MAKALAH
Diajukan untuk memenuhi salah satu tugas mata kuliah Fisiologi Tumbuhan,
Jurusan Pendidikan Biologi, Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Universitas
Siliwangi
Oleh
Mila Rachmi Amalia 172154043
Dhea Annisa 172154044
Puji syukur kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas segala rahmat-Nya
sehingga makalah ini yang berjudul “Bioenergetik dan Sintesis ATP” dapat
tersusun hingga selesai,
Makalah ini penulis susun dengan tujuan untuk mengetahui bioenergetik
dan sintesis ATP pada fisiologi tumbuhan.
Penulis menyadari bahwa selama penyusunan makalah ini penulis
mendapat banyak bantuan dari berbagai pihak. Oleh karena itu penulis
mengucapkan terima kasih kepada:
1. Ibu Dr. Diana Hernawati.,S.Pd.,M.Pd. selaku dosen pengampu mata
kuliah Fisiologi Tumbuhan Jurusan Pendidikan Biologi Fakultas
Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Siliwangi;
2. Rekan-rekan seperjuangan yang telah memberikan motivasi dalam
menyelsaikan makalah.
Penulis menyadari akan adanya kekurangan dalam makalah ini. Untuk itu
kritik dan saran yang sifatnya membangun sangat penulis harapkan demi
kesempurnaan makalah ini. Akhirnya, penulis berharap makalah ini dapat
bermanfaat bagi penulis khususnya dan umumnya bagi pembaca.
i
DAFTAR ISI
ii
BAB I
PENDAHULUAN
1
2
B. Rumusan Masalah
Berdasarkan latar belakang di atas, maka penulis merumuskan
masalah sebagai berikut:
1. Bagaimana proses bioenergetika dan transformasi energi dalam organisme
hidup?
2. Bagaimana transformasi energi dan reaksi berganda?
3. Bagaimana transduksi energi dan chemiosmotik sintesis ATP?
C. Tujuan Makalah
Makalah ini disusun berdasarkan latar belakang dan rumusan masalah
dengan tujuan sebagai berikut:
1. Untuk mengetahui proses bioenergetika dan transformasi energi dalam
organisme hidup.
2. Untuk mengetahui transformasi energi dan reaksi berganda.
3. Untuk mengetahui transduksi energi dan chemiosmotik sintesis ATP.
D. Manfaat Makalah
Makalah ini disusun dengan harapan dapat memberikan manfaat baik
secara teoritis maupun secara praktis. Secara teoritis, makalah ini berguna
sebagai salah satu sumer ilmu pengetahuan mengenai materi bioenergetik dan
sintesis ATP.
Secara praktis makalah ini diharapkan bermanfaat bagi:
1. Penulis, sebagai sarana untuk menambah wawasan dan pengetahuan
khususnya pada materi bioenergetik dan sintesis ATP.
2. Pembaca, sebagai media informasi materi bioenergetik dan sintesis ATP.
BAB II
ISI
4
5
terbatas. Mereka secara individual bebas untuk memutar dan jatuh melalui
ruang. Untuk karbon, molekul glukosa dan karbon dioksida masing-
masing molekul memiliki entropi, tetapi karbon produk molekul dioksida
kurang teratur, kebebasan gerakan lebih besar, dan begitu pula entropi
mereka. Penting untuk dicatat, bagaimanapun, bahwa untuk setiap reaksi
yang diberikan, reaksi entropi semua reaktan dan mempertimbangkan
semua produk harus diambil. Untuk sistem yang tidak diam,
kecenderungan alami untuk entropi meningkat, yaitu untuk sistem menjadi
semakin kacau. Persamaan 5.2 menunjukkan hubungan antara entropi, S,
dan gangguan, D, di mana k adalah konstanta Boltzmann (1.3800662 ×
·◦ −1
10−23 J K ). Dengan demikian, ketika gangguan meningkat, demikian
pula entropi.
S = k log D (5.2)
Kecenderungan ini dirangkum oleh R. J. Clausius: entropi alam semesta
cenderung ke arah yang maksimal. Clausius diktum adalah salah satu cara
untuk menyatakan hukum kedua termodinamika. Karakteristik utama dari
semua kehidupan adalah kompleks ketertiban yang tampaknya
bertentangan dengan hukum kedua termodinamika. Namun, ini tidak
terjadi sama sekali organisme hidup menunjukkan masa hidup terbatas
yang dapat bervariasi dari jam ke hari hingga bertahun-tahun hingga
berabad-abad tergantung pada Spesies. Karena urutan (1 / D) adalah
kebalikan dari gangguan (D), Persamaan 5.2 menjadi
−S = k log (1 / D) (5.3)
Dengan demikian, entropi negatif (−S)!
Namun, sebagai ahli fisiologi, perhatian kita pada entropi terutama
yang mewakili energi yang tidak tersedia untuk melakukan kerja. Dalam
konteks ini, hukum kedua dapat disajikan kembali sebagai: kapasitas
sistem yang terisolasi untuk melakukan kerja terus menurun. Dengan kata
lain, itu tidak mungkin untuk memanfaatkan semua energi dari suatu
sistem untuk melakukan kerja.
5. Kemampuan untuk Melakukan Kerja Tergantung pada Ketersediaan
Energi Bebas
8
GAMBAR 5.1 Energi bebas dari suatu reaksi adalah fungsi dari perpindahannya
kesetimbangan. K adalah rasio aksi massa ketika reaksi berada pada kesetimbangan.
Panah vertikal menunjukkan kemiringan kurva energi bebas, atau perubahan energi
bebas, sebagai reaktan dikonversi menjadi produk. Perhatikan bahwa perubahan energi
11
bebas pada kesetimbangan adalah nol dan bahwa besarnya perubahan energi bebas,
ditunjukkan oleh panjangnya panah, meningkat ketika reaksi bergerak menjauh dari
kesetimbangan menuju reaktan murni atau produk murni. Panah ke bawah
menunjukkan perubahan energi bebas negatif; sebuah panah ke atas menunjukkan
perubahan energi bebas positif. (Digambar ulang dari D. G. Nicholls dan S. J. Ferguson,
Bioenergetics, New York: Academic Press, 2002. Dicetak ulang oleh izin.
GAMBAR 5.2 Adenosin trifosfat (ATP). (A) Molekul ATP terdiri dari adenin (basa nitrogen),
ribosa (gula), dan tiga kelompok terminal fosfat. (B) Hidrolisis ATP menghasilkan ADP
(adenosine difosfat) ditambah fosfat anorganik molekul.
Fotosintesis dan respirasi, yang akan kita bahas lebih rinci, adalah
fenomena elektrokimia. Masing-masing beroperasi sebagai urutan reaksi
oksidasi-reduksi di mana elektron berada ditransfer dari satu komponen ke
komponen lainnya. Jadi, oksidasi itu satu komponen dihubungkan atau
digabungkan dengan pengurangan komponen selanjutnya. Seperti elektron
yang digabungkan reaksi transfer dikenal sebagai reduksi-oksidasi atau
reaksi redoks. Ini dapat diilustrasikan sebagai berikut cara umum. Senyawa
apa pun, A, dalam bentuk tereduksi (Ared), menjadi teroksidasi (Aox)
ketika melepaskan elektron (e−) (Persamaan 5.15). Demikian pula,
senyawa apa pun, B, dalam bentuk teroksidasi (Box), menjadi tereduksi
(Bred) ketika ia menerima elektron (Persamaan 5.16). Ketika kedua reaksi
digabungkan, efek bersihnya adalah transfer elektron dari senyawa A ke
senyawa B (Persamaan 5.17) dengan Ared menjadi reduktor dan Box
menjadi oksidan.
Ared → Aox + e− (5.15)
Box + e− → Bred (5.16)
Ared + Box → Aox + Bred (5.17)
Sebagai contoh biologis spesifik, pertimbangkan jaring reduksi asam tiga-
fosfogliserat (PGA) menjadi gliseraldehida-3-P (GAP) dengan bentuk
tereduksi dari nikotinamid adenin dinukleotida fosfat (NADPH):
PGA + NADPH + H+ → GAP + NADP+ (5.18)
Reaksi redoks dapat dengan mudah dibedah menjadi dua setengah reaksi
yang melibatkan sumbangan dan penerimaan elektron. Dengan demikian
pengurangan PGA ke GAP mungkin dianggap sebagai dua reaksi setengah:
NADPH → NADP+ + H+ + 2e− (5.19)
PGA + 2e− + H+ → GAP (5.20)
Jadi, oksidasi NADPH menjadi NADP + digabungkan ke pengurangan
PGA ke GAP. Sepasang tereduksi / teroksidasi seperti NADPH / NADP +
dikenal sebagai pasangan redoks. Perhatikan bahwa reaksi oksidasi-
reduksi sering melibatkan transfer proton. Proton yang bermuatan positif
menyeimbangkan muatan negatif dari elektron yang diperoleh, yang
16
TABEL 5.1 Potensi redoks titik tengah untuk pemilihan pasangan redoks yang terlibat dalam
fotosintesis dan pernapasan.
17
Jadi, untuk transfer elektron yang digabungkan dari air (donor) ke NADP +
(akseptor) seperti yang terjadi dalam transpor elektron fotosintetik dalam
kloroplas, ΔEm = (−320) - (+820) = −1140 mV = −1.14 V.
Dalam Persamaan 5.21, nilai ΔGo’ untuk transfer dua elektron dari H2O ke
NADP+ adalah +220 kJ mol-1. Perhatikan bahwa tanda ΔGo’positif,
menunjukkan bahwa transfer elektron ini tidak akan terjadi secara spontan.
Dalam fotosintesis, energi cahaya digunakan untuk menggerakkan
hubungan reaksi endergonik ini. Sebaliknya, mitokondria mentransfer
18
elektron dari NADH ke O2. Untuk hubungan reaksi transfer elektron, nilai
ΔEm adalah +1.14 V dan akibatnya ΔGo’ adalah 20220 kJ mol−1,
berdasarkan transfer elektron ini dalam mitokondria bersifat eksergonik
yang akan terjadi secara spontan.
Penting untuk diperhatikan bahwa mekanisme molekuler, elektron
ditransfer melalui proses yang kompleks seperti fotosintesis, respirasi, dan
asimilasi nitrogen tidak dalam bidang bioenergi.
yang berbeda fungsi: membran luar, membran bagian dalam, ruang antar
membran, dan matriks (Gambar 5.7B). Komposisi dan sifat dari kedua
membran itu sangat berbeda. Bagian luar membran, yang memiliki
beberapa fungsi enzimatik, kaya dalam lipid dan mengandung protein yang
relatif sedikit. Bagian dalam membran, di sisi lain, mengandung lebih dari
70 persen protein berdasarkan berat kering. Membran luar juga sangat
permeabel bagi sebagian besar metabolit. Itu mengandung protein
pembentuk saluran besar, yang dikenal sebagai porins, yang pada dasarnya
memungkinkan bagian gratis dari molekul dan ion dengan massa molekul
10.000 Da atau kurang. Permeabilitas membran bagian dalam, seperti
kloroplas, jauh lebih selektif, bebas menyerap hanya ke beberapa molekul
kecil seperti itu seperti air, O2, dan CO2. Seperti membran thylakoid
kloroplas, permeabilitas bagian dalam membran mitokondria ke proton
sangat rendah, faktor yang signifikan yakni sehubungan dengan perannya
dalam sintesis ATP.
Membran bagian dalam mitokondria dilipat lebar. Invaginasi ini
membentuk jaringan padat membran internal yang disebut krista. Tipe
gambar buku teks biologi dari krista berdasarkan pada hewan mitokondria
di mana lipatan pada dasarnya adalah garis panjang dan membentuk
ekstensi seperti platina ke dalam matriks. Pola umum dalam mitokondria
tanaman kurang teratur, membentuk sistem tabung dan kantung (Gambar
5.8). Interior mitokondria yang tidak terstruktur, atau matriks, adalah fase
air yang terdiri dari 40 hingga 50 persen protein dari berat. Sebagian besar
protein ini terdiri dari enzim terlibat dalam metabolisme karbon, tetapi
matriks juga mengandung genom mitokondria, termasuk DNA, RNA,
ribosom, dan mesin yang diperlukan untuk menyalin gen dan protein
sintesis.
23
GAMBAR 5.9 Model ATP sintase kloroplas. CF0 adalah protein membran
integral yang membentuk saluran proton melalui membran tilakoid. CF1
melekat pada sisi stroma CF0 dan berisi situs aktif untuk sintesis ATP. CF 1
terdiri dari lima subunit berbeda dengan stoikiometri α3, β3, γ, δ, ε. CF0
terdiri dari empat subunit berbeda dengan stoikiometri yang diusulkan a, b,
b’, c10. Saluran proton terletak di antarmuka antara subunit a dan cincin
subunit c. PMF memutar cincin subunit c, yang menyebabkan CF 1 untuk
memutar dan mengubah ADP dan Pi menjadi ATP. Besar panah
menunjukkan arah rotasi.
Elemen penting dari hipotesis chemiosmotic Mitchell adalah
reversibilitas dari reaksi ATP synthase. Ini berarti bahwa dalam kondisi
yang sesuai CF0-CF1 dan kompleks serupa lainnya dapat menggunakan
energi bebas negatif hidrolisis ATP untuk membentuk proton gradien.
Misalnya, baik membran plasma dan tonoplast mengandung ATPase
proton pompa, yang mana pompa proton keluar dari sel atau vakuola.
Energi ATP dilestarikan dalam bentuk gradien proton yang kemudian dapat
dihubungkan ke berbagai bentuk kerja seluler. ATPase proton pompa
adalah cara utama memanfaatkan ATP untuk menyediakan energi untuk
pengangkutan ion lain dan zat terlarut kecil molekul melintasi membran
seluler.
26
A. Simpulan
Penerapan hukum termodinamika untuk studi aliran energi melalui
organisme hidup disebut bioenergetik. Ada dua bentuk energi, tersedia untuk
melakukan pekerjaan (energi bebas) dan yang tidak (entropi). Dalam sistem
biokimia seperti organisme hidup, energi bebas terkait dengan keseimbangan
kimia. Semakin jauh reaksi ditahan dari keseimbangan, semakin banyak
pekerjaan yang bisa dilakukan.
Sel memanfaatkan prinsip ini untuk menghubungkan atau
memasangkan reaksi yang menghasilkan energi dengan reaksi konsumsi
energi. Faktanya, kehidupan ada karena sel mampu menghindari
keseimbangan, yaitu, menghindari entropi maksimum.
Sebagian besar pertukaran energi reaksi dalam sel dimediasi oleh
intermediet terfosforilasi, terutama ATP dan terkait molekul. ATP berguna
dalam hal ini karena ia memiliki konstanta kesetimbangan besar dan sangat
tinggi ponsel di dalam sel. Karena ATP diaktifkan lebih cepat, dipertahankan
jauh dari keseimbangan.
Dengan mengeksploitasi kompartemen spesifik dalam kloroplas
(stroma vs lumen) dan mitokondria (matriks vs. ruang intermembran), sintesis
chemiosmotic dari ATP dihubungkan atau digabungkan dengan proton yang
kaya energi gradien (distribusi proton nonequilibrium) melintasi tylakoid
transduksi energi dari kloroplas atau membran bagian dalam (krista)
mitokondria. Energi bebas transpor elektron digunakan untuk menetapkan
gradien proton dan ATP disintesis sebagai proton kembali melalui ATP
transmembran mensintesis kompleks.
27
28
B. Saran
Dengan penulisan makalah ini penulis mengharapkan agar pembaca dapat
mengetahui dan memahami tentang bioenergetik dan sintesis ATP dan diharapkan
dapat memperbanyak wawasan mengenai bioenergetik melalui sumber-sumber
atau referensi yang lain.
DAFTAR PUSTAKA
29