KLASIFIKASI MIKROORGANISME

Putu Yudhistira Budhi Setiawan

 PENDAHULUAN
• Bagi banyak orang, kata kuman dan mikroba mengingatkan
sekelompok makhluk kecil

• Mikroba, juga disebut mikroorganisme, adalah makhluk

hidup kecil yang secara individual biasanya terlalu kecil untuk
dilihat dengan mata telanjang.

• Hari ini kita memahami bahwa mikroorganisme ditemukan

hampir di mana-mana. Ribuan orang meninggal dalam
pandemi

• Banyak pasien meninggal karena vaksinasi dan antibiotik

yang tidak tersedia untuk melawan infeksi

• Pertama-tama, kita akan melihat kelompok utama mikroba

dan bagaimana mereka diberi nama dan diklasifikasikan.
 MIKROBA
• Mikroba di alam secara umum berperanan sebagai produsen,
konsumen dan redusan
• Produsen: menghasilkan bahan organik dari bahan anorganik
dengan energi sinar matahari : algae dan bakteri fotosintetik
• Konsumen: menggunakan bahan organik yang dihasilkan oleh
produsen : protozoa
• Redusen: menguraikan bahan organik dan sisa-sisa jasad
hidup yang mati: bakteri dan jamur
 The Three Domain System

Carl Woese: proposed that based on differences

seen in the ribosomal RNA of cells, all living
organisms can be classified into three domains.
• Eukarya: protozoa, plants, animals, and fungi
• Eubacteria: all pathogenic and non pathogenic
true bacteria
• Archaebacteria: Live in extreme env. Conditions
and carry out unique biochemical rxs.
The Three Domain System
 Klasifikasi
Karakteristik utama yang digunakan adalah:

• Bentuk • Bahan penyusun dinding sel

• Ukuran • Sumber energi
• Morfologi koloni • Hasil Fermentasi
• Kebiasaan pewarnaan • Suhu pertumbuhan optimum
• Mekanisme pergerakan & kisarannya
• Isi sel • Toleransi osmosis
• Hubungan oksigen
• pH optimum & kisaran
pertumbuhan
• Sensitivitas terhadap
metabolik inhibitors &
antibiotics
KLASIFIKASI MIKRORGANISME
(Ruggiero 2015)

Mikroorganisme

Monera Protista Fungi Virus

Bakteri Arkea Protozoa Alga Cendawan Khamir Kapang

 KLASIFIKASI MIKROORGANISME
Secara umum Mikroorganisme dibagi menjadi
1. Bakteri (Prokariotik)
2. Algae
3. Protozoa (Eukariotik)
4. Fungi
5. Virus (Nonseluler)
Bakteri
• Bakteri adalah organisme yang relatif
sederhana, bersel tunggal (uniseluler).
• Karena materi genetiknya tidak terbungkus
dalam membran inti khusus, sel bakteri disebut
prokariota yang berasal dari dari kata Yunani
yang berarti pranukleus.
• Sel bakteri umumnya muncul dalam salah satu
dari beberapa bentuk.
• Bakteri individu dapat membentuk pasangan,
rantai, cluster, atau pengelompokan lainnya;
formasi seperti itu biasanya merupakan ciri dari
genus atau spesies bakteri tertentu.
 Bakteri
• Bakteri terbungkus dalam dinding sel
yang sebagian besar terdiri dari
kompleks karbohidrat dan protein
yang disebut peptidoglikan.
• Bakteri umumnya berkembang biak
dengan membelah diri menjadi dua
sel yang sama; proses ini disebut
pembelahan biner.
• Untuk nutrisi, sebagian besar bakteri
menggunakan bahan kimia organik,
yang di alam dapat berasal dari
organisme mati atau hidup.
• Beberapa bakteri dapat membuat
makanan mereka sendiri dengan
fotosintesis, dan beberapa dapat
memperoleh nutrisi dari zat
anorganik.
• Banyak bakteri dapat “berenang”
dengan menggunakan alat gerak yang
disebut flagela.
ARCHEA
• Seperti bakteri, archaea terdiri dari sel
prokariotik
• Dinding selnya kekurangan peptidoglikan namun
tersusun, membrane selnya mengandung lipid
• Archaea, sering ditemukan di lingkungan yang
ekstrim, dibagi menjadi tiga kelompok utama.
• Methanogen menghasilkan metana sebagai
produk limbah dari respirasi.
• Halofil ekstrim (halo = garam; philic = mencintai)
hidup di lingkungan yang sangat asin
• Termofil ekstrim (term = panas) hidup di air
panas belerang, seperti mata air panas Archaea
tidak diketahui menyebabkan penyakit pada
manusia.
 ALGA
• Alga adalah eukariota fotosintesis dengan
berbagai bentuk.
• Alga yang menarik bagi ahli mikrobiologi biasanya
uniseluler dan multiseluler
• Dinding sel banyak alga, terdiri dari karbohidrat
yang disebut selulosa.
• Dapat berfotosintesis, alga membutuhkan cahaya,
air, dan karbon dioksida untuk produksi dan
pertumbuhan makanan
• Sebagai hasil fotosintesis, alga menghasilkan
oksigen dan karbohidrat yang kemudian
dimanfaatkan oleh organisme lain, termasuk
hewan.
• Kebanyakan alga ditemukan di laut. Lokasi mereka
tergantung pada ketersediaan nutrisi yang sesuai,
panjang gelombang cahaya, dan permukaan
tempat tumbuh.
Protozoa
• Protozoa adalah mikroba eukariotik uniseluler
• Protozoa bergerak dengan pseudopoda, flagela, atau
silia.
• Amoeba bergerak dengan menggunakan
perpanjangan sitoplasma mereka yang disebut
pseudopoda (kaki palsu).
• Protozoa lain memiliki flagela panjang atau banyak
pelengkap yang lebih pendek untuk bergerak yang
disebut silia.
• Protozoa memiliki berbagai bentuk dan hidup baik
sebagai entitas bebas atau sebagai parasit (organisme
yang memperoleh nutrisi dari inang hidup) yang
menyerap atau menelan senyawa organik dari
lingkungannya.
• Beberapa protozoa, seperti Euglena, bersifat
fotosintesis. Mereka menggunakan cahaya sebagai
sumber energi dan karbon dioksida sebagai sumber
utama karbon untuk menghasilkan gula.
 Protozoa

Paramecium
Amoeba
plasmodium vivax
 FUNGI
• Fungi adalah organisme eukariotik karena selnya memiliki nukleus yang mengandung materi
genetik (DNA) sel dikelilingi oleh selubung khusus yang disebut membran nukleus.
• Organisme dalam kingdom fungi dapat berupa uniseluler atau multiseluler.
• Jamur multiseluler besar, seperti jamur, mungkin terlihat seperti tanaman, tetapi tidak seperti
kebanyakan tanaman, jamur tidak dapat melakukan fotosintesis.
• Bentuk uniseluler jamur: ragi adalah mikroorganisme oval yang lebih besar dari bakteri.
• Jamur yang paling khas adalah kapang jamur membentuk massa yang terlihat yang disebut
miselia, yang terdiri dari filamen panjang (hifa) yang bercabang dan saling terkait.
• Pertumbuhan kapas/benang yang kadang-kadang ditemukan pada roti dan buah adalah
miselia kapang.
• Jamur memperoleh makanan dengan menyerap larutan bahan organik dari lingkungan
FUNGI

Jamur

Kapang

Khamir
 Virus
• Virus sangat berbeda dari kelompok mikroba lain
• Virus sangat kecil sehingga sebagian besar hanya dapat dilihat dengan mikroskop
elektron.
• Secara struktural sangat sederhana, partikel virus mengandung inti yang hanya
terdiri dari satu jenis asam nukleat, baik DNA atau RNA.
• Inti ini dikelilingi oleh lapisan protein, yang kadang-kadang terbungkus oleh
membran lipid yang disebut amplop.
• Virus dianggap hidup hanya ketika mereka berkembang biak di dalam sel inang
yang mereka infeksi. Dalam pengertian ini, virus adalah parasit dari bentuk
kehidupan lain.
• Di sisi lain, virus tidak dianggap hidup karena mereka inert di luar inang hidup.
 Parasit multiseluler
• Meskipun parasit hewan multiseluler tidak sepenuhnya mikroorganisme
• Parasit adalah eukariota kelompok utama adalah cacing parasit adalah cacing pipih
dan cacing gelang, yang secara kolektif disebut cacing.
• Selama beberapa tahap siklus hidup mereka, cacing berukuran mikroskopis.
 Pergolongan Mikroorganisme
• Berdasarkan Sumber energi
Mikroorganisme fototrof : sinar matahari
Mikroorganisme khemotrof : Senyawa organik

• Berdasarkan kebutuhan oksigen

Aerob menggunakan oksigen bebas
Anaerob tidak dapat menggunakan oksigen
Aerob fakultatif dapat hidup dalam keadaan
aerob maupun anaerob
 Mengapa mikroorganisme ada yang bersifat
anaerob dan aeorb, sertakan dengan contoh ?
 Nomenclature

• Penamaan ilmiah dari suatu

mikroorganisme
• Diatur oleh Peraturan
Internasional (The International
Code of Nomenclature of
Prokaryotes).
• Species/genus baru divalidasi dan
dipublikasi di The International
Journal of Systematic and
Evolutionary Microbiology
(former: The International Journal
of Bacteriology)
Cara Penulisan Nama Sistem LINNAEAN

• Huruf sebutan pertama ditulis dengan huruf kapital dan species

(nama kedua) tidak usah dengan huruf kapital, ditulis sebagai
sebutan kedua.
Contoh: Streptococcus pneumonia
Salmonella typhosa
Staphylococcus aureus

• Banyak spesies mengalami perubahan nama dalam kegunaan

sehari-hari, dan juga kurang formal.

Contoh: Streptococcus pneumonia

Diplococcus pneumoniae
pneumococcus

28
 Nama Ilmiah

 Mungkin merupakan suatu penghargaan bagi seorang ilmuwan

 Asal usul dalam bahasa Latin
Contoh. Escherichia coli (E. coli)
- penemu: Theodor Escherich
- menjelaskan tempat hidupnya (habitat) (colon/intestine)

Contoh. Staphylococcus aureus (S. aureus)

- Clustered (staphylo), spherical (cocci)
- Gold colored colonies (aureus)

Contoh. Ralstonia solanacearum (R. solanacearum)

- penemu : Ericka Ralston
- menginfeksi tanaman famili Solanaceae
TERIMA KASIH