UNIVERSITAS BHAKTI KENCANA

FAKULTAS FARMASI
PROGRAM STUDI STRATA 1
RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER (RPS)
Nama Mata Kuliah Kode Mata Bobot (sks) Semester Tgl
Kuliah Penyusunan

Praktikum Kimia Medisinal FF032033 1 SKS 3 (Tiga) 14 September

2021
Otorisasi Nama Koordinator Koordinator Bidang Keahlian (Jika Ka PRODI
Pengembang RPS Ada)

Dr. apt. Fauzan Zein M., Dr. apt. Fauzan Zein M., M.Si. apt. Aris Suhardiman, M.Si.
M.Si.
Capaian CPL-PRODI (Capaian Pembelajaran Lulusan Program Studi) Yang Dibebankan Pada Mata Kulia
Pembelajaran S9 Menunjukkan sikap bertanggungjawab atas pekerjaan keahliannya secara mandiri dalam bidangnya
(CP PP1 Menguasai teori, metode, aplikasi ilmu dan teknologi farmasi (farmasetika, kimia farmasi,  farmakognosi
dan farmakologi), konsep dan aplikasi ilmu biomedik (biologi, anatomi  manusia, mikrobiologi, fisiologi,
patofisiologi, etik biomedik, biostatistik, konsep  farmakoterapi, pharmaceutical care, pharmacy practise,
serta prinsip pharmaceutical  calculation, epidemiologi, pengobatan berbasis bukti dan farmakoekonomi
(P.1, P.2, P.4) 
KU2 Mampu menunjukkan kinerja mandiri, bermutu dan terukur.
KKj3 Melaksanakan riset dan mengidentifikasi dan menyelesaikan problem untuk berkontribusi  pada
perbaikan dalam ilmu farmasi. (KK.18) (KU.3; KU.4; KU.9)
KTj3 Mampu mengevaluasi diri dan mengelola pembelajaran diri sendiri dalam upaya  meningkatkan
kemampuan praktik kefarmasian. (KK.16)

CPMK (Capaian Pembelajaran Mata Kuliah)

 CPMK1 Mampu memahami dan melakukan perhitungan sifat-sifat fisikokimia dengan bantuan aplikasi komputer
CPMK2 Mampu memvisualisasikan dan menganalisis molekul target kerja obat
CPMK3 Mampu membuat hubungan kuantitatif struktur dan aktivitas suatu kelompok senyawa
CPMK4 Mampu melakukan studi interaksi antara target dan ligand serta analisisnya
Diskripsi Singkat Praktikum kimia medisinal merupakan mata praktikum penunjang kuliah kimia medisinal. Dalam praktikum ini
MK mahasiswa diperkenalkan dengan pendekatan-pendekatan yang dilakukan dalam penemuan dan desain obat
berbantukan perangkat lunak computer.
Bahan Kajian / 1. Responsi
Materi 2. Pemodelan struktur 2D dan 3D senyawa dengan Chemoffice
Pembelajaran 3. Perhitungan parameter fisikokimia dengan Chemoffice
4. Optimasi dan perhitungan frekuensi dengan Gaussian09
5. Visualisasi molekul target (protein) dengan VMD
6. Analisis molekul target (protein) dengan VMD
7. HSA
8. HKSA 1
9. HKSA 2
10. Studi docking
11. Virtual screening
12. Review
Daftar Referensi Utama :
1. Christopher J. Cramer. Essentials of Computational Chemistry, Theories and Models. Johns Willey and Sons
Ltd. 2002
2. Thomas Nogrady and Donald F. Weaver, 2005, Medicinal Chemistry : A Molecular and Biochemical
Approach, New York : Oxford University Press, Inc.
3. Gareth Thomas, 2003, Fundamentals of Medicinal Chemistry, England : John Wiley & Sons Ltd.
4. Graham L. Patrick, 2009, An Introduction to Medicinal Chemistry, 4th ed, New York : Oxford University
Press, Inc
5. Gaussian 09, Revision E.01, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R.
Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P.
Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda,
J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E.
Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J.
 Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M.
Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann,
O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G.
Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B.
Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
3. Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K., "VMD - Visual Molecular Dynamics", J. Molec. Graphics, 1996,
vol. 14, pp. 33-38.
4. Kunal Roy, Supratik Kar and Rudra Narayan Das, Understanding the Basics of QSAR for Applications in
Pharmaceutical Sciences and Risk Assessment, Academic Press, 2015, doi: 10.1016/C2014-0-00286-9.
5. https://pyrx.sourceforge.io/blog/105-articles-citing-pyrx.
6. http://gaussian.com/gaussian16/.

Bacaan anjuran
1. Molecular docking-based screening of a simulated HIF-1 protein model for potential inhibitors. Latha MS,
Saddala MS. Bioinformation. 2017 Nov 30;13(11):388-393.
2. Muhammad Arba, Ruslin, Nursan, Maulidiyah, DaryonoHadiTjahjono, Hubungan Kuantitatif Struktur-
Aktivitas (HKSA) dan Penambatan Molekul Senyawa Turunan Benzamida sebagai Inhibitor Alosterik Mitogen
Enhanced Kinase (MEK), Jurnal Kimia VALENSI: JurnalPenelitian dan PengembanganIlmu Kimia, 4(1), Mei
2018, 42-51.

Nama Dosen Dr. apt. Fauzan Zein M, M.Si.

Pengampu
Mata kuliah -
prasyarat (Jika
ada)
Mingg Sub-CP-MK Bahan Kajian (Materi Bentuk dan Estimasi Pengalaman Penilaian
u Ke- Pembelajaran) Metode Waktu Belajar
(Sebagai kemampuan
Pembelajaran Mahasiswa Kriteria Indikator Bobot
akhir yang
[Media & & Bentuk Penilaia
diharapkan
Sumber Belajar] n (%)
(1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) (8) (9)
1 Mampu mempersiapkan Kontrak kuliah. Bentuk: 1x170”  Mendengark Kriteria: Praktikum 0%
diri untuk mengikuti Perkenalan. Pengenalan an terselengg
Pemaparan, pemaparan Ketertiban
seluruh rangkaian aplikasi-aplikasi yang ara
diskusi  Diskusi selama
praktikum kimia akan digunakan selama dengan
praktikum
medisinal praktikum tertib
Bentuk:
Media:
nontest
PC
2 Mampu menggambarkan Struktur 2D dan 3D Bentuk: 1x170”  Menggamb Kriteria: Struktur- 10%
struktur 2D dan 3D senyawa dengan aplikasi arkan struktur
Praktikum struktur 2D Ketepatan
senyawa Chemoffice senyawa
dan 3D yang telah
termasuk ditentukan
Media: stereokimia digambark
nya
PC an dengan
tepat
3 Mampu menghitung Menghitung parameter Bentuk: 1x170”  Menggamba Kriteria: Tepat 10%
parameter fisikokimia fisikokimia senyawa. r struktur dalam
Praktikum  Menghitung Ketepatan
suatu senyawa menggam
sifat-sifat bar
fisikokimia struktur
dan
 Media: perhitung
an sifat
PC
fisikokimia
nya
4 Mampu melakukan Menggambar struktur Bentuk: 1x170”  Menggamba Kriteria: Ketepatan
optimasi geometri dan dalam Gaussian, r struktur dalam
Praktikum  Mengoptima Ketapatan
perhitungan frekuensi optimasi geometri, menggam
dengan Aplikasi perhitungan frekuensi si barkan
Gaussian09  Menghitung struktur
Media: frekuensi senyawa
PC dan
menghitun
g
frekuensin
ya
5 Mampu Mendonload protein, Bentuk: 1x170”  Donload Kriteria: Ketepatan
memvisualisasikan memvisualisasikannya protein visualisasi
Praktikum target ketepatan
bentuk target kerja obat dengan aplikasi VMD protein
(protein) dalam berbagai  Visualisasi
bentuk dan metode protein
pewarnaan Media:

PC
6 Mampu menganalisis Analisis protein target Bentuk: 1x170”  Menganalisi Kriteria: Analisis 10%
protein target s protein yang tepat
Praktikum ketepatan
tentang
protein
target
Media:
 PC
7 Ujian Tengah Semester
8 Mampu melakukan studi Hubungan struktur Bentuk: 1x170”  Melakukan Kriteria: Kemampu
hubungan struktur dan aktivitas studi an
Praktikum hubungan Ketepatan
aktivitas menganali
struktur daya
sis
aktivitas analisis
pengaruh
Media:  Menarik yang
kesimpulan
PC timbul
pengaruh
akibat
yang timbul
pada perubahan
aktivitas jika struktur
struktur
mengalami
perubahan
kecil
9 Mampu melakukan Hubungan kuantitatif Bentuk: 1x170”  Membaca Kriteria: Tepat 10%
pemilihan training set struktur aktivitas 1 jurnal dalam
Praktikum1  Menyusun Ketepatan
dan perhitungan pemilihan
training set dan
parameter fisikokimia training
 Menghitung ketelitian
set dan
Media: parameter menyusun
fisikokimia
PC parameter
fisikokimia
nya
dengan
teliti
10 Mampu membangun Persamaan HKSA, Bentuk: 1x170”  Membuat Kriteria: Tepat 10%
persamaan HKSA yang Validasi persamaan persamaan dalam
 tervalidasi dan HKSA, desain senyawa Praktikum HKSA Ketepatan membuat
menggunakannya untuk baru  Memvalidasi dan persamaa
memprediksi aktivitas persamaan kreativitas n, kreatif
senyawa baru Media: HKSA dalam
 Memprediks mendesai
PC i aktivitas n senyawa
senyawa
baru
baru
 Membuat
laporan
11 Mampu melakukan studi Studi docking Bentuk: 1x170”  Validasi Kriteria: Penarikan 10%
interaksi calon obat metode kesimpula
Praktikum docking Ketepatan
dengan target kerjanya n yang
 Preparasi analisis
tepat
protein
Media: target dan
molekul uji
PC  Docking
senyawa uji
 Analisis
hasil
docking
 Menyusun
laporan
12 Mampu melakukan Virtual screening dengan Bentuk: 1x170”  Mengunduh Kriteria: Penarikan 10%
skrining secara virtual aplikasi Pyrex database kesimpula
praktikum senyawa Ketapatan
n yang
 Virtual tepat
screening
dengan
Pyrex
13 Ujian Akhir Semester

Catatan:
1. Capaian Pembelajaran Lulusan PRODI (CPL-PRODI) adalah kemampuan yang dimiliki oleh setiap lulusan PRODI yang merupakan
internalisasi dari sikap, penguasaan pengetahuan dan ketrampilan sesuai dengan jenjang prodinya yang diperoleh melalui proses
pembelajaran.
2. CPL yang dibebankan pada mata kuliah adalah beberapa capaian pembelajaran lulusan program studi (CPL-PRODI) yang digunakan
untuk pembentukan/pengembangan sebuah mata kuliah yang terdiri dari aspek sikap, ketrampulan umum, ketrampilan khusus dan
pengetahuan.
3. CP Mata kuliah (CPMK) adalah kemampuan yang dijabarkan secara spesifik dari CPL yang dibebankan pada mata kuliah, dan bersifat
spesifik terhadap bahan kajian atau materi pembelajaran mata kuliah tersebut.
4. Sub-CP Mata kuliah (Sub-CPMK) adalah kemampuan yang dijabarkan secara spesifik dari CPMK yang dapat diukur atau diamati dan
merupakan kemampuan akhir yang direncanakan pada tiap tahap pembelajaran, dan bersifat spesifik terhadap materi pembelajaran
mata kuliah tersebut.
5. Kriteria Penilaian adalah patokan yang digunakan sebagai ukuran atau tolok ukur ketercapaian pembelajaran dalam penilaian
berdasarkan indikator-indikator yang telah ditetapkan. Kriteria penilaian merupakan pedoman bagi penilai agar penilaian konsisten dan
tidak bias. Kriteria dapat berupa kuantitatif ataupun kualitatif.
6. Indikator penilaian kemampuan dalam proses maupun hasil belajar mahasiswa adalah pernyataan spesifik dan terukur yang
mengidentifikasi kemampuan atau kinerja hasil belajar mahasiswa yang disertai bukti-bukti.