Halo, saya Rafi Rashid.

Pada bagian ini, Anda akan diperkenalkan dengan berbagai masalah

yang perlu ditangani agar kita dapat mencapai pembangunan berkelanjutan. Microbiomes
relevan untuk memahami masalah ini serta merancang solusi potensial. Solusi ini akan dibahas
di bagian terpisah. Dalam dua video pertama dari bagian saat ini, kami mempertimbangkan
peran mikrobioma usus dalam kesehatan dan penyakit manusia. Untuk video pertama ini,
tujuan pembelajaran kami adalah untuk menggambarkan komposisi mikrobioma usus dan
menghargai peran yang dimainkan mikrobioma usus dalam kesehatan manusia. Pada bagian
sebelumnya, kami menghargai fakta bahwa kami tidak sendirian di tubuh kami karena hidup di
dalam setiap manusia adalah triliunan mikroba, yang meliputi berbagai bakteri, archaea, jamur,
protista dan ganggang. Kami juga belajar bahwa usus dan kulit adalah dua lokasi yang menonjol
untuk mikroba. Setiap lokasi memiliki mikrobioma, yang kami definisikan sebelumnya sebagai
komunitas mikroba karakteristik yang menempati habitat yang cukup jelas, yang memiliki sifat
fisiko-kimia yang berbeda. Untuk memahami peran microbiome dalam kesehatan dan penyakit
manusia, langkah pertama adalah mengkarakterisasi microbiome pada individu yang sehat.
Seperti yang Anda pelajari dari Dr. Rohan Williams di video lain, karakterisasi ini dilakukan
dengan mengurutkan penanda taksonomi yang dilestarikan, seperti gen RNA ribosom 16S pada
bakteri. Sekuensing telah mengungkapkan bahwa berbagai organ membawa penghuni mikroba
yang berbeda. Ada mikroba yang hidup di usus, rongga mulut dan saluran urogenital, serta di
kulit. Kelompok mikroba yang paling menarik perhatian dalam penelitian biomedis adalah yang
ada di usus. Mayoritas mikroorganisme yang menghuni manusia berada di dalam usus. Sekitar
500 hingga 1000 spesies bakteri berada di usus setiap orang bersama sejumlah virus, jamur,
dan mikroba lainnya yang belum ditentukan. Bakteri ini sebagian besar termasuk dalam dua
filum utama – Bacteroidetes dan Firmicutes. Dalam biologi, filum adalah tingkat klasifikasi atau
peringkat taksonomi, di bawah kingdom dan di atas kelas. Digarisbawahi dalam kotak ini adalah
contoh bakteri dari dua filum utama yang menghuni perut, seperti Streptococcus, Gemella, dan
Porphyromonas, bersama dengan contoh dari filum lainnya. Usus kecil mengandung
perwakilan lain dari dua filum seperti yang digarisbawahi di sini, seperti Lactobacillus,
Caprococcus, Veillonella, dan Prevotella. Demikian pula, spesies bakteri lain unik untuk usus
besar. Misalnya, Enterococcus, Clostridium, Escherichia, dan Bifidobacterium. Komposisi
mikrobioma usus dipengaruhi oleh beberapa faktor, misalnya, cara melahirkan, dan akses
menyusui membentuk mikrobiota usus bayi. Dan mikrobiota usus matang secara bertahap
selama masa kanak-kanak sebagai respons terhadap paparan lingkungan. Setelah itu,
mikrobiota usus tetap relatif stabil pada akhir masa kanak-kanak, remaja, dan dewasa sampai
penurunan terjadi pada keragaman mikroba pada usia yang lebih tua. Mikrobioma usus
memainkan peran penting dalam pertahanan terhadap patogen, sintesis vitamin dan asam
amino esensial, pelatihan kekebalan inang, pembentukan pembuluh darah di usus, dan nutrisi
inang, termasuk produksi asam lemak rantai pendek yang penting dalam metabolisme energi
inang. Ini membuat mikrobioma usus menjadi organ penting tubuh, yang tanpanya kita tidak
akan berfungsi dengan benar. Untuk lebih memahami peran mikroba usus dalam kesehatan
dan penyakit manusia, para peneliti dari seluruh dunia telah tertarik pada komposisi
mikrobioma usus pada individu yang sehat. Apa yang mereka temukan adalah bahwa
mikrobiota usus cukup beragam dibandingkan dengan situs tubuh lainnya, seperti kulit. Juga,
mereka telah menemukan bahwa konstituen mikrobiota usus, spesies anggota individu
bervariasi dengan genetika inang, paparan lingkungan seperti diet, dan gaya hidup. Jadi, apa
yang membuat mikrobioma usus sehat? Secara umum, keragaman spesies yang besar,
kekayaan gen mikroba yang besar, dan fungsi mikrobioma inti yang stabil membuat
mikrobioma usus yang sehat. Sekarang setelah Anda mengetahui peran mikrobioma usus
dalam kesehatan manusia, kita dapat mengalihkan perhatian kita ke perannya dalam penyakit.
Beberapa penyakit sekarang dianggap dipengaruhi oleh proses dalam mikrobioma usus.
Misalnya, penyakit kardiovaskular, sindrom iritasi usus besar, kanker, multiple sclerosis dan
autisme. Dalam video berikutnya, kita akan berkonsentrasi pada peran mikrobioma usus dalam
penyakit kardiovaskular. Sebagai kesimpulan, saya punya tiga pesan yang dibawa pulang untuk
Anda. Mikrobioma usus didominasi oleh spesies bakteri. Komposisi mikrobioma usus bervariasi
dengan genetika inang, faktor lingkungan seperti diet, dan gaya hidup. Dan, mikrobioma usus
telah dikaitkan dengan penyakit yang mempengaruhi berbagai bagian tubuh. Terima kasih dan
sampai jumpa di video berikutnya.

Halo! Dalam video sebelumnya, Anda belajar tentang peran mikrobioma usus dalam kesehatan
manusia. Kami juga mencatat bahwa beberapa mikroba telah dikaitkan dengan penyakit yang
mempengaruhi berbagai bagian tubuh. Dalam video ini, kita akan mengeksplorasi peran
mikrobioma usus dalam penyakit manusia, khususnya jenis penyakit kardiovaskular yang
dikenal sebagai aterosklerosis. Ada dua tujuan pembelajaran yang ingin kita capai selama
kuliah ini. Mereka harus mempertimbangkan bagaimana mikrobioma usus dikaitkan dengan
aterosklerosis dan untuk menghargai konsep "dysbiosis". Aterosklerosis adalah penyakit di
mana plak menumpuk di arteri Anda. Plak ini mengandung kolesterol, lemak, dan zat lainnya.
Gambar A menunjukkan arteri normal dengan aliran darah normal. Gambar inset menunjukkan
penampang arteri normal. Gambar B menunjukkan arteri dengan penumpukan plak. Gambar
inset menunjukkan penampang arteri dengan penumpukan plak, yang menghasilkan
pengerasan dan penyempitan arteri. Jika arteri koroner tersumbat oleh deposisi plak, serangan
jantung dapat terjadi. Berkat teknologi sekuensing kultur-independen dan bioinformatika,
banyak penelitian terkait mikrobioma usus telah meneliti bagaimana perubahan komposisi
mikrobioma usus dikaitkan dengan berbagai penyakit. Beberapa penelitian sebelumnya
mengungkapkan DNA dari bakteri yang biasanya menjajah usus dan rongga mulut juga hadir
dalam plak aterosklerotik. Misalnya, Firmicutes yang merupakan filum paling melimpah di usus
dan rongga mulut, ditemukan dalam plak. Juga, proporsi Bacteroidetes, filum yang ditemukan
terutama di usus, lebih rendah pada pasien dengan penyakit arteri koroner dibandingkan
dengan individu yang sehat. Meskipun beberapa spesies telah dikaitkan dengan aterosklerosis,
sulit untuk menentukan komunitas mikroba yang benar-benar patogen. Oleh karena itu, istilah
dysbiosis telah digunakan untuk menggambarkan ketidakseimbangan komposisi mikrobiota
dalam keadaan penyakit tertentu. Dysbiosis pada penyakit kardiovaskular, dapat secara
sederhana didefinisikan sebagai komunitas mikroba yang berubah atau terganggu,
dibandingkan dengan keadaan normal. Dengan penyakit kardiovaskular, perubahan komposisi
termasuk penurunan Enterobacter aerogenes dan E. dan peningkatan Faecalibacterium
prausnitzii, spesies Klebsiella, Ruminococcus gnavus, dan spesies Streptococcus. Namun,
perubahan komposisi mikrobiota hanya bersifat asosiatif, sehingga sulit untuk menentukan
apakah perubahan mikroba mendorong keadaan penyakit atau lebih tepatnya didorong oleh
mereka. Dengan kata lain, apakah perubahan komposisi penyebab atau efek penyakit? Jadi,
bagaimana kita bisa secara kausal melibatkan mikrobiota usus pada penyakit kardiovaskular?
Pertimbangkan contoh berikut. Trimethylamine atau TMA adalah metabolit yang diproduksi
oleh anggota mikrobiota usus tertentu dari lemak makanan yang secara kolektif dikenal sebagai
lesitin, yang ditemukan dalam daging merah, unggas, makanan laut, dan telur. Lesitin diubah
menjadi TMA melalui enzim mikroba yang dikenal sebagai TMA lyases. TMA diangkut ke hati
melalui sirkulasi portal di mana ia dengan cepat teroksidasi menjadi TMAO trimetilamina-N-
oksida oleh enzim hati yang disebut monooksigenase yang mengandung flavin atau FMO.
TMAO telah dikaitkan dengan risiko aterosklerosis dalam studi klinis. Percobaan pada hewan
pengerat menunjukkan bahwa pemberian makanan TMAO atau prekursornya menyebabkan
percepatan aterosklerosis, menginduksi agregasi trombosit, dan meningkatkan potensi untuk
membentuk gumpalan darah. Studi-studi ini secara kausal melibatkan peningkatan kadar
TMAO dalam perkembangan aterosklerosis. Temuan menarik ini tentu saja menimbulkan
pertanyaan. Berdasarkan mekanisme ini, dapatkah kita merancang cara-cara baru untuk
mengobati aterosklerosis. Ketika produksi TMA dihambat pada tikus menggunakan inhibitor
enzim yang menghambat enzim yang digunakan oleh bakteri usus untuk mengubah lesitin
menjadi TMA, kadar TMAO dalam darah turun. Akibatnya, penurunan aterosklerosis dan
pembekuan darah diamati. Dengan demikian, inhibitor enzim mikroba dapat melayani peran
masa depan dalam pengobatan aterosklerosis. Pada catatan itu, mari kita akhiri video ini
dengan pesan yang dibawa pulang. Pertama, meskipun mikrobioma usus yang berubah telah
dikaitkan dengan penyakit, kita perlu bergerak melampaui mempelajari asosiasi untuk
mempelajari sebab-akibat untuk menentukan peran mikroba dalam penyakit. Kedua, TMAO
adalah salah satu dari beberapa metabolit yang secara kausal terlibat dalam penyakit
kardiovaskular. Terima kasih.

Unit ini merupakan bagian dari Bagian 3 tentang "Pembangunan Tidak Berkelanjutan", dan
memberikan pengenalan luas tentang bioaerosol, yaitu partikel udara yang berasal dari
biologis. Topik ini didasarkan pada diskusi yang kami lakukan tentang mikrobioma udara di
bagian sebelumnya. Ini akan menjadi garis besar presentasi saya. Kami akan menunjukkan hasil
pembelajaran utama yang dapat Anda harapkan untuk dicapai di akhir diskusi, diikuti dengan
beberapa diskusi tentang beberapa aspek bioaerosol, termasuk sumber, karakteristik, dan
keterkaitan dengan COVID-19. Dalam hal hasil pembelajaran, Anda akan memiliki pemahaman
yang mendalam tentang paparan polusi udara dan masalah kesehatan terkait. Anda akan
meningkatkan pengetahuan Anda tentang dampak lingkungan dan kesehatan dari bioaerosol,
komposisi bioaerosol, sumber bioaerosol, dan akhirnya, pandemi global COVID-19 saat ini dan
peran bioaerosol dalam krisis kesehatan masyarakat ini. Polusi udara adalah masalah
lingkungan global dan menimbulkan risiko kesehatan bagi populasi global. Dari semua polutan
udara, kami memiliki partikel udara atau PM, mendapatkan banyak perhatian akhir-akhir ini
karena dampak kesehatannya yang merugikan, misalnya, polusi udara bertanggung jawab atas
peningkatan penyakit pernapasan dan kematian, yaitu, kematian dini, dan dengan demikian
penurunan harapan hidup. Ukuran partikel atau PM yang berbeda dapat dihirup dan disimpan
ke berbagai bagian sistem pernapasan. Anda akan melihat animasi di slide berikutnya. Semakin
halus PM, semakin dalam PM akan disetorkan. Ada 7 juta kematian dini secara global setiap
tahun yang disebabkan oleh inhalasi PM. Oleh karena itu, paparan PM harus dikontrol
sebanyak mungkin. Paparan terus-menerus terhadap partikel udara dapat menyebabkan efek
kesehatan akut, atau efek kesehatan kronis tergantung pada apa yang kita hadapi, durasi, dan
tempat paparan. Apa itu bioaerosol? Nah, bioaerosol didefinisikan sebagai partikel udara – PM,
atau aerosol yang berasal dari mikroorganisme, tumbuhan atau hewan, yang terkait dengan
asal-usul biologis alami dan buatan manusia. Bioaerosol mencakup tiga jenis utama. Pertama,
mikroorganisme di udara, seperti bakteri, jamur, actinomycetes, archaea, dan virus yang
bersifat patogen atau non-patogen, hidup atau mati. Kedua, metabolit yang dihasilkan selama
kehidupan mikroorganisme dan setelah kematian dan lisis, seperti endotoksin bakteri,
mikotoksin, peptidoglikan dan beta-glukan. Dan ketiga, alergen dan puing-puing tersuspensi
berasal dari tumbuhan dan hewan, seperti serbuk sari, puing-puing tumbuhan, dan fragmen
serangga. Mengapa kita khawatir tentang bioaerosol? Pertama-tama, sebagian besar proporsi
bioaerosol memiliki kemungkinan tinggi untuk dihirup, dan kemudian menembus dan
mengendap pada kedalaman yang berbeda dari sistem pernapasan manusia. Kedua, penelitian
terbaru telah menunjukkan hubungan sebab-akibat antara menghirup bioaerosol dan berbagai
efek kesehatan yang merugikan. Ketiga, penyakit utama yang dapat dibedakan yang terkait
dengan bioaerosol diakui sebagai penyakit menular, penyakit pernapasan, dan kanker. Terakhir,
selain efek pada kesehatan manusia, bioaerosol memiliki fungsi yang menonjol pada koneksi
biogeokimia antara biosfer, litosfer, atmosfer, hidrosfer, dan antroposfer. Bagaimana kita
mendeteksi dan mengkarakterisasi bioaerosol? Dalam hal kelimpahan, komposisi, dan
keanekaragamannya. Nah, bioaerosol telah banyak dipelajari menggunakan kedua teknik
tradisional, misalnya, teknik berbasis budaya, dan teknik lanjutan, misalnya, teknik
biomolekuler. Teknik berbasis kultur dapat digunakan untuk mengkarakterisasi bioaerosol
dengan mengisolasi dan mengidentifikasi mikroorganisme kultur pada media pertumbuhan.
Namun, dengan pendekatan ini, lebih dari 90% mikroba yang ada di lingkungan sulit untuk
dikultur atau tidak dapat dikultur. Selain itu, kuantifikasi mikroorganisme yang dapat dikultur
dan layak dapat menjadi bias saat menggunakan kondisi pertumbuhan yang berbeda.
Keterbatasan ini secara signifikan menghambat pemahaman seluruh komunitas bioaerosol.
Dengan menggunakan alat biomolekuler, kami sekarang memiliki pemahaman yang lebih baik
tentang komposisi dan keragaman komunitas bioaerosol dengan kedalaman dan resolusi tinggi
yang belum pernah terjadi sebelumnya. Secara umum, metode biomolekuler memberikan
wawasan tentang bioaerosol dengan mendeteksi keberadaan asam nukleat dari konstituen
bioaerosol target dan non-target. Di antara teknik molekuler yang ada, sekuensing amplikon
dan sekuensing metagenome adalah dua alat ampuh yang semakin banyak digunakan akhir-
akhir ini. Dengan teknik ini, kita dapat mempelajari dan menggambarkan komunitas bioaerosol.
Namun, optimalisasi kinerja teknik biomolekuler, terutama sekuensing amplikon, tetap menjadi
tantangan. Apa yang kita ketahui tentang komposisi bioaerosol? Berdasarkan teknik molekuler,
kita sekarang memiliki pemahaman yang baik tentang komposisi komunitas mikroba bioaerosol
yang berbeda. Komunitas-komunitas ini termasuk komunitas prokariotik di udara dan
komunitas eukariotik di udara, dan sub-komponennya, seperti bakteri, archaea, spora jamur,
serbuk sari, dan sebagainya, dalam hal kekayaan, keanekaragaman, spesies dominan, patogen
dan alergen. Namun, hubungan dan interaksi antara berbagai komunitas atau sub-komunitas
bioaerosol agak kurang dipahami. Mikroorganisme prokariotik di udara, yang terdiri dari
bakteri di udara dan beberapa jenis archaea, telah menjadi salah satu subjek penelitian
bioaerosol yang paling umum. Dengan ukuran yang lebih kecil dari komponen mikroba udara
lainnya, bakteri dan archaea terutama melekat pada partikel halus, yang mudah dihirup.
Izinkan saya berbagi beberapa informasi tentang komposisi bioaerosol. Komunitas eukariotik
udara mewakili salah satu anggota bioaerosol yang paling melimpah. Di antara komunitas-
komunitas ini, spora jamur dan serbuk sari di udara telah menarik perhatian paling luas. Spora
jamur di udara menyumbang bagian terpenting kedua dari bioaerosol, mengikuti bakteri di
udara. Endotoksin, yang merupakan lipopolisakarida, yang disebut LPS, dalam bentuk murni,
berasal dari membran luar sebagian besar bakteri Gram-negatif dan cyanobacteria. Endotoksin
udara telah mendapatkan perhatian yang cukup besar dalam beberapa tahun terakhir karena
menghirup endotoksin di udara dikaitkan dengan efek kesehatan manusia yang merugikan. Apa
sumber bioaerosol? Secara umum, bioaerosol dapat berasal dari vegetasi, tanah, manusia, air
laut, dan partikel mineral tertentu. Terlepas dari lingkungan luar ruangan, bioaerosol juga
dapat ditemukan di lingkungan dalam ruangan. Sumber umum bioaerosol dalam ruangan
termasuk sistem ventilasi lokal, yang dapat menampung mikroorganisme dalam kondisi operasi
tertentu. Sistem pipa, karena penggunaan air. Tumbuhan, manusia, kita menumpahkan bakteri
dari kulit kita atau mikroba lain saat bersin atau batuk. Hewan peliharaan; sistem pendingin
udara, tergantung pada bagaimana mereka dioperasikan. Tidak semua mikroba di udara
berbahaya bagi kita. Ini adalah sesuatu yang perlu diingat. Sebuah studi komprehensif
dilakukan di Singapura pada komposisi mikroba aerosol menggunakan apa yang disebut teknik
sekuensing generasi berikutnya. Jamur adalah yang paling dominan, terhitung sekitar 82% dari
total komunitas mikroba, diikuti oleh bakteri, yaitu sekitar 15%. Studi ini juga membandingkan
komunitas mikroba di udara tropis dengan ekosistem tropis lainnya seperti laut, air, tanah, dan
manusia, khususnya, usus. Sebagian besar data dan mikrobioma udara tidak ditugaskan untuk
spesies mikroba yang diketahui, karena tidak ada kecocokan yang ditemukan dalam database
yang ada. Hal ini mungkin disebabkan oleh rendahnya jumlah penelitian yang dilakukan pada
mikrobioma udara. Selain itu, kelimpahan dan komposisi komunitas mikroba di udara berbeda
dibandingkan dengan ekosistem lainnya. Sebuah penelitian dilakukan di Beijing, Cina, untuk
menganalisis komunitas mikroba dan partikel udara. Dalam partikel halus dan kasar, bakteri
adalah spesies yang paling dominan, terhitung sekitar 95% dari total komunitas bakteri. Virus
adalah komunitas berlimpah kedua. Spesies seperti E. hadir dalam proporsi yang tinggi. Sebuah
studi baru-baru ini menganalisis kelimpahan dan keragaman gen resistensi antibiotik dalam
partikel udara. Menariknya, mikroorganisme dalam partikel kasar mengandung jumlah gen
resistensi yang lebih tinggi dibandingkan dengan mikroba dalam partikel yang lebih kecil. Juga
di antara 10 kelas resistensi antibiotik yang diuji, penam, kelas antibiotik beta-laktam, adalah
yang paling dominan di kedua jenis partikel udara. Sindrom pernapasan akut parah,
Coronavirus, SARS-CoV-2 menyebabkan COVID-19, seperti yang kita kenal sekarang. Kasus
pertama diidentifikasi pada orang dengan pneumonia di Wuhan, Cina pada akhir Desember
2019. Pada 12 Maret 2020, Organisasi Kesehatan Dunia menyatakan COVID-19 sebagai
pandemi global. Jumlah kasus COVID-19 di seluruh dunia meningkat secara eksponensial tahun
lalu. Sayangnya, paparan virus mematikan ini mengakibatkan sejumlah kematian yang
signifikan. Untuk mengendalikan penyebaran wabah global, langkah-langkah penguncian
diperkenalkan di banyak negara dalam hal membatasi mobilitas manusia, mendorong
telecommuting, menegakkan jarak sosial, dan membuat orang memakai masker. Seperti yang
Anda lihat di slide, atomisasi virus pada manusia muncul dari batuk atau bersin dari orang yang
terinfeksi yang memproduksi virus yang mengandung tetesan, yang berukuran sekitar lebih dari
lima mikrometer, dan aerosol, yang berukuran kurang dari lima mikrometer. Penularan virus
dari orang ke orang terjadi melalui kontak langsung atau tidak langsung, dan rute aerosol atau
tetesan udara. Tetesan besar terutama mengendap di udara ke mobil, orang, kontaminasi
benda, sementara aerosol tersebar secara efisien di udara. Transmisi langsung dan udara
terjadi dalam jarak pendek dan jarak atau waktu yang diperpanjang masing-masing. Virus
udara yang dihirup mengendap langsung ke saluran pernapasan manusia. Bagaimana kita
secara efektif mengurangi paparan manusia terhadap COVID-19? Negara-negara berbeda
dalam implementasi langkah-langkah mitigasi yang efektif. Skenario penularan virus di bawah
jarak jauh, karantina, tindakan isolasi saja, yaitu jalur A, seperti yang Anda lihat pada gambar.
Langkah-langkah dengan jarak, karantina, isolasi, diikuti dengan penutup wajah, diidentifikasi
sebagai jalur B. Dan langkah-langkah dengan penutup wajah simultan, dan jarak, karantina,
isolasi bersama, diidentifikasi sebagai jalur C. Panah putus-putus pendek memberi label
kemungkinan sisa-sisa penularan virus karena keadaan ketika tindakan itu tidak mungkin, atau
tidak dipatuhi, dan atau ketidaksempurnaan ukuran. Selama penguncian, karena banyak orang
tetap berada di dalam ruangan, sangat penting untuk menjaga kontrol ventilasi seefektif
mungkin. Sangat penting untuk memasok udara luar ruangan bersih maksimum ke lingkungan
dalam ruangan dengan meningkatkan perubahan udara per jam atau ACH, tergantung pada
sifat dan hunian lingkungan dalam ruangan. Faktor kunci yang mempengaruhi komposisi dan
kelimpahan bioaerosol adalah, misalnya, kondisi cuaca, terutama suhu, kelembaban relatif, dan
kecepatan angin. Juga, kita perlu mempertimbangkan ukuran partikel dan sumber dari mana
mikroba udara muncul. Jadi, pada akhirnya, izinkan saya meringkas pesan utama yang dibawa
pulang dari unit ini. Paparan komponen biologis partikel udara yang dapat dihirup semakin
memprihatinkan dari sudut pandang kesehatan masyarakat. Karakterisasi bioaerosol dalam hal
keragaman dan komposisinya tetap menjadi tantangan. Penilaian risiko kesehatan mikroba
dengan referensi khusus untuk penyebaran penyakit menular sangat penting, terutama di
lingkungan dalam ruangan yang terbatas. Dan akhirnya, mitigasi paparan polusi udara
partikulat yang efektif diperlukan untuk melindungi kesehatan manusia, mengingat partikel
udara ada di mana-mana, yang berarti mereka ada hampir di mana-mana. Terima kasih. Sampai
jumpa di unit berikutnya, yang akan lebih fokus pada hubungan antara urbanisasi dan
keanekaragaman hayati.

Halo, Nama saya Rohan Williams. Selamat datang di video ini, yang akan memeriksa
keterkaitan antara masalah resistensi antimikroba atau AMR untuk jangka pendek, dan
pengolahan air limbah. Hubungan antara keduanya merupakan ilustrasi dari konsep One
Health, yang berupaya mengembangkan teori dan praktik menjaga kesehatan manusia, hewan,
dan seluruh ekosistem secara keseluruhan secara terintegrasi. Dalam video ini, kami akan
mengulas konsep resistensi antimikroba, dan memahaminya dalam konteks kotoran manusia,
khususnya berfokus pada penyebaran resistensi antimikroba dari ekosistem manusia ke
ekosistem alami dan kemudian kembali lagi. Kami juga akan meninjau konsep One Health, yang
akan menjadi semakin penting ketika umat manusia bergerak lebih dalam ke Antroposen
selama beberapa dekade mendatang. Pengembangan obat antibiotik yang efektif pada
pertengahan abad ke-20 merupakan tonggak utama pengobatan modern, dan mewakili
kemajuan melawan infeksi bakteri yang mengancam jiwa yang telah menjangkiti umat manusia
selama ribuan tahun. Namun, pengobatan infeksi bakteri sekarang semakin kompleks karena
fakta bahwa beragam spesies bakteri patogen tumbuh resisten terhadap obat antimikroba. 20
tahun yang lalu, Organisasi Kesehatan Dunia mengakui resistensi antimikroba sebagai masalah
kesehatan masyarakat global. Resistensi antimikroba berkembang melalui mekanisme evolusi,
sebagai konsekuensi dari mutasi genetik acak yang menyampaikan resistensi terhadap senyawa
antimikroba, di mana obat antibiotik hanyalah salah satu contohnya. Varian genetik semacam
itu akan menyampaikan kebugaran kepada bakteri yang membawanya dalam genom mereka,
dan populasi bakteri tersebut akan memiliki peluang yang lebih baik untuk bertahan hidup dan
berkembang biak. Namun, materi genetik yang menyampaikan resistensi antimikroba juga
dapat dengan mudah ditularkan di antara strain bakteri dan spesies yang berbeda dengan
mekanisme transfer gen horizontal, atau HGT, seperti yang ditunjukkan dalam slide ini. Transfer
gen horizontal membuatnya relatif mudah bagi bakteri yang membawa resistensi mikroba
terhadap obat tertentu untuk mentransfer kapasitas itu ke jenis bakteri lain seperti yang
ditunjukkan pada slide ini. Sementara resistensi terhadap antibiotik diakui segera setelah obat
antibiotik pertama kali diperkenalkan, telah menjadi jelas bahwa perkembangan resistensi
antibiotik bukan hanya masalah yang terkait dengan penggunaan berlebihan atau penggunaan
yang tidak tepat pada manusia. Sejumlah besar antibiotik telah digunakan dalam menjaga
kesehatan hewan yang dibesarkan untuk produksi pangan dan juga untuk mengobati infeksi
pada tanaman pertanian. Hal ini mengakibatkan reservoir besar resistensi antimikroba di
seluruh populasi manusia, hewan dan tumbuhan. Juga jelas bahwa resistensi antimikroba
dapat bergerak di dalam dan di antara ekosistem yang berbeda ini, karena meningkatnya
pergerakan manusia dan hewan, termasuk hewan liar, dan ini diperkuat oleh peningkatan
pembangunan dan industrialisasi di seluruh dunia dalam beberapa dekade terakhir. Beberapa
jalur untuk perbanyakan bakteri resisten antimikroba atau materi genetik antimikroba
ditunjukkan dalam slide ini. Menariknya, juga menjadi jelas bahwa air limbah manusia
merupakan reservoir penting resistensi antimikroba. Ini tidak mengherankan karena kotoran
manusia akan mengandung obat antibiotik yang tidak terdegradasi serta bakteri yang resisten
terhadap obat-obatan tersebut. Yang penting, bioproses pengolahan air limbah dari jenis yang
telah kita bahas sebelumnya dalam kursus ini hanya menghilangkan beberapa, tetapi tidak
semua bakteri resisten ini. Konsekuensi dari ini adalah bahwa air limbah yang diolah akan
mengandung bakteri resisten antimikroba, dan ini dapat menyebar ke lingkungan perairan dan
laut hilir. Konsep ini diuraikan dalam slide saat ini di mana kita melihat lingkungan air hilir yang
beragam yang pada akhirnya akan muncul dengan air yang diolah. Tentu saja, air ini akan
digunakan untuk menopang populasi manusia dan aktivitas pertanian. Ini adalah salah satu
contoh lingkaran umpan balik lingkungan dari lingkungan alam ke populasi manusia dan
hewan, yang selanjutnya akan mempertahankan dan mungkin memperkuat masalah resistensi
antimikroba. Penggunaan metode sekuensing metagenom dari jenis yang dibahas sebelumnya
dalam kursus ini dapat digunakan untuk memantau dan mempelajari terjadinya resistensi
antimikroba pada kotoran manusia, yang akan menjadi "pembacaan" penting untuk
mengevaluasi upaya mengurangi atau menghilangkan sumber polusi biologis. Contoh analisis
semacam itu ditunjukkan di sini. Kami sebelumnya melihat bahwa bioproses pengolahan air
limbah dirancang dengan tujuan utama menghilangkan nutrisi seperti senyawa fosfor dan
nitrogen. Namun, jelas bahwa instalasi pengolahan air limbah sekarang harus berurusan
dengan polutan tambahan, di mana bakteri resisten antimikroba hanyalah salah satu
contohnya. Mengembangkan bioproses fleksibel seperti itu akan menjadi arah penelitian dan
pengembangan yang penting di tahun-tahun mendatang. Masalah ini juga merupakan contoh
bagus dari kompleksitas yang terkait dengan apa yang disebut masalah One Health yang telah
Anda temui sebelumnya dalam kursus ini. Konsep One Health dikembangkan dari pengakuan
keterkaitan ekosistem manusia dan alam. Oleh karena itu, masuk akal untuk mencoba dan
mengembangkan strategi yang menjaga kesehatan populasi manusia, hewan, dan tumbuhan,
dan memang seluruh ekosistem sebagai keseluruhan yang terintegrasi. Konsekuensi dari
kegagalan untuk memperhitungkan tingkat kompleksitas ini sekarang menjadi jelas, dengan
sejumlah penyakit zoonosis yang muncul, seperti HIV dan SARS-CoV-2, tampaknya menjadi
konsekuensi langsung dari pelampiasan berlebihan ekosistem manusia ke dalam ekosistem
alami. Terima kasih atas perhatiannya. Dan saya akan berharap untuk berbicara dengan Anda
lebih lanjut pada waktunya.

5
Dalam segmen video ini, kami akan menunjukkan kepada Anda bagaimana kami memperoleh
urutan genom keseluruhan dari sampel mikrobioma. Kami berada di Singapore Centre for
Environmental Life Sciences Engineering. Kami akan mampir di laboratorium bioreaktor, untuk
melihat contoh komunitas mikrobioma. Kapal ini adalah bioreaktor yang mengandung
mikrobioma. Mikrobioma awalnya diambil sampelnya dari pabrik pengolahan air limbah skala
penuh. Microbiome dari pabrik pengolahan ditempatkan ke dalam pembuluh ini, dan
dipelihara dalam jangka waktu yang lama, biasanya berminggu-minggu, atau berbulan-bulan.
Tabung menyediakan cara untuk memberi makan microbiome dengan bahan kimia dan nutrisi
yang dibutuhkan untuk bertahan hidup dan tumbuh. Tabung-tabung ini juga memungkinkan
kita untuk memantau kondisi keseluruhan komunitas microbiome, dengan mengukur kadar
oksigen, keasaman, dan faktor lingkungan lainnya. Kita dapat secara rutin mengambil sampel
microbiome menggunakan pod akses di sisi bejana reaktor. Biomassa sampel memiliki struktur
flokular. Berdasarkan analisis metagenomik, kita dapat memperkirakan bahwa ada sekitar 200
spesies bakteri dalam microbiome ini. Sebagian besar biomassa diperhitungkan oleh sekitar 10
hingga 15 spesies dominan. Sebelum melakukan sekuensing, biomassa sampel dibawa ke
laboratorium di mana DNA genom diekstraksi. DNA yang diekstraksi dibawa ke laboratorium
biologi molekuler untuk diurutkan. Di laboratorium biologi molekuler ini, DNA yang telah
diekstraksi dari biomassa, diambil sampelnya dari bioreaktor, siap untuk diurutkan. Perangkat
persegi panjang ini akan membantu mengurutkan DNA yang diekstraksi. Perangkat ini adalah
sequencer DNA Minion, diproduksi oleh Oxford Nanopore Technologies. DNA dalam larutan
dimasukkan ke dalam pipet, kemudian disuntikkan ke mesin sekuensing untuk memulai operasi
pengurutan. Trek horizontal menunjukkan pembacaan nukleotida untuk beberapa molekul
DNA. Operasi sekuensing akan berlanjut hingga 2 hari, setelah itu, sekitar 20 hingga 30 miliar
nukleotida DNA akan diurutkan. Setelah menyelesaikan proses sekuensing, data nukleotida
yang dikumpulkan dirakit menjadi seluruh genom. Genom yang dirakit dapat dilihat di sini
sebagai lingkaran bulat. Jika kita masuk lebih dalam ke bagian genom, kita dapat melihat gen
individu. Terima kasih telah meluangkan waktu untuk melihat video ini. Kami berharap
bermanfaat untuk memahami proses di mana kami memperoleh data genom dari sampel
mikrobioma.

Unit ini juga merupakan bagian dari Bagian 3 tentang "Pembangunan Tidak Berkelanjutan", dan
berfokus pada urbanisasi dan dampaknya terhadap keanekaragaman hayati. Istilah "urbanisasi"
mengacu pada perluasan domain kota karena pertumbuhan penduduk. Istilah
"keanekaragaman hayati" atau "keanekaragaman hayati" mengacu pada berbagai kehidupan di
Bumi pada semua tingkatannya, dari gen hingga ekosistem. Dan ini akan menjadi garis besar
presentasi saya. Kami akan menunjukkan hasil Pembelajaran utama yang dapat Anda harapkan
untuk dicapai berdasarkan diskusi tentang topik tertentu yang disusun dalam urutan berikut.
pertumbuhan penduduk dan urbanisasi, manfaat urbanisasi, kerugian urbanisasi, dan akhirnya,
solusi berbasis alam. Dalam hal hasil pembelajaran, Anda akan memahami pentingnya
keanekaragaman hayati dalam konteks keberlanjutan dan hilangnya keanekaragaman hayati di
kota-kota akibat urbanisasi. Selanjutnya, Anda akan mencari cara untuk mendesain ulang kota-
kota yang ada untuk membuatnya lebih ramah lingkungan dan menawarkan solusi berbasis
alam untuk masalah lingkungan yang kompleks ketika dan ketika mereka ada. Sampai sekarang,
kita memiliki sekitar 7,8 miliar orang di planet ini bersaing satu sama lain untuk meningkatkan
standar hidup mereka. Setiap tahun, kami terus menambahkan sekitar 8,3 juta lebih banyak
orang ke populasi Global. Jika tren ini berlanjut, kita akan memiliki sekitar 8,5 miliar orang pada
tahun 2030. Sebagian besar populasi global lebih suka tinggal di kota untuk mencari
kemakmuran ekonomi yang lebih baik. Proyeksi ini adalah bahwa kita akan memiliki sekitar
68% dari populasi global yang tinggal di daerah perkotaan dalam beberapa dekade dari
sekarang. Bagaimana kota akan tumbuh dalam hal lingkungan binaan dengan semakin banyak
orang ditambahkan? Satu, kota dapat tumbuh baik ke luar atau ke atas tergantung pada
seberapa banyak ruang yang tersedia. Kota-kota dengan luas lahan terbatas dapat tumbuh
secara vertikal, menyebabkan kepadatan penduduk yang tinggi. Kota-kota seperti itu akan
menjadi kompak. Kota-kota dengan luas lahan yang cukup tersedia untuk ekspansi ke luar akan
menjadi lebih tersebar. Ada beberapa manfaat yang terkait dengan urbanisasi. Misalnya,
daerah perkotaan adalah platform ekonomi global untuk produksi, inovasi, dan perdagangan,
dan menawarkan peluang signifikan untuk pekerjaan formal dan informal. Selain itu, urbanisasi
telah membantu jutaan orang keluar dari kemiskinan melalui peningkatan produktivitas dan
kesempatan kerja, peningkatan kualitas hidup melalui pendidikan dan kesehatan yang lebih
baik, investasi publik skala besar dan akses ke infrastruktur dan layanan yang lebih baik.
Keanekaragaman hayati mengacu pada berbagai kehidupan di Bumi pada semua tingkatannya
mulai dari gen hingga ekosistem, dan itu mencakup proses evolusi, ekologi, dan budaya yang
menopang kehidupan. Keanekaragaman hayati adalah dasar dari jasa ekosistem yang
kesejahteraan manusia terkait erat. Jadi, konservasinya di kota-kota tetap menjadi tantangan
karena ekspansinya yang cepat. Keanekaragaman hayati penting dalam ekosistem yang dikelola
manusia maupun alami. Keputusan yang dibuat manusia yang mempengaruhi keanekaragaman
hayati mempengaruhi kesejahteraan diri mereka sendiri dan orang lain. Dalam semua jenis
ekosistem, materi yang mengandung siklus nutrisi penting melalui komponen ekosistem yang
hidup dan tidak hidup, seperti yang dapat Anda lihat pada gambar ini. Siklus ini disebut siklus
biogeokimia, yang penting dalam hal keberlanjutan dan jasa ekosistem. Sayangnya, aktivitas
manusia memiliki dampak negatif yang besar pada distribusi materi dalam siklus biogeokimia
karena degradasi lingkungan yang disebabkan oleh polusi. Kerugian utama termasuk ekosistem
yang tidak berkelanjutan, kurangnya vegetasi dalam hal hilangnya keanekaragaman hayati,
masalah kuantitas dan kualitas air, polusi dan masalah kesehatan manusia, polusi suara karena
aktivitas manusia yang intens, masalah terkait perubahan iklim perkotaan, pulau panas
perkotaan, yaitu, kota menjadi lebih hangat daripada lingkungannya, terutama pada malam
hari karena pelepasan panas yang diserap oleh bangunan pada siang hari. Terakhir, polusi
cahaya. Bagaimana kita mendesain ulang kota agar lebih ramah lingkungan? Kita dapat
menggunakan beberapa tindakan ramah lingkungan. Misalnya, pusatkan populasi dalam area
tertentu. Gunakan energi terbarukan sebanyak mungkin. Membangun dan merancang kota
yang berorientasi pada orang. Gunakan energi dan materi secara efisien. Cegah polusi dan
kurangi limbah. Daur ulang, gunakan kembali, dan kompos. Melindungi dan mendorong
keanekaragaman hayati. Promosikan taman kota dan pasar petani. Zona untuk tingkat populasi
yang stabil secara lingkungan. Tren yang muncul di kota-kota yang ramah lingkungan adalah
menjadikannya lebih "biofilik", yang berarti kota menjadi lebih hijau dengan kehutanan kota.
Ini akan memungkinkan kita untuk mencari solusi berbasis alam, masalah kompleks yang
dihadapi kota saat ini. Solusi berbasis alam mengacu pada solusi yang terinspirasi dan didukung
oleh alam yang hemat biaya, sekaligus memberikan manfaat lingkungan, sosial, dan ekonomi,
serta membantu membangun ketahanan. Beberapa solusi berbasis alam yang sudah
diterapkan sedang dieksplorasi di kota-kota ditunjukkan dalam slide ini. Kami akan membahas
beberapa contoh spesifik di bagian selanjutnya, misalnya, retensi stormwater, bioremediasi,
dan sebagainya. Untuk meringkas diskusi ini, ada tiga pesan penting yang dapat dibawa pulang
yang ingin saya soroti. Pertama, sementara urbanisasi memiliki banyak keuntungan dalam hal
skala ekonomi, kepadatan penduduk dan infrastruktur yang tinggi di daerah perkotaan dapat
menyebabkan hilangnya keanekaragaman hayati dan degradasi lingkungan. Kedua, kerangka
umum yang dibahas dalam bagian ini berimplikasi pada pengembangan dan implementasi
strategi di masa depan terkait konservasi keanekaragaman hayati, infrastruktur hijau, dan
pembangunan perkotaan berkelanjutan. Dan terakhir, solusi berbasis alam memiliki potensi
untuk mengatasi berbagai tantangan yang dihadapi daerah perkotaan dan untuk mempercepat
pembangunan perkotaan yang berkelanjutan. Terima kasih. Sampai jumpa di bagian
selanjutnya berurusan dengan solusi berkelanjutan.

Seperti yang mungkin telah Anda sadari pada akhir bagian ini, kita hidup di dunia "masalah
jahat", masalah yang tidak jelas, berubah sepanjang waktu, dan menentang solusi disiplin
tunggal. "Jahat" adalah istilah yang digunakan untuk menggambarkan beberapa masalah yang
paling menantang dan kompleks di zaman kita, seperti kesehatan dan kesejahteraan,
pengelolaan limbah, air bersih dan sanitasi, dan mitigasi perubahan iklim. Ini adalah beberapa
masalah yang sangat perlu ditangani agar kita dapat mencapai pembangunan berkelanjutan.
Kita cenderung berasumsi bahwa mikroba itu "buruk". Bagaimanapun, patogen menyebabkan
penyakit, mencemari air kita dan menjadi semakin resisten terhadap antibiotik. Namun, hanya
sebagian kecil mikroba yang benar-benar patogen. Sebagian besar melakukan banyak fungsi
bermanfaat dalam diri kita dan juga di seluruh dunia. Jadi, apa sebenarnya yang baik tentang
mereka? Mengingat peran mereka yang luas, mikrobioma dapat mendukung solusi untuk
mengatasi masalah jahat. Kami pada dasarnya mencari solusi holistik untuk mencapai
beberapa Tujuan Pembangunan Berkelanjutan lainnya sebagaimana didefinisikan oleh
Perserikatan Bangsa-Bangsa. Pada bagian selanjutnya, kita akan membahas beberapa solusi
untuk masalah ini. Kami juga akan berbagi pemikiran kami tentang bagaimana kami dapat
berjalan bersama untuk mendiagnosis masalah, mengidentifikasi solusi potensial, dan
mengevaluasi hasilnya. Sampai ketemu!