3/16/2015

Falsafah Biokimia
Ratih Rizqi Nirwana

Apa yang akan kita pelajari hari ini

ini??
1. Menganalisis tujuan mempelajari
biokimia (diperkuat dalil aqli dan naqli)
(C4)
2. Membedakan ciri-ciri organisme dengan
benda mati (C4)
3. Mengidentifikasi komposisi dasar
organisme (C1)
4. Mengklasifikasikan biomolekul (C4)
5. Membuat diagram transformasi energi
dalam organisme secara holistic (C5)
6. Memberikan contoh reaksi kimia dalam
Sel (C3)

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

1
 3/16/2015

Biokimia
Ilmu pengetahuan yang berkanaan
dengan dasar biokimiawi kehidupan
Ilmu pengetahuan yang berkenaan
dengang berbagai molekul di dalam sel
serta organisme beserta reaksi
kimiannya
Ilmu pengetahuan yang berhubungan
dengan unsur-unsur kimiawi dalam sel
hidup dengan berbagai reaksi serta
proses yang dialaminya

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

1. Tujuan mempelajari ilmu biokimia

1.Memehami proses kimiawi pada tingkat

molekuler yang berhubungan dengan sel
hidup
2.Memehami bagaimana kehidupan

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

2
 3/16/2015

Cakupan biokimia

Biologi sel,
biologi molekuler
genetika molekuler

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

Ayat Al
Al--Quran

Dan DIA lah yang menciptakan kamu dari satu diri. Kemudian
(diberi-Nya) tempat tinggal (di Dunia) dan tempat tetap (di
Akhirat). Sesungguhnya telah KAMI terang kan tanda-tanda
(Kekuasaan KAMI) bagi kaum yang memahami. (Q.S. Al-
Anaam : 98)

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

3
 3/16/2015

Sesungguhnya Allah yang membelah (menumbuhkan) butir

dan biji, DIA mengeluarkan yang hidup dari yang mati,
dan mengeluarkan yang mati dari yang hidup. Demikian
itulah (Kekuasaan) Allah. Maka mengapa ka mu tidak
mengindahkan-Nya ? (Tidak mau menyembah-Nya ?.
(Q. Al-Anaam : 95)

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

DIA-lah yang menurunkan air (hujan) dari Langit. Kemudian KAMI

menumbuhkan ber-aneka ragam tumbuh-tumbuhan. Kemudian KAMI
keluarkan Daun dan Ranting yang menghijau. Lantas KAMI keluarkan dari
padanya biji (buah) yang lebat. Dan dari pohon Kurma mengurai mayang-
mayang yang menjulai dan kebun-kebun Anggur. Zaitun dan Delima yang
serupa dan berlainan bentuknya. Perhatikanlah waktu (tumbuh-tumbuhan)
berbuah dan di waktu ranum. Sesungguhnya semua itu adalah bukti-bukti
(Kekuasaan Allah) bagi kaum yang beriman. (Al-Anaam:99)

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

4
 3/16/2015

Hadits

Ketahuilah ! Sesungguhnya dalam Tubuh Manusia itu, ada

segumpal Daging. Apabila ia baik. (maka) seluruh Tubuh akan
baik. Dan apabila ia rusak. Maka seluruh Tubuh akan rusak.
Ketahuilah ! ia adalah Hati.(Al-Bukhori)

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

2. Ciri
Ciri--ciri Zat Hidup
Zat hidup tersusun oleh molekul-molekul yang tidak
bernyawa
Bila komponen-komponen zat hidup tersebut diisolasi dan
diteliti satu persatu, molekul-molekul tersebut tidak
bertentangan dengan hukum fisik dan kimia yang
berlaku bagi semua benda mati
Tetapi, suatu organisme mempunyai sifat-sifat
khusus yang tidak ditunjukkan oleh banda mati
Apa perbedaan antara zat hidup/organisme dengan benda mati?

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

5
 3/16/2015

No Organisme Benda Mati

1 Kompleks & terorganisir baik Campuran acak dari senyawa kimia
sederhana
2 Tiap komponennya memiliki Tiap komponen penyusun hanya
fungsi / tujuan tertentu kebetulan ada di dalamnya
3 Mammpu mengekstrak, Menggunakan energi secara tidak
mengubah & menggunakan terencana
energi lingkungan dalam
bentuk zat gizi organik atau
sinar matahari
4 Mampu melakukan replikasi Tidak mampu tumbuh dan
diri secara tepat / bereproduksi
bereproduksi

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

3. Biokimia dalam zat hidup

Komposisi dasar tubuh organisme
Konstituen utama sebagian besar biomolekul:
99% seluruh atom organisme terdiri atas: C, H, O, dan N
H dan O bersama-sama membentuk molekul air (60-70%
dari sel)
Unsur makro (kebutuhan >100 mg/hari):
P dan S sebagai unsur pembangun
Ion anorganik: Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Cl- dan I- sebagai
elektrolit
Unsur mikro/trace elements (kebutuhan
<100mg/hari)
Fe, Zn, Cu, Mn, Co, Cr, Se & Mo
Sebagai kofaktor

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

6
 3/16/2015

4. Biomolekul utama
No Nama Unsur pembangun Fungsi
Biomolekul
1 DNA deoksiribonukleotida Informasi genetik
2 RNA Ribonukleotida Template sintesis Protein
3 Protein Asam amino unsur struktural: penyusun
membran
molekul pekerja: enzim,
unsur-unsur kontraktil,
protein carrier, dll
4 Polisakarida Monosakarida Cadangan energi
unsur struktural di bagian
luar sel
5 Lipid Ester asam lemak komponen membran
Simpanan energi jangka
panjang
Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris
Kimia FITK IAIN Walisongo

Struktur DNA & RNA

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

7
 3/16/2015

Gambar molekul protein sebagai enzim

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

Gambar struktur selulosa

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

8
 3/16/2015

Gambar molekul asam lemak

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

5. Transformasi Energi
Organisme dapat mengambil
energi dari lingkungannya
lalu mentransformasikannya
jadi bentuk-bentuk energi
yang dapat dimanfaatkan
Energi masuk:
Energi matahari
Energi makanan
Pemanfaatan energi:
Kerja mekanik: gerak sel
Transport membran
Metabolisme & biosintesa
Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris
Kimia FITK IAIN Walisongo

9
 3/16/2015

energi yang bernamfaat

Heat loss

ATP ADP

Cahaya matahari Makanan

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris
Kimia FITK IAIN Walisongo

6. Reaksi Kimia dalam Sel

Energi potensial
Tegangan

DG

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

10
 3/16/2015

Reaksi Kimia dalam Sel

Untuk:
Memperoleh energi
Mengendalikan reaksi kimia
yang berurutan
Mensintesis / mendegradasi
molekul
Mempertahankan
kesetimbangan dinamis
Swa-susun struktur kompleks
Menggandakan secara akurat
Mempertahankan keteraturan
proses biokimia dalam
ligkungan yang berubah-ubah
Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris
Kimia FITK IAIN Walisongo

Bagaimana jika reaksi tidak spontan

spontan??
Menggunakan pasangan kimia (reaksi
coupling) untuk mengendalikan proses
reaksi yang jika pada kondisi normal tidak
bisa terjadi
Menggunakan enzim untuk memacu reaksi

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

11
 3/16/2015

Perubahan biokimia
Reaksi pemindahan gugus
Reaksi redoks
Reaksi isomerasi / penataan ulang
Reaksi pemotongan
Reaksi kondensasi

Ratih Rizqi Nirwana - Biokimia - Tadris

Kimia FITK IAIN Walisongo

Next meeting:
Komponen Molekular dari Sel (1)
1. Ayat-ayat proses penciptaan manusia: Mendiskusikan ayat Al-Quran tentang
proses kejadian manusia (C2)
2. Hirarki struktur organisme dari yang paling sederhana ke yang paling kompleks
(beserta contoh)
a. Mengurutkan hirarki struktur organisme dari yang paling sederhana ke yang
paling kompleks (C4)
b. Memberikan contoh pada tiap level organisasi dari organisme (C3)
3. Ikatan- ikatan kimia dalam biomolekul
a. Menjelaskan berbagai ikatan kimia yang terjadi dalam biomolekul (C2)
4. Beberapa makromolekul yang paling penting dalam kehidupan
a. Menentukan beberapa makromolekul yang paling penting dalam kehidupan
(C4)
5. Beberapa molekul kecil penting dalam sel
a. Memberikan contoh beberapa molekul kecil penting dalam sel (C3)
6. Sel prokariotik vs eukariotik dan Sel tumbuhan vs sel hewan
a. Membuat tabel perbedaan sel prokariotikRatih
dengan eukariotik
Rizqi Nirwana (C4)
- Biokimia - Tadris
Kimia FITK IAIN Walisongo
b. Membuat tabel perbedaan sel hewan dengan sel tumbuhan (C4)

12