METABOLISME

MIKROORGANISME
MIKROBIOLOGI Kelas E
 Kelompok 4

Ninda Luthfiani
172154048 Windani Dewi C
Siti Latifah N
172154082
172154084
Materi Yang Akan Dibahas
• Metabolisme Energy, Enzym and Regulation
• Metabolisme Energy Release and
Consevation
• Metabolisme The Use of Energy
Inbiosynthesis
 METABOLISME
Metabolisme merupakan hasil dari semua reaksi kimia yang terjadi dalam sel
 Dalam metabolisme ada dua fase

KATABOLISME ANABOLISME

Melibatkan serangkaian langkah:

1. Konversi sumber karbon organisme
2. Sintesis monomer
3. Sintesis makromolekul
4. perakitan makromolekul ke dalam struktur
seluler.
 Energi Dalam Metabolisme

Sel-sel hidup melakukan tiga jenis pekerjaan utama

1. Pekerjaan kimia
2. Pekerjaan transportasi
3. Pekerjaan mekanis
 Hukum Termodinamika
Hukum Termodinamika I “Energi tidak dapat diciptakan ataupun dimusnahkan, melainkan
hanya bisa diubah bentuknya saja.”
Hukum Termodinamika II yang disebut juga dengan entropi

Proses Hukum Kedua. Perluasan gas ke dalam silinder

kosong hanya mendistribusikan ulang molekul gas hingga
tercapai kalibrasi atau kesetimbangan. Jumlah total molekul
tetap tidak berubah
 Peran ATP dalam Metabolisme

Ada beberapa prinsip dalam proses metabolisme, yaitu :

• Penggunaan ATP untuk menyimpan energi yang ditangkap
selama reaksi eksergonik sehingga dapat digunakan untuk
mendorong reaksi endergonik
• pengaturan reaksi metabolik menjadi jalur dan siklus;
• katalisis reaksi metabolik oleh enzim; dan
• pentingnya reaksi reduksi oksidasi dalam konservasi energi.
Bagian ini mempertimbangkan peran ATP dalam metabolisme.
Energi dilepaskan dari sumber energi sel dalam reaksi
eksergonik (yaitu, reaksi dengan G negatif).
ATP sebagai molekul berenergi tinggi tidak berarti bahwa ada
banyak energi yang tersimpan dalam ikatan ATP tertentu. Ini
hanya menunjukkan bahwa penghapusan terminal fosfat dapat
berjalan sampai selesai dengan perubahan energi bebas standar
negatif yang besar; yaitu, reaksinya sangat eksergonik.
 Siklus ATP sel

ATP terbentuk dari energi yang tersedia selama respirasi aerob, respirasi anaerob,
fermentasi, chemolithotrophy, dan fotosintesis. Penguraiannya menjadi ADP dan fosfat
(Pi) memungkinkan kerja kimia, transportasi, dan mekanis
 Enzim
Menurut Smith et al (1997), enzim adalah biomolekul berupa protein yang berfungsi
sebagai katalis dalam suatu reaksi kimia organik.

Enzim tersusun atas dua bagian:

• Apoenzim merupakan enzim yang tersusun dari protein
• Gugus prostetik adalah enzim yang tersusun dari nonprotein. Berdasarkan bahan penyusunnya, gugus prostetik
terbagi menjadi dua:
1) Koenzim (tersusun dari bahan organik)
2) Kofaktor (tersusun dari bahan anorganik)
 Teori lock and key dalam enzim

Aktivitas Enzim
persamaan Michaelis-Menten Aktivitas enzim oleh pH, Suhu,
Metabolisme Energy Release
and
Consevation
Proses Chemoorganotrophic
Sumber energy untuk mikroorganisme

Kebanyakan mikroorganisme menggunakan salah satu dari

tiga sumber energy
1. Fototrof
2. Mikotrof
3. Energi kimia
Proses metabolisme Chemoorganotrophic Molekul organik berfungsi sebagai sumber energi dan
elektron untuk ketiga proses metabolisme yang digunakan
oleh chemoorganotroph.
Dalam respirasi aerobik dan respirasi anaerob, elektron
melewati sistem transpor elektron. Hal ini menghasilkan
gaya gerak proton (PMF), yang digunakan untuk mensintesis
sebagian besarATP seluler dengan mekanisme yang disebut
fosforilasi oksidatif (ox phos); sejumlah kecil ATP dibuat oleh
proses yang disebut fosforilasi tingkat-substrat (SLP).
Dalam respirasi aerobik, O2 adalah akseptor terminal
elektron, sedangkan pada respirasi anaerob molekul
eksogenselain O2 berfungsi sebagai akseptor elektron.
Selama fermentasi, molekul organik endogen bertindak
sebagai akseptor elektron, aliran elektron tidak digabungkan
dengan sintesis ATP, dan ATP disintesis hanya oleh fosforilasi
tingkat-substrat.
 Respirasi Aerobik
Tiga Tahapan Respirasi Aerobik.
Diagram umum respirasi aerobik dalam proses
ini chemoorganoheterotroph menunjukkan tiga
tahap dan posisi sentral dari siklus asam
tricarboxylic.
Meskipun ada banyak protein, polisakarida, dan
lipid yang berbeda, mereka terdegradasi melalui
aktivitas beberapa jalur metabolisme umum .

Garis putus-putus menunjukkan aliran elektron, yang dibawa oleh NADH dan
FADH2, ke rantai transpor elektron.
 Pemecahan Glukosa Menjadi Piruvat

Cara mikroorganisme mendegradasi gula menjadi piruvat terdapat tiga rute :

1. jalur Embden-Meyerhof,
2. jalur pentosa fosfat, dan
3. jalur Entner-Doudoroff.
 Ekspor dan Impor Fosfil Oksidatif

Hipotesis Chemiosmotic pada Mitokondria

Dalam skema ini pembawa diatur secara asimetris dalam membran bagian dalam sehingga
proton diangkut melintasi sebagai elektron bergerak sepanjang rantai.
 Respirasi Anaerobik
Respirasi anaerob, proses dimana akseptor
elektron terminal eksogen selain O2
digunakan untuk transpor elektron,
dilakukan oleh banyak bakteri dan archaea

Meskipun beberapa bakteri dan archaea

hanya tumbuh menggunakan respirasi
anaerob, tetapi ada yang bisa melakukan
respirasi aerob, tergantung pada
ketersediaan oksigen.
 Fermentasi

Selama Fermentasi NADH dari glikolisis

direoksidasi yang digunakan untuk
mengurangi piruvat atau turunan piruvat
(X). Hasil laktat atau produk Y yang
berkurang.

Ada dua jenis fermentasi asam format.

Fermentasi asam campuran menghasilkan
Reoksidasi NADH ekskresi etanol dan campuran asam
kompleks, terutama asam asetat, laktat,
suksinat, dan asam format
Katabolisme Lipid

Asam Lemak
 amonium, sehingga menjadikannya basa
sedang.

Katabolisme Protein dan Asam Amino

Transaminasi.
Contoh dari prosesnya, Kelompok -amino (biru) dari alanin ditransfer ke akseptor
-ketoglutarate membentuk piruvat dan glutamat. Piruvat dapat dikatabolisme dalam siklus
asam tricarboxylic acid atau digunakan dalam biosintesis
Chemolithotrophy

Proses Chemolithotrophic.

Bakteri chemolithotrophic dan archaea

mengoksidasi molekul anorganik (misalnya,
H2S dan NH3), yang berfungsi sebagai
sumber energi dan elektron
Fototropi
Reaksi Phototrophic

Phototroph menggunakan cahaya untuk menghasilkan

gaya gerak proton (PMF), yang kemudian digunakan untuk
mensintesis ATP dengan proses yang disebut fotofosforilasi
(foto phos).
Proses ini membutuhkan pigmen penyerap cahaya.
memicu aliran elektron melalui rantai transpor elektron,
disertai dengan pemompaan proton melintasi membran
Metabolism: the use of
energy in biosyinthesis
• Prinsip yang mengatur Biosintesis
• Metabolit Prekursor
• Perbaikan CO2 oleh Autotrof
• Sintesis gula dan polisakarida
• Sintesis asam amino
• Sintesis Purin, Pirimidin, dan Nukleotida
• Sintesis Lipid
 Prinsip yang mengatur
biosintesis

• Pembangunan makromolekul besar (molekul

kompleks) dari beberapa untuk struktural sederhana
(monomer) menghemat banyak kapasitas penyimpanan
genetik, bahan baku biosintesis, dan energi
 Prinsip yang
mengatur
biosintesis
• Penggunaan banyak enzim yang sama untuk proses katabolik dan anabolik menghemat
bahan dan energi tambahan. Sebagai contoh, sebagian besar enzim glikolitik terlibat
dalam sintesis dan degradasi glukosa.
• Penggunaan enzim terpisah untuk mengkatalisasi dua arah dari satu langkah dalam
jalur amphibolik memungkinkan pengaturan katabolisme dan anabolisme secara
independen
Rute yang menghubungkan G dengan
X, Y, dan Z murni anabolik karena
hanya digunakan untuk sintesis produk
akhir. Jalur dari A ke G adalah amfibol
yaitu, ia memiliki fungsi katabolik dan
anabolik.
 Prinsip yang
mengatur biosintesis

• Untuk mensintesis molekul secara efisien, jalur anabolik harus beroperasi secara
ireversibel ke arah biosintesis. Sel dapat mencapai ini dengan menghubungkan beberapa
reaksi biosintetik ke pemecahan ATP dan trifosfat nukleosida lainnya
• Kompartemenasi dalam sel eukariotik yaitu, pelokalan jalur biosintetik ke dalam
kompartemen seluler tertentu dan jalur katabolik menjadi jalur lain memudahkan jalur
katabolik dan anabolik untuk beroperasi secara simultan namun mandiri
Lanjutan…

• Jalur anabolik dan katabolik sering menggunakan kofaktor yang berbeda.

Biasanya oksidasi katabolik menghasilkan substrat untuk transport elektron.
Sebaliknya, ketika donor elektron diperlukan selama biosintesis, NADPH
biasanya berfungsi sebagai donor
Metabolit Prekursor

Generasi metabolit prekursor adalah langkah

penting dalam anabolisme. Metabolit prekursor
adalah kerangka karbon (Rantai karbon) yang
digunakan sebagai substrat awal untuk sintesis
monomer dan blok bangunan lain yang
diperlukan untuk sintesis makromolekul.
 Perbaikan CO2 oleh
Autotrof
Autotrof menggunakan CO2 sebagai sumber tenaga atau sumber karbon utama
untuk mengurangi dan menggabungkan CO2 membutuhkan banyak energi.
Banyak autotrof memperoleh energi dengan menjebak cahaya selama fotosintesis,
tetapi beberapa memperoleh energi dari oksidasi donor elektron anorganik yang
berkurang
 Sintesis gula dan polisakarida

Autotrof yang menggunakan proses fiksasi CO2 selain dari siklus Calvin dan
heterotrof yang tumbuh pada sumber karbon selain gula harus mampu
mensintesis glukosa. Sintesis glukosa dari prekursor non karbohidrat disebut
glukoneogenesis.
 Sintesis asam amino

Banyak metabolit prekursor berfungsi sebagai substrat awal

untuk sintesis asam amino. Dalam jalur biosintesis asam
amino, kerangka karbon dirancang ulang dan sebuah gugus
amino, dan kadang-kadang belerang.
Setelah glutamat telah disintesis, gugus amino yang baru terbentuk dapat ditransfer
ke kerangka karbon lainnya dengan reaksi transaminasi untuk membentuk asam
amino yang berbeda. Transaminase memiliki koenzim piridoksal fosfat, yang
bertanggung jawab untuk transfer gugus amino. Mikroorganisme memiliki
sejumlah transaminase, yang masing-masing mengkatalisis pembentukan beberapa
asam amino menggunakan asam amino yang sama sebagai donor kelompok amino.
Ketika glutamat dehidrogenase bekerja dalam kerja sama dengan transaminase,
amonia dapat dimasukkan ke dalam berbagai asam amino
 Sintesis Purin, Pirimidin,
dan Nukleotida

Biosintesis purin dan pirimidin sangat penting untuk semua sel

karena molekul ini digunakan untuk sintesis beberapa faktor, asam
ribonukleat (RNA), asam deoksiribonukleat (DNA), dan komponen
sel penting lainnya
Sintesis Pyrimidine. PRPP adalah
singkatan dari 5-phosphoribosyl 1-
pyrophosphoric acid, yang
menyediakan rantai ribosa 5- fosfat.
Bagian yang berasal dari karbamoil
fosfat diarsir dalam pirus.
 Sintesis lipid

Berbagai lipid ditemukan dalam mikroorganisme, terutama di membran sel. Sebagian besar
mengandung asam lemak atau turunannya. Asam lemak adalah asam monokarboksilat
dengan rantai alkil panjang yang biasanya memiliki jumlah karbon yang merata (panjang
rata-rata adalah 18 karbon). Beberapa mungkin tidak jenuh yaitu memiliki satu ikatan
rangkap atau lebih. Sebagian besar asam lemak mikroba dirantai lurus, tetapi ada pula yang
bercabang. Bakteri gram negatif sering memiliki asam lemak siklopropana (asam lemak
dengan satu atau lebih cincin siklopropana dalam rantai mereka).
 Thank You

Any Question?