GLIDING MYXOBACTERIA

( TIMORIA NOVALINDA / 170301013 )

1. MYXOCOCCUS
a. PENGERTIAN MYXOCOCCUS
Beberapa bakteri menunjukkan motilitas yang disebut gliding. Gliding
bacteria mempunyai tangkai panjang atau filament yang khas dalam
morfologi.nya, tidak mempunyai flagella tetapi dapat berpindah saat menyentuh
permukaan.Myxobacteria ("bakteri lendir") adalah kelompok bakteri yang
sebagian besar hidup di tanah dan memakan zat organik yang tidak larut.

Satu kelompok dari gliding bacteria, fruiting myxobacteria, mempunyai

susunan struktur multiseluler yang disebut fruiting bodies dan menunjukkan siklus
hidup yang kompleks melibatkan komunikasi interseluler. Secara filogenetis,
gliding bacteria adalah anggota dari Deltaproteobacteria. Fruiting myxobacteria
menunjukkan pola perilaku dan siklus hidup yang paling kompleks dari semua
bakteri. Untuk menyandi kompleksitas tersebut, kromosom dari myxobacteria ini
sangat besar. Sebagai contoh Myxococcus xanthus, memiliki kromosom tunggal
yang melingkar 9.2 Mbp, dua kalinya Escherichia coli. Memang , kromosom
tersebut 2/3 dari ukuran seluruh genom milik yeast, eukariota, yang
didistribusikan di 16 kromosom. Sel vegetatif dari fruiting myxobacteria itu
sederhana, tidak berflagella, tangkai gram negative yang dapat menggelinding di
atas permukaan dan memperoleh nutrisi primer mereka dengan melisis bakteri
lain dan menggunakan nutrient yang terlepas. Dibawah kondisi appropriate,
segerombolan agregat sel vegetatif dan mengkonstruksi fruiting bodies, dengan
beberapa sel yang terkonversi menjadi struktur resting yang disebut myxospores.

b. MORFOLOGI
Myxobacteria memliki Mifamili memiliki genom yang sangat besar, relatif
terhadap bakteri lain, misalnya 9-10 juta nukleotida kecuali Anaeromyxobacter
dan Vulgatibacter Salah satu myxobacteria, Minicystis rosea, memiliki genom
terlahir terbesar dengan lebih dari 16 juta nukleotida. Yang kedua terbesar adalah
myxobacteria Sorangium cellulosum lainnya. Myxobacteria termasuk di antara
kelompok delta proteobacteria, takson besar bentuk Gram-negatif.

c. HABITAT
Myxobacteria adalah keluarga penggali bakteri yang menarik yang
menghasilkan tubuh buah dalam kondisi kelaparan. Mereka umum ditemukan di
kotoran hewan dan tanah kaya organik dari pH netral atau basa. Beberapa di
antaranya tumbuh dengan memanfaatkan selulosa, namun banyak di antaranya
diberi antibiotik sekresi. untuk membunuh bakteri lain dan kemudian
menghasilkan enzim untuk melisiskan sel mangsanya.

Sel vegetatif mengekskresikan lendir, dan meninggalkan jejak lendir saat

berpindah diatas permukaan yang padat. Jejak tersebut kemudian digunakan oleh
sel lain yang berkerabat. Fruiting bodies yang tersusun adalah sebuah struktur
yang kompleks yang diproduksi oleh diferensiasi sel di daerah tangkai dan
bantalan kepala myxospora. Fruiting bodies tidak akan tersusun jika adequate
nutrient untuk pertumbuhan vegetatif itu ada tetapi selama kekurangan nutrien,
kawanan sel vegetatif mulai berbuah. Agregat sel, kemungkinan melalui respon
chemotactic dengan sel bermigrasi ke arah satu sama lain dan membentuk
gundukan atau tumpukan sel; sebuah single fruiting body memiliki sel sebanyak
109 atau lebih. Saat massa sel bertambah, diferensiasi fruiting body menjadi
tangkai dan kepala dimulai. Tangkai adalah hasil perubahan dari lendir, dengan
sedikit sel yang mungkin bisa terperangkap. Sebagian besar sel terakumulasi
dalam kepala fruiting body, dimana mereka mengalami diferensiasi menjadi
myxospora. Pada genera tertentu, myxospora diapit struktur berdinding besar
yang disebut kista.Dibandingkan dengan sel vegetatif, myxospora lebih resisten
terhadap kekeringan, vibrasi sonic, radiasi UV dan panas, tetapi derajat resistensi
terhadap panasnya lebih rendah daripada endospora bakteri. Fungsi utama dari
encysted myxospore adalah untuk mengaktifkan organisme untuk bertahan hidup
selama kekeringan di habitatnya. Setelah diseminasi ke habitat yang cocok atau
pemulihan kondisi pertumbuhan yang memadai, akhirnya myxospore
berkecambah oleh pecahnya kapsul, dengan pertumbuhan dan munculnya sel
vegetatif.
 Myxobacteria biasanya terpigmentasi oleh pigmen karotenoid, dan pigmen
utamanya adalah karotenoid glukosidase. Formasi pigmen dibantu dengan sinar
dan salah satu fungsi dari pigmen adalah fotoproteksi, yang dibutuhkan karena di
alam myxobacteria biasanya menyusun fruiting bodies dalam cahaya. Pada genus
Stigmatella, cahaya menstimulasi formasi fruiting body dan mengkatalisis
produksi lipid feromon 2,5,8-trimethyl-8-hydroxy-nonane-4-one. Substansi ini
menginisasi tahapan agregasi. Fruiting myxobacteria terklasifikasi dalam
morfologi dasar menggunakan karakteristik dari sel vegetatif, myxospore dan
struktur fruiting body dan pada dasar filogenetis, menggunakan 16S rRNA
analisis sekuensi gen.
2. STIGMATELLA

A.. PENGERTIAN STIGMATELLA

Stigmatella aurantiaca adalah anggota myxobacteria, kelompok bakteri

gram negatif dengan siklus hidup perkembangan yang kompleks. S. aurantiaca,
seperti spesies myxobacterial lainnya, memiliki siklus hidup yang kompleks
termasuk meluncur sosial (swarming), pembentukan tubuh buah, dan perilaku
makan predator. Bakteri tidak berenang, tapi meluncur pada permukaan
meninggalkan jejak lendir, membentuk biofilm mobile. Ini biasanya tumbuh di
permukaan membusuk kayu lunak atau jamur.

B. MORFOLOGI

S. aurantiaca ditemukan pada kayu atau jamur yang membusuk dan jarang
ditemukan pada sampel tanah. Protein yang disekresikan dan tidak disekresikan
yang terlibat dalam perilaku makan mereka, diidentifikasi secara langsung atau
secara spekulatif berdasarkan analisis proteom, termasuk enzim yang mampu
memecah berbagai pilihan peptidoglikan, polisakarida, protein dan detritus sel
lainnya. Berbagai senyawa lain yang disekresikan yang mungkin terlibat dalam
predasi meliputi antibiotik seperti stigmatellin, yang beracun untuk jamur ragi dan
filamen tetapi tidak kebanyakan bakteri, dan aurafuron A dan B, yang
menghambat pertumbuhan berbagai jamur filamen.

C. HABITAT

Spesies stigmatella kemudian muncul di alam untuk membantu

menguraikan sisa-sisa biologis yang tidak larut. Ini hanya berhubungan jauh
dengan mioksobakteri selulolitik, tidak menghasilkan selulase, dan sangat
bakteriofisik. Oleh karena itu, Stigmatella mengkonsumsi organisme yang
memakan kayu ketimbang memberi makan kayu secara langsung. Selain bakteri,
produksi antibiotik antijamurnya menunjukkan bahwa spesies Stigmatella dapat
memberi makan pada ragi dan jamur juga, atau sebaliknya, dapat menyarankan
agar Stigmatella bersaing dengan jamur untuk sumber daya bersama. Dengan
memproduksi senyawa antimikroba, Stigmatella dapat berperan dalam menjaga
keseimbangan populasi mikroba di habitatnya.S. aurantiaca, seperti spesies
myxobacterial lainnya, memiliki siklus hidup yang kompleks termasuk meluncur
sosial (swarming), pembentukan tubuh buah, dan perilaku makan predator.
Bakteri tidak berenang, tapi meluncur di permukaan yang meninggalkan lendir,
membentuk biofilm mobile. Ini biasanya tumbuh di permukaan hutan lunak
lembut atau jamur, di mana ia mungkin membentuk bercak oranye terang.Selama
bagian vegetatif siklus hidup mereka, swarming memungkinkan massa
myxobacteria terkoordinasi untuk menyiram sekresi enzim pencernaan
ekstraselular mereka yang digunakan untuk membunuh dan mengkonsumsi
mikroorganisme mangsa, efek bakteri "serigala". Yang paling banyak dipelajari
dari myxobacteria, Myxococcus xanthus, telah terbukti aktif mengelilingi
organisme mangsa, menjebaknya di saku di tempat mereka dapat dikonsumsi.

Serangga roaming M. xanthus dapat mendeteksi gumpalan bakteri mangsa

di kejauhan, membuat belokan ke arah gumpalan dan bergerak langsung ke arah
mereka.Seperti spesies myxobacterial lainnya, S. aurantiaca bertahan dalam
periode kelaparan dengan menjalani proses perkembangan dimana individu
agregat swarm membentuk tubuh buah (jangan dikelirukan dengan jamur). Di
dalam tubuh buah, fraksi tertentu dari sel-sel berdiferensiasi menjadi myxospores,
yang merupakan sel yang tidak aktif yang resisten terhadap pengeringan dan suhu
sampai 90 C. Diferensiasi ke tubuh buah tampaknya dimediasi oleh sinyal
kontak yang dimediasi. Dalam kondisi pertumbuhan laboratorium, kemampuan
untuk menjalani diferensiasi untuk membentuk tubuh buah cepat hilang kecuali
jika kultur secara teratur dipaksa menghasilkan buah dengan mentransfer ke
media kelaparan. Budaya Shaker S. aurantiaca secara permanen kehilangan
kemampuan untuk menghasilkan buah.Siklus hidup mykobakteria yang kompleks
mengingatkan pada siklus hidup cetakan lendir seluler eukariotik.

Model sistem untuk pengembangan

Myxobacteria dibedakan dari kebanyakan bakteri dengan berbagai

perilaku sosial mereka yang luar biasa, dan sebagai hasilnya, beberapa
laboratorium telah mempelajari penelitian bakteri ini sebagai paradigma
prokariotik untuk proses diferensiasi dan transduksi sinyal. Sebagian besar
penelitian tentang perilaku sosial pada myxobacteria telah berfokus pada M.
xanthus, yang telah menyediakan sistem yang sangat baik yang dapat diterima
oleh banyak pendekatan eksperimental genetik klasik. Tubuh buah M. xanthus
adalah gundukan yang relatif sederhana, dan struktur buah yang jauh lebih rumit
yang dihasilkan oleh S. aurantiaca telah menyebabkan S. aurantiaca dianggap
sebagai sistem pelengkap yang sangat baik untuk M. xanthus, terutama mengingat
kemunculan alat genom kontemporer. analisis. Sebagian besar dari 95 gen spesifik
pengembangan M. xanthus sangat dilestarikan pada S. aurantiaca. Gen untuk
seluruh jalur transduksi sinyal yang penting untuk pembentukan tubuh buah pada
M. xanthus dilestarikan pada S. aurantiaca, sedangkan hanya sedikit yang
dilestarikan pada Anaeromyxobacter dehalogenans, anggota non-fruiting dari orde
Myxococcales. Berbagai gen telah diidentifikasi pada S. aurantiaca yang terlibat
dalam proses pembentukan tubuh buah, termasuk fbfA, yang mengkodekan
polipeptida homolog ke chitin synthases,fbfB, gen yang mengkodekan suatu
oksidase galaktosa putatif, berbagai gen termasuk yang encoding tRNAAsp dan
tRNAVal yang terletak di lokus attB (situs lampiran fag), dan sebagainya. Gen ini
memainkan berbagai peran dalam siklus perkembangan. Sebagai contoh, dalam
percobaan di mana gen fbFA dinonaktifkan, bakteri membentuk rumpun
terstruktur dan bukan badan buah.

Untuk mengendalikan pembentukan struktur multiselular rumit dan rumit

secara spasial yang merupakan tubuh buah, sel harus menukar sinyal selama
keseluruhan proses. Pada M. xanthus, berbagai molekul sinyal yang terlibat dalam
proses ini telah diidentifikasi. Pada S. aurantiaca, Stevens (1982) mengidentifikasi
molekul pensinyalan ekstraselular dan diffusible (feromon) yang dapat
menggantikan cahaya dalam merangsang pematangan tubuh berbuah. Beberapa
tahun kemudian, struktur molekul ini, sebuah hidroksi keton yang diberi nama
stigmolone, ditentukan oleh NMR dan spektroskopi massa. Selain pensinyalan
melalui pertukaran zat diffusible, pensinyalan sel-cell dapat dimediasi melalui
kontak melalui aktivitas permukaan makromolekul yang ada. Contoh dari hal ini
di S. aurantiaca adalah homolog csgA ke gen M. xanthus, yang terikat pada sel
amplop. Produk gen csgA membantu sel untuk tetap bersama selama
pengembangan dan mengatur motilitas sel. Pxr sRNA adalah RNA peraturan yang
merendahkan gen yang bertanggung jawab untuk pembentukan tubuh buah pada
M. xanthus, dan homolog telah dicatat dalam S. aurantiaca. Asam nukleat pendek
lain yang secara spekulatif dikaitkan dengan pengenalan sel-sel adalah multicopy
single stranded DNA (msDNA). Urutan perbandingan msDNA dari M. xanthus,
S. aurantiaca, dan bakteri lainnya mengungkapkan domain kekekalan dan
hipervariabel yang mengingatkan pada urutan kekekalan dan hipervariabel yang
ditemukan pada molekul allorecognition. Cara lain untuk pensinyalan antar sel
bisa melalui pertukaran vesikel membran luar (OMVs). Vesikel-vesikel ini
dihasilkan dari membran luar sel myxobacterial dan ditemukan dalam jumlah
besar di dalam biofilm bakteri. OMVs tampaknya memainkan berbagai peran
dalam pertumbuhan, predasi, dan pengembangan Myxobacterial.

Metabolit sekunder alami

Produk alami telah menjadi sumber sebagian besar bahan aktif dalam
pengobatan, dan terus menjadi sumber penting terlepas dari munculnya metode
skrining throughput high-throughput untuk penemuan obat pada senyawa sintetis.
Secara historis, actinomycetes dan jamur telah menjadi sumber utama metabolit
sekunder mikroba yang berguna sebagai titik awal pengembangan obat baru,
namun beberapa dekade terakhir telah melihat myxobacteria menjadi yang
terdepan dalam penelitian obat terlarang. Minat farmasi pada organisme ini
berasal dari produksi berbagai macam metabolit unik struktural dengan aktivitas
biologis yang menarik. Epothilone, yang berasal dari myxobacterium Sporangium
cellulosum, mewakili kelas obat kanker baru yang baru disetujui. Senyawa
myxobacterial lain dari potensi farmasi termasuk disorazol, tubulysin, rhizopodin,
chondramid, aurafuron, tuscolid, tuscuron, dan dawenol, chivosazol, soraphen,
myxochelin, dan leuprinin.S. aurantiaca telah menjadi sumber beberapa senyawa
bioaktif ini, termasuk myxothiazol, penghambat rantai transpor elektron, dawenol,
metabolit poliena, stigmatellin, agen antijamur, aurafuron antijamur A dan B, dan
siderophores besi myxochelin A dan B.
 DAFTAR PUSTAKA

Frimansyah,Burhan.2011. Makalah Delta- And Epsilon-Protebacteria. Fakultas

Bioteknologi .Univesitas Kristen Duta Wacana .Yogyakarta.