PROGRAM MAGISTER (S2)

FAKULTAS BIOLOGI
UNIVERSITAS GADJAH MADA

UJIAN TENGAH SEMESTER GENAP T.A. 2022-2023

MATAKULIAH METODE PENELITIAN BIOLOGI BIMB202101/BIMB202170

Hari, Tanggal : Rabu, 12-04-2023

Nama : Amelia Nurma Hidayah
RuangUjian : Ruang 6 - Ujian 1
DosenPenguji : Hari Purwanto, PhD NIM : 22/508511/PBI/01885
No.
Presensi : 9

Waktu : Jam 08.00-10.00

Tanda
Closed book
tangan :
Petunjuk:
Jawablah soal dengan menggunakan dokumen word. Bila menggunakan excel dalam menjawab,
insertkan spreadsheet dalam word. Kirim balik ke Simaster sebelum waktu ujian berakhir. Dilarang
membuka program lain selain laman Simaster, Word dan Excel.

Bobot
PLO/
Dukungan
No. Soal CPM
CPMK/
K
poin
Pengampu: Hari Purwanto, PhD
Jawablah pertanyaan berikut secara singkat dan padat.
Masing-masing jawaban bernilai 20 poin

1. Mengapa untuk meneliti suatu fenomena biologi tertentu, peneliti

menggunakan organisme model yang relatif terbatas jenisnya.? Misal E. coli,
Saccharomyces cerevisiae, Arabidopsis thaliana, Drosophila melanogaster,
tikus putih, mencit, babi.
 Peneliti menggunakan organisme model yang relatif terbatas jenisnya
karena ada beberapa keuntungan dan kemudahan dalam menggunakan
organisme model yang telah banyak diteliti sebelumnya.
 Pertama, organisme model tersebut telah banyak diteliti sehingga informasi
mengenai genom, sistem biologi, dan interaksi dengan lingkungan telah banyak

Soal ujian ini telah diverifikasi oleh: Tanggal Tandatangan

(……………………………………...) (……………………………….) (…………………………….)

 tersedia. Hal ini mempermudah peneliti untuk memahami dasar-dasar biologi
organisme tersebut.
 Kedua, organisme model seringkali memiliki siklus hidup yang pendek dan
mudah untuk dipelihara dalam laboratorium. Hal ini memungkinkan peneliti
untuk melakukan banyak percobaan dalam waktu yang relatif singkat, dan
dengan demikian mempercepat kemajuan penelitian.
 Ketiga, organisme model seringkali memiliki kemampuan untuk mereplikasi
dan bereproduksi dengan cepat, yang memudahkan peneliti untuk melakukan
percobaan pada banyak individu dalam waktu yang relatif singkat.
 Keempat, organisme model seringkali memiliki kejelasan filogenetik dan
hubungan evolusioner yang baik dengan organisme lain. Hal ini
memungkinkan peneliti untuk mengekstrapolasikan hasil penelitian pada
organisme model ke organisme lain yang lebih kompleks.
 Beberapa organisme model yang populer diantaranya Escherichia coli (E. coli)
untuk studi mikrobiologi, Saccharomyces cerevisiae untuk studi biologi sel dan
genetika, Arabidopsis thaliana untuk studi biologi tumbuhan, Drosophila
melanogaster untuk studi biologi perkembangan dan genetika, tikus putih dan
mencit untuk studi biologi kedokteran, serta babi untuk studi biologi biomedis .

2. Dengan analagi memanah/menembak sasaran, jelaskan arti dari akurasi dan

presisi.
Akurasi mengukur sejauh mana hasil pengukuran mendekati nilai yang
sebenarnya atau target yang diinginkan, sedangkan presisi mengukur
sejauh mana hasil pengukuran terpisah satu sama lain atau seberapa
dekat nilai-nilai yang diukur dengan satu sama lain.
Jadi, dengan analogi memanah, akurasi mengacu pada seberapa benar
suatu pengukuran atau tembakan dari target yang diinginkan, sedangkan
presisi mengacu pada seberapa konsisten atau reproduktif hasil
pengukuran atau tembakan tersebut atau sejauh mana hasil tembakan
terpisah satu sama lain.
Akurasi dan presisi sangat berperan penting dalam dunia ilmiah untuk
memastikan bahwa hasil yang diperoleh dapat diandalkan dan dapat
diulangi. Jika hasil pengukuran memiliki akurasi dan presisi yang tinggi,
maka tingkat kesalahan atau ketidakpastian (error) akan berkurang dan
hasil pengukuran lebih kredibel dan dapat dipercaya.
3. Jelaskan apa yang anda ketahui tentang tiga prinsip utama rancangan
percobaan: randomisasi, replikasi, serta reduksi derau (noise reduction). Beri
ilustrasi.
 Randomisasi atau pengacakan merupakan pengalokasian perlakuan secara
acak ke dalam unit percobaan untuk menghindari adanya rancu data
akibat perlakuan dan efek lain yang tidak diketahui.
 Replikasi merupakan kegiatan yang dilakukan dengan tujuan untuk
mengukur variasi alami antara unit percobaan yang ada untuk
meningkatkan tingkat akurasi.
 Reduce noise atau reduksi derau yaitu dengan mengontrol atau
mengendalikan sebanyak mungkin kondisi dalam percobaan dengan
mengelompokkan unit percobaan yang sejenis ke dalam suatu blok yang
sama.
Ilustrasi dari tiga prinsip utama dalam rancangan percobaan adalah sebagai
berikut: Seorang peneliti ingin menguji efektivitas dua jenis pupuk pada
pertumbuhan tanaman jagung. Peneliti menggunakan rancangan percobaan acak
terkontrol, dengan menempatkan setiap perlakuan pupuk secara acak pada
kelompok tanaman jagung yang berbeda. Setiap kelompok tanaman jagung
diukur setiap minggu selama empat minggu, dan pengukuran diamati oleh dua
orang peneliti yang berbeda. Setelah empat minggu, data dihitung dan dianalisis
dengan statistik. Dalam hal ini, randomisasi dilakukan dengan menempatkan
pupuk secara acak pada kelompok tanaman jagung yang berbeda, replikasi
dilakukan dengan mengukur setiap kelompok tanaman jagung setiap minggu
selama empat minggu, dan reduksi derau dilakukan dengan memastikan
lingkungan laboratorium terkontrol dan pengukuran dilakukan secara akurat dan
konsisten oleh dua orang peneliti yang berbeda.

4. Bila anda berniat untuk mendapatkan konfirmasi adanya suatu patogen pada
organisme tertentu, sementara anda menduga prevalensi patogen tersebut amat
sangat rendah di populasi, berapa banyak sampel yang anda butuhkan sehingga
anda memiliki kemungkinan yang cukup besar untuk menemukan organisme
yang terserang patogen tersebut?
Semakin rendah prevalensi sebuah penyakit di suatu populasi maka semakin
rendah peluang munculnya penyakit tersebut di populasi, sehingga diperlukan
data dengan jumlah sampel yang banyak untuk dapat menemukan kasus
kejadian penyakit tersebut.
 Ukuran minimum sampel dapat ditentukan dengan menghitung varian sasaran,
kekuatan uji statistik yang dilakukan dan tingkat konfidensi yang diharapkan.
Ukuran minimum sampel yang akan diambil dapat dicari dengan perhitungan
menggunakan rumus P= X/n.
5. Seorang peneliti telah selesai melakukan penelitian efek beberapa jenis pupuk
(P1-P6) terhadap pertumbuhan tanaman padi yang dilihat dari tinggi tanaman
(cm) 2 bulan setelah perlakuan. Dari data berikut, buktikan hipotesis bahwa
paling tidak ada satu pupuk yang mampu meningkatkan pertumbuhan tanaman.
Apakah data yang diperoleh sudah dapat diandalkan?

Ulangan Kontrol P1 P2 P3 P4 P5 P6
1 89.8 84.4 64.4 75.2 88.4 56.4 65.6

2 93.8 116.0 79.8 62.4 90.2 83.2 79.4

3 88.4 84.0 88.0 62.4 73.2 90.4 65.6

4 112.6 68.6 69.4 73.8 87.8 85.6

6.

JAWABAN SOAL NOMOR 5

Treatment
Replicate P1 P2 P3 P4 P5 P6
1 84.4 64.4 75.2 88.4 56.4 65.6
2 116 79.8 62.4 90.2 83.2 79.4
3 84 88 62.4 73.2 90.4 65.6
4 68.6 69.4 73.8 87.8 85.6
Yi 353 301.6 273.8 339.6 315.6 210.6 Y.. 1794.2
1888 14911.0
∑Yi^2 32341.32 23075.76 9 29017.68 25602.72 8 Yij^2 143837.6

1. Tuliskan hipotesis untuk diujikan

H0 jika μ1 = μ2 = μ3 atau pemberian pupuk tidak memberikan pengaruh yang signifikan terhadap
pertumbuhan tanaman
HA jika μ1 = μ2 ≠ μ3 atau μ1 ≠ μ2 = μ3 atau μ1 = μ2 ≠ μ3 atau pemberian pupuk memberikan
pengaruh yang signifikan terhadap pertumbuhan tanaman

2. Hitung Correction Factor (CF)

2
Y 2 (1794.2)
CF= = = 134131.4017
rt 6(4 )

3. Cari total SS
Total SS = ∑ Yij^2 = (23)2 + ….. + (39)2 – CF
 = 143837.6 - 134131.4017
= 9706.158

4. Menghitung treatment SS (TRTSS)

Yi2 - CF
TRTSS =∑
r
3532 + …… 210.62 –
= 134131.4017
4 3
=
7020.098

5. Menghitung Eror SS
Eross SS = Total SS – Teatment SS
= 9706.158 – 7020.098
= 6382.09

6. Melengkapi tabel ANOVA

Sumber Variasi Df SS MS Fhit

Treatment (t-1) = 5 7020.098 1404.02 9.40871
Error t(r-1)=18 2686.06 149.2256
Total rt-1=23 9706.158

7. Cari Tabel F value 0,05 dan 0,01

F0.05;5,18 = 2.77
F0.01;5,18 = 4.25

8. Buat Kesimpulan

0 2.77 4.25 9.40871

 Karena Fhit (9.40871) > Ftabel (2.77) maka Ho (µ1 = µ2 = µ3) ditolak dan HA (μ1 = μ2 ≠ μ3 atau
μ1 ≠ μ2 = μ3 atau μ1 = μ2 ≠ μ3) diterima pada tingkat kepercayaan 95%
 Karena Fhit (9.40871) > Ftabel (4.25) maka Ho (µ1 = µ2 = µ3) ditolak dan HA (μ1 = μ2 ≠ μ3 atau
μ1 ≠ μ2 = μ3 atau μ1 = μ2 ≠ μ3) diterima pada tingkat kepercayaan 99%
 Karena HA (μ1 = μ2 ≠ μ3 atau μ1 ≠ μ2 = μ3 atau μ1 = μ2 ≠ μ3) diterima maka dapat disimpulkan
bahwa setidaknya ada satu pemberian pupuk yang berpengaruh signifikan terhadap pertumbuhan
tanaman.