TUGAS DESIGN PRIMER

MATA KULIAH BIOLOGI MOLEKULER II

Disusun oleh :

PROGRAM STUDI TEKNOLOGI LABORATORIUM MEDIS

PROGRAM SARJANA TERAPAN
SEKOLAH TINGGI ILMU KESEHATAN
WIRA MEDIKA BALI
DENPASAR
2022
1. Dari database NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.govpilihlah nukelotida DNA suatu gen terkait
bakteri (apa saja) dengan panjang antara 1000 -5000 bp dalam format Fasta
2. Dengan bantuan Primer3Plus NCBI
http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi, gunakan sekuen DNA
dalam format Fasta yang anda dapatkan pada langkah sebelumnya sebagai input untuk
mendesain primer pada
3. Catat 1 pasang atau lebih primer yang anda dapatkan.

Primer Primer sequence Tm (C) Ukuran

pair produk(bp)
No.
1. F 5’- GCCAACCAGGGTAAAACAGA 60.0 °C 222 bp
R 5’- CACGGATTCTCACAAGCAGA 60.0 °C

2. F 5’- GGCTAGAAGTCGTCCTGTCG 60.0 °C 166 bp

R 5’- TTCACTTGAATGTCCCCACA 59.9 °C

3. F 5’- CTGAAAGCCAACCAGGGTAA 60.1 °C 228 bp

R 5’- CACGGATTCTCACAAGCAGA 60.0 °C

4. F 5’- TCTCAGTGAAAAGCCCAACC 60.2 °C 200 bp

R 5’-CAGCCAGAGTGACAGGACAA 60.0 °C

5. F 5’- CCCCAGTCTCTCCTTGTGAG 59.8 °C 237 bp

R 5’- AACAGCCAGACACCCTCTGT 59.8 °C