METABOLISME NUKLEOTIDA

dr. Bambang prijadi,MS

LAB. BIOKIMIA – BIOMOL FKUB

1
PENDAHULUAN :

■ Nukleotida purin dan pirimidin adalah senyawa

heterosiklis yang sangat penting dalam tubuh.

■ Nukleosida dan nukleotida merupakan derivat dari

basa purin dan pirimidin ; sebagai unsur pembangun
untuk asam nukleat( DNA, RNA )dan juga berfungsi
dalam melaksakan reaksi esensial dalam
metabolisme.

2
 NUKLEOTIDA PURIN dan PIRIMIDIN :
 Molekul intra sel
 Berperan dalam berbagai proses biokimiawi :
> Pra zat DNA / RNA
> Sebagai sumber energi tinggi  ATP, cAMP,
GTP, UDP-Glu.
> Sebagai KOENZIM : FAD, NAD, NADP.

BASA PURIN dan PIRIMIDIN :

 Senyawa heterosiklik
 Komponen dalam nukleotida / nukleosida
 STRUKTUR PURIN & PIRIMIDIN :
6 7
4
5
N1
3N 5
2 8
4 2 6
3 N N9
N1
PURIN PIRIMIDIN

CONTOH Basa PURIN : - ADENIN - XANTIN

- GUANIN - HIPOXANTIN

CONTOH Basa PIRIMIDIN : -SITOSIN - TIMIN

-URASIL
 BASA PURIN
NH2 O2
6 N 6 N
1N 1 N

4 2 4
H2N
N N 9 N N 9
H H
ADENIN GUANIN
O2 O2
N N
HN HN

O
N N N N
H H H
HIPOXANTIN XANTIN
 O
CH2 O CH2
N N
H2C
N
N

O O
N N
N N
CH2 CH2
KAFEIN ( 1,3,7-trimetil xantin ) TEOBROMIN ( 3,7-dimetil xantin )

H2C N

O TEOFILIN ( 1,3-dimetil xantin )

N N
CH2
 BASA PIRIMIDIN
NH2 O

CH3
3N 5 3 HN 5

O O
NH 1 O 1NH

SITOSIN TIMIN
HN

O
NH
URASIL
 BASA PURIN yang lain :
H3C CH3
N CH3
O
6 N 6 N
1N 1H N

4 2 4
H2N
N N 9 N N 9
H
DIMETILAMINADENIN 7-METILGUANIN

BASA PIRIMIDIN yang lain :

NH2 NH2
CH2 CH2OH
N
N

O O
N
H N
H
5-METILSITOSIN 5-HIDROKSIMETILSITOSIN
NUKLEOSIDA :
* BASA PURIN / PIRIMIDIN

IKATAN β-N-GLIKO-
* GULA PENTOSA SIDA pada N9 / N1
(RIBOSA / DEOKSI RIBOSA)

ADENOSIN = ADENIN + D-RIBOSA, dg ikataan pada N9

GUANOSIN = GUANIN + D-RIBOSA, dg ikataan pada N9

SITIDIN = SITOSIN + D-RIBOSA, dg ikataan pada N1

URIDIN = URASIL + D-RIBOSA, dg ikataan pada N1
 NH2
RIBONUKLEOSIDA
N O
N
N
1N

N 9 H2N
N
N N 9
O O
51 11 HO
HOH2C-C CH 51 11
H H H O
C C
OH OH NH2 OH OH
ADENOSIN GUANOSIN HN

N
O
O O N 9

N 1 HO
HO O 11
SITIDIN
11 URIDIN
OH OH
OH OH
NUKLEOTIDA :
 NUKLEOSIDA + gugus FOSFAT

□ ADENOSIN MONO FOSFAT = AMP = AS. ADENILAT

= ADENIN + RIBOSA + FOSFAT

□ TIMIDIN MONO FOSFAT = TMP = AS. TIMIDILAT

= TIMIN + 2-DEOKSIRIBOSA + FOSFAT

□ URIDIN MONO FOSFAT = UMP = AS. URIDILAT

= URASIL + RIBOSA + FOSFAT
 NH2
NH2
N
N
N N

N N 9 N N 9
O
O
O O O O
5’ 1’
P P 5’ 1’
O O O O
OH OH
OH H

AMP dAMP
( Asam adenilat ) ( Asam 2’deoksi-adenilat )
 O O

HN CH3
HN

O O
N 1 N 1
O O O O
O O
5’ 1’ P 5’ 1’
P
O O
O O OH H
OH OH

UMP TMP
( Asam Uridilat ) ( Asam Timidilat )
 NH2
N
N ADENOSIN

N N 9
CH2 O
1’
0 O O O
RIBOSA
HO – P – O – P– O – P
HO OH
O O O

Adenosin 5’-monofosfat ( AMP )

Adenosin 5’-difosfat ( ADP )

Adenosin 5’-trifosfat ( ATP )

 NUKLEOSIDA NUKLEOTIDA
BASA ( BASA + RIBOSA / ( BASA + RIBOSA /
DEOKSIRIBOSA ) DEOKSIRIBOSA +
FOSFAT )
ADENIN ADENOSIN AMP, ADP, ATP
A A
GUANIN GUANOSIN GMP, GDP. GTP
G G
SITOSIN SITIDIN CMP, CDP, CTP
C C
URASIL URIDIN UMP. UDP, UTP
U U
TIMIN TIMIDIN TMP, TDP, TTP
T T
POLINUKLEOTIDA = ASAM NUKLEAT
☻ Asam organik yang ada didalam inti sel / nukleus ,
bergabung dengan protein  nukleoproetein.
☻ MACAMNYA : > DNA = ASAM DEOKSI RIBO NUKLEAT
> RNA = ASAM RIBO NUKLEAT
☻ Merupakan gabungan / rangkaian dari banyak
nukleotida, yang satu sama lain dihubungkan dengan
ikatan diester fosfat  polimer nukleotida

 c1 dari gugus gula berikatan dengan N 9 / N1

dari basa purin atau pirimidin .

 ikatan nukleotida satu sama lain berhubungan
melalui ikatan diester fosfat antara c3 dari gugus
gula pertama dengan c5 dari gugus gula berikutnya.
 METABOLISME
NUKLEOTIDA PURIN & PIRIMIDIN :
 KONSUMSI NUKLEOTIDA KEBANYAKAN BERUPA
NUKLEOPROTEIN.
 MANUSIA MAMPU MENSINTESIS NUKLEOTIDA SECA
RA DE NOVO DARI SENYAWA AMFIBOLIK.
PENCERNAAN NUKLEOTIDA PURIN dan PIRIMIDIN :
■ NUKLEOTIDA PURIN dan PIRIMIDIN DIPECAH
OLEH ENZIM-ENZIM DALAM Tr. DIGESTIVUS.
■ HASIL AKHIRNYA :
NUKLEOTIDA PURIN ASAM URAT
NUKLEOTIDA PIRIMIDIN CO2, NH3 ASAM β- ISOBUTIRAT
NUKLEOPROTEIN MAKANAN
enzim protyeolitik & DNA ase & RNA ase

POLINUKLEOTIDA ( ASAM NUKLEAT ) PROTEIN

Polinukleotidase

( MONO ) NUKLEOTIDA
Nukleotidase & fosfatase

NUKLEOSIDA + FOSFAT
nukleosidase
PURIN dan PIRIMIDIN + PENTOSA
( RIBOSA / DEOKSIRIBOSA )

ASAM URAT CO2 + NH3 + ASAM-β-ISOBUTIRAT

 SUMBER NUKLEOTIDA

Ada 3 sumber utama nukleotida :

1. Sintesis de novo
2. Salvage pathways
3. Ekstraseluler/ diet
BIOSINTESIS PURIN :
CO2 PERNAPASAN

SUMBER ATOM-ATOM PURIN : 6

C GLISIN
7
ASPARTAT N
1C 5C 8 N5N10METE-
N10-FORMIL- NIL TETRA-
C HIDRO FOLAT
TETRA-HIDRO-
FOLAT 2C 4C 9
N
3
N
Amida dari GLUTAMIN
REAKSI SINTESIS PURIN :
1. PEMBENTUKAN FOSFORIBOSIL PIRO FOSFAT = PRPP
ATP AMP
RIBOSA-5-P 5-FOSFORIBOSIL-1-PIRO FOSFAT
PRPP - SINTASE
( PRPP )
PRPP JUGA PRAZAT UNTUK PIRIMIDIN, NAD dan NADP

2. PEMBENTUKAN 5-FOSFO- β –RIBOSILAMIN :

 GLUTAMIN GLUTAMAT
H20 PPi
PRPP 5-FOSFO- β -RIBOSIL AMIN
PRPP-GLUTAMIN AMIDO TRANSFERASE

ATP AMP
3. 5-FOSFO- β -RIBOSIL AMIN + GLISIN GLISIN AMIDA
GAR-SINTASE
Metenil-tetra RIBOSIL-5-FOSFAT ( GAR )
hidro folat Tetra hidro folat
4. GLISIN AMIDA RIBO- FORMIL GLISIN AMIDA
RIBOSIL FOSFAT
SIL-5-FOSFAT (GAR) GAR FORMIL TRANSFERASE
( FGAR )
GLUTAMIN
GLUTAMAT
5. FORMIL GLISIN AMIDA FORMIL GLISIN AMI DIN
RIBOSIL FOSFAT
RIBOSIL FOSFAT (FGAR)
ATP ADP
H2O
6. FORMIL GLISIN AMIDIN AMINO IMIDAZOL RI-
BOSIL-5-FOSFAT
RIBOSIL FOSFAT ATP ADP
 CO2
7. AMINO IMIDAZOL RIBO- AMINO IMIDAZOL KARBOK-
SIAMIDA RIBOSIL-5 P
SIL -5-FOSFAT
H2O
8. AMINO IMIDAZOL KARBOK- AMINO IMIDAZOL SUK-
SINIL KARBOKSI RIBO-
SIAMIDA RIBOSIL-5 P
SIL-5-P
ASPARTAT
9. AMINO IMIDAZOL SUKSI- AMINO IMIDAZOL KARBOK
SIAMIDA RIBOSIL-5-P
NIL KARBOKSI RIBOSIL-5-P
FUMARAT
N10Formil tetra
Tetra hidro
hidro folat
folat
10. AMINO IMIDAZOL KARBOK FORMIMIDO IMIDA-
ZOL ARBOKSIAMI-
SIAMIDA RIBOSIL-5-P
DA RIBOSIL-5-P
11. FORMIMIDO IMIDAZOL INOSIN MONO
KARBOKSIAMIDA RIBOSIL-5-P FOSFAT ( IMP )

SELANJUTNYA IMP DIUBAH MENJADI AMP dan GMP

 (12) (13)
IMP ADENILO SUKSINAT AMP
AMPS-SINTASE ADENILO SUKSINASE
NAD+ ( AMPS )
(14) H2O
IMP-DEHIDROGENASE
NADH +
GLUTAMAT
H+
GLUTAMIN
XANTOSIN MONO FOSFAT GUANOSIN MONO
ATP (15) FOSFAT ( G M P )
( XMP )

SENYAWA / OBAT YANG DAPAT MENGHAMBAT SINTESIS PURIN :

. ANTI FOLAT REAKSI 4 ( TETRA HIDRO FOLAT )
. AZASERIN REAKSI 5
. DIAZANORLEUSIN REAKSI 2
. 6-MERKAPTOPURIN REAKSI 13 & 14
. ASAM MIKOFENOLAT REAKSI 15
BIOSINTESIS PURIN :
PERUBAHAN IMP ke AMP dan GMP :
KATABOLISME PURIN :
HASIL AKHIR KATABOLISME PURIN ADALAH ASAM URAT.
± 99 % ASAM URAT MERUPAKAN HASIL PEMECAHAN OLEH
ENZIM NUKLEOSIDA PURIN FOSFORILASE .
REAKSINYA :
ADENOSIN GUANOSIN
PURIN NUKLEOSIDA
ADENOSIN FOSFORILASE
DEAMINASE
INOSIN GUANIN

GUANASE
PURIN NUKLEOSIDA OKSIDASE

HIPOXANTIN XANTIN
XANTIN OKSIDASE
XANTIN OKSIDASE

ASAM URAT
( SUKAR LARUT AIR )
 Arthritis Na-Urate
Stone crystal

Na-Urate
Allopurinol

Na+
NH3

H2O + O2 H2O2 H2O + O2 H2O2

Xanthine Xanthine oxydase

oxydase

KATABOLISME PURIN
 KATABOLISME PURIN

• PRODUK AKHIR KATABOLISME PURIN PADA

MANUSIA ADALAH ASAM URAT.
• PADA MAMALIA TERTENTU MEMPUNYAI ENZIM
URAT OKSIDASE, YANG MENGKATALISIS URAT
MENJADI ALLANTOIN YANG LEBIH MUDAH LARUT.

• ASAM URAT DIBENTUK TERUTAMA DIDALAM LIVER

DAN DIEKSKRESIKAN OLEH GINJAL KEDALAM
URINE.
CLINICAL ASPECT

Ca-Mammae Lips-Ca

Condyloma Ca-Penis
 KELAINAN METABOLISME PURIN :
KATABOLISME NUKLEOSIDA PURIN ( ADENOSIN dan GUANOSIN )
PRODUK AKHIRNYA : ASAM URAT URINE
ASAM URAT : Asam lemah & sukar larut dalam air; dalam cairan tubuh
dapat berupa garam ( Na urat ).
garam Na urat bersifat lebih larut dari pada asam urat, yang juga
dibuang melalui urine.
KRISTALISASI GARAM Na URAT DAPAT TERJADI DI :
. GINJAL   BATU
. JARINGAN LUNAK & PERSENDIAN  ENDAPAN 
TOFUS   INFLAMASI AKUT / KRONIS :
ARTHRITIS GOUT AKUT dan
ARTHRITIS GOUT KRONIS.
SELAIN PENYAKIT GOUT, JUGA TERDAPAT KELAINAN LAIN dari
METABOLISME PURIN : LIHAT TABEL
HIPERURISEMIA = KADAR ASAM URAT SERUM MELEBIHI BATAS
. NORMAL
gout

Severe
Gouty tophi
CLINICAL ASPECT
Synthesis purine (De novo)
diazanorleucine

azaserine
 6-mercaptopurine

mycophenolic acid
 TABEL : KELAINAN BAWAAN PADA METABOLISME PURIN.
KELAINAN ENZIM YANG KARAKTERISTIK KELAINAN POLA PE-
KLINIS CACAT KLINIS WARISAN
GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -
SEKRESI PURIN TERKAIT X
GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -
SEKRESI PURIN TERKAIT X
GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER KEMUNGKIN-
SEKRESI PURIN AN RSESIF X

GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -

SEKRESI PURIN TERKAIT X

SINDROM LESCH - HGPRT-ASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -

NYHAN SEKRESI PURIN ; SELF MUTA- TERKAIT X
TION
DEFISINSI IMUN ADENOSIN DE- IMUNO DOFISIENSI KOMBI- RESESIF -
AMINASE NASI ( SEL T & B ) AUTOSOMAL
NEFROLITIASIS ADENIN FOSFO NEFROLITIASIS 2,8-DEHI – RESESIF -
RIBOSILTRANSF DROKSI ADENIN AUTOSOMAL
XANTINURIA XANTIN OKSI- NEFROLITIASIS XANTIN, RESESIF -
DASE HIPOXANTIN AUTOSOMAL
BIOSINTESIS PIRIMIDIN :
PADA BIOSINTESIS PURIN dan PIRIMIDIN TERDAPAT BEBERAPA
PRECURSOR YANG SAMA, YAITU PRPP, GLUTAMIN, CO2 & ASPARTAT
REAKSINYA :
KARBAMOIL-P SINTASE II
1. CO2 + GLUTAMIN + ATP KARBAMOIL-P
ASPARTAT TRANSKARBAMOILASE
2. KARBAMOIL-P + ASPARTAT KARBAMOIL-ASPARTAT
DEHIDRO OROTASE
3. KARBAMOIL-ASPARTAT AS. DEHIDRO OROTAT
( DHOA )
DEHIDROGENASE
4. AS. DEHIDRO OROTAT + NAD+ ASAM OROTAT
OROTAT FOSFO RIBOSIL TRANSFERASE
5. ASAM OROTAT + PRPP OROTIDIN MONOFOSFAT
( OMP )
CO2
6. OROTIDIN MONOFOSFAT URIDIN MONOFOSFAT ( UMP )
OROTODILAT DEKARBOKSILASE
 ATP ADP ATP ADP GLUTAMIN

7. UMP UDP UTP CTP

CTP SINTASE REDUKTASE
NADPH + H+
CTP SINTASE REDUKTASE

NADP+
H2O Pi Metilen H4folat Folat

d UDP d UMP TMP

TIMIDILAT
SINTASE
BIOSINTESIS PIRIMIDIN
Methotrexate :Menghambat fungsi Dihidrofolat reduktase
KATABOLISME PIRIMIDIN :
HASIL AKHIRNYA adalah CO2, NH3 dan ASAM β-
AMINO BUTIRAT, YANG MUDAH LARUT.
SITOSIN TIMIN

NH3

URASIL DIHIDROTIMIN
NADPH + H+
NADP+
DIHIDROURASIL β-URIDOISOBUTIRAT

H2O
ASAM UREIDOPROPIONAT
H2O
ALANIN
β- AMINO BUTIRAT

CO2 + NH3
 KELAINAN METABOLISME PIRIMIDIN :
▪ HASIL METABOLISME PIRIMIDIN BERSIFAT SANGAT LARUT DALAM AIR

▪ OVER PRODUKSI KATABOLIT PIRIMIDIN JARANG MENIMBULKAN

KELAINAN KLINIS

ASIDURIA ASAM OROTAT TIPE I :

> DIFISAIENSI OROTAT FOSFORIBOSILTRANSFERASE
dan atau OROTIDILAT DEKARBOKSILASE

ASIDURIA ASAM OROTAT TIPE II :

> DEFISIENSI OROTIDILAT DEKARBOKSILASE
> LEBIH RINGAN DIBANDING DENGAN TIPE I
> DAPAT DIATASI DENGAN PEMBERIAN URIDIN ORAL
NUKLEOTIDA ALAMIAH :
NUKLEOTIDA BEBAS  YANG TIDAK TERIKAT DENGAN ASAM NUKLEAT;
BANYAK TERDAPAT DIJARINGAN TUBUH, a.l. :
DERIVAT ADENOSIN :
@ ADP = ADENOSIN DIFOSFAT
@ ATP = ADENOSIN TRIFOSFAT
@ c AMP = 31-51–ADENOSIN MONOFOSFAT
ATP cAMP AMP
Adenilat sikllase fosfo diesterase
@ S-ADENOSIN METIONIN  SEBAGAI DONOR METIL
DERIVAT GUANIN : GDP. GTP, GMP.
DERIVAT URASIL : @ URIDIN DIFOSFOGLUKOSA ( UDP-GLUKOSA )
@ URIDIN DIFOSFOGLUKORONAT ( UDP-GLUKORONAT)
@ UTP
DERIVAT VITAMIN : @ FLAVIN DINUKLEOTIDA = FAD
@ NIKOTINAMID ADENIN DINUKLEOTIDA = NAD
@ NIKOTINAMID ADENIN DINUKLEOTIDA FOSFAT = NADP
DERIVAT SINTETIK :
* 5-YODO-2’-DEOKSI URIDIN
* 5-FLUORO MURASIL
* 6-MERKAPTO PURIN
* 6-TIOGUANIN
* AZAURIDIN
* AZAGUANIN
SELAMAT BELAJAR SEMOGA SUKSES