Nihms862014 Indonesian

Akses Publik HHS
Naskah penulis
Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.
Naskah Penulis Naskah Penulis Naskah Penulis Naskah Penulis
Diterbitkan dalam bentuk akhir yang diedit sebagai:

Mutagen Lingkungan Mol . 2017 Juni; 58 (5): 235–263. doi: 10.1002 / em.22087.
Mekanisme kerusakan DNA, perbaikan dan mutagenesis

Nimrat Chatterjee * dan Graham C. Walker
Departemen Biologi, Institut Teknologi Massachusetts, Cambridge, MA 02138
Abstrak
Organisme hidup terus menerus terpapar pada banyak sekali agen perusak DNA
yang dapat memengaruhi kesehatan dan mengatur status penyakit. Namun,
perbaikan DNA yang kuat dan mekanisme pemintas kerusakan dengan setia
melindungi DNA dengan menghilangkan atau menoleransi kerusakan untuk
memastikan kelangsungan hidup secara keseluruhan. Penyimpangan dalam
fine-tuning inidiketahui mengganggu kestabilan homeostasis metabolik seluler,
seperti yang dicontohkan pada berbagai jenis kanker di mana gangguan atau
deregulasi jalur perbaikan DNA mengakibatkan ketidakstabilan genom. Karena agen
biologis, fisik dan kimia yang digunakan secara rutin berdampak pada kesehatan
manusia, pengujian genotoksisitas dan pengaturan penggunaannya menjadi
penting. Dalam tinjauan pengantar ini, kami akan menggambarkan mekanisme
kerusakan DNA dan jalur perbaikan / toleransi yang menangkal untuk memberikan
wawasan tentang dasar molekuler genotoksisitas dalam sel yang menjadi dasar
untuk artikel selanjutnya dalam masalah ini.
Kata kunci
Perbaikan eksisi dasar; perbaikan ketidakcocokan; perbaikan eksisi nukleotida;
perbaikan putus untai tunggal dan ganda; sintesis translesion; telomer
pengantar
Mempertahankan informasi urutan genom dalam organisme hidup penting
untuk kelangsungan hidup. Pada saat yang sama, mutagenesis memainkan
peran yang sangat diperlukan dalam pemeliharaan dan evolusinya, sementara
juga berkontribusi pada kanker, penyakit manusia tertentu, dan penuaan.
Diketahui bahwa DNA, unit dasar pewarisan, adalah molekul yang secara
intrinsik reaktif dan sangat rentan terhadap modifikasi kimiawi oleh agen
endogen dan eksogen. Lebih lanjut, DNA polimerase yang terlibat dalam
replikasi dan perbaikan DNA membuat kesalahan, sehingga membebani sel
dengan mutasi yang berpotensi merugikan. Namun, sel dilengkapi dengan
sistem yang rumit dan canggih — perbaikan DNA , toleransi kerusakan, pos
pemeriksaan siklus sel, dan jalur kematian sel — yang secara kolektif berfungsi
untuk mengurangi konsekuensi merusak dari kerusakan DNA.
Sel merespons kerusakan DNA dengan memicu jalur respon kerusakan DNA
yang kuat (DDR), yang memberikan waktu yang cukup untuk jalur perbaikan
DNA tertentu untuk secara fisik menghilangkan kerusakan dengan cara yang
bergantung pada substrat . Setidaknya lima jalur perbaikan DNA utama —
perbaikan eksisi dasar (BER), perbaikan eksisi nukleotida (NER), perbaikan
ketidakcocokan
*
Penulis korespondensi: nimratc@mit.edu, Telepon:
832-702-0106. Tidak ada konflik kepentingan.
Chatterjee dan Walker Halaman 2
(MMR), rekombinasi homolog (HR) dan penggabungan ujung

non-homolog (NHEJ) — aktif di seluruh tahapan siklus sel yang berbeda,
memungkinkan sel untuk memperbaiki kerusakan DNA. Beberapa lesi spesifik

juga dapat dihilangkan dengan perbaikan direct chemical reversal dan
interstrand crosslink (ICL). Proses perbaikan ini adalah kunci untuk menjaga
stabilitas genetik dalam sel. Selain itu, jenis kerusakan DNA tertentu
merupakan substrat untuk jalur toleransi kerusakan DNA. Pada eukariota yang
lebih tinggi, misalnya, baik diatur kelompok lima sintesis translesion utama
(TLS) polimerase-Rev 1, POL ζ , POL η , POL κ dan POL ι -bypass kerusakan
untuk memungkinkan kelanjutan dari replikasi, tetapi dengan kemungkinan
dari pengenalan bersamaan dari basis yang salah yang dapat diperbaiki
menjadi mutasi pada putaran replikasi berikutnya. Dalam keadaan tersebut,
ketika DNA yang rusak tetap ada, kematian sel terprogram atau apoptosis,
respons regulasi terhadap kerusakan DNA, diaktifkan untuk menyingkirkan sel
dengan ketidakstabilan genom yang luas.
Tidak mengherankan, pada banyak kanker, perbaikan DNA, toleransi

kerusakan DNA, dan jalur DDR terganggu atau dideregulasi, yang
meningkatkan mutagenesis dan ketidakstabilan genom, sehingga mendorong
perkembangan kanker [Bouwman dan Jonkers, 2012; Ghosal dan Chen, 2013;
Wolters dan Schumacher, 2013]. Demikian juga, penuaan dikaitkan dengan
gesekan ujung kromosom dan kegagalan kapasitas dari kombinasi jalur ini.
Penyakit lain, seperti gangguan neurodegeneratif, diakibatkan oleh kegagalan
kombinatorial lebih dari satu proses ini. Penghargaan Nobel Kimia 2015 untuk
Drs. Lindahl, Modrich dan Sancar menyoroti pentingnya mekanisme
kerusakan dan perbaikan DNA serta implikasinya bagi kesehatan manusia.
Dalam ulasan ini kita akan membahas detail berbagai jenis dan mekanisme
kerusakan DNA dan jalur perbaikan kompensasi dan toleransi.
Jenis kerusakan DNA

Kerusakan DNA dapat dikategorikan menjadi dua kelas utama berdasarkan
asalnya: endogen dan eksogen. Mayoritas kerusakan DNA endogen muncul
dari DNA yang aktif secara kimiawi yang terlibat dalam reaksi hidrolitik dan
oksidatif dengan air dan spesies oksigen reaktif (ROS), yang secara alami ada di
dalam sel. Reaksi DNA yang cenderung inheren dengan molekul dari
lingkungan sekitarnya memicu perkembangan penyakit keturunan dan kanker
sporadis [Visconti dan Grieco, 2009; Reuter dkk., 2010; Perrone dkk., 2016].
Kerusakan DNA eksogen, di sisi lain, terjadi ketika agen lingkungan, fisik dan
kimia merusak DNA. Contohnya termasuk UV dan radiasi pengion, agen
alkilasi, dan agen pengikat silang. Di sini kami menawarkan ringkasan singkat
dari agen endogen dan lingkungan utama yang menghasilkan berbagai kelas
kerusakan DNA yang kemudian menjadi substrat untuk jalur perbaikan DNA
spesifik yang dibahas di bagian selanjutnya.
Kerusakan DNA endogen

Kesalahan replikasi, ketidaksesuaian basa DNA dan kompleks DNA topoisomerase
Setiap kali sel manusia bereplikasi, sekitar 3 X 10 9 basa disalin oleh

polimerase replikatif kesetiaan tinggi ( δ dan ε ). Namun, baterai polimerase
DNA lain ( α , β , σ , γ , λ , REV1, ζ , η , ι , κ , θ , ν , μ, Tdt dan PrimPol) dapat
melakukan sintesis DNA kesetiaan yang lebih rendah selama replikasi DNA
atau perbaikan (Tabel 1) [Loeb dan Monnat (2008)]. Tinggi
sintesis DNA kesetiaan merupakan konsekuensi dari atribut struktural dan

Penulis
biokimia dari polimerase DNA replikatif, yang memastikan penyisipan

deoksinukleotida komplementer yang benar berlawanan dengan basis
s Naskah Penulis Naskah Penulis Naskah Penulis
template. Ini dicapai, misalnya, dengan: 1) stabilitas termodinamika dan
energetika pasangan basa dari dNTP dan basis template yang masuk,
2) pemilihan geometris dNTP yang berbentuk dan berukuran benar di situs
aktif polimerase, dan 3) menghilangkan deoksinukleotida yang dimasukkan
secara tidak benar oleh eksonuklease deoksinukleotida 3 ' -5 ' . Selain itu, jalur
perbaikan ketidakcocokan (MMR) berkontribusi terhadap replikasi kesetiaan
lebih dari 100 kali lipat dengan mengoreksi kesalahan langka yang lolos
proofreading oleh replikatif polimerase [Kunkel, 2004; Kunkel, 2009; Kunkel,
2011].
Namun demikian, substitusi basa dan kesalahan penyisipan dan penghapusan

basa tunggal masih terakumulasi pada frekuensi 10 -6 hingga 10 -8 per sel per
generasi [Kunkel, 2004; Kunkel, 2009]. Kesalahan replikasi tambahan
terakumulasi dari kejadian selip untai pada urutan berulang yang
menyebabkan penyisipan dan penghapusan nukleotida yang berpotensi
mengubah kerangka pembacaan [Viguera et al., 2001; Chatterjee N., 2013]. Di
lain waktu, polimerase replikatif salah memasukkan urasil dalam DNA atau
berakhir dengan kesetiaan yang dikompromikan karena perubahan
konsentrasi relatif dan absolut dNTP dan rNTP dalam lingkungan sel [Andersen
et al., 2005; Vertessy dan Toth, 2009; Kumar dkk., 2011; Clausen dkk., 2013;
Buckland et al., 2014; Potenski dan Klein, 2014]. Nukleotida yang dipasangkan /
digabungkan secara tidak tepat ini yang lolos dari proofreading dan MMR
menjadi mutasi pada putaran replikasi berikutnya dan merupakan sumber
utama mutagenesis spontan.
Sumber lain dari kerusakan DNA endogen berasal dari aksi enzim
topoisomerase (misalnya: TOP I, TOP II, TOP III; 7 gen TOP ditemukan dalam
genom manusia), yang terutama menghilangkan ketegangan superhelical pada
DNA selama replikasi dan transkripsi [Wang , 2002; Pommier et al., 2006].
TOP1, misalnya, secara sementara menorehkan DNA superkoil dan
memfasilitasi rotasi untaian yang putus di sekitar untai DNA yang terikat TOP1
untuk mengendurkan DNA. Setelah itu, TOP1 menganut pemutusan hubungan
kerja dengan menyelaraskan gugus 5 ′ -OH dari DNA dengan ikatan
fosfodiester DNA tirosin untuk menyelesaikan kompleks tersebut [Stewart et
al., 1998; Carey et al., 2003]. Misalignment dari ujung DNA 5 ' -OH menstabilkan
kompleks pembelahan untuk membentuk lesi DNA [Pommier dan Cherfils,
2005; Pommier dan Marchand, 2005]. Menariknya, obat antikanker seperti
camptothecin dan banyak senyawa naturopati diketahui menstabilkan
kompleks pembelahan TOP1 -DNA [Staker et al., 2002; Han et al., 2008]. Selain
itu, DNA adduct (dari UV dan turunan benzene) dan struktur DNA yang
menyimpang (nicks, mismatches, abasic sites) juga dapat secara permanen
menjebak kompleks pembelahan TOP1-DNA menjadi lesi DNA yang disebut
kompleks bunuh diri [Burgin et al., 1995; Pourquier dan Pommier, 2001; Meng
et al., 2003]. Kerusakan DNA terkait TOP1 biasanya diperbaiki dengan
pembalikan kompleks ini atau dieksisi oleh TDP1 (tirosil DNA fosfodiesterase)
dan endonuklease [Pommier et al., 2006].
Deaminasi basa spontan
Deaminasi basa adalah sumber utama mutagenesis spontan pada sel manusia,
di mana sitosin (C), adenin (A), guanin (G), dan 5-metil sitosin (5mC) dalam
DNA kehilangan amina eksosikliknya menjadi urasil (U), hipoksantin, xantin
dan timin (T), masing-masing (Gambar 1B). Menariknya, peristiwa deaminasi
dasar ini terjadi pada frekuensi yang jauh lebih tinggi
pada untai tunggal versus DNA beruntai ganda dan sering diperburuk oleh
h Penulis
untai tunggal transien selama replikasi aktif, transkripsi dan rekombinasi

[Lindahl, 1993; Yonekura et al., 2009]. Dalam kasus deaminasi sitosin, misalnya,
pasangan basa C: G asli berubah menjadi pasangan basa U: A pada putaran
pertama replikasi, yang pada putaran berikutnya menghasilkan mutasi CG →
TA. Sitosin dan 5-metil sitosin adalah yang paling sering mengalami deaminasi,
tetapi 5-metil sitosin mengalami deaminasi tiga sampai empat kali lebih sering
daripada sitosin [Lindahl, 1979]. Sementara sitosin terdeaminasi dengan cepat
dihilangkan dari DNA oleh urasil-DNA glikosilase, pasangan basa G: T yang
dihasilkan dari deaminasi 5-metilsitosin malah menjadi substrat untuk
glikosilase DNA timin (TDG) dan proses MMR yang relatif lambat [Lindahl,
1979; Wiebauer dan Jiricny, 1990; Waters dan Swann, 1998]. Akibatnya, transisi
GC → AT pada urutan CpG menyumbang sepertiga dari mutasi situs tunggal
yang bertanggung jawab untuk penyakit keturunan pada manusia [Cooper dan
Youssoufian, 1988; De Bont dan van Larebeke, 2004].
Paradoksnya, deaminasi sitosin juga merupakan rute normal untuk

hipermutagenesis somatik selama pengembangan antibodi karena aksi enzim
deaminase AID (aktivasi-induksi deaminase) dan APOBEC1 (Apolipoprotein B
mRNA editing enzyme katalitik polipeptida 1), yang memediasi pertahanan
tubuh terhadap reterovirus [ Goff, 2003; Blanc dan Davidson, 2010; Chandra et
al., 2015]. Selain sumber deaminasi endogen, paparan lingkungan terhadap
radiasi UV, agen interkalasi, asam nitrat dan natrium bisulfit secara umum
dapat meningkatkan laju deaminasi basa dalam DNA [Chen dan Shaw, 1993;
Moyer et al., 1993; Pfeifer dkk., 2005; d'Ischia et al., 2011]. Dari sudut pandang
evolusi, deaminasi sitosin dari sumber endogen dan eksogen dapat berfungsi
sebagai sumber keragaman genetik [Fryxell dan Zuckerkandl, 2000; Nabel et
al., 2012].
Situs abasic
Situs abasic atau AP (apurinic / apyrimidic) terus menerus dibuat dalam DNA
ketika ikatan N-glikosil, yang menghubungkan basa nitrogen dan tulang
punggung gula fosfat, baik terhidrolisis secara spontan atau dibelah oleh DNA
glikosilase untuk menghasilkan perantara di BER jalan. Misalnya, situs AP
terbentuk ketika urasil dihilangkan dari DNA oleh urasil-DNA glikosilase
[Lindahl dan Barnes, 2000]. Dalam sel manusia, sekitar 10.000 situs abasic
dibuat per hari; baik kondisi pH ekstrim maupun suhu tinggi berdampak
positif pada pembangkitannya [Lindahl, 1993; Tropp, 2011]. Situs abasic secara
inheren tidak stabil dan mudah diubah menjadi pemutusan untai tunggal (SSB)
dari reaksi penyisihan β yang menargetkan ikatan fosfodiester 3 ' dari
deoksiribosa sisa [Bailly dan Verly, 1988; Waters dan Walker, 2006; Tropp, 2011;
Chan et al., 2013]. Kebanyakan situs AP secara efektif dihilangkan oleh
endonuklease AP yang membelah di ujung 5 -nya dan memungkinkan jalur BER
untuk memperbaikinya. Atau, situs AP dapat dilewati oleh polimerase TLS
[Chan et al., 2013]. Tidak diketahui apakah tekanan eksogen lain juga dapat
secara langsung mendorong pembentukan situs AP dalam genom.
Kerusakan DNA oksidatif
Spesies oksigen reaktif (ROS) adalah produk sampingan khas dari rantai
transpor elektron (ETC) selama respirasi seluler pada organisme aerob, dan
juga berasal dari oksidase katabolik, proses anabolik dan metabolisme
peroksisom [Henle dan Linn, 1997].
Pada tingkat rendah, spesies ROS melakukan fungsi seluler penting seperti
berfungsi sebagai pembawa pesan seluler dalam reaksi pensinyalan redoks
Naskah
dan mempengaruhi respons pertahanan penting untuk menyerang patogen

oleh sistem kekebalan [Errol C. Friedberg, 2005; Segal, 2005; Malle et al., 2007].
Naskah
Namun, secara berlebihan, spesies ROS dapat menyebabkan total sekitar 100
Penulis
lesi basa oksidatif yang berbeda dan modifikasi 2-deoksiribosa [Bjelland dan
Seeberg, 2003; Cadet dkk., 2010; Cadet dkk., 2011; Cadet et al., 2012; Ravanat et
Penulis
al., 2012; Kadet dan Wagner, 2014]. Biasanya, konsekuensi merusak dari ROS
diatur dalam sel dengan 1) membatasi respirasi di kompartemen mitokondria,
s Naskah Penulis Naskah Penulis
dengan demikian melindungi komponen seluler lainnya, 2) melindungi DNA
dengan mengomplekskannya dengan histon, dan 3) memadamkan kelebihan
spesies ROS oleh anti-oksidan enzim superoksida dismutase, katalase, dan
peroksiredoksin [Riley, 1994; Mates et al., 1999; Mates dan Sanchez-Jimenez,
1999]. Meskipun demikian, spesies ROS yang melimpah terutama terkait
dengan perkembangan penyakit manusia, seperti kanker, penyakit Alzheimer,
penyakit Parkinson, diabetes, dan gagal jantung [Giacco dan Brownlee, 2010;
Liou dan Storz, 2010; Mohsenzadegan dan Mirshafiey, 2012; Dias dkk., 2013;
Hafstad dkk., 2013].
Spesies ROS yang paling mencolok adalah radikal superoksida (• O 2 - ),

hidrogen peroksida (H 2 O 2 ), dan radikal hidroksil (• OH) [Tropp, 2011]. Di
antara spesies ROS ini, radikal • OH, yang dihasilkan sebagai produk sampingan
dari reaksi Fenton dari H 2 O 2 dengan Fe 2+ , sejauh ini paling reaktif, dan
mampu merusak DNA, protein, dan lipid [Imlay et al. , 1988; Dizdaroglu et al.,
1991]. Radikal elektrofilik • OH ini bereaksi dengan basa DNA dengan 1)
menambah ikatan rangkapnya, 2) mengabstraksi atom hidrogen dari gugus
metilnya, dan 3) menyerang residu gula di sekitarnya [Breen dan Murphy, 1995;
Winterbourn, 2008]. Misalnya, residu glikol timin dihasilkan dari serangan •
OH pada ikatan rangkap timin C5 / C6 (Gambar 1C). Demikian pula, • OH radikal
yang dihasilkan sebagai produk sampingan dari reaksi Fenton dari H 2 O 2 dan
Fe 2+ menginduksi pembukaan cincin imidazol dalam guanin dan adenin untuk
membentuk struktur purin yang terfragmentasi formamidopyrimidine
(Gambar 1C) [Chetsanga et al., 1981 ; Errol C. Friedberg, 2005; C., 2006]. Lesi
basa oksidatif utama dan signifikan secara biologis yang terbentuk dari
hidroksilasi residu C-8 guanin adalah cincin imidazol jenuh 7,8
dihidro-8-oksoguanin (8-okso-G) (Gambar 1C). 8- pasangan okso-guanin salah
dengan adenin daripada sitosin, sehingga menambah beban mutasi secara
keseluruhan, dan selanjutnya teroksidasi menjadi lesi DNA sekunder yang
merusak karena potensi oksidasi yang rendah [Kasai dan Nishimura, 1984;
Cheng et al., 1992; Cadet et al., 1999; Cadet et al., 2010].
Selain menyerang basis DNA, radikal ROS juga dapat membahayakan tulang
punggung DNA yang menyebabkan sekitar 2.300 untai tunggal putus per sel
per jam dalam sel mamalia [Giloni et al., 1981; R, 1981; Henner dkk., 1983a;
Henner et al., 1983b]. Sementara jalur BER memperbaiki basa teroksidasi,
kerusakan pada tulang punggung DNA diperbaiki oleh jalur perbaikan putus
untai tunggal (SSBR) atau jalur perbaikan putus untai ganda (DSBR) [Henner et
al., 1983a; Demple dan Harrison, 1994]. Akhirnya, peroksidasi lipid, oksidasi
molekul lipid oleh radikal hidroksil, menghasilkan produk aldehida seperti
malondialdehida dan 4-hidroksinonenal, yang dapat bereaksi dengan adenin,
guanin dan sitosin untuk membentuk aduk mutagenik [Marnett, 2000;
Plastaras dkk., 2000; VanderVeen et al., 2001]. Sekitar 1 aduk per 10 6 - 10 7 DNA
induk pangkalan hasil dari peristiwa peroksidasi lipid dan jumlah adduct
mutagenik diharapkan menjadi lebih tinggi untuk penyakit penyimpanan
logam seperti
Penyakit Wilson dan hemochromatosis [Carmichael et al., 1995; Luczaj dan

Skrzydlewska, 2003; Broedbaek et al., 2009].
Naskah Penulis
Metilasi DNA
S-adenosylmethionine (SAM), yang digunakan sebagai donor metil oleh metil
transferase selama reaksi metilasi normal, juga dapat secara spontan
Naskah Penulis
menghasilkan hingga 4000 N7- methylguanine, 600 N3-methyladenine dan

10-30 O 6 -methylguanine residu per sel per hari pada mamalia (Gambar 1d)
[Rydberg dan Lindahl, 1982; Holliday dan Ho, 1998; De Bont dan van Larebeke,
2004]. Agen methylating lainnya termasuk garam empedu nitrosated endogen,
betaine, choline, dan agen lingkungan seperti asap tembakau, diet, polusi atau
turunan dari senyawa N-nitroso [O'Driscoll et al., 1999; Zhao et al., 1999]. O 6 -
s Naskah Penulis Naskah Penulis methylguanine dan residu terkait O 4 -methylthymine dan O 4 -ethylthymine
sangat mutagenik, menghasilkan mutasi transisi G: C → A: T dan T: A → C: G.
Sebaliknya, N3-methyladenine hanya sebagian sitotoksik karena
penghambatan sintesis DNA, sedangkan residu N7-methylguanine pada
dasarnya tidak berbahaya kecuali jika mengalami pembelahan spontan untuk
menghasilkan situs AP atau membuka cincin imidazol untuk membentuk
formamidopyrimidine [Loveless, 1969; Loechler dkk., 1984; Larson dkk., 1985;
Preston dkk., 1986; Preston dkk., 1987; O'Connor dkk., 1988; Singer et al., 1989;
Tudek et al., 1992]. Lesi metil minor lainnya yang dihasilkan oleh SAM adalah
mutagenik N3-methylthymine dan
N3-methylcytosine (Gambar 1D) [Boiteux dan Laval, 1982; Saffhill, 1985; Huff
dan Topal, 1987].
Basa termetilasi dihilangkan dari DNA dengan dua jalur utama: 1) pembalikan
langsung kerusakan DNA oleh O 6- metilguanin DNA metiltransferase atau
dengan oksidasi oleh homolog AlkB dioksigenase yang bergantung pada α -
ketoglutaratat , dan 2) BER, yang diprakarsai oleh DNA glikosilase untuk
menghilangkan basa termetilasi dengan mengkatalisis pemutusan ikatan
glikosidiknya [Sakumi dan Sekiguchi, 1990; Tudek et al., 1992; Huang et al.,
1994; Zak et al., 1994; Ye et al., 1998]. Selain itu, lesi DNA
O 6- metilguanin secara menarik memicu siklus MMR sitotoksik dan sia-sia,
melalui pasangan basa abnormal dengan residu lain [Branch et al., 1993; Kat
et al., 1993]. Jika dibiarkan tidak diperbaiki, basa DNA yang dimetilasi adalah
sumber utama kerusakan DNA spontan. Kerusakan DNA teralkilasi dari
senyawa eksogen akan dibahas nanti di artikel.
Kerusakan DNA eksogen

Radiasi Pengion (IR)
Radiasi pengion, terdiri dari alfa, beta, gamma, neutron, dan sinar-X,
berlimpah di lingkungan kita, dihasilkan dari berbagai sumber mulai dari
bebatuan, tanah, dan radon, hingga radiasi kosmik dan perangkat medis. Setiap
jenis radiasi dapat diklasifikasikan untuk menggambarkan efeknya (langsung
atau tidak langsung) dan kepadatan ionisasi (transfer energi linier (LET)).
Bergantung pada jumlah energi yang ditransfer ke materi, radiasi
diklasifikasikan sebagai LET tinggi (sinar alfa) atau LET rendah (beta dan
gamma). Secara kumulatif, IR dapat merusak DNA baik secara langsung atau
tidak langsung, seperti dengan radiolisis air di sekitarnya untuk menghasilkan
sekelompok radikal hidroksil yang sangat reaktif (• OH) [Errol C. Friedberg,
2005; Omar Desoukya, 2015]. Kehadiran oksigen dan spesies reaktif lainnya di
sekitarnya juga
mempotensiasi pembentukan radikal bebas reaktif DNA lainnya oleh IR

[Wardman, 2009]. Faktanya, kerusakan DNA tidak langsung dari radikal (•
Naskah Penulis Naskah
OH) menyumbang sekitar 65% dari kerusakan DNA yang diinduksi radiasi
[Vignard et al., 2013]. Karena itu, IR menghasilkan spektrum lesi dasar yang
mirip dengan yang dihasilkan oleh spesies ROS (lihat bagian sebelumnya).
Lesi utama termasuk 8-oxo-guanaine, timin glikol dan formamidopyrimidines
(Gambar 1C).
Selain menyebabkan lesi basa, radiasi pengion juga menyebabkan putusnya

untai tunggal dengan tanda yang unik, di mana pemutusan DNA memiliki
Naskah
ujung 3 ′ fosfat atau 3 ′ -fosfoglikolat daripada 3 ′ -OH berakhir. Selain itu,

turunan gula yang terfragmentasi dan hilangnya residu dasar terminal
Penulis
berujung pada kerusakan berkerumun atau celah untai tunggal [Henner et

Penulis
al., 1982; Henner dkk., 1983b; Obe et al., 1992]. Endonuklease AP,
s Naskah Penulis
polinukleotida kinase / fosfatase (PNKP) dan tirosil DNA fosfodiesterase 1
(TDP1) dapat secara efisien memproses ujung yang dimodifikasi dan
memungkinkan perbaikan paruh untai tunggal yang diinduksi IR [Price, 1993;
Jilani dkk., 1999; Zhou et al., 2005; El-Khamisy dkk., 2007]. Sebuah lesi yang
diinduksi radiasi yang sangat penting adalah putusnya untai ganda, terbentuk
dari beberapa situs yang rusak yang diposisikan dekat pada kedua untai DNA
[Hutchinson, 1985; Iliakis, 1991]. Meskipun beracun, putus untai ganda yang
diinduksi IR dapat diperbaiki dengan jalur HR [Lomax et al., 2013].
Radiasi ultraviolet (UV)
Radiasi UV yang memancar dari matahari merupakan penyebab utama kanker

kulit pada manusia [Davies, 1995; KIEFER, 2007]. Biasanya, radiasi UV
dikategorikan menjadi tiga kelas berdasarkan rentang panjang gelombang:
UV-C (190–290 nm), UV-B (290–320 nm) dan UV-A (320–400nm). DNA menyerap
radiasi UV maksimal pada 260 nm, setelah itu absorpsi foto turun drastis. Sinar
matahari terdiri dari 5,1% UV-A, 0,3% UV-B, 62,7% cahaya tampak dan 31,9%
inframerah, karena UV-C yang berbahaya sebagian besar disaring oleh lapisan
ozon [Davies, 1995]. Efek UV pada materi disebarkan dengan dua cara.
Pertama, jika UV dapat diserap, molekul dalam materi tereksitasi sehingga
menyebabkan perubahan fotokimia mereka. Kedua, jika UV tidak dapat
langsung diserap, transfer energi dari molekul terdekat yang disebut
fotosensitizer secara tidak langsung mempengaruhi materi. DNA merusak UV
oleh kedua jalur.
Studi laboratorium telah menunjukkan bahwa UV-C merusak DNA terutama

dengan menyebabkan hubungan kovalen antara dua pirimidin yang
berdekatan. Di sini dua fotoproduk utama adalah fotoproduk pirimidin
siklobutane (CPD) dan fotoproduk pirimidin (6 - 4) pirimidon ((6
- 4) PP) (Gambar 2). Frekuensi pembentukan relatif mereka tergantung pada
panjang gelombang dan dosis cahaya [Varghese, 1972; Mitchell dan Nairn,
1989; Davies, 1995], meskipun, hasil (6 -
4) PP sedikit lebih rendah dari CPD [Mitchell dan Nairn, 1989]. Fotoproduk
minor lainnya juga dihasilkan, seperti hidrat pirimidin, glikol timin, dan hasil
adisi dipurin [Demple dan Linn, 1982; Bose dkk., 1983; Kumar et al., 1991;
Mitchell dkk., 1991]. Pada CPD, cincin siklobutan secara kovalen
menghubungkan dua pirimidin yang berdekatan, sedangkan pada (6 - 4) PP,
posisi C6 dari satu pirimidin terkait secara kovalen dengan posisi C4 dari
pirimidin yang berdekatan. Dimer besar ini mendistorsi heliks, membutuhkan
TLS polimerase untuk replikasi melewatinya, sehingga berkontribusi pada
mutagenisitas. Sebagai contoh, C: G → T: A, T: A → C: G dan tandem
karakteristik CC → TT hasil mutasi transisi dari dimer pirimidin [Chan et al.,
1985; Dumaz dkk., 1993; Gentil dkk., 1996; Naegeli, 1997]. Atribut yang menarik
dari (6 - 4) PP adalah ia mengalami fotoisomerisasi menjadi isomer valensi
Dewar dengan adanya UV-
B, saat kembali ke struktur PP konvensional (6 - 4) saat terkena sinar UV-C

[Mitchell dan Nairn, 1989; Davies, 1995]. Jika lesi ini dibiarkan tanpa
Naskah Penulis Naskah Penulis
perbaikan atau tidak dilewati, hal itu menyebabkan sitotoksisitas.
UV-C banyak digunakan dalam penyelidikan laboratorium karena penyerapan

maksimalnya oleh DNA, menghasilkan lebih banyak fotoproduk daripada
radiasi UV-A dan UV-B , yang juga merupakan panjang gelombang UV yang
relevan secara fisiologis yang juga menyebabkan kerusakan DNA [KIEFER,
2007]. UV-B misalnya menyebabkan pembentukan pirimidin dimer, tetapi
kurang efisien dibandingkan UV-C [You et al., 2000; Errol C. Friedberg, 2005;
Rastogi et al., 2010]. UV-A merusak DNA dengan menginduksi pembentukan
DNA adduct dengan reaksi fotooksidasi dan dengan eksitasi fotosensitizer
endogen (porfirin dan flavin) dan eksogen (psoralens, tetrasiklin, promazin
dan metilen biru) [Epe, 1991; Kvam dan Tyrrell, 1997; Douki et al., 1999]. Selain
itu, fotosensitisasi yang dimediasi UV-A dapat menyebabkan pembentukan
8-oksoG atau akumulasi berlebih dari dimer cyclobutane [Epe, 1991; Rochette
dkk., 2003]. Dalam sel mamalia, radiasi UV dekat dan jauh diketahui
menyebabkan ikatan silang protein DNA, sedangkan radiasi UV-A
menyebabkan kerusakan untai DNA [Peak and Peak, 1986; Errol C. Friedberg,
2005]. Lesi UV diperbaiki dengan pembalikan langsung dari basa UV-rusak ,
NER, perbaikan interstrand crosslink (ICL), sintesis translesion, atau
rekombinasi homolog (HR), yang semuanya memperbaiki lesi atau
memungkinkan sel untuk mentolerir keberadaan mereka [Sancar, 1996 ; Errol
C. Friedberg, 2005; Waters dan Walker, 2006; Eppink dkk., 2011].
Agen kimia eksogen

Agen alkilasi
Agen alkilasi eksogen terutama diproduksi dari komponen makanan, asap
tembakau, pembakaran biomassa, proses industri dan agen kemoterapi
[Lawley, 1966; AE, 1990; Crutzen dan Andreae, 1990]. Agen alkilasi elektrofilik
bereaksi dengan peningkatan afinitas pada nitrogen cincin basa nukleofilik
tinggi, terutama N7 dari guanin dan N3 dari adenin, dan sedikit lebih sedikit
dengan oksigen. Contoh basa DNA aduksi termasuk adenin termodifikasi (pada
N1, N3, N 6 dan N7), guanin (N1, N 2 , N3, N7 dan O 6 ), sitosin (N3, N 4 dan O 2 ),
timin (N3, O 2 dan O 4 ), dan alkil fosfat di tulang punggung DNA (posisi
eksosiklik pada basis DNA dalam superskrip miring) [Singer dan Kusmierek,
1982; Penyanyi, 1986; Errol C. Friedberg, 2005]. Secara mekanis, zat
pengalkilasi menambahkan gugus alkil dengan 1) reaksi substitusi S N 1 yang
berlangsung melalui kinetika orde pertama dan melibatkan ion karbonium
antara, atau, 2) reaksi substitusi S N 2 yang mengikuti kinetika orde dua, dan
secara umum menghasilkan aduk yang kurang mutagenik dan karsinogenik
dibandingkan dengan jalur S N 1 [Naegeli, 1997], meskipun bukti telah
disajikan bahwa beberapa agen alkilasi S N 1 mungkin tidak diproses melalui
perantara ion karbonium [Loechler, 1994].
Agen alkilasi yang paling umum digunakan di laboratorium, termasuk methyl

methanesulfonate (MMS), ethyl methanesulfonate (EMS), N-methyl
-N ′ –nitro-N- nitrosoguanidine (MNNG) dan methylnitrosourea (MNU)
(Gambar 3A), bereaksi dengan DNA untuk menghasilkan lesi mutagenik dan
karsinogenik. Misalnya, MMS menghasilkan mutagenik N7-metilguanin dan
N3-metiladenin, keduanya rentan terhadap pemutusan ikatan N-glikosidik ,
sehingga menghasilkan situs AP, sedangkan MNNG dan MNU menghasilkan O
6-
methylguanine, yang salah pasangan dengan T dan menyebabkan mutasi G:

C → A: T [Loechler et al., 1984; Beranek, 1990; Wyatt dan Pittman, 2006].
Naskah Penulis NaskahNaskah
Contoh klasik lain dari agen alkilasi adalah sulfur dan nitrogen mustard, yang
pertama kali digunakan dalam Perang Dunia I, dan dalam banyak konflik
lainnya sejak termasuk Suriah saat ini. Sawi menggerakkan reaksi S N 1, dan
berfungsi ganda karena membawa dua kelompok reaktif, bukan satu seperti
pada agen alkilasi monofungsional, dan dengan demikian memiliki potensi
untuk bereaksi dengan dua situs berbeda pada DNA. Reaksi bifungsional
seperti itu menghasilkan ikatan silang intra dan interstrand, bersama dengan
ikatan silang DNA-protein , yang memblokir aktivitas metabolisme DNA
[Lawley, 1966; AE, 1990]. Properti mustard ini telah dieksploitasi dalam
PenulisPenulis
penggunaannya sebagai agen alkilasi kemoterapi [DeVita dan Chu, 2008]. Salah
satu agen alkilasi yang relevan secara klinis untuk kemoterapi adalah
siklofosfamid (Gambar 3B) yang digunakan dalam pengobatan limfoma,
leukemia dan tumor padat [Emadi et al., 2009]. Kelas lain dari agen pengikat
s Naskah Penulis
silang yang digunakan dalam kemoterapi termasuk cisplatin (Gambar 3B),
senyawa platinum pertama yang disetujui FDA yang digunakan untuk
mengobati berbagai macam kanker [Kelland, 2007; Dasari dan Tchounwou,
2014]. Agen pengikat silang yang bukan merupakan agen alkilasi, psoralen
(sebuah furocoumarin) (Gambar 3B), berinterkalasi menjadi DNA dan
menyebabkan ikatan silang interstrand dan adduct pirimidin pada fotoaktivasi
oleh UV-A [Yurkow dan Laskin, 1991]. Kombinasi psoralen + UV-A atau PUVA
telah efektif digunakan untuk mengobati kondisi kulit seperti psoriasis, eksim,
dan limfoma sel-T kulit . Pembalikan kerusakan langsung, BER dan perbaikan
ICL adalah jalur perbaikan diduga yang menanggapi kerusakan basa teralkilasi
[Wyatt dan Pittman, 2006].
Amina aromatik
Amina aromatik pada dasarnya dihasilkan dari asap rokok, bahan bakar, batu
bara, pewarna industri, pestisida, dan pemasakan suhu tinggi sehari-hari
[Sugimura, 1986; Skipper dkk., 2010]. Setelah aktivasi oleh sistem
monooksigenase P450, amina aromatik diubah menjadi agen alkilasi
karsinogenik (ester dan sulfat) yang menyerang posisi C8 guanin [Hammons et
al., 1997; Naegeli, 1997]. Contoh amina aromatik yang paling banyak dipelajari
adalah 2-aminofluorene (AF) dan turunannya yang diasetilasi
N-acetyl-2-aminofluorene (AAF) (Gambar 3C), yang pada awalnya digunakan
sebagai insektisida sampai ditarik kembali karena sifat karsinogeniknya [
Kriek, 1992]. Lesi C8-guanin yang terbentuk dari aminofluoren diketahui
membentuk lesi persisten yang pada akhirnya menimbulkan substitusi basa
dan mutasi frameshift [Mah et al., 1989; Heflich dan Neft, 1994; Shibutani et al.,
2001]. Sifat mutagenik dari lesi C8-guanine berasal dari kemampuannya yang
khas untuk mengadopsi dua konformasi pada DNA [Eckel dan Krugh, 1994a].
Dalam konformasi eksternal di mana bagian fluorene menonjol keluar, ada
gangguan minimal untuk pasangan basa Watson-Crick , yang memungkinkan
isomer ini secara efektif dilewati oleh polimerase TLS [Vooradi dan Romano,
2009]. Sementara dalam konformasi internal, lesi C8-guanin dan sitosin
mitranya dipindahkan ke alur minor, sepenuhnya mengubah geometri dan
bertindak sebagai substrat yang sangat mutagenik pada DNA [Kriek, 1992;
Eckel dan Krugh, 1994a; Eckel dan Krugh, 1994b]. Jalur NER dikenal untuk
memperbaiki adduct C8-guanine dalam sel manusia [Mu et al., 2012]
Hidrokarbon aromatik polisiklik (PAH)

Naskah Penulis Naskah Penulis Naskah Penulis
Hidrokarbon aromatik polisiklik adalah senyawa karbon dengan dua atau

lebih cincin aromatik dan umumnya dikenal sebagai karsinogen inert,
nonpolar dan tersebar luas di lingkungan [Harvey, 1991]. Sumber umum
termasuk asap tembakau, knalpot mobil, makanan hangus dan pembakaran
bahan organik dan bahan bakar fosil yang tidak sempurna [Schoket, 1999; Yu,
2002]. Karsinogenisitas senyawa ini pertama kali didokumentasikan pada
tahun 1775, diikuti oleh isolasi mereka dari tar batubara dan penjelasan
selanjutnya dari mekanisme kerja mereka [Butlin, 1892; Phillips, 1983; Fujiki,
2014]. PAH bergantung pada sistem P-450 hati untuk menghasilkan zat antara
reaktif yang bereaksi dengan DNA [Phillips, 1983]. Foto-oksidasi, satu oksidasi
elektron, beberapa jalur oksidasi cincin dan reduksi nitrogen juga diketahui
mengaktifkan PAH [Strniste et al., 1980; Fu, 1990; RamaKrishna dkk., 1992;
Rogan dkk., 1993; Flowers et al., 1997; Penning et al., 1999; Yu, 2002].
Contoh PAH yang menonjol adalah naftalen, antrasen, pirena, 1-hidroksipiren,

1-nitropirena, benzo ( a ) pirena dan dibenzo [ a, l ] piren. Dari jumlah tersebut,
yang paling banyak dipelajari adalah benzo ( a ) pyrene (Gambar 3D). Setelah
aktivasi P-450 , benzo ( a ) pyrene menghasilkan karsinogen utama
s Naskah Penulis
(+) - anti -BPDE [(+) - 7,8-hydroxy-9 α , 10 α -epoxy-7,8,9,10- tetrahydrobenzo ( α )
pyrene], bersama dengan (+) - anti-BPDE dan (-) - zat antara anti-BPDE .
Perantara ini pertama-tama berinterkalasi menjadi DNA, kemudian posisi C10
dari BPDE mengikat ke posisi eksosiklik N 2 guanin untuk membentuk DNA
adduct [Geacintov, 1986; Graslund dan Jernstrom, 1989; Cosman et al., 1992].
Dalam hal karsinogenisitas, dibenzo [ a, l ] pyrene (Gambar 3D) adalah PAH
yang paling kuat dan menimbulkan risiko kanker utama pada manusia [Luch,
2009]. Biasanya, jalur perbaikan eksisi seperti NER dan BER memperbaiki lesi
DNA PAH jika tidak dilewati oleh TLS polimerase [Braithwaite et al., 1998; Jha
dkk., 2016].
Elektrofil reaktif lainnya

Mengingat keterbatasan ruang dan cakupan manuskrip ini, kami hanya akan
menyentuh secara singkat beberapa elektrofil reaktif relevan lainnya yang
merusak DNA. N-nitrosamin, yang merupakan karsinogen kuat, merupakan
produk sampingan dari asap tembakau dan juga ditemukan oleh manusia
dalam daging yang diawetkan. N-nitrosamin telah terlibat dalam
perkembangan kanker esofagus, lambung dan nasofaring [Bartsch dan
Montesano, 1984; Tricker dan Preussmann, 1991; Hecht, 1999; Herrmann et al.,
2015]. Elektrofil reaktif lainnya, 4-nitroquinoline 1-oxide, memiliki sifat
karsinogenik dan mutagenik (Gambar 3E). Setelah aktivasi metabolik menjadi
4-acetoxyaminoquinoline 1-oxide (Ac-4HAQO), 4NQO1 membentuk aduk
kovalen dengan C8 atau N 2 guanin dan N 6 adenin, serta menyebabkan stres
oksidatif yang mengakibatkan lesi 8-hidroksiguanin , semuanya yang secara
signifikan menambah peristiwa kerusakan untai dan karsinogenesis oral
[Galiegue-Zouitina et al., 1985; Galiegue-Zouitina dkk., 1986; Kohda dkk., 1986;
Hawkins dkk., 1994; Kanojia dan Vaidya, 2006].
Senyawa penting terakhir kami adalah hormon estrogen, yang sering

digunakan dalam terapi penggantian hormonal, yang menimbulkan
peningkatan risiko kanker kumulatif setelah penggunaan jangka panjang
[Cavalieri et al., 2000; Yager dan Davidson, 2006]. Studi uji epidemiologis dan
klinis menunjukkan peningkatan risiko kanker payudara dan masalah
kesehatan lainnya dari penggunaan kombinatorial estrogen dan progesteron
dibandingkan dengan estrogen saja [Yager dan Davidson, 2006]. Itu
Kompleks enzim P-450 1BI, secara konstitutif diekspresikan dalam payudara

dan jaringan lain, menghidroksilasi estrogen pada posisi 4 untuk
Naskah Penulis Naskah Penulis Naskah
menghasilkan estrogen katekol reaktif, yang teroksidasi menjadi semiquinon

dan kuinon yang bereaksi dengan posisi purin N3 dan N7, atau menghasilkan
spesies ROS [Nutter dkk., 1991; Nutter dkk., 1994; Errol C. Friedberg, 2005].
Kedua adduct besar dan oksidan yang tidak stabil ini menghasilkan situs AP
dan kerusakan untai [Errol C. Friedberg, 2005]. Estrogen juga terlibat dalam
perkembangan kanker prostat, di mana untai putus dan peroksidasi lipid
adalah pembacaan fenotipik dalam model tikus prostat [Ho dan Roy, 1994;
Nelles et al., 2011].
Racun
Racun alami merupakan kelas senyawa genotoksik dan karsinogenik, yang

biasanya digunakan oleh mikroorganisme atau jamur dalam respons
pertahanan [Ames et al., 1990]. Eksposur pada manusia dan hewan dihasilkan
Naskah
dari sereal yang terkontaminasi, minyak sayur, rempah-rempah, kacang

pohon, susu dan produk susu [Lopez et al., 2002]. Aflatoksin adalah racun
alami dari Aspergillus flavus dan Aspergillus parasiticus, di mana aflatoksin B1
Penulis
adalah karsinogen hati yang paling kuat [Bennett dan Klich, 2003]. Setelah
Penulis
berdifusi pasif ke dalam sel, aflatoksin B1 (Gambar 3F) dimetabolisme oleh

kompleks P-450 menjadi bentuk aktif, aflatoksin B1-8,9- epoksida. Elektrofil
reaktif ini kemudian aduk dengan N7 guanin untuk membentuk produk
bermuatan positif, 8,9-dihydro-8- (N7-guanyl) -9-hydroaflatoxin B1, yang
melemahkan ikatan glikosidik yang mengakibatkan depurinasi [Essigmann et
al., 1977 ; Smela et al., 2001].
Tekanan lingkungan
Sumber stres lingkungan seperti panas atau dingin yang ekstrim, hipoksia, dan
stres oksidatif telah terbukti menyebabkan kerusakan DNA pada sel manusia
[Gregory dan Milner, 1994; Gafter- Gvili et al., 2013; Luoto dkk., 2013;
Neutelings et al., 2013; Kantidze et al., 2016]. Tekanan ini juga telah terbukti
menyebabkan mutagenesis pada pengulangan trinukleotida, yang terlibat
dalam perkembangan gangguan neurodegeneratif melalui jalur perbaikan
DNA alt-NHEJ [Chatterjee et al., 2015; Chatterjee dkk., 2016b]. Sama
menariknya adalah pengamatan bahwa jalur mutagenesis akibat stres
lingkungan serupa dengan program ketidakstabilan genom fisiologis yang
beroperasi di banyak sel kanker [Chatterjee et al., 2015; Chatterjee dkk., 2016b].
Sangatlah menarik untuk mengetahui apakah fenotipe stres lingkungan yang
serupa dapat direkapitulasi dalam penelitian tikus.
Produk biologis penggunaan sehari-hari lainnya semakin dikaitkan dengan

kerusakan DNA. Sebagai contoh, butyl paraben (BP) dan bisphenol A (BPA),
ditemukan dalam kosmetik, farmasi, produk makanan dan pengolahan
minuman, terkait dengan kerusakan DNA dalam sel sperma [Oishi, 2002;
Meeker dkk., 2010a; Meeker dkk., 2010b; Meeker dkk., 2011]. Pengawet
makanan [(natrium benzoat (SB), kalium benzoat (PB) dan kalium sorbat (PS)]
dan aditif makanan [(asam sitrat (CA), asam fosfat (PA), biru cemerlang (BB),
dan kuning matahari terbenam (SY) ] semuanya diketahui menyebabkan
kerusakan DNA [Mamur et al., 2010; Zengin et al., 2011; Yilmaz et al., 2014;
Pandir, 2016]. Selain itu, produk perlindungan tanaman (PPP) yang biasa
digunakan oleh pekerja kebun juga telah dikaitkan dengan kerusakan DNA
[Kasiotis et al., 2012]. Contoh seperti itu menekankan pentingnya persyaratan
peraturan global tentang penggunaan bahan kimia yang berisiko bagi
kesehatan manusia, karena mungkin masih ada bahan kimia yang tidak
diketahui yang memiliki risiko kesehatan.
Respons kerusakan DNA (DDR)

Naskah Penulis Naskah Penulis NaskahNaskah
Setelah DNA rusak, protein sensor khusus lesi memulai respons kerusakan
DNA. DDR adalah kumpulan mekanisme yang merasakan kerusakan DNA,
memberi sinyal keberadaannya dan mendorong perbaikan selanjutnya [Harper
dan Elledge, 2007]. Perekrutan faktor DDR adalah proses yang diatur secara
spasiotemporal, di mana faktor-faktor DDR dikumpulkan di lokasi kerusakan
secara berurutan dan terkoordinasi, sebagaimana diverifikasi oleh mikroskop
selang waktu dari fokus diskrit [Harper dan Elledge, 2007; Ciccia dan Elledge,
2010; Polo dan Jackson, 2011]. Selain itu, pemodelan ulang kromatin
merupakan modulator penting dari respons DDR, di mana modifikasi
pasca-translasi kunci memungkinkan perakitan DDR spesifik dan faktor
perbaikan [Bekker-Jensen et al., 2006; Harper dan Elledge, 2007; Misteli dan
Soutoglou, 2009; Polo dan Jackson, 2011; Altmeyer dan Lukas, 2013a; Altmeyer
dan Lukas, 2013b; House et al., 2014]. Mutasi yang mempengaruhi komponen
jaringan DDR adalah penyebab dari beberapa sindrom predisposisi kanker,
yang mencerminkan pentingnya secara keseluruhan dalam menghindari
penyakit manusia yang disebabkan oleh kerusakan DNA [Ciccia dan Elledge,
2010]. Namun, jalur perbaikan DNA (Gambar
Penulis Penulis
4) secara efektif menghilangkan sebagian besar lesi DNA, yang sebaliknya dapat menyebabkan
pembentukan
mutasi atau memblokir proses metabolisme seperti replikasi dan transkripsi
sehingga menyebabkan penuaan dan kematian sel seperti yang akan kita
bahas di bawah ini. Pembaca diarahkan ke ulasan yang sangat baik tentang
peran modifikasi histon selama respons kerusakan DNA [van Attikum dan
Gasser, 2005; Altaf et al., 2007; Zhu dan Wani, 2010].
Perbaikan kerusakan DNA basa

Pembalikan kerusakan DNA
Himpunan kecil lesi DNA — fotolion UV dan basa teralkilasi — dibalik begitu
saja dengan cara yang bebas kesalahan . Pembaca diarahkan ke sumber
literatur yang sangat baik tentang fotoreaktivasi yang dimediasi oleh fotolyase
dari lesi UV yang ditemukan pada organisme tingkat rendah dan marsupial
[Kato et al., 1994; Errol C. Friedberg, 2005; Yi dan He, 2013]. Di sini kita akan
membahas secara singkat pembalikan kerusakan DNA teralkilasi.
Dua kelas enzim yang berbeda membalikkan basa teralkilasi pada manusia dan
mamalia. Pertama, enzim O 6 - alkilguanin-DNA alkiltransferase (AGT / MGMT)
membalikkan lesi DNA teralkilasi-O , seperti gugus O 6- metil, etil, 2-kloroetil,
benzil dan alifatik, hasil adisi piridiloksobutil dari guanin, dan bahkan
memperbaiki hubungan silang interstrand O 6 –G-alkil- O 6 - G [Tubbs et al.,
2007; Fang dkk., 2008; Pegg, 2011]. Sebuah molekul AGT menghilangkan aduk
alkilasi dalam reaksi satu langkah dengan mentransfer gugus alkil dari oksigen
pada basa DNA ke residu sistein dalam kantong katalitiknya [Kaina et al., 2007].
AGT memiliki makna khusus dan kompleks dalam bidang kanker. Di satu sisi,
potensi AGT untuk menargetkan beragam substrat dieksploitasi untuk
mensintesis pseudosubstrates yang dapat digunakan dalam kombinasi dengan
agen alkylating terapeutik untuk menghindari resistensi terhadap kemoterapi
kanker [Tubbs et al., 2007]. Di sisi lain, kurangnya ekspresi AGT dikaitkan
dengan kelompok kanker tertentu [Lee et al., 2011; Mokarram dkk., 2013].
Selain itu, protein mirip alkiltransferase (ATL), suatu famili homolog AGT,
menghambat enzim AGT dengan mengarahkan perbaikan kerusakan alkil
besar pada jalur NER [Margison et al., 2007; Tubbs et al., 2009].
Kelas kedua enzim pembalikan langsung, terkait AlkB-

α -ketoglutarate tergantung oksigease (AlkB), reverse N-teralkilasi adduct dasar.
Ada 9 homolog manusia E. coli AlkB, yang ditunjuk sebagai ALKBH1-8 (

Alkylation Repair Homologs) dan FTO (Massa Lemak dan Obesitas terkait)
dalam sel manusia [Kurowski et al., 2003; Gerken dkk., 2007; Sanchez-Pulido
dan Andrade-Navarro, 2007; Yi dan He, 2013]. Untuk demetilasi, protein
keluarga AlkB menghidroksilasi gugus alkil dengan cara
bergantung α -ketoglutarat dan besi (II). Gugus alkil teroksidasi dilepaskan
sebagai formaldehida, meninggalkan basa aslinya [Drablos et al., 2004; Falnes
et al., 2007].
Perbaikan eksisi dasar (BER)

BER mengoreksi bentuk oksidatif, deaminasi, alkilasi dan kerusakan basa
tunggal abasic yang tidak dianggap sebagai distorsi signifikan pada heliks DNA.
Di dalam nukleus, proses perbaikan ini terutama aktif dalam fase G1 dari siklus
sel [Dianov dan Hubscher, 2013]. Untuk transaksi BER, pemodelan ulang
kromatin di lokasi kerusakan DNA diikuti dengan pengenalan lesi oleh DNA
glikosilase [Odell et al., 2013]. Setidaknya 11 glikosilase DNA yang berbeda
dapat mengenali dan mengeluarkan dasar yang rusak dari heliks yang tidak
terdistorsi, serta yang dibalik dari alur utama [Huffman et al., 2005; Krokan
Naskah Penulis
dan Bjoras, 2013]. Dari segi fungsi, DNA glikosilase bersifat monofungsional,
hanya dengan aktivitas glikosilase, seperti urasil glikosilase, N-metilpurin DNA
Glikosilase (MPG), dan MutY Homolog (MUTYH), atau berfungsi ganda dengan
glikosilase dan tambahan β - aktivitas lyase . Contoh yang terakhir termasuk
DNA glikosilase 1 mirip-N (NTHL1), DNA mirip-Nei glikosilase 1 (NEIL1) dan
DNA mirip-Nei glikosilase 2 (NEIL2) [Jacobs dan Schar, 2012]. Perlu dicatat
bahwa 8-oksoguanin DNA glikosilase (OGG1) dan NEIL3 berfungsi sebagai
glikosilase mono dan bifungsional [Svilar et al., 2011]. Sebuah situs abasic
dibuat dari glikosilase monofungsional berkomitmen untuk jalur
perbaikan patch pendek , sedangkan glikosilase bifungsional memulai jalur
perbaikan patch panjang BER [Dianov dan Hubscher, 2013].
Dalam perbaikan patch singkat, situs abasic adalah substrat untuk

endonuklease AP (APE1 dalam sel manusia), yang membelah fosfodiester
obligasi 5 ' ke situs abasic dan menghasilkan residu hidroksil pada 3 ' -end
sementara meninggalkan fosfat deoksiribosa ( dRP) di ujung 5 ' . Perbaikan gap
ini disesuaikan dengan aktivitas lyase 5 ′ -dRP dari POL β (gap tailoring), diikuti
dengan pengisian celah nukleotida tunggal oleh POL β dan ligasi oleh LIG1
(DNA ligase 1) atau kompleks LIG3 (DNA ligase 3). ) dan XRCC1 (X-ray
memperbaiki protein pelengkap silang 1) [Almeida dan Sobol, 2007]. Dalam
perbaikan tambalan yang lama, celah perbaikan yang tertinggal dari glikosilase
bifungsional disesuaikan dengan aktivitas 3 ' fosfodiesterase APE1. Setelah itu,
POL β (dalam sel non-proliferasi ) atau POL δ / ε (dalam sel yang berproliferasi)
mensintesis dengan cara perpindahan untai , yang kemudian diikuti dengan
pengangkatan flap oleh endonuklease flap dan ligasi bermediasi LIG1 [Akbari
et al ., 2009; Svilar et al., 2011].
Sementara BER dari lesi 8-oxo-G pada pengulangan CAG terlibat dalam
ketidakstabilan pengulangan triplet, downregulation OGG1 dikaitkan dengan
penuaan, gangguan neurodegeneratif dan kanker [Kovtun et al., 2007; Tian et
al., 2009; Curtin, 2012; Mollersen dkk., 2012; Chatterjee N., 2013; Krokan dan
Bjoras, 2013; Chatterjee et al., 2015]. Secara spesifik, mutasi pada POL β
ditemukan pada kanker padat dan varian POL β dapat berperan sebagai
dominan negatif dan berurutan.
mutator spesifik [Wang et al., 1992; Starcevic dkk., 2004; Lang et al., 2007;
Murphy et al., 2012]. Selain itu, PARP1 (Poly [ADP-ribose] polimerase 1) juga
telah terbukti diperlukan untuk perbaikan putus untai tunggal dan basa purin
yang rusak oleh sub-jalur BER [Krokan dan Bjoras, 2013; Reynolds et al., 2015].
Akhirnya, mitokondria juga diketahui melakukan patch BER pendek dan
panjang, dimana langkah sintesisnya dilakukan oleh POL γ ; semuanya
menambah signifikansi jalur perbaikan ini dalam pemeliharaan stabilitas
genom global [Akbari et al., 2008; Liu dan Demple, 2010]. Pembaca diarahkan
ke ulasan ini untuk gambaran umum BER mitokondria [Bauer et al., 2015;
Prakash dan Doublie, 2015].
Memperbaiki kerusakan dasar ganda dan besar

Perbaikan eksisi nukleotida (NER)
Perbaikan eksisi nukleotida adalah jalur pilihan untuk menghilangkan lesi

besar seperti CPD dan (6 - 4) PP dari radiasi UV, aduk benzo [ a ] pyrene, atau
kerusakan dari agen kemoterapi. Kekurangan NER menyebabkan sejumlah
sindrom manusia yang berbeda: Xeroderma Pigmentosum (XP), yang
berhubungan dengan kecenderungan untuk terkena kanker kulit; Sindrom
Cockayne (CS); Sindrom Sensitif UV langka (UV S S); dan sindrom
Cerebro-Oculo-Facio-Skeletal (COFS) [Errol C. Friedberg, 2005; Vermeulen dan
Naskah Penulis
Fousteri, 2013]. Namun, seperti jalur BER, NER berkontribusi pada mekanisme
ketidakstabilan pada gangguan pengulangan triplet [Lin et al., 2006; Hubert
dkk., 2011; Dion, 2014]. Untuk memulai NER, pemodelan ulang kromatin yang
dimediasi oleh komponen kromatin dan NER membuka jalan bagi mesin NER
pada lesi DNA yang ditentukan [Scharer, 2013]. Ada dua cabang utama NER:
genom global NER (GG − NER) dan transkripsi − coupled NER (TC −NER).
Dalam GG-NER, sensor kerusakan DNA utama adalah protein XPC (Xeroderma
Pigmentosum, grup komplementasi C), yang dikomplekskan dengan protein
RAD23B (UV excision repair protein Radiation sensitive 23B) dan CETN2
(Centrin 2). Pemindaian kompleks ini untuk mengetahui keberadaan DNA untai
tunggal sementara (ssDNA) yang disebabkan oleh pasangan basa yang
terganggu karena lesi [Masutani et al., 1994; Nishi dkk., 2005]. Untuk perbaikan
CPD yang diinduksi UV, kompleks DNA damage-binding protein
(UV-DDB) yang rusak ultraviolet , terdiri dari DDB1 (XPE − binding factor) dan
protein spesifik GG − NER DDB2, secara langsung berikatan dengan radiasi UV−
lesi yang diinduksi dan kemudian merangsang pengikatan XPC [Chu dan
Chang, 1988; Wakasugi et al., 2002; Scrima et al., 2008]. XPC yang terikat pada
lesi menjadi substrat untuk kompleks faktor inisiasi transkripsi II H (TFIIH),
faktor inisiasi dan perbaikan transkripsi yang terdiri dari sepuluh subunit
protein yang dapat beralih fungsi baik dalam inisiasi transkripsi maupun
dalam NER [Yokoi et al., 2000; Volker et al., 2001; Compe dan Egly, 2012].
Langkah terakhir dari eksisi ganda dan pengisian celah dikoordinasikan untuk
mencegah pembentukan celah ssDNA yang berpotensi memicu pensinyalan
DDR [Marini et al., 2006; Marti et al., 2006; Mocquet et al., 2008].
Langkah sayatan GG-NER mengikat semua protein menjadi NER. Ini melibatkan
penggunaan endonuklease spesifik struktur XPF-ERCC1 dan XPG (juga dikenal
sebagai ERCC5 ), yang memotong untai yang rusak pada jarak pendek dari
ujung lesi 5 ' dan 3 ' masing-masing [Fagbemi et al., 2011]. Replikasi protein
PCNA (sel berkembang biak
antigen nuklir), RFC (faktor replikasi C), POL δ , POL ε atau POL κ , dan LIG1
atau XRCC1-LIG3 melaksanakan langkah terakhir dari sintesis dan ligasi
pengisian celah. Status proliferatif sel menentukan pilihan polimerase yang

digunakan. Misalnya, perbaikan bergantung- POL ε mendominasi pada sel
yang tidak bereplikasi, sedangkan POL δ dan POL κ adalah polimerase NER
utama dalam sel yang bereplikasi. Ligasi yang bergantung pada LIG1 terjadi
pada sel replikasi. Namun, kompleks XRCC1-LIG3 menutup celah pada sel
non-proliferasi karena ekspresi dNTP dan LIG1 yang rendah dalam sel ini,
[Moser et al., 2007; Ogi et al., 2010].
Jalur NER kedua, TC-NER, dimulai oleh RNA polimerase II yang terhenti lesi ,
yang dimulai dengan perekrutan protein spesifik TC-NER CSA (sindrom
Cockayne WD repeat protein A; juga dikenal sebagai ERCC8) dan CSB (Cockayne
sindrom protein B, juga dikenal sebagai ERCC6), yang penting untuk perakitan
tambahan komponen TC-NER lainnya [Fousteri et al., 2006]. Ini termasuk faktor
inti NER (kecuali untuk kompleks UV-DDB dan XPC spesifik GG -NER ) dan
protein spesifik TC-NER, seperti UVSSA (protein perancah terstimulasi UV A),
USP7 (protease pemrosesan spesifik ubiquitin 7; juga dikenal sebagai ubiquitin
C − terminal hydrolase 7), XAB2 (XPA − binding protein 2; juga dikenal sebagai
pre − mRNA − splicing factor SYF1) dan HMGN1 (kelompok mobilitas tinggi
nukleosom −binding domain − yang mengandung protein 1; juga dikenal
sebagai protein kromosom non-histon HMG14) [Fousteri et al., 2006;
Schwertman et al., 2012]. Setelah terlokalisasi di lokasi lesi, kompleks CSA-CSB
backtracks (atau translokasi balik) RNA polimerase II, memperlihatkan lokasi
lesi. TFIIH direkrut untuk lesi. Urutan kejadian selanjutnya diperkirakan sama
seperti di GG-NER karena lesi dihilangkan dari untai yang ditranskripsi
[Marteijn et al., 2014].
Perbaikan ketidakcocokan (MMR)

MMR adalah jalur perbaikan pasca replikasi yang dikonservasi secara
evolusioner yang berkontribusi terhadap kesetiaan replikasi setidaknya
100 kali lipat [Kunkel, 2009; Arana dan Kunkel, 2010]. Substrat khas untuk jalur
MMR adalah ketidaksesuaian dasar yang muncul selama replikasi dan loop
penyisipan-penghapusan (IDL) dalam urutan DNA berulang yang dihasilkan
dari kejadian selip untai [Errol C. Friedberg, 2005; Jiricny, 2006]. MMR juga
terlibat dalam berbagai proses seluler termasuk stabilitas mikrosatelit,
rekombinasi meiosis dan mitosis, pensinyalan kerusakan DNA , apoptosis,
rekombinasi saklar kelas , hipermutasi somatik dan ekspansi
triplet-pengulangan [Jiricny, 2006; Jiricny, 2013; Chatterjee dkk., 2016a]. Mutasi
germline pada gen MMR mengakibatkan sindrom Lynch (juga dikenal sebagai
kanker kolorektal nonpolyposis herediter atau HNPCC), yang muncul sebagai
kerentanan keluarga terhadap kanker usus besar dan ovarium serta sejumlah
kanker lainnya [Peltomaki, 2001]. Modifikasi kromatin baru-baru ini telah
terbukti membuka jalan bagi protein MMR untuk mendapatkan akses ke lesi
DNA dan memulai perbaikan [Li et al., 2013; Li, 2014].
Dari delapan polipeptida MSH (MutS homolog) yang diketahui pada eukariota,
manusia menggunakan MutS α heterodimer (MSH2 / MSH6) untuk mengenali
ketidakcocokan basa dan IDL satu-ke-dua nukleotida, dan MutS β heterodimer
(MSH2 / MSH3) untuk mengenali IDLs [Kunkel dan Erie, 2005; Sachadyn, 2010].
Model yang diterima sebelumnya adalah bahwa setelah langkah pengenalan
lesi, kompleks MutS berpindah sepanjang DNA dengan cara yang bergantung
pada ATP untuk memberi jalan bagi komponen MMR hilir [Jiricny, 2013]. Baru-
baru ini,
Laboratorium Modrich telah menunjukkan bahwa MutL dapat menjebak MutS

pada ketidakcocokan sebelum membentuk penjepit geser [Qiu et al., 2015].
Selanjutnya, kompleks MutL direkrut ke DNA dan di antara 4 homolog MutL

manusia yang diketahui; heterodimer α MutL (heterodimer MLH1 / PMS2)
memainkan peran utama dalam MMR [Nicolaides et al., 1994; Papadopoulos
dkk., 1994; Li dan Modrich, 1995; Lipkin et al., 2000]. MutL α mengatur
penghentian eksisi yang dipicu ketidakcocokan , dan aktivitas endonuklease
yang berperan dalam pencernaan 3 ′ yang diarahkan oleh nick oleh EXO1
(Exonuclease 1) dengan cara yang bergantung pada PCNA / RFC [Zhang et al.,
2005; Kadyrov et al., 2006]. EXO1 juga melakukan eksisi mismatch 5 'yang
menciptakan celah yang distabilkan oleh RPA [Genschel dan Modrich, 2003;
Zhang et al., 2005]. POL δ , RFC, HMGB1 (protein kotak 1 kelompok mobilitas
tinggi) dan LIG1 mengatur langkah-langkah akhir sintesis dan ligasi DNA baru
[Genschel dan Modrich, 2003; Yuan dkk., 2004; Guo et al., 2006]. PCNA
memainkan peran penting baik dalam langkah inisiasi MMR dan sintesis DNA
selanjutnya dengan berinteraksi dan melokalisasi kompleks MutS α / β dan
MutL α di lokasi lesi [Umar et al., 1996; Lau dan Kolodner, 2003; Jiricny, 2006].
Selain perbaikan ketidakcocokan dan fungsi seluler lainnya, gen perbaikan

ketidakcocokan baru-baru ini telah terbukti ditekan sebagai respons terhadap
tekanan lingkungan, seperti hipoksia, benzo [ a ] pirena, peradangan dan
bahkan lingkungan mikro tumor [Mihaylova et al., 2003; Bindra dan Glazer,
2007; Nakamura dkk., 2008; Edwards et al., 2009; Chen et al., 2013]. Masih
harus dilihat apakah tekanan eksogen lain juga dapat menekan ekspresi gen
MMR.
Perbaikan interstrand cross-link (ICL)
Interstrand crosslinks adalah lesi di mana dua basa dari untai

komplementer terhubung secara kovalen karena kerusakan DNA dari agen
pengikat silang seperti senyawa platinum, mustard nitrogen, MMC,
psoralens dan agen alkilasi [Clauson et al.,
2013]. Modifikasi tambahan dari agen pengikat silang ini termasuk saluran
jalan basa, ikatan silang intrastrand, dan ikatan silang DNA-protein . Lesi ini
dikenali dan diperbaiki oleh protein Fanconi anemia (FA). Mutasi pada gen FA
adalah penyebab gangguan FA resesif autosom. Gangguan FA adalah kelainan
genetik heterogen dan langka yang ditandai dengan frekuensi tinggi dari
kelainan hematologi, kelainan bawaan dan kecenderungan umum untuk
kanker [Kee dan D'Andrea, 2012]. Secara klasik, FA didiagnosis dengan menilai
hipersensitivitas seluler — kerusakan kromosom dan formasi radial kromosom
— terhadap agen DNA ICL seperti diepoxybutane (DEB) dan MMC [D'Andrea,
2010]. Selain itu, uji kerusakan kromosom yang diinduksi DEB banyak
digunakan untuk diagnosis utama FA [Auerbach, 1993].
Perbaikan interstrand crosslink dimulai dengan pemuatan kromatin protein

FA dengan cara yang bergantung pada siklus sel [Mi dan Kupfer, 2005; Kim et
al., 2008]. Keluarga FA terdiri dari 21 grup komplementasi fungsional yang
berbeda (A, B, C, D1, D2, E, F, G, I, J, L, M, N, O, P, Q, R, S, T, U , V), yang diketahui
menekan sensitivitas ICL [Bluteau et al., 2016; Michl dkk., 2016]. Setelah
kerusakan ICL, FANCM direkrut ke situs yang rusak bersama dengan FAAP24
(Fanconi Anemia terkait protein 24 kDa) dan MFH (histone fold protein
complex) [Ciccia et al., 2007; Niedernhofer, 2007; Yan et al., 2010]. Pemodelan
ulang garpu replikasi dirangsang oleh MFH dan FANCM mempromosikan
migrasi persimpangan Holliday dan
penciptaan celah ssDNA [Gari et al., 2008a; Gari et al., 2008b; Huang et al.,
2010]. RPA terikat sinyal ssDNA aktivasi ATR [Zou dan Elledge, 2003;
Ben-Yehoyada dkk., 2009]. ATR memfosforilasi target hilir CHK1, yang pada
gilirannya memfosforilasi FANCE, FANCD2, FANCI dan MRN [Andreassen et al.,
2004; Smogorzewska dkk., 2007; Wang et al., 2007a; Cui et al., 2009; Duquette et
al., 2012]. Dalam cara yang belum diketahui, inti FA komponen lain yang
kompleks (FANCA / B / C / E / F / G / L / T) merakit di lokasi yang rusak dan
mengaktifkan terfosforilasi Fanci-FANCD2 heterodimer melalui
FANCL-dimediasi monoubiquitination [Smogorzewska et al ., 2007]. Aktivasi
tanda FANCI-D2 ini sebagai saklar aktivasi utama untuk jalur FA [Wang, 2008;
Tomida et al., 2013]. Selanjutnya, eksisi untai DNA (5 ' dan 3 ' ) lesi
dikoordinasikan oleh endonuklease spesifik struktur
— XPF-ERCC1, MUS8-EME1, SLX4-SLX1, FAN1, SNM1A / SNM1B — dengan cara
yang masih belum jelas [ Clauson et al., 2013]. Selanjutnya, tergantung pada
keadaan proliferasi sel, perbaikan ICL bercabang menjadi salah satu dari dua
jalur di bawah ini.
Pada sel replikasi, kehadiran ICL warung replikasi berlangsung pada

terkemuka untai, serta pada 5 ' akhir untai tertinggal agak jauh dari lesi
[Raschle dkk., 2008; Knipscheer et al., 2009]. Selanjutnya, XPF-ERCC1 dan
SNM1A menginduksi sayatan di kedua sisi lesi yang melepaskan ikatan ICL dari
untai yang tertinggal, sehingga menghasilkan celah [Wang et al., 2011]. Untai
utama dengan ICL menjadi templat untuk sintesis DNA baru — oleh TLS
polimerase POL ι , POL κ , POL ν dan REV1 — yang berlanjut hingga lesi,
melewati itu, dan melampaui lesi sampai mencapai hilir pertama Okazaki
fragmen [Minko et al., 2008; Raschle dkk., 2008; Yamanaka dkk., 2010; Ho et al.,
2011; Klug et al., 2012]. Setelah langkah ini, 3 ' overhang dari sisa untai
tertinggal menyerang untai yang baru disintesis dengan cara yang bergantung
pada RAD51 dengan cara yang terkoordinasi secara ketat [Long et al., 2011].
Menariknya, resolusi antara HR ini bergantung pada kompleks FANCD2-FANCI .
Jalur NER akhirnya menghilangkan pengait ICL yang masih menggantung di
untai terdepan.
Dalam sel non-replikasi , perbaikan ICL psoralen, MMC, cisplatin, dan alkil ICL
bergantung pada polimerase NER dan TLS seperti REV1 dan POL ζ [Clauson et
al., 2013]. Lesi distorsi heliks dikenali oleh jalur GG-NER dan TC-NER untuk
memulai perbaikan, meskipun beberapa lesi seperti cisplatin mungkin luput
dari pengenalan [Enoiu et al., 2012]. Setelah pengenalan lesi, komponen jalur
NER diketahui hanya memotong sisi 5 ' lesi, dengan sayatan lebih lanjut
mungkin dibantu oleh kompleks MutS β membuat celah ssDNA [Bessho et al.,
1997; Mu et al., 2000; Smeaton dkk., 2008; Zhao et al., 2009]. Selanjutnya, TLS
polimerase rawan kesalahan mensintesis melintasi celah dan akhirnya
putaran kedua NER menghilangkan pengait ICL pada untai lainnya [Clauson et
al., 2013].
Studi terbaru memberikan bukti yang mencolok dari crosstalk antara FA dan
jalur perbaikan lainnya. Misalnya, jalur FA menekan penggabungan akhir
non-homolog (NHEJ) dengan berinteraksi dengan CtIP, dan merekrut
molekul penghambat NHEJ — PARP1 dan RAD18 ke DNA [Saberi et al., 2007;
Ceccaldi et al., 2016a]. Demikian pula, penghambatan komponen NHEJ
mengurangi sensitivitas sel defisiensi FA terhadap agen pengikat silang,
sementara sel defisiensi FA yang sama menunjukkan pengayaan komponen
53BP1, RIF1 dan RAP80 pada kromatin yang rusak [Adamo et al., 2010; Pace et
al., 2010; Ceccaldi et al., 2016b; Renaud et
al., 2016]. Contoh menarik kedua dari crosstalk jalur FA adalah perannya
yang tidak ditentukan dalam mempromosikan peristiwa penggabungan
akhir alternatif, seperti yang terlihat pada pasien dengan mutasi FANCA yang
kekurangan rekombinasi saklar kelas imunoglobulin. Selain itu, hilangnya
FANCD2 menganugerahkan fenotipe mematikan sintetis di POL θ nol tikus
[Nguyen et al, 2014.; Ceccaldi dkk., 2015; Howard dkk., 2015]. Akhirnya, jalur
FA sekarang telah terlibat dalam ketidakstabilan berulang trinukleotida
[Chatterjee N., 2016].
Translesion Synthesis (TLS)
Sintesis translesion dilakukan oleh polimerase TLS yang sangat terkonservasi.

TLS polimerase adalah polimerase DNA khusus yang dapat mereplikasi lesi
DNA menyimpang berlawanan dan masa lalu dengan cara yang relatif lebih
rendah dari DNA polimerase replikatif [Sale, 2013]. Jika nukleotida yang salah
dimasukkan oleh TLS polimerase, mereka akan menjadi mutasi pada putaran
replikasi berikutnya, yang mendorong tumorigenesis dan penyakit, tetapi juga
dapat berkontribusi pada kebugaran dan evolusi organisme secara
keseluruhan. Sebanyak sebelas polimerase TLS diketahui (REV1, POL η , POL ι ,
POL κ , POL ζ , POL μ, POL λ , POL β , POL ν , POL θ ), yang didistribusikan dalam
empat famili (Y, B, X dan A) dan PrimPol (Tabel 1). Meskipun semua TLS
polimerase kurang akurat dibandingkan polimerase replikatif, polimerase TLS
tertentu dapat menyalin relatif akurat pada lesi serumpun tertentu. Misalnya,
CPD timin-timin cyclobutane adalah lesi serumpun untuk POL η (Tabel 1).
Frekuensi kesalahan sintesis DNA selama sintesis translesion bergantung pada
beberapa faktor, seperti apakah lesi tersebut serumpun untuk TLS DNA
polimerase tertentu, karakteristik biokimia dari polimerase TLS tertentu dan
konteks urutan DNA [Halaman dan Fuchs, 2002; McCulloch dkk., 2004; Waters
dan Walker, 2006]. Pasien XPV, yang menunjukkan fenotipe fotosensitif dengan
insiden kanker kulit yang tinggi, menyoroti signifikansi fisiologis dari
polimerase DNA TLS tertentu yang melewati lesi tertentu. Pasien-pasien ini
kekurangan enzim POL η dan sangat rentan terhadap radiasi UV karena
polimerase TLS alternatif (POL ι dan POL κ ) sebagai gantinya melewati dimer
cyclobutane yang diinduksi UV (CPD) dalam mode rawan kesalahan [Yamada et
al., 2000; Sweasy dkk., 2006; Wang dkk., 2007b; Ziv et al., 2009].
Kemampuan menarik polimerase TLS untuk membantu sel mentolerir
kerusakan DNA muncul dari fitur struktural dan biokimia mereka [Rothwell
dan Waksman, 2005; Pavlov dkk., 2006; Waters dan Walker, 2006]. Atribut
fungsional unik polimerase TLS yang membedakannya dari polimerase
replikatif klasik, berasal dari fitur fisik diskritnya. Fitur penting termasuk
homologi urutan yang sangat terbatas untuk polimerase DNA replikatif, tidak
adanya domain eksonuklease 3 ′ -5 ′ untuk mengoreksi nukleotida yang masuk,
dan domain ibu jari dan jari yang lebih kecil, yang membuat lebih sedikit
kontak dengan DNA daripada yang ditemukan dalam DNA replikatif.
polimerase [Rothwell dan Waksman, 2005; Waters dan Walker, 2006; Dijual,
2013]. Perbedaan struktural ini mengarahkan domain katalitik ibu jari, jari,
telapak tangan, dan jari kelingking ke dalam situs aktif terbuka yang relatif
lebih besar, sementara dibantu oleh fitur fisik lainnya seperti domain
terkait polimerase (PAD), pergelangan tangan, dan wilayah N-gesper ditemukan
dalam polimerase DNA Keluarga Y yang memfasilitasi ikatan DNA tambahan.
Bersama-sama, fitur struktural ini memberikan polimerase TLS dengan
arsitektur unik yang memungkinkan mereka untuk melewati kerusakan DNA
atau mengisi celah ssDNA
[Trincao et al., 2001; Ling et al., 2003; Lone et al., 2007; Jansen et al., 2009a;
Jansen et al., 2009b].
Dua model telah diusulkan untuk menjelaskan proses bypass lesi DNA melalui
sintesis translesion. Dalam model sakelar polimerase, polimerase TLS
bergabung secara berurutan dalam proses dua langkah untuk mereplikasi
melewati lesi DNA pada garpu replikasi yang terhenti. Pertama, enzim TLS
'penyisip', biasanya POL η , POL ι , atau POL κ , dan lebih jarang REV1 atau POL
ζ , menggabungkan nukleotida yang berlawanan dengan lesi DNA [Korzhnev
dan Hadden, 2016]. Pada langkah kedua, enzim TLS extender, peran yang
biasanya dipenuhi oleh POL ζ secara eksklusif tetapi dalam beberapa kasus
oleh POL κ , menggantikan inserter polymerase dan memperluas termini
template primer [Washington et al., 2002; Yuji Masuda, 2016]. Ini dua-langkah
model yang diusulkan untuk mengarahkan kedua bebas dari kesalahan dan
rawan kesalahan sintesis DNA translesion seluruh kerusakan [Shachar et al.,
2009]. Molekul pusat yang mengatur baik langkah penyisipan maupun
ekstensi adalah REV1, dan melalui fungsi perancah uniknya memfasilitasi
kumpulan polimerase TLS dengan mengikat ke
polimerase yang mengandung RIR — POL η , POL ι , atau POL κ —melalui satu
antarmuka, dan juga ke POL ζ 4 (REV3-REV7-POLD2-POLD3), melalui
antarmuka kedua, langkah sentral dalam eksekusi model ini [Wojtaszek et al.,
2012a; Wojtaszek dkk., 2012b]. Selain itu, POLD3, yang merupakan bagian dari
kompleks POL ζ 4 , berinteraksi dengan REV1 melalui RIR-nya, sehingga
membantu peralihan dari penyisipan yang diarahkan RIR ke POL medi 4 -
ekstensi yang dimediasi selama bypass kerusakan [Pustovalova et al., 2016].
Dalam model pengisian celah , celah untai tunggal ditinggalkan oleh

polimerase replikatif selama replikasi atau melalui proses perbaikan DNA
yang tidak lengkap, seperti selama hipermutasi gen imunoglobulin,
merupakan target sintesis TLS [Sale et al., 2009]. Biasanya, jenis peristiwa TLS
ini diharapkan berada di luar fase S, tetapi berdasarkan jenis lesi DNA,
terkadang independensi siklus sel diberikan [Quinet et al., 2016].
Menggunakan uji gapped plasmid, telah ditunjukkan bahwa TLS sama tinggi
atau lebih tinggi dalam G2 dibandingkan dengan fase S dalam sel manusia,
dengan jumlah POL η yang sedikit lebih tinggi di G2 dibandingkan dengan fase
S dari siklus sel [Diamant et al., 2012]. Urutan kejadian yang tepat untuk
celah-TLS masih belum diketahui, dengan hanya beberapa studi terisolasi yang
menyiratkan peran polimerase TLS dalam pengisian celah. Misalnya, REV1
sangat penting dalam sel tikus untuk sintesis melintasi celah pasca-replikatif di
mana REV1 direkrut ke celah oleh ujung 5 ' , tidak seperti langkah
pengisian celah NER, di mana POL κ adalah polimerase pilihan [Ogi dan
Lehmann, 2006; de Groote dkk., 2011; Dijual, 2013]. Demikian juga, REV3
terlibat dalam TLS melintasi celah berlawanan 6-4 fotoproduk [Quinet et al.,
2016], semua sugestif peran TLS dalam mereplikasi di seluruh celah ssDNA.
Selain fungsi pintas kerusakan DNA tradisional mereka, polimerase TLS

sekarang diketahui berperan dalam jalur seluler lainnya. Misalnya, seperti
yang dibahas sebelumnya, polimerase TLS diperlukan untuk perbaikan ICL
dan juga dapat berperan dalam jalur BER dan NER untuk mensintesis DNA
baru setelah langkah eksisi. Stresor eksogen — misalnya UV-C, MNNG, dan
BPDE — mengatur ekspresi transkripsi POL η , POL ι , POL
κ dan POL ζ [Zhu et al., 2003; Yu et al., 2004; Liu dan Chen, 2006; Zhu et al.,
2010; Zhu et al., 2012]. Demikian juga, inhibitor HSP90 mengurangi ekspresi
REV1 dan POL η dalam sel manusia, menunjukkan regulasi evolusioner dari
polimerase ini [Sekimoto et al., 2010; Pozo et al., 2011]. Menariknya, polimerase
TLS, REV1 dan REV3, juga terlibat dalam pengembangan kemoresistensi dalam
sel manusia dan model tikus, membuka
kemungkinan untuk kelas baru obat kemoterapi yang menjanjikan [Doles

et al., 2010; Xie dkk., 2010; Xu et al., 2013].
Perbaikan kerusakan DNA

Perbaikan istirahat terdampar tunggal (SSBR)
Single strand break (SSBs) sering dihasilkan dari kerusakan oksidatif pada
DNA, dari situs abasic, atau dari aktivitas yang salah dari enzim DNA
topoisomerase 1 (TOP1) [Wang, 2002; Hegde dkk., 2008]. SSB yang tidak
terselesaikan sering merusak replikasi DNA, menghentikan transkripsi yang
sedang berlangsung, dan mempengaruhi aktivasi PARP1, yang melepaskan
NAD + seluler , ATP dan faktor penginduksi apoptosis (AIF) dalam sel [Zhou dan
Doetsch, 1993; Heeres dan Hergenrother, 2007] Setidaknya dua kelainan
genetik manusia, ataksia spinocerebellar dengan neuropati aksonal 1 (SCAN1)
dan ataksia-okulomotor apraxia 1 (AOA1), berhubungan dengan SSBR yang
gagal. Pasien-pasien ini sering menunjukkan ketidakstabilan genetik dan
tingginya insiden kanker [El-Khamisy et al., 2005; Reynolds et al., 2009]. SSBR
diperkirakan terjadi melalui tiga jalur berbeda tergantung pada sumber SSB.
Dalam jalur SSBR patch panjang, SSB dideteksi sementara oleh PARP1, yang
mengalami siklus ribosilasi poli (ADP) yang cepat dan berdisosiasi untuk
mendeteksi SSB berikutnya [D'Amours et al., 1999; Davidovic et al., 2001].
Setelah ini, ujungnya menjalani pemrosesan akhir oleh apurinic-apyrimidic
endonuclease 1 APE1, PNKP (polynuceotide kinase 3 ′ -phosphate) dan
aprataxin (APTX) [McKinnon and Caldecott, 2007]. Selanjutnya, FEN1
menghilangkan 5 ' termini yang rusak dibantu oleh PARP1 dan PCNA,
meninggalkan celah ssDNA, yang diisi oleh POL β , dalam kombinasi dengan
POL δ / ε . Langkah terakhir ligasi dilakukan oleh LIG1, yang bergantung pada
keberadaan PCNA dan XRCC1 [Lan et al., 2004; Mortusewicz et al., 2006;
McKinnon dan Caldecott, 2007]. Dalam jalur SSBR patch pendek, SSB yang
dihasilkan selama BER dikenali oleh APE1 diikuti oleh jalur
pemrosesan akhir yang serupa dengan perbaikan patch panjang. Tahap
pengisian celah , bagaimanapun, hanya dilakukan oleh enzim POL β , diikuti
oleh ligasi katalis LIG3 [McKinnon dan Caldecott, 2007]. Akhirnya, jalur TOP1-
SSB adalah varian dari PARP1 tergantung perbaikan patch yang panjang di
mana pengolahan end dilakukan oleh TDP1 yang (tyrosyl-DNA
phosphodiesterase 1) enzim yang menghilangkan TOP1 yang dari 3 ' -end
[Caldecott , 2008].
Perbaikan istirahat untai ganda (DSBR)
DSB yang sangat beracun diinduksi oleh berbagai agen perusak DNA kimia dan
fisik [Pfeiffer et al., 2000]. DSB yang tidak terselesaikan terlibat dalam berbagai
gangguan manusia dan kanker [Jackson dan Bartek, 2009]. Kami akan
membahas secara singkat dua jalur utama — rekombinasi homolog (HR) dan
penggabungan akhir non-homolog (NHEJ) —bahwa organisme telah berevolusi
untuk menyelesaikan DSB. Modifikasi kromatin adalah peristiwa pertama yang
mencatat keberadaan DSB dan memicu serangkaian peristiwa termasuk
aktivasi ATM, fosforilasi H2AX yang ditargetkan, PARilasi kromatin, perekrutan
MDC1 dan akhirnya perekrutan 53BP1 dan BRCA1 [Rogakou et al., 1998;
Rothkamm et al., 2003; Gottschalk dkk., 2009; Chou dkk., 2010; Lukas dkk., 2011;
Price dan D'Andrea, 2013; Liu et al., 2014]. Menariknya, baik 53BP1 dan BRCA1
menunjukkan pengaruh antagonis
satu sama lain dan penipisan 53BP1 menyelamatkan kematian embrio dari
tikus nol BRCA1 [Xie et al., 2007; Cao et al., 2009; Bunting dkk., 2010].
Dalam jalur NHEJ DSBR, 53BP1 memainkan peran regulasi penting dengan
merekrut komponen NHEJ ke lokasi istirahat, mengaktifkan pensinyalan pos
pemeriksaan dan memfasilitasi sinapsis dari dua ujung [Panier dan Boulton,
2014]. Heterodimer Ku (Ku70 dan Ku80) adalah yang pertama mengenali dan
mengikat DSB dalam hitungan detik untuk mencegah reseksi akhir dan
berfungsi sebagai perancah untuk merekrut komponen NHEJ lainnya [Pang et
al., 1997; Mari dkk., 2006; Soutoglou et al., 2007; Mimitou dan Symington, 2010].
Komponen lain yang direkrut termasuk DNA-PKcs, XRCC4, LIG4 dan XLF (
faktor mirip XRCC4 ), APLF ( faktor mirip Aprataxin-dan-PNK ) [dan juga TdT
(terminal deoxynucleotidyl transferase) dalam limfosit] [Gottlieb dan Jackson,
1993; Nick McElhinny dkk., 2000; Costantini et al., 2007; Yano dkk., 2008;
Grundy dkk., 2013]. Studi terbaru menunjukkan bahwa urutan perekrutan
komponen ini mungkin tergantung pada kompleksitas kerusakan DNA;
misalnya, perekrutan DNA-PKcs tergantung pada sifat kerusakan [Mari et al.,
2006; Yano dan Chen, 2008]. Namun, setelah DNA-PKcs direkrut, itu diaktifkan
dengan cara yang bergantung pada DNA; itu mendorong Ku ke dalam pada
DNA dan kemudian memfosforilasi komponen lain di dekatnya, termasuk
autoautofosforilasi itu sendiri [Gottlieb dan Jackson, 1993; Yoo dan Dynan,
1999; Weterings dan Chen, 2008]. Pada saat yang sama, XRCC4 dipercaya
membantu menstabilkan kompleks NHEJ dengan mengikat ujungnya dan
bertindak sebagai perancah tambahan dengan Ku untuk merekrut komponen
lain [Malivert et al., 2010; Hammel dkk., 2011; Andres et al., 2012]. Setelah
ujungnya dijembatani dan distabilkan, Artemis, PNKP, APLF, WRN, Aprataxin
dan Ku memulai pemrosesan akhir DNA, yang melibatkan pemindahan
kelompok yang menghalangi ujung dan reseksi untaian telanjang yang
dihasilkan [Ma et al., 2002; Bernstein dkk., 2005; Ahel dkk., 2006; Perry et al.,
2006; Roberts et al., 2010; Li et al., 2011]. Celah yang tertinggal setelah reseksi
diisi oleh keluarga X polimerase dengan cara yang bergantung pada cetakan
(POL μ) atau tidak tergantung pada cetakan (POL λ ) [Ramadan et al., 2004;
Roberts et al., 2010]. LIG4 bergabung dengan ujung dan menyelesaikan proses
NHEJ [Grawunder et al., 1997].
Jalur HR terdiri dari satu set sub-jalur terkait yang memanfaatkan invasi untai
DNA dan sintesis perbaikan DNA yang diarahkan template untuk
mempengaruhi perbaikan kesetiaan tinggi [Li dan Heyer, 2008]. Selain jalur HR
yang diinduksi DSBR tradisional , synthesis-dependent strand annealing (SDSA)
dan break-induced repair (BIR) adalah dua variasi lain yang mengikuti premis
HR [Li dan Heyer, 2008]. Di sini, kami akan secara singkat merangkum jalur
SDM DSBR.
MRN (MRE11-RAD50-NBS1) kompleks memulai HR di DSB, di mana ia
mengenali dan mengikat DSB dan kemudian merekrut ATM dan TIP60 ke DNA
[Sun et al., 2005; Stracker dan Petrini, 2011]. ATM yang diaktifkan (dari TIP60)
memfosforilasi H2AX, yang kemudian berfungsi sebagai jangkar untuk MDC1
[Bhatti et al., 2011]. Selanjutnya, MDC1 difosforilasi oleh ATM, dan fungsi MDC1
terfosforilasi sebagai perancah untuk membawa ligase E3 ubiquitin RNF8 dan
RNF168 [Altmeyer dan Lukas, 2013b]. Kedua ligase E3 ini ada di mana-mana
H2AX, yang kemudian berfungsi sebagai situs dok untuk 53BP1 dan BRCA1.
Dalam fase S / G2 di mana HR dominan, BRCA1 (direkrut oleh kromatin di
mana-mana) berhasil melawan 53BP1 dan memulai komponen hilir di mana-
mana, CtIP [Yu et al., 2006;
Chapman dkk., 2012]. Pada saat ini, komponen HR lainnya, RPA, dan protein
RAD51 menuju ke DNA.
Langkah selanjutnya dari reseksi akhir melibatkan degradasi nukleolitik

5 ' -ke-3 ' untuk menghasilkan 3 ' overhang, memasukkan sel ke jalur HR.
Reseksi awal terjadi oleh aktivitas endonuklease MRN, dengan bantuan CtIP,
diikuti oleh reseksi jarak jauh oleh EXO1 atau BLM bersama dengan DNA2
[Chen et al., 2008; Nimonkar et al., 2011]. Selanjutnya, RPA melapisi overhang 3
' , yang kemudian digantikan oleh RAD51, menghasilkan filamen
nukleoprotein. BRCA2 dan PALB2 membantu dalam pembentukan formasi
filamen nukleoprotein yang menyerang DNA dupleks terdekat membentuk
D-loop [Zhang et al., 2009; Holloman, 2011]. Beberapa protein lain berfungsi
bersama pada langkah ini. Agar untai menyerang DNA cetakan, RAD54 dan
RAD54B menghapus RAD51 dan memungkinkan gugus 3 ′ -OH untuk sintesis
prima oleh Polymerases δ , κ dan ν [Mazin et al., 2010; Sebesta et al., 2013]. Jika
sintesis DNA baru berhenti setelah jarak terbatas, seperti yang terjadi di SDSA,
enzim RTEL1 melarutkan D-loop [Barber et al., 2008]. Jika tidak, persimpangan
Holliday secara kolektif diproses oleh kompleks BLM-TOPOIII-RMI1-RMI2 ,
endonuklease GEN1, kompleks MUS81-EME1 dan kompleks SLX1-SLX4 [Chang
et al., 2008; Ciccia et al., 2008; Xu dkk., 2008; Fekairi dkk., 2009; Rass et al.,
2010].
Kerusakan DNA dan telomer

Telomer adalah struktur nukleoprotein yang terkonservasi dengan baik yang
ditemukan di ujung kromosom linier yang membantu membedakan ujung
kromosom normal dari DSB [Longhese, 2008; Shammas, 2011]. DNA telomeric
terdiri dari tandem repetitive DNA (TTAGGG pada manusia), dimana untai
kaya G (juga disebut G-tail), terikat oleh protein sheltrin POT1 (proteksi telomer
1), melampaui untai kaya C komplementer dan menyerang menjadi DNA
telomer beruntai ganda. The t loop sehingga dihasilkan kompleks dengan
protein sheltrin lain seperti TRF1 (telomeric-repeat mengikat faktor 1), TRF2,
TIN2 (TRF- berinteraksi protein 2), yang RAP1 transkripsi represor / aktivator
protein, dan TPP1 yang (POT1- dan TIN2 - mengatur protein), yang bersama-
sama mencegah ujung kromosom dikenali sebagai kerusakan DNA [Takai et al.,
2003; d'Adda di Fagagna dkk., 2004; Liu et al., 2004; de Lange, 2005]. Selain itu,
DNA telomerik direplikasi dan dipertahankan oleh kompleks
ribonukleoprotein khusus yang disebut telomerase [terdiri dari komponen
RNA telomer (TERC) dan transkriptase terbalik telomer (TERT)], yang
merupakan satu-satunya pengatur positif panjang telomer [Bachand et al. ,
2001; Blasco, 2003]. Penurunan aktivitas telomerase berkontribusi pada atrisi
telomer, yang berhubungan dengan penuaan, kanker dan beberapa gangguan
gagal sumsum tulang (IBMF) yang diturunkan [Chang dan Harley, 1995; Shay
dkk., 2001; Alter et al., 2015].
Telomere yang terdeproteksi menimbulkan respons kerusakan DNA, merekrut
komponen DSBR yang berusaha untuk memperbaiki ujung yang terbuka,
menyebabkan degradasi nukleolitik yang merusak, rekombinasi, dan fusi
kromosom [Longhese, 2008]. Misalnya, telomere pendek sering merakit DDR
faktor seperti 53BP1, ATM, γ H2AX, dan MRE11 sebagai fokus, yang disebut
telomere Disfungsi-Induced Foci (TIF), yang sangat rentan terhadap
NHEJ-dimediasi end to-end fusion [Takai et al., 2003; Hewitt et al., 2012;
Marcand, 2014]. Anehnya, pemeliharaan telomer membutuhkan kehadiran
beberapa komponen DSBR / NHEJ yang sama
komponen — misalnya, Ku dan kompleks MRN — mempersulit pemahaman

kita tentang mekanisme pasti stabilitas telomer [Maser dan DePinho, 2004;
Marcand, 2014]. Membangun dinamika biologi telomer ini merupakan bidang

penelitian yang aktif.
Baru-baru ini, beberapa racun lingkungan telah terlibat dalam pemendekan

telomer. Misalnya, asap tembakau menyebabkan pemendekan telomer melalui
stres oksidatif [Valdes et al., 2005; McGrath dkk., 2007; Song et al., 2010;
Babizhayev dan Yegorov, 2011]. Obesitas juga telah dikaitkan dengan
percepatan pemendekan telomere pada jaringan adiposa tikus, dimana tingkat
ROS tinggi [Song et al., 2010]. Demikian juga, sel darah putih wanita gemuk
memiliki telomere yang lebih pendek daripada wanita kurus [Valdes et al.,
2005]. Stresor genotoksik seperti polutan tertentu (misalnya toluena dan
benzena, dan PAH) juga terkait dengan pemendekan telomer [Hoxha et al.,
2009; Pavanello dkk., 2010; Trusina, 2014]. Akhirnya, stres sehari-hari,
termasuk stres psikologis, diketahui memperpendek telomere, sedangkan
meditasi dan kesadaran dapat membawa efek sebaliknya [Epel et al., 2004;
Cherkas dkk., 2006; Simon et al., 2006; Epel dkk., 2009; Mathur et al., 2016].
Telomer yang sangat pendek dikaitkan dengan penuaan dan kanker
[Shammas, 2011].
Kesimpulan
Kesimpulannya, DNA terus-menerus terpapar pada agen perusak DNA
endogen dan eksogen yang secara kimiawi memodifikasi konstituen DNA.
Kerusakan DNA yang tidak terselesaikan dapat menyebabkan penyakit dan
kanker pada manusia. Namun, perbaikan DNA yang kuat dan jalur toleransi
kerusakan membantu menghilangkan atau mentolerir lesi untuk
memungkinkan kelangsungan hidup (Gambar 4). Pemahaman tentang jalur
ini membantu mengevaluasi kemungkinan paparan racun dan strategi desain
untuk mengontrol konsekuensi yang merugikan pada kesehatan manusia.
Ucapan Terima Kasih

Penulisan tinjauan ini didukung oleh National Institute of Environmental Health Sciences
memberikan ES-015818 kepada GCW dan P30 ES-002109 kepada Pusat MIT untuk Ilmu
Kesehatan Lingkungan. GCW adalah Profesor American Cancer Society. Nimrat Chatterjee
dan Graham Walker menulis naskah itu.
Referensi
Adamo A, Collis SJ, Adelman CA, Silva N, Horejsi Z, Ward JD, Martinez-Perez E,
Boulton SJ, La Volpe A. Mencegah penggabungan akhir nonhomolog menekan
kerusakan perbaikan DNA pada anemia Fanconi. Mol Cell. 2010;
39 (1): 25–35. [PubMed: 20598602]
AEP. Perbaikan DNA dan karsinogenesis oleh agen alkilasi. CCaG, PL., Editor. Berlin:
Springer; 1990. hal. 103-131.
Ahel I, Rass U, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements PM, McKinnon PJ, Caldecott KW,
West SC. Aprataxin protein penyakit neurodegeneratif mengatasi zat antara ligasi
DNA yang gagal. Alam. 2006; 443 (7112): 713–716. [PubMed: 16964241]
Akbari M, Pena-Diaz J, Andersen S, Liabakk NB, Otterlei M, Krokan HE. Ekstrak sel
manusia yang berproliferasi dan non-proliferasi menampilkan jalur eksisi dasar
yang berbeda dan memperbaiki kesetiaan. Perbaikan DNA (Amst). 2009;
8 (7): 834–843. [PubMed: 19442590]
Akbari M, Visnes T, Krokan HE, Perbaikan eksisi basa Otterlei M. Mitokondria dari
situs urasil dan AP dilakukan dengan penyisipan nukleotida tunggal dan sintesis
DNA patch panjang . Perbaikan DNA (Amst). 2008; 7 (4): 605–616. [PubMed:
18295553]
Almeida KH, Sobol RW. Gambaran terpadu perbaikan eksisi basa: kompleks protein
yang bergantung pada lesi diatur oleh modifikasi pasca-translasi . Perbaikan DNA
(Amst). 2007; 6 (6): 695–711. [PubMed: 17337257]

Altaf M, Saksouk N, modifikasi Cote J. Histone sebagai respons terhadap
kerusakan DNA. Mutat Res. 2007; 618 (1–2): 81–90. [PubMed: 17306843]
Ubah BP, Giri N, Savage SA, Rosenberg PS. Panjang telomer pada sindrom
kegagalan sumsum tulang yang diturunkan. Haematologica. 2015;
100 (1): 49–54. [PubMed: 25304614]
Altmeyer M, Lukas J. Menjaga kerusakan jaminan selama transaksi chromatin. Sel.
2013a; 153 (7): 1431–1434. [PubMed: 23791174]
Altmeyer M, Lukas J. Untuk menyebarkan atau tidak menyebarkan - modifikasi
kromatin sebagai respons terhadap kerusakan DNA. Curr Opin Genet Dev.
2013b; 23 (2): 156–165. [PubMed: 23312207]
Ames BN, Profet M, Gold LS. Pestisida makanan (99,99% semuanya alami). Proc
Natl Acad Sci AS A. 1990; 87 (19): 7777–7781. [PubMed: 2217210]
Andersen S, Heine T, Sneve R, Konig I, Krokan HE, Epe B, Nilsen H.Masukkan dUMP
ke dalam DNA adalah sumber utama kerusakan DNA spontan, sedangkan eksisi
urasil tidak diperlukan untuk sitotoksisitas fluoropirimidin pada fibroblas
embrionik tikus . Karsinogenesis. 2005; 26 (3): 547–555. [PubMed: 15564287]
Andreassen PR, D'Andrea AD, Taniguchi T. ATR memasangkan monoubiquitination
FANCD2 dengan respon kerusakan DNA. Genes Dev. 2004;
18 (16): 1958–1963. [PubMed: 15314022]
Andres SN, Vergnes A, Ristic D, Wyman C, Modesti M, Junop M.
Kompleks XRCC4-XLF manusia menjembatani DNA. Res asam nukleat. 2012;
40 (4): 1868–1878. [PubMed: 22287571]
Arana ME, Kunkel TA. Fenotipe mutator karena ketidaksetiaan replikasi DNA. Biol
Kanker Semin. 2010; 20 (5): 304–311. [PubMed: 20934516]
Auerbach AD. Diagnosis anemia Fanconi dan tes diepoxybutane (DEB). Exp
Hematol. 1993; 21 (6): 731–733. [PubMed: 8500573]
Babizhayev MA, Yegorov YE. Merokok dan kesehatan: hubungan antara panjang
telomer dan faktor-faktor yang berdampak pada penyakit manusia, kualitas
hidup dan masa hidup dalam kohort berbasis populasi yang besar di bawah
pengaruh durasi merokok. Fundam Clin Pharmacol. 2011;
25 (4): 425–442. [PubMed: 20698892]
Bachand F, Triki I, Autexier C. Interaksi protein RNA telomerase manusia . Res asam
nukleat. 2001; 29 (16): 3385–3393. [PubMed: 11504876]
Bailly V, Verly WG. Kemungkinan peran reaksi beta-eliminasi dan delta-eliminasi
dalam perbaikan situs DNA yang mengandung AP (apurinic / apyrimidinic)
dalam sel mamalia. Biochem J. 1988; 253 (2): 553–559. [PubMed: 2460081]
Barber LJ, Youds JL, Ward JD, McIlwraith MJ, O'Neil NJ, Petalcorin MI, Martin JS, Collis
SJ, Cantor SB, Auclair M, Tissenbaum H, West SC, Rose AM, Boulton SJ. RTEL1
mempertahankan stabilitas genom dengan menekan rekombinasi homolog. Sel.
2008; 135 (2): 261–271. [PubMed: 18957201]
Bartsch H, Montesano R. Relevansi nitrosamin dengan kanker manusia.
Karsinogenesis. 1984; 5 (11): 1381–1393. [PubMed: 6386215]
Bauer NC, Corbett AH, Doetsch PW. Keadaan kerusakan dan perbaikan basis DNA
eukariotik saat ini. Res asam nukleat. 2015; 43 (21): 10083–10101. [PubMed:
26519467]
Bekker-Jensen S, Lukas C, Kitagawa R, Melander F, Kastan MB, Bartek J, Lukas J.
Organisasi spasial mesin pengintai genom mamalia sebagai respons terhadap
putusnya untai DNA. J Sel Berbagai. 2006; 173 (2): 195–206. [PubMed: 16618811]
Ben-Yehoyada M, Wang LC, ID Kozekov, Rizzo CJ, Gottesman ME, Gautier J. Checkpoint
memberi sinyal dari satu DNA interstrand crosslink. Mol Cell. 2009;
35 (5): 704–715. [PubMed: 19748363]
Bennett JW, Klich M. Mycotoxins. Clin Microbiol Rev.2003; 16 (3): 497–516. [PubMed: 12857779]
Beranek DT. Distribusi aduk metil dan etil setelah alkilasi dengan zat alkilasi
monofungsional. Mutat Res. 1990; 231 (1): 11–30. [PubMed: 2195323]
Bernstein NK, Williams RS, Rakovszky ML, Cui D, Green R, Karimi-Busheri F, Mani
RS, Galicia S, Koch CA, Cass CE, Durocher D, Weinfeld M, Glover JN. Arsitektur
molekuler enzim perbaikan DNA mamalia, polynucleotide kinase. Mol Cell. 2005;
17 (5): 657–670. [PubMed: 15749016]
Bessho T, Mu D, Sancar A. Inisiasi perbaikan DNA interstrand cross-link pada

manusia: sistem perbaikan eksisi nukleotida membuat sayatan ganda 5 ' ke basis
ikatan silang dan menghilangkan 22 sampai 28 -nukleotida-panjang

bebas kerusakan untai. Mol Sel Biol. 1997; 17 (12): 6822–6830. [PubMed: 9372913]
Bhatti S, Kozlov S, Farooqi AA, Naqi A, Lavin M, Khanna KK. Protein kinase ATM:
kunci utama pertahanan seluler terhadap stres. Cell Mol Life Sci. 2011;
68 (18): 2977–3006. [PubMed: 21533982]
Bindra RS, Glazer PM. Co-represi ekspresi gen perbaikan ketidakcocokan oleh
hipoksia dalam sel kanker: peran jaringan Myc / Max. Cancer Lett. 2007;
252 (1): 93–103. [PubMed: 17275176]
Bjelland S, Seeberg E. Mutagenisitas, toksisitas dan perbaikan kerusakan basa DNA
yang disebabkan oleh oksidasi. Mutat Res. 2003; 531 (1–2): 37–80. [PubMed:
14637246]
Blanc V, Davidson NO. Pengeditan RNA yang dimediasi APOBEC-1 . Berbagai Med.
Wiley Interdiscip Rev Syst. 2010; 2 (5): 594–602. [PubMed: 20836050]
Blasco MA. Telomer pada kanker dan penuaan: pelajaran dari tikus. Cancer Lett.
2003; 194 (2): 183– 188. [PubMed: 12757976]
Bluteau D, Masliah-Planchon J, Clairmont C, Rousseau A, Ceccaldi R, Dubois
d'Enghien C, Bluteau O, Cuccuini W, Gachet S, Peffault de Latour R, Leblanc T,
Socie G, Baruchel A, Stoppa-Lyonnet D , D'Andrea AD, Soulier J. Inaktivasi biallelic
dari REV7 dikaitkan dengan anemia Fanconi. J Clin Investasikan. 2016;
126 (9): 3580–3584. [PubMed: 27500492]
Boiteux S, Laval J. Mutagenesis oleh agen alkilasi: properti pengkodean untuk
cetakan DNA polimerase dari poli (dC) yang mengandung
3-metilsitosin. Biochimie. 1982; 64 (8–9): 637–641. [PubMed: 6814512]
Bose SN, Davies RJ, Sethi SK, McCloskey JA. Pembentukan saluran foto adenin-timin
di deoksidinukleosida monofosfat d (TpA) dan dalam DNA. Ilmu. 1983;
220 (4598): 723–725. [PubMed: 6836308]
Bouwman P, Jonkers J. Efek kerusakan DNA deregulasi yang memberi sinyal pada
respons dan resistensi kemoterapi kanker. Nat Rev Cancer. 2012;
12 (9): 587–598. [PubMed: 22918414]
Braithwaite E, Wu X, Wang Z. Perbaikan lesi DNA yang disebabkan oleh hidrokarbon
aromatik polisiklik dalam ekstrak bebas sel manusia : keterlibatan dua mekanisme
perbaikan eksisi secara in vitro. Karsinogenesis. 1998; 19 (7): 1239–1246. [PubMed:
9683183]
Cabang P, Aquilina G, Bignami M, Karran P. Pengikatan ketidakcocokan cacat dan
fenotipe mutator dalam sel yang toleran terhadap kerusakan DNA. Alam. 1993;
362 (6421): 652–654. [PubMed: 8464518]
Breen AP, Murphy JA. Reaksi radikal oksil dengan DNA. Radic Bebas Berbagai Med.
1995; 18 (6): 1033– 1077. [PubMed: 7628729]
Broedbaek K, Poulsen HE, Weimann A, Kom GD, Schwedhelm E, Nielsen P, Boger
RH. Ekskresi biomarker kemih dari DNA dan RNA yang rusak secara oksidatif
pada hemochromatosis herediter. Radic Bebas Berbagai Med. 2009;
47 (8): 1230–1233. [PubMed: 19686840]
Buckland RJ, Watt DL, Chittoor B, Nilsson AK, Kunkel TA, Chabes A. Pool dNTP yang
meningkat dan tidak seimbang secara simetris mempromosikan ketidaksetiaan
replikasi untai yang terdepan dan tertinggal. PLoS Genet. 2014; 10 (12):
e1004846. [PubMed: 25474551]
Bunting SF, Callen E, Wong N, Chen HT, Polato F, Gunn A, Bothmer A, Feldhahn N,
Fernandez- Capetillo O, Cao L, Xu X, Deng CX, Finkel T, Nussenzweig M, Stark JM,
Nussenzweig A. 53BP1 menghambat rekombinasi homolog pada sel yang
kekurangan Brca1 dengan menghalangi reseksi kerusakan DNA. Sel. 2010;
141 (2): 243–254. [PubMed: 20362325]
Burgin AB Jr, Huizenga BN, Nash HA. Substrat bunuh diri baru untuk
topoisomerase DNA dan rekombinase spesifik lokasi. Res asam nukleat. 1995;
23 (15): 2973–2979. [PubMed: 7659520]
Butlin HT. TIGA KULIAH tentang KANKER SKROTUM di CHIMNEY-SWEEPS dan
LAINNYA: Disampaikan di Royal College of Surgeons of England. Sdr. Med J. 1892; 1
(1643): 1341– 1346.
VSC. Kerusakan DNA yang disebabkan oleh radikal bebas dan perbaikannya. Berlin / Heidelberg:
Springer-Verlag; 2006.
Kadet J, Delatour T, Douki T, Gasparutto D, Pouget JP, Ravanat JL, Sauvaigo S. Hidroksil
radikal dan kerusakan basis DNA. Mutat Res. 1999; 424 (1–2): 9–21. [PubMed:
10064846]
Kadet J, Douki T, Ravanat JL. Kerusakan basa yang dihasilkan secara oksidatif pada
DNA seluler. Radic Bebas Berbagai Med. 2010; 49 (1): 9–21. [PubMed: 20363317]
Kadet J, Douki T, Ravanat JL. Pengukuran kerusakan basa yang dihasilkan secara
oksidatif dalam DNA seluler. Mutat Res. 2011; 711 (1–2): 3–12. [PubMed:
21329709]
Kadet J, Ravanat JL, TavernaPorro M, Menoni H, Angelov D. Kerusakan DNA

kompleks yang dihasilkan secara oksidatif: tandem dan lesi berkerumun.
Cancer Lett. 2012; 327 (1–2): 5–15. [PubMed: 22542631]

Kadet J, Wagner JR. Kerusakan basa yang dihasilkan secara oksidatif pada DNA
seluler oleh radikal hidroksil dan oksidan satu elektron: persamaan dan
perbedaan. Arch Biochem Biophys. 2014; 557: 47–54. [PubMed: 24820329]
Caldecott KW. Perbaikan kerusakan untai tunggal dan penyakit genetik. Nat Rev
Genet. 2008; 9 (8): 619–631. [PubMed: 18626472]
Cao L, Xu X, Bunting SF, Liu J, Wang RH, Cao LL, Wu JJ, Peng TN, Chen J, Nussenzweig
A, Deng CX, Finkel T.Syarat selektif untuk 53BP1 dalam respon biologis terhadap
ketidakstabilan genom yang disebabkan oleh Defisiensi Brca1. Mol Cell. 2009;
35 (4): 534–541. [PubMed: 19716796]
Carey JF, Schultz SJ, Sisson L, Fazzio TG, Champoux JJ. Relaksasi DNA oleh manusia
topoisomerase I terjadi pada konformasi penjepit tertutup protein. Proc Natl Acad
Sci AS A. 2003; 100 (10): 5640–5645. [PubMed: 12711735]
Carmichael PL, Hewer A, Osborne MR, Strain AJ, Phillips DH. Deteksi lesi DNA besar di
hati pasien dengan penyakit Wilson dan hemokromatosis primer. Mutat Res. 1995;
326 (2): 235–243. [PubMed: 7529889]
Cavalieri E, Frenkel K, Liehr JG, Rogan E, Roy D. Estrogen sebagai agen genotoksik
endogen - DNA adduct dan mutasi. J Natl Cancer Inst Monogr. 2000;
(27): 75–93. [PubMed: 10963621]
Ceccaldi R, Liu JC, Amunugama R, Hajdu I, Primack B, Petalcorin MI, O'Connor
KW, Konstantinopoulos PA, Elledge SJ, Boulton SJ, Yusufzai T, D'Andrea AD.
Tumor homolog -rekombinasi-defisien bergantung pada perbaikan yang
dimediasi oleh Poltheta . Alam. 2015; 518 (7538): 258–262. [PubMed:
25642963]
Ceccaldi R, Rondinelli B, D'Andrea AD. Perbaiki Pilihan Jalur dan Konsekuensi di
Double-Strand Break. Tren Biol Sel. 2016a; 26 (1): 52–64. [PubMed: 26437586]
Ceccaldi R, Sarangi P, D'Andrea AD. Jalur anemia Fanconi: pemain baru dan fungsi
baru. Nat Rev Mol Sel Berbagai. 2016b; 17 (6): 337–349. [PubMed: 27145721]
Chan GL, Doetsch PW, Haseltine WA. Dimer pirimidin siklobutana dan (6-4)
produkfotoproduk memblokir polimerisasi oleh DNA polimerase I. Biokimia.
1985; 24 (21): 5723–5728. [PubMed: 4084488]
Chan K, Resnick MA, Gordenin DA. Pemilihan nukleotida yang disisipkan
berlawanan dengan situs abasa yang terbentuk di dalam DNA kromosom
mengungkapkan aktivitas polimerase yang berpartisipasi dalam sintesis DNA
translesion. Perbaikan DNA (Amst). 2013; 12 (11): 878–889. [PubMed: 23988736]
Chandra V, Bortnick A, Murre C. AID menargetkan: misteri lama dan tantangan
baru. Tren Immunol. 2015; 36 (9): 527–535. [PubMed: 26254147]
Chang E, Harley CB. Panjang telomer dan penuaan replikatif di jaringan pembuluh
darah manusia. Proc Natl Acad Sci AS A. 1995; 92 (24): 11190–11194. [PubMed:
7479963]
Chang JH, Kim JJ, Choi JM, Lee JH, Cho Y. Struktur kristal kompleks Mus81-Eme1 .
Genes Dev. 2008; 22 (8): 1093–1106. [PubMed: 18413719]
Chapman JR, Taylor MR, Boulton SJ. Memainkan permainan akhir: pilihan jalur
perbaikan istirahat untai ganda DNA . Mol Cell. 2012; 47 (4): 497–510. [PubMed:
22920291]
Chatterjee N, Lin Y, Santillan BA, Yotnda P, Wilson JH. Stres lingkungan
menyebabkan mutagenesis berulang trinukleotida dalam sel manusia. Proc
Chatterjee N, Lin Y, Wilson JH. Perbaikan ketidakcocokan meningkatkan kematian sel
yang diinduksi transkripsi konvergen pada pengulangan trinukleotida dengan
mengaktifkan ATR. Perbaikan DNA (Amst). 2016a; 42: 26–32. [PubMed: 27131875]
Chatterjee N, Lin Y, Yotnda P, Wilson JH. Stres Lingkungan Menginduksi
Mutagenesis Pengulangan Trinukleotida dalam Sel Manusia dengan
Perbaikan Penggabungan Akhir Alt-Nonhomolog . J Mol berbagai. 2016b;
428 (15): 2978–2980. [PubMed: 27318194]
Chatterjee N, LY, Wilson JH. Jalur anemia Fanconi mengatur kematian sel yang
diinduksi transkripsi konvergen pada pengulangan trinukleotida dalam sel
manusia. Jurnal PostDoc. 2016; 4 (5): 46–54. [PubMed: 27595121]
Chatterjee, N., SBA, Wilson, JH. Mikrosatelit Berulang: Burung kenari di Coalmine. New York: 2013.

Chen H, Shaw BR. Kinetika deaminasi sitosin yang diinduksi bisulfit dalam DNA
untai tunggal. Biokimia. 1993; 32 (14): 3535–3539. [PubMed: 8466898]
Chen L, Nievera CJ, Lee AY, Wu X. Pembentukan kompleks BRCA1.CtIP.MRN yang

bergantung pada siklus sel penting untuk perbaikan kerusakan untai ganda DNA .
J berbagai Chem. 2008; 283 (12): 7713–7720. [PubMed: 18171670]
Chen Y, Huang C, Bai C, Gao H, Ma R, Liu X, Dong Q. Benzo [alpha] pyrene
menekan perbaikan ketidakcocokan DNA dalam sel kanker payudara
manusia. Toksikologi. 2013; 304: 167–172. [PubMed: 23313663]
Cheng KC, Cahill DS, Kasai H, Nishimura S, Loeb LA. 8-Hydroxyguanine, suatu
bentuk kerusakan DNA oksidatif yang melimpah, menyebabkan substitusi G ---- T
dan A ---- C. J berbagai Chem. 1992; 267 (1): 166–
172. [PubMed: 1730583]
Cherkas LF, Aviv A, Valdes AM, Hunkin JL, Gardner JP, Surdulescu GL, Kimura M,
Spector TD. Pengaruh status sosial pada penuaan biologis yang diukur dengan
panjang telomer sel darah putih . Penuaan Sel. 2006; 5 (5): 361–365. [PubMed:
16856882]
Chetsanga CJ, Lozon M, Makaroff C, Savage L. Pemurnian dan karakterisasi
Escherichia coli formamidopyrimidine-DNA glycosylase yang mengeksisi
7-methylguanine rusak dari asam deoksiribonukleat. Biokimia. 1981;
20 (18): 5201–5207. [PubMed: 7028101]
Chou DM, Adamson B, Dephoure NE, Tan X, Nottke AC, Hurov KE, Gygi SP, Colaiacovo
MP, Elledge SJ. Layar lokalisasi kromatin menunjukkan perekrutan poli (ADP
ribose) yang diatur dari polcomb represif dan kompleks NuRD ke lokasi kerusakan
DNA. Proc Natl Acad Sci AS A. 2010; 107 (43): 18475–18480. [PubMed: 20937877]
Chu G, Chang E. Xeroderma pigmentosum grup E sel kekurangan faktor inti yang
mengikat DNA yang rusak. Ilmu. 1988; 242 (4878): 564–567. [PubMed: 3175673]
Ciccia A, Elledge SJ. Respon kerusakan DNA: membuatnya aman untuk dimainkan
dengan pisau. Mol Cell. 2010; 40 (2): 179–204. [PubMed: 20965415]
Ciccia A, Ling C, Coulthard R, Yan Z, Xue Y, Meetei AR, Laghmani el H, Joenje H,
McDonald N, de Winter JP, Wang W, West SC. Identifikasi FAAP24, protein
kompleks inti anemia Fanconi yang berinteraksi dengan FANCM. Mol Cell. 2007;
25 (3): 331–343. [PubMed: 17289582]
Ciccia A, McDonald N, SC Barat. Hubungan struktural dan fungsional dari keluarga
protein XPF / MUS81. Annu Rev Biochem. 2008; 77: 259–287. [PubMed: 18518821]
Clausen AR, Zhang S, Burgers PM, Lee MY, Kunkel TA. Penggabungan ribonukleotida,
proofreading dan bypass oleh delta polimerase DNA manusia. Perbaikan DNA
(Amst). 2013; 12 (2): 121–127. [PubMed: 23245697]
Clauson C, Scharer OD, Niedernhofer L. Kemajuan dalam memahami mekanisme
kompleks perbaikan cross-link DNA interstrand . Berbagai Perspektif Cold Spring
Harb. 2013; 5 (10): a012732. [PubMed: 24086043]
Compe E, Misalnya JM. TFIIH: ketika transkripsi memenuhi perbaikan DNA. Nat Rev
Mol Sel Berbagai. 2012; 13 (6): 343–354. [PubMed: 22572993]
Cooper DN, Youssoufian H. Dinukleotida CpG dan penyakit genetik manusia.
Genet Hum. 1988; 78 (2): 151–155. [PubMed: 3338800]
Cosman M, de los Santos C, Fiala R, Hingerty BE, Singh SB, Ibanez V, Margulis LA, Live
D, Geacintov NE, Broyde S, dkk. Konformasi larutan aduk utama antara
karsinogen
(+) - anti-benzo [a] pyrene diol epoxide dan DNA. Proc Natl Acad Sci AS A. 1992;
89 (5): 1914-1918. [PubMed: 1311854]
Costantini S, Woodbine L, Andreoli L, Jeggo PA, Vindigni A. Interaksi Ku heterodimer
dengan kompleks DNA ligase IV / Xrcc4 dan regulasi oleh DNA-PK. Perbaikan
DNA (Amst). 2007; 6 (6): 712–722. [PubMed: 17241822]
Crutzen PJ, Andreae MO. Pembakaran biomassa di daerah tropis: berdampak
pada kimia atmosfer dan siklus biogeokimia. Ilmu. 1990;
250 (4988): 1669–1678. [PubMed: 17734705]
Cui B, Johnson SP, Bullock N, Ali-Osman F, Bigner DD, Friedman HS. Alkylator DNA
bifungsional 1,3-bis (2-kloroetil) -1-nitrosourea mengaktifkan jalur ATR-Chk1
secara independen dari jalur perbaikan ketidakcocokan. Mol Pharmacol. 2009;
75 (6): 1356–1363. [PubMed: 19261750]
Curtin NJ. Disregulasi perbaikan DNA dari penggerak kanker ke target terapeutik.
Nat Rev Cancer. 2012; 12 (12): 801–817. [PubMed: 23175119]
d'Adda di Fagagna F, Teo SH, Jackson SP. Hubungan fungsional antara telomer dan
protein dari respon kerusakan DNA . Genes Dev. 2004;
ah Penulis
18 (15): 1781–1799. [PubMed: 15289453]

D'Amours D, Desnoyers S, D'Silva I, Poirier GG. Reaksi asi poli (ADP-ribosil) dalam
regulasi fungsi inti. Biochem J. 1999; 342 ( Pn 2): 249–268. [PubMed: 10455009]
D'Andrea AD. Jalur kerentanan pada anemia Fanconi dan kanker payudara. N Engl J
Med. 2010; 362 (20): 1909–1919. [PubMed: 20484397]
d'Ischia M, Napolitano A, Manini P, Panzella L. Target sekunder spesies nitrogen
reaktif turunan nitrit : jalur nitrosasi / nitrasi, mekanisme pertahanan
antioksidan, dan implikasi toksikologis. Chem Res Toxicol. 2011;
24 (12): 2071–2092. [PubMed: 21923154]
Dasari S, Tchounwou PB. Cisplatin dalam terapi kanker: mekanisme aksi
molekuler. Eur J Pharmacol. 2014; 740: 364–378. [PubMed: 25058905]
Davidovic L, Vodenicharov M, Affar EB, Poirier GG. Pentingnya poli (ADP-ribosa)
glycohydrolase dalam pengendalian metabolisme poli (ADP-ribosa) . Exp Sel Res.
2001; 268 (1): 7–13. [PubMed: 11461113]
Davies RJ. Kuliah Medali Royal Irish Academy. Kerusakan radiasi ultraviolet pada
DNA. Biochem Soc Trans. 1995; 23 (2): 407–418. [PubMed: 7672432]
De Bont R, van Larebeke N. Kerusakan DNA endogen pada manusia: tinjauan
data kuantitatif. Mutagenesis. 2004; 19 (3): 169–185. [PubMed: 15123782]
de Groote FH, Jansen JG, Masuda Y, Shah DM, Kamiya K, de Wind N, Siegal G.
Polimerase sintesis translesion Rev1 memiliki beberapa mode pengikatan DNA
yang berbeda. Perbaikan DNA (Amst). 2011; 10 (9): 915–925. [PubMed: 21752727]
de Lange T. Shelterin: kompleks protein yang membentuk dan melindungi telomer
manusia. Genes Dev. 2005; 19 (18): 2100–2110. [PubMed: 16166375]
Demple B, Harrison L. Perbaikan kerusakan oksidatif pada DNA: enzim dan
biologi. Annu Rev Biochem. 1994; 63: 915–948. [PubMed: 7979257]
Demple B, Linn S. 5,6- lesi timin jenuh dalam DNA: produksi oleh sinar ultraviolet
atau hidrogen peroksida. Res asam nukleat. 1982; 10 (12): 3781–3789. [PubMed:
7111022]
DeVita VT Jr, Chu E. Riwayat kemoterapi kanker. Res kanker. 2008;
68 (21): 8643–8653. [PubMed: 18974103]
Diamant N, Hendel A, Vered I, Carell T, Reissner T, de Wind N, Geacinov N, Livneh Z.
Pemintas kerusakan DNA beroperasi pada fase S dan G2 dari siklus sel dan
menunjukkan mutagenisitas yang berbeda. Res asam nukleat. 2012;
40 (1): 170–180. [PubMed: 21908406]
Dianov GL, Hubscher U. Perbaikan eksisi dasar mamalia: malaikat agung yang
terlupakan. Res asam nukleat. 2013; 41 (6): 3483–3490. [PubMed: 23408852]
Dias V, Junn E, Mouradian MM. Peran stres oksidatif dalam penyakit Parkinson. J
Parkinsons Dis. 2013; 3 (4): 461–491. [PubMed: 24252804]
Dion V. Spesifitas jaringan dalam perbaikan DNA: pelajaran dari ketidakstabilan
berulang trinukleotida. Trends Genet. 2014; 30 (6): 220–229. [PubMed:
24842550]
Dizdaroglu M, Rao G, Halliwell B, Gajewski E. Kerusakan pada basa DNA pada
kromatin mamalia oleh hidrogen peroksida dengan adanya ion besi dan cupric.
Arch Biochem Biophys. 1991; 285 (2): 317–324. [PubMed: 1654771]
Doles J, Oliver TG, Cameron ER, Hsu G, Jacks T, Walker GC, Hemann MT. Supresi Rev3,
subunit katalitik dari Pol {zeta}, membuat peka terhadap tumor paru yang
resistan terhadap obat terhadap kemoterapi. Proc Natl Acad Sci AS A. 2010;
107 (48): 20786–20791. [PubMed: 21068376]
Douki T, Perdiz D, Grof P, Kuluncsics Z, Moustacchi E, Cadet J, Sage E.Oksidasi guanin
dalam DNA seluler oleh radiasi UV matahari: peran biologis. Photochem
Photobiol. 1999; 70 (2): 184–190. [PubMed: 10461457]
Drablos F, Feyzi E, Aas PA, Vaagbo CB, Kavli B, Bratlie MS, Pena-Diaz J, Otterlei M,
Slupphaug G, Krokan HE. Kerusakan alkilasi pada DNA dan RNA - mekanisme
perbaikan dan signifikansi medis. Perbaikan DNA (Amst). 2004;
3 (11): 1389–1407. [PubMed: 15380096]
Dumaz N, Drougard C, Sarasin A, Daya-Grosjean L. Spektrum mutasi spesifik yang
diinduksi UV pada gen p53 tumor kulit dari pasien xeroderma pigmentosum
yang kekurangan perbaikan DNA . Proc Natl Acad Sci AS A. 1993;
90 (22): 10529–10533. [PubMed: 8248141]
Duquette ML, Zhu Q, Taylor ER, Tsay AJ, Shi LZ, Berns MW, McGowan CH. CtIP
diperlukan untuk memulai perbaikan lintas-lintas yang bergantung pada
Naskah Penulis
replikasi . PLoS Genet. 2012; 8 (11): e1003050. [PubMed: 23144634]

Eckel LM, Krugh TR. Dupleks DNA 2-aminofluorene yang dimodifikasi ada
dalam dua konformasi yang dapat dipertukarkan. Nat Struct Biol. 1994a;
1 (2): 89–94. [PubMed: 7656023]
Naskah Penulis
Eckel LM, Krugh TR. Karakterisasi struktural dari dua konformasi yang dapat
dipertukarkan dari oligomer DNA termodifikasi 2- aminofluorene oleh NMR dan
minimisasi energi. Biokimia. 1994b; 33 (46): 13611–13624. [PubMed: 7947770]
Edwards RA, Witherspoon M, Wang K, Afrasiabi K, Pham T, Birnbaumer L, Lipkin SM. Epigenetik
represi perbaikan ketidakcocokan DNA oleh peradangan dan hipoksia pada
penyakit radang usus terkait kanker kolorektal. Res kanker. 2009;
69 (16): 6423–6429. [PubMed: 19638594]
El-Khamisy SF, Hartsuiker E, Caldecott KW. TDP1 memfasilitasi perbaikan
untai tunggal DNA yang diinduksi radiasi pengion . Perbaikan DNA (Amst). 2007;
6 (10): 1485–1495. [PubMed: 17600775]
El-Khamisy SF, Saifi GM, Weinfeld M, Johansson F, Helleday T, Lupski JR, Caldecott
KW. Perbaikan kerusakan untai tunggal DNA yang rusak pada ataksia
spinocerebellar dengan neuropati aksonal -1. Alam. 2005;
434 (7029): 108–113. [PubMed: 15744309]
Emadi A, Jones RJ, Brodsky RA. Siklofosfamid dan kanker: peringatan emas. Nat
Rev Clin Oncol. 2009; 6 (11): 638–647. [PubMed: 19786984]
Enoiu M, Jiricny J, Scharer OD. Perbaikan ikatan silang interstrand DNA yang
diinduksi cisplatin dengan jalur replikasi-independen yang melibatkan
perbaikan yang digabungkan dengan transkripsi dan sintesis translesion. Res
asam nukleat. 2012; 40 (18): 8953–8964. [PubMed: 22810206]
Epe B. Genotoksisitas oksigen singlet. Chem Biol Berinteraksi. 1991; 80 (3): 239–260. [PubMed: 1954654]
Epel E, Daubenmier J, Moskowitz JT, Folkman S, Blackburn E. Dapatkah meditasi
memperlambat laju penuaan sel? Stres kognitif, perhatian penuh, dan
telomere. Ann NY Acad Sci. 2009; 1172: 34–53. [PubMed: 19735238]
Epel ES, Blackburn EH, Lin J, Dhabhar FS, Adler NE, Morrow JD, Cawthon RM.
Pemendekan telomer yang dipercepat sebagai respons terhadap stres hidup.
Proc Natl Acad Sci AS A. 2004; 101 (49): 17312– 17315. [PubMed: 15574496]
Eppink B, Tafel AA, Hanada K, van Drunen E, Hickson ID, Essers J, Kanaar R. Respons
sel mamalia terhadap sinar UV menunjukkan jalur rekombinasi homolog yang
bergantung pada Rad54 dan independen. Perbaikan DNA (Amst). 2011;
10 (11): 1095–1105. [PubMed: 21885354]
Friedberg, Errol C., GCW, Siede, Wolfram, Wood, Richard D., Schultz, Roger A.,
Ellenberger, Tom. Perbaikan dan Mutagenesis DNA. 2. ASM Press; 2005. hal.
1118
Essigmann JM, Croy RG, Nadzan AM, Busby WF Jr, Reinhold VN, Buchi G, Wogan GN.
Identifikasi struktural dari DNA adduct utama yang dibentuk oleh aflatoksin B1
in vitro. Proc Natl Acad Sci AS A. 1977; 74 (5): 1870–1874. [PubMed: 266709]
Fagbemi AF, Orelli B, Scharer OD. Pengaturan aktivitas endonuklease dalam
perbaikan eksisi nukleotida manusia. Perbaikan DNA (Amst). 2011;
10 (7): 722–729. [PubMed: 21592868]
Falnes PO, Klungland A, Alseth I. Perbaikan lesi metil dalam DNA dan RNA
dengan demetilasi oksidatif. Ilmu saraf. 2007;
145 (4): 1222–1232. [PubMed: 17175108]
Fang Q, Noronha AM, Murphy SP, Wilds CJ, Tubbs JL, Tainer JA, Chowdhury G,
Guengerich FP, Pegg AE. Perbaikan O6-G-alkil-O6-G interstrand cross-link oleh
manusia O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase. Biokimia. 2008;
47 (41): 10892–10903. [PubMed: 18803403]
Fekairi S, Scaglione S, Chahwan C, Taylor ER, Tissier A, Coulon S, Dong MQ, Ruse C,
Yates JR 3rd, Russell P, Fuchs RP, McGowan CH, Gaillard PH. Human SLX4 adalah
subunit resolvase persimpangan Holliday yang mengikat beberapa
endonuklease perbaikan / rekombinasi DNA. Sel. 2009; 138 (1): 78–89. [PubMed:
19596236]
Bunga L, Ohnishi ST, Penning TM. Pemotongan untai DNA oleh o-kuinon
hidrokarbon aromatik polisiklik: peran spesies oksigen reaktif, siklus redoks Cu
(II) / Cu (I), dan radikal anion o-semikuinon . Biokimia. 1997;
36 (28): 8640–8648. [PubMed: 9214311]
Fousteri M, Vermeulen W, van Zeeland AA, Mullenders LH. Protein A dan B
sindrom Cockayne secara berbeda mengatur perekrutan pemodelan ulang
kromatin dan faktor perbaikan ke RNA polimerase II in vivo yang terhenti.
Mol Cell. 2006; 23 (4): 471–482. [PubMed: 16916636]
Fryxell KJ, Zuckerkandl E. Deaminasi sitosin memainkan peran utama dalam evolusi
isokor mamalia. Mol berbagai Evol. 2000; 17 (9): 1371–1383. [PubMed: 10958853]
Naskah Penulis
Fu PP. Metabolisme hidrokarbon aromatik nitro-polisiklik . Drug Metab Rev. 1990;

22 (2–3): 209– 268. [PubMed: 2272288]
Fujiki H. Inti dari makalah Dr. Katsusaburo Yamagiwa yang berjudul "Studi eksperimental
tentang patogenesis tumor epitel" (laporan I hingga VI). Cancer Sci. 2014;
Naskah Penulis
105 (2): 143–149. [PubMed: 24313817]

Gafter-Gvili A, Zingerman B, Rozen-Zvi B, Ori Y, Green H, Lubin I, Malachi T, Gafter
U, Herman- Edelstein M. Kerusakan dan perbaikan DNA akibat stres oksidatif
dalam sel mononuklear darah perifer manusia: peran pelindung dari
hemoglobin. PLoS One. 2013; 8 (7): e68341. [PubMed: 23874593]
Galiegue-Zouitina S, Bailleul B, Ginot YM, Perly B, Vigny P, Loucheux-Lefebvre MH.
N2-guanyl dan N6 -adenyl arylation dari DNA eritrosit ayam oleh karsinogen
utama dari 4-nitroquinoline 1-oxide. Res kanker. 1986; 46 (4 Pt
1): 1858–1863. [PubMed: 3081259]
Galiegue-Zouitina S, Bailleul B, Loucheux-Lefebvre MH. Aduksi dari aksi in vivo
karsinogen 4-hidroksiaminoquinolin 1-oksida pada tikus dan dari reaksi in
vitro 4-asetoksaminoquinolin 1-oksida dengan DNA dan polinukleotida. Res
kanker. 1985; 45 (2): 520– 525. [PubMed: 3917848]
Gari K, Decaillet C, Delannoy M, Wu L, Constantinou A. Renovasi struktur replikasi
DNA dengan titik cabang translocase FANCM. Proc Natl Acad Sci AS A. 2008a;
105 (42): 16107– 16112. [PubMed: 18843105]
Gari K, Decaillet C, Stasiak AZ, Stasiak A, Constantinou A. Protein anemia Fanconi
FANCM dapat mendorong migrasi cabang persimpangan Holliday dan garpu
replikasi. Mol Cell. 2008b; 29 (1): 141–148. [PubMed: 18206976]
Geacintov NE. Apakah interkalasi merupakan faktor penting dalam pengikatan
kovalen epoksida diol polisiklik mutagenik dan tumorigenik polisiklik
aromatik ke DNA? Karsinogenesis. 1986; 7 (5): 759–766. [PubMed: 3698204]
Genschel J, Modrich P. Mekanisme 5 ' -directed eksisi dalam perbaikan
ketidakcocokan manusia. Mol Cell. 2003; 12 (5): 1077–1086. [PubMed: 14636568]
Gentil A, Le Page F, Margot A, Lawrence CW, Borden A, Sarasin A. Mutagenisitas
dari dimer timin-timin yang unik atau fotoproduk timin-timin pirimidin
(6-4) dalam sel mamalia. Res asam nukleat. 1996;
24 (10): 1837–1840. [PubMed: 8657563]
Gerken T, Girard CA, Tung YC, Webby CJ, Saudek V, Hewitson KS, Yeo GS, McDonough
MA, Cunliffe S, McNeill LA, Galvanovskis J, Rorsman P, Robins P, Prieur X, Coll AP,
Ma M, Jovanovic Z , Farooqi IS, Sedgwick B, Barroso I, Lindahl T, Ponting CP,
Ashcroft FM, O'Rahilly S, Schofield CJ. The obesitas-terkait gen FTO mengkodekan
2-oksoglutarat tergantung demethylase asam nukleat. Ilmu. 2007;
318 (5855): 1469–1472. [PubMed: 17991826]
Ghosal G, toleransi kerusakan Chen J. DNA: pedang bermata dua yang menjaga
genom. Transl Cancer Res. 2013; 2 (3): 107–129. [PubMed: 24058901]
Giacco F, Brownlee M. Stres oksidatif dan komplikasi diabetes. Circ Res. 2010; 107
(9): 1058– 1070. [PubMed: 21030723]
Giloni L, Takeshita M, Johnson F, Iden C, Grollman AP.
DNA yang diinduksi Bleomycin . Mekanisme pembelahan deoksiribosa. J
berbagai Chem. 1981; 256 (16): 8608–8615.
Goff SP. Kematian karena deaminasi: sistem pembatasan host baru untuk HIV-1. Sel.
2003; 114 (3): 281–283. [PubMed: 12914693]
Gottlieb TM, Jackson SP. The DNA-dependent protein kinase: persyaratan
untuk ujung DNA dan asosiasi dengan antigen Ku. Sel. 1993;
72 (1): 131–142. [PubMed: 8422676]
Gottschalk AJ, Timinszky G, Kong SE, Jin J, Cai Y, Swanson SK, Washburn MP, Florens L,
Ladurner AG, Conaway JW, Conaway RC. Poli (ADP-ribosyl) asi mengarahkan
perekrutan dan aktivasi remodeler kromatin yang bergantung pada ATP . Proc
Natl Acad Sci AS A. 2009; 106 (33): 13770–13774.
[PubMed: 19666485]
Graslund A, Jernstrom B. Interaksi DNA-karsinogen : DNA-adduct kovalen dari benzo
(a) pyrene 7,8- dihydrodiol 9,10- epoxides dipelajari dengan teknik biokimia dan
biofisik. Q Rev Biophys. 1989; 22 (1): 1–37. [PubMed: 2501820]
Grawunder U, Wilm M, Wu X, Kulesza P, Wilson TE, Mann M, Lieber MR. Aktivitas

DNA ligase IV dirangsang oleh pembentukan kompleks dengan protein XRCC4
Naskah Penulis Naskah
dalam sel mamalia. Alam. 1997; 388 (6641): 492–495. [PubMed: 9242410]
Gregory CD, Milner AE. Pengaturan kelangsungan hidup sel pada limfoma Burkitt:
implikasi dari studi apoptosis setelah pengobatan syok dingin . Int J. Cancer.
1994; 57 (3): 419–426. [PubMed: 8169005]
Grundy GJ, Rulten SL, Zeng Z, Arribas-Bosacoma R, Iles N, Manley K, Oliver A,
Caldecott KW. APLF mempromosikan perakitan dan aktivitas kompleks
protein penggabung ujung non-homolog . EMBO J. 2013;
32 (1): 112–125. [PubMed: 23178593]
Guo S, Zhang Y, Yuan F, Gao Y, Gu L, Wong I, Li GM. Pengaturan fungsi replikasi
protein A dalam perbaikan ketidakcocokan DNA dengan fosforilasi. J berbagai
Chem. 2006; 281 (31): 21607–21616. [PubMed: 16731533]
Naskah
Penulis
Hafstad AD, Nabeebaccus AA, Shah AM. Aspek baru dari pensinyalan ROS pada gagal
jantung. Res Dasar Cardiol. 2013; 108 (4): 359. [PubMed: 23740217]
Hammel M, Rey M, Yu Y, Mani RS, Classen S, Liu M, Pique ME, Fang S, Mahaney BL,
Penulis
Weinfeld M, Schriemer DC, Lees-Miller SP, Tainer JA. Interaksi protein XRCC4
dengan XRCC4-like factor (XLF) membuat perancah beralur diperpanjang untuk
s Naskah Penulis
ligasi DNA dan perbaikan putus untai ganda. J berbagai Chem. 2011;
286 (37): 32638–32650. [PubMed: 21775435]
Hammons GJ, Milton D, Stepps K, Guengerich FP, Tukey RH, Kadlubar FF.
Metabolisme amina heterosiklik dan aromatik karsinogenik oleh enzim
sitokrom P450 manusia rekombinan. Karsinogenesis. 1997;
18 (4): 851–854. [PubMed: 9111224]
Han HJ, Tan NH, Zeng GZ, Fan JT, Huang HQ, Ji CJ, Jia RR, Zhao QS, Zhang YJ, Hao XJ, Wang LQ.
Penghambat alami topoisomerase DNA I dengan sitotoksisitas. Chem
Biodivers. 2008; 5 (7): 1364–1368. [PubMed: 18649302]
Harper JW, Elledge SJ. Respon kerusakan DNA: sepuluh tahun setelahnya. Mol Cell.
2007; 28 (5): 739–745. [PubMed: 18082599]
Harvey, RG. Hidrokarbon Aromatik Polisiklik: Kimia dan Karsinogenisitas.
Cambridge University Press; 1991.
Hawkins BL, Heniford BW, Ackermann DM, Leonberger M, Martinez SA, Hendler FJ.
4NQO karsinogenesis: model tikus karsinoma sel skuamosa rongga mulut. Kepala
Leher. 1994; 16 (5): 424–432. [PubMed: 7960739]
Hecht SS. Pembentukan DNA adduct dari N-nitrosamines spesifik tembakau . Mutat
Res. 1999; 424 (1–2): 127–142. [PubMed: 10064856]
Heeres JT, Hergenrother PJ. Poly (ADP-ribose) membuat tanggal dengan kematian.
Curr Opin Chem Berbagai. 2007; 11 (6): 644–653. [PubMed: 17936669]
Heflich RH, Neft RE. Toksisitas genetik dari 2-acetylaminofluorene, 2-aminofluorene
dan beberapa metabolit dan model metabolitnya. Mutat Res. 1994;
318 (2): 73–114. [PubMed: 7521935]
Hegde ML, Hazra TK, Mitra S. Langkah awal eksisi basa DNA / jalur perbaikan
interupsi untai tunggal pada sel mamalia. Res sel. 2008; 18 (1): 27–47. [PubMed:
18166975]
Henle ES, Linn S. Pembentukan, pencegahan, dan perbaikan kerusakan DNA oleh
besi / hidrogen peroksida. J berbagai Chem. 1997;
272 (31): 19095–19098. [PubMed: 9235895]
Henner WD, Grunberg SM, Haseltine WA. Situs dan struktur untai DNA yang
diinduksi radiasi gamma . J berbagai Chem. 1982;
257 (19): 11750–11754. [PubMed: 7118909]
Henner WD, Grunberg SM, Haseltine WA. Aksi enzim pada 3 ' ujung untai DNA yang
diinduksi radiasi pengion akan terputus. J berbagai Chem. 1983a;
258 (24): 15198–15205. [PubMed: 6361028]
Henner WD, Rodriguez LO, Hecht SM, Haseltine WA. Gamma Ray menyebabkan
putusnya untai asam deoksiribonukleat. 3 ' Glycolate termini. J berbagai Chem.
1983b; 258 (2): 711–713. [PubMed: 6822504]
Herrmann SS, Granby K, Duedahl-Olesen L. Pembentukan dan mitigasi
N-nitrosamin dalam sosis matang yang diawetkan dengan nitrit. Kimia
Makanan. 2015; 174: 516–526. [PubMed: 25529714]
Hewitt G, Jurk D, Marques FD, Correia-Melo C, Hardy T, Gackowska A, Anderson R,
Taschuk M, Mann J, Passos JF. Telomer adalah target favorit dari respons
kerusakan DNA yang persisten dalam penuaan dan penuaan akibat stres . Nat
Commun. 2012; 3: 708. [PubMed: 22426229]
Ho SM, Roy D. Kerusakan DNA inti akibat hormon seks dan peroksidasi lipid pada
prostat dorsolateral tikus Noble. Cancer Lett. 1994; 84 (2): 155–162. [PubMed:
8076372]
Ho TV, Guainazzi A, Derkunt SB, Enoiu M, Scharer OD. Bypass yang

bergantung pada struktur dari ikatan silang antar-untai DNA oleh polimerase
Naskah Penulis Naskah Penulis
sintesis translesion. Res asam nukleat. 2011; 39 (17): 7455–7464. [PubMed:

21666254]
Holliday R, Ho T. Membungkam gen dan metilasi DNA endogen dalam sel mamalia.
Mutat Res. 1998; 400 (1–2): 361–368. [PubMed: 9685696]
Holloman WK. Mengurai mekanisme BRCA2 dalam rekombinasi homolog. Nat Struct
Mol berbagai. 2011; 18 (7): 748–754. [PubMed: 21731065]
Rumah NC, Koch MR, Freudenreich CH. Modifikasi kromatin dan perbaikan DNA:
lebih dari putus untai ganda. Genet Depan. 2014; 5: 296. [PubMed: 25250043]
Howard SM, Yanez DA, Stark JM. Faktor respons kerusakan DNA dari jalur yang
berbeda, termasuk perbaikan ikatan silang DNA, menengahi sambungan
ujung alternatif. PLoS Genet. 2015; 11 (1): e1004943. [PubMed: 25629353]
Hoxha M, Dioni L, Bonzini M, Pesatori AC, Fustinoni S, Cavallo D, Carugno M, Albetti
Naskah Penulis
B, Marinelli B, Schwartz J, Bertazzi PA, Baccarelli A. Asosiasi antara leukosit

pemendekan telomere dan paparan polusi lalu lintas: a silang studi bagian pada
petugas lalu lintas dan pekerja kantor dalam ruangan. Kesehatan Lingkungan.
2009; 8:41. [PubMed: 19772576]
Huang JC, Hsu DS, Kazantsev A, Sancar A. Spektrum substrat excinuclease manusia:
perbaikan situs abasic, basa termetilasi, ketidakcocokan, dan adduct besar. Proc
s Naskah Penulis
Huang M, Kim JM, Shiotani B, Yang K, Zou L, D'Andrea AD. Kompleks FANCM /
FAAP24 diperlukan untuk respons checkpoint yang diinduksi oleh DNA
interstrand crosslink . Mol Cell. 2010; 39 (2): 259–268. [PubMed: 20670894]
Hubert L Jr, Lin Y, Dion V, Wilson JH. Defisiensi Xpa mengurangi ketidakstabilan
berulang trinukleotida CAG di jaringan saraf dalam model tikus SCA1. Hum Mol
Genet. 2011; 20 (24): 4822–4830. [PubMed: 21926083]
Huff AC, Topal MD. Kerusakan DNA pada timin N-3 menghilangkan kapasitas
pasangan basa selama sintesis DNA. J berbagai Chem. 1987;
262 (26): 12843–12850. [PubMed: 2442169]
Huffman JL, Sundheim O, Tainer JA. Pengenalan dan penghapusan kerusakan
dasar DNA: tikungan dan alur baru. Mutat Res. 2005;
577 (1–2): 55–76. [PubMed: 15941573]
Hutchinson F. Perubahan kimiawi yang diinduksi dalam DNA dengan radiasi
pengion. Biol Mol Asam Nukleat Prog. 1985; 32: 115–154. [PubMed: 3003798]
Iliakis G. Peran putus untai ganda DNA dalam pembunuhan sel eukariotik yang
diinduksi radiasi pengion . Bioessays. 1991; 13 (12): 641–648. [PubMed:
1789781]
Imlay JA, Chin SM, Linn S. Kerusakan DNA toksik oleh hidrogen peroksida melalui
reaksi Fenton in vivo dan in vitro. Ilmu. 1988; 240 (4852): 640–642. [PubMed:
2834821]
Jackson SP, Bartek J. Respon kerusakan DNA dalam biologi dan penyakit
manusia. Alam. 2009; 461 (7267): 1071–1078. [PubMed: 19847258]
Jacobs AL, Schar P. DNA glikosilase: dalam perbaikan DNA dan seterusnya.
Kromosoma. 2012; 121 (1): 1–20. [PubMed: 22048164]
Jansen JG, Tsaalbi-Shtylik A, Hendriks G, Gali H, Hendel A, Johansson F, Erixon K,
Livneh Z, Mullenders LH, Haracska L, de Wind N.Domain terpisah dari Rev1
menengahi dua mode bypass kerusakan DNA dalam sel mamalia . Mol Sel Biol.
2009a; 29 (11): 3113–3123. [PubMed: 19332561]
Jansen JG, Tsaalbi-Shtylik A, Hendriks G, Verspuy J, Gali H, Haracska L, de Wind N.
Polimerase zeta mamalia sangat penting untuk perbaikan pasca-replikasi lesi
DNA yang diinduksi UV . Perbaikan DNA (Amst). 2009b;
8 (12): 1444–1451. [PubMed: 19783229]
Jha V, Bian C, Xing G, Ling H. Struktur dan mekanisme replikasi bebas kesalahan
melewati aduk benzo [a] pyrene utama oleh DNA manusia polimerase kappa.
Res asam nukleat. 2016; 44 (10): 4957–4967. [PubMed: 27034468]
Jilani A, Ramotar D, Slack C, Ong C, Yang XM, Scherer SW, Lasko DD. Kloning
molekuler dari gen manusia, PNKP, mengkodekan polynucleotide kinase
3 ′ -phosphatase dan bukti perannya dalam perbaikan untai DNA yang rusak
yang disebabkan oleh kerusakan oksidatif. J berbagai Chem. 1999; 274 (34):
24176– 24186. [PubMed: 10446192]
Jiricny J. Sistem perbaikan ketidakcocokan multifaset . Nat Rev Mol Sel Berbagai.
2006; 7 (5): 335–346. [PubMed: 16612326]
Naskah Penulis Naskah Penulis Naskah
Jiricny J. Perbaikan ketidakcocokan postreplicative. Berbagai Perspektif Cold

Spring Harb. 2013; 5 (4): a012633. [PubMed: 23545421]
Kadyrov FA, Dzantiev L, Constantin N, Modrich P. Fungsi endonukleolitik dari
MutLalpha dalam perbaikan ketidakcocokan manusia. Sel. 2006;
126 (2): 297–308. [PubMed: 16873062]
Kaina B, Christmann M, Naumann S, Roos WP. MGMT: simpul kunci dalam
pertempuran melawan genotoksisitas, karsinogenisitas dan apoptosis yang
disebabkan oleh agen alkilasi. Perbaikan DNA (Amst). 2007; 6 (8):
1079–1099. [PubMed: 17485253]
Kanojia D, Vaidya MM. 4-nitroquinoline-1-oxide menginduksi karsinogenesis oral
eksperimental. Oncol Lisan. 2006; 42 (7): 655–667. [PubMed: 16448841]
Kantidze OL, Velichko AK, Luzhin AV, Razin SV. Kerusakan DNA Akibat Tekanan
Panas . Acta Naturae. 2016; 8 (2): 75–78. [PubMed: 27437141]
Kasai H, Nishimura S. Hidroksilasi deoxyguanosine pada posisi C-8 oleh asam
askorbat dan zat pereduksi lainnya. Res asam nukleat. 1984;
12 (4): 2137–2145. [PubMed: 6701097]
Naskah
Kasiotis KM, Kyriakopoulou K, Emmanouil C, Tsantila N, Liesivuori J, Souki H,

Manakis S, Machera K. Pemantauan paparan sistemik produk perlindungan
tanaman dan kerusakan DNA pada pekerja kebun. Toxicol Lett. 2012;
Penulis
210 (2): 182–188. [PubMed: 22115631]

Penulis
Kat A, Thilly WG, Fang WH, Longley MJ, Li GM, Modrich P. Garis sel manusia mutator
yang toleran terhadap alkilasi kekurangan dalam perbaikan ketidakcocokan
spesifik untai . Proc Natl Acad Sci AS A. 1993; 90 (14): 6424–6428. [PubMed:
8341649]
Kato T Jr, Todo T, Ayaki H, Ishizaki K, Morita T, Mitra S, Ikenaga M. Kloning gen
fotolyase DNA marsupial dan kurangnya urutan nukleotida terkait pada
mamalia plasenta. Res asam nukleat. 1994; 22 (20): 4119–4124. [PubMed:
7937136]
Kee Y, D'Andrea AD. Patogenesis molekuler dan manajemen klinis anemia
Fanconi. J Clin Investasikan. 2012; 122 (11): 3799–3806. [PubMed: 23114602]
Kelland L. Kebangkitan kemoterapi kanker berbasis platinum . Nat Rev Cancer. 2007;
7 (8): 573– 584. [PubMed: 17625587]
KIEFER, JR. Pengaruh Radiasi Ultraviolet pada DNA. Günter Obe, V., editor. Berlin;
New York: Springer; 2007.
Kim JM, Kee Y, Gurtan A, D'Andrea AD. Pemuatan kromatin yang
bergantung pada siklus sel dari kompleks inti anemia Fanconi oleh FANCM /
FAAP24. Darah. 2008; 111 (10): 5215–5222. [PubMed: 18174376]
Klug AR, Harbut MB, Lloyd RS, Minko IG. Bypass replikasi dari ikatan silang
interstrand N2-deoxyguanosine oleh DNA manusia polimerase eta dan iota.
Chem Res Toxicol. 2012; 25 (3): 755–762. [PubMed: 22332732]
Knipscheer P, Raschle M, Smogorzewska A, Enoiu M, Ho TV, Scharer OD, Elledge SJ, Walter JC. Itu
Jalur anemia Fanconi mempromosikan replikasi-dependent DNA interstrand
cross-link repair. Ilmu. 2009; 326 (5960): 1698–1701. [PubMed: 19965384]
Kohda K, Tada M, Kasai H, Nishimura S, Kawazoe Y. Pembentukan residu
8-hidroksiguanin dalam DNA seluler yang terpapar karsinogen
4-nitroquinoline 1-oksida. Biochem Biophys Res Commun. 1986;
139 (2): 626–632. [PubMed: 3094520]
Korzhnev DM, Hadden MK. Menargetkan Jalur Sintesis Translesion untuk
Pengembangan Kemoterapi Anti-Kanker . J Med Chem. 2016
Kovtun IV, Liu Y, Bjoras M, Klungland A, Wilson SH, McMurray CT. OGG1 memulai
ekspansi trinukleotida CAG yang bergantung pada usia dalam sel somatik. Alam.
2007; 447 (7143): 447–452. [PubMed: 17450122]
Kriek E. Lima puluh tahun penelitian tentang N-acetyl-2-aminofluorene, salah satu
senyawa paling serbaguna dalam penelitian kanker eksperimental. J Kanker Res
Clin Oncol. 1992; 118 (7): 481–489. [PubMed: 1624539]
Krokan HE, perbaikan eksisi Bjoras M. Base. Berbagai Perspektif Cold Spring
Harb. 2013; 5 (4): a012583. [PubMed: 23545420]
Kumar D, Abdulovic AL, Viberg J, Nilsson AK, Kunkel TA, Chabes A.Mekanisme mutagenesis pada
vivo karena kumpulan dNTP tidak seimbang. Res asam nukleat. 2011;
39 (4): 1360–1371. [PubMed: 20961955]

Kumar S, Joshi PC, Sharma ND, Bose SN, Jeremy R, Davies H, Takeda N, McCloskey JA.
Fotodimerisasi adenin dalam urutan deoksiadenilat: penjelasan mekanisme
melalui studi struktural dari fotoproduk d utama (ApA). Res asam nukleat. 1991;
19 (11): 2841–2847. [PubMed: 2057348]
Kunkel TA. Kesetiaan replikasi DNA. J berbagai Chem. 2004; 279 (17): 16895–16898. [PubMed: 14988392]
Kunkel TA. Pandangan yang berkembang tentang replikasi DNA (dalam) kesetiaan.
Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2009; 74: 91–101. [PubMed: 19903750]
Kunkel TA. Menyeimbangkan asimetri replikasi eukariotik dengan kesetiaan
replikasi. Curr Opin Chem Berbagai. 2011; 15 (5): 620–626. [PubMed:
21862387]
Kunkel TA, Erie DA. Perbaikan ketidakcocokan DNA. Annu Rev Biochem. 2005;
74: 681–710. [PubMed: 15952900]
Kurowski MA, Bhagwat AS, Papaj G, Bujnicki JM. Identifikasi filogenomik lima
homolog manusia baru dari enzim perbaikan DNA AlkB. BMC Genomics. 2003;
4 (1): 48. [PubMed: 14667252]
Kvam E, Tyrrell RM. Latar belakang buatan dan tingkat kerusakan basa oksidatif
yang diinduksi dalam DNA dari sel manusia. Karsinogenesis. 1997;
18 (11): 2281–2283. [PubMed: 9395233]
Lan L, Nakajima S, Oohata Y, Takao M, Okano S, Masutani M, Wilson SH, Yasui A.
Analisis in situ proses perbaikan untuk kerusakan DNA oksidatif dalam sel
mamalia. Proc Natl Acad Sci AS A. 2004; 101 (38): 13738–13743. [PubMed:
15365186]
Lang T, Dalal S, Chikova A, DiMaio D, Sweasy JB. Varian terkait kanker lambung DNA
Naskah Penulis
polimerase beta E295K mengganggu perbaikan eksisi dasar dan menyebabkan

transformasi seluler. Mol Sel Biol. 2007; 27 (15): 5587–5596. [PubMed: 17526740]
Larson K, Sahm J, Shenkar R, Strauss B. Blok yang diinduksi metilasi untuk
replikasi DNA in vitro. Mutat Res. 1985; 150 (1–2): 77–84. [PubMed: 4000169]
Lau PJ, Kolodner RD. Transfer kompleks MSH2.MSH6 dari antigen inti sel yang
berproliferasi ke basis DNA yang salah pasangan. J berbagai Chem. 2003;
278 (1): 14–17. [PubMed: 12435741]
Lawley PD. Pengaruh beberapa mutagen kimia dan karsinogen pada asam nukleat.
Biol Mol Asam Nukleat Prog. 1966; 5: 89–131. [PubMed: 5337700]
Lee KH, Lee JS, Nam JH, Choi C, Lee MC, Park CS, Juhng SW, Lee JH. Status metilasi
promotor dari gen hMLH1, hMSH2, dan MGMT pada kanker kolorektal yang
berhubungan dengan urutan adenoma-karsinoma . Langenbecks Arch Surg.
2011; 396 (7): 1017–1026. [PubMed: 21706233]
Li F, Mao G, Tong D, Huang J, Gu L, Yang W, Li GM. Tanda histone H3K36me3 mengatur manusia
Perbaikan ketidakcocokan DNA melalui interaksinya dengan MutSalpha.
Sel. 2013; 153 (3): 590–600. [PubMed: 23622243]
Li GM. Wawasan dan tantangan baru dalam perbaikan ketidakcocokan:
mengatasi rintangan kromatin. Perbaikan DNA (Amst). 2014;
19: 48–54. [PubMed: 24767944]
Li GM, Modrich P. Pemulihan perbaikan ketidakcocokan ekstrak inti sel tumor kolorektal H6 oleh a
heterodimer dari homolog MutL manusia. Proc Natl Acad Sci AS A. 1995;
92 (6): 1950–1954. [PubMed: 7892206]
Li S, Kanno S, Watanabe R, Ogiwara H, Kohno T, Watanabe G, Yasui A, Lieber MR.
Polynucleotide kinase dan aprataxin-like forkhead- related protein (PALF)
bertindak baik sebagai endonuklease DNA untai tunggal dan untai tunggal DNA 3
′ eksonuklease dan dapat berpartisipasi dalam ujung DNA bergabung dalam
sistem biokimia. J berbagai Chem. 2011; 286 (42): 36368–36377. [PubMed:
21885877]
Li X, Heyer WD. Rekombinasi homolog dalam perbaikan DNA dan toleransi
kerusakan DNA. Res sel. 2008; 18 (1): 99–113. [PubMed: 18166982]
Lin Y, Dion V, Wilson JH. Transkripsi mendorong kontraksi saluran berulang CAG
dalam sel manusia. Nat Struct Mol berbagai. 2006; 13 (2): 179–180. [PubMed:
16388310]
Lindahl T. DNA glikosilase, endonuklease untuk situs apurinik / apirrimidinik, dan
perbaikan eksisi dasar . Biol Mol Asam Nukleat Prog. 1979;
22: 135–192. [PubMed: 392601]
Lindahl T. Ketidakstabilan dan pembusukan struktur primer DNA. Alam. 1993;
362 (6422): 709–715. [PubMed: 8469282]
Lindahl T, Barnes DE. Perbaikan kerusakan DNA endogen. Cold Spring Harb
Symp Quant Biol. 2000; 65: 127–133. [PubMed: 12760027]
Ling H, Boudsocq F, Plosky BS, Woodgate R, Yang W. Replikasi dimer timin cis-syn
pada resolusi atom. Alam. 2003; 424 (6952): 1083–1087. [PubMed: 12904819]
Liou GY, Storz P. Spesies oksigen reaktif pada kanker. Res Radik Bebas. 2010;
44 (5): 479–496. [PubMed: 20370557]
Lipkin SM, Wang V, Jacoby R, Banerjee-Basu S, Baxevanis AD, Lynch HT, Elliott RM,
Collins FS. MLH3: gen perbaikan ketidakcocokan DNA yang terkait dengan
ketidakstabilan mikrosatelit mamalia. Nat Genet. 2000; 24 (1): 27–35. [PubMed:
10615123]
Liu C, Srihari S, Cao KA, Chenevix-Trench G, Simpson PT, Ragan MA, Khanna KK.
Sebuah skala halus diseksi dari DNA untai ganda mesin istirahat perbaikan
dan implikasinya untuk terapi kanker payudara. Res asam nukleat. 2014;
42 (10): 6106–6127. [PubMed: 24792170]
Liu D, O'Connor MS, Qin J, Songyang Z. Telosome, kompleks terkait telomer
mamalia yang dibentuk oleh beberapa protein telomer. J berbagai Chem.
2004; 279 (49): 51338–51342. [PubMed: 15383534]
Liu G, Chen X. DNA polimerase eta, produk dari gen varian pigmentosum
xeroderma dan target p53, memodulasi pos pemeriksaan kerusakan DNA dan
aktivasi p53. Mol Sel Biol. 2006; 26 (4): 1398–1413. [PubMed: 16449651]
Liu P, Demple B. Perbaikan DNA di mitokondria mamalia: Lebih dari yang kita duga?
Mutagen Lingkungan Mol. 2010; 51 (5): 417–426. [PubMed: 20544882]
Loeb LA, Monnat RJ Jr. DNA polimerase dan penyakit manusia. Nat Rev Genet. 2008;
9 (8): 594–604. [PubMed: 18626473]
Loechler EL. Pelanggaran terhadap prinsip Swain-Scott , dan bukan mekanisme
reaksi SN1 versus SN2, menjelaskan mengapa agen alkilasi karsinogenik dapat
membentuk proporsi aduk yang berbeda pada oksigen versus nitrogen dalam
DNA. Chem Res Toxicol. 1994; 7 (3): 277–280. [PubMed: 8075356]
Loechler EL, CL Hijau, Essigmann JM. Mutagenesis in vivo oleh O6-methylguanine
dibangun menjadi situs unik dalam genom virus. Proc Natl Acad Sci AS A. 1984;
81 (20): 6271–6275. [PubMed: 6093094]
Lomax ME, Folkes LK, O'Neill P. Konsekuensi biologis dari kerusakan DNA
akibat radiasi : relevansi dengan radioterapi. Clin Oncol (R Coll Radiol).
2013; 25 (10): 578–585. [PubMed: 23849504]
Lone S, Townson SA, Uljon SN, Johnson RE, Brahma A, Nair DT, Prakash S, Prakash
L, Aggarwal AK. DNA manusia polimerase kappa melingkari DNA: implikasi
untuk ekstensi mismatch dan bypass lesi. Mol Cell. 2007;
25 (4): 601–614. [PubMed: 17317631]
DT Panjang, Raschle M, Joukov V, Walter JC. Mekanisme perbaikan cross-link DNA
yang bergantung pada RAD51 . Ilmu. 2011; 333 (6038): 84–87. [PubMed:
21719678]
Longhese MP. Respon kerusakan DNA pada telomer fungsional dan disfungsional.
Genes Dev. 2008; 22 (2): 125–140. [PubMed: 18198332]
Lopez C, Ramos L, Bulacio L, Ramadan S, Kandungan Rodriguez F. Aflatoksin B1 pada
pasien dengan penyakit hati. Medicina (B Aires). 2002; 62 (4): 313–316. [PubMed:
12325486]
Tanpa Cinta A. Kemungkinan relevansi alkilasi O-6 deoksiguanosin dengan
mutagenisitas dan karsinogenisitas nitrosamin dan nitrosamida. Alam. 1969;
223 (5202): 206–207. [PubMed: 5791738]
Luch A. Tentang dampak struktur molekul dalam karsinogenesis kimia. EXS. 2009;
99: 151–179. [PubMed: 19157061]
Luczaj W, Skrzydlewska E. Kerusakan DNA yang disebabkan oleh produk
peroksidasi lipid. Sel Mol berbagai Lett. 2003; 8 (2): 391–413. [PubMed:
12813574]
Lukas J, Lukas C, Bartek J. Lebih dari sekedar fokus: Respon kromatin terhadap
kerusakan DNA dan perannya dalam pemeliharaan integritas genom. Nat Sel
Biol. 2011; 13 (10): 1161–1169. [PubMed: 21968989]
Luoto KR, Kumareswaran R, Bristow RG. Tumor hipoksia sebagai pendorong
ketidakstabilan genetik. Genome Integr. 2013; 4 (1): 5. [PubMed: 24152759]
Ma Y, Pannicke U, Schwarz K, Lieber MR. Pembukaan jepit rambut dan pemrosesan
overhang oleh kompleks protein kinase yang bergantung pada Artemis / DNA
dalam penggabungan ujung nonhomolog dan rekombinasi V (D) J. Sel. 2002;
108 (6): 781–794. [PubMed: 11955432]
Mah MC, Maher VM, Thomas H, Reid TM, King CM, McCormick JJ. Mutasi yang
disebabkan oleh aduksi aminofluorene-DNA selama replikasi dalam sel
manusia. Karsinogenesis. 1989; 10 (12): 2321–2328. [PubMed: 2591021]

Malivert L, Ropars V, Nunez M, Drevet P, Miron S, Faure G, Guerois R, Mornon JP,
Revy P, Charbonnier JB, Callebaut I, de Villartay JP. Delineasi wilayah yang
berinteraksi dengan Xrcc4 di domain head globular cernunnos / XLF. J berbagai
Chem. 2010; 285 (34): 26475–26483. [PubMed: 20558749]
Malle E, Furtmuller PG, Sattler W, Obinger C. Myeloperoxidase: target
pengembangan obat baru? Br J Pharmacol. 2007; 152 (6): 838–854. [PubMed:
17592500]
Mamur S, Yuzbasioglu D, Unal F, Yilmaz S. Apakah kalium sorbat menginduksi efek
genotoksik atau mutagenik pada limfosit? Toksikol In Vitro. 2010;
24 (3): 790–794. [PubMed: 20036729]
Marcand S. Bagaimana telomer dan NHEJ hidup berdampingan? Mol Sel Oncol.
2014; 1 (3): e963438. [PubMed: 27308342]
Margison GP, Butt A, Pearson SJ, Wharton S, Watson AJ, Marriott A, Caetano CM,
Hollins JJ, Rukazenkova N, Begum G, Santibanez-Koref MF.
Protein mirip alkiltransferase . Perbaikan DNA (Amst). 2007;
6 (8): 1222–1228. [PubMed: 17500045]
Mari PO, Florea BI, Persengiev SP, Verkaik NS, Bruggenwirth HT, Modesti M,
Giglia-Mari G, Bezstarosti K, Demmers JA, Luider TM, Houtsmuller AB, van Gent
DC. Perakitan dinamis kompleks sambungan -akhir membutuhkan interaksi
antara Ku70 / 80 dan XRCC4. Proc Natl Acad Sci AS A. 2006; 103 (49): 18597–18602.
[PubMed: 17124166]
Marini F, Nardo T, Giannattasio M, Minuzzo M, Stefanini M, Plevani P, Muzi Falconi
M. Sinyal yang bergantung pada perbaikan eksisi nukleotida DNA untuk aktivasi
pos pemeriksaan. Proc Natl Acad Sci AS A. 2006;
103 (46): 17325–17330. [PubMed: 17088560]
Marnett LJ. Kerusakan oksiradikal dan DNA. Karsinogenesis. 2000;
21 (3): 361–370. [PubMed: 10688856]
Marteijn JA, Lans H, Vermeulen W, Hoeijmakers JH. Memahami perbaikan eksisi
nukleotida dan perannya dalam kanker dan penuaan. Nat Rev Mol Sel Berbagai.
2014; 15 (7): 465–481. [PubMed: 24954209]
Marti TM, Hefner E, Feeney L, Natale V, Cleaver JE. Fosforilasi H2AX dalam fase G1
setelah iradiasi UV bergantung pada perbaikan eksisi nukleotida dan bukan
putusnya untai ganda DNA . Proc Natl Acad Sci AS A. 2006; 103 (26): 9891–9896.
[PubMed: 16788066]
Maser RS, DePinho RA. Telomer dan respon kerusakan DNA: mengapa rubah
menjaga kandang ayam. Perbaikan DNA (Amst). 2004;
3 (8–9): 979–988. [PubMed: 15279784]
Masutani C, Sugasawa K, Yanagisawa J, Sonoyama T, Ui M, Enomoto T, Takio K,
Tanaka K, van der Spek PJ, Bootsma D, dkk. Pemurnian dan kloning kompleks
perbaikan eksisi nukleotida yang melibatkan protein grup C xeroderma
pigmentosum dan homolog manusia dari ragi RAD23. EMBO J. 1994;
13 (8): 1831–1843. [PubMed: 8168482]
Pasangan JM, Perez-Gomez C, Nunez de Castro I. Enzim antioksidan dan
penyakit manusia. Clin Biochem. 1999; 32 (8): 595–603. [PubMed:
10638941]
Pasangan JM, enzim Sanchez-Jimenez F. Antioksidan dan implikasinya dalam
proses patofisiologis. Depan Biosci. 1999; 4: D339–345. [PubMed: 10077544]
Mathur MB, Epel E, Jenis S, Desai M, Taman CG, Sandler DP, Khazeni N. Stres
yang dirasakan dan panjang telomer: Tinjauan sistematis, meta-analisis,
dan pertimbangan metodologis untuk memajukan bidang. Brain Behav
Immun. 2016; 54: 158–169. [PubMed: 26853993]
Mazin AV, Mazina OM, Bugreev DV, Rossi MJ. Rad54, motor rekombinasi homolog.
Perbaikan DNA (Amst). 2010; 9 (3): 286–302. [PubMed: 20089461]
McCulloch SD, Kokoska RJ, Kunkel TA. Efisiensi, ketepatan dan peralihan
enzimatik selama sintesis DNA translesion. Siklus sel. 2004;
3 (5): 580–583. [PubMed: 15118407]
McGrath M, Wong JY, Michaud D, Hunter DJ, De Vivo I. Panjang telomer, merokok,
dan risiko kanker kandung kemih pada pria dan wanita. Cancer Epidemiol
Biomarkers Sblm. 2007; 16 (4): 815– 819. [PubMed: 17416776]
McKinnon PJ, Caldecott KW. Perbaikan untai DNA dan penyakit genetik
manusia. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2007; 8: 37–55. [PubMed:
17887919]
Meeker JD, Calafat AM, Hauser R. Konsentrasi bisphenol A urin dalam kaitannya
dengan tiroid serum dan kadar hormon reproduksi pada pria dari klinik
infertilitas. Lingkungan Sci Technol. 2010a; 44 (4): 1458–1463. [PubMed:

20030380]
Meeker JD, Ehrlich S, Toth TL, Wright DL, Calafat AM, Trisini AT, Ye X, Hauser R.
Kualitas semen dan kerusakan DNA sperma dalam kaitannya dengan bisphenol
A urin di antara pria dari klinik infertilitas. Reproduksi Toxicol. 2010b;
30 (4): 532–539. [PubMed: 20656017]
Meeker JD, Yang T, Ye X, Calafat AM, Hauser R. Konsentrasi paraben dan kadar
hormon serum dalam urin, parameter kualitas semen, dan kerusakan DNA
sperma. Perspektif Kesehatan Lingkungan. 2011; 119 (2): 252–257. [PubMed:
20876036]
Meng LH, Liao ZY, Pommier Y. Penghambat topoisomerase I DNA non-camptothecin
dalam terapi kanker. Curr Top Med Chem. 2003; 3 (3): 305–320. [PubMed:
12570765]
Mi J, Kupfer GM. Kompleks inti anemia Fanconi berhubungan dengan kromatin
selama fase S. Darah. 2005; 105 (2): 759–766. [PubMed: 15256425]
Michl J, Zimmer J, Tarsounas M. Interaksi antara anemia Fanconi dan jalur
rekombinasi homolog dalam integritas genom. EMBO J. 2016;
35 (9): 909–923. [PubMed: 27037238]
Mihaylova VT, Bindra RS, Yuan J, Campisi D, Narayanan L, Jensen R, Giordano F,
Johnson RS, Rockwell S, Glazer PM. Penurunan ekspresi gen perbaikan
ketidakcocokan DNA Mlh1 di bawah tekanan hipoksia pada sel mamalia. Mol Sel
Biol. 2003; 23 (9): 3265–3273. [PubMed: 12697826]
Mimitou EP, Symington LS. Ku mencegah reseksi DNA yang bergantung pada Exo1
dan Sgs1 berakhir tanpa adanya kompleks MRX fungsional atau Sae2. EMBO J.
2010; 29 (19): 3358–3369. [PubMed: 20729809]
Minko IG, Harbut MB, Kozekov ID, Kozekova A, Jakobs PM, Olson SB, Moses RE, Harris
TM, Rizzo CJ, Lloyd RS. Peran DNA polymerase kappa dalam pengolahan
cross-link N2-N2-guanine interstrand . J berbagai Chem. 2008;
283 (25): 17075–17082. [PubMed: 18434313]
Misteli T, Soutoglou E. Peran yang muncul dari arsitektur nuklir dalam
perbaikan DNA dan pemeliharaan genom. Nat Rev Mol Sel Berbagai.
2009; 10 (4): 243–254. [PubMed: 19277046]
Mitchell DL, Jen J, Cleaver JE. Induksi relatif cyclobutane dimer dan cytosine
photohydrates dalam DNA yang diradiasi in vitro dan in vivo dengan
sinar ultraviolet-C dan ultraviolet-B . Photochem Photobiol. 1991;
54 (5): 741–746. [PubMed: 1665910]
Mitchell DL, Nairn RS. Biologi fotoproduk (6-4) . Photochem Photobiol. 1989; 49 (6):
805–819. [PubMed: 2672059]
Mocquet V, Laine JP, Riedl T, Yajin Z, Lee MY, Egly JM. Perekrutan berurutan dari
faktor perbaikan selama NER: peran XPG dalam memulai langkah resintesis.
EMBO J. 2008; 27 (1): 155–167. [PubMed: 18079701]
Mohsenzadegan M, Mirshafiey A. Peran imunopatogenik spesies oksigen reaktif pada
penyakit Alzheimer. Iran J Alergi Asma Immunol. 2012;
11 (3): 203–216. [PubMed: 22947905]
Mokarram P, Zamani M, Kavousipour S, Naghibalhossaini F, Irajie C, Moradi Sarabi
M, Hosseini SV. Pola metilasi DNA yang berbeda dari dua daerah promotor
O6-methylguanine-DNA methyltransferase (O6-MGMT) yang berbeda pada
kanker kolorektal. Mol berbagai Rep.2013; 40 (5): 3851–3857. [PubMed:
23271133]
Mollersen L, Rowe AD, Illuzzi JL, Hildrestrand GA, Gerhold KJ, Tveteras L,
Bjolgerud A, Wilson DM 3rd, Bjoras M, Klungland A. Neil1 adalah pengubah
genetik dari ketidakstabilan berulang trinukleotida CAG somatik dan
germline pada tikus R6 / 1. Hum Mol Genet. 2012;
21 (22): 4939–4947. [PubMed: 22914735]
Mortusewicz O, Rothbauer U, Cardoso MC, Leonhardt H. Perekrutan diferensial DNA
Ligase I dan III ke lokasi perbaikan DNA. Res asam nukleat. 2006;
34 (12): 3523–3532. [PubMed: 16855289]
Moser J, Kool H, Giakzidis I, Caldecott K, Mullenders LH, Fousteri MI. Penyegelan
lubang DNA kromosom selama perbaikan eksisi nukleotida membutuhkan
XRCC1 dan DNA ligase III alfa dengan cara khusus siklus sel . Mol Cell. 2007;
27 (2): 311–323. [PubMed: 17643379]
Moyer R, Briley D, Johnsen A, Stewart U, Shaw BR. Echinomycin, agen
bis-intercalating , menginduksi mutasi C -> T melalui deaminasi sitosin. Mutat
Res. 1993; 288 (2): 291–300. [PubMed: 7688090]
Mu D, Bessho T, Nechev LV, Chen DJ, Harris TM, Hearst JE, Sancar A. DNA interstrand
cross-link menginduksi sintesis perbaikan yang sia-sia dalam ekstrak sel
mamalia. Mol Sel Biol. 2000; 20 (7): 2446–2454. [PubMed: 10713168]

Mu H, Kropachev K, Wang L, Zhang L, Kolbanovskiy A, Kolbanovskiy M, Geacintov
NE, Broyde S. Perbaikan eksisi nukleotida dari 2-acetylaminofluorene- dan
2-aminofluorene- (C8) -guanine adducts: simulasi dinamika molekuler
menjelaskan bagaimana lesi efisiensi perbaikan dampak konteks struktur dan
urutan dasar. Res asam nukleat. 2012; 40 (19): 9675–9690. [PubMed: 22904073]
Murphy DL, Donigan KA, Jaeger J, Sweasy JB. Varian tumor usus besar E288K dari
DNA polimerase beta adalah mutator spesifik urutan. Biokimia. 2012;
51 (26): 5269–5275. [PubMed: 22650412]
Nabel CS, Manning SA, Kohli RM. Biologi kimiawi sitosin yang aneh: deaminasi,
metilasi, dan oksidasi sebagai modulator potensi genom. ACS Chem berbagai.
2012; 7 (1): 20– 30. [PubMed: 22004246]
Naegeli, H. Struktur DNA: Ketidakstabilan yang melekat dan reaksi genom. Peloncat; 1997.
Nakamura H, Tanimoto K, Hiyama K, Yunokawa M, Kawamoto T, Kato Y, Yoshiga K,
Poellinger L, Hiyama E, Nishiyama M. Gen perbaikan ketidakcocokan manusia,
MLH1, secara transkripsi ditekan oleh faktor transkripsi yang diinduksi hipoksia
, DEC1 dan DEC2. Onkogen. 2008; 27 (30): 4200– 4209. [PubMed: 18345027]
Nelles JL, Hu WY, Prins GS. Tindakan estrogen dan kanker prostat. Ahli Rev
Endocrinol Metab. 2011; 6 (3): 437–451. [PubMed: 21765856]
Neuteling T, Lambert CA, Nusgens BV, Colige AC. Efek guncangan dingin ringan
(25 derajat C) diikuti dengan pemanasan pada 37 derajat C pada respons
stres seluler. PLoS One. 2013; 8 (7): e69687. [PubMed: 23936078]
Nguyen TV, Riou L, Aoufouchi S, kekurangan Rosselli F. Fanca mengurangi
transisi A / T dalam hipermutasi somatik dan mengubah persimpangan
rekombinasi sakelar kelas dalam sel B tikus. J Exp Med. 2014;
211 (6): 1011–1018. [PubMed: 24799500]
Nick McElhinny SA, CM Snowden, McCarville J, Ramsden DA. Ku merekrut
kompleks XRCC4-ligase IV ke ujung DNA. Mol Sel Biol. 2000;
20 (9): 2996–3003. [PubMed: 10757784]
Nicolaides NC, Papadopoulos N, Liu B, Wei YF, Carter KC, Ruben SM, Rosen CA,
Haseltine WA, Fleischmann RD, Fraser CM, dkk. Mutasi dua homolog PMS
pada kanker kolon nonpolyposis herediter. Alam. 1994;
371 (6492): 75–80. [PubMed: 8072530]
Niedernhofer LJ. Penanda signalosome anemia Fanconi. Mol Cell. 2007;
25 (4): 487–490. [PubMed: 17317622]
Nimonkar AV, Genschel J, Kinoshita E, Polaczek P, Campbell JL, Wyman C, Modrich P,
Kowalczykowski SC. BLM-DNA2-RPA-MRN dan EXO1-BLM-RPA-MRN merupakan
dua mesin reseksi ujung DNA untuk perbaikan kerusakan DNA manusia. Genes
Dev. 2011; 25 (4): 350–362. [PubMed: 21325134]
Nishi R, Okuda Y, Watanabe E, Mori T, Iwai S, Masutani C, Sugasawa K, Hanaoka
F. Centrin 2 merangsang perbaikan eksisi nukleotida dengan berinteraksi
dengan protein xeroderma pigmentosum grup C. Mol Sel Biol. 2005;
25 (13): 5664–5674. [PubMed: 15964821]
Nutter LM, Ngo EO, Abul-Hajj YJ. Karakterisasi kerusakan DNA yang diinduksi
oleh 3,4-estrone-o- quinone dalam sel manusia. J berbagai Chem. 1991;
266 (25): 16380–16386. [PubMed: 1653233]
Nutter LM, Wu YY, Ngo EO, Sierra EE, Gutierrez PL, Abul-Hajj YJ. Sebuah o-kuinon
bentuk estrogen menghasilkan radikal bebas pada sel kanker payudara
manusia: korelasi dengan kerusakan DNA. Chem Res Toxicol. 1994;
7 (1): 23–28. [PubMed: 8155821]
O'Connor TR, Boiteux S, Laval J. Sisa 7-methylguanine yang terbuka cincin dalam DNA adalah blok untuk
sintesis DNA vitro. Res asam nukleat. 1988; 16 (13): 5879–5894. [PubMed: 3399381]
O'Driscoll M, Macpherson P, Xu YZ, Karran P. Sitotoksisitas karboksimetilasi DNA
dan metilasi oleh model agen karboksimetilasi azaserine dalam sel manusia.
Karsinogenesis. 1999; 20 (9): 1855–1862. [PubMed: 10469634]
Obe G, Johannes C, Schulte-Frohlinde D. DNA double-strand break yang diinduksi oleh
radiasi ionisasi yang jarang dan endonuklease sebagai lesi kritis untuk kematian
sel, penyimpangan kromosom, mutasi dan transformasi onkogenik. Mutagenesis.
1992; 7 (1): 3–12. [PubMed: 1321942]
ID Odell, Wallace SS, Pederson DS. Aturan keterlibatan untuk perbaikan eksisi dasar
dalam kromatin. J Sel Physiol. 2013; 228 (2): 258–266. [PubMed: 22718094]
Ogi T, Lehmann AR. The Y-keluarga DNA polimerase kappa (pol kappa) fungsi
dalam mamalia nukleotida-eksisi perbaikan. Nat Sel Biol. 2006;
8 (6): 640–642. [PubMed: 16738703]
Ogi T, Limsirichaikul S, Overmeer RM, Volker M, Takenaka K, Cloney R, Nakazawa Y,
Niimi A, Miki Y, Jaspers NG, Mullenders LH, Yamashita S, Fousteri MI, Lehmann
AR. Tiga polimerase DNA, direkrut oleh mekanisme yang berbeda, melakukan
sintesis perbaikan NER dalam sel manusia. Mol Cell. 2010;
37 (5): 714–727. [PubMed: 20227374]
Oishi S. Pengaruh butil paraben pada sistem reproduksi jantan pada tikus. Arch
Toxicol. 2002; 76 (7): 423–429. [PubMed: 12111007]
Omar Desoukya ND, Zhoub Guangming. Efek tertarget dan tidak tertarget dari
radiasi pengion. Jurnal Penelitian Radiasi dan Ilmu Terapan. 2015;
8 (2): 247–254.
Pace P, Mosedale G, Hodskinson MR, Rosado IV, Sivasubramaniam M, Patel KJ. Ku70
merusak perbaikan DNA tanpa adanya jalur anemia Fanconi. Ilmu. 2010;
329 (5988): 219–223. [PubMed: 20538911]
Halaman V, Fuchs RP. Bagaimana lesi DNA diubah menjadi mutasi di dalam sel?
Onkogen. 2002; 21 (58): 8957–8966. [PubMed: 12483512]
Pandir D. Kerusakan DNA pada sel germinal manusia yang terpapar
beberapa bahan tambahan makanan secara in vitro. Sitoteknologi.
2016; 68 (4): 725–733. [PubMed: 25501537]
Protein Pang D, Yoo S, Dynan WS, Jung M, Dritschilo A. Ku bergabung dengan
fragmen DNA seperti yang ditunjukkan oleh mikroskop gaya atom. Res
kanker. 1997; 57 (8): 1412–1415. [PubMed: 9108436]
Panier S, Boulton SJ. Perbaikan kerusakan untai ganda : 53BP1 menjadi fokus. Nat
Rev Mol Sel Berbagai. 2014; 15 (1): 7–18. [PubMed: 24326623]
Papadopoulos N, Nicolaides NC, Wei YF, Ruben SM, Carter KC, Rosen CA, Haseltine
WA, Fleischmann RD, Fraser CM, Adams MD, dkk. Mutasi mutL homolog pada
kanker usus besar herediter. Ilmu. 1994; 263 (5153): 1625–1629. [PubMed:
8128251]
Pavanello S, Pesatori AC, Dioni L, Hoxha M, Bollati V, Siwinska E, Mielzynska D,
Bolognesi C, Bertazzi PA, Baccarelli A. Panjang telomer yang lebih pendek
dalam limfosit darah tepi pekerja yang terpapar hidrokarbon aromatik
polisiklik. Karsinogenesis. 2010; 31 (2): 216–221. [PubMed: 19892797]
Pavlov YI, Shcherbakova PV, Rogozin IB. Peran DNA polimerase dalam replikasi,
perbaikan, dan rekombinasi pada eukariota. Int Rev Cytol. 2006;
255: 41–132. [PubMed: 17178465]
Puncak MJ, Puncak JG. Tautan silang DNA-ke-protein dan patah tulang punggung yang
disebabkan oleh ultraviolet jauh dan dekat, dan radiasi cahaya tampak pada sel
mamalia. Dasar Kehidupan Sci. 1986; 38: 193–202. [PubMed: 3741331]
Pegg AE. Peran multifaset dari alkyltransferase dan protein terkait dalam
perbaikan DNA, kerusakan DNA, ketahanan terhadap kemoterapi, dan alat
penelitian. Chem Res Toxicol. 2011; 24 (5): 618–639. [PubMed: 21466232]
Peltomaki P. Perbaikan ketidakcocokan DNA dan kanker. Mutat Res. 2001; 488 (1): 77–85. [PubMed:
11223406]
Penning TM, Burczynski ME, Hung CF, McCoull KD, Palackal NT, Tsuruda LS.
Dehidrogenase dihidrodiol dan aktivasi hidrokarbon aromatik polisiklik:
pembentukan o-kuinon aktif reaktif dan redoks . Chem Res Toxicol. 1999;
12 (1): 1–18. [PubMed: 9894013]
Perrone S, Lotti F, Geronzi U, Guidoni E, Longini M, Buonocore G. Stres Oksidatif pada
Penyakit Genetik Rawan Kanker pada Usia Anak: Peran Disfungsi Mitokondria.
Oksid Med Sel Panjang Umur. 2016; 2016: 4782426. [PubMed: 27239251]
Perry JJ, Yannone SM, Holden LG, Hitomi C, Asaithamby A, Han S, Cooper PK, Chen DJ,
Tainer JA. Struktur eksonuklease WRN dan mekanisme molekuler menyiratkan
peran pengeditan dalam pemrosesan akhir DNA. Nat Struct Mol berbagai. 2006;
13 (5): 414–422. [PubMed: 16622405]
Pfeifer GP, You YH, Besaratinia A. Mutasi yang disebabkan oleh sinar ultraviolet.
Mutat Res. 2005; 571 (1–2): 19–31. [PubMed: 15748635]
Pfeiffer P, Goedecke W, Obe G. Mekanisme perbaikan kerusakan untai ganda DNA
dan potensinya untuk menginduksi penyimpangan kromosom. Mutagenesis.
2000; 15 (4): 289–302. [PubMed: 10887207]
Phillips DH. Lima puluh tahun benzo (a) pyrene. Alam. 1983; 303 (5917): 468–472. [PubMed: 6304528]
Plastaras JP, Riggins JN, Otteneder M, Marnett LJ. Reaktivitas dan mutagenisitas agen
oksopropenilasi DNA endogen: propena basa, malondialdehida, dan
N (epsilon) -oxopropenyllysine. Chem Res Toxicol. 2000;

13 (12): 1235–1242. [PubMed: 11123964]
Polo SE, Jackson SP. Dinamika protein respon kerusakan DNA pada kerusakan DNA:
fokus pada modifikasi protein. Genes Dev. 2011; 25 (5): 409–433. [PubMed:
21363960]
Pommier Y, Barcelo JM, Rao VA, Sordet O, Jobson AG, Thibaut L, Miao ZH, Seiler JA,
Zhang H, Marchand C, Agama K, Nitiss JL, Redon C.Perbaikan kerusakan DNA
yang dimediasi oleh topoisomerase I. Biol Mol Asam Nukleat Prog. 2006;
81: 179–229. [PubMed: 16891172]
Pommier Y, Cherfils J. Penghambatan interfasial interaksi makromolekul:
paradigma alam untuk penemuan obat. Tren Pharmacol Sci. 2005;
26 (3): 138–145. [PubMed: 15749159]
Pommier Y, Marchand C. Penghambat interfasial interaksi asam nukleat protein .
Agen Curr Med Chem Antikanker. 2005; 5 (4): 421–429. [PubMed: 16101492]
Potenski CJ, Klein HL. Bagaimana kesalahan penggabungan ribonukleotida ke
dalam DNA genom dapat berbahaya dan membantu sel. Res asam nukleat.
2014; 42 (16): 10226–10234. [PubMed: 25159610]
Pourquier P, Pommier Y. Kerusakan DNA yang dimediasi oleh topoisomerase I. Res
Kanker Adv. 2001; 80: 189– 216. [PubMed: 11034544]
Pozo FM, Oda T, Sekimoto T, Murakumo Y, Masutani C, Hanaoka F, Yamashita T.
Pendamping molekuler Hsp90 mengatur mutagenesis yang dimediasi REV1 .
Mol Sel Biol. 2011; 31 (16): 3396– 3409. [PubMed: 21690293]
Prakash A, Perbaikan Eksisi Pangkalan Doublie S. di Mitokondria. J Cell Biochem.
2015; 116 (8): 1490– 1499. [PubMed: 25754732]
Preston BD, Penyanyi B, Loeb LA. Potensi mutagenik O4-methylthymine in vivo
ditentukan dengan pendekatan enzimatik untuk mutagenesis spesifik lokasi .
Proc Natl Acad Sci AS A. 1986; 83 (22): 8501– 8505. [PubMed: 3464967]
Preston BD, Penyanyi B, Loeb LA. Perbandingan mutagenicities relatif situs
O-alkylthymines- secara khusus dimasukkan ke dalam DNA phi X174. J
berbagai Chem. 1987; 262 (28): 13821–13827. [PubMed: 2958453]
Harga A. Perbaikan kerusakan DNA akibat radiasi pengion . Biol Kanker Semin. 1993;
4 (2): 61–71. [PubMed: 8513149]
Harga BD, D'Andrea AD. Pemodelan ulang kromatin pada putus untai ganda DNA .
Sel. 2013; 152 (6): 1344–1354. [PubMed: 23498941]
Pustovalova Y, Magalhaes MT, D'Souza S, Rizzo AA, Korza G, Walker GC, Korzhnev
DM. Interaksi antara Domain C-Terminal Rev1 dan Subunit PolD3 Polzeta
Menyarankan Mekanisme Pertukaran Polimerase pada Sintesis Translesion
Tergantung Rev1 / Polzeta . Biokimia. 2016; 55 (13): 2043–2053. [PubMed:
26982350]
Qiu R, Sakato M, Sacho EJ, Wilkins H, Zhang X, Modrich P, Hingorani MM, Erie DA,
Weninger KR. MutL menjebak MutS pada ketidakcocokan DNA. Proc Natl Acad
Sci AS A. 2015; 112 (35): 10914–10919. [PubMed: 26283381]
Quinet A, Martins DJ, Vessoni AT, Biard D, Sarasin A, Stary A, Menck CF. Mekanisme
sintesis translesion bergantung pada sifat kerusakan DNA pada sel manusia
yang terkena radiasi UV . Res asam nukleat. 2016; 44 (12): 5717–5731. [PubMed:
27095204]
RS. Kerusakan dan perbaikan kromosom. New York: Pers Pleno; 1981.
Ramadan K, Shevelev IV, Maga G, Hubscher U. De novo Sintesis DNA oleh DNA
polymerase lambda manusia, DNA polimerase mu dan terminal
deoxyribonucleotidyl transferase. J Mol berbagai. 2004;
339 (2): 395–404. [PubMed: 15136041]
RamaKrishna NV, Devanesan PD, Rogan EG, Cavalieri EL, Jeong H, Jankowiak R,
Small GJ. Mekanisme aktivasi metabolik karsinogen kuat
7,12-dimethylbenz [a] antrasen. Chem Res Toxicol. 1992;
5 (2): 220–226. [PubMed: 1643251]
Raschle M, Knipscheer P, Enoiu M, Angelov T, Sun J, Griffith JD, Ellenberger TE,
Scharer OD, Walter JC. Mekanisme replikasi-kopling DNA interstrand
perbaikan crosslink. Sel. 2008; 134 (6): 969–980. [PubMed: 18805090]
Rass U, Compton SA, Matos J, Singleton MR, Ip SC, Blanco MG, Griffith JD, SC Barat.
Mekanisme resolusi persimpangan Holliday oleh protein GEN1 manusia. Genes
Dev. 2010; 24 (14): 1559-1569. [PubMed: 20634321]

RP Rastogi, Richa, Kumar A, Tyagi MB, Sinha RP. Mekanisme molekuler dari
kerusakan dan perbaikan DNA akibat radiasi ultraviolet. J Asam Nukleat. 2010;
2010: 592980. [PubMed: 21209706]
Ravanat JL, Cadet J, Douki T. Lesi DNA yang dihasilkan secara oksidatif sebagai
biomarker potensial dari stres oksidatif in vivo. Curr Mol Med. 2012;
12 (6): 655–671. [PubMed: 22292434]
Renaud E, Barascu A, Rosselli F. Gangguan asetilasi H4K16 yang dimediasi TIP60
menyebabkan akumulasi kromatin menyimpang dari 53BP1 dan RAP80
dalam sel yang kekurangan jalur anemia Fanconi . Res asam nukleat. 2016;
44 (2): 648–656. [PubMed: 26446986]
Reuter S, Gupta SC, Chaturvedi MM, Aggarwal BB. Stres oksidatif, peradangan, dan
kanker: bagaimana kaitannya? Radic Bebas Berbagai Med. 2010;
49 (11): 1603–1616. [PubMed: 20840865]
Reynolds JJ, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements P, McKinnon PJ, Caldecott KW. Ligasi
DNA yang rusak selama perbaikan kerusakan untai tunggal patch pendek
pada ataksia okulomotor apraxia 1. Mol Cell Biol. 2009;
29 (5): 1354–1362. [PubMed: 19103743]
Reynolds P, Cooper S, Lomax M, O'Neill P. Gangguan fungsi PARP1 menghambat
perbaikan eksisi basa dari sub-set lesi DNA. Res asam nukleat. 2015;
43 (8): 4028–4038. [PubMed: 25813046]
Riley PA. Radikal bebas dalam biologi: stres oksidatif dan efek radiasi pengion.
Berbagai Radiat Int J. 1994; 65 (1): 27–33. [PubMed: 7905906]
Roberts SA, Strande N, Burkhalter MD, Strom C, Havener JM, Hasty P, Ramsden DA.
Ku adalah fase 5 ′ - dRP / AP yang mengekspos kerusakan nukleotida di dekat
ujung yang putus. Alam. 2010; 464 (7292): 1214– 1217. [PubMed: 20383123]
Rochette PJ, Therrien JP, Drouin R, Perdiz D, Bastien N, Drobetsky EA, Sage E.
UVA yang diinduksi cyclobutane pyrimidine dimer terbentuk terutama di
timin-timin dipyrimidin dan berkorelasi dengan spektrum mutasi pada sel
hewan pengerat. Res asam nukleat. 2003; 31 (11): 2786– 2794. [PubMed:
12771205]
Rogakou EP, Pilch DR, Orr AH, Ivanova VS, Bonner WM. DNA double-stranded
break menginduksi histon H2AX fosforilasi pada serine 139. J Biol Chem.
1998; 273 (10): 5858–5868. [PubMed: 9488723]
Rogan EG, Devanesan PD, RamaKrishna NV, Higginbotham S, Padmavathi NS,
Chapman K, Cavalieri EL, Jeong H, Jankowiak R, Small GJ. Identifikasi dan
kuantisasi aduk benzo [a] pyrene-DNA yang terbentuk pada kulit tikus. Chem Res
Toxicol. 1993; 6 (3): 356–363. [PubMed: 7686408]
Rothkamm K, Kruger I, Thompson LH, Lobrich M. Pathways of DNA double-strand
break repair selama siklus sel mamalia. Mol Sel Biol. 2003;
23 (16): 5706–5715. [PubMed: 12897142]
Rothwell PJ, Waksman G. Struktur dan mekanisme polimerase DNA. Adv Protein
Chem. 2005; 71: 401–440. [PubMed: 16230118]
Rydberg B, Lindahl T. Metilasi nonenzymatic DNA oleh donor kelompok metil
intraseluler S -adenosil-L-metionin adalah reaksi yang berpotensi mutagenik.
EMBO J. 1982; 1 (2): 211–216. [PubMed: 7188181]
Saberi A, Hochegger H, Szuts D, Lan L, Yasui A, Sale JE, Taniguchi Y, Murakawa Y, Zeng
W, Yokomori K, Helleday T, Teraoka H, Arakawa H, Buerstedde JM, Takeda S.
RAD18 dan poli (ADP -ribosa) polimerase secara independen menekan akses
ujung nonhomolog yang bergabung ke putus untai ganda dan memfasilitasi
perbaikan yang dimediasi rekombinasi homolog . Mol Sel Biol. 2007;
27 (7): 2562–2571. [PubMed: 17242200]
Sachadyn P. Konservasi dan keanekaragaman protein MutS. Mutat Res. 2010;
694 (1–2): 20–30. [PubMed: 20833188]
Saffhill R. Kesalahan pengkodean in vitro alkylthymines dengan DNA dan RNA
polimerase. Chem Biol Berinteraksi. 1985; 53 (1–2): 121–130. [PubMed: 2581714]
Sakumi K, Sekiguchi M. Struktur dan fungsi DNA glikosilase. Mutat Res. 1990;
236 (2–3): 161–172. [PubMed: 2204824]
Sale JE. Sintesis DNA translesion dan mutagenesis pada eukariota. Berbagai
Perspektif Cold Spring Harb. 2013; 5 (3): a012708. [PubMed: 23457261]
Sale JE, Batters C, Edmunds CE, Phillips LG, Simpson LJ, Szuts D. Pengaturan waktu
penting: pengisian celah rawan kesalahan dan sintesis translesion dalam
hipermutasi gen imunoglobulin. Philos Trans R Soc Lond B berbagai Sci. 2009;
364 (1517): 595–603. [PubMed: 19008194]
Perbaikan eksisi DNA Sancar A. Annu Rev Biochem. 1996; 65: 43–81. [PubMed: 8811174]
Sanchez-Pulido L, Andrade-Navarro MA. Kode gen FTO (massa lemak dan terkait
obesitas) untuk anggota baru dari superfamili dioksigenase non-heme . BMC
Biochem. 2007; 8:23. [PubMed: 17996046]
Scharer OD. Perbaikan eksisi nukleotida pada eukariota. Berbagai Perspektif
Cold Spring Harb. 2013; 5 (10): a012609. [PubMed: 24086042]
Schoket B. Kerusakan DNA pada manusia yang terpapar hidrokarbon polisiklik
aromatik lingkungan dan makanan. Mutat Res. 1999;
424 (1–2): 143–153. [PubMed: 10064857]
Schwertman P, Lagarou A, Dekkers DH, Raams A, van der Hoek AC, Laffeber C, Hoeijmakers
JH, Demmers JA, Fousteri M, Vermeulen W, Marteijn JA. Protein sindrom sensitif UV
UVSSA merekrut USP7 untuk mengatur perbaikan yang
digabungkan dengan transkripsi . Nat Genet. 2012; 44 (5): 598–602.
[PubMed: 22466611]
Scrima A, Konickova R, Czyzewski BK, Kawasaki Y, Jeffrey PD, Groisman R, Nakatani
Y, Iwai S, Pavletich NP, Thoma NH. Dasar struktural pengenalan kerusakan DNA
UV oleh kompleks DDB1-DDB2 . Sel. 2008; 135 (7): 1213–1223. [PubMed:
19109893]
Sebesta M, Burkovics P, Juhasz S, Zhang S, Szabo JE, Lee MY, Haracska L, Krejci L.
Peran PCNA dan TLS polimerase dalam ekstensi D-loop selama rekombinasi
homolog pada manusia. Perbaikan DNA (Amst). 2013; 12 (9): 691–698. [PubMed:
23731732]
Segal AW. Bagaimana neutrofil membunuh mikroba. Annu Rev Immunol.
2005; 23: 197–223. [PubMed: 15771570]
Sekimoto T, Oda T, Pozo FM, Murakumo Y, Masutani C, Hanaoka F, Yamashita T.
Pendamping molekuler Hsp90 mengatur akumulasi DNA polimerase eta di
lokasi replikasi yang terhenti dalam sel yang diiradiasi UV . Mol Cell. 2010;
37 (1): 79–89. [PubMed: 20129057]
Shachar S, Ziv O, Avkin S, Adar S, Wittschieben J, Reissner T, Chaney S, Friedberg EC,
Wang Z, Carell T, Geacintov N, Livneh Z. Mekanisme dua polimerase menentukan
DNA translesion yang bebas kesalahan dan rawan kesalahan sintesis pada
mamalia. EMBO J. 2009; 28 (4): 383–393. [PubMed: 19153606]
Shammas MA. Telomer, gaya hidup, kanker, dan penuaan. Curr Opin Clin Nutr
Metab Care. 2011; 14 (1): 28–34. [PubMed: 21102320]
Shay JW, Zou Y, Hiyama E, Wright WE. Telomerase dan kanker. Hum Mol Genet.
2001; 10 (7): 677– 685. [PubMed: 11257099]
Shibutani S, Suzuki N, Tan X, Johnson F, Grollman AP. Pengaruh konteks urutan
mengapit pada mutagenisitas DNA adduct turunan acetylaminofluorene dalam
sel mamalia. Biokimia. 2001; 40 (12): 3717–3722. [PubMed: 11297440]
Simon NM, Smoller JW, McNamara KL, Maser RS, Zalta AK, Pollack MH, Nierenberg
AA, Fava M, Wong KK. Pemendekan telomer dan gangguan mood: dukungan
awal untuk model stres kronis dari penuaan yang dipercepat. Biol Psikiatri.
2006; 60 (5): 432–435. [PubMed: 16581033]
Singer B. O-alkyl pyrimidines dalam mutagenesis dan karsinogenesis: kejadian dan
signifikansi. Res kanker. 1986; 46 (10): 4879–4885. [PubMed: 3530434]
Penyanyi B, Chavez F, Goodman MF, Essigmann JM, Dosanjh MK. Pengaruh 3 '
tetangga mengapit pada kinetika pemasangan dCTP atau dTTP berlawanan
dengan O6-metilguanin dalam oligonukleotida prima yang ditentukan ketika
Escherichia coli DNA polimerase I digunakan. Proc Natl Acad Sci AS A. 1989;
86 (21): 8271–8274. [PubMed: 2682644]
Penyanyi B, Kusmierek JT. Mutagenesis kimiawi. Annu Rev Biochem. 1982;
51: 655–693. [PubMed: 7051963]
Skipper PL, Kim MY, Sun HL, Wogan GN, Tannenbaum SR. Amina aromatik monosiklik
sebagai karsinogen manusia potensial: lama adalah baru lagi. Karsinogenesis.
2010; 31 (1): 50–58. [PubMed: 19887514]
Smeaton MB, Hlavin EM, McGregor Mason T, Noronha AM, Wilds CJ, Miller PS.
Unhooking interstrand cross-link bergantung pada distorsi pada ekstrak sel
mamalia. Biokimia. 2008; 47 (37): 9920–9930. [PubMed: 18702509]
Smela ME, Currier SS, Bailey EA, Essigmann JM. Kimia dan biologi aflatoksin B (1):
dari spektrometri mutasi hingga karsinogenesis. Karsinogenesis. 2001;
22 (4): 535–545. [PubMed: 11285186]

Smogorzewska A, Matsuoka S, Vinciguerra P, McDonald ER ke-3, Hurov KE, Luo J,
Ballif BA, Gygi SP, Hofmann K, D'Andrea AD, Elledge SJ. Identifikasi protein
FANCI, paralog FANCD2 monoubiquitinated diperlukan untuk perbaikan DNA.
Sel. 2007; 129 (2): 289–301. [PubMed: 17412408]
Lagu Z, von Figura G, Liu Y, Kraus JM, Torrice C, Dillon P, Rudolph-Watabe M, Ju Z,
Kestler HA, Sanoff H, Lenhard Rudolph K. Dampak gaya hidup pada ekspresi
biomarker kerusakan DNA terkait penuaan dan disfungsi telomer dalam darah
manusia. Penuaan Sel. 2010; 9 (4): 607–615. [PubMed: 20560902]
Soutoglou E, Dorn JF, Sengupta K, Jasin M, Nussenzweig A, Ried T, Danuser G, Misteli
T. Stabilitas posisi putus untai ganda tunggal dalam sel mamalia. Nat Sel Biol.
2007; 9 (6): 675–682. [PubMed: 17486118]
Staker BL, Hjerrild K, Feese MD, Behnke CA, Burgin AB Jr, Stewart L. Mekanisme
keracunan topoisomerase I oleh analog camptothecin. Proc Natl Acad Sci AS A.
2002; 99 (24): 15387–15392. [PubMed: 12426403]
Starcevic D, Dalal S, Sweasy JB. Apakah ada hubungan antara DNA polimerase
beta dan kanker? Siklus sel. 2004; 3 (8): 998–1001. [PubMed: 15280658]
Stewart L, Redinbo MR, Qiu X, Hol WG, Champoux JJ. Sebuah model untuk
mekanisme topoisomerase I. Sains manusia. 1998;
279 (5356): 1534–1541. [PubMed: 9488652]
Stracker TH, Petrini JH. Kompleks MRE11: mulai dari ujung. Nat Rev Mol Sel
Berbagai. 2011; 12 (2): 90–103. [PubMed: 21252998]
Strniste GF, Martinez E, Martinez AM, Rem RJ. Reaksi benzo (a) pyrene yang
diinduksi foto dengan DNA in vitro. Res kanker. 1980;
40 (2): 245–252. [PubMed: 7356507]
Sugimura T. Mutagen masa lalu, sekarang, dan masa depan dalam makanan yang
dimasak. Perspektif Kesehatan Lingkungan. 1986; 67: 5–10. [PubMed:
3530738]
Sun Y, Jiang X, Chen S, Fernandes N, Harga BD. Peran histon asetiltransferase Tip60
dalam asetilasi dan aktivasi ATM. Proc Natl Acad Sci AS A. 2005;
102 (37): 13182–13187. [PubMed: 16141325]
Mirip D, Goellner EM, Almeida KH, Sobol RW. Perbaikan eksisi dasar dan
subpathways yang bergantung pada lesi untuk perbaikan kerusakan DNA
oksidatif. Sinyal Redoks Antioksidan. 2011; 14 (12): 2491– 2507. [PubMed:
20649466]
Sweasy JB, Lauper JM, Eckert KA. Polimerase DNA dan penyakit manusia. Res radiasi.
2006; 166 (5): 693–714. [PubMed: 17067213]
Takai H, Smogorzewska A, de Lange T. Kerusakan DNA fokus pada telomer yang
tidak berfungsi. Curr Biol. 2003; 13 (17): 1549–1556. [PubMed: 12956959]
Tian F, Tong TJ, Zhang ZY, McNutt MA, Liu XW. Penurunan regulasi yang bergantung
pada usia dari mitokondria 8-oksoguanin DNA glikosilase di otak tikus
SAM-P / 8 dan efeknya pada penuaan otak. Res peremajaan. 2009;
12 (3): 209–215. [PubMed: 19594329]
Tomida J, Itaya A, Shigechi T, Unno J, Uchida E, Ikura M, Masuda Y, Matsuda S, Adachi
J, Kobayashi M, Meetei AR, Maehara Y, Yamamoto K, Kamiya K, Matsuura A,
Matsuda T, Ikura T , Ishiai M, Takata M. Sebuah interaksi baru antara kompleks
inti anemia Fanconi dan ATR-ATRIP kinase selama perbaikan DNA cross-link . Res
asam nukleat. 2013; 41 (14): 6930–6941. [PubMed: 23723247]
Tricker AR, Preussmann R. Karsinogenik N-nitrosamin dalam makanan:
kejadian, pembentukan, mekanisme dan potensi karsinogenik. Mutat Res.
1991; 259 (3–4): 277–289. [PubMed: 2017213]
Trincao J, Johnson RE, Escalante CR, Prakash S, Prakash L, Aggarwal AK. Struktur inti
katalitik DNA polimerase S. cerevisiae eta: implikasi untuk sintesis DNA
translesion. Mol Cell. 2001; 8 (2): 417–426. [PubMed: 11545743]
Tropp, BE. Biologi molekuler, Dari gen menjadi protein. 4. Pembelajaran Jones & Bartlett; 2011. hal. 1100
Trusina A. Pemendekan telomer akibat stres: umur lebih panjang dengan mutasi
lebih sedikit? BMC Syst Berbagai. 2014; 8:27. [PubMed: 24580844]

Tubbs JL, Latypov V, Kanugula S, Butt A, Melikishvili M, Kraehenbuehl R, Fleck O,

Marriott A, Watson AJ, Verbeek B, McGown G, Thorncroft M, Santibanez-Koref
MF, Millington C, Arvai AS, Kroeger MD, Peterson LA, Williams DM, MG
Goreng, Margison GP, Pegg AE, Tainer JA. Pembalikan kerusakan DNA
teralkilasi menjembatani perbaikan dasar dan eksisi nukleotida. Alam. 2009;
459 (7248): 808–813. [PubMed: 19516334]
Tubbs JL, Pegg AE, Tainer JA. Pengikatan DNA, pembalikan nukleotida, dan
motif heliks-putar-heliks dalam perbaikan basa oleh
alkyltransferase O6-alkylguanine-DNA dan implikasinya terhadap kemoterapi
kanker. Perbaikan DNA (Amst). 2007; 6 (8): 1100–1115. [PubMed: 17485252]
Tudek B, Boiteux S, Laval J. Sifat biologis N7-methylguanine yang dibuka cincin
imidazol dalam DNA fag M13mp18. Res asam nukleat. 1992;
20 (12): 3079–3084. [PubMed: 1620605]
Umar A, Buermeyer AB, Simon JA, Thomas DC, Clark AB, Liskay RM, Kunkel TA.
Persyaratan untuk PCNA dalam perbaikan ketidakcocokan DNA pada langkah
sebelum resintesis DNA. Sel. 1996; 87 (1): 65–73. [PubMed: 8858149]
Valdes AM, Andrew T, Gardner JP, Kimura M, Oelsner E, Cherkas LF, Aviv A, Spector
TD. Obesitas, merokok, dan panjang telomer pada wanita. Lanset. 2005;
366 (9486): 662–664. [PubMed: 16112303]
van Attikum H, Gasser SM. Kode histon di DNA rusak: panduan untuk
memperbaiki? Nat Rev Mol Sel Berbagai. 2005; 6 (10): 757–765. [PubMed:
16167054]
VanderVeen LA, Hashim MF, Nechev LV, Harris TM, Harris CM, Marnett LJ. Evaluasi
potensi mutagenik dari DNA adduct utama akrolein. J berbagai Chem. 2001; 276
(12): 9066– 9070. [PubMed: 11106660]
Varghese AJ. Fotokimia asam nukleat dan konstituennya. Fotofisiologi. 1972; (7): 207–
274. [PubMed: 4618356]
Vermeulen W, Fousteri M. Perbaikan eksisi dengan transkripsi mamalia .
Berbagai Perspektif Cold Spring Harb. 2013; 5 (8): a012625. [PubMed:
23906714]
Vertessy BG, Toth J. Menjaga urasil keluar dari DNA: peran fisiologis, struktur dan
mekanisme katalitik dUTPases. Acc Chem Res. 2009; 42 (1): 97–106. [PubMed:
18837522]
Vignard J, Mirey G, Salles B. Radiasi pengion yang diinduksi DNA untai ganda
putus: penerangan langsung dan tidak langsung. Radiother Oncol. 2013;
108 (3): 362–369. [PubMed: 23849169]
Viguera E, Canceill D, Ehrlich SD. Slip replikasi melibatkan jeda dan disosiasi
DNA polimerase. EMBO J. 2001; 20 (10): 2587–2595. [PubMed: 11350948]
Visconti R, Grieco D. Wawasan baru tentang stres oksidatif pada kanker. Curr Opin
Drug Discov Devel. 2009; 12 (2): 240–245.
Volker M, Mone MJ, Karmakar P, van Hoffen A, Schul W, Vermeulen W, Hoeijmakers
JH, van Driel R, van Zeeland AA, Mullenders LH. Perakitan berurutan dari
faktor perbaikan eksisi nukleotida in vivo. Mol Cell. 2001;
8 (1): 213–224. [PubMed: 11511374]
Vooradi V, Romano LJ. Pengaruh Aduk N-2-acetylaminofluorene dan
2-aminofluorene pada pengikatan DNA dan sintesis oleh ragi DNA polimerase
eta. Biokimia. 2009; 48 (19): 4209–4216. [PubMed: 19354292]
Wakasugi M, Kawashima A, Morioka H, Linn S, Sancar A, Mori T, Nikaido O,
Matsunaga T. DDB terakumulasi di lokasi kerusakan DNA segera setelah
penyinaran UV dan secara langsung merangsang perbaikan eksisi nukleotida. J
berbagai Chem. 2002; 277 (3): 1637–1640. [PubMed: 11705987]
Wang AT, Sengerova B, Cattell E, Inagawa T, Hartley JM, Kiakos K, Burgess-Brown NA,
Swift LP, Enzlin JH, Schofield CJ, Gileadi O, Hartley JA, McHugh PJ. SNM1A
manusia dan XPF-ERCC1 bekerja sama untuk memulai perbaikan cross-link
DNA interstrand . Genes Dev. 2011; 25 (17): 1859–1870. [PubMed: 21896658]
Wang JC. Peran seluler topoisomerase DNA: perspektif molekuler. Nat Rev Mol Sel
Berbagai. 2002; 3 (6): 430–440. [PubMed: 12042765]
Wang L, Patel U, Ghosh L, Banerjee S. DNA polimerase mutasi beta pada kanker
kolorektal manusia. Res kanker. 1992; 52 (17): 4824–4827. [PubMed: 1511447]
Wang W. Saklar utama untuk jalur respons kerusakan DNA anemia Fanconi . Nat
Struct Mol berbagai. 2008; 15 (11): 1128–1130. [PubMed: 18985065]
Wang X, Kennedy RD, Ray K, Stuckert P, Ellenberger T, D'Andrea AD.

Fosforilasi FANCE yang dimediasi Chk1 diperlukan untuk jalur anemia Fanconi
enulis
/ BRCA. Mol Sel Biol. 2007a; 27 (8): 3098–3108. [PubMed: 17296736]

Wang Y, Woodgate R, McManus TP, Mead S, McCormick JJ, Maher VM. Bukti bahwa
dalam sel varian pigmentosum xeroderma, yang kekurangan DNA polimerase
eta, DNA polimerase iota menyebabkan frekuensi yang sangat tinggi dan
spektrum unik dari mutasi yang diinduksi oleh UV . Res kanker. 2007b; 67 (7):
3018–3026. [PubMed: 17409408]
Wardman P. Pentingnya kimia radiasi terhadap radiasi dan biologi radikal bebas
(The 2008 Silvanus Thompson Memorial Lecture). Br J Radiol. 2009;
82 (974): 89–104. [PubMed: 19168690]
Washington MT, Johnson RE, Prakash L, Prakash S. Human DINB1-encoded DNA
polymerase kappa adalah extender promiscuous dari termini primer yang salah
pasangan. Proc Natl Acad Sci AS A. 2002; 99 (4): 1910–1914. [PubMed: 11842189]
Waters LS, Walker GC. Translesi mutagenik DNA polimerase Rev1 sangat
diekspresikan selama fase G (2) / M daripada fase S. Proc Natl Acad Sci AS A.
2006; 103 (24): 8971–8976. [PubMed: 16751278]
Waters TR, Swann PF. Kinetika aksi glikosilase DNA timin. J berbagai Chem.
1998; 273 (32): 20007–20014. [PubMed: 9685338]
Weterings E, Chen DJ. Kisah tanpa
akhir tentang penggabungan akhir non-homolog . Res sel. 2008; 18 (1): 114–
124. [PubMed: 18166980]
Wiebauer K, Jiricny J. Mismatch spesifik DNA timin glikosilase dan DNA polimerase
beta menengahi koreksi kesalahan GT dalam ekstrak nuklir dari sel manusia.
Proc Natl Acad Sci AS A. 1990; 87 (15): 5842–5845. [PubMed: 2116008]
Winterbourn CC. Merekonsiliasi kimia dan biologi spesies oksigen reaktif. Nat Chem
berbagai. 2008; 4 (5): 278–286. [PubMed: 18421291]
Wojtaszek J, Lee CJ, D'Souza S, Minesinger B, Kim H, D'Andrea AD, Walker GC, Zhou
P.Basis struktural perakitan yang dimediasi Rev1 dari kompleks polimerase
translesion vertebrata kuartener yang terdiri dari Rev1, heterodimeric
polimerase (Pol ) zeta, dan Pol kappa. J berbagai Chem. 2012a;
287 (40): 33836–33846. [PubMed: 22859295]
Wojtaszek J, Liu J, D'Souza S, Wang S, Xue Y, Walker GC, Zhou P. Pengakuan multifaset
vertebrata Rev1 oleh translesion polymerases zeta dan kappa. J berbagai Chem.
2012b; 287 (31): 26400– 26408. [PubMed: 22700975]
Wolters S, Schumacher B. Pemeliharaan genom dan integritas transkripsi dalam
penuaan dan penyakit. Genet Depan. 2013; 4:19. [PubMed: 23443494]
Wyatt MD, Pittman DL. Agen metilasi dan respons perbaikan DNA: Basa termetilasi
dan sumber putus untai. Chem Res Toxicol. 2006; 19 (12): 1580–1594. [PubMed:
17173371]
Xie A, Hartlerode A, Stucki M, Odate S, Puget N, Kwok A, Nagaraju G, Yan C, Alt FW,
Chen J, Jackson SP, Scully R. Peran berbeda dari protein terkait kromatin MDC1
dan 53BP1 pada mamalia ganda- untai perbaikan istirahat. Mol Cell. 2007;
28 (6): 1045–1057. [PubMed: 18158901]
Xie K, Doles J, Hemann MT, Walker GC. Sintesis translesion rawan kesalahan
menengahi kemoresistensi yang diperoleh. Proc Natl Acad Sci AS A. 2010;
107 (48): 20792–20797. [PubMed: 21068378]
Xu D, Guo R, Sobeck A, Bachrati CZ, Yang J, Enomoto T, Brown GW, Hoatlin ME,
Hickson ID, Wang W. RMI, kompleks OB-lipat baru yang penting untuk
protein sindrom Bloom untuk menjaga stabilitas genom. Genes Dev. 2008;
22 (20): 2843–2855. [PubMed: 18923082]
Xu X, Xie K, Zhang XQ, Pridgen EM, Park GY, Cui DS, Shi J, Wu J, Kantoff PW, Lippard
SJ, Langer R, Walker GC, Farokhzad OC. Meningkatkan respon sel tumor
terhadap kemoterapi melalui pengiriman kode yang dimediasi oleh nanopartikel
dari siRNA dan prodrug cisplatin. Proc Natl Acad Sci AS A. 2013;
110 (46): 18638–18643. [PubMed: 24167294]
Yager JD, Davidson NE. Karsinogenesis estrogen pada kanker payudara. N Engl J
Med. 2006; 354 (3): 270– 282. [PubMed: 16421368]
Yamada A, Masutani C, Iwai S, Hanaoka F. Komplementasi sintesis translesion yang
rusak dan sensitivitas sinar UV pada sel varian pigmentosum xeroderma oleh
DNA polimerase eta manusia dan tikus. Res asam nukleat. 2000;
28 (13): 2473–2480. [PubMed: 10871396]

Yamanaka K, Minko IG, Takata K, Kolbanovskiy A, ID Kozekov, Kayu RD, Rizzo CJ,
Lloyd RS. Fungsi enzimatik baru DNA polimerase nu dalam translesion
sintesis DNA melewati alur utama DNA-peptida dan ikatan silang DNA-DNA
. Chem Res Toxicol. 2010; 23 (3): 689–695. [PubMed: 20102227]
Yan Z, Delannoy M, Ling C, Daee D, Osman F, Muniandy PA, Shen X, Oostra AB, Du H,
Steltenpool J, Lin T, Schuster B, Decaillet C, Stasiak A, Stasiak AZ, Stone S, Hoatlin
ME , Schindler D, Woodcock CL, Joenje H, Sen R, de Winter JP, Li L, Seidman MM,
Whitby MC, Myung K, Constantinou A, Wang W. Kompleks lipatan histon dan
FANCM membentuk kompleks pemodelan ulang DNA yang dilestarikan untuk
menjaga stabilitas genom. Mol Cell. 2010; 37 (6): 865–878. [PubMed: 20347428]
Yano K, Chen DJ. Pencitraan sel hidup XLF dan XRCC4 mengungkapkan pandangan baru tentang perakitan
protein di
yang non-homolog akhir bergabung jalur. Siklus sel. 2008;
7 (10): 1321–1325. [PubMed: 18418068]
Yano K, Morotomi-Yano K, Wang SY, Uematsu N, Lee KJ, Asaithamby A, Weterings E,
Chen DJ. Ku merekrut XLF untuk mematahkan untai ganda DNA . EMBO Rep.2008;
9 (1): 91–96. [PubMed: 18064046]
Ye N, Holmquist GP, O'Connor TR. Perbaikan heterogen N-metilpurin di tingkat
nukleotida dalam sel manusia normal. J Mol berbagai. 1998;
284 (2): 269–285. [PubMed: 9813117]
Yi C, He C. Perbaikan DNA dengan membalikkan kerusakan DNA. Berbagai
Perspektif Cold Spring Harb. 2013; 5 (1): a012575. [PubMed: 23284047]
Yilmaz S, Unal F, Yuzbasioglu D, Celik M. Kerusakan DNA pada limfosit manusia yang
terpapar empat aditif makanan secara in vitro. Toxicol Ind Kesehatan. 2014;
30 (10): 926–937. [PubMed: 23188648]
Yokoi M, Masutani C, Maekawa T, Sugasawa K, Ohkuma Y, Hanaoka F. Kompleks
protein xeroderma pigmentosum grup C XPC-HR23B memainkan peran penting
dalam perekrutan faktor transkripsi IIH ke DNA yang rusak. J berbagai Chem.
2000; 275 (13): 9870–9875. [PubMed: 10734143]
Yonekura S, Nakamura N, Yonei S, Zhang-Akiyama QM. Generasi, konsekuensi
biologis dan mekanisme perbaikan deaminasi sitosin dalam DNA. J Radiat Res.
2009; 50 (1): 19–26. [PubMed: 18987436]
Yoo S, Dynan WS. Geometri kompleks yang dibentuk oleh protein perbaikan
pemecahan untai ganda pada ujung DNA tunggal: perekrutan DNA-PKcs
menginduksi translokasi ke dalam protein Ku. Res asam nukleat. 1999;
27 (24): 4679–4686. [PubMed: 10572166]
Anda YH, Szabo PE, Pfeifer GP. Dimer pirimidin siklobutan terbentuk secara
istimewa di hotspot mutasi p53 utama pada tumor kulit tikus yang
diinduksi UVB . Karsinogenesis. 2000; 21 (11): 2113– 2117. [PubMed: 11062176]
Yu H. Hidrokarbon polisiklik aromatik karsinogenik lingkungan: fotokimia dan
fototoksisitas. J Environ Sci Health C Karsinog Lingkungan Ecotoxicol Rev.2002;
20 (2): 149–183. [PubMed: 12515673]
Yu X, Fu S, Lai M, Baer R, Chen J. BRCA1 ubiquitinates di mana-mana mitra
pengikat yang bergantung pada fosforilasi CtIP. Genes Dev. 2006;
20 (13): 1721–1726. [PubMed: 16818604]
Yu Y, Yang J, Zhu F, Xu F. Respon promotor REV3 terhadap
N-methyl-N ′ -nitro-N-nitrosoguanidine. Mutat Res. 2004;
550 (1–2): 49–58. [PubMed: 15135640]
Yuan F, Gu L, Guo S, Wang C, Li GM. Bukti keterlibatan protein HMGB1 dalam
perbaikan ketidakcocokan DNA manusia. J berbagai Chem. 2004;
279 (20): 20935–20940. [PubMed: 15014079]
Yuji Masuda, FH., Masutani, Chikahide. Jalur Sintesis DNA Translesion dan Toleransi
Kerusakan. Hanaoka, FKS., Editor. Jepang: Springer; 2016.
Yurkow EJ, Laskin JD. Mekanisme kerja psoralens: analisis isobologram
mengungkapkan bahwa potensiasi sinar ultraviolet dari aksi psoralen bukanlah
aditif tetapi sinergis. Farmakol Kemoterapi Kanker. 1991;
27 (4): 315–319. [PubMed: 1998988]
Zak P, Kleibl K, Laval F.Perbaikan O6-methylguanine dan O4-methylthymine oleh manusia dan tikus
O6-methylguanine-DNA methyltransferases. J berbagai Chem. 1994;
269 (1): 730–733. [PubMed: 8276875]
Zengin N, Yuzbasioglu D, Unal F, Yilmaz S, Aksoy H. Evaluasi genotoksisitas dua
pengawet makanan: natrium benzoat dan kalium benzoat. Makanan Chem
Toxicol. 2011; 49 (4): 763– 769. [PubMed: 21130826]
Zhang F, Fan Q, Ren K, Andreassen PR. PALB2 secara fungsional menghubungkan

protein kerentanan kanker payudara BRCA1 dan BRCA2. Mol Kanker Res. 2009;
ulis
7 (7): 1110–1118. [PubMed: 19584259]
Zhang Y, Yuan F, Presnell SR, Tian K, Gao Y, Tomkinson AE, Gu L, Li GM.
Rekonstitusi perbaikan ketidakcocokan manusia yang diarahkan pada 5 '
dalam sistem yang dimurnikan. Sel. 2005; 122 (5): 693–705. [PubMed:
16143102]
Zhao C, Tyndyk M, Eide I, Hemminki K. Aduk DNA endogen dan latar belakang
dengan agen metilasi dan 2-hidroksietilasi . Mutat Res. 1999;
424 (1–2): 117–125. [PubMed: 10064855]
Zhao J, Jain A, Iyer RR, Modrich PL, Vasquez KM. Perbaikan ketidakcocokan dan
protein perbaikan eksisi nukleotida bekerja sama dalam pengenalan ikatan
silang antar DNA. Res asam nukleat. 2009; 37 (13): 4420–4429. [PubMed:
19468048]
Zhou T, Lee JW, Tatavarthi H, Lupski JR, Valerie K, Povirk LF. Kekurangan dalam
pemrosesan 3 ' -fosfoglikolat dalam sel manusia dengan mutasi turun-temurun
pada tirosil-DNA fosfodiesterase (TDP1). Res asam nukleat. 2005;
33 (1): 289–297. [PubMed: 15647511]
Zhou W, Doetsch PW. Pengaruh situs abasic dan DNA untai tunggal putus pada
polimerase RNA prokariotik. Proc Natl Acad Sci AS A. 1993;
90 (14): 6601–6605. [PubMed: 8341674]
Zhu F, Yang J, Xu F, Yu YN. Kloning dan bioinformatika wilayah promotor gen REV3
manusia dan responsnya terhadap karsinogen
N-metil-N ′ -nitro-N-nitrosoguanidine. Zhejiang Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban. 2003;
32 (5): 393–397. [PubMed: 14610737]
Zhu H, Fan Y, Jiang H, Shen J, Qi H, Mei R, Shao J. Respon dari promotor iota DNA
polimerase manusia untuk N-methyl-N ′ -nitro-N-nitrosoguanidine. Farmakol
Toksikol Lingkungan. 2010; 29 (1): 79– 86. [PubMed: 21787586]
Zhu H, Fan Y, Shen J, Qi H, Shao J. Karakterisasi promotor kappa DNA polimerase
sebagai respons terhadap benzo [a] pyrene diol epoxide. Farmakol Toksikol
Lingkungan. 2012; 33 (2): 205–211. [PubMed: 22227292]
Zhu Q, Wani AA. Modifikasi histon: elemen penting untuk respons kerusakan
dan restorasi kromatin. J Sel Physiol. 2010; 223 (2): 283–288. [PubMed:
20112283]
Ziv O, Geacintov N, Nakajima S, Yasui A, Livneh Z. DNA polimerase zeta bekerja sama
dengan polimerase kappa dan iota dalam translesion DNA sintesis di fotodimer
pirimidin dalam sel dari pasien XPV. Proc Natl Acad Sci AS A. 2009;
106 (28): 11552–11557. [PubMed: 19564618]
Zou L, Elledge SJ. Merasakan kerusakan DNA melalui pengenalan ATRIP
kompleks RPA-ssDNA . Ilmu. 2003; 300 (5625): 1542–1548. [PubMed:
12791985]

Naskah Penulis
Gambar 1.
Lesi dasar DNA yang umum. A) Struktur normal basa DNA: adenin (A), guanin (G),
sitosin (C) dan timin (T). B) Basa terdeaminasi: hipoksantin, xantin, urasil, dan
timin yang timbul dari deaminasi basa eksosiklik adenin, guanin, sitosin, dan 5
metil sitosin (5-mC) masing-masing. C) Basa DNA teroksidasi: turunan
formamidopyrimidine dari adenin (Fapy-A), 7,8 dihydro-8-oxoguanine
(8-oxo-G) dan timin glikol. D) Basa DNA yang dimetilasi :
N3-metiladenin, N7-metilguanin, O 6- metilguanin, N3- metilsitosin,
O 4- metilitimin, O 4 -etilitimin dan N3- metilitimin .

Gambar 2.
Lesi utama DNA yang diinduksi radiasi UV . A) Representatif cyclobutane
pyrimidine dimer (CPD). Tampil di sini adalah dimer timin cyclobutane. B)
Pirimidin representatif (6
- 4) produk foto pirimidon [(6 - 4) PP]. Ditunjukkan di sini adalah turunan dari
dua basa timin yang dihubungkan melalui C6 dari satu basa timin dan C4 dari
basa timin lainnya.

Gambar 3.
Struktur agen perusak DNA yang representatif. A) Agen alkilasi: methyl
methanesulfonate (MMS), ethyl methanesulfonate (EMS), N-methyl
-N ′ –nitro-N- nitrosoguanidine (MNNG) dan methylnitrosourea (MNU). B) Agen
pengikat silang: Cyclophosphamide, cisplatin dan psoralen. C) Amina
aromatik: 2-aminofluorene (AF) dan N-acetyl-2-aminofluorene (AAF). D)
Hidrokarbon aromatik polisiklik: benzo ( a ) pyrene dan dibenzo [ a, l ] pyrene.
E) Elektrofil reaktif: 4-nitroquinoline 1-oxide (4-NQO). F) Racun: Afaltoksin B1.

nulis
Gambar 4.
Skema berbagai jalur perbaikan DNA yang diinduksi kerusakan DNA. Berbagai
agen perusak DNA dapat menyebabkan kerusakan DNA, yang menjadi substrat
untuk jalur perbaikan DNA tertentu. Panel atas menunjukkan perwakilan agen
perusak DNA: kesalahan dari replikasi, deaminasi basa spontan, agen alkilasi,
racun, agen oksidatif, radiasi pengion, radiasi UV, agen pengikat silang,
senyawa aromatik dan agen lingkungan seperti panas, dingin dan hipoksia.
Panel tengah mewakili berbagai jenis DNA yang rusak: ketidaksesuaian basa
(C: T), urasil akibat deaminasi sitosin, situs abasic dari hilangnya basa dari satu
untai DNA, metilasi guanin, adenin termetilasi, lesi 8-okso-G , glikol timin, untai
tunggal putus, untai ganda putus, dimer timin intrastrand cyclobutane dan
ikatan silang guanin interstrand. Panel bawah mencantumkan jalur perbaikan
DNA spesifik yang dihasut untuk memperbaiki kerusakan DNA: perbaikan
ketidakcocokan memperbaiki kesalahan replikasi dan ketidakcocokan dasar
lainnya; perbaikan eksisi dasar menghilangkan adduktus basa, urasil, situs
abasik dan lesi oksidatif; jalur perbaikan kerusakan untai tunggal
memperbaiki kerusakan untai tunggal di tulang punggung DNA; double strand
break repair pathway repair double strand break; perbaikan eksisi nukleotida
menghilangkan lesi besar dan intrastrand
tautan silang; Perbaikan crosslink interstrand menghilangkan hubungan

interstrand dan sintesis translesion melewati crosslinks intrastrand dan lesi
besar.
Tabel 1
Menunjukkan polimerase DNA manusia yang representatif. BER (perbaikan eksisi dasar),
MMR (perbaikan ketidakcocokan), NER (perbaikan eksisi nukleotida), DSBR (perbaikan putus
untai ganda), dCTP (deoxycytidine phosphate), FA (anemia fanconi), TLS (sintesis
translesion), SHM (hipermutasi somatin) ), ICL (tautan silang interstrand), dRP
(deoxyribosephosphate), TdT (Terminal deoxynucleotidyl transferase), RT (reverse
transcriptase), AEP ( primase archaeo -eukariotik ).
Polimerase Keluarga Tingkat kesalahan Fungsi

α ( POLA ) B 10 -4 - 10 -5 Primase RNA selama replikasi; peran dalam pos pemeriksaan fase-S.
β ( POLB ) X 5 X 10 −4 Lyase dRP dan AP; peran dalam BER
δ ( POLD ) B 10 −5 - 10 −6 Memiliki aktivitas exonuclease 3 ′ -5 ′ ; peran dalam replikasi; peran tambahan dalam BER,
DSBR, NER

ε ( POLE ) B 10 -6 - 10 -7 Memiliki aktivitas exonuclease 3 ′ -5 ′ ; peran dalam replikasi; peran tambahan BER, MMR,
DSBR, NER dan pos pemeriksaan fase S.

REV1 ( REV1 ) Y Menggabungkan hanya dCTP Menggabungkan hanya dCTP dan memediasi interaksi protein-protein selama TLS; peran d
FA, HR

ζ ( REV3 ) B 10 −3 Peran di TLS, DSBR, FA dan SHM

η ( POLH ) Y 3,5 X 10 −2 Peran dalam TLS, SHM, BER
ι ( POLI ) Y 10 -1 - 10 -4 Peran dalam TLS, SHM, BER
κ ( POLK ) Y 10 −2 - 10 −3 Peran dalam TLS dan NER
θ ( POLQ ) SEBUAH 2,4 X 10 −3 Memiliki motif helicase; Perbaikan ICL
γ ( POLG ) SEBUAH 10 −5 Memiliki aktivitas exonuclease 3 ′ -5 ′ ; peran dalam replikasi mitokondria; BER
λ ( POLL ) X 1,5 X 10 −4 Lyase dRP; peran dalam rekombinasi V (D) J, NHEJ dan BER
μ ( POLM ) X 10 −3 - 10 −5 Sebuah transferase terminal; peran dalam rekombinasi V (D) J dan NHEJ
Naskah Penulis
ν ( POLN ) SEBUAH 3,5 X 10 −3 Mungkin TLS

σ ( POLS ) X tidak diketahui Memiliki aktivitas exonuclease 3 ′ -5 ′ ; peran dalam pertukaran kromatid saudara

Tdt X tidak diketahui Rekombinasi V (D) J, template sintesis independen

Telomerase RT 2 X 10 −3 Mereplikasi ujung kromosom

PrimPol AEP tidak diketahui Translesion polymerase dengan efisiensi tinggi


Nihms862014 Indonesian

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Judul Asli

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

Nihms862014 Indonesian

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

Akses Publik HHS

Diterbitkan dalam bentuk akhir yang diedit sebagai:

Mekanisme kerusakan DNA, perbaikan dan mutagenesis

(MMR), rekombinasi homolog (HR) dan penggabungan ujung

memungkinkan sel untuk memperbaiki kerusakan DNA. Beberapa lesi spesiﬁk

Tidak mengherankan, pada banyak kanker, perbaikan DNA, toleransi

Jenis kerusakan DNA

Kerusakan DNA endogen

Setiap kali sel manusia bereplikasi, sekitar 3 X 10 9 basa disalin oleh

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 3

sintesis DNA kesetiaan merupakan konsekuensi dari atribut struktural dan

biokimia dari polimerase DNA replikatif, yang memastikan penyisipan

Namun demikian, substitusi basa dan kesalahan penyisipan dan penghapusan

Deaminasi basa spontan

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 4

untai tunggal transien selama replikasi aktif, transkripsi dan rekombinasi

Paradoksnya, deaminasi sitosin juga merupakan rute normal untuk

Kerusakan DNA oksidatif

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 5

dan mempengaruhi respons pertahanan penting untuk menyerang patogen

Spesies ROS yang paling mencolok adalah radikal superoksida (• O 2 - ),

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 6

Penyakit Wilson dan hemochromatosis [Carmichael et al., 1995; Luczaj dan

menghasilkan hingga 4000 N7- methylguanine, 600 N3-methyladenine dan

Kerusakan DNA eksogen

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 7

mempotensiasi pembentukan radikal bebas reaktif DNA lainnya oleh IR

Selain menyebabkan lesi basa, radiasi pengion juga menyebabkan putusnya

ujung 3 ′ fosfat atau 3 ′ -fosfoglikolat daripada 3 ′ -OH berakhir. Selain itu,

berujung pada kerusakan berkerumun atau celah untai tunggal [Henner et

Radiasi ultraviolet (UV)

Radiasi UV yang memancar dari matahari merupakan penyebab utama kanker

Studi laboratorium telah menunjukkan bahwa UV-C merusak DNA terutama

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 8

B, saat kembali ke struktur PP konvensional (6 - 4) saat terkena sinar UV-C

perbaikan atau tidak dilewati, hal itu menyebabkan sitotoksisitas.

UV-C banyak digunakan dalam penyelidikan laboratorium karena penyerapan

Agen kimia eksogen

Agen alkilasi yang paling umum digunakan di laboratorium, termasuk methyl

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 9

methylguanine, yang salah pasangan dengan T dan menyebabkan mutasi G:

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 10

Hidrokarbon aromatik polisiklik (PAH)

Hidrokarbon aromatik polisiklik adalah senyawa karbon dengan dua atau

Contoh PAH yang menonjol adalah naftalen, antrasen, pirena, 1-hidroksipiren,

Elektroﬁl reaktif lainnya

Senyawa penting terakhir kami adalah hormon estrogen, yang sering

Mutagen Lingkungan Mol . Naskah penulis; tersedia di PMC 2018 1 Juni.

Chatterjee dan Walker Halaman 11

Kompleks enzim P-450 1BI, secara konstitutif diekspresikan dalam payudara

menghasilkan estrogen katekol reaktif, yang teroksidasi menjadi semiquinon

Racun alami merupakan kelas senyawa genotoksik dan karsinogenik, yang

dari sereal yang terkontaminasi, minyak sayur, rempah-rempah, kacang

berdifusi pasif ke dalam sel, aﬂatoksin B1 (Gambar 3F) dimetabolisme oleh

Produk biologis penggunaan sehari-hari lainnya semakin dikaitkan dengan