LKPD/BIO/XII/KD 3.

3
Nama : Bernadeta Videlsia Ikun
Kelas : XII Mipa 1
SUBSTANSI GENETIKA

Kompetensi Dasar:
3.3. Menganalisis hubungan struktur dan fungsi gen, DNA, kromosomdalam
penerapan prinsip pewarisan sifat pada makhluk hidup
4.3. Merumuskan urutan proses sintesis protein dalam kaitannya dengan
penyampaian kode genetik (DNA-RNA-Protein)

A. PENDAHULUAN
Substansi dasar nukleus terdiri atas nukleoprotein yang disusun oleh senyawa protein
dan asam nukleat. Ada dua jenis asam nukleat yang berkaitan dengan hereditas, yaitu
DNA (Deoxyribonucleic Acid) dan RNA (Ribonucleic Acid). Keduanya
bertanggungjawab terhadap sintesis protein serta mengontrol sifat-sifat keturunan.
Sel-sel seluruh tubuh manusia terdiri dari kromosom yang berasal dari kedua orang
tuanya, artinya individu tersebut mendapatkan DNA sebagai materi genetik yang
berasal dari kedua orang tuanya. Sifat-sifat yang diturunkan setiap makhluk hidup
dari orang tua pada keturunannya disebut hereditas. Proses tersebut melibatkan
beberapa komponen, antara lain gen, alel, DNA, dan kromosom. setiap harinya
masing-masing makhluk hidup membutuhkan makanan demi kelangsungan
hidupnya. Makanan yang mereka makan nantinya akan dicerna dalam sistem
pencernaan mereka yang nantinya akan diolah menjadi energi dalam tubuh. Dalam
proses pencernaan makanan ada istilah yang disebut dengan sintesis protein.
B. PETUNJUK KERJA
I. GEN
1. Perhatikan gambar berikut!

a. Berdasarkan gambar, adakah kemiripan antara anggota keluarga tersebut?

Jawab :
Ya, ada. Misalnya bentuk wajah dari putri Presiden Jokowi mirip dengan
Ibu Iriana dan bentuk wajah kedua putranya mirip dengan wajah pak
Jokowi.
b. Mengapa terdapat kemiripan diantara keluarga tersebut?
Jawab :
Karena terdapat faktor genetik

c. Apa yang dimaksudkan dengan gen?

Jawab :
Gen (dari bahasa Belanda: gen) adalah unit pewarisan sifat bagi
organisme hidup. Bentuk fisiknya adalah urutan DNA yang

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
melekat/berada di suatu protein, polipeptida, atau seuntai RNA yang
memiliki fungsi bagi organisme yang memilikinya.

d. Perhatikan gambar berikut!

Gen tersusun atas 3 komponen. Berdasarkan gambar di atas, tentukan

dan jelaskan komponen:

A. Rekon, yaitu komponen yang lebih kecil dari gen dan terdiri atas

satu atau dua pasang nukleotida.
B. Muton, yaitu komponen yang lebih besar dari rekon dan terdiri
atas satu atau dua pasang nukleotida.
C. Sistron, yaitu komponen yang terdiri atas ratusan nukleotida.
e. Sebutkan 6 sifat-sifat gen!
1) Gen mengandung informasi genetik
2) Setiap gen mempunyai tugas dan fungsi yang berbeda-beda
3) waktu pembelahan mitosis dan meiosis bisa mengadakan
duplikasi
4) kerjanya ditentukan oleh susunan komniasi basa nitrogennya
5) sebagai zarah yang terdapat di dalam kromosom

f. Sebutkan 3 fungsi gen!

1) Gen-gen ialah substansi hereditas yang mempunyai fungsi
sebagai berikut:
2) Dapat memberikan informasi tentang genetika dari generasi ke
generasi.
3) Dapat mengendalikan, ini artinya bisa mengatur metabolisme
dan pertumbuhan tubuh.
4) Dapat menentukan sifat-sifat pada keturunannya. misalnya
yang dicontohkan pada fakta di depan. Sifat-sifat itu bisa
berupa bentuk rambut, bentuk badan, atau warna kulit, dan lain
sebagainya.
5) Proses reaksi kimia di dalam tubuh dapat terjadi secara
bertubi-tubi. Dan pada tiap-tiap reaksinya diperlukan enzim.
Pembentukan dan juga pengendalian kerja enzim tersebut

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
dilaksanakan oleh gen. Dan juga pada proses perkembangan
yang membutuhkan hormon juga diatur oleh gen.

II. DNA DAN RNA

1. Perhatikan gambar struktur DNA berikut!

a. Tentukan bagian yang bernomor 1,2,3,4,5,dan 6!

Jawab :
1) Fosfat
2) Gula deoksiribosa
3) Adenine
4) Thymine
5) Guanine
6) Cytosinen

b. Jelaskan struktur DNA!

Jawab :
Struktur DNA yang konvensional adalah heliks ganda (double helix);
tersusun atas basa nitrogen Adenin, Guanin, Timin dan Sitosin; dan
merupakan polimer dari monomer nukleotida (fosfat-gula deoksiribosa-
basa nitrogen). Adenin dan Guanin termasuk purin. Sedang Sitosin dan
Timin tergolong pirimidin. Menurut Crick & Watson, struktur DNA 
heliks ganda tersusun atas dua utas polinukleotida yang saling terhubung
oleh ikatan hidrogen yang lemah. Ikatan hidrogen tersebut terbentuk
antara dua basa nitrogen, Purin dan Pirimidin, yang saling berpasangan.
Adenin (basa purin) berpasangan dengan Timin (basa pirimidin) yang
terhubung dengan ikatan rangkap dua, sementara Guanin (basa purin)
berpasangan dengan Sitosin (basa pirimidin) yang terhubung dengan
ikatan rangkap tiga. Nah, berikut ini struktur molekul dari Adenin dan
Guanin, serta Timin dan Sitosin. Basa nitrogen tersebut terhubung ke
suatu gula deoksiribosa pada rantai punggung DNA. Gula deoksiribosa
merupakan modifikasi dari gula ribosa, yaitu gula dengan 5 atom karbon,
di mana pada atom karbon nomor 2 kehilangan atom oksigennya. Oleh
karena itu, gula tersebut dinamakan de-oksi yang berarti kehilangan
oksigen. Pada rantai punggung DNA (DNA backbone), gula deoksiribosa
kemudian terhubung dengan suatu gugus fosfat, tepatnya pada atom
karbon nomor 5 dari gula deoksiribosa.

c. Sebutkan 5 sifat-sifat DNA!

Jawab :

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
1) Merupakan material kromosom yang membawa informasi genetik,
lewat aktivitas pembelahan sel.
2) Jumlah DNA konstan di setiap jenis sel dan spesies.
3) Kandungan DNA di dalam sel bergantung dari sifat ploidi
(genom) sel/ jumlah kromosom di dalam sel.
4) Dapat melakukan replikasi,
5) Dalam sel organisme prokariotik (bakteri), DNA rantainya
tunggal.
6) Pada suhu yang mendekati titik didih/ pH ekstrim (kurang dari 3/
lebih dari 10), DNA mengalami denaturasi/ membuka.
d. Sebutkan 4 fungsi DNA
Jawab :

1) Menjadi bahan warisan sel

asam deoksiribonukleat merupakan bahan yang bisa diwariskan
pada semua sel,  DNA secara tepatnya bereplikasi (memperbanyak
diri) setiap generasi sel.
2) Mengendalikan aktivitas sel
dalam mengendalikan aktivitas suatu sel dilakukan untuk
menentukan sintesis enzim serta protein lainnya.
3) Menjadi kumpulan unit informasi
Gen yang adalah fragmen fragmen fungsional dari DNA berfungsi
dalam menentukan rangkaian pada asam amino suatu protein.
4) Menyintesis molekul kimia lain
5) Duplikasi diri atau melakukan replikasi.

e. Apa yang dimaksudkan dengan transkripsi dan replikasi!

1) transkripsi adalah langkah pertama ekspresi gen yang menghasilkan
molekul mRNA dari templat DNA.
2) replikasi adalah proses yang menghasilkan dua salinan
identik DNA dari molekul DNA asli

f. Lengkapi tabel hipotesis replikasi DNA!

No Jenis hipotesis Pengertian Gambar

1 Teori hipotesis Menurut hipotesis
konservatif ini, rantai ganda
DNA induk
langsung
membentuk salinan
berupa rantai ganda
DNA baru tanpa
ada pemisahan
rantai ganda DNA
induk terlebih
dahulu. Replikasi
pertama
menghasilkan dua
rantai ganda DNA,
terdiri dari satu
rantai ganda DNA
induk dan satu
rantai ganda DNA
yang benar-benar
baru. Pada replikasi

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
kedua, masing-
masing rantai
ganda DNA
tersebut langsung
membentuk salinan
DNA yang baru
lagi. Akhirnya,
menghasilkan
empat buah DNA.
Satu DNA tetap
merupakan DNA
induk yang utuh
dan tiga DNA
merupakan DNA
baru.
2 Teori Semi
Konservatif Hipotesis model
semi konservatif ini
dikemukakan oleh
Watson dan Crick,
menyatakan bahwa
rantai ganda DNA
induk membuka
atau memisah
terlebih dahulu
sehingga terbentuk
dua buah rantai
tunggal DNA.
Masing-masing
rantai tunggal
tersebut berfungsi
sebagai cetakan
untuk membentuk
rantai tunggal DNA
baru, melalui
pembentukan
pasangan basa yang
komplementer
dengan basa
nitrogen DNA
induk.

Dengan demikian,
hasil replikasi
pertama adalah dua
buah DNA.

Masing-masing
DNA terdiri dari
satu rantai tunggal
induk dan satu
rantai tunggal yang
baru. Pada replikasi
kedua, masing-
masing rantai
ganda DNA
tersebut membuka
kembali sehingga

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
dihasilkan empat
buah DNA. Dua
buah DNA
mengandung rantai
tunggal induk dan
dua buah DNA
yang lain
merupakan rantai
DNA baru.

3 Teori Hipotesis Rantai ganda DNA

Dispersif hasil replikasi
pertama maupun
replikasi ke dua
dari DNA induk
mengandung
segmen campuran
antara rantai DNA
induk dan rantai
DNA baru.
Artinya, rantai
ganda DNA
salinannya terdiri
dari dua rantai
tunggal DNA yang
masing-masing
mengandung
segmen (bagian
atau potongan)
DNA induk dan
segmen DNA baru.

g. Sebutkan 3 jenis enzim yang terlibat dalam replikasi DNA dan

penjelasannya!
1) Enzim polimerase DNA I
DNA polimerase I berperan menghilangkan RNA primer yang
melekat pada lagging strand DNA dan mengganti dgn DNA
2) Enzim polimerase DNA II
Fungsi spesifik enzim polimerase DNA II belum dapat jelas, hanya
diketahui enzim ini berperan juga pada replikasi DNA. Kecepatan
mengkatalisis sebanyak 0,5 nukleotida ditambahkan tiap detik, serta
mempunyai aktivitas 3’-5’ exonuclease.
3) Enzim Polimerase DNA III
Merupakan polimerase yang bertanggungjawab Pada replikasI invivo.
Merupakan Holoenzim kompleks denGan BM 550.000 yang terdiri
atas 7 polipeptida yang berbeda, α membawa aktivitas 5’-
3’ exonclease sedangkan lainnya memBawa aktivitas 3’-
5’ exonulease.
4) DNA ligase
Enzim polimerase DNA dapat menambahkan deoksiribonukleotida ke
rantai pemula, tetapi tidak dapat mengkatalisis penggabungan 2 rantai
DNA. Pada tahun 1967 ditemukan adanya enzim yag mengkatalisis
pembentukan ikatan fosfodiester antara 2 rantai.
5) Enzim girase DNA (”DNA Gyrase”)
- Termasuk topoisomerase tipe II
- Berfungsi membuka supercoiled sebelum replikasi berlangsung
- Mengubah bentuk relax menjadi supercoiled dengan membutuhkan
ATP

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
6) Enzim helicase
Enzim yang membuka putaran segmen DNA tepat di bagian depan
garpu replikasi, disebut enzim helicase. Enzim ini mengikat ATP dan
mengikat rantai tunggal DNA. 
7) Single Strand Binding Protein (SSBP)
Secepatnya setelah rantai terbuka beberapa mol protein tertentu
mengikatkan diri sangat erat untuk menjaga jangan sampai rantai
berdekatan lagi. Enzim ini disebut Helix-destabilizing protein (single
strand DNA binding protein (SSBP). SSBP pada E.coli merupakan
polipeptida yang terdiri atas 177 asam amino. Rantai yang telah
terikat oleh SSBP menjadi kaku dan lurus, tidak ada
lekukan/bengkokan.
8) Enzim primase
DNA beraktivitas dengan arah 5’-3’ (hanya terdiri atas 10
nukleotida). Kemudian pada ujung 3’ ditambahkan
dioksiribonukleosida trifosfat (oleh enzim polimerase DNA III) satu
demi satu sehinga lengkap 1000-2000 nukleotid. Nukleotida pada
RNA pemula/RNA primer dihilangkan/diputus satu demi satu oleh
aktivitas 5’-3’ exonuclease.
2. Perhatikan gambar struktur RNA berikut!

a. Tentukan bagian yang bernomor 1,2,3,4,P,dan Q!

1) Adonine
2) Guanine
3) Urucil
4) Cytosin
P) Phosphate
Q) Ribose
b. Jelaskan struktur RNA!
Jawab :
Berbeda dengan DNA, RNA merupakan rantai tunggal
polinukleotida. Tiap ribonukleotida 
terdiri dari 3 molekul gugus, yaitu gula 5 karbon (ribosa), gugus fosfat,
membentuk punggung RNA bersama ribosa, basa nitrogen, yang terdiri
dari basa purin yang sama dengan DNA sedangkan pirimidin berbeda,
yaitu sitosin dan urasil, dan gugus fosfat.
c. Jelaskan jenis-jenis RNA!
Jawab :
1) RNA genetik, yaitu RNA yang berperan seperti DNA dalam
membawa informasi genetik. RNA tipe ini hanya ada dalam
beberapa jenis virus.

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
2) RNA nongenetik, yaitu RNA yang hanya berperan dalam
proses sintesis protein. RNA tipe ini ada dalam organisme
yang memiliki DNA. Ada tiga macam RNA nongenetik, yaitu:
-RNA duta (mRNA), rantai tunggal panjang yang tersusun atas
ratusan nukleotida. RNA ini terbentuk melalui proses
transkripsi di dalam inti sel oleh DNA. Fungsi dari mRNA
adalah sebagai pembawa kode genetik (kodon) dari inti sel ke
sitoplasma.
-RNA pemindah (tRNA), rantai tunggal pendek yang dibentuk
DNA dalam inti sel kemudian diangkut ke sitoplasma. Fungsi
dari tRNA adalah sebagai penerjemah kodon dari mRNA dan
pengangkut asam-asam amino dari sitoplasma ke ribosom.
3) RNA ribosom (rRNA) memiliki rantai tunggal, tidak
bercabang, serta fleksibel pada ribosom yang berbentuk DNA
di dalam inti sel. Jumlahnya lebih banyak mRNA atau
tRNA. Fungsi dari rRNA adalah sebagai mesin perakit
polipeptida pada sintesis protein.
d. Sebutkan 9 fungsi RNA
Jawab :
1) Perantara antara DNA dan protein dalam proses ekspresi
genetik .Karena ini berlaku untuk semua organisme hidup.
Dalam peran ini, RNA diproduksi sebagai salinan kode urutan
basa nitrogen DNA dalam proses transkripsi. Kode urutan basa
ini tersusun dalam bentuk ‘triplet’, tiga urutan basa N, yang
dikenal dengan nama kodon. Setiap kodon berelasi dengan
satu asam amino (atau kode untuk berhenti), monomer yang
menyusun protein. RNA merupakan bahan genetik universal
sebelum organisme hidup memakai DNA. Fungsi yang sama
dengan DNA, yakni merupakan
2) sebagai molekul genetik yang secara keseluruhan bertanggung
jawab dalam membawa segala materi genetis
3) Bagi virus RNA merupakan bahan genetik dan berfungsi
sebagai penyimpan informasi genetik, sebagaimana DNA pada
organisme hidup lain.
4) RNA berfungsi sebagai enzim (ribozim) yang dapat mengkalis
formasi RNA nya sendiri atua molekul RNA lain.
5) Asam ribonukleat atau RNA berperan sebagai pembawa bahan
genetik dan memainkan peran utama dalam ekspresi genetik.
Dalam genetika molekular, RNA menjadi perantara antara
informasi yang dibawa DNA dan ekspresi fenotipik yang
diwujudkan dalam bentuk protein.
6) didalam RNA terdiri dari fospor dalam bentuk fosfat. Adapun
kandungan fospor terdapat hampir di seluruh bhan makanan
yag mengandung protein seperti ayam, tempe, keju, susu dll.
7) RNAd bertugas atau berfungsi menerima informasi/
keterangan genetik dari DNA. Proses ini dinamakan
Trasnkripsi dan berlangsung dalam sel;
8) RNAp berfungsi mngikat asam amino yang terdapat dalam
sitoplasma. Sebelum dapat diikat oleh RNAp asam amino
bereaksi dahulu dengan ATP (adenosin tripospat) agar

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
berernergi dan aktif. RNAp membawa asam amino yang diikat
itu ke ribosom disinilah berlangsung perubahan informasi
genetik yang dinyatakan oleh urutan basa dari RNAd keurutan
asam amino dalam protein yang dibentuk. Proses ini
dinamakan translasi;
9) RNAr berfungsi mensintesis protein dengan menggunakan
bahan asam amino. Proses ini berlangsung didalam ibosom
dan hasil akhir berupa polipeptida.

e. Jelaskan perbedaan antara DNA dan RNA!

No Parameter DNA RNA

1 Letak Inti sel Inti sel, sitoplasma,
ribosom
2 Bentuk Pita spiral ganda Pita tunggal
3 Fungsi Mengendalikan Sintesis protein
faktor keturunan
dan sintesis protein
4 Basa nitrogen Purin, Adenin, Purin, Adenin,
Guanin, Pirimidin, Guanin, Pirimidin,
Sitosin, timin Sitosin, urasil
5 Komponen gula Deoksiribosa Ribosa
6 Kadar Tidak dipengaruhi Berubah-ubah
oleh kecepatan menurut kecepatan
sintesis protein sintesis protein
7 Ukuran Sangat panjang Pendek

III. KROMOSOM
1. Perhatikan gambar struktur kromosom berikut!

a. Lengkapi struktur kromosom sesuai penomoran!

Jawab :
1. Lokus

2. Matriks
3. Kromiol
4. Sentromer(kinetokor)
5. Benang kromonema
6. Satelit
7. Lengan kromosom
b. Sebutkan 5 fungsi kromosom!
1. untuk menyimpan materi genetik. Materi genetik inilah
yang akan menentukan sifat dan kekhasan setiap individu.

SMAK Giovanni Kupang - 2020

 LKPD/BIO/XII/KD 3.3
2. Menentukan jenis kelamin.
3. Berperan penting dalam proses transkripsi DNA untuk
melakukan sintesis protein. Ini dikarenakan kromosom lah
yang membawa materi genetik seperti DNA.
4. Berperan dalam proses pembelahan sel dan memastikan
masingmasing sel yang telah membelah mendapatkan gen
yang sama.
5. Melakukan replikasi selama pembelahan sel dan
memastikan setiap sel yang membelah mendapatkan gen
yang sama.

c. Perhatikan gambar bentuk kromosom berikut!

Beri nama pada bentuk-bentuk kromosom berikut dan

pengertiannya masing-masing!
a) Metasentrik. Kromosom jenis metasentrik memiliki
panjang lengan yang relatif sama sehingga sentromer
berada ditengahtengah kromosom, seperti pada gambar (a)
b) Submetasentrik. Kromosom jenis submetasentrik memiliki
satu lengan kromosom yang lebih pendek sehingga
membuat sentromer sedikit bergeser dari posisi tengah
kromosom, seperti pada gambar (b)
c) Akrosentrik. Kromosom jenis akrosentrik ini memiliki satu
lengan kromosom yang lebih pendek dibandingkan dengan
kromosom lainnya, seperti pada gambar (c)
d) Telosentrik. Kromosom jenis telosentrik hanya memiliki
satu buah lengan kromosom yang menyebabkan sentromer
berada diujung lengan kromosom, seperti pada gambar (d).

SMAK Giovanni Kupang - 2020