UNIVERSITAS PRIMA INDONESIA

(UNPRI)

“BIOKIMIA KLINIK”
(1)
“Sintesis, Replikasi dan perbaikan DNA” Sabtu,
(2)
05 Oktober
“Struktur dan fungsi RNA, sintesis RNA” 2019
(3)
“Proses modifikasi RNA”
PROGRAM STUDI MAGISTER SAINS BIOMEDIK
 Mengenal,,,menilik,,,mengenang,,,memahami sifat
dan kedirian manusia dari sisi zat kimia penyusun nya
Prof. Dr. Ramlan Silaban, M.Si.

Referensi :
1. Lehninger, Chapter-8 halaman 273- 305
2. Lehninger, Chapter-26 halaman 995 -- Sabtu;
3. Harper, Bagian V, halaman 304 - 415 13 Okt-2018
4. Lainnya
PENGANTAR KULIAH

Mengapa Saudara mengikuti Program

Magister Sain Biomedik ini ???

Ingin menjadi DOSEN dan

atau KLINISI atau PRAKTISI ?

Dimohon respon dari mahasiswa,,,

 Okkk,,,jika demikian halnya Bapak Ibu,
kita mulai saja Perkuliahannya ya

Di Slide berikut ini, ada Perintah untuk Bapak Ibu

laksanakan,,,
1/26/2020 4
 Bapak minta Semua mahasiswa berdiri, coba
cari pasanganmu kiri dan atau kanan lalu kalian
saling berhadapan :
Pandang lah pasangan berhadapanmu, berkenalan, tanya
siapa namanya, sekitar 1 menit, lalu anda duduk :
1. Tuliskanlah nama pasangan berhadapan mu, lalu
deskripsikanlah sifatnya
2. Lanjutkan hal yang sama, deskripsikanlah karakternya
3. Mengapa “sifat dan karakter” antar manusia berbeda
4. Apakah “sifat” seseorang dapat berubah
5. Bagaimanakah “sifat” itu diwariskan,,,,
Kertas kerja :
Dari pernyataan dan pertanyaan di atas, buatlah suatu tulisan, Bapak
tunggu dalam 5 hari ini sebelum pertemuan berikut, lalu kirimkanlah
ke email bapak : drrsilabanmsi@yahoo.co.id.
Pada pertemuan berikut, akan bapak minta dipaparkan.
 Sifat dan karakter manusia :

1. Ada dalam 2 bentuk : Genotif dan Fenotif

2. Bagaimana fenotif muncul dari genotif
3. Kloning, adalah salahsatu bentuk atau teknik
memperbaharui sifat

1/26/2020 Prof. Ramlan Silaban 6

 Sifat dan Karakter

1. Apakah sifat (gen) itu

2. Apakah karakter itu
3. Dapatkah anda medeskripsikan keduanya yang
anda miliki?
4. Apakah sifat dapat diubah
5. Apakah karakter dapat diubah?
6. Hakekat pendidikan adalah “ mengubah karakter

1/26/2020 Prof. Ramlan Silaban 7

 REKAYASA GENETIKA
Pemahaman tentang konsep dasar DNA sebagai
pembawa informasi genetik, pada akhirnya melahirkan
sub disiplin ilmu baru dari disiplin ilmu genetika, genetika
molekuler.

Kehadirannya melengkapi sub disiplin yang lainnya

seperti: genetika formal, genetika populasi, genetika
klinik, dan pelayanan konsultasi genetika.

Genetika molekuler berbicara banyak tentang:

DNA sebagai pembawa informasi genetik;
Struktur DNA, replikasi, dan reparasi; Konsep dasar
transkripsi dan translasi; Konsep dasar kode genetik,
gena, dan mutasi; sertaProf.rekayasa
1/26/2020 Ramlan Silaban
genetika. 8
 Struktur dan biokimia
Bahan Genetik
Lechninger;
Chapter 8, halaman 273 --
dan
Chapter-22 halaman 862 –
Bacalah Buku tersebut sesuai pembagian tugas (lebih bagus
jika diskusi) , diberikan waktu 30 menit,,, tuliskanlah
rangkuman atau intisarinya dalam Buku Catatan mu,,,, jika
ada yang mau menjelaskan ke depan,,,silahkan
(1)
“Sintesis, Replikasi dan perbaikan DNA” Akan
(2) dimulai
“Struktur dan fungsi RNA, sintesis RNA” setelah
(3) slide 47
1/26/2020 “ProsesProf.modifikasi
Ramlan Silaban RNA” 9
No NIM Nama No Tugas
1 193307040021 Gabriella Cynthia 1
2 193307040022 Darwin 2
3 193307040023 Kistia Maryanti 3
4 193307040024 Eka Syafrida 1
5 193307040025 Herdesti Berliani Bago 2
6 193307040026 Muhammad Fadli 3
7 193307040027 Gilbert Lister 1
8 193307040028 Hedya Nadhrati Surura 2
9 193307040029 Novita Rachmasari 3
10 193307040030 Fina Ansisfa Panggabean 1
11 193307040031 Nur Iman Waruwu 2
12 193307040032 Agnes Fany Cahyani Hura 3
13 193307040033 Timotius Agung Soripada 1
14 193307040034 Devi Ardila 2
15 193307040035 Tri Lestari Simangunsong 3
16 193307040036 Lusi Veronika Sinaga 1
17 193307040037 Wulan Dhari 2
18 193307040038 Welly Ria Utami Lubis 3
No NIM Nama No Tugas
19 193307040039 Cory Oriensia Siahaan 1
20 193307040040 Yuyun Permata Arnaz 2
21 193307040041 Shafira Ramadhani 3
22 193307040042 Agung Adha Witasa Dewana 1
23 193307040043 Sahriyal Siregar 2
24 193307040044 Risyad Rizki Maulidi 3
25 193307040045 Winly Felicia 1
26 193307040046 Nico Marcelino 2
27 193307040047 Gempita Cahaya Aulia Tambunan 3
28 193307040048 Kania Indryani Fauhan 1
29 193307040049 Felicia Kurnia 2
30 193307040050 Elisabeth Chindy Clara De Fatima 3
31 193307040051 Muhammad Chairul Wahyu 1
32 193307040052 Wenti Aggraeni 2
33 193307040053 Nirwana Sembiring 3
 What is Biochemistry and Biomolecules ?

• Chemical reaction and its aspect on live

• Synthesing or analysing
• Compose or decompose
• On the cell or out of the cell
• Endergonic or exergonic
• Explain Biomolecules and its aspect
All reaction catalysis by enzyme

26/01/2020 Prof Ramlan Silaban 12

 Kedirian Bahan Genetik

 The property of the living cells explain in two form :

genotive and fenotive
 Nucleic acids is a genotive
 Protein is the fenotive, and expressed from genotive
via tri genetics expression process, those are
replication, transcription and translation
 Protein is the macromolecules, composed by amino
acids
 There are 20s amino acids which able to compose
protein or peptides via peptide bonds

1/26/2020 Prof. Ramlan Silaban 13

What is the Cell and Chromosome ?
• Atom : the smallest unit of the matter
• Cell : the smallest unit of the living organism
• Cell consist some organelles (organella)
• Dalam Inti Sel, ada Kromosom
• Chromosome : adalah Bahan Genetik dimana
terdapat DNA
• Ada 3 jenis bahan genetik : DNA; RNA; Protein

26/01/2020 Prof Ramlan Silaban 14

 Sel sebagai tempat Bahan Genetik

1/26/2020 Prof. Ramlan Silaban 15

 Biokimia Bahan Genetik

DNA :
- Biomolecule
- Genotive
- Composed by nucleotides
(G,A,T,C) PROTEIN :
- Macromolecule
RNA :
- Fenotive
- Macromolecule
- Composed by amino
- Genotive
acids (there are 20s
- Composed by nucleotides amino acids composing
(G,A,U,C) protein)
1/26/2020 Prof. Ramlan Silaban 16
There are 6 reactions composing genetics material in
living cell and catalysed by enzymes
Classification Type of reaction catalyzed

Oxidoreductases Oxidation-reduction reaction

Transferases Transfer of functional groups

Hydrolases Hydrolisis reaction

Lyases Group elimination to form double

bonds
Isomerases Isomerization

Ligases Bond formation coupled with ATP

hydolysis
26/01/2020 Prof Ramlan Silaban 17
 Lingkupan Sain Biomedik ANTIAGING
Pengaruh : internal dan eksternal

BIOKIMIA
Mikrobiologi
BIOKIMIA BIOMEDIK
FISIOLOGI

-
Biomolekul :
Karbohidrat
Proses kimia Farmakologi
- Lemak Aplikasi dalam
-
-
Protein
Asam Nukleat
kehidupan manusia Fisiologi
- Vitamin

Anatomi
 MATERIAL GENETIK DAN PROSES EKSPRESINYA

Urutan Nukleotida : Urutan Asam Amino

G A T C C G T

Interrelation of DNA, RNA and Protein

Informasi Genetik Kode Genetik

DNA RNA PROTEIN

Asam Nukleat
Pengenalan material genetik
Genetic expression :
(central dogma FH Crick
replication
DNA
transcription

RNA

translation

PROTEIN
 Apakah ada kaitan antara USIA dengan Bahan Genetik ?

CIRI-CIRI ORANG YANG SUDAH TUA

UPAYA UNTUK TETAP MUDA (jangan tua)
 Aspek kimia
ASAM
NUKLEAT

DNA RNA
(deoxyribose nucleic acid) (Ribose nucleic acid)
 STRUKTUR NUKLEOTIDA, ASAM NUKLEAT

• Nukleosida : zat atau senyawa material

genetik yang disusun oleh basa nukleat dan
asam gula pentosa (ribosa dan deoksiribosa)
• Nukleotida : adalah senyawa yang disusun
oleh Nukleosida dan asam fosfat
 ASAM NUKLEAT

• Asam nukleat : zat atau senyawa polimer

yang disusun oleh Nukleotida (satuan
monomer)
• Asam Nukleat ada 2 jenis :
• DNA (asam deoksiribosa nukleat,
deoxyribose nucleic acid)
• RNA (asam ribosa nukleat, ribose nucleic
acid)
 BASA
NUKLEAT
BASA BASA
PURIN PIRIMIDIN

Adenin Guanin Timin Urasil

(A) (G) (T) (U)
BASA NUKLEAT
 Molekul Gula pada Nukleotida
Ribosa merupakan molekul
gula pada RNA
2-Deoksiribosa merupakan
molekul gula pada DNA

Perhatikan:
Ikatan gula ribosa dengan basa
nitrogen (pada atom karbon nomor 1).
Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat
(pada atom karbon nomor 5).
Gugus hidroksil pada atom karbon
nomor 2

DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

Penamaan Nukleotida:

DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

 FUNGSI NUKLEOTIDA
• Penting untuk semua sel
• Komponen cofaktor enzim :
CoA; FAD; NAD; NADP
• Pembawa energi kimia (Energy Carriers): ATP,
ADP, GTP
• Precursor sintesis DNA
• Precursor sintesis RNA
Nukleotida Penyusun DNA

3
Nukleotida Penyusun RNA
 Perangkaian Nukleotida
membentuk asam nukleat

1. Asam nukleat DNA dan RNA merupakan polimer,

dan monomer nya adalah nukleotida
2. Ikatan yang menghubungkan satu monomer
dengan monomer lain nya adalah ikatan fosfoster,
sehingga dalam satu dimer ada dua ikatan
fosfoester, makanya disebut ikatan fosfodiester.
3. Setiap terbentuk satu ikatan fosfoester, dihasilkan
satu molekul air.
4. Dalam pembentukan atau pertumbuhan rantai
polimer, selalu arah 5’ - 3’
 STRUKTUR PRIMER DNA dan RNA

Bagaimana nukleotida-nuleotida
dirangkai atau disusun secara teratur
melalui ikatan fosfodiester

Arah pertumbuhan rantai : 5’ ke 3’

 IKATAN BASA DALAM DNA

• Pasangan basa C-G (merah) dan A-T

(biru) merupakan pasangan isosterik
(bentuk dan ukurannya sama),
•Pengisian ruang antar
sehingga memungkinkan pengisian
lilitan.
ruang antar lilitan yang tidak
dipengaruhi oleh urutan basa
penyusunnya.
 ASAM NUKLEAT 36 pasangan basa
Struktur penopang - biru;
Basa- abu-abu

 Konformasi B – Konformasi
DNA.
 Konformasi A – Konformasi
RNA.
STRUKTUR SEKUNDER DNA dan RNA
PENEMU STRUKTUR DNA

• Franklin memperoleh data

difraksi sinar x (di awal tahun
1950s) yang menunjukkan adanya
2 periodisitas DNA, yakni 3.4 Å
dan 34 Å.
• Watson dan Crick membuat
model 3-D dari data tersebut.
 STRUKTUR DNA
 Terdiri dari dua untai rangkaian
nukleotida yang saling melilit
kekanan dengan aksis yang sama.
 Satu lilitan berukuran 36 Å, atau
tersusun atas 10,5 pasangan basa.
 Struktur utama, yang merupakan
rangkaian deoksiribosa yang
berselang-seling dengan gugus
fosfat, berada di bagian luar lilitan.
 Pasangan basa purin dan pirimidin
dari masing-masing untaian
mengisi bagian dalam lilitan.
 UNTAIAN BENANG DNA
• Pasangan benamg DNA bukan identik tetapi
berpasangan.
• C berpasangan dengan G, sedangkan A
dengan T.
• Kedua benang DNA berpasangan secara
antiparallel.
• Urutan basa ditulis dari ujung yang memiliki
fosfat bebas di atom C no 5' dari gugus
deoksiribosanya ke arah ujung yang memiliki
hidroksil bebas di atom C no 3' dari gugus
deoksiribosanya.
• Struktur ini sangat sesuai untuk
penyimpanan dan transfer informasi!
DNA :
- The chromosomal
substances contain
genes;and linier form
- The extrachromosomal
substances namely
plasmid, did not contain
genes, circular form,
smallest
 KROMOSOM
Ekstrakromosom

DNA
(sirkuler)
atau
plasmid DNA (linier)

GEN-GEN Ada berapa banyakkah

sifat manusia ?

Gen struktur p o
i

Gen Pengendali
Coba saudara jelaskan fungsi setiap gen
 • M1 RNA yang
panjangnya 337
nukleotida sebagai
bagian dari enzim RNase RNA berukuran
P (memproses tRNA)
yang dimiliki oleh E. coli besar membentuk
memiliki banyak struktur
hairpin loops struktur kompleks
• Rangkaian RNA acakpun
dapat membentuk
struktur (60-70%)

G-U pairs

Pasangan G-U juga

ditemukan, karena
secara termodinamika
dimungkinkan.
Beberapa bagian lain dapat berpasangan
sehingga membentuk lipatan tersier.
 RNA MEMBENTUK STRUKTUR TERSIER

RNA untai tRNAPhe dari khamir

tunggal (1TRA)
dalam
heliks
memilin
ke kanan
Bentuk kepala palu dari
Hijau = ribozim (1MME)
Struktur
utama

Intron T. thermophila,
Suatu ribozim (enzim dari
RNA) (1GRZ)
 ANNEALING: HIBRIDISASI
 Percobaan: DNA manusia dan lalat yang
mengalami denaturasi total.
 Cuplikan DNA terdenaturasi dicampur dan
dibiarkan pada suhu ~ 65 ˚C selama beberapa
jam
 Dalam kondisi ini basa-basa yang berpasangan
akan mengalami annealing.
 Sebagian besar DNA lalat akan anneal dengan
DNA lalat; sedangkan DNA manusia akan anneal
dengan DNA manusia
 Beberapa potongan DNA lalat akan anneal
dengan potongan DNA manusia membentuk
hybrid duplexes.
 Hal ini menunjukkan adanya bagian yang sama
antara DNA manusia dan lalat sebagai bukti Bagaimana jika DNA
adanya kesamaan nenek moyang. manusia dan simpanse?
 Melanjutkan diskusi tentang
Struktur dan biokimia
Bahan Genetik
Lechninger;
Chapter 8, halaman 273 --
dan
Chapter-22 halaman 862 –
Bacalah Buku tersebut sesuai pembagian tugas (lebih bagus
jika diskusi) , diberikan waktu 30 menit,,, tuliskanlah
rangkuman atau intisarinya dalam Buku Catatan mu,,,, jika
ada yang mau menjelaskan ke depan,,,silahkan
(1)
“Sintesis, Replikasi dan perbaikan DNA”
(2)
“Struktur dan fungsi RNA, sintesis RNA”
(3)
1/26/2020 “ProsesProf.modifikasi
Ramlan Silaban RNA” 47
 (1)
“Sintesis, Replikasi dan perbaikan DNA”
 Telah dikemukakan sebelumnya :

Urutan Nukleotida : Urutan Asam Amino

G A T C C G T

Interrelation of DNA, RNA and Protein

Informasi Genetik Kode Genetik

DNA RNA PROTEIN

Asam Nukleat
 Dalam untai DNA :
• Terdapat informasi genetik dalam bentuk Urutan
Nukeotida
• 1 gen satu sifat
• Terdapat ribuan gen (tanya google : Human genome,
berapa banyak sifat manusia)
• Ketika satu sifat hendak diekspresi, terlebih dahulu gen
penyandi nya diperbanyak (d-replikasi)
• Replikasi : hanya terjadi pada Gen
• Pada manusia : replikasi semi konservatif : 2; 4; 8; 16,
dst
 REPLIKASI DNA
• Pada replikasi DNA, masing-masing untai DNA
berfungsi sebagai cetakan untuk sintesis untai
pasangannya yang baru, menghasilkan dua
molekul DNA.
• Cara ini disebut cara replikasi semikonservatif.
• Replikasi cara semikonservatif membutuhkan
pemisahan untai DNA (pelelehan sebagian,
atau denaturasi) sehingga untai tetua menjadi
cetakan.
 DNA Replication
– Nucleotides added &
new strand forms at
replication forks
– DNA helicase (enzyme)
uncoils & breaks the
weak hydrogen bonds
between
complementary bases
(strands separate)
– DNA polymerase adds
new nucleotides to the
exposed bases
953 Leh
 DNA Replication
• DNA ligase helps join
segments together
 DNA Replication
– DNA polymerase
proofreads the new
DNA checking for errors
& repairing them; called
excision repair
– Helicase recoils the
two, new identical DNA
molecules
 Molekul Gula pada Nukleotida
Ribosa merupakan molekul
gula pada RNA
2-Deoksiribosa merupakan
molekul gula pada DNA

Perhatikan:
Ikatan gula ribosa dengan basa
nitrogen (pada atom karbon nomor 1).
Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat
(pada atom karbon nomor 5).
Gugus hidroksil pada atom karbon
nomor 2

DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

 (2)
“Struktur dan Fungsi RNA, Sintesis RNA”
 RNA
• Found in nucleus & cytoplasm
• Contains ribose sugar
• Contains the nitrogen base uracil (U) instead
of thymine so A pairs with U
• Base pairings are A-U and C-G
• Three types of RNA exist (mRNA, TRNA, &
rRNA)
 ADA 3 JENIS RNA
• mRNA (messenger RNA)
– Membawa informasi genetik dari DNA ke ribosom untuk
sintesis protein

• rRNA (ribosomal RNA)

– Penyusun 65 % ribosom, sisanya protein
– Mengenali mRNA

• tRNA (transfer RNA)

– Menterjemahkan kode genetik dari mRNA menjadi asam
amino tertentu
 Peran RNA pada Biosintesis Protein
• tRNA’s break loose
from amino acid, leave
the ribosome, & return
to cytoplasm to pick up
another amino acid
• Animation of
translation
• http://sps.k12.ar.us/ma
ssengale/ANIMPROT.ht
m
 RNA MEMILIKI STRUKTUR YANG
BERAGAM
Pasangan basa Watson-
Crick (bagian yang
membentuk heliks;
konformasi A). Heliks
adalah struktur
sekunder.

Perhatikan pasangan A-
U di RNA

DNA juga
dapat
membentuk
struktur
seperti ini.
 mRNA
• Messenger RNA
• Single, uncoiled, straight strand of nucleic acid
• Found in the nucleus & cytoplasm
• Copies DNA’s instructions & carries them to the
ribosomes where proteins can be made
• mRNA’s base sequence is translated into the amino
acid sequence of a protein
• Three consecutive bases on mRNA called a codon
(e.g. UAA, CGC, AGU)
• Reusable
 tRNA
• Transfer RNA
• Single stranded molecule containing 80
nucleotides in the shape of a cloverleaf
• Carries amino acids in the cytoplasm to
ribosomes for protein assembly
• Three bases on tRNA that are
complementary to a codon on mRNA are
called anticodons (e.g. codon- UUA;
anticodon- AAU)
• Amino Acid attachment site across from
anticodon site on tRNA
• Enters a ribosome & reads mRNA codons
and links together correct sequence of
amino acids to make a protein
• Reusable
 rRNA
• Ribosomal RNA
• Globular shape
• Helps make up the structure of
the ribosomes
• rRNA & protein make up the
large & small subunits of
ribosomes
• Ribosomes are the site of
translation (making
polypeptides)
• Aids in moving ribosomes along
the mRNA strand as amino acids
are linked together to make a
prote
RNA
Sintesis RNA
 Proses Transkripsi
• Tanskripsi
Sintesa RNA berdasarkan arahan DNA
[ perintah gen ]
- Saat ini kedua asam nukleat mengguna-
bahasa yg sama shg informasinya langsung
ditranskripsi/disalin dari satu mo-
lekul ke molekul yg lain
- DNA menyediakan suatu cetakan untuk
penyusunan urutan nukleotida RNA
- Molekul RNA yg di hasilkan merupakan
rekaman penuh dari instruksi2 pemba-
ngun protein dari gen disebut m RNA
- Mensintesis semua jenis RNA dari DNA
 Translasi
- sintesis polipeptida yg sesungguhnya,
berdasarkan arahan dari m RNA
- tahap ini terjadi perubahan bahasa shg
sel tersebut harus menterjemah/transla
si urutan basa molekul m RNA kedalam
urutan as. amino polipeptida
- tempat ribosom
• Perbedaan transkripsi dan translasi pd
prokariora dan eukarita
- prokariota misal : bakteri
.transk transl terjadi dalam satu ruangan
.DNA tidak dipisahkan dari ribosom dan
pensintesa protein lainnya
.m RNA segera ditranslasi tanpa proses
tambahan
-

eukariota
.transk transl terjadi pd ruangan terpisah yaitu nukleus
dan sitoplasma
.transk terjadi dalam nukleus dengan hasil pra m
RNA,kemudian
diproses dengan berbagai cara oleh enzim sebelum
meninggalkan nukleus sebagai m RNA akhir yg fungsional
.m RNA berpindah dari nukleus ke sitoplasma melalui pori2
diselu
bung nukleus
.jadi transk gen eukariotik menghasilkan pra m RNA dan
pemrosesan
[ RNA prosesing ],menghasilkan RNA akhir
• Tahapan transkripsi
-Dipengaruhi enzim RNA polimerase yg berge
rak disepanjang promoter sampai dibela-
kang terminator
-Enzim ini membuka pilinan kedua untai
DNA sehg terpisah dan mengaitkan nuk-
leotida RNA pd saat molekul ini memben
tuk pasangan basa disepanjang cetakan
DNA
-RNA polimerase dapat menambahkan
nukleotida hanya pd ujung 3’ dari poli-
mer yg sdng tumbuh
-rentangan DNA yg ditranskripsi menjadi
molekul RNA disebut ‘unit transkripsi’
• Bakteri hanya memiliki satu tipe RNA po-
limerase
- Eukariota memiliki 3 tipe RNA polimera
se yg dipakai utk sintesis m RNA ada-
lah RNA polimerase II
• Pengikatan RNA pol dan inisiasi transkrip
- PROMOTER----daerah DNA dimana RNA pol
melekat dan mengawali trans-
kripsi,membentang td bbrp lusin nukleo-
tida dan menentukan untai heliks DNA yg
mana sbg cetakan
• Pd prokariota,RNA pol secara spesifik
mengenali dan berikatan dg promoter
- Pd eukariota,sekumpulan protein disebut
‘ faktor transk’ menjadi perantara pd pengi
katan RNA pol dan inisiasi transk
Setelah faktor transk ttt diikat promoter
barulah RNA pol mengikatkan diri dsbt
‘kompleks inisiasi transkripsi’
- Peran faktor transk dan urutan DNAprom
menjadi penting utk mengenal‘boks TATA’
dalam mem- btk komplek inisiasi
- Begitu RNA pol terikat kuat pd prom,ke-
dua untai DNA mengulur disana dan en
zim mulai mentranskripsi untai cetakan
nya
• Elongasi untai RNA
- Saat RNA pol bergerak disepanjang DNA
,enzim tsb terus membuka puntiran
DNA lebih kurang 10-20 basa DNA seka
li gus berpsngan dg nukleotida RNA
- RNA pol menambahkan nukleotida ke
ujung3’ RNA yg sedang tumbuh
- Pd saat sintesis RNA berlsng heliks gan
da DNA terbentuk kembali,dan mol RNA
yg baru akan lepas dari cetakannya
- Pd eukariota berlangsung dg laju 40 nukl
/detik,krn satu gen tunggal dapat ditransk
secara bersamaan oleh RNA pol
yg saling mengikuti
 Terminasi transkripsi
• - Transkripsi berlangsung sp RNA polimerasi
mencapai urutan DNA terminator
- Pd prokariota transk biasanya berhenti tepat pd akhir
terminasi
- Pd eukariot, RNA pol terus melewati sinyal terminasi
suatu urutan poliadenilase [AAUAAA]
didalam pra m RNA
- Pada titik 10-35 nukleotida,pra m RNA
dipotong hingga terlepas
- Tempat pemotongan pra m RNA ----tem
pat untuk menambah ekor poli [A]
 Pemrosesan RNA
Yaitu penambahan tutup 5’dan ekor poli
[A],yg dimodifikasi oleh enzim dan terle-
tak pd kedua ujung pra mRNA eukariotik
- Ujung 5’----ditutup nukleotida guanin
- Ujung 3’----terdiri dari 30-200 nukleotida
adenin
 Fungsi ujung2
- Melindungi m RNA dari perombakan
oleh e hidrolitik [nukleus]
- Tempat melekat ribosom [sitoplasma]
- Pada saat ini terdapat segmen leader dan
trailer adalah tempat lekat tutup,
RNA yg tidak ditranslasi
- Tahap yg paling mengagumkan dari
pemrosesan RNA didlm nukleus eukario
ta adalah pemindahan sebagian besar
mol RNA yg mula2 disintesis-----pekerja
an potong dan tempel yg disbt penyam-
bungan RNA [RNA splicing]
- Ini terjadi karena panjang DNA 8000
nukl----dibutuhkan 1200 nukl [400 as am]
utk mengkode protein,berarti gen uekari
ota dan transkrip RNA nya memiliki ren-
tangan nukl bukan pengkode
- Lebih mengejutkan lagi bahwa sebagian
besar urutan bukan pengkode tersebar
berselang seling diantara sel pengkode
- Disebut ‘intron’ dan ‘ekson’
- Cara penyambungan RNA,sinyal2 pd
urutan nukleotida pendek diujung intron

Hasil transkripsi adalah : mRNA

 Regulasi Ekspresi gen pada Bakteri

• Regulasi transkripsi
– Jika suatu protein (yang dikodekan oleh gen)
diperlukan, maka gen akan ditranskripsi
– Jika suatu protein (yang dikodekan oleh gen)
Tidak diperlukan, maka gen akan Tidak akan
ditranskripsi

89
 Unit Transkripsi pada Bakteri
Operon

promoter
operator

-35 TTGACA
-10 TATAAT (Pribnow box)
90
 Regulasi pada Transkripsi

• Kontrol Positif atau Negatif

– Positif - membutuhkan suatu protein untuk
terjadinya transkripsi
– Negatif - protein dibutuhkan untuk mem block
transkripsi

• Model operon pada bakteri

– Lac operon

91
 Regulasi Lac operon

• Merupakan Kontrol Negatif

• Repressor protein (lac I gene product)
• Berikatan pada operator region dari Lac operon
• Mencegah terjadinya proses transkripsi

92
 Induksi repressed operon

(allolactose)
(lac repressor) (can’t bind)

o
93
 Regulasi Lac operon

• Repressor berikatan pada operator

– TIDAK terjadi transkripsi
• Effector berikatan pada Repressor
– Repressor tidak dapat berikatan dengan operator
– Terjadi Transkripsi
• Berkurangnya konsentrasi Effector
– Repressor akan bebas untuk berikatan dengan
operator
– TIDAK terjadi transkripsi

94
 Regulasi Lac operon

• Satu gen yang berekspresi dari lac operon

– b-galactosidase
– Memecah laktosa (dan allolactose) menjadi
glukosa dan laktosa

LACTOSE b-gal Glucose

(allolactose) &
(effector) Galactose
95
 Repressi Operon Bakteri

Repressor co-repressor (tryptophan)

Biosynthetic
complex Operons
(Trp Operon)

96
 Aktivasi & Deaktivasi Operon

effector
inactive
Activator
complex

97
 Regulasi Transkripsi Eukariotik
• Kemampuan untuk aktivasi dan penekanan
gen menjadi bagian yang esensial untuk
memelihara kespesifikan sel

neuron hepatocyte

skin

98
 Regulasi Transkripsi Eukariotik

• Lebih kompleks dibanding bakteri

• Pengendalian dimediasi oleh protein-protein
yang diklasifikasikan sebagai Transcription
Factors - TF :
– Basal TF - diperlukan oleh semua gen
– Specific TF - menentukan spesifitas ekspresi
– Activator - meningkatkan ekspresi
– Repressor - menurunkan ekspresi

99
 (3)
“Proses Modifikasi RNA”
• Jika ada kesalahan pada saat transkripsi dari
DNA ke RNA, maka sel akan melakukan
modifikasi
Pada sel eukariot, proses transkripsi tidak terjadi
secara bersamaan, transkripsi terjadi di dalam inti
sel sedangkan translasi terjadi di dalam sitoplasma.
Proses transkripsi dan translasi pada eukariot lebih
kompleks bila dibandingkan dengan sel prokariot,
termasuk proses pembentukan mRNA.
mRNA pada eukariot diturunkan dari gen primer transkrip
dan melibatkan beberapa proses, yaitu
(1) Pemotongan sebagian besar precursor mRNA (pre-
mRNA) menjadi molekul mRNA yang lebih kecil,
(2) Penambahan kelompok 7-metil guanosin pada ujung 5’
(“topi ujung 5’”)molekul,
(3) Penambahan sekitar 200 nukleotida dengan urutan
adenilat nukleotida ( ujung “poly-A”) yang panjang pada
ujung 3’ molekul,
(4) Pembentukan protein spesifik yang kompleks. Proses
pemotongan melibatkan perubahan pre-mRNA menjadi
molekul mRNA dan juga sering melibatkan pemindahan
urutan utama dari ujung 5’ ke kodon inisial translasi,
dan segmen bukan kodon diantara daerah
kodon.
 Jenis modifikasi RNA
• Pemindahan Urutan Intron dari Penyambungan
RNA
• Penyambungan Precursor tRNA
• Penyambungan Autokatalisis Pada Precursor
Tetrahymena tRNA
• Penyambungan Pre-mRNA: snRNAs, snRNPs, dan
Spliceosome

Agar dicari
penjelasannya
Sekian dan Terima Kasih