1 TOT Persiapan OSK 2024 BiSelMolMikTek
1 TOT Persiapan OSK 2024 BiSelMolMikTek
(A)K = Kontrol (tidak ada bakteri yang tergores pada kotak putus - putus), P1-P4 = Kandidat probiotik 1-4, a = Streptococcus sp.
(Gram-positif), b = Vibrio sp. (Gram- negatif), c = Bacillus sp. (Gram-positif), d = Salmonella sp. (Gram-negatif).
(B)U = budidaya udang saja, U+V = budidaya udang dengan penambahan Vibrio harveyi, U+V+P1-4 = budidaya udang dengan
penambahan Vibrio harveyi dan kandidat probiotik spesifik P1-4.
A. Kandidat No.1 (P1) menghasilkan senyawa antimikroba yang menghambat bakteri
Gram negatif dan Gram positif.
B. Kandidat No.2 (P2) mampu menurunkan patogenisitas Vibrio sp. tanpa
membunuh mereka.
C. Kandidat No.3 (P3) menghasilkan senyawa antimikroba yang menargetkan
membran luar.
D. Kandidat No.4 (P4) berpengaruh baik terhadap kelangsungan hidup udang dengan
cara menghambat bakteri Gram negatif.
A. Kandidat No.1 (P1) menghasilkan senyawa antimikroba yang menghambat bakteri Gram negatif dan Gram positif.
(A)K = Kontrol (tidak ada bakteri yang tergores pada kotak putus - putus), P1-P4 = Kandidat probiotik 1-4, a = Streptococcus sp.
(Gram-positif), b = Vibrio sp. (Gram- negatif), c = Bacillus sp. (Gram-positif), d = Salmonella sp. (Gram-negatif).
(B)U = budidaya udang saja, U+V = budidaya udang dengan penambahan Vibrio harveyi, U+V+P1-4 = budidaya udang dengan
penambahan Vibrio harveyi dan kandidat probiotik spesifik P1-4.
C. Kandidat No.3 (P3) menghasilkan senyawa antimikroba yang menargetkan membran luar.
(A)K = Kontrol (tidak ada bakteri yang tergores pada kotak putus - putus), P1-P4 = Kandidat probiotik 1-4, a = Streptococcus sp.
(Gram-positif), b = Vibrio sp. (Gram- negatif), c = Bacillus sp. (Gram-positif), d = Salmonella sp. (Gram-negatif).
(B)U = budidaya udang saja, U+V = budidaya udang dengan penambahan Vibrio harveyi, U+V+P1-4 = budidaya udang dengan
penambahan Vibrio harveyi dan kandidat probiotik spesifik P1-4.
Perbedaan antara bakteriosidal dan bakteriostatik berkaitan dengan efek suatu zat atau agen terhadap bakteri. Berikut
adalah penjelasan singkat mengenai keduanya:
1.Bakteriosidal:
1. Definisi: Bakteriosidal merujuk pada kemampuan suatu zat atau agen untuk membunuh bakteri.
2. Aksi: Substansi bakteriosidal mengakibatkan kematian bakteri, biasanya dengan merusak struktur kritis dalam sel
bakteri seperti dinding sel atau membran sel.
3. Contoh: Antibiotik seperti penisilin dan sebagian besar agen antimikroba lainnya yang memiliki efek langsung dalam
membunuh bakteri secara efektif dikategorikan sebagai bakteriosidal.
2.Bakteriostatik:
1. Definisi: Bakteriostatik merujuk pada kemampuan suatu zat atau agen untuk menghentikan pertumbuhan dan
reproduksi bakteri, tanpa membunuh mereka secara langsung.
2. Aksi: Substansi bakteriostatik menghambat pertumbuhan bakteri dengan mengganggu proses vital dalam siklus
hidup bakteri, namun tidak menyebabkan kematian sel.
3. Contoh: Antibiotik seperti tetrasiklin dan kloramfenikol memiliki sifat bakteriostatik; mereka menghentikan
perkembangan bakteri sehingga sistem kekebalan tubuh dapat lebih mudah menangani bakteri tersebut.
Penting untuk dicatat bahwa klasifikasi ini tidak bersifat mutlak, dan beberapa zat atau agen dapat memiliki efek
baktericidal atau bakteriostatic tergantung pada konsentrasi, jenis bakteri yang ditargetkan, dan kondisi lingkungan.
Beberapa agen antimikroba juga dapat memiliki efek baktericidal terhadap beberapa bakteri dan efek bakteriostatic
terhadap yang lain.
D. Kandidat No.4 (P4) berpengaruh baik terhadap kelangsungan hidup udang dengan cara menghambat bakteri Gram negatif.
(A)K = Kontrol (tidak ada bakteri yang tergores pada kotak putus - putus), P1-P4 = Kandidat probiotik 1-4, a = Streptococcus sp.
(Gram-positif), b = Vibrio sp. (Gram- negatif), c = Bacillus sp. (Gram-positif), d = Salmonella sp. (Gram-negatif).
(B)U = budidaya udang saja, U+V = budidaya udang dengan penambahan Vibrio harveyi, U+V+P1-4 = budidaya udang dengan
penambahan Vibrio harveyi dan kandidat probiotik spesifik P1-4.
Mold of Fungi in agar plates
2. Bayangkan Anda sedang mempelajari protein membran yang ditunjukkan dalam diagram di bawah ini. Anda menyiapkan
vesikel buatan yang mengandung protein membran. Vesikel kemudian diperlakukan dengan protease (2) atau
dipermeabilisasi sebelum perlakuan dengan protease (3). Peptida yang dihasilkan selanjutnya dipisahkan menggunakan SDS-
PAGE (sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis).
Protein membran (a, b, c, d, e: domain) dan gel SDS-PAGE (1. kontrol, 2. peptida setelah pemotongan protease, 3. peptida
setelah permeabilisasi dan pemotongan
protease. Panah menunjukkan arah migrasi ).
Nonpolar
Polar
A. Fragmen yang lebih besar di jalur 3 bersifat hidrofilik.
B. Fragmen yang lebih kecil di jalur 2 mewakili domain protein yang menonjol di luar membran.
C. Domain a kaya akan leusin atau isoleusin.
D. Domain a, c dan e menonjol ke dalam lumen vesikel.
b d c
c a e
a e b d
3. Ketika mitokondria terisolasi ditangguhkan dalam buffer yang mengandung ADP, Pi, dan substrat yang dapat teroksidasi, tiga
proses yang mudah diukur terjadi: substrat teroksidasi; O2 dikonsumsi; dan ATP disintesis. Sianida (CN- ) adalah penghambat
lewatnya elektron ke O2 . Oligomisin menghambat ATP sintase dengan berinteraksi dengan subunit F0 . 2,4-dinitrofenol
(DNP) dapat berdifusi dengan mudah melintasi membran mitokondria dan melepaskan proton ke dalam matriks, sehingga
menghilangkan gradien proton.
Konsumsi oksigen dan sintesis ATP di mitokondria. Garis padat menunjukkan jumlah
oksigen yang dikonsumsi dan garis putus-putus menunjukkan jumlah ATP yang disintesis
x x
x x
CN-
x
x
Oligomisin berikatan dengan ATPase, sehingga tidak ada pembentukan ATP.
x
Oligomisin
3. Ketika mitokondria terisolasi ditangguhkan dalam buffer yang mengandung ADP, Pi, dan substrat yang dapat teroksidasi, tiga
proses yang mudah diukur terjadi: substrat teroksidasi; O2 dikonsumsi; dan ATP disintesis. Sianida (CN- ) adalah penghambat
lewatnya elektron ke O2 . Oligomisin menghambat ATP sintase dengan berinteraksi dengan subunit F0 . 2,4-dinitrofenol
(DNP) dapat berdifusi dengan mudah melintasi membran mitokondria dan melepaskan proton ke dalam matriks, sehingga
menghilangkan gradien proton.
Konsumsi oksigen dan sintesis ATP di mitokondria. Garis padat menunjukkan jumlah
oksigen yang dikonsumsi dan garis putus-putus menunjukkan jumlah ATP yang disintesis
C. z adalah DNP.
Rantai transport electron tetap berjalan, namun gradien proton tidak terbentuk.
Pada penambahan DNP, sehingga ATPase tidak dapat membentuk ATP.
x
H+ H+
H+ H+
H+
3. Ketika mitokondria terisolasi ditangguhkan dalam buffer yang mengandung ADP, Pi, dan substrat yang dapat teroksidasi, tiga
proses yang mudah diukur terjadi: substrat teroksidasi; O2 dikonsumsi; dan ATP disintesis. Sianida (CN- ) adalah penghambat
lewatnya elektron ke O2 . Oligomisin menghambat ATP sintase dengan berinteraksi dengan subunit F0 . 2,4-dinitrofenol
(DNP) dapat berdifusi dengan mudah melintasi membran mitokondria dan melepaskan proton ke dalam matriks, sehingga
menghilangkan gradien proton.
Konsumsi oksigen dan sintesis ATP di mitokondria. Garis padat menunjukkan jumlah
oksigen yang dikonsumsi dan garis putus-putus menunjukkan jumlah ATP yang disintesis
1.RNA Tunggal Beruntai (ssRNA): Virus Influenza tipe A memiliki genom yang terdiri dari beberapa segmen RNA
tunggal beruntai. RNA ini bersifat negatif-sense, yang berarti bahwa tidak dapat berfungsi sebagai cetakan
langsung untuk sintesis protein. Sebelum protein virus dapat diproduksi, RNA negatif-sense harus diubah
terlebih dahulu menjadi RNA positif-sense. Proses transkripsi ini rentan terhadap kesalahan, dan ketiadaan
mekanisme perbaikan kesalahan selama replikasi membuat genom virus Influenza A sangat rentan terhadap
mutasi.
2.Replikasi Rentan Kesalahan: Saat virus Influenza A bereplikasi, polimerase RNA virus tidak memiliki
kemampuan untuk memperbaiki kesalahan yang mungkin terjadi selama sintesis untai RNA baru. Akibatnya,
mutasi dapat terakumulasi dengan cepat selama setiap putaran replikasi. Proses replikasi yang rentan kesalahan
ini berkontribusi pada tingkat mutasi tinggi yang teramati pada virus Influenza A.
3.Drift Antigenik: Akumulasi mutasi dalam gen yang mengkode protein virus kunci, seperti hemaglutinin (HA)
dan neuraminidase (NA), menyebabkan drift antigenik. Drift antigenik merujuk pada perubahan bertahap pada
antigen permukaan virus dari waktu ke waktu. Perubahan ini dapat memengaruhi kemampuan virus untuk
menghindari sistem kekebalan inang dan dapat mempengaruhi efektivitas kekebalan yang telah diperoleh
sebelumnya.
Secara ringkas, genom RNA tunggal beruntai negatif dari virus Influenza A, yang dikombinasikan dengan proses
replikasi yang rentan kesalahan, menghasilkan tingkat mutasi yang tinggi. Variabilitas genetik ini berkontribusi
pada adaptabilitas virus, memungkinkannya untuk menghindari respons kekebalan dan potensial menyebabkan
munculnya strain baru dengan sifat antigenik yang berbeda.
4. Genom Influenza A terdiri dari 8 molekul RNA beruntai tunggal terpisah, yang menyandikan total 11 protein virus. Virus
influenza A dikategorikan berdasarkan dua antigen permukaannya, hemaglutinin (H), yang terdiri dari 18 subtipe berbeda
(H1- 18); dan neuraminidase (N), yang mana terdapat 11 subtipe berbeda (N1-11) (Gbr.). Siklus hidup virus influenza A
disajikan pada Gambar.
Virus influenza A: (A) struktur virus dan (B) siklus hidup virus.
A.Penurunan nilai pH dari hari ke-1 ke hari ke-3 hanya disebabkan oleh asam organik yang hanya diproduksi oleh bakteri asam laktat.
B.Asam laktat yang dihasilkan oleh bakteri asam laktat mendukung pertumbuhan sel ragi dari hari ke 10 hingga hari ke 26.
C. Sel-sel ragi bergeser dari fermentasi ke respirasi aerobik setelah hari ke-22.
D. Beberapa jamur berfilamen menunjukkan toleransi terhadap pH rendah.
Kimchi 김치
Kimuchi キムチ
Sauerkraut
sayur asin
5. Sayuran fermentasi laktat adalah makanan tradisional di banyak masakan Asia. Mikroorganisme yang biasa ditemukan dalam
kaldu fermentasi adalah bakteri asam laktat, ragi dan jamur berfilamen. Gambar di bawah ini menunjukkan flowchart
jumlah sel yang layak (log CFU/mL) dari tiga kelompok mikroba yang berbeda dan nilai pH selama fermentasi laktat kubis.
Oksigen terlarut dalam kaldu fermentasi menurun seiring waktu dan habis dikonsumsi setelah 22 hari.
Perubahan mikroflora selama fermentasi asam laktat kubis.
A.Penurunan nilai pH dari hari ke-1 ke hari ke-3 hanya disebabkan oleh asam organik yang
hanya diproduksi oleh bakteri asam laktat.
5. Sayuran fermentasi laktat adalah makanan tradisional di banyak masakan Asia. Mikroorganisme yang biasa ditemukan dalam
kaldu fermentasi adalah bakteri asam laktat, ragi dan jamur berfilamen. Gambar di bawah ini menunjukkan flowchart
jumlah sel yang layak (log CFU/mL) dari tiga kelompok mikroba yang berbeda dan nilai pH selama fermentasi laktat kubis.
Oksigen terlarut dalam kaldu fermentasi menurun seiring waktu dan habis dikonsumsi setelah 22 hari.
Perubahan mikroflora selama fermentasi asam laktat kubis.
C. Sel-sel ragi bergeser dari fermentasi ke respirasi aerobik setelah hari ke-22.
5. Sayuran fermentasi laktat adalah makanan tradisional di banyak masakan Asia. Mikroorganisme yang biasa ditemukan dalam
kaldu fermentasi adalah bakteri asam laktat, ragi dan jamur berfilamen. Gambar di bawah ini menunjukkan flowchart
jumlah sel yang layak (log CFU/mL) dari tiga kelompok mikroba yang berbeda dan nilai pH selama fermentasi laktat kubis.
Oksigen terlarut dalam kaldu fermentasi menurun seiring waktu dan habis dikonsumsi setelah 22 hari.
Perubahan mikroflora selama fermentasi asam laktat kubis.
A. Hydrolysis of ATP by F1 leads to the conformational change of alpha and beta subunits.
B. From the set of figures, the filament rotated anticlockwise (looking from the cytosolic side).
C. Rotary rate is below 0.3 rounds per second.
D. Rotating the actin filament in the opposite direction is coupled with ATP synthesis.
6. F1 subunit (a peripheral membrane protein) of the ATP synthase catalyses ATP synthesis using proton motive force
responsible for the rotation of F0 subunit (integral membrane protein complex) in one direction. F1 is composed of three alpha
and three beta subunits arranged in alternating manner around a central shaft, the gamma subunit. To study the rotation,
Masasuke Yoshida and his team attached a fluorescently labelled actin filament to gamma and watched its movement.
Attachment of labelled actin filament to ATP synthase.
Rotating actin filaments were observed by an inverted fluorescence microscope after
addition of 2 mM ATP into a chamber containing actin-tagged F complex immobilized on
the bottom side as a mirror image formed on a camera. The time interval between images
was 220 ms. A series of 12 images were taken and is shown in Fig.
A.Hydrolysis of ATP by F1 leads to the conformational change of alpha and beta subunits.
Gaya gerak yang memutar subunit gamma dihasilkan dari serangkaian perubahan konformasi pada
subunit F1 yang terkait langsung dengan hidrolisis ATP, mencerminkan perubahan yang terkait dengan
sintesis ATP.
6. F1 subunit (a peripheral membrane protein) of the ATP synthase catalyses ATP synthesis using proton motive force
responsible for the rotation of F0 subunit (integral membrane protein complex) in one direction. F1 is composed of three
alpha and three beta subunits arranged in alternating manner around a central shaft, the gamma subunit. To study the
rotation, Masasuke Yoshida and his team attached a fluorescently labelled actin filament to gamma and watched its
movement. Attachment of labelled actin filament to ATP synthase.
Rotating actin filaments were observed by an inverted fluorescence microscope after
addition of 2 mM ATP into a chamber containing actin-tagged F complex immobilized on
the bottom side as a mirror image formed on a camera. The time interval between images
was 220 ms. A series of 12 images were taken and is shown in Fig.
B. From the set of figures, the filament rotated anticlockwise (looking from the cytosolic side).
Dari kumpulan gambar, filamen diputar berlawanan arah jarum jam. Rotasinya jelas berlawanan arah jarum jam -
tetapi dilihat dari arah yang berlawanan, selain sisi membran dan secara bersamaan sebagai bayangan cermin. Oleh
karena itu, gambar yang dihasilkan berlawanan arah jarum jam.
6. F1 subunit (a peripheral membrane protein) of the ATP synthase catalyses ATP synthesis using proton motive force
responsible for the rotation of F0 subunit (integral membrane protein complex) in one direction. F1 is composed of three alpha
and three beta subunits arranged in alternating manner around a central shaft, the gamma subunit. To study the rotation,
Masasuke Yoshida and his team attached a fluorescently labelled actin filament to gamma and watched its movement.
Attachment of labelled actin filament to ATP synthase.
Rotating actin filaments were observed by an inverted fluorescence microscope after
addition of 2 mM ATP into a chamber containing actin-tagged F complex immobilized on
the bottom side as a mirror image formed on a camera. The time interval between images
was 220 ms. A series of 12 images were taken and is shown in Fig.
D. Rotating the actin filament in the opposite direction is coupled with ATP synthesis.
Putaran filamen aktin searah jarum jam akan dibarengi dengan sintesis ATP. Pada percobaan di atas, hidrolisis
ATP oleh ATPase ketika filamen diputar berlawanan arah jarum jam. Aktivitas ATP sintase harus terjadi ketika
filamen berputar ke arah yang berlawanan, jam.
7. Antifreeze glycoproteins (AFGPs) possess the ability to inhibit the formation of ice and are therefore essential to the survival
of many marine teleost fishes that routinely encounter sub-zero temperatures. A typical AFGP consists of repeating
tripeptide units, the alanyl-threonyl-alanyl (Ala-Thr-Ala)n unit connected to a disaccharide through a glycosidic bond at the
second hydroxyl group of the threonine residue. To identify chemical groups which affect antifreeze activities of this
glycoprotein, scientists synthesized numerous AFGP analogues by modifying both the structure of the sugar moieties and the
peptide by replacing three groups R1 R2 R3 as shown in Fig. with different chemical groups and recorded the antifreeze
activity. The structure of a typical AFGP
The results of the study are shown in the following table.
A.A disaccharide bound to the threonine residue is required for antifreeze activity.
AFGP memiliki aktivitas ketika R3 adalah hidrogen (H), oleh karena itu residu asam
amino yang berikatan dengan disakarida tidak diperlukan untuk aktivitas antibeku.
7. Antifreeze glycoproteins (AFGPs) possess the ability to inhibit the formation of ice and are therefore essential
to the survival of many marine teleost fishes that routinely encounter sub-zero temperatures. A typical AFGP
consists of repeating tripeptide units, the alanyl-threonyl-alanyl (Ala-Thr-Ala)n unit connected to a
disaccharide through a glycosidic bond at the second hydroxyl group of the threonine residue. To identify
chemical groups which affect antifreeze activities of this glycoprotein, scientists synthesized numerous AFGP
analogues by modifying both the structure of the sugar moieties and the peptide by replacing three groups
R1 R2 R3 as shown in Fig. with different chemical groups and recorded the antifreeze activity. The structure
of a typical AFGP
The results of the study are shown in the following table.
B. A mutant that has threonine residues replaced with serine residues reduces
antifeeze activities.
Residu serin dapat membentuk ikatan glikosidik dengan disakarida tetapi tidak memiliki gugus hidrofobik metil (-
CH3). Dalam hal ini R2 adalah FI (lihat tabel) sehingga AFGP tidak memiliki aktivitas antibeku.
7. Antifreeze glycoproteins (AFGPs) possess the ability to inhibit the formation of ice and are therefore essential
to the survival of many marine teleost fishes that routinely encounter sub-zero temperatures. A typical AFGP
consists of repeating tripeptide units, the alanyl-threonyl-alanyl (Ala-Thr-Ala)n unit connected to a
disaccharide through a glycosidic bond at the second hydroxyl group of the threonine residue. To identify
chemical groups which affect antifreeze activities of this glycoprotein, scientists synthesized numerous AFGP
analogues by modifying both the structure of the sugar moieties and the peptide by replacing three groups R1
R2 R3 as shown in Fig. with different chemical groups and recorded the antifreeze activity. The structure of a
typical AFGP
The results of the study are shown in the following table.
Teleost mencakup keragaman ikan yang luar biasa, mulai dari ikan tropis kecil
dan berwarna-warni hingga spesies besar yang penting secara komersial.
Contoh teleost termasuk salmon, trout, tuna, cod, bass, ikan emas, guppy, dan
banyak lainnya. Keberhasilan mereka disebabkan oleh adaptabilitas mereka,
mekanisme pakan yang efisien, dan strategi reproduksi mereka.
Evolusi dan radiasi teleost telah memainkan peran penting dalam keberagaman
dan kelimpahan ikan di ekosistem akuatik di seluruh dunia.
8. Laju translasi mRNA dapat diukur menggunakan elektroforesis gel poliakrilamida natrium dodesil sulfat (SDS-
PAGE). Dalam percobaan ini, mRNA virus mosaik tembakau (TMV), yang mengkode protein 116.000 dalton,
diterjemahkan dalam lisat retikulosit kelinci dengan adanya 35S-metionin. Lisat berisi semua mesin translasi
retikulosit kelinci. SDS-PAGE dilakukan pada sampel yang diekstraksi dengan interval
1 menit. Produk terjemahan terpisah dilihat menggunakan autoradiografi. Polipeptida terbesar yang
terdeteksi menjadi lebih besar seiring waktu, seperti yang ditunjukkan pada gambar di bawah, hingga protein
panjang penuh terlihat sekitar 25 menit.
(Perjalanan waktu sintesis protein TMV dalam lisat kelinci-retikulosit. Berat molekul (kDa) sebagai fungsi
waktu t (menit).)
A. Sintesis protein TMV terjadi pada kelajuan eksponensial yang sebanding dengan waktu.
Laju sintesis protein berbanding lurus dengan waktu.
8. Laju translasi mRNA dapat diukur menggunakan elektroforesis gel poliakrilamida natrium dodesil sulfat (SDS-
PAGE). Dalam percobaan ini, mRNA virus mosaik tembakau (TMV), yang mengkode protein 116.000 dalton,
diterjemahkan dalam lisat retikulosit kelinci dengan adanya 35S-metionin. Lisat berisi semua mesin translasi
retikulosit kelinci. SDS-PAGE dilakukan pada sampel yang diekstraksi dengan interval
1 menit. Produk terjemahan terpisah dilihat menggunakan autoradiografi. Polipeptida terbesar yang
terdeteksi menjadi lebih besar seiring waktu, seperti yang ditunjukkan pada gambar di bawah, hingga protein
panjang penuh terlihat sekitar 25 menit.
(Perjalanan waktu sintesis protein TMV dalam lisat kelinci-retikulosit. Berat molekul (kDa) sebagai fungsi
waktu t (menit).)
B.Dengan massa molekul rata-rata asam amino 110 dalton, kelajuan rata-rata sintesis
protein kira-kira 35 sampai 40 asam amino per menit.
8. Laju translasi mRNA dapat diukur menggunakan elektroforesis gel poliakrilamida natrium dodesil sulfat (SDS-
PAGE). Dalam percobaan ini, mRNA virus mosaik tembakau (TMV), yang mengkode protein 116.000 dalton,
diterjemahkan dalam lisat retikulosit kelinci dengan adanya 35S-metionin. Lisat berisi semua mesin translasi
retikulosit kelinci. SDS-PAGE dilakukan pada sampel yang diekstraksi dengan interval
1 menit. Produk terjemahan terpisah dilihat menggunakan autoradiografi. Polipeptida terbesar yang
terdeteksi menjadi lebih besar seiring waktu, seperti yang ditunjukkan pada gambar di bawah, hingga protein
panjang penuh terlihat sekitar 25 menit.
(Perjalanan waktu sintesis protein TMV dalam lisat kelinci-retikulosit. Berat molekul (kDa) sebagai fungsi
waktu t (menit).)
D. mRNA mungkin mengandung lebih dari dua kodon langka dalam urutannya.
9. Mikroorganisme yang hidup pada konsentrasi garam tinggi (di atas 2M NaCl) dipaparkan
ke media dengan aktivitas air rendah, dan harus memiliki mekanisme untuk
menghindari kehilangan air melalui osmosis. Analisis konsentrasi ion intraseluler
Halobacteriales yang hidup di danau garam menunjukkan bahwa mikroorganisme ini
mempertahankan konsentrasi garam (KCl) yang sangat tinggi di dalam selnya. Kehadiran
konsentrasi garam intraseluler yang tinggi membutuhkan adaptasi khusus dari protein
dan makromolekul sel lainnya.
A.Sebagian besar protein intraseluler Halobacteriales mengandung banyak asam amino
bermuatan di permukaan luarnya.
B. Halobacteriales menghabiskan banyak ATP untuk mempertahankan tekanan
osmotik.
C.Sebagian besar enzim intraseluler Halobacteriales kehilangan aktivitas katalitiknya
ketika disuspensikan dalam larutan yang mengandung kurang dari 1 M NaCl.
D.Pada Halobacteriales, asam amino dapat diimpor melalui antiporter Na+/asam
amino.
Fotosintesis pada Halobacterium salinarum, sejenis archaeon, cukup berbeda dengan fotosintesis yang terjadi pada
tumbuhan dan cyanobacteria. Halobacterium salinarum dikenal karena adaptasinya terhadap lingkungan ekstrem,
khususnya kondisi hipersalin. Berikut adalah gambaran sederhana dari proses fotosintesis pada Halobacterium
salinarum:
1.Pigmen Rhodopsin: Halobacterium salinarum tidak mengandung klorofil seperti tumbuhan, melainkan menggunakan
pompa proton yang dijalankan oleh cahaya yang disebut bakteriorodopsin. Bakteriorodopsin adalah jenis pigmen
rhodopsin yang tertanam dalam membran sel.
2.Penyerapan Cahaya: Bakteriorodopsin menyerap energi cahaya, khususnya pada daerah spektrum hijau dan biru.
Penyerapan ini menyebabkan perubahan konformasi dalam pigmen tersebut.
3.Pompa Proton: Setelah menyerap cahaya, bakteriorodopsin mengalami serangkaian perubahan struktural yang
menghasilkan transportasi aktif proton (ion H⁺) melintasi membran sel. Proses ini menghasilkan gradien proton melintasi
membran.
4.Sintesis ATP: Gradien proton yang dihasilkan oleh pompa proton yang dijalankan oleh cahaya digunakan untuk
menghasilkan ATP. Ini dicapai melalui proses yang dikenal sebagai sintesis ATP kemosmotik, mirip dengan mekanisme
yang diamati pada mitokondria selama respirasi sel.
5.Fiksasi Karbon: Berbeda dengan tumbuhan dan cyanobacteria, Halobacterium salinarum tidak memperbaiki karbon
dioksida melalui siklus Calvin yang konvensional. Sebagai gantinya, ia menggunakan sumber karbon organik untuk
kebutuhan karbonnya.
Penting untuk dicatat bahwa proses fotosintesis pada Halobacterium salinarum adalah jenis fotosintesis berbasis
bakteriorodopsin, yang berbeda dari fotosintesis berbasis klorofil yang ditemukan pada tumbuhan dan cyanobacteria.
Adaptasi terhadap kondisi salin ekstrem dan penggunaan bakteriorodopsin menunjukkan keragaman mekanisme
fotosintesis yang luar biasa pada berbagai organisme.
9. Mikroorganisme yang hidup pada konsentrasi garam tinggi (di atas 2M NaCl) dipaparkan
ke media dengan aktivitas air rendah, dan harus memiliki mekanisme untuk
menghindari kehilangan air melalui osmosis. Analisis konsentrasi ion intraseluler
Halobacteriales yang hidup di danau garam menunjukkan bahwa mikroorganisme ini
mempertahankan konsentrasi garam (KCl) yang sangat tinggi di dalam selnya. Kehadiran
konsentrasi garam intraseluler yang tinggi membutuhkan adaptasi khusus dari protein
dan makromolekul sel lainnya.
Banyak ATP digunakan untuk mempertahankan konsentrasi garam (KCl) yang sangat
tinggi di dalam sel mereka dan juga untuk ekstrusi Na+ dari sel.
9. Mikroorganisme yang hidup pada konsentrasi garam tinggi (di atas 2M NaCl) dipaparkan
ke media dengan aktivitas air rendah, dan harus memiliki mekanisme untuk
menghindari kehilangan air melalui osmosis. Analisis konsentrasi ion intraseluler
Halobacteriales yang hidup di danau garam menunjukkan bahwa mikroorganisme ini
mempertahankan konsentrasi garam (KCl) yang sangat tinggi di dalam selnya. Kehadiran
konsentrasi garam intraseluler yang tinggi membutuhkan adaptasi khusus dari protein
dan makromolekul sel lainnya.
B. Ketika konsentrasi HSCoA intraseluler tinggi, laju sintesis PHB akan meningkat.
C. Ketika laju sintesis PHB meningkat, laju pertumbuhan sel eutropha Ralstonia juga akan meningkat.
Laju pertumbuhan sel Ralstonia eutropha akan menurun karena sebagian besar Asetil-
KoA masuk ke jalur sintesis PHB.
10. Poli(3-hidroksibutirat) (PHB) adalah intermediat cadangan bakteri yang diakumulasikan oleh berbagai
bakteri, biasanya ketika tumbuh di bawah batasan nutrisi seperti oksigen, nitrogen, fosfat, belerang, atau
magnesium dan dengan adanya kelebihan karbon. Gambar. menunjukkan jalur sintesis PHB Ralstonia
eutropha dari asetil-KoA, yang diatur oleh penghambatan umpan balik. Selain itu, asetil-KoA dapat
memasuki siklus asam sitrat.
Asetoasetil-KoA reduktase dirangsang oleh rasio NADPH+H+/NADP yang tinggi dan konsentrasi NADPH+H+ yang tinggi.