APLIKASI FISIKA RADIASI DALAM BIDANG KESEHATAN

Oleh :
Innes Andriani (2220442001)

PASCASARJANA FISIKA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS ANDALAS
2022
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

A. Latar Belakang

Pemberian pengobatan yang tepat sangat penting dalam radioterapi untuk memaksimalkan rasio terapeutik antara
dosis tumor dan dosis jaringan normal. Secara optimal, tumor seluler dan jaringan normal di sekitarnya harus
dicitrakan selama pemberian pengobatan untukmemastikan pemberian pengobatan yang benar. Ini telah memotivasi
kegiatan penelitian yang substansial dalam mengembangkan metode untuk pemantauan gerakan tumor dan
kompensasi selama pengiriman radioterapi.

Beberapa kelompok penelitian mengintegrasikan unit perawatan radioterapi dengan magnetic resonance imaging
(MRI),dan upaya ini baru-baru ini mengarah pada studi hantu pertama yang menunjukkan adaptasi gerak real-time
yang dipandu MRI selama pemberian perawatan.7,8MRI menarik untuk pemantauan tumor dan gerakan organ karena
memberikan pencitraan volumetrik kontras tinggi dari jaringan lunak tanpa menggunakan radiasi pengion.

Dalam penelitian ini, peneliti mengembangkan dan mengevaluasi metode baru untuk pelacakan gerak 3D dalam seri
MRI waktu nyata 2D. Metode ini memperkirakan posisi 3D dari struktur anatomi yang dilacak untuk setiap gambar MRI
2D. Sebagai aplikasi pertama, kami mendemonstrasikan metode pelacakan 3D struktur pembuluh darah dalam gambar
MRI 2D aksial, sagital, dan koronal hati. Pembuluh darah dapat berfungsi sebagai penanda atau pengganti yang dapat
diandalkan untuk menentukan posisi tumor tak terlihat MR pada pasien kanker.
PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

B. Metode

1. Dimensi Data
5. In vitrovalidasi metode
pelacakan 3D
2. Metode untuk Pelacakan
Gerak 3D dalam Gambar MRI 2D
6. Deformasi Hati
3. Relawan dan Akuisisi Gambar
MR
7. Validitas Pelacakan Hati 3D
4. Demonstrasi Metode Pelacakan
3D
PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

B. Metode

1. Diensi data

Sepanjang makalah ini, 2D dan 3D mengacu pada jumlah dimensi spasial.

Semua gambar 2D diperoleh dan direkonstruksi terus menerus dan
dimensi temporal juga hadir. Sementara pemindaian volume 3D tidak
memiliki dimensi temporal, pelacakan 3D secara implisit menunjukkan
pelacakan gerakan 3D dari waktu ke waktu.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA
B. Metode

2. Metode untuk Pelacakan

Gerak 3D dalam Gambar MRI 2D Pertama,pemindaian volumetrik 3D hati diperoleh, dan struktur pembuluh
darah (atau tumor) yang akan dilacak ditentukan [titik pada Gambar.2(a).

Kedua, volume 3D diiris ulang dan disampel ulang untuk menghasilkan

serangkaian irisan 2D dengan orientasi, ketebalan irisan, dan ukuran piksel
yang sama seperti pada rangkaian gambar MRI 2D real-time yang diperoleh
kemudian. Pustaka template 2D [persegi panjang hitam pada Gambar.2(b)

Ketiga, template library digunakan untuk segmentasi berbasis template dalam

seri 2D MRI real- time. Dalam setiap gambar 2D real-time MRI, korelasi
silang yang dinormalisasi antara gambar dan rentang template yang sesuai
di perpustakaan dihitung untuk rentang posisi 2D.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA
B. Metode

3. Relawan dan Akuisisi

Gambar MR

Lima sukarelawan sehat dengan usia rata-rata 42,6 tahun (kisaran: 26-64 tahun) dilibatkan dalam penelitian ini.
Percobaan dilakukan pada pemindai MRI Siemens Avanto 1.5 T (Siemens, Erlangen, Jerman, rilis perangkat lunak
VB17a) menggunakan kumparan penerima jantung 32 saluran.

Untuk mempercepat akuisisi data, pencitraan paralel diterapkan menggunakan teknik rekonstruksi GRAPPA pada
faktor undersampling 2. Gambar 3D direkonstruksi menggunakan sistem rekonstruksi yang disediakan oleh Siemens.
Semua gambar 2D direkonstruksi menggunakan Gadgetron paket perangkat lunak, yang merupakan kerangka kerja
sumber terbuka untuk rekonstruksi pencitraan medis. Rekonstruksi dilakukan secara realtime pada workstation
eksternal dengan AMD© RFX8120 8- prosesor inti dan NVIDIA© RProses Grafis GTX-580-.Setelah akuisisi seri
gambar waktu nyata 2D, pemindaian MRI volumetrik 3D kedua (pemindaian 3D) diperoleh dengan pengaturan yang
sama seperti prapemindaian 3D, dengan tujuan mendeteksi kemungkinan deformasi dan pergeseran hati selama
waktu pemeriksaan.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA
B. Metode

4. Demonstrasi Metode
Pelacakan 3D

Sebagai bukti prinsip, metode pelacakan yang diusulkan didemonstrasikan secara off-line setelah akuisisi citra
menggunakan perangkat lunak internal (Matlab, R2012b, Mathworks, Natick, MA). Untuk masing-masing dari lima
sukarelawan, karakteristik struktur pembuluh darah hati pertama kali dipilih dalam volume MR prescan 3D dan
kemudian dilacak dalam rangkaian gambar 2D waktu nyata berikutnya dengan metode yang diusulkan.

Pelacakan dilakukan dalam dua seri MRI 2D aksial, sagital, dan koronal yang berbeda yang terletak cukup dekat
dengan struktur yang dipilih. Di masing-masing dari enam seri 2D, pelacakan 3D dilakukan dengan dua
perpustakaan template yang berbeda dan tidak tumpang tindih, menghasilkan 12 Lintasan gerak 3D 30 detik per
sukarelawan. Untuk setiap lintasan, amplitudo puncak-ke-puncak pernapasan maksimum dan rata-rata dihitung
menggunakan enam siklus pernapasan berturut-turut. Resolusi pelacakan adalah satu panjang piksel 2D untuk
lokalisasi dalam bidang (1,56-1,67 mm) dan satu panjang voxel 3D untuk lokalisasi melalui bidang (1,56 mm untuk
seri 2D aksial dan koronal, 1,6 mm untuk seri sagital).
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

B. Metode

5. In Vitrovalidasi Metode
Pelacakan 3D

Untuk menyelidiki keakuratan metode pelacakan 3D untuk sistem yang kaku tanpa deformasi, prescan
3D dan pemindaian MRI 2D real-time berikutnya diperoleh dalam semangka menggunakan parameter
pemindaian yang sama dan analisis off-line seperti untuk pemindaian hati. Semangka ditempatkan pada
platform yang secara manual dipindahkan secara bertahap ke arah craniocaudal (CC) dengan
menambahkan spacer plastik dengan ketebalan yang diketahui antara sisi platform dan penyangga tetap.

Seri MRI 2D diperoleh dengan orientasi aksial, koronal, dan sagital untuk sembilan posisi CC semangka yang
mencakup kisaran 17 mm. Kontras MRI antara rongga udara yang terdistribusi secara heterogen dan daging buah
semangka digunakan untuk pelacakan 3D dengan cara yang sama seperti pembuluh darah di parenkim hati. Karena
rongga udara semangka kurang unik daripada pembuluh darah hati sebagai sidik jari untuk posisi bidang, perkiraan
templat 50% lebih besar digunakan untuk semangka daripada hati untuk memastikan pelacakan yang kuat. Posisi CC
yang diperkirakan oleh MRI 2D dibandingkan dengan posisi CC yang sebenarnya.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA
B. Metode

6. Deformasi Hati

Lokalisasi melalui bidang dari struktur pembuluh hati yang dilacak mengasumsikan bahwa struktur tetap pada jarak
yang sama dari irisan hati 2D yang saat ini dicitrakan seperti yang terjadi selama prescan 3D. Dengan demikian,
deformasi hati dianggap dapat diabaikan pada skala panjang hingga beberapa cm. Asumsi ini diuji dalam kumpulan
data MRI saat ini dengan dua cara. Pertama, kemungkinan deformasi hati dan pergeseran antara pra dan pasca
pemindaian 3D diselidiki. Di setiap sukarelawan, area persegi 40×40 piksel dipilih dalam 40 irisan sagital berturut-
turut dari prescan 3D, yang mencakup total volume hati 62×62×64 mm3.

Masing-masing dari 40 kotak dibagi menjadi empat 20 . yang berdekatan×20 templat piksel, menghasilkan total 160
subvolume ukuran 31×31×1,6 mm3 yang semuanya terletak sepenuhnya di dalam hati dan mengandung struktur
pembuluh darah yang khas. Setiap subvolume kemudian digunakan sebagai template dalam pencarian berbasis
template di postingan 3D dapat dilakukan dengan program komputer yang sama seperti yang digunakan untuk
pelacakan 3D dalam rangkaian gambar 2D. Analisis ini menghasilkan pergeseran 3D dari masing- masing 160
subvolume antara pra-pemindaian 3D dan pasca- pemindaian. Rata-rata dan standar deviasi dari pergeseran
subvolume dihitung sebagai ukuran pergeseran dan deformasi hati, masing-masing.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

B. Metode

7. Validitas Pelacakan Hati 3D

Karena gerakan sebenarnya dari struktur kapal yang dilacak tidak diketahui, serangkaian analisis
dilakukan untuk menilai secara tidak langsung validitas metode pelacakan 3D. Gerak hati biasanya
paling besar pada arah CC dengan komponen gerak yang lebih kecil pada arah AP dan bahkan lebih
sedikit pada arah kiri-kanan (LR).Biasanya, ada korelasi kuat antara gerakan CC dan AP sehingga
gerakan kaudal yang terlihat selama inspirasi dikaitkan dengan gerakan anterior simultan. Akibatnya,
ada arah gerak yang lebih disukai di bidang sagital, yang telah terbukti relative stabil dari waktu ke
waktu untuk titik tertentu pada individu tertentu.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA
C. Hasil
Gambar 3. Plot sebar dari posisi CC actual dari struktur
semangka persus posisi CC yang diperkirakan dalam gambar
MRI 2D dengan oriantasi irisan aksial (berlian), koronal
(lingkaran), dan sagittal (salib). Garis kesatuan menggambarkan
estimasi posisi yang sempurna
Gambar 4. Contoh gambar (a) aksial, (b) koronal, dan (c) sagital 2D MRI pada
ekspirasi maksimum (kiri) dan inspirasi (kanan) untuk Relawan 2. Setiap
gambar menunjukkan template yang dipilih dari perpustakaan (inset), posisi
tersegmentasi dari template ini (persegi panjang putih), dan estimasi posisi
3D absolut yang dihasilkan dari struktur yang dilacak dalam milimeter.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

C. Hasil

Posisi CC dari struktur semangka diperkirakan dengan kesalahan akar rata-rata-kuadrat 0,86 mm (MRI aksial),
0,44 mm (MRI koronal), dan 0,59 mm (MRI sagital) dalam seri MRI 2D dengan metode pelacakan 3D (Gbr.3).
Untuk kelima sukarelawan, volume MRI 3D prescan dan postscan dan seri 2D real-time MRI berhasil diperoleh,
direkonstruksi, dan divisualisasikan. Gambar 2D aksial dan sagital memiliki kualitas dan kontras gambar yang
serupa dengan pemindaian 3D, sedangkan gambar koronal memiliki rasio signal-to-noise (SNR) yang lebih
rendah. Namun demikian, ketiga orientasi irisan menunjukkan kualitas gambar yang cukup untuk pelacakan
gerak 3D. Untuk setiap sukarelawan dan orientasi irisan, dua seri MRI 2D dipilih untuk pelacakan 3D. Lebar dan
tinggi rata-rata templat yang digunakan untuk pelacakan adalah 45 mm (kisaran: 30–61 mm) dan 41 mm
(kisaran: 31–53 mm), sedangkan area rata-rata adalah 1854 mm2 (kisaran: 872–3008 mm2).

Gambar 4 menunjukkan contoh gambar MRI hati 2D, dengan templat yang cocok dan estimasi posisi 3D yang
dihasilkan dari struktur yang dilacak dalam fase pernapasan ekstrem untuk subjek yang menunjukkan gerakan
pernapasan terbesar (Relawan 2). Gambar 5 menyajikan kurva gerakan 3D dari struktur pembuluh darah dalam
seri gambar aksial, koronal, dan sagital untuk Relawan 1 dan 2. Secara umum, perkiraan gerakan 3D terbesar
di arah CC, dan besarnya serupa terlepas dari orientasi gambar 2D (Gambar 5 dan Tabel 1).
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

C. Hasil

Untuk Relawan 1, posisi embusan napas dari struktur yang dilacak tetap dekat dengan posisinya di prescan 3D
[(0,0,0) pada Gambar.5], sedangkan Relawan 2 memiliki pergeseran dasar yang besar sebesar 13,4 mm (LR), 12,6
mm (CC), dan 0,5 mm (AP) [Gbr.5 (b)]. Perbandingan dengan postcan 3D [Gbr.5 (b), kanan] menunjukkan bahwa ini
adalah pergeseran sistematis sejati dari sukarelawan, yang dengan demikian dideteksi dengan benar oleh metode
pelacakan 3D di ketiga orientasi gambar 2D. Relawan 2 adalah satu-satunya subjek dengan pergeseran substansial
antara dua pemindaian 3D:

Pergeseran rata-rata dari empat sukarelawan lainnya antara prapemindaian 3D dan pascapemindaian di bawah 2
piksel ke segala arah dengan rata-rata pergeseran rata-rata absolut 1,9 mm (CC), 1,7 mm (AP), dan 0,5 mm (LR).
Relawan 2 juga satu-satunya subjek dengan kecenderungan deformasi antara dua (menghembuskan) scan 3D,
yaitu, pergeseran diferensial sistematis dari 160 subvolume, antara dua scan volume. Di sini, pergeseran CC
bergantung pada posisi lateral dan rata-rata 2,1 mm lebih besar untuk 40 subvolume paling lateral kanan
dibandingkan dengan 40 subvolume paling medial. Standar deviasi rata-rata dari pergeseran subvolume untuk
kelima sukarelawan adalah 1,0 mm (CC), 0,6 mm (AP), dan 0,8 mm (LR).
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

C. Hasil

Mengenai deformasi yang diinduksi pernapasan, segmentasi dari empat 15×Wilayah 15 piksel dalam seri
gambar 2D real-time sagital menunjukkan bahwa rata-rata amplitudo gerakan pernapasan CC selalu lebih
besar (2,3–3,3 mm) untuk wilayah tengkorak daripada untuk wilayah ekor. Tidak ada tren sistematis untuk
pasangan wilayah AP karena amplitudo gerakan CC rata-rata terbesar untuk wilayah anterior untuk beberapa
sukarelawan (hingga 2,3 mm) dan terbesar untuk wilayah posterior untuk yang lain (hingga 2,0 mm)
(perbedaan rata-rata = 0,3 mm). Hasil ini menunjukkan bahwa deformasi hati CC yang diinduksi pernapasan
hingga 3,3 mm pada jarak sekitar 6 cm pada kelompok sukarelawan yang disertakan.

Untuk semua sukarelawan, PC pertama dari empat wilayah yang dilacak di bidang sagital berada di arah
tengkorak dengan kemiringan antara 8,9◦ dan 21.1◦ menuju arah posterior (panah hitam pada Gambar.6).
Penyimpangan absolut rata-rata antara arah ini dan PC pertama dari gerakan 3D seperti yang diperkirakan
dari kumpulan data 2D (panah yang tersisa pada Gambar.6) dulu 3.0◦ (±2.0◦, 1 standar deviasi) (seri aksial),
1,5◦ (±1.6◦) (irisan sagital), dan 2,9◦ (±2.0◦) (irisan koronal).
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

C. Hasil
Perbedaan RMS antara gerakan CC melalui bidang yang diperkirakan dari dua templat yang tidak tumpang
tindih dalam seri aksial 2D yang sama memiliki nilai rata-rata 2,0 mm (kisaran: 1,3–3,2 mm) dan melebihi 2 mm
hanya untuk Relawan 2. Gambar 7 menunjukkan perkiraan gerakan melalui bidang dan lokasi templat untuk
kasus dengan perbedaan RMS mendekati nilai rata-rata dan untuk kasus dengan perbedaan RMS tertinggi.
Gambar 8 membandingkan perbedaan amplitudo pernapasan CC antara lokasi templat posterior dan anterior
dalam seri aksial dengan perbedaan amplitudo CC antara bagian hati posterior dan anterior yang diukur secara
langsung dalam bidang oleh pelacakan wilayah dalam irisan sagital.

Meskipun tidak berkorelasi signifikan (p=0,08, uji peringkat Spearman), perbedaan amplitudo pernapasan yang
diukur melalui bidang cukup sesuai dengan perbedaan amplitudo yang diukur di dalam bidang antara bagian
posterior dan anterior hati (berarti perbedaan absolut 1,4 mm antara perbedaan amplitudo melalui bidang dan
dalam bidang ).

Waktu perhitungan korelasi silang untuk gambar MRI 2D secara kasar sebanding dengan panjang dan lebar
template, panjang dan lebar area pencarian, dan jumlah bidang yang dicari di perpustakaan template. Waktu
perhitungan untuk ukuran template rata-rata (29×27 piksel) dalam volume pencarian 3D 25×25×25 voxel adalah 90
ms dalam implementasi Matlab saat ini. Ini akan jauh lebih cepat dalam implementasi klinis, menggunakan C++
atau bahasa pemrograman yang setara, yang menunjukkan bahwa pelacakan 3D dapat dilakukan secara real-time.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

C. Hasil

Tabel 1. Rata-rata [dan jangkauan] dari gerakan hati puncak-ke-puncak yang diukur dalam seri 2D
real-time MRI untuk lima sukarelawan. Font tebal menunjukkan gerakan melalui bidang.

Orientasi irisan 2D Gerakan LR (mm) Gerakan CC (mm) Gerakan AP (mm)

 
Aksial 2.5[1.6–3.3] 15.3[10.9–18.8] 3.5[1.6–4.7]

Maksimum untuk seluruh seri Mahkota 2.5[1.6–6.3] 14.6[10.9–20.0] 4.1[3.1–6.3]

sagital 3.8[3.2–4.8] 13.0[9.4–15.6] 3.8[3.1–4.7]
Aksial 1.8[0–3.1] 12.1[4.7–18.8] 2.5[1.6–4.7]

Rata-rata enam siklus Mahkota 1.2[0–3.1] 10.0[4.7–20.0] 2.4[0–4.7]

pernapasan berturut-turut

sagital 1.9[0–4.8] 11.0[7.8–15.6] 2.7[0–4.7]

 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

C. Hasil

Gambar 6. Arahan komponen utama pertama untuk Relawan 1–5 pada bidang sagital untuk empat wilayah
terlacak dalam bidang dalam bidang sagital (hitam) dan untuk pelacakan 3D dalam rangkaian MRI 2D.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

D. D.
Pembahasan
DISKUSI

Gambar 7. Gerakan melalui bidang

kraniokaudal diperkirakan menggunakan
lokasi perpustakaan templat posterior dan
anterior yang tidak tumpang tindih dalam
seri MRI 2D aksial untuk (a) Relawan 1 dan
(b) Relawan 2 Gambar yang disisipkan
menunjukkan posisi templat. Perbedaan
RMS antara kurva gerak yang diperkirakan
oleh dua lokasi template ditunjukkan.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

D. Pembahasan

Gambar 8. Perbedaan amplitudo

gerakan puncak-ke-puncak rata-rata
craniocaudal be-antara daerah hati
posterior dan anterior yang diukur
dalam bidang dalam irisan sagital
dan melalui bidang dalam irisan
aksial untuk lima sukarelawan. Garis
lurus menggambarkan korelasi
kesatuan.
 PELACAKAN GERAKAN HATI TIGA DIMENSI MENGGUNAKAN MRI
DUA DIMENSI WAKTU NYATA

E. Kesimpulan

Sebuah metode untuk pelacakan 3D dalam gambar MRI 2D yang secara

eksplisit menjelaskan gerakan melalui bidang dikembangkan dan
didemonstrasikan untuk seri gambar aksial, koronal, dan sagital di hati. Alur kerja
yang diterapkan dapat langsung digunakan dalam MR-Linac untuk pelokalan
waktu nyata 3D dalam gambar MRI 2D pada frekuensi yang dapat digunakan
untuk adaptasi sinar waktu nyata terhadap gerakan pernapasan.
THANK YOU