LAPORAN LENGKAP PRAKTIKUM

“MIKROBIOLOGI PERTANIAN”

OLEH :

FATKUR RAHMAN
NIM. D1B1 18 077

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI

FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS HALU OLEO
KENDARI
2019
 LAPORAN LENGKAP PRAKTIKUM
“MIKROBIOLOGI PERTANIAN’’

Diajukan sebagai Salah Satu Syarat untuk Mengikuti Ujian Pratikum Mata
Kuliah Mikrobiologi Pertanian

OLEH :

FATKUR RAHMAN
D1B1 18 077

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI

FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS HALU OLEO
KENDARI
2019

ii
 LEMBAR PENGESAHAN

Judul : Laporan Lengkap Praktikum Mikrobiologi Pertanian

Nama : Fatkur Rahman
Stanbuk : D1B1 18 077
Kelas : AGT-D
Jurusan : Agroteknologi
Fakultas : Pertanian

Telah Diperiksa dan Disetujui Oleh:

Kendari, Desember 2019

Asisten Praktikum:

1. Muh. Fadlan Tamrin (……………)

2. Saripa Ni’ma (…………..)

3. Jumardi (…………...)

4. Muh. Abdil Insani Farli (…………..)

5. Sukma Ayu (…………..)

6. Nur Avanti (…………..)

Mengetahui,

Dosen Koordinator Mata Kuliah Koordinator Asisten Prartikum

Mikrobiologi Pertanian Mikrobiologi Pertanian

Prof. Dr. Ir.Gusti Ayu Kade Sutariati, M. Si Vit Neru Satrah, S.P., M.P.
NIP. 19690606 199303 2 001 NIDN. 8806280018
Tanggal Pengesahan: …/Desember/2019

iii
 KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Allah SWT. yang telah melimpahkan rahmat dan

hidayah-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan laporan lengkap praktikum

Mikrobiologi Pertanian. Penulisan laporan lengkap ini dilakukan untuk memenuhi

salah satu syarat mengikuti ujian praktikum Mikrobiologi Pertanian.

Penulis mengucapkan banyak terima kasih atas bantuan dari pihak yang

telah berkontribusi dengan memberikan sumbangan baik materi maupun moril.

Khususnya penulis mengucapkan banyak terima kasih kepada kedua orang tua

yang selalu memberikan motivasi dan doa, tidak lupa penulis mengucapkan terima

kasih kepada kakak asisten yang telah banyak memberikan sumbangan saran,

kritik dan waktu dalam penyusunan laporan ini sehingga penulis dapat

menyelesaikannya tepat waktu.

Penulis menyadari masih ada kekurangan baik dari segi susunan kalimat

maupun isi laporan, oleh karena itu penulis mengharapkan saran dan kritik yang

sifatnya membagun dari setiap pembaca demi kesempurnaan laporan ini.

Kendari, Desember 2019

Penyusun

iv
 RIWAYAT HIDUP

 FATKUR RAHMAN (D1B118077)  dilahirkan di  

Kota Baubau,  Kecamatan     Murhum, Provinsi Sulawesi

Tenggara pada hari Selasa, 08 Oktober 2000. Anak ke-3

(tiga) dari tiga besaudara dari pasangan Bapak Ismiyono

Widodo dan Ibu Karni Karto, Alamat Jalan Al-Muhajirin

No.10F, Kecamatan Muruhum, Provinsi Sulawesi

Tenggara. Penulis lulus pendidikan Sekolah Dasar pada tahun 2012 di SD Negeri

2 Lamangga, dinyatakan lulus dari pendidikan Sekolah Menengah Pertama  di

SMP Negeri 4 Baubau dan pada tahun 2015 dan menyelesaikan pendidikan

Sekolah Menengah Atas pada tahun 2018 di SMA Negeri 2 Baubau. Dari jenjang

pendidikan sekolah dasar hingga jenjang pendidikan Sekolah Menengah Atas

penulis juga aktif dalam beberapa oragnisasi baik intra maupun ekstra yang dapat

mengubah setiap detik hidup penulis diantaranya yaitu OSIS, PRAMUKA, PMR

dan juga Sanggar Seni. Penulis kemudian melanjutkan pendidikan di Universitas

Halu Oleo dan terdaftar sebagai mahasiswa yang lulus melalui jalur SBMPTN

pada jurusan Agroteknologi Fakultas Pertanian Universitas Halu Oleo, Kendari

pada tahun 2018 dan sampai saat ini penulis masih aktif dalam proses

perkuliahan.

Selama penulis melanjutkan pendidikannya di Universitas Halu Oleo,

penulis memiliki beberapa pengalaman yang baru seperti memiliki teman-teman

baru yang berasal dari beberapa suku dan budaya yang menjadi satu dalam ikatan

jurusan Agroteknologi.

v
 UCAPAN TERIMA KASIH

Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT, karena atas Rahmat dan

Hidayah-Nya jualah maka penulis dapat menyelesaikan laporan ini. Seiring

dengan selesainya laporan ini, penulis mengucapkan terima kasih dan

penghormatan kepada asisten praktikum yang telah banyak meluangkan waktunya

dalam membimbing penulis selama penyusunan laporan ini. Terima kasih penulis

tujukan kepada kedua orang tua atas perhatian dan doanya kepada penulis.

Ucapan terima kasih juga penulis tujukan kepada:

1. Prof. Dr. Ir.Gusti Ayu Kade Sutariati, M. Si selaku dosen penanggung jawab

Mata Kuliah Mikrobiologi Pertanian.

2. Vit Neru Satrah, S.P., M.P. selaku Koordinator Praktikum Mata Kuliah Dasar-

Dasar Agronomi serta pihak-pihak lain yang telah membantu yang tidak dapat

penulis sebutkan satu per satu.

Akhirnya penulis berharap semoga Allah Subhanahu Wata’ala senantiasa

memberikan imbalan yang berlipat ganda kepada semua pihak yang telah

membantu dan semoga laporan ini dapat bermanfaat bagi banyak pihak. Penulis

juga menyadari masih banyak kelemahan dalam laporan ini sehingga penulis

mengharapkan saran dan kritik dari pembaca demi kesempurnaan laporan ini di

masa mendatang.

Kendari, Desember 2019

Penulis

vi
 DAFTAR ISI

HALAMAN JUDUL......................................................................................... i
HALAMAN SAMPUL......................................................................................ii
HALAMAN PENGESAHAN...........................................................................iii
KATA PENGANTAR.......................................................................................iv
RIWAYAT HIDUP...........................................................................................v
UCAPAN TERIMA KASIH.............................................................................vi
DAFTAR ISI .....................................................................................................vii
DAFTAR TABEL..............................................................................................viii
DAFTAR GAMBAR.........................................................................................ix
I. Pengenalan Alat-Alat Laboratorium………………………………… 1
II. Pengenalan dan Pemakaian Mikroskop……………………………… 15
III. Persiapan Media dan Sterilisasi……………………………………… 31
IV. Keanekaragaman Mikroorganisme (Bakteri)...................................... 42
V. Teknik Biakan Murni........................................................................... 51
VI. Pengecetan Gram dan Pengujian KOH pada Bakteri........................... 65
VII. Morfologi Mikroba Selain Bakteri…………………………………… 56
VIII.    Mikroorganisme bermanfaat Bagi Pertanian…………………………  76
DAFTAR PUSTAKA........................................................................................
LAMPIRAN.......................................................................................................

vii
 DAFTAR TABEL

Tabel 1.1 Pengenalan Alat-Alat Laboratorium...................................................

Tabel 2.1 Pengenalan dan Pemakaian Mikroskop..............................................
Tabel 3.1 Persiapan Media dan Sterilisasi..........................................................
Tabel 4.1 Keanekaragaman Mikroorganisme (Bakteri)......................................
Tabel 5.1 Teknik Biakan Murni..........................................................................
Tabel 6.1 Pengecetan Gram dan Pengujian KOH pada Bakteri..........................
Tabel 7.1 Morfologi Mikroba Selain Bakteri......................................................
Tabel 8.1 Mikroorganisme bermanfaat Bagi Pertanian......................................

viii
 DAFTAR GAMBAR

1. Gambar 1 Pengenalan Alat-Alat Laboratorium..............................................

2. Gambar 2 Pengenalan dan Pemakaian Mikroskop..........................................
3. Gambar 3 Persiapan Media dan Sterilisasi......................................................
4. Gambar 4 Keanekaragaman Mikroorganisme (Bakteri).................................
5. Gambar 5 Teknik Biakan Murni.....................................................................
6. Gambar 6 Pengecetan Gram dan Pengujian KOH pada Bakteri.....................
7. Gambar 7 Morfologi Mikroba Selain Bakteri.................................................
8. Gambar 8 Mikroorganisme bermanfaat Bagi Pertanian..................................

ix
 DAFTAR PUSTAKA

Ahmad PP. 2019. Teknik-teknik isolasi atau penanaman mikroba.

http://farmasi.unida.gontor.ac.id/2019/03/24/teknik-teknik-isolasi-atau-
penanaman-mikroba/. Diakses pada tanggal 23 Oktober 2019.

Anastasia TH dan Agustin WG. 2017. Biologi dan bioteknologi cendawan dalam
praktik. UM Press. Malang.

Andriani R. 2016. Pengenalan alat-alat laboratorium mikrobiologi untuk

mengatasi keselamatan kerja dan keberhasilan praktikum. Jurnal
Mikrobiologi. Vol. 1(1): 1-10.

Ariebowo M dan Fictor FP. 2016. Praktik belajar biologi. VBINDO. Surabaya.

Bakhshi M. 2019. Epitypification of cercospora rautensis, the causal agent og

ideal of leaf spot disease on securigera varia, and its first report from Iran.
Journal Fungal Systematics and Evalution, 3(10): 157-163.

Chauhan P dan Mini M. 2016. Applications of microscopy in bacteriology.

Journal Microscopy Research, 4(1): 1-9.

Dasmohapatra PK, Harekrishna J, Tamanna R dan Keshab CM. 2016. The rapid
and easy method to detect the pathogenic aerobicbacteria without staining
A case study from Bankura and its surrounding area, West Bengal, India.
Journal Scholars Academic og Bioscience, 4(4): 366-369.

David D dan Buston P. 2018. Assessment of the potassium hydroxide test as a

complimentary test fot the Gram-stain. Journal Pharming, 1(2): 1-11.

Diniari EB. 2018. Biologi kelas 10/Apa itu pewarnaan Gram ?.

http://blog.ruangguru.com/biologi-kelas-10-apa-itu-pewarnaan-gram?
hs_amp=true. Diakses pada tanggal 31 Oktober 2019.

Ghazali M, Sri N dan Faturrahman. 2015. Deteksi bakteri pathogen yang

berasosiasi dengan Kappaphycus alvarezji (Doty) bergejala penyakit ice-
ice. Jurnal Sains Teknologi dan Lingkungan, 1(2): 24-30.

Giraud E, Shin O, Paniada T, Albin T, Julien T, Joel F, Clemence C, DJamel G,

Jean FA, noriyuki F, Hiroki M, Michiko Y, Nico N and Neung T. 2016.
Rhizobium-legume symbiosis in the absence og nod factore two possible
scenarios with or without the T3SS. Journal International Society for
Microbial Ecology, 10(10): 64-74.

x
Goel R, Saurabh K, Mendalam CS, Amit Y dan Yogesh S. 2019. Microbial
diversity and soil physiochemical characteristic of higher altitude. Juornal
Plos One, 1(1): 1-15.

Habazar T dan Yulmira Y. 2019 Pengantar bakteriologi tumbuhan. Sumatra

Barat. Multimedia LPTIK.

Hagebock M, Martin S, Claudia K, Maximilian S, Sophie P dan Bettina C. 2019

(a). Influence of media heat sterilization process on growth performance of
representative strains of the genus Lactobacillus. Journal Fermentation,
5(20): 1-11.

Hagebock M, Martin S, Claudia K, Maximilian S, Sophie P dan Bettina C.

2019(b). Influence of media heat sterilization process on growth
performance of representative strains of the genus Lactobacillus. Journal
Fermentation, 5(20): 1-11.

Hagebock M, Martin S, Claudia K, Maximilian S, Sophie P dan Bettina C.

2019(c). Influence of media heat sterilization process on growth
performance of representative strains of the genus Lactobacillus. Journal
Fermentation, 5(20): 1-11.

Hasan BMB dan Sohail AA. 2018. Morphological and moleculer identification og
fungi isolated from different environmental sources in the northem eastern
desert of Jordan. Jordan Journal of Biological Sciences, 11(3): 329-337.

Heppy SF, Ella S, Dian WN, Mochamad N dan Irma SR. 2014. Mikrobiologi
umum. Universitas Brawijaya. Malang.

Herrani CR. 2015. Penggunaa virtual lab untuk meningkatkan keterampilan

mahasiswa pendidikan biologi dalam menggunakan alat-alat mikrobiologi.
Jurnal Kependidikan, 27(2): 160-171.

Hidayat N, Irene M, Siswa S, Usman P, Evi S, Mediana CP, Agustin KW, Umi P,
Ignatius S dan Susana R. 2018. Mikrobiologi Industri Pertanian. UB
Press. Malang.

I Nyoman Kader. 2019. Laboratorium dan Sejarah Penggunaannya dalam

Pendidikan. https://www.kompasiana.com/inyoman3907/5b3d7d5fbde575
5f01501002/laboratorium-dan-sejarah-penggunaannya-dalam-pendidikan?
page=all. Diakses Rabu, 18 September 2019.

Irfan M dan Danang RSP. 2018. Isolasi bakteri Rhizobium dari tumbuhan
leguminosa yang tumbuh di lahan bergambut. Jurnal Agroteknoloi, 9(1):
31-40.

xi
Jut I, Annisa F, Agus W, Karina, Nur H, Deby EL dan Alif N. 2014 (a).
Peralatan, sterilisasi dan media pertumbuhan mikroba. Jurnal Praktikum
Mikrobiologi Dasar. Vol. 1(10): 1-10.

Jut I, Annisa F, Agus W, Karina, Nur H, Deby EL dan Alif N. 2014 (b). Peralatan,
sterilisasi dan media pertumbuhan mikroba. Jurnal Praktikum
Mikrobiologi Dasar, 1(3): 1-10.

Kaur H dan Jasmeen K. 2015. Advantages and effectiveness of bacterial culture in

medical laboratories. Journal International of Advanced Research, 3(8):
1028-1039.

Khodir MA. 2015. Struktur tumbuhan dan pengenalan mikroskop. Jurnal

Praktikum Fisiologi dan Perkembangan Tumbuhan BA-2101, 1(1): 1-10.

Kopriva S, Richard J, Manuela P, Antonella S and Anna K. 2017. The role of soil
microorganisms in plant mineral nutrition- current knowledge and future
diractions. Journal Frontiers in Plants Science, 8(1617): 1-10.

Marin M, Juan L, Andreas K, Yen-Yu Lin, Emily B and Thomas O. 2019. A

subcompatible rhizobium strain reveals ingection duality in Lotus,.
Journal og Experimental Botany, 70(6): 1903-1913.

Marvira R dan Abdullah. 2014. Analisi karakteristik psikomotorik dalam

menggunakan mikroskop pada siswa kelas VII SMP Negeri 8 Banda Aceh.
Jurnal Jesbio, 3(5): 25-32.

Milar MH dan Rahayu SA. 2017. Uji cemaran air minum masyarakat sekitar
Margahayu Raya Bandung dengan identifikasi bakteri Escherichia coli.
Jurnal IJPST, 4(2): 50-56.
Mukodiningsih S, Arinda KD dan Cahya SU. 2014. Kandungan total fungi serta
jenis kapang dan khamir pada limbah pabrik pakan yang difermentasikan
dengan berbagai aras starter ‘Starfung’. Jurnal Gripet, 14(2): 102-106.

Muqni R dan Yeti S. 2016. Modification of carry-blair transport media for storage
Salmonela typhi. Jurnal Teknologi Laboratorium, 5(2): 72-73.

Namblar S, A Lavanya, SV Sowmya, Roope SR, Dominic A dan Vanlahrl CH.

2017. Troubleshooters in light microscopy. Journal of Dentistry, 8(6):
511-518.

Nida K, Yusmaniar dan Wardiyah. 2017. Mikrobiologi dan parasitology. UB

Press. Malang.

xii
Nuhamara ST, Hartini S dan Ferdinandus K. 2017. Keanekaragaman jamur di
cagar alam gunung Mutis kabupaten Timor Tengah Utara, Nusa Tenggara
Timut. Jurnal Biota, 2(3): 105-110.

Ochui IO dan Ihejiamaizu CC. 2016. Utilization of biology laboratory equipment

and students’ academic performance in cross river state, Nigeria. British
Journal of Education. Vol. 4(9): 55-63.

Oetari A, Indrawati GR dan Wellyzar S. 2014. Mikologi Dasar dan Terapan.

Jakarta. Pustaka Obor Indonesia.

Pfaller MA. 2015. Application of culture-independent rapid diagnostic tests in the

management of invasive candidiasis and cryptococcosis. Journal of Fungi,
1(10); 217-251.

Pratama P. 2018. Sterilisasi dan pembuatan media. https://padlipratama.wordpress
.com/sterilisasi-dan-pembuatan-media/. Diakses pada Selasa, 1 Oktober
2019.

Prayudyaningsih R dan Ramdana S. 2015. Rhizobium: pemanfaatannya sebagai

bakteri penambah nitrogen. Jurnal Teknis EBONI, 12(1): 51-64.

Putri AI, Nur H, Wignyanto dan Sri S. 2016. Mikologi Industri. Malang. UB
Press.

Raharjo. 2017. Pengelolaan alat bahan dan laboratorium kimia. Jurnal Kimia
Sains dan Aplikasi. Vol. 20(2): 99-104.

Reka K dan Bharathi V. 2015. Isolation and identification of microorganisms

from goat intestine. Journal of Chemical and Pharmaceutical Research,
7(7): 117-123.

Rizal AM, Misbachul M, Novarina IH dan Nanik IS. 2017. Isolasi bakteri
heterotrofik anaerobic pada pengelolahan air limbah industry tekstil.
Jurnal Inovasi dan Pembangunan, 1(1): 50-59.

Rybenkov VV, David AW, Ganesh K, David W, Rupa S dan Helen IZ. 2017.
Bifurcation kinetics of drug uptake by Gram-negative bacteria. Journal
PLOS One, 10(1371): 1-18.

Sadina. 2016. Mengubah mikroskop cahaya menjadi mikroskop digital

multimedia dengan menggunakan software IM magician 4TECH. Jurnal
Inovasi dan Pembangunan, 2(2): 173-185.

xiii
Shrivastava SK. 2017. Safety procedures in science laboratory. International
Journal of Engineering& Scientific Research. Vol. 5(1): 54-64.

Shyntya D dan Suoiana DN. 2016. Efektitas pengenceran terhadap pertumbuhan

koloni mikroba pada saus tomat. Jurnal Sumber Daa dan Lingkungan,
1(2): Sadina. 2016. Mengubah mikroskop cahaya menjadi mikroskop
digital multimedia dengan menggunakan software IM magician 4TECH.
Jurnal Inovasi dan Pembangunan, 2(2): 61-68.

Soewondo A, Nunung H, Setijono S dan Serafinah I. 2017. Mikroteknik dasar.

UB Press. Universitas Brawijaya.

Subandi M. 2014. Mikrobiologi. PT. Remaja Rosdakarya. Bandung.

Sudarnika E, Mazdani UD, Mirnawati S dan Widagdo SN. 2015 (a).

Pengembangan media padat untuk menumbuhkan Mycobacterium bovis.
Jurnal Veteriner, 16(4): 497-504.

Sudarnika E, Mazdani UD, Mirnawati S dan Widagdo SN. 2015 (b).

Pengembangan media padat untuk menumbuhkan Mycobacterium bovis.
Jurnal Veteriner, 16(4): 497-504.

Sugeng. 2018. Dasar pertanian. http://dasar-pertanian.blogspot.com/2019/04/defin
isi-bakteri-rhizobium-sp-dan.html?m=1. Diakses pada Senin, 18
November 2019.

Sukmawati D, Tri HK, Reni I, Muzajjanah dan Yoswita R. 2018. Penuntun prakti
kum mikrobiologi. Jakarta. UNJ Press.

Suryanata N. 2018. Tahukah anda apa itu fungi?. http://www.kompasiana.com/am
p/nataliasuryanata/5d426a3097f366e7224ee2/tahukah-anda-apa-itu- fungi.
Diakses pada tanggal 5 November 2019.

Syauqi A. 2017. Mikrobiologi Lingkungan. VBINDO. Surabaya.

Utami HP. 2009. Mengenal cahaya dan optik. PT. Gramedia. Jakarta.

Videau P, Vaille A, Swenson, Amanda DS, Michael OG, Blaker U, Benjamin P,

Loralyn MC dan Nina MV. 2018. Assessment and verification of
commercially available pressure cookers for laboratory sterilization.
Journal Plos One, 13(12): 1-13.
Warsito KR dan I Nyoman C. 2010. Pengetahuan Praktis Labaratorium Kimia.
Bengkulu. UNIB Press.

xiv
Wijaya H. 2018. Pengertian mikroskop, fungsi dan bagiannya. http://portal-
ilmu.com/pengertian-fungsi-bagian-mikroskop/. Diakses pada Selasa, 24
September 2019.

Yanto B. 2018. Mikrobiologi lanjutan kelompok 1. http://www.google.com/amp/s
/mikrobiologilanjutankelompok1,wordpress.com/2018/02/23/biodiversitas-
mikroba/amp/. Diakses pada tanggal 9 Oktober 2019.

Young-Ok Lee, Sun-Ja Cho dan Mi-Hee Kim. 2016. Effect of pH on soil bacterial
. Journal of Ecology and  Environment, 40(10): 1-9.

Yuliana N, Nur H dan Irene M. 2018. Mikrooganisme dan pemanfaatannya. UB

Press. Malang.

Zainuddin A, Maftuchah dan Aris W. 2014. Teknik dasar analisis biologi

molekuler. Yogyakarta. Deepublish. Mes.

xv