DISUSUN OLEH :
201501169
FAKULTAS FARMASI
MEDAN
2021
RANGKUMAN
Sebagian besar asam amino yang terdapat dalam sel dipergunakan untuk sintesis protein.
Protein memegang peran dalam sel sebagai enzim, komponen struktural, dan toksin.
Penggabungan beberapa asam amino untuk membentuk protein melibatkan sintesis
dehidrasi dan memerlukan energi dalam bentuk ATP. Mekanisme sintesis protein
melibatkan beberapa gen.
1. Famili Glutamat
Keluarga α-Ketoglutarat Asam Amino Termasuk Glu, Gln, Pro, Arg, dan Lys
Asam amino yang berasal dari -ketoglutarat termasuk glutamat (Glu), glutamin (Gln),
prolin (Pro), arginin (Arg), dan pada jamur dan protoctists seperti Euglena, lisin
(Lys). Rute untuk sintesis Glu dan Gln dijelaskan ketika kami mempertimbangkan
jalur asimilasi amonium.
Prolin berasal dari glutamat melalui serangkaian empat reaksi yang melibatkan
aktivasi, kemudian reduksi, dari γ-gugus karboksil menjadi aldehida (glutamat 5-
semialdehida), yang secara spontan mengalami siklisasi untuk menghasilkan basa
Schiff internal, 1-pirolin-5-karboksilat. Reduksi yang bergantung pada NADPH dari
pyrro ikatan rangkap garis menghasilkan prolin.
Ornitin memiliki tiga peran metabolik: (1) berfungsi sebagai prekursor arginin, (2)
berfungsi sebagai perantara dalam siklus urea, dan (3) bertindak sebagai perantara
dalam degradasi Arg. Bagaimanapun, δ-NH3 ornitin dikarbamoilasi dalam reaksi
yang dikatalisis oleh transkarbamoylase ornitin. Gugus karbamoil berasal dari
karbamoil-P yang disintesis oleh karbamoil-fosfat sintetase I (CPS-I). CPS-I adalah
isozim CPS mitokondria; menggunakan dua ATP mengkatalisis pembentukan
karbamoil-P dari NH3 dan HCO3 , satu untuk mengaktifkan ion bikarbonat dan yang
lainnya untuk memfosforilasi karbamat yang timbul dari karboksifosfat melalui
reaksi dengan ion amonium. CPS-I mewakili langkah komitmen dalam siklus urea,
dan CPS-I diaktifkan secara alosterik oleh N-asetilglutamat. Karena N-asetilglutamat
merupakan prekursor untuk sintesis ornitin dan penting untuk operasi siklus urea, ini
berfungsi untuk mengkoordinasikan jalur terkait ini.
Kerangka karbon arginin terutama diturunkan dari -ketoglutarat, tetapi atom N dan C
yang menyusun gugus guanidino dari rantai samping Arg berasal dari NH4 , HCO3
(sebagai karbamoil-P), dan α-NH2 kelompok glutamat dan aspartat. Lingkaran siklus
urea ditutup ketika ornitin diregenerasi dari Arg oleh arginase hidrolisis arginin yang
dikatalisis. Urea adalah produk lain dari reaksi ini dan memberikan namanya pada
siklus. Perhatikan bahwa atom N dalam urea muncul dari NH4 dan gugus amino Asp.
Pada vertebrata darat, sintesis urea diperlukan untuk mengekskresikan kelebihan
nitrogen yang dihasilkan oleh peningkatan katabolisme asam amino—misalnya,
mengikuti konsumsi makanan dengan jumlah protein yang lebih dari cukup.
Pembentukan urea pada dasarnya terbatas pada hati.
Lisin Biosintesispada beberapa jamur dan protoctist Euglena juga berasal dari
α-ketoglutarat, membuat lisin menjadi anggota dari α-ketoglutarat keluarga asam
amino dalam organisme ini.
2. Famili Aspartat
Keluarga Asam Amino Aspartat Termasuk Asp, Asn, Lys, Met, Thr, dan Ile
Anggota dari keluarga asam amino aspartat meliputi aspartat (Asp), sebagai paragin
(Asn), lisin (melalui jalur asam diaminopimelat), metionin (Met), treonin (Thr), dan
isoleusin (Ile).
Aspartat dibentuk dari siklus asam sitrat oksaloasetat antara melalui transfer gugus
amino dari glutamat melalui reaksi aminotransferase yang bergantung pada PLP.
Seperti sintesis glutamat dari α-ketoglutarat, tesis sintesis aspartat adalah saluran pada
siklus asam sitrat. Seperti yang telah kita lihat, gugus amino Asp berfungsi sebagai
donor N dalam konversi citrulline menjadi arginine. kita akan melihat bahwa ONH2
ini juga merupakan sumber dari salah satu atom N dari sistem cincin purin selama
biosintesis nukleotida, serta gugus C-6-amino dari adenin purin utama. Selain itu,
seluruh molekul aspartat digunakan dalam tesis biosintesis nukleotida pirimidin.
Asparagin dibentuk oleh amidasi dari -gugus karboksil dari aspartat. Dalam bakteri,
analogi dengan sintesis glutamin, nitrogen yang ditambahkan dalam amidasi ini
berasal langsung dari NH4 . Pada organisme lain, asparagin sintetase mengkatalisis
transfer bergantung ATP dari amido-N glutamin ke aspartat untuk menghasilkan
glutamat, AMP, PPi , dan asparagine.
Treonin, metionin, dan lisin Biosintesis pada bakteri berasal dari prekursor umum
aspartat, yang pertama diubah menjadi aspartil--fosfat dan kemudian menjadi β-
aspartil-semialdehida. Reaksi pertama adalah fosforilasi yang bergantung pada ATP
yang dikatalisis oleh aspartokinase (Gambar 25.27, reaksi 1). Dalam E. coli, ada tiga
isozim aspartokinase, yang ditunjuk sebagai aspartokinase I, II, dan III. Masing-
masing isozim ini secara unik dikendalikan oleh salah satu dari tiga asam amino
produk akhir. Bentuk I dihambat oleh umpan balik oleh treonin dan bentuk III oleh
lisin. Bentuk II tidakumpan balik dihambat oleh, tetapi sintesisnya ditekan oleh
metionin.
Secara sepintas, penting untuk dicatat peran metionin itu sendiri dalam reaksi metilasi
. Enzim S-adenosylmethionine synthase mengkatalisis reaksi methio sembilan
dengan ATP untuk membentuk S-adenosylmethionine, atau SAM. SAM is a substrate
of methyltransferases in a variety of methyl-donor reactions, such as the formation of
phosphatidylcholine from phosphatidylethanolamine.
Asam amino yang tersisa dari keluarga aspartat adalah treonin dan isoleusin.
Treonin, seperti metionin, disintesis dari homoserin. Memang, homoserin adalah
analog alkohol primer dari alkohol sekunder Thr. Untuk memindahkan ini OOH dari
C-4 ke C-3 membutuhkan aktivasi hidroksil melalui fosfor yang bergantung pada
ATP phorilasi oleh homoserine kinase. Sebagai reaksi pertama tion unik untuk Thr
biosintesis, homoserine kinase adalah umpan balik yang dihambat oleh treonin.
Langkah terakhir dikatalisis oleh treonin sintase, enzim yang bergantung pada PLP.
Isoleusin termasuk dalam keluarga asam amino aspartat karena empat enam
karbonnya berasal dari Asp (melalui treonin) dan hanya dua yang berasal dari piruvat.
Namun demikian, empat dari lima enzim yang diperlukan untuk sintesis isoleusin
adalah umum ke jalur untuk biosintesis valin, jadi diskusi tentang sintesis isoleusin
disajikan di bawah biosintesis keluarga asam amino piruvat.
3. Famili Piruvat
Keluarga Asam Amino Piruvat Termasuk Ala, Val, dan Leu
Keluarga asam amino piruvat termasuk alanin (Ala), valin (Val), dan leusin (Leu).
Transaminasi piruvat, dengan glutamat sebagai donor amino, menghasilkan alanin.
Karena reaksi transaminasi ini mudah reversibel, degradasi alanine terjadi melalui
rute sebaliknya, dengan α-ketoglutarat berfungsi sebagai akseptor amino.
Transaminasi piruvat menjadi alanin adalah reaksi yang ditemukan di hampir semua
organ tetapi valin, leusin, dan isoleusin adalah asam amino esensial, dan dengan
demikian, mereka tidak disintesis pada mamalia. Jalur sintesis valin dan isoleusin
dapat dipertimbangkan bersama karena satu set empat enzim umum untuk yang
terakhir empat langkah dari kedua jalur. Kedua jalur dimulai dengan asam α-keto.
Isoleusin dapat dianggap sebagai analog struktural valin yang memiliki satu tambahan
Satuan -CH2-, dan prekursor asam α-ketonya, yaitu α-ketobutirat, adalah satu karbon
lebih lama dari prekursor valin, piruvat. Menariknya, -ketobutyrate terbentuk dari
treonin oleh treonin deaminase. PLP ini enzim dependen (juga dikenal sebagai
treonin dehidratase atau serin dehidratase) adalah umpan balik-dihambat oleh
isoleusin, produk akhir. Perhatikan bahwa bagian dari karbon kerangka untuk Ile
berasal dari Asp melalui Thr. Mulai dari sini, jalur Val dan Ile cara menggunakan set
enzim yang sama. Reaksi pertama melibatkan generasi hidroksietil-tiamin pirofosfat
dari piruvat dalam reaksi yang analog dengan yang dikatalisis oleh transketolase dan
kompleks piruvat dehidrogenase. Itu gugus hidroksietil dua karbon ditransfer dari
TPP ke masing-masing asam keto akseptor oleh acetohydroxy acid synthase
(acetolactate synthase) untuk memberikan α–acetolactate atau α-aseto-α-
hidroksibutirat. Reduksi bergantung reduksi NAD(P)H asam α-keto hidroksi ini
menghasilkan asam dihidroksi α,β-dihydroxyisovalerate dan α,β-dihidroksi-β-
metilvalera. Dehidrasi masing-masing asam dihidroksi ini oleh asam dihidroksi
dehidratase memberikan α-keto yang sesuai kerangka karbon asam α-ketoisovalerate
dan α-keto-β-methylvalerat. Transaminasi oleh rantai cabang asam amino
aminotransferase menghasilkan Val atau Ile, masing-masing.
Sintesis leusin bergantung pada reaksi ini juga, karena α-ketoisovalerate adalah
prekursor yang umum untuk Val dan Leu. Meskipun Val dan Leu hanya berbeda satu
-CH2- pada rantai sampingnya masing-masing, gugus karboksil dari α-ketoisovalerate
pertama mengambil dua karbon dari asetil-KoA untuk memberikan α-isopropilmalat
dalam reaksi yang dikatalisis oleh isopropilmalat sintase; enzim sensitif terhadap
inhibisi umpan balik oleh Leu. Isopropilmalat dehidratase mengubah α-isomer
menjadi bentuk β-, yang mengalami reaksi Dekarboksilasi oksidatif bergantung
NAD+ oleh isopropilmalat dehydrogenase, sehingga gugus karboksil -
ketoisovalerat hilang sebagai CO2. Aminasi α-ketoisokaproat oleh leusin
aminotransferase.
4. Serine Family
Keluarga 3-Fosfogliserat Asam Amino Termasuk Ser, Gly, dan Cys
Serin, glisin, dan sistein berasal dari intermediet glikolitik 3-fosfogliserat. Pengalihan
3-PG dari glikolisis dicapai melalui 3-fosfogliserat dehidrogenase. NAD+ ini -
oksidasi dependen 3-PG menghasilkan 3-fosfohidroksipiruvat—yang, sebagai α-keto
asam, adalah substrat untuk transaminasi oleh glutamat untuk menghasilkan 3-
fosfoserin. Serin fosfatase kemudian menghasilkan serin (Gambar 25.31, reaksi
3). Serin menghambat enzim pertama, 3-PG dehidrogenase, dan dengan demikian
umpan balik mengatur sintesisnya sendiri.
Glisin dibuat dari serin melalui dua proses enzimatik terkait. Pertama, serin
hidroksimetiltransferase, enzim yang bergantung pada PLP, mengkatalisis transfer
dari serin β-karbon menjadi tetrahidrofolat (THF), agen utama dari satu-karbon
metabolisme. Glycine dan N5, N10-methylene-THF adalah produknya. Selain itu,
glisin dapat disintesis dengan kebalikan dari reaksi glisin oksidase. Di sini, glisin
terbentuk ketika N5, N10-metilen-THF mengembun dengan NH4+ dan CO2. Melalui
rute ini,β-karbon serin menjadi bagian dari glisin.
Konversi serin menjadi glisin adalah cara yang menonjol untuk menghasilkan satu-
karbon turunan THF, yang sangat penting untuk biosintesis purin dan Gugus metil C-
5 dari timin (sebuah pirimidin), serta amino asam metionin. Glisin sendiri
berkontribusi pada sintesis purin dan heme.
Sintesis sistein dicapai dengan transfer sulfhidril ke seri. Dibeberapa bakteri, H2S
mengembun langsung dengan serin melalui reaksi katalis enzim yang bergantung
pada PLP, tetapi pada sebagian besar mikroorganisme dan tumbuhan hijau,
reaksi sulfhydrylation membutuhkan bentuk aktif dari serin, O-asetilserin. O-
asetilserin dibuat oleh serin asetiltransferase, dengan transfer gugus asetil dari asetil-
KoA ke -OH dari Ser. Enzim ini dihambat oleh Cys.
5. Famili Aromatik
Chorismate Disintesis dari Biosintesis Chorismate PEP dan Erythrose-4-P
Prekursor untuk jalur ini adalah intermediet metabolik umum phosphoenolpyruvate
dan erythrose-4-fosfat. Zat antara ini dihubungkan untuk membentuk 3-deoxy-D-
arabino-heptulosonate-7-fosfat (DAHP) oleh DAHP sintase. Meskipun ini reaksi
jauh dari produk akhir asam amino aromatik utama, ini adalah poin penting untuk
regulasi biosintesis asam amino aromatik, seperti yang akan kita lihat. Dilangkah
selanjutnya dalam perjalanan chorismate, DAHP disiklus untuk membentuk enam
anggota senyawa cincin jenuh, 5-dehidrokuinat, dalam suatu reaksi dikatalisis oleh
dehydroquinate synthase (NAD+ adalah koenzim dalam reaksi ini tetapi tidak
diubah olehnya). Urutan reaksi terjadi kemudian yang memperkenalkan
ketidakjenuhan ke dalam cincin melalui dehidrasi dan reduksi,menghasilkan
shikimate. Fosforilasi shikimate oleh shikimate kinase kemudian penambahan PEP
oleh 3-enolpyruvylshikimate-5-phosphate synthase, diikuti oleh chorismate
synthase, menghasilkan chorismate. Jadi, dua ekuivalen PEP adalah diperlukan untuk
membentuk chorismate dari erythrose-4-P
Triptofan
Jalur sintesis triptofan mungkin yang paling menyeluruh mempelajari urutan
biosintetik apa pun, terutama dalam hal organisasi dan ekspresi genetiknya. Sintesis
Trp dari chorismate membutuhkan enam langkah. Pada sebagian besar
mikroorganisme, enzim pertama, antranilat sintase adalah protein tipe α2 β2,
dengan subunit β-bertindak di sebuah peran glutamin-amidotransferase untuk
menyediakan kelompok ONH2 dari anthranilate.
6. Famili Histidin
Histidine Family Rantai samping asam amino basa menerima proton. Pada pH
fisiologis, gugus-R dari lisin dan arginin sepenuhnya terionisasi dan bermuatan
positif. Sebaliknya, Histidin merupakan basa lemah, dan asam amino bebasnya tidak
bermuatan pada pH fisiologis. Namun, bila histidin bergabung dengan suatu protein,
gugus-R dapat bermuatan positif maupun netral, tergantung pada lingkungan ion yang
disediakan oleh protein. Hal ini merupakan sifat penting histidin ang bereperan
sebagai buffer dalam fungsi suatu protein seperti pada hemoglobin..
Jasad hidup tingkat tinggi tidak dapat mensintesa asam amino esensial. Mekanisme
reaksi pembentukannya disusun dari biosintesa asam tersebut dalam bakteri dan
dalam tanaman. Yang tergolong dalam asam amino esensial adalah valin, leusin,
isoleusin, fenilalanin, metionin, treonin, ornitin, arginin, histidin.
DAFTAR PUSTAKA
Simamora, A.2015.Buku Ajar Blok 3 Biologi Sel 1: Asam Amino, Peptida, dan Protein. Jakarta:
Universitas Ukrida. Halaman 4.