NAMA : LULUK MEILA

NIM : 490316
MATAKULIAH : TAKSONOMI NEMATODA
DOSEN PEGAMPU : Dr. Siwi Indarti, SP,MP

1. Dalam taksonomi nematoda terjadi perubahan besar. Berikan penjelasan

Saudara tentang karakter takson yang digunakan sebagai dasar dalam
klasifikasi nematoda terutama di level Class sampai Ordo pada Filum
Nematoda pada tahun sebelum dan sesudah 2002.
JAWAB :
- Lorenzen (1981, 1994) Lorenzen menganggap nematoda sebagai kelas
dengan dua subkelas, Adenophorea dan Secernentea. Dalam
pembahasannya tentang pembagian Nematoda, Lorenzen menolak
pernyataan Maggenti (1963) bahwa pembagian paling awal tidak terjadi
antara Adenophorea dan Secernentea, tetapi antara Enoplia dan
Chromadoria.
- Pada tahun 1986, selama kuliah undangan untuk menghormati
pengunduran diri Dewey Raski, saya mempertahankan dan
memperdebatkan pandangan tersebut, mengusulkan bahwa filum
Nematoda harus dibagi menjadi dua kelas, Enoplea dan Chromadorea,
yang terakhir termasuk nematoda secernentian. Pandangan ini
selanjutnya disebarluaskan dalam Kursus Nematologi Internasional di
Universitas Ghent dan kadangkadang disebut dalam Coomans et al.
(1996) dan Coomans (2000). Setelah analisis kladistik, Adamson (1987)
sampai pada kesimpulan serupa, tetapi menggunakan nama Enoplea dan
Rhabditea.
- De Ley dan Blaxter (2001) telah melakukan upaya yang patut dipuji
dalam mengusulkan klasifikasi dari semua taksa monofiletik yang
diketahui (mungkin) sampai ke tingkat famili, berdasarkan data
molekuler dan morfologi. Ini terdiri dari dua kelas, Enoplea dan
Chromadorea. Enoplea dibagi menjadi subkelas Enoplia, dengan tiga
ordo (Enoplida, Triplonchida dan Trefusiida) dan subkelas
Dorylaimia, dengan delapan ordo (Dorylaimida, Mononchida,
Isolaimida, Dioctophymatida, Muspiceida, Marimermithida,
Mermithida dan Trichinellida). Chromadorea dibagi lagi menjadi sub
kelas Chromadoria, dengan tujuh ordo (Desmoscolecida,
Chromadorida, Desmodorida, Monhysterida, Araeolaim ida, Plectida
dan Rhabditida).
- Salah satu perbedaan paling radikal dari klasifikasi sebelumnya
adalah bahwa semua spirurid dan semua tylench termasuk dalam
ordo Rhabditida, menurunkan posisi hierarki mereka dalam sistem ke
tingkat yang lebih sesuai dengan sejarah filogenetik mereka daripada
posisi mereka yang sebelumnya ditentukan secara antroposentris.

2. Menurut Saudara pendekatan mana yang perlu dilakukan dalam mempelajari

sistematika nematoda? Karakter-karakter apa saja yang digunakan dalam
setiap penggolongan takson di tingkat Famili dengan contoh 3 famili yang
berbeda.
Jawab :
a. Pendekatan yang perlu dilakukan dalam mempelajari sistematika
nematoda dengan menganalisi secara morfologi dan morfometri,
kemudian bisa dengan pendekatan menganalisis dengan berbasis DNA
dan bisa melakukan pendekatan dengan metode berbasis protein.
b. Karakter-karakter yang digunakan dalam setiap penggolongan takson
ditingkat famili dengan 3 contoh family yang berbeda :
Karakter Family Tylenchidae :
- Stylet kecil, Kerangka labial halus , Bukaan amphid dari kecil hingga
memanjang, sinuousoid atau lurus, memanjang ke belakang secara
longitudinal; median bulb spindle berbentuk, kecil, halus atau bulat,
berotot; kelenjar esofagus tersusun simetris, piriform; ekor memanjang,
panjang banyak yang umumnya dianggap sebagai karakter leluhur
(Qing dan Bert, 2017).
Karakter family Pratylenchidae:
-  Tubuh ramping, seperti cacing hingga sangat bengkak. 
- Daerah bibir rendah, kurang dari 0,5 diameter cincin
bibir basal ; umumnya dengan kurang dari lima annules
- Kerangka cephalic berkembang dengan baik, terutama lempeng
basal. 
- Phasmid terletak di daerah ekor. 
- Ekor umumnya lebih dari dua diameter tubuh dubur. 
- Stylet kuat, tetapi pendek, kurang dari 2,5 kali lebih panjang dari
diameter annulus daerah bibir basal.
- Postcorpus overlapping
-  Kelenjar esofagus tumpang tindih dengan usus, umumnya di bagian
perut (pengecualian: beberapa Pratylenchoides ). 
- Jantan  caudal alae peloderan . 
- Betina dengan satu atau dua cabang genital (ketika salah satu
cabang posterior adalah kantung postuterine).
- Rahim berbentuk kolom terdiri dari tiga baris sel. 
- Dimorfisme seksual dapat terjadi, baik alat makan jantan berhenti
tumbuh atau betina mungkin bersakrat.
-  Endoparasit obligat dari akar tanaman yang lebih tinggi, baik parasit
yang bermigrasi atau menetap.
Ref: Maggenti, dkk. (1987), H. Ferris

Karakter family criconematidae :

- Badannya berbentuk silindris. 
- Kutikula tebal, tidak memiliki bidang lateral yang khas (kadang-kadang
ditandai dengan ketidakteraturan pada annuli tubuh dan/atau garis
longitudinal superfisial yang sangat bervariasi dalam spesies yang
sama). 
- Anulus tubuh baik mundur, dilengkapi atau tidak dengan lobasi,
krenasi, sisik atau duri, atau bulat dan ditutupi atau tidak dengan
lapisan ekstra-kutikuler. 
- Area labial berbentuk beragam; lobus submedian tidak ada atau
berkembang secara bervariasi. Sklerotisasi labial kuat. 
- Stylet masif; kerucut lebih panjang dari alas plus kenop; kenop stylet
berbentuk jangkar atau miring ke belakang. 
 - Isthmus sangat pendek; bola kelenjar esofagus berkurang secara
nyata.

3. Jika suatu tanaman didiagnosis terserang nematoda dan Saudara diminta

untuk melakukan identifikasi sampai level/ tingkat spesies. Tahapan-tahapan
apa yang akan Saudara lakukan.
JAWAB:
Tahapan identifikasi nematoda samai tahap spesies :
a. Pengambilan sample nematoda dari bagian tanaman yang terserang
b. Melakukan ekstraksi sample dan isolasi nematoda
c. Melakukan pendekatan berbagai macam identifikasi seperti dengan
melakukan identifikasi secara morfologi dan morfometri terlebih dahulu
yang meliputi pengukuran panjang tubuh total, panjang stylet, panjang
esofagus, panjang ekor dari ujung posterior sampai anus, diameter tubuh
anterior, diameter tubuh maksimum, diameter tubuh posterior, melakukan
pengamatan dengan melihat sidik pantatnya, melihat pola anulasi nya,
bidang lateral line nya dan juga mengamati morfologi nya dengan SEM
agar lebih jelas.
d. Melakukan pendekatan secara molekuler atau berbasis DNA untuk
memastikan jenis spesies dari nematoda yang ditemukan

4. Jelaskan prosedur yang perlu dilakukan dalam menyiapkan manuskrip

publikasi untuk “spesies baru nematoda “. Data-data apa yang perlu Saudara
disiapkan
JAWAB :
Prosedur yang perlu dilakukan dalam menyiapkan manuskrip publikasi untuk
“spesies baru nematoda” :
a. Menyiapkan tanaman yang terinfeksi nematoda
b. Melakukan pengambilan sample
c. Melakukan ekstraksi dan isolasi
d. Melakukan pengolahan nematoda yaitu dengan fiksasi
e. Melakukan identifikasi baik secara
- morfologi dan anatomi : melihat secara spesifik ciri nematoda dewasa
baik yang jantan maupun yang betina, bentuk stylet, kemudian posisi
esophagus ( 2 atau 3 bagion , overlapping atau tidak), posisi vulva (60-
90%), spikula, ovarium testis, anulasi, bentuk bibir, melihat karakter
sidiq pantat, bentuk ekor dan juga melihat garis lateral line dan
jumlahnya yang digunakan sebagai dasar salah satu karakter morfologi
nematoda.
- Morfometri : mengukur panjang tubuh, lebar tubuh, panjang stylet,
diameter vulva, panjang esophagus, dll
- metode biokimia
- metode berbasis PCR untuk memastikan karakter DNA SPESIFIK
DARI SPESIES TSB.