KULIAH BIOMEDIK I-BIOKIMIA

UNTUK MAHASISWA FKUH-2020

SEMESTER I
Oleh : Rosdiana Natzir
 TOPIK MATAKULIAH

Dasar Biokimiawi Tubuh Manusia

(Atom, ikatan kimia dan komponen
organik)
SASARAN PEMBELAJARAN ;
▣ Setelah menyelesaikan mata kuliah ini,
mahasiswa akan mampu mengenali dan
menganalisis aspek Biokimia berbagai proses
tubuh yang terkait dengan Dasar Biokimiawi
Tubuh Manusia (Atom, ikatan kimia dan
komponen organik) untuk mempertahankan
fisiologis tubuh yang optimal, dan mampu
mengintegrasikan dan menerapkannya pada
Blok/sistem pembelajaran terkait selanjutnya
 POKOK BAHASAN
▣ Komposisi utama Kimiawi Normal Tubuh
manusia.
▣ Berbagai Unsur Atom ( berguna bagi tubuh
dan yang toksik )
▣ Senyawa-senyawa Kimia sebagai Dasar
Kehidupan
▣ Biomolekul kompleks utama penyusun tubuh
manusia.
▣ Ikatan dasar biokimia dan interaksinya.
▣ Komponen organik dalam tubuh manusia.
 SUBPOKOK BAHASAN
1. Menjelaskan Komposisi utama Kimiawi Normal
Tubuh manusia.
2. Menjelaskan Berbagai Unsur Atom ( berguna
bagi tubuh dan yang toksik )
3. Menjelaskan bentuk Senyawa-senyawa Kimia
sebagai Dasar Kehidupan
4. Menjelaskan bentuk Biomolekul kompleks
utama penyusun tubuh manusia.
5. Menjelaskan bentuk Ikatan dasar biokimia dan
interaksinya.
6. Menjelaskan bentuk Komponen organik dalam
tubuh manusia.
 Komposisi tubuh manusia

Unsur utama, minor dan unsur sisa :

▣ Hampir 99% dari massa tubuh manusia
tersusun oleh enam unsur: oksigen, karbon,
hidrogen, nitrogen, kalsium, dan fosfor.
▣ Hanya sekitar 0,85% yang disusun oleh lima
unsur lainnya: kalium, belerang, natrium,
klorin, dan magnesium. Seluruh sebelas
unsur tersebut diperlukan untuk hidup.
▣.
▣ Unsur yang tersisa adalah unsur renik (< 1
microgr/ per gram ), yang lebih dari selusin
diperkirakan (berdasarkan bukti yang baik)
diperlukan untuk hidup. Jika seluruh massa
unsur renik diletakkan bersama-sama (kurang
dari 10 gram untuk tubuh manusia).
▣ Tubuh manusia dewasa dengan berat rata-rata
70 kg mengandung sekitar 7×1027 atom dan
sekurang-kurangnya 60 unsur kimia yang
terdeteksi renik.
▣ Sekitar 29 unsur dari jumlah ini diperkirakan
memainkan peran positif aktif dalam
kehidupan dan kesehatan manusia
▣ Jumlah relatif masing-masing unsur bervariasi
menurut individu, terutama karena perbedaan
proporsi lemak, otot dan tulang dalam tubuh
mereka.
▣ Orang dengan lemak lebih banyak akan memiliki
proporsi karbon yang lebih tinggi dan proporsi
sebagian besar unsur lain yang lebih rendah.
▣ Proporsi hidrogen kira-kira sama. Jumlah dalam
tabel adalah rata-rata jumlah yang berbeda yang
dilaporkan berdasarkan referensi perbedaan
▣ Rata-rata tubuh manusia dewasa mengandung
air ~53%. Hal ini sangat bervariasi menurut
usia, jenis kelamin, dan adipositas.
▣ Dalam sampel besar orang dewasa dari semua
umur dan kedua jenis kelamin, angka untuk
fraksi air menurut beratnya ditemukan 48 ± 6%
untuk wanita dan 58 ± 8% air untuk laki-laki
UNSUR ESENSIAL UNTUK MANUSIA EFEK NEGATIF

OKSIGEN Air; akseptor elektron Spesies oksigen

reaktif
KALIUM Senyawa organik
HIDROGEN Air
NITROGEN DNA ; asam amino
KALSIUM Kalmodulin; hidroksiapatit dalam
tulang
FOSFOR DNA ; fosforilasi Putih, toksik
KALIUM Na-K-ATP ase
BELERANG Sistein, Metionin, Biotin, Tiamin

NATRIUM Na-K-ATP ase

KLORIN ATPase transport klorida
MAGNESIUM berikatan dengan ATP dan
nukleotida lainnya
BESI Hemoglobin, Sitokrom)
FLUOR mungkin >> toksik
SENG protein
UNSUR ESENSIAL UNTUK MANUSIA EFEK NEGATIF

STRONSIUM ------

BROM --------

TIMBAL tidak toksik

TEMBAGA protein tembaga

ALUMINIUM tidak

KADMIUM tidak toksik

BARIUM Tidak toksik

TIMAH Tidak

IODIUM tiroksin, triiodotironin

TITANIUM Tidak

BORON Mungkin

SILIKON Mungkin
UNSUR ESENSIAL UNTUK MANUSIA EFEK NEGATIF

ARSENIK Mungkin Toksik

LITHIUM ----- Toksik

AIRRAKSA Tidak Toksik

MOLIBDENUM molibdenum
oksotransferase, , Xantin
oksidase , Sulfit oksidase

KOBALT Kobalamin vit.B12

ANTIMON tidak Toksik

PERAK tidak

TORIUM tidak toksik, radioaktif

URANIUM tidak toksik, radioaktif

UNSUR ESENSIAL UNTUK EFEK NEGATIF
MANUSIA

BELERIUM Tidak >> toksik

RADIUM Tidak toksik, radioaktif

TALIUM Tidak sangat toksik

EMAS tidak Mungkin genotoksik

VANADIUM Mungkin (diperkirakan faktor

pertumbuhan osteo-
metabolisme (tulang)

SELENIUM Ya >> toksik

NIKEL mungkin >> toksik

KROMIUM Ya

MANGAN Ya misal Mn-SOD

Basic biochemical bonds and their interactions
 Senyawa Kimia sebagai Dasar
Kehidupan
▣ Senyawa-senyawa yang bermolekul besar dan
kecil yang berhubungan dengan senyawa
kimia dalam sistem hidup disebut biomolekul
▣ Sebagian besar (99%) dari unsur-unsur
biomolekul adalah karbon,nitrogen,oksigen
dan hidrogen serta fosfor dan belerang.
▣ Senyawa dasar dalam sel hidup secara tahap
diubah ke dalam senyawa yang lebih kompleks
baik fungsi maupun strukturnya.
▣ Molekul sederhana terutama CO2, H2O dan
nitrogen atmosferik diubah melalui senyawa
dasar menjadi satuan penyusun oleh jasad/sel
hidup.
▣ Satuan penyusun ini bergabung melalui ikatan
kovalen menjadi makromolekul dan
selanjutnya membentuk molekul yang lebih
besar lagi adalah supramolekul
▣ Unsur-unsur utama penyusun tubuh adalah
karbon (C), hidrogen (H), oksigen (O) dan
nitrogen (N).
▣ Selain itu masih terdapat beberapa unsur lain
yaitu: kalsium (Ca), fosfor (P), kalium (K),
sulfur (S), natrium (Na), klor (Cl), magnesium
(Mg), besi (Fe), mangan (Mn) dan iodium (I)
 BIOMOLEKUL KOMPLEKS UTAMA PENYUSUN TUBUH
Biomolekul Molekul Pembangun Fungsi Utama
DNA Deoksiribonukleotida Materi genetik

RNA Ribonukleotida Sintesis protein

Protein Asam amino Sangat banyak, umumnya

menjadi bagian dari sel yang
melangsungkan kerja (enzim,
unsur kontraktilitas dll.)

Polisakarida berupa glikogen Glukosa Simpanan energi jangka

pendek.

Lipid Asam lemak Sangat banyak, misalnya

simpanan energi jangka
panjang, komponen membran
sel dll.
 Ikatan Kimia
▣ Molekul di dalam tubuh, baik yang sederhana
maupun yang kompleks, dapat terbentuk
karena adanya ikatan kimia.
▣ Ikatan kimia digolongkan menjadi 2 yaitu
ikatan kovalen dan ikatan non kovalen.
▣ Ikatan non kovalen terdiri atas : ikatan ionik,
ikatan hidrogen dan ikatan Van Der Waals.
a. Ikatan kovalen
▣ Ikatan kovalen adalah ikatan yang terbentuk
oleh valensi dari masing-masing atom. Contoh
dari ikatan kovalen adalah CO2. Dalam hal ini
valensi C adalah 4 dan valensi O adalah 2.
▣ elektron-elektron yang tidak terlibat dalam
ikatan kovalen disebut elektron bebas. Elektron
bebas ini berpengaruh dalam menentukan
bentuk molekul.
▣ b. Ikatan ionik
▣ Ikatan ionik adalah ikatan antara dua gugus
dengan muatan berlawanan. Contohnya
adalah ikatan antara substrat dan enzim.
Pembentukan ikatan ionik dilakukan dengan
cara transfer elektron, transfer elektron ini
akan menghasilkan suatu ikatan ionik yang
mempersatukan ion anion dan kation.
▣ Ikatan hidrogen
▣ Ikatan hidrogen adalah pengikatan satu atom
hidrogen oleh dua atom lain yang berbeda.
▣ Ikatan hidrogen ini terjadi pada ikatan antara
atom H dengan atom N, O, dan F yang
memiliki pasangan elektron bebas. Hidrogen
dari molekul lain akan bereaksi dengan
pasangan elektron bebas ini membentuk suatu
ikatan hidrogen dengan besar ikatan
bervariasi.
▣ Atom yang mengikat hidrogen lebih kuat
disebut donor hidrogen sedang lainnya
dinamakan akseptor hidrogen
▣ Ikatan hidrogen saat atom hidrogen terikat
kovalen ke atom yang elektronegatif kuat
seperti nitrogen atau oksigen
▣ Kekuatan ikatan hidrogen ini dipengaruhi oleh
beda keelektronegatifan dari atom-atom
penyusunnya. Semakin besar perbedaannya
semakin besar pula ikatan hidrogen yang
dibentuknya.
▣ Ikatan Van Der Waals
▣ Van Der Waals lahir di Leiden, Belanda
▣ Ikatan Van Der Waals adalah daya tarik non
spesifik, yang berperan pada saat dua atom
berjarak 3-4 Angstrom, terjadi pada saat dua atom
berdekatan sehingga terjadi penolakan dan
penarikan bersifat dipolar atau elektrostatis dan
jauh lebih lemah dari pada ikatan hidrogen.
▣ Contoh :gaya van der waals terdapat pada
senyawa hidrokarbon. Misalnya pada senyawa
CH4
 Komponen Organik
▣ Pembeda antara kimia organik dan
anorganik adalah ada/tidaknya ikatan karbon-
hidrogen.
▣ Senyawa organik adalah golongan
besar senyawa kimia yang molekul nya
mengandung karbon,kecuali karbonat, dan
oksida karbon..
▣ Banyak di antara senyawaan organik,
seperti protein, lemak, dan karbohidrat,
merupakan komponen penting
dalam biokimia.
Karbon adalah atom utama untuk kehidupan.

Karena atom C mengandung

4 elektron di kulit terluarnya,
atom C dapat berpasangan
dalam banyak cara dengan
banyak atom berbeda dalam
"upaya" untuk mengisi kulit
terluarnya.
 Carbon is the Central Atom of
Life.

glucos
e

amino acids

fat
Some Useful
Nomenclature

Belajar
mengenali
kelompok
kimia ini.
Dalam Biologi, Bentuk Molekuler Itu Penting

Some major types of biological

molecules.
 Molecules of
Life
Bagaimana Anda membangun sel?
Start with water, add lots
of small carbon-
containing molecules and
…….

use these four major classes of biological

molecules.
 Monomers, Polymers and
Macromolecules
Banyak molekul biologis adalah
makromolekul - kumpulan atom
dengan ukuran sangat besar.

Makromolekul dibentuk dengan

menghubungkan satu set blok
bangunan (monomer) menjadi
rantai panjang (polimer).
 KARBOHIDRAT
▣ Karbohidrat sendiri terdiri atas karbon,
hidrogen, dan oksigen
▣ Di dalam tubuh makhluk hidup, karbohidrat
mempunyai fungsi utama sebagai sumber
energi, namun di samping itu beberapa
senyawa karbohidrat juga merupakan
pembentuk struktur tubuh, misalnya selulosa
yang merupakan komponen utama dinding sel
tumbuhan dan chitin yang banyak ditemukan
pada cangkang serangga dan dinding sel
jamur.
▣ Karbohidrat biasa disebut juga karbon hidrat,
hidrat arang, sacharon (sakarida) atau gula.
Karbohidrat berarti karbon yang terhidrat.
Rumus umumnya adalah Cx(H2O)y.
Karbohidrat dibuat oleh tanaman melalui
proses fotosintesis.
 KARBOHIDRAT
Karbohidrat digunakan untuk energi dan untuk
membuat struktur. Bahan penyusun karbohidrat adalah
gula sederhana

Contoh ketiga struktur sederhana gula.

Menghubungkan Gula Sederhana - Langkah
Pertama ke struktur Polimer

monosaccharide a
s disaccharide
Karbohidrat kompleks adalah polimer rantai
panjang yang terbuat dari gula sederhana
Some Familiar and Important Complex
Carbohydrates

Perhatikan cara makromolekul kompleks dibangun dengan

menghubungkan unit berulang sederhana.
 Karbohidrat
adalah kunci
utama dalam
Produksi dan
Penyimpanan
Energi
Karbohidrat bentuk Kompleks Sering
Digunakan untuk Membuat Struktur

Selulosa adalah makro

molekul paling melimpah
di bumi - dan Anda
mungkin sedang mema --
kai nya sekarang.
 LIPID=LEMAK
▣ Lipid merupakan kelompok senyawa yang
penting bagi kelangsungan hidup.
▣ Tubuh manusia mengandung kurang lebih
15% lipid.
▣ Fungsinya sebagai sumber energi, cadangan
energi dalam bentuk triasilgliserol, sebagai
insulator yaitu penahan panas agar suhu tubuh
dapat dipertahankan dalam kondisi normal.
▣ Lipid merupakan sumber energi dan memiliki sifat
mudah larut dalam pelarut organik dan sukar larut
dalam air .
▣ Fosfolipid dan kolesterol adalah senyawa-senyawa
penting yang membentuk membran sel dan
prekursor hormon-hormon seksual.
▣ Lipid juga ada yang berperan sebagai vitamin
yaitu A,D,E,K.
▣ Vitamin-vitamin ini mempunyai struktur kimia
yang berbeda satu sama lain, namun mempunyai
satu kesamaan yaitu sukar larut di dalam air
namun mudah larut dalam pelarut organik
Lipid adalah Molekul Hidrofobik Yang Ada Dalam
Tiga Bentuk Utama

Fa
 Stero
l

Phospholip
id
Lipid : Menghubungkan Rantai
Asam Lemak ke Gliserol yg memiliki
3 molekul C

Space-filling model
of a fat
A fatty
acid
Molecular Structure of a
Fat
Fats are
Used in
Energy
Storage
and
Production
Tingkat Saturasi Dari Lemak Mempengaruhi Sifat
Fisik Dan Kesehatan

Dimana ikatan rangkapnya?

ikatan karbon ganda membuat asam lemak
tak jenuh /unsaturated fatty acid , lebih
cenderung menjadi minyak cair daripada
lemak padat pada temperatur ruangan.
Cis and Trans polyunsaturated Fats

all cis polyunsaturated

 “Good
”
Omega-3-
fatty acids

mono-
and poly-
unsaturated

saturated
trans

“Bad
”
 At a Store Near You

The new line

showing levels of
trans fat

Beginning January 1, 2006, the FDA

required that the amount of trans
fat be listed on all food labels.
Sterols

Note the four ring structure

common to all sterols.
Sterols are:

1) Essential membrane components and

2) Form many hormones.
Sterols As
Hormones such as:
- Estrogen,
- Testosterone,
- Progesterone,
- Corticosteriods
(cortisol) are all
steroid hormones.
Phospholipids are Building Blocks of Cellular
Membranes

Kelompok kepala hidrofilik dan Ekor hidrofobik adalah fungsi utama

fosfolipid.
Fosfolipid membentuk Membran Biologis Lapisan
Ganda
 Protei
n
** Protein adalah elemen kunci
kehidupan.
* * struktur protein menentukan
fungsinya.
** Karena protein merupakan
bagian utama sel, maka struktur
protein menentukan fungsi sel.
▣ Protein adalah senyawa organik kompleks
berbobot molekul besar yang terdiri dari asam
amino yang dihubungkan satu sama lain
dengan ikatan peptida.
▣ Molekul protein mengandung karbon,
hidrogen, oksigen, nitrogen dan kadang kala
sulfur serta fosfor.
▣ Protein berperan penting dalam pembentukan
struktur, fungsi, regulasi sel-sel makhluk
hidup dan virus.
▣ Protein juga bekerja sebagai neurotransmiter
dan pembawa oksigen dalam darah
(hemoglobin).
▣ Protein juga berguna sebagai sumber energi
tubuh.
▣ Tubuh manusia terdiri dari sekitar 100 trilyun
sel, masing-masing sel memiliki fungsi yang
spesifik.
▣ Setiap sel memiliki ribuan protein berbeda,
yang bersama-sama membuat sel melakukan
tugasnya.
▣ Protein tersusun dari monomer-monomer
asam amino. Di dalamnya memiliki gugus
karboksil dan gugus amino.
Protein Keratin Membuat Rambut
Protein adalah Rantai Linear dari Asam Amino Terkait
Amino Acids, Peptide Bonds, Polypeptides, Protein

Proteins are linear chains of 20 different building blocks called

amino acids.

Peptide bonds
Amino acids are linked by peptide bonds – a form of
covalent bond.
Protein adalah
Struktur yg terlipat
bentuknya dan
berfungsi tergantung
pada urutan Asam
Amino
Nucleic
Acids
Ada dua macam asam
nukleat, DNA dan RNA.
Keduanya terlibat dalam
penyimpanan dan aliran
informasi dari gen ke produk
gen.
RNA juga memainkan peran
pengaturan yang penting.

DNA
Nukleotida
Adalah
Monomer Yang
Membuat
Polimer DNA
dan RNA
 Nukleotida Penting dalam bbrp hal :

Nukleotida
memberi bahan
bakar pada sel dan
mengoordinasikan
metabolisme.

ATP, modal
energi utama
sel.
 Sekian
Wassalam wr wb
Semoga sukses selalu