ANALISIS INSTRUKSIONAL

DAN
SILABUS

MATA KULIAH DAN PRAKTIKUM

MIKROBIOLOGI DASAR
(BIO 210)

Oleh:

Dr. Rika Indri Astuti, M.Si

DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
INSTITUT PERTANIAN BOGOR
2018

ANALISIS INSTRUKSIONAL
 Mata Kuliah : Mikrobiologi Dasar, BIO210/3(2-1)

Capaian Pembelajaran :
(1) Mahasiswa mampu menjelaskan teori kedudukan dan sistematika mikrob terhadap organisme lain (2) Mampu mengidentifikasi karakter dan keragaman
mikrob yang didasari oleh ciri morfologi, fisiologi, metabolisme dan genetika (3) Mampu menerapkan teknik-teknik dasar analisis mikrobiologi di laboratorium
secara benar dan tepat (4) Menguasai pengetahuan dan teori mikrobiologi sebagai ilmu dasar dan potensi aplikasi-nya dalam kehidupan, mencakup lingkup
biodiversitas, lingkungan, dan bioteknologi.

11. Mampu menjelaskan kedudukan dan perkembangan Mikrobiologi sebagai ilmu dasar
dan ilmu terapan

6. Terampil dalam mengkarakterisasi

mikrob melaui teknik pewarnaan dan uji
fisiologi
7. Mampu 8. Mampu 9. Mampu 10. Mampu
menjelaskan peranan menjelaskan menjelaskan menjelaskan
mikrob dalam siklus interaksi mikrob peranan mikrob peranan mikrob
biogeokimia (bidang dengan manusia dalam bidang dalam bidang 5. Mampu menerapkan teknik kuantitasi
lingkungan) (bidang kesehatan) pertanian industri mikrob dengan teknik turbidimetri,
hitungan langsung dan MPN

6. Mampu menjelaskan teknik pengendalian mikrob baik secara biologi, fisik dan kimiawi 4. Terampil dalam penyiapan medium
pertumbuhan dan kultivasi mikrob

5. Mampu menjelaskan keragaman mikrob (Arkaea, bakteri, virus, eukaria) berdasarkan

morfologi, fenotipik dan genetika-nya
3. Terampil dalam menerapkan teknik
aseptik

3. Mampu menjelaskan struktur morfologi 4. Mampu menjelaskan secara umum

dan perangkat genetik sel mikrob beserta karakter fisiologi mikrob (metabolisme
2. Terampil menggunakan mikroskop
fungsinya primer, fermentasi, fotosintesis)
untuk pengamatan sel mikrob

2. Mampu menjelaskan sistematika 1. Memahami dan patuh pada tata

kedudukan mikrob terhadap organisme lain tertib praktikum

Kuliah Praktikum
1. Mampu menjelaskan secara umum
sejarah perkembangan ilmu Mikrobiologi

2
 SILABUS

Mata Kuliah : Mikrobiologi Dasar (BIO210)

Kode MK : BIO 210
Semester : Genap

Deskripsi Singkat :
Kuliah ini mempelajari dasar-dasar mikrobiologi, berbagai macam struktur dan aktivitas sel, nutrisi, produksi dan pemanfaatan energi metabolisme
untuk pertumbuhan, diferensiasi selular, perilaku dan komunikasi, aspek genetika, proses pengendalian dan pendayagunaan kelompok utama
mikroorganisme prokariot/eukariot dan virus, serta aplikasi mikrobiologi di bidang industri dan pertanian.

Dosen :
1. Dr. Rika Indri Astuti, M.Si, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi (Koordinator Kuliah dan Praktikum)
2. Prof. Dr. Aris Tri Wahyudi, MSi, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi
3. Prof. Dr. Anja Meryandini, MS, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi
4. Prof. Dr. Antonius Suwanto, MSc, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi
5. Dr. Yulin Lestari, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi
6. Dr. dr. Sri Budiarti, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi
7. Dr. Ir. Iman Rusmana, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi
8. Dr. Nisa Rachmania, MSi, Bagian Mikrobiologi, Departemen Biologi

Capaian Pembelajaran/ Learning outcomes:

Mahasiswa mampu menguasai, menjelaskan konsep dan mampu mengaplikasikan teori kedudukan serta peran mikrob
Prokariot/eukariot dalam aspek kehidupan berikut pengendalian dan aplikasinya pada kehidupan manusia.
Mahasiswa menguasai konsep dasar mikrobiologi dan mampu menyelesaikan masalah yang berkaitan dengan mikrobiologi berdasarkan
teori dasar yang dikuasainya.
Mampu mengambil keputusan berdasarkan analisis mikrobiologi dan memberikan solusi alternatifnya..

Divisi : Mikrobiologi

3
RENCANA PEMBELAJARAN SATU SEMESTER

Minggu Kemampuan akhir Pokok bahasan Sub-bahan kajian Bentuk Kriteria Bobot Nilai
yang diharapkan pembelajaran penilaian (%)
(Indikator)
Mahasiswa akan
mampu
1. Menjelaskan sejarah Mikroorganisme 1. Kontrak Perkuliahan Ceramah dan diskusi Kebenaran dan 3
mikrobiologi dan dan Sejarah 2. Mikrobiologi sebagai pemahaman
mampu menjelaskan Mikrobiologi bagian Biologi penjelasan
peranan dan 3. Kedudukan mikrob
kedudukan mikrob di diantara organisme lain
antara organisme lain 4. Sejarah mikrobiologi
melalui perkembangan 5. Mikrobiologi dan biologi
ilmu dan teknologi modern
hingga biologi
modern.
2. Menjelaskan berbagai Struktur dan 1. Mikroskopi Ceramah dan diskusi Ketepatan 3
struktur sel beserta Fungsi Sel 2. Ukuran, bentuk dan serta praktikum pemahaman, dan
fungsinya yang Prokariot penataan sel ketepatan,
dimiliki prokariot 3. Struktur eksternal dinding keterampilan
untuk melakukan sel dalam
fungsi dalam 4. Struktur internal dinding penguasaan
menjalankan aspek sel teknik observasi
kehidupan. 5. Morfogenesis : Spora mikroskopis,

3. Menjelaskan Reproduksi dan 1. Pengertian pertumbuhan Ceramah dan diskusi Ketepatan 6

komponen dan cara Pertumbuhan Mikrob serta praktikum pemahaman, dan
untuk reproduksi sel Mikrob Prokariot 2. Faktor lingkungan yang ketepatan,
prokariot, faktor mempengaruhi keterampilan
lingkungan yang pertumbuhan dalam
menunjang 3. Reproduksi bakteri penguasaan
pertumbuhan, menjaga 4. Pengukuran pertumbuhan teknik
keseimbangan sel, cara 5. Metabolit primer dan pengukuran

4
Minggu Kemampuan akhir Pokok bahasan Sub-bahan kajian Bentuk Kriteria Bobot Nilai
yang diharapkan pembelajaran penilaian (%)
(Indikator)
Mahasiswa akan
mampu
reproduksi, cara sekunder pertumbuhan
mengukur mikrob,
pertumbuhan sel.
4. Menjelaskan jenis Nutrisi, kultivasi 1. Nutrisi dan Media untuk Ceramah dan diskusi Kebenaran 5
nutrient untuk dan metabolisme kultivasi serta praktikum penjelasan,
kultivasi prokariot, mikrob 2. Lintasan Metabolisme keterampilan
lintasan utama (Glikolisis dalam
metabolisme berikut Lintasan Pentosa Fosfat penguasaan
proses-prosesnya yang Lintasan Entner teknik, kultivasi
berkaitan dengan Doudoroff mikrob
produksi dan 3. Siklus TCA
pemanfaatan energi 4. Biosintesis makromolekul
serta biosintesis
makromolekul.
5. Menjelaskan berbagai Fermentasi dan 1. Pengertian Fermentasi Ceramah dan diskusi Kelengkapan 7
tipe fermentasi dan Fotosintesis pada 2. Fermentasi laktat, asam serta praktikum dan kebenaran
berbagai tipe mikrob campuran, butirat, butanol penjelasan,
fotosintesis pada dan aseton ketepatan
prokariot dan eukariot 3. Prokariot fotosintetik mengidentifikasi
sebagai pembanding 4. Fotosintetik Oksigenik masalah,
dan anoksigenik ketepatan teknik
5. Sianobakter dan kloroplas kulltivasi mikrob
secara anaerobik

6. Menjelaskan Genetika bakteri 1. Pengertian Mutasi dan Ceramah dan Kelengkapan 5

pengertian mutasi dan mutan Diskusi dan kebenaran
mutan serta dasar 2. Dasar molekuler mutasi penjelasan,
molekuler 3. Transfer gen pada bakteri ketepatan
pembentukannya, 4. Peranan plasmid dan mengidentifikasi

5
Minggu Kemampuan akhir Pokok bahasan Sub-bahan kajian Bentuk Kriteria Bobot Nilai
yang diharapkan pembelajaran penilaian (%)
(Indikator)
Mahasiswa akan
mampu
mekanisme transfer transposon masalah,
gen pada bakteri, 5. Kloning molekuler ketepatan
peranan plasmid dan memberikan
transposon, serta alternatif
pengklonan gen pemecahan
masalah

7. Menjelaskan dengan Virus: Struktur, 1. Struktur virus Ceramah dan Kelengkapan 4

singkat mengenai virus pertumbuhan, dan 2. Replikasi, tahapan dan Diskusi dan kebenaran
sebagai elemen keragaman kuantitasi penjelasan,
genetika morfologi 3. Keragaman virus: Virus ketepatan
dan keragaman, bakteria mengidentifikasi
tahapan replikasi, 4. Virus tanaman masalah,
kuantitasi plak, 5. Virus hewan
lisogeni, virus dengan
inangnya seperti
bakteri, tanaman dan
hewan
8. Ujian Tengah Semester 25
9. Menjelaskan ciri-ciri Keragaman 1. Domain arkhaea, bakteria, Ceramah dan diskusi Kelengkapan 4
dan dasar Mikrob (Arkhaea, dan eukaria serta praktikum dan kebenaran
pengelompokan arkea, Bakteria, dan 2. Arkhaea: Metabolisme penjelasan,
bacteria, dan eukaria Eukaria: fungi) dan Fisiologi, Ekologi, ketepatan
(fungi) berdasarkan dan taksonomi serta mengidentifikasi
ciri filogenetik, fungsionalnya masalah,
fenotipik, morfologi, 3. Domain bakteria: ketepatan teknik
serta fisiologi sebagai Kelompok bakteria identifikasi
metode praktis untuk terpilih dengan ciri unik mikrob secara

6
Minggu Kemampuan akhir Pokok bahasan Sub-bahan kajian Bentuk Kriteria Bobot Nilai
yang diharapkan pembelajaran penilaian (%)
(Indikator)
Mahasiswa akan
mampu
mengidentifikasinya dan pemanfaatannya fisiologi
4. Domain Eukaria:
kelompok fungi terpilih
dan pendayagunaannya
10. Menjelaskan siklus Ekologi Mikrob 1. Pengertian ekologi mikrob Ceramah dan Kelengkapan 5
biogeokimia, siklus C, 2. Siklus biogeokimia Diskusi dan kebenaran
N, P, dan S serta 3. Mikrob yang berperan penjelasan,
mikrob yang berperan dalam Siklus biogekimia: ketepatan
dalam siklus siklus karbon, nitrogen, mengidentifikasi
fosfor, dan sulfur masalah,
1. Fiksasi nitrogen ketepatan
memberikan
alternatif
pemecahan
masalah
berkaitan dengan
peranan mikrob
di lingkungan
11. Menjelaskan berbagai Pengendalian 2. Prinsip dasar pengendalian Ceramah dan diskusi Kelengkapan 6
sarana fisik, kimiawi Mikroorganisme 3. Pengendaliam secara fisik serta praktikum dan kebenaran
dan antibiotik yang dan Kimiawi penjelasan,
dapat digunakan untuk 4. Antibiotik sebagai ketepatan
pengendalian substansi antimikrob mengidentifikasi
pertumbuhan mikrob 5. Antibakteri, masalah,
melalui penghambatan Anticendawan, ketepatan teknik
atau penyingkiran antiprotozoa dan antivirus pengendalian
berikut mekanisme 5. Resistensi antibiotik mikrob.
kerja substansi
antimikrob dan

7
Minggu Kemampuan akhir Pokok bahasan Sub-bahan kajian Bentuk Kriteria Bobot Nilai
yang diharapkan pembelajaran penilaian (%)
(Indikator)
Mahasiswa akan
mampu
resistensi

12. Menjelaskan interaksi Interaksi Mikrob 1. Interaksi mikrob-manusia: Ceramah dan diskusi Kelengkapan 5
mikrob dengan dengan Manusia overview serta praktikum dan kebenaran
manusia, mikrob 2. Mikroflora normal pada penjelasan,
normal pada tubuh tubuh manusia ketepatan
manusia, mikrob yang 3. Interaksi mikrob mengidentifikasi
berbahaya pada berbahaya dengan manusia masalah,
manusia, serta 4. Faktor virulensi dan toksin ketepatan teknik.
mekanisme pertahanan 5. Mekanisme pertahanan
tubuh inang (manusia) inang
13. Menjelaskan berbagai Mikrobiologi 1. Penyakit infeksi dan Ceramah dan Kelengkapan 5
Penyakit Infeksi dan Diagnostik dan Imunodiagnostik Diskusi dan kebenaran
Imunodiagnostik, serta Imunologi 2. Sistem tanggap kebal penjelasan,
dapat menjelaskan 3. Kekebalan spesifik dan ketepatan
berbagai sistem non- mengidentifikasi
tanggap kebal terhadap spesifik masalah,
antigen dan antibodi 4. Reaksi antigen dan ketepatan
antibodi memberikan
alternatif
pemecahan
masalah dalam
diagnostik

8
Minggu Kemampuan akhir Pokok bahasan Sub-bahan kajian Bentuk Kriteria Bobot Nilai
yang diharapkan pembelajaran penilaian (%)
(Indikator)
Mahasiswa akan
mampu
14. Menjelaskan Mikrobiologi 1. Mikrob penting pada Ceramah dan Kelengkapan 5
kelompok mikrob Pertanian bidang pertanian Diskusi dan kebenaran
yang sangat berperan 2. Interaksi mikrob dengan penjelasan,
penting pada bidang tanaman ketepatan
pertanian, interaksi 3. Penambatan nitrogen mengidentifikasi
mikrob dengan secara hayati: simbiotik masalah,
tanaman, serta dan non-simbiotik ketepatan
penambatan nitrogen 4. Bakteri pemacu tumbuh memberikan
serta mikrob pemacu tanaman (PGPR) alternatif
tumbuh tanaman. pemecahan
masalah

15. Menjelaskan peranan Mikrobiologi 1. Mikrob penting di bidang Ceramah dan Kelengkapan 6
Mikrob dalam Industri industri Diskusi dan kebenaran
biokonversi, industri 2. Biokonversi penjelasan,
probiotik, enzim dan 3. Antibiotik ketepatan
antibiotik. 4. Enzim mengidentifikasi
Mahasiswa dapat 5. Probiotik masalah,
menguasai, ketepatan
menerapkan memberikan
pengetahuan alternatif
mikrobiologi dasar pemecahan
untuk mengambil masalah
keputusan di bidang
biodiversitas,
lingkungan,
bioteknologi

9
Minggu Kemampuan akhir Pokok bahasan Sub-bahan kajian Bentuk Kriteria Bobot Nilai
yang diharapkan pembelajaran penilaian (%)
(Indikator)
Mahasiswa akan
mampu
16 Ujian Akhir Semester 25

Tugas terstruktur (kuliah) 10

Penilaian praktikum

Kuis 5

Ujian praktikum 20

Laporan praktikum 15
Total nilai praktikum 40

Nilai UTS+UAS+Tugas terstruktur 60

Nilai BIO210 100

10
RANCANGAN TUGAS PEMAHAMAN (TUGAS TERSTRUKTUR)

Minggu ke- Tujuan tugas Uraian tugas Kriteria penliaian

1-4 Melatih mahasiswa untuk Esai singkat mengenai tokoh penting dalam dunia Ketepatan, kelengkapan dan
mencapai kemampuan akhir Mikrobiologi kejelasan esai
pembahasan 1 sampai 3 Esai singkat mengenai keunikan morfologi sel mikrob
5-6 Melatih mahasiswa untuk Esai singkat mengenai keunikan metabolisme primer dan Ketepatan, kelengkapan dan
mencapai kemampuan akhir genetika mikrob kejelasan esai
pembahasan 5 sampai 6
7-10 Melatih mahasiswa untuk Esai singkat mengenai keragaman mikrob dan interaksinya Ketepatan, kelengkapan dan
mencapai kemampuan akhir dengan lingkungan kejelasan esai
pembahasan 7 sampai 10
11-14 Melatih mahasiswa untuk Esai singkat mengenai peran mikrob dalam dunia medis Ketepatan, kelengkapan dan
mencapai kemampuan akhir dan industri kejelasan esai
pembahasan 7 sampai 10

RANCANGAN PENILAIAN

Capaian pembelajaran Kuis Tugas Ujian Kuliah Ujian Laporan praktikum

terstruktur UTS UAS praktikum (individu)
mampu menguasai, menjelaskan konsep dan mampu ✔ ✔ ✔
mengaplikasikan teori kedudukan serta peran mikrob
Prokariot/eukariot dalam aspek kehidupan berikut
pengendalian dan aplikasinya pada kehidupan
manusia.

Mahasiswa menguasai konsep dasar mikrobiologi ✔ ✔ ✔

dan mampu menyelesaikan masalah yang berkaitan
dengan mikrobiologi berdasarkan teori dasar yang
dikuasainya.

Mampu mengambil keputusan berdasarkan analisis ✔ ✔ ✔

mikrobiologi dan memberikan solusi alternatifnya..

11
BOBOT PENILAIAN
Penilaian Kisaran Nilai Bobot Nilai (%) Keterangan
Penilaian praktikum
Kuis 0-100 5 Nilai individu
Ujian Praktikum 0-100 20 Nilai individu
Laporan Praktikum 60-100 15 Nilai individu

Penilaian Kuliah
UTS 0-100 25 Nilai individu
UAS 0-100 25 Nilai individu
Tugas tersrtuktur 0-100 10 Nilai individu

BUKU/BACAAN POKOK DALAM KULIAH

A. Utama
Madian MT, Martinko JM, Bender KS, Buckley DH, Stahl DA, Brock D. Brock Biology of Microorganisms 14th .2015. Pearson Education.
Sunatmo, TI. 2009 dan 2012. Mikrobiologi Esensial (Terjemahan). Jakarta. Ardy Agency.

B. Anjuran
David White, James Drummond, Clay Fuqua. 2011. The Physiology and Biochemistry of Prokaryotes. Oxford University Press

BUKU/BACAAN POKOK DALAM PRAKTIKUM

A. Utama
Ratna Siri H.,1985. Mikrobiologi Dasar dalam Praktek: Teknik dan Prosedur dasar Laboratorium. PT Gramedia,Jakarta.1985
B. Anjuran
Atlas,RM. 1993.Parks,LC. (ed). Handbook of Microbiological Media.CRC.Press,Inc. London.
Buchanan,RE. & Gibbons,NE. editor,1974. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. Eight ed. The William & Wilkins Company,
Baltimore.USA
Cappuccino,JG.& Sherman,N. 1987. Microbiology: A Laboratory Manual. The Benjamin/Cummings Publishing Company,Inc. California.

12
13