,
maka dilakukan pewarnaan.
Bahan yang digunakan adalah isolat
protein dari praktikum sebelumnya.
Langkah pertama yang dilakukan yaitu
glass plate dibersihkan dengan alkhohol
75%, lalu karet penyangga dipasangkan
dan direkatkan dengan klip. Jika tidak
ada kebocoran, maka ethanol 95%
dibuang dan bagian dalam kaca
dikeringkan. Hal hal yang menyebabkan
kebocoran yaitu glass plaste rusak
(chipped), pemasangan spacer glass
plate tidak sejajar, atau karet yang sudah
rusak, kotor, dan tidak dipasang dengan
benar (Bio-rad Laboratories, 2016). Saat
menunggu pengecekan, dapat dilakukan
pembuatan stacking gel dan running gel.
Setelah dipastikan tidak bocor, maka
larutan running gel dimasukkan ke
4
dalam glass plate secara perlahan agar
tidak terbentuk gelembung. Running gel
berfungsi untuk memisahkan protein
berdasarkan berat molekulnya, yang
memiliki pori kecil, kandungan
akrilamid sedikit, dan pH 8,8. Running
gel terdiri atas Acrylamide, tris HCl pH
8,8, ddH2O, SDS (Sodium Dodecyl
Sulfate), APS (Amonium Persulfat), dan
TEMED. Tris-HCl sebagai buffer untuk
mencegah kerusakan protein yang
sensitif terhadap perubahan pH yang
sempit. ddH2O adalah air distilasi
sebagai pelarut (Garfin, 2003). SDS
adalah deterjen anionic yang melapisi
protein dan dapat mendenaturasi protein.
Ammonium persulfate (APS) bereaksi
dengan molekul poliakrilamida
membentuk rantai polimer yang
panjang. TEMED berfungsi sebagai
katalisator reaksi polimerisasi akrilamid
menjadi gel poliakrilamid yang
digunakan dalam pemisahan protein.
Penambahan SDS, APS, dan TEMED
harus dilakukan secara berurutan agar
dapat terjadi polimerisasi secara
sempurna (Chairi, 1995).
Setelah running gel mengeras, stacking
gel ditambahkan dan dipasangkan comb
diatasnya, serta ditunggu hingga
mengeras. Comb adalah alat untuk
membentuk sumuran sampel pada gel
agarose maupun acrylamide sebelum
terjadi pengerasan gel. Stacking gel
adalah gel untuk mensejajarkan protein
dengan BM berbeda pada pita tipis.
Pensejajaran ini berguna untuk
mencegah dan menahan protein dengan
berat molekul besar merusak pori pada
bagian atas separating gel sebelum
protein dengan berat molekul kecil
masuk. Stacking gel memiliki pori besar,
sedikit kandungan akrilamid, dan ber-pH
6,8 (Oswald, 2016).
Setelah mengeras, rangkaian glass plate
dipindahkan ke elektroforesis, dan
ditambahkan tank buffer hingga penuh.
Semua perangkat dihubungkan dengan
power supply dengan kondisi arus pada
400mA dan tegangan 180 volt hingga
sampel mencapai running gel. Tegangan
dan arus listrik pada proses
elektroforesis digunakan untuk tenaga
penggerak molekul bermuatan melalui
pori matriks, dimana makin tinggi
tegangan dan arus yang diberikan, maka
perpindahan molekul kearah elektroda
positiv semakin cepat. Tegangan yang
digunakan harus optimal, untuk
menghindari peningkatan suhu pada
buffer yang digunakan. Sebelumnya
sampel yang akan digunakan di inkubasi
di dalam water bath selama 5 menit, dan
sebelumnya sudah dihitung jumlahnya
berdasarkan perbandingan
konsentrasinya. Pemanasan berfungsi
untuk mendenaturasi protein berstruktur
kompleks menjadi lebih sederhana.
Running dijalankan hingga pewarna
mencapai bagian bawah gel, dan arus
listrik dimatikan. Glass plate dibuka
secara perlahan dan gel dipindahkan ke
dalam stain solution dan didiamkan pada
shaker selama 30 menit. Lalu, stain
solution dibuang dan diganti dengan
destain solution selama 4 jam – 1 malam.
Destain solution diganti sebanyak 3-4
kali hingga warna birunya hilang dan
pita terlihat dengan jelas. Destaining
adalah proses penghilangan warna yang
tidak berikatan dengan protein, agar pita
protein terlihat lebih jelas. Pewarna yang
5
digunakan adalah Coomasie Brilliant
Blue R250. Pewarna ini kurang sensitiv,
namun waktu pewarnaan lebih cepat
(Neuhoff et al., 1988).
Gel hasil SDS-PAGE discan untuk
mendapatkan gambar digital. Lalu,
dilakukan pengukuran jarak pita protein
yang terbaca dari marker protein dengan
rumus pencarian Rf. Setelah
mendapatkan nilai Rf , angka tersebut
dimasukkan kedalam persamaan regresi
linier y = a + bx. Retension faktor (Rf)
adalah faktor penghambat untuk
memisahkan protein-protein pada gel
dengan cara menghambat laju migrasi
protein sehingga terjadi pemisahan yang
membentuk pita-pita pada jarak migrasi
yang saling berbeda karena perbedaan
berat molekul. Berat molekul sampel
digunakan untuk pencarian profil protein
pada database UniProt
(www.uniprot.org). Protein dengan berat
molekul paling mendekati dicatat
namanya (protein names). UniProt
menyimpan data-data mengenai protein
termasuk sumbernya, berat molekul,
sekuens, panjang, fungsi, dan masih
banyak informasi lain yang disusun oleh
ilmuan di seluruh dunia (UniProt, 2016).
Berat molekul berbeda menghasilkan
profil protein yang berbeda. Pada
kelompok C1-C4 menggunakan sampel
isolat tempe, sedangkan C5-C8
menggunakan yoghurt cair sebagai
sampel. Kelompok C1 dengan berat
molekul 190,9896 kDa, yang diketahui
bahwa protein tersebut adalah DNA
polimerase. Protein ini merupakan
enzim yang berperan dalam replikasi
atau reparasi DNA, dan bersifat
katalisator. Kelompok C2 dihasilkan
berat molekul sec63-domain-containing
protein, dimana protein ini berfungsi
untuk dalam penentuan segmen dan
homolog mamalia yang dapat dilibatkan
dalam pengaturan transkripsi gen dan
struktur kromatin. Pada kelompok C3
dihasilkan berat molekul 195,9923 kDa
dengan protein putative DNA-directed
RNA polymerase, yang berperan dalam
aktivitas dimerisasi protein dan
trasnkripsi DNA. Dibawahnya terdapat
protein dengan berat molekul 192,2282
yaitu clathrin heavy chain, yang
berperan dalam lalu lintas selektif
membran pada eukariotik. Pada C4
dihasilkan berat molekul 197,2633 kDa,
dengan protein Adenyly cyclase, dimana
protein tersebut terlibat dalam
pembentukan ingatan dan detektor. Lalu,
protein dengan berat molekul 194,2633
yaitu cation-transporting ATPase,
berfungsi untuk mengangkut berbagai
senyawa yang berbeda, termasuk ion dan
fosfolipid, melintasi membran
menggunakan hidrolisis ATP untuk
energi, dan protein dengan berat molekul
188,5364 yaitu Putative TATA-binding
protein associated factor MOT1, yang
berperan sebagai trasnkripsi yang
mengikat rangkaian DNA (Oswald,
2016)
Pada kelompok C5 dihasilkan bera
molekul 195,9923 yaitu putative large
secreted protein, yang berfungsi untuk
aktifitas transferase. Dibawahnya
dihasilkan berat molekul 193,4748 yaitu
endo-beta-N-acetylglucosaminidase,
yaitu enzim yang berperan dalam
pemrosesan oligosakarida bebas di
sitosol. Selanjutnyaa, berat molekul
6
yang didiapatkan yaitu 189,7590 yaitu
ferrous iron transporter B, yang
berfungsi sebagai transporter membran
besi. Pada C6 juga dihasilkan protein
endo-beta-N-acetylglucosaminidase,
lalu dihasilkan berat molekul 190,9896
yaitu putative collagen binding surface-
anchored protein, dihasilkan protein
fibronectin dengan berat molekul
186,1146 yang berperan dalam
pembekuan darah. Pada C7 dihasilkan
juga protein endo-beta-N-
acetylglucosaminidase, protein serine
protease dengan berat molekul 185,5402
yang berfungsi sebagai enzim yang
membelah ikatan peptida, dimana serine
adalah asam amino nukleofilik.
Dibawahnya dihasilkan berat molekul
179,0344 yaitu sortase B, yaitu enzim
peptidase yang mengkatalis reaksi
penyortiran dinding sel yang
dipermukaannya mengandung motif
NXTN yang telah mengalami
pembelahan (Chairi, 1995). Pada C8
juga dihasilkan endo-beta-N-
acetylglocosaminidase, selain itu
dihasilkan protein fibronectin dan
sortase B juga yang fungsinya telah
dibahas sebelumnya
6. KESIMPULAN
 Elektroforesis adalah teknik
memisahkan campuran berdasarkan
pergerakan partikel bermuatan
dengan pengaruh medan listrik.
 SDS-PAGE adalah metode untuk
memisahkan rantai polipeptida pada
protein berdasarkan kemampuan
bergeraknya pada arus listrik
 Bahan yang digunakan yaitu dari
isolat protein tempe dan yoghurt cair
  Tempe mengandung protein : DNA
polymerase, set63-domain-containin
protein, putative DNA-directed RNA
polymerase, Clathrin heavy chain,
Adenyly cyclase, cation-transporting
ATPase, dan Putative TATA-
bindung protein associated factor
MOT1.
 Yoghurt cair mengandung protein :
putative large secreted protein, endo-
beta-N-acetylglucosaminidase,
ferrous iron transporter
fibronectin, sortase B, dan serine
protease
Semarang, 3 Oktober 2018
Praktikan, Asisten Praktikum
isoelectric focusing gels with clear
background at nanogram sensitivity
using coomassie brilliant blue G-
250 and R-250. Electrophoresis, 9,
255–262.
Oswald, N. (2016). How SDS-PAGE
works.
http://bitesizebio.com/580/how-sds-
page-works/ diakses pada 2 Oktober
2018.
UniProt (2016). UniProtKB -
B,
A0A0F7RJF1 (A0A0F7RJF1_VIG
RR)http://www.uniprot.org/uniprot
/A0A0F7RJF1. diakses 2 Oktober
2018.

Monica Novelia Angela Novita

7. DAFTAR PUSTAKA
Bio-Rad Laboratories. (2016). A Guide
to Polyacrylamide Gel
Electrophoresis and Detection.
Bulletin 6040 Rev B US/EG.

Chiari, M. & Righetti, P.G. (1995). New

types of separation matrices for
electrophoresis. Electrophoresis,
16, 1815-1829.

Dolnik, V. (1997) Capillary zone

electrophoresis of proteins,
Electrophoresis, Vol. 18, No. 12-13
(1997) pp. 2353-2361, ISSN: 0173-
0835.

Neuhoff, V., Arold, N., Taube, D. &

Ehrhardt, W. (1988). Improved
staining of proteins in
polyacrylamide gels including
8. LAMPIRAN
8.1. Hasil Pengamatan

7
Hasil perhitungan Rf protein Ladder Gel dapat dilihat pada Tabel 1.

Tabel 1. Hasil Perhitungan Rf Protein Ladder Gel

BM (kDA) Panjang Pita (cm) Log (BM) Rf
180 2,5 2,2553 0,6098
130 2,9 2,1139 0,7073
100 3,3 2,0000 0,8049
75 3,7 1,8751 0,9024
63 4,2 1,7993 1,0244
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
16.
17.
18.
19.

20.
21.

Gambar 1. Kurva Persamaan Linear Gel dengan Buffer Aquabidest

Hasil pengukuran berat molekul dan profil protein dapat dilihat pada Tabel 2.
Tabel 2. Hasil Pengukuran Berat Molekul dan Profil Protein.
Panjang
Kel. Rf Y (Log BM) BM (kDa) Profil Protein
Pita (cm)
C1 2,6 0,6341 2,2810 190,9896 DNA polymerase
Sec63-domain-containing
C2 2,7 0,6585 2,2782 189,7590
protein
Putative DNA-directed RNA
C3 2,2 0,5366 2,2922 195,9923
polymerase
2,5 0,6098 2,2838 192,2282 Clathrin heavy chain

C4 2,1 0,5122 2,2950 197,2633 Adenylyl cyclase

2,3 0,5610 2,2894 194,7295 Cation-transporting ATPase

8
 Putative TATA-binding protein
2,8 0,6829 2,2754 188,5364
associated factor MOT1
Putative large secreted
C5 2,2 0,5366 2,2922 195,9923
protein
Endo-beta-N-
2,4 0,5854 2,2866 193,4748
acetylglucosaminidase
2,7 0,6585 2,2782 189,7590 Ferrous iron transporter B
Endo-beta-N-
3,2 0,7805 2,2642 183,7240
acetylglucosaminidase
Endo-beta-N-
C6 2,1 0,5122 2,2950 197,2633
acetylglucosaminidase
Putative collagen-binding
2,6 0,6341 2,2810 190,9896
surface-anchored protein
3 0,7317 2,2698 186,1146 Fibronectin

3,5 0,8537 2,2557 180,1955 Cell wall anchor protein

Endo-beta-N-
C7 2,1 0,5122 2,2950 197,2633
acetylglucosaminidase
2,9 0,7073 2,2726 187,3216 Subtilisin-like serine protease
3,3 0,8049 2,2614 182,5402 Serine protease
3,6 0,8780 2,2529 179,0344 Sortase B
Endo-beta-N-
C8 2,1 0,5122 2,2950 197,2633
acetylglucosaminidase
3 0,7317 2,2698 186,1146 Fibronectin
Endo-beta-N-
3,2 0,7805 2,2642 183,7240
acetylglucosaminidase
3,6 0,8780 2,2529 179,0344 Sortase B
3,9 0,9512 2,2445 175,5960 Putative flagellar protein FliS

Gambar 2. Gambar hasil SDS PAGE

8.2. Perhitungan

9
Perhitungan Tabel 1

Rumus :

Persamaan linier regresi y = -0,1151x + 2,354

𝑗𝑎𝑟𝑎𝑘 𝑝𝑒𝑟𝑔𝑒𝑟𝑎𝑘𝑎𝑛 𝑝𝑖𝑡𝑎 𝑑𝑎𝑟𝑖 𝑡𝑒𝑚𝑝𝑎𝑡 𝑎𝑤𝑎𝑙
𝑅𝑓 = 𝑗𝑎𝑟𝑎𝑘 𝑝𝑒𝑟𝑔𝑒𝑟𝑎𝑘𝑎𝑛 𝑔𝑒𝑙 𝑑𝑎𝑟𝑖 𝑡𝑒𝑚𝑝𝑎𝑡 𝑎𝑤𝑎𝑙

Panjang Gel : 4,1 cm

BM = 180

Panjang pita = 2,5 cm

Panjang gel = 4,1 cm

2,5
Rf = 4,4 = 0,6098

BM = 130

Panjang pita = 2,9 cm

Panjang gel = 4,1 cm

2,9
Rf = 4,4 = 0,7073

BM = 100

Panjang pita = 3,3 cm

Panjang gel = 4,1 cm

3,3
Rf = = 0,8049
4,1

BM = 75

Panjang pita = 3,7 cm

Panjang gel = 4,1 cm

3,7
Rf = 4,1
= 0,902

10
BM = 63

Panjang pita = 4,2 cm

Panjang gel = 4,1 cm

4,2
Rf = 4,1
= 1,024

Perhitungan Tabel 2
𝑗𝑎𝑟𝑎𝑘 𝑝𝑒𝑟𝑔𝑒𝑟𝑎𝑘𝑎𝑛 𝑝𝑖𝑡𝑎 𝑑𝑎𝑟𝑖 𝑡𝑒𝑚𝑝𝑎𝑡 𝑎𝑤𝑎𝑙
𝑋 = 𝑅𝑓 = 𝑗𝑎𝑟𝑎𝑘 𝑝𝑒𝑟𝑔𝑒𝑟𝑎𝑘𝑎𝑛 𝑔𝑒𝑙 𝑑𝑎𝑟𝑖 𝑡𝑒𝑚𝑝𝑎𝑡 𝑎𝑤𝑎𝑙

Y = -0,1151x + 2,354

BM = anti log Y

11
Kelompok C1 Y = -0,1151x + 2,354

Panjang pita = 2,6 cm Y = -0,1151 (0,6098) + 2,354

2,6 Y = 2,2838
X = Rf = = 0,6341
4,1
BM = anti log (2,2838)
Y = -0,1151x + 2,354
BM = 192,2282
Y = -0,1151 (0,6341) + 2,354

Y = 2,2810
Kelompok C4
BM = anti log (2,2810)
Panjang pita = 2,1 cm
BM = 190,9896
2,1
X = Rf = = 0,5122
4,1

Kelompok C2 Y = -0,1151x + 2,354

Panjang pita = 2,7 cm Y = -0,1151 (0,5122) + 2,354

2,7 Y = 2,2950
X = Rf = 4,1
= 0,6585
BM = anti log (2,2950)
Y = -0,1151x + 2,354
BM = 197,2633
Y = -0,1151 (0,6585) + 2,354

Y = 2,2782

BM = anti log (2,2782)

Panjang pita = 2,3 cm
BM = 189,7590
2,3
X = Rf = 4,1
= 0,5610

Kelompok C3 Y = -0,1151x + 2,354

Panjang pita = 2,2 cm Y = -0,1151 (0,5610) + 2,354

2,2 Y = 2,2894
X = Rf = 4,1
= 0,5366
BM = anti log (2,2894)
Y = -0,1151x + 2,354
BM = 194,7295
Y = -0,1151 (0,5366) + 2,354

Y = 2,2922
Panjang pita = 2,8 cm
BM = anti log (2,2922)
2,8
BM = 195,9923 X = Rf = 4,1
= 0,6829

Y = -0,1151x + 2,354

Panjang pita = 2,5 cm Y = -0,1151 (0,6829) + 2,354

2,5 Y = 2,2754
X = Rf = 4,1
= 0,6098

12
BM = anti log (2,2754) 3,2
X = Rf = = 0,7805
4,1
BM = 188,5364
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,7805) + 2,354

Kelompok C5
Y = 2,2642
Panjang pita = 2,2 cm
BM = anti log (2,2642)
2,2
X = Rf = 4,1
= 0,5366 BM = 183,7240

Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,5366) + 2,354 Kelompok C6

Y = 2,2922 Panjang pita = 2,1 cm

BM = anti log (2,2922) 2,1

X = Rf = = 0,5122
4,1
BM = 195,9923
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,5122) + 2,354

Panjang pita = 2,4 cm
Y = 2,2950
2,4
X = Rf = 4,1
= 0,5854 BM = anti log (2,2950)

Y = -0,1151x + 2,354 BM = 197,2633

Y = -0,1151 (0,5854) + 2,354

Y = 2,2866 Panjang pita = 2,6 cm

BM = anti log (2,2866) 2,6

X = Rf = = 0,6341
4,1
BM = 193,4748
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,6341) + 2,354

Panjang pita = 2,7 cm
Y = 2,2810
2,7
X = Rf = 4,1
= 0,6585 BM = anti log (2,2810)

Y = -0,1151x + 2,354 BM = 190,9896

Y = -0,1151 (0,6585) + 2,354

Y = 2,2782 Panjang pita = 3 cm

BM = anti log (2,2782) 3

X = Rf = 4,1
= 0,7317
BM = 189,7590
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,7317) + 2,354

Panjang pita = 3,2 cm
Y = 2,2698

13
BM = anti log (2,2698) 2,1
X = Rf = = 0,8049
4,1
BM = 186,1146
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,8049) + 2,354

Panjang pita = 3,5 cm
Y = 2,2614
3,5
X = Rf = 4,1
= 0,8537 BM = anti log (2,2614)

Y = -0,1151x + 2,354 BM = 182,5402

Y = -0,1151 (0,8537) + 2,354

Y = 2,2557 Panjang pita = 3,6 cm

3,6
BM = anti log (2,2557) X = Rf = = 0,8780
4,1
BM = 180,1955
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,8780) + 2,354

Kelompok C7
Y = 2,2529
Panjang pita = 2,1 cm
BM = anti log (2,2529)
2,1
X = Rf = = 0,5122 BM = 179,0344
4,1

Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,5122) + 2,354 Kelompok C8

Y = 2,2950 Panjang pita = 2,1 cm

2,1
BM = anti log (2,2950) X = Rf = = 0,5122
4,1
BM = 197,2633
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,5122) + 2,354

Panjang pita = 2,9 cm
Y = 2,2950
2,9
X = Rf = 4,1
= 0,7073 BM = anti log (2,2950)

Y = -0,1151x + 2,354 BM = 197,2633

Y = -0,1151 (0,7073) + 2,354

Y = 2,2726 Panjang pita = 3 cm

3
BM = anti log (2,2726) X = Rf = = 0,7317
4,1
BM = 187,3216
Y = -0,1151x + 2,354

Y = -0,1151 (0,7317) + 2,354

Panjang pita = 3,3 cm
Y = 2,2698

14
BM = anti log (2,2698) Y = -0,1151 (0,8780) + 2,354

BM = 186,1146 Y = 2,2529

BM = anti log (2,2529)

Panjang pita = 3,2 cm BM = 179,0344

3,2
X = Rf = 4,1
= 0,7805
Panjang pita = 3,9 cm
Y = -0,1151x + 2,354
3,9
Y = -0,1151 (0,7805) + 2,354 X = Rf = 4,1
= 0,9512

Y = 2,2642 Y = -0,1151x + 2,354

BM = anti log (2,2642) Y = -0,1151 (0,9512) + 2,354

BM = 183,7240 Y = 2,2445

BM = anti log (2,2445)

Panjang pita = 3,6 cm BM = 175,5960

3,6
X = Rf = 4,1
= 0,8780

Y = -0,1151x + 2,354
8.3. Laporan Sementara

15