O O O O
H2O, H +
NHCHC NHCHC H2NCHCOH
2H + H 2NCHCO 2H
H
kalor
R R' R R'
H 2N C H
Gugus -amino
R variasi struktur terjadi
dalam rantai samping
CHO CO 2H
HO C H H 2N C H
CH 2OH R
CO2H
Dalam Asam
Dalam Basa
Klasifikasi asam amino menurut fungsi biologisnya
NH2
arginina* arg H2NCNHCH 2CH2CH2CHCO 2H
NH2 NH2
O
NH2
Nama Singkatan Struktur
asam aspatat asp HO2CCH 2CHCO 2H
NH2
sisteina cys HSCH 2CHCO 2H
(cysteine)
NH2
glu HO2CCH 2CH2CHCO 2H
asam glutamat
O NH2
NH2
NH2
lisina* lys H2NCH 2CH2CH2CH2CHCO 2H
NH2
NH2
Nama Singkatan Struktur
pro CO2H
pirolina N
H
thr OH
treonina*
CH3CHCHCO 2H
NH2
Nama Singkatan Struktur
CH2CHCO 2H
triptofan* try
N NH2
H
tirosina tyr
(tyrosine) HO CH2CHCO 2H
NH2
NH2
ikatan peptida
O O O O
-H2O
H2NCHCOH + H2NCH2COH H2NCHC NHCH2COH
CH3 CH3
CH3 CH3
alanilglisina glisilalanina
Asam amino dengan gugus amino bebas biasanya ditaruh
pada ujung kiri struktur itu. Asam amino ini disebut asam
amino N-ujung.
Asam amino dengan gugus karboksil bebas ditaruh diujung
kanan disebut asam amino C-ujung.
C-ujung di kanan
N-ujung di kiri
O O O
CH3 CH2 OH
alaniltirosilglisina
suatu tripeptida
STRUKTUR PROTEIN
PRIMER, SEKUNDER (HELIKS), TERSIER (GLOBULER) ATAU KUARTERNER
(POLIGLOBULER
URUTAN ASAM AMINO
STRUKTUR
PRIMER
ATAU
STRUKTUR
SEKUNDER
KUMPARAN TAK BERATURAN
HELIKS
ATAU
LEMBARAN BERLIPAT
SUB UNIT
MIOGLOBIN HEMOGLOBIN
H Protein Secondary Structure:
N
C H Helix
C
O N
C H
C
H
O N +
C -
N C H O H O
C H
O H N C N C OH
C C C
O N
C
H H
O C H C H C H
H H HO H
H N
C
N C
C O
O
H Protein Secondary Structure:
N
C
C
H
N
Helix
O C
C
H
O
H N - +
C C H O H O
N O
C H
H N C N C OH
C C C
O N H H
C
C H C H C H
O H H HO H
H N
C
N C
C O
O
Protein Secondary Structure:
Helix
R
R
R groups stick out R
R
from the helix R
influencing higher R
R
levels of protein R
R
organization R
R
R
R
R
Protein Secondary Structure:
Pleated Sheet
O H O H O H O H
C C C C
C C N C C N C C N C C N
N C N C N C N C
H O H O H O H O
O H O H O H O H
C C N C C N C C N C C N
N C C N C C N C C N C C
H O H O H O H O
Protein Secondary Structure:
Pleated Sheet
O H O H O H O H
C C C C
C C N C C N C C N C C N
N C N C N C N C
H O H O H O H O
O H O H O H O H
C C N C C N C C N C C N
N C C N C C N C C N C C
H O H O H O H O
O H O H O H O H
C C C C
C C N C C N C C N C C N
N C N C N C N C
H O H O H O H O
Protein sequencing
1a. Apa yang dimaksud dengan sifat dipolar dari asam amino?
b. Mengapa asam amino bersifat amfoter, tuliskan reaksinya
dengan asam dan basa.
c. Apa yang dimaksud ikatan peptida .
d. Tuliskan struktur tripeptida dari Alanin-Tirosin-Sistein
e. Jelaskan perbedaan struktur primer, sekunder, tersier, dan kuartener dari protein
H H
H3C C COOH HSH 2C C COOH
NH 2 NH 2
Alanin sistein
H
HO CH2 C COOH
NH 2
tirosin