com
TDIA JOURNAL OF BIOLOGI CHEMISTRY Jil. 272, No. 42, Edisi 17 Oktober, hlm. 26132–26138, 1997
© 1997 oleh The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc. Dicetak di AS
(Diterima untuk publikasi, 15 April 1997, dan dalam bentuk revisi, 28 Juli 1997)
cDNA untuk kasein kinase 1 (CK1) dari Plasmodium regulasi spesifik, dan analisis mutasi P. falciparumkasein kinase 1
falciparum dikloning, diurutkan, dan diekspresikan dalam (PfCK1).1
bakteri. Kerangka baca tunggal utama terbuka dari pasangan Kasein kinase-1 dan -2 (CK1 dan CK2) adalah protein kinase Ser/
1,2-kilobase cDNA dikodekan untuk polipeptida asam amino Thr multipotensial, awalnya dimurnikan dari lisat retikulosit
324 dari;37 kDa, urutan prediksi yang menunjukkan identitas kelinci menggunakan kasein sebagai substrat (ditinjau dalam Ref.
kuat dengan isoform CK1 yang diketahui. Enzim rekombinan 3 dan 4). Pada tahun-tahun berikutnya, kedua enzim terbukti
yang dimurnikan menunjukkan sifat karakteristik CK1, memfosforilasi, dan dengan demikian mengatur, berbagai
seperti penghambatan oleh CK1-7, kemampuan untuk macam protein seluler. Penjajaran urutan gen CK1 dari berbagai
memfosforilasi substrat peptida yang sangat spesifik, dan organisme dan analisis penghapusan ragi rekombinan CK1 baru-
preferensi yang kuat untuk ATP daripada GTP. Aktivitas
baru ini menghasilkan penggambaran domain berikut dalam
kasein kinase, sebagian dimurnikan dari ekstrak larutP.
prototipe enzim ragi 45-kDa (diringkas dalam Ref. 5 dan 6):
falciparum dengan kromatografi afinitas melalui kolom CK1-7
domain katalitik N-terminal dari sekitar 300 asam amino yang
menampilkan sifat yang identik. Aktivitas tersebut
diikuti oleh regangan 12-residu yang dipertahankan di antara
menunjukkan ekspresi spesifik stadium pada parasit, dengan
urutan trofozoit > cincin >> skizon. Analisis utara beberapa bentuk tetapi tidak dalam bentuk lain; segmen 85-
menunjukkan keberadaan dua mRNA CK1 utama, panjang 2,4 residu hidrofilik diprediksi fleksibel dan kaya akan Pro dan Ser;
dan 3,2 kilobase, tingkat yang berada di cincin urutan > dan akhirnya, situs prenilasi terminal-C 43-residu yang berisi
skizon > trofozoit. Mutagenesis CK1 rekombinan sinyal lokalisasi. Struktur kristal dari inti katalitik 298-residu dari
mendefinisikan residu asam amino penting dan peran Schizosaccharomyces pombe CK1 dalam kompleks dengan
potensialnya dalam konformasi enzim. CK1 malaria MgATP baru-baru ini telah dijelaskan pada resolusi 2,0-Å (6).
tampaknya merupakan salah satu enzim CK1 terkecil dan Struktur tersebut menunjukkan peran sejumlah residu yang
mungkin paling primitif yang diketahui, mengandung sedikit dilestarikan dalam berbagai fungsi katalitik enzim, seperti
informasi urutan di luar domain katalitik minimal. pengikatan ATP, Mg21, dan gugus fosfat dari substrat.
Untuk mengkonfirmasi identitas cDNA CK1 (PfCK1) malaria,
kami telah mempelajari sifat biokimia dari enzim malaria
rekombinan secara rinci dan membandingkannya dengan
Protozoa parasit, Plasmodium falciparum, adalah agen penyebab aktivitas enzim asli. Selain itu, analisis mutasi awal enzim
malaria di seluruh dunia dan bertanggung jawab atas angka kematian dilakukan untuk memastikan sifat esensial dari beberapa residu
tahunan hampir 3 juta, yang sebagian besar adalah anak-anak dan invarian dan pengaruhnya terhadap parameter enzimatik. Studi
ibu hamil (1). Namun, alat yang tersedia untuk mengendalikan ekspresi spesifik tahap gen PfCK1 menyarankan peraturan
malaria tidak memadai, dan jenis yang resistan terhadap obat transkripsi dan pasca-transkripsi. Hasil kami merupakan laporan
tersebar luas; apalagi, prospek langsung dari vaksin yang berguna pertama dari enzim CK1 dalam parasit protozoa eukariotik.
tidak pasti. Dengan demikian, ada kebutuhan mendesak untuk
memperoleh pengetahuan dasar tentang berbagai proses selulerP.
falciparum pada tingkat molekuler, sehingga target yang rentan PROSEDUR EKSPERIMEN
dapat diidentifikasi. Dengan tujuan jangka panjang ini, kami telah Kultur dan Ekstrak Parasit—P. falciparumstrain Dd2 dipertahankan
memulai studi tentang sistem transduksi sinyal diP. falciparum. dalam kultur eritrosit yang dimodifikasi (7, 8). Kultur disinkronkan dengan
pemurnian tahap schizont lebih dari 65% Percoll (Pharmacia) bantal diikuti
Karena fosforilasi dan defosforilasi protein reversibel merupakan
dengan inkubasi parasit tahap cincin di 5%D-sorbitol (9). 1 liter sinkronP.
mekanisme utama transduksi sinyal (2), salah satu tujuan langsung falciparum kultur tahap yang sesuai dan pada parasitemia 15-20% diobati
kami adalah mengkarakterisasi berbagai protein kinase di dengan saponin (konsentrasi akhir 0,1%) untuk melisiskan eritrosit. Pelet
P.falciparum. Dalam makalah ini, kami melaporkan karakterisasi, parasit disuspensikan kembali dalam buffer lisis (50 mM Tris-Cl, pH 7,6, 2 m
ekspresi, tahap- M dithiothreitol, 2 mM MgCl2, 1 mM fenilmetilsulfonil fluorida, 10 Mg/ml
leupeptin, 1% (v/v) aprotinin), dihomogenkan, dan disonikasi sebentar
pada suhu 4 °C. Lisat disentrifugasi pada 100.0003 G selama 1 jam pada
* Biaya publikasi artikel ini sebagian dibiayai oleh pembayaran biaya suhu 4°C. Supernatan (S100) menjadi sasaran pengendapan amonium
halaman. Oleh karena itu, artikel ini harus diberi tanda “iklan” sesuai sulfat (0-60%) diikuti oleh resuspensi dan dialisis fraksi pelet dalam buffer
dengan 18 USC Bagian 1734 semata-mata untuk menunjukkan fakta ini. di atas.
Sebuah akun awal dari pekerjaan ini dipresentasikan pada Molecular
Parasitology Meeting VII di Woods Hole, MA (15-19 September 1996).
Isolasi dari P. falciparum DNA genomik dan RNA dari Saponin-
Urutan nukleotida yang dilaporkan dalam makalah ini telah diserahkan
ke GenBankTM/EBI Data Bank dengan nomor aksesi AF017139.
1 Singkatan yang digunakan adalah: PfCK1, P. falciparum kasein kinase 1; CK1
Kepada siapa korespondensi harus ditujukan. Telp.: 334-460-6860; Faks: dan CK2, kasein kinase-1 dan -2, masing-masing; kb, pasangan kilobase;
334-460-6127; Email: sbarik@jaguar1.usouthal.edu. HALAMAN, elektroforesis gel poliakrilamida.
parasit malaria mengalami perubahan morfologi yang berbeda ditentukan dengan pemindaian densitometri, berada pada rasio
selama perkembangan melalui siklus hidup intraeritrositiknya: 100:42:3. Keaslian aktivitas CK1 selanjutnya diverifikasi oleh
cincin (tahap pematangan awal setelah invasi), trofozoit (sel sensitivitasnya terhadap inhibitor CK1-7 dan dibandingkan
mononukleat yang lebih besar yang aktif secara metabolik yang dengan CK1D (Gambar 6). Pada 20MM CK1-7, misalnya, aktivitas
mengandung pigmen hemozoin), dan skizon (sel berinti banyak). semua tahap dihambat oleh 85-90%.
Untuk mengatasi apakah gen PfCK1 diekspresikan dalam cara Substrat Endogen Malaria CK1—Dalam upaya untuk
khusus tahap melalui siklus hidup yang rumit ini, sampel RNA mendapatkan perkiraan awal substrat alami CK1 malaria, kami
diisolasi dari kultur yang disinkronkan setiap 6 jam. Seperti yang menjadikan ekstrak S100 dari tiga tahap utama parasit untuk
ditunjukkan oleh Gambar. 5, ekspresi transkrip PfCK1 memang memfosforilasi sendiri, di mana jumlah yang sama dari protein
diatur oleh siklus sel. Kedua kelas ukuran transkrip menunjukkan S100 diinkubasi dengan adanya [G-32P]ATP dan peningkatan
ekspresi puncak pada tahap cincin awal dan hampir tidak konsentrasi CK1-7. Analisis produk reaksi pada SDS-PAGE, seperti
terdeteksi pada tahap trofozoit dan skizon. yang ditunjukkan pada Gambar. 7, menghasilkan sejumlah
Menariknya, ketika kami menentukan aktivitas spesifik CK1 temuan, yang diringkas sebagai berikut. (A) Sejumlah polipeptida
dalam ekstrak S100 dari berbagai tahap parasit, gambaran yang malaria tampaknya berfungsi sebagai substrat untuk kinase
berbeda muncul. Menggunakan substrat fosfopeptida spesifik, endogen. Spesies fosfoprotein utama yang umum di kedua cincin
aktivitas CK1 tertinggi ditemukan pada trofozoit, diikuti oleh dan trofozoit menunjukkan massa molekul 66, 60, 33, dan 27 kDa
cincin, sedangkan aktivitas pada skizon hampir tidak terdeteksi di samping sejumlah spesies dengan berat molekul tinggi,
(Gbr. 6). Kegiatan relatif dalam tiga tahap, sedangkan 42-
Malaria Kasein Kinase 1 26135
FAKU G. 2.A, Analisis Selatan P. falciparum DNA genom Dd2. 3Mg DNA
FAKU G. 5.Ekspresi spesifik panggung dari mRNA PfCK1. Total RNA
genom, dibatasi dengan enzim berikut, menjadi sasaran analisis Selatan
diisolasi setiap 6 jam dari synchronous P. falciparum budaya Dd2. Sekitar 4
menggunakan PfCK1 cDNA sebagai probe (10). Jalur 1, NdeSAYA;jalur 2, pst
SAYA; jalur 3, ramah lingkunganRI; jalur 4, ramah lingkunganRV; jalur 5,
Mg sampel RNA dari setiap titik waktu dianalisis seperti pada GambarB.
bamHAI; jalur 6,hindIII; jalur 7, XbaSAYA; jalur 8, KpnSAYA. B, Analisis utara Jalur 1, trofozoit awal; jalur 2, trofozoit;jalur 3, trofozoit dewasa/skizon
awal; jalur 4, skizon; jalur 5, tersegmentasi; jalur 6, dering awal; jalur 7,
RNA CK1. 10Mg dari total P. falciparum RNA dari kultur asinkron diperiksa
cincin. Posisi penanda RNA standar (dalam kb) ditampilkan. Jumlah relatif
dengan cDNA PfCK1 (10). Penanda DNA dan RNA standar ditampilkan.
transkrip, ditentukan oleh pemindaian densitometrik dari autoradiograf,
dalam rasio berikut (kiri ke Baik): 4:14:12:22:45:100:98.