com
Bacaan:Stryer Edisi 6: Bab 23 dan 24. Gambar-gambar dalam dokumen ini berasal dari
Stryer kecuali disebutkan lain.
TUJUAN:
2. Memahami ciri-ciri umum degradasi protein lisosom, termasuk jenis protein apa
yang terdegradasi dalam lisosom.
4. Memahami jalur umum untuk menghilangkan gugus --amino dari -- asam amino
selama katabolisme asam amino.
6. Memahami dasar-dasar siklus urea dan bagaimana pengaturannya. Memahami bagaimana enzim
siklus urea yang rusak dapat menyebabkan penyakit, dan bagaimana penyakit tersebut diobati.
7. Pahami kerangka karbon asam amino mana yang menjadi sumber zat antara
metabolisme utama selama katabolisme asam amino.
8. Ketahui asam amino mana yang semata-mata ketogenik, semata-mata glukogenik, dan keduanya ketogenik dan
glukogenik.
9. Ketahui langkah mana dalam degradasi asam amino yang menyebabkan penyakit
berikut: methylmalonic acedemia, homocystinuria, maple syrup disease, fenilketonuria,
tirosinemia I, II dan III, dan alkaptonuria. Untuk setiap penyakit, Anda harus mengetahui
nama enzim yang rusak, reaksi yang dikatalisis oleh enzim, dan jalur di mana enzim
berfungsi.
10. Mengetahui asam amino mana yang esensial dan mana yang tidak esensial pada manusia.
11. Mengetahui pada manusia, zat antara metabolisme utama mana yang dapat berfungsi sebagai
kerangka karbon untuk biosintesis asam amino mana.
12. Ketahui asam amino mana yang dapat bertindak sebagai neurotransmiter.
13. Mengetahui asam amino mana yang dapat digunakan untuk sintesis neurotransmiter mana.
Pengingat: untuk mengunduh film yang digunakan dalam kuliah saya, buka halaman web saya:
http://www.biochem.uthscsa.edu/~lafer/
(Atau pergi ke departemen biokimia UTHSCSA, klik fakultas, dll. untuk menemukan
tautan di atas) Klik tautan, untuk cermin file ppt di papan tulis, serta file film yang tidak
diizinkan di papan tulis karena keterbatasan ukuran .
1. Lisosom mendegradasi protein yang diambil oleh endositosis, atau protein yang
lalu lintas dalam jalur endositik.
2. Lisosom mengandung ~50 enzim hidrolitik (protease). pH mereka
optima bersifat asam.
3. pH lisosom adalah ~5.
4. Pada sel yang bergizi baik, degradasi protein lisosom bersifat non-selektif.
5. Dalam sel yang kelaparan, ada
jalur selektif yang secara istimewa mendegradasi Tanda Kematian
protein sitosol yang mengandung pentapeptida
KFERQ (Lys-Phe-Glu-Arg-Gln).
E1=Aktivasi Ubiquitin
Enzim
E2=Ubiquitin-
Enzim Konjugasi
E3=Ubiquitin-Protein
Ligase
6.
Ubiquitin melekat pada
gugus --amino dari
residu lisin pada
protein sasaran.
7.Korelasi klinis:Manusia
papilloma virus (HPV) mengkodekan protein yang
mengaktifkan enzim E3 spesifik. Enzim penekan tumor p53
ada di mana-mana dan protein lain yang mengontrol
perbaikan DNA, yang kemudian dihancurkan. Aktivasi
enzim E3 ini diamati pada lebih dari 90% dari semua
karsinoma serviks.
8. Sebuah molekul ubiquitin tunggal adalah sinyal yang buruk untuk degradasi. Namun,
rantai 4 atau lebih molekul ubiquitin adalah sinyal yang sangat kuat untuk degradasi.
proteasom 20S
(aktivitas katalitik)
sebuah. 700kD,
28 homolog
subunit: 14 dari
tipe - dan 14
tipe -.
b. Sub-
unit adalah
diatur dalam 4
cincin dari 7 subunit masing-masing untuk membentuk tong tertutup.
1. Setiap asam amino yang dihasilkan oleh katabolisme protein yangtidak dibutuhkan
sebagai blok bangunan untuk reaksi sintetik biomolekuler baru adalahterdegradasike
kerangka karbon di hati.
Dehidrogenasi Hidrolisis
dikeluarkan
asam alfaketo 1 ASAM AMINO 2
d. Semua aminotransferase
mengandung prostetik
kelompok piridoksal
fosfat (PLP).
e. PLP Tautomer:
Gugus hidroksil fenolik sedikit asam,
mendukung deprotonasi.
asam alfaketo 1
1 2 3
3 2 1
.
4
ASAM AMINO 2
(GLUTAMAT)
dikeluarkan
asam alfaketo 1 ASAM AMINO 2
h. Aspartat Aminotransferase
1. Siklus Alanin
Glutamin Sintetase:
NH4++ glutamat + ATP
c. Membawa satu atom C dan satu atom N ke dalam siklus urea sebagai
gugus karbamoil.
peningkatan besar dalam laju penghilangan NH+ 4memastikan bahwa NH+4tetap rendah.
b. Dua intraseluler
lokasi.
c. Matriks mitokondria:
karbamoil fosfat
pembentukan dan
sintesis sitrulin.
d. Sitosol:
argininosuksinat
pembentukan; belahan dada
argininosuksinat menjadi
arginin dan fumarat;
hidrolisis arginin menjadi
ornitin dan urea.
13. Pengaturan siklus urea
sebuah. Itu
b.
Kontrol keseluruhan dari siklus
c. Glutamin dan glutamat yang tinggi dapat menyebabkan kerusakan otak, mungkin dengan menghasilkan efek
osmotik yang menyebabkan pembengkakan otak
VII. NASIB RANGKA KARBON DARI ASAM AMINO
1. Strategi dari
degradasi asam amino adalah untuk
mengubah kerangka karbon menjadi
metabolisme utama
perantarayang dapat diubah
menjadi glukosa, atau dioksidasi oleh
siklus asam sitrat.
2. karbon
kerangka dari beragam set 20
asam amino disalurkan menjadi
hanya 7 molekul:piruvat, asetil
KoA, asetoasetil KoA, --
ketoglutarat, suksinil KoA,
fumarat dan oksaloasetat.
sebuah. Piruvat sebagai titik masuk ke dalam metabolisme
3-karbonasam amino
ala, ser, cys masuk
melalui piruvat.
1. Kerangka4-
karbonasam amino masuk pada oksaloasetat.
e. Klinis
Korelasi:
1. Homosistinuria:
Skoliosis, otot
kelemahan, mental
keterbelakangan, kurus
rambut pirang
Sistation --
sintase rusak.
2. Metil-malonik
akademisi:
Metilmalonil-KoA
mutase rusak.
(Gambar dari
Prinsip dari
Biokimia oleh
Lehninger dan Fox,
Penerbitan Freeman)
f. Asam amino ketogenik versus glukogenik
c.Korelasi Klinis:
Selain PKU, sejumlah penyakit lain
disebabkan oleh gangguan metabolisme
asam amino aromatik.(Gambar dari Prinsip
Biokimia oleh Lehninger dan Fox, Freeman
Publishing)
Tidak berbahaya
d. triptofan
Degradasi
1. Hampir semua
Sebagian besar neurotransmiter molekul kecil adalah asam amino atau turunannya
Tirosin
*
Tirosin
Tirosin
glutamat
triptofan
GABA
histidin
4. Biosintesis Serotonin
2. Biosintesis GABA
II. BIOSINTESIS AMIN BIOGENIK
AKU AKU AKU. BIOSINTESIS CREATINE DAN PHOSPHOCREATINE