GENETIKA 1
Disusun oleh:
JURUSAN BIOLOGI
Maret 2019
KODE GENETIK
Jika urutan asam amino yang diubah tidak berfungsi dengan baik, protein yang
dihasilkan oleh gen mutan ganda akan aktif. Ketika mutasi penekan diisolasi
dalam strain mutan-tunggal oleh backcrosses ke tipe liar, semua ditemukan
fenotipe mutan, sama seperti mutasi asli yang mereka tekan. Crick dan rekannya
kemudian mengisolasi mutasi supresor yang diinduksi proflavin dari mutasi
supresor yang sebelumnya terisolasi (hadir dalam mutan tunggal pulih dari
backcrosses). Setelah mengulangi proses ini selama beberapa siklus, semua
mutasi yang diklasifikasikan sebagai plus (untuk penambahan pasangan basis
tunggal) atau minus (untuk penghapusan pasangan basis tunggal) dasar bahwa
mutasi plus akan menekan mutasi minus, tetapi tidak ditambah mutasi lainnya,
dan sebaliknya. Jadi meskipun yang terbentuk ada 64 variasi ini nggak masalah
karena Asam amino yang terkodekan ini sangat menguntungkan pada proses
pembentukkan protein karena dapat menggantikan asam amino yang
kemungkinan rusak selain itu dari 20 asam amino
kelompok mutasi mewakili penambahan atau tidak; mereka bisa saja hanya
penghapusan. Satu-satunya poin penting adalah bahwa semua penghapusan
berakhir dalam satu kelompok (baik itu kelompok plus atau kelompok minus), dan
semua tambahan berakhir di kelompok lain rekombinan yang mengandung tiga
overedtions ditambah muta (b) atau tiga mutasi minus sering memiliki fenotipe
liar. Dengan demikian, kerangka pembacaan tipe liar untuk bagian distal gen
dipulihkan dengan tiga penambahan pasangan pase tunggal atau tiga penghapusan
pasangan basa tunggal, tetapi diubah oleh salah satu atau dua penambahan atau
penghapusan pasangan basa.
(4) apakah spesies yang berbeda menggunakan kodon yang sama atau berbeda -
kodean (nukleotida dengan asam amino) memang tiga telah berasal dari banyak
sumber. Bukti yang cukup mendukung kode triplet berevolusi dari penelitian yang
menggunakan sistem terjemahan in vitro. dia mengikuti pengamatan adalah sangat
penting.
(2) Molekul RNA yang disintesis secara kimia, mengandung urutan dinukleotida
berulang, mengarahkan sintesis kopolimer dengan urutan asam amino bolak-balik.
Poli (UG) n, misalnya, bila digunakan sebagai rRNA buatan dalam sistem in vitro,
mengarahkan sintesis kopolimer berulang (cys-val) n
(3) Molekul dengan urutan berulang trinuc.e otide, pada sisi lain, mengarahkan
sintesis tesis dari campuran tiga homopolimer (inisiatior secara acak pada mRNA
tersebut dalam sistem in vitro.
konstitusi hampir selalu konsisten dengan penugasan kodon yang diberikan pada
Tabel 10.1 dan efek mutagen yang diketahui. Lebih meyakinkan lagi, ketika
sekuens nukleotida gen atau mRNA ditentukan dan dibandingkan dengan sekuens
asam amino polipeptida yang dikodekan oleh gen atau mRNA tersebut, korelasi
yang diamati selalu ditemukan pada prediksi dari penugasan kodon yang diterima
dengan molekul mRNA
Masing-masing dari tiga kodon terminasi hadir sekali antara sekuens yang
diterjemahkan dari gen mantel dan sekuens yang diterjemahkan dari gen replase.
Perhatikan bahwa urutan asam amino dari protein ini, disintesis secara in vivo,
persis seperti yang diprediksi dari sekuens nukleotida menggunakan penugasan
kodon yang disajikan pada Tabel 10.1.
Degenerasi dan goyangan Semua asam amino kecuali metionin dan triptofan
ditentukan oleh lebih dari satu kodon yaitu Tiga asam amino, leusin, serin, dan
arginin, masing-masing ditentukan oleh enam kodon yang berbeda. Isoleusin
memiliki tiga kodon. Asam amino lainnya masing-masing memiliki dua atau
empat kodon. Terjadinya lebih dari satu kodon per asam amino disebut degenerasi
(meskipun konotasi yang umum dari istilah ini hampir tidak sesuai). Kemerosotan
dalam kode genetik tidak sembarangan; sebagai gantinya, itu sangat orderea.
Biasanya asam amino dengan sifat kimia yang sangat mirip (misalnya, valin untuk
isoleusin). Dalam kebanyakan kasus, penggantian seperti itu tidak akan
menghasilkan produk gen yang tidak aktif, sekali lagi, ini meminimalkan efek
mutasi. harus ada beberapa tRNA berbeda yang mengenali kodon yang berbeda
yang menentukan asam amino yang diberikan atau antikodon dari tRNA yang
diberikan harus mampu memasangkan basa dengan beberapa kodon yang berbeda.
Sebenarnya, kedua hal ini terjadi. Beberapa tRNA ada untuk amino tertentu
Karena degenerasi kode genetik, asam, dan beberapa tRNA mengenali lebih dari
pada kodon. Ikatan hidrogen antara basa dan antikodon tRNA dan kodon mRNA
tampaknya mengikuti aturan pasangan berpasangan yang ketat (mis., Menjadi
"kencang") hanya untuk dua pangkalan pertama dari kodon.
Inisiasi dan Terminasi Codon Kode genetik juga menyediakan untuk purictuation
informasi genetik di tingkat terjemahan. Kodie ini, UAA, UAG, dan UGA,
menentukan pemutusan rantai polipeptida. Kodon-kodon ini dikenali oleh faktor
pelepasan protein, bukan oleh tRNA. Bijih protein ini, yang ditunjuk RF-1,
tampaknya spesifik untuk UAA dan UAG. Yang lainnya, RF-2, menyebabkan
terminasi pada kodon UAA dan UGA. Dua kodon, AUG dan GUG, adalah case.
Diwujudkan oleh inisiator tRNA, tRNA Mer, tetapi hanya muncul ketika mereka
mengikuti urutan nukleotida yang sesuai dalam segmen pemimpin molekul
mRNA. dan GUG dikenali oleh valin tRNA. Dalam kasus kodon inisiasi AUG
dan GUG dan tRNAer, basis obble tampak sebagai basis pertama atau 5 'dari
posisi internal t, AUG dikenali oleh kodon tRNAMer. Karena goyangan pada
basis pertama adalah unik untuk inisiasi, itu mungkin terkait dengan pemasangan-
pasangan di situs P daripada di situs A pada ribosom.
Tiga serine tRNA telah dikarakterisasi (1) tRNAzeri (antikodon AGG) berikatan
dengan kodon UCU dan UCC, (2) tRNAsera (antikodon AGU) berikatan dengan
kodon UCA dan UCG, dan (3) tRNAsers (anticodon UCG) mengikat kodon AGU
dan AGC. Kekhususan ini diverifikasi oleh ikatan trinucleotide-stimulated. Ini
dari aminoacyl-tRNA yang dimurnikan menjadi ribosom vitro. Akhirnya,
beberapa tRNA mengandung inosin basa (diproduksi oleh modifikasi enzimatik
posttranskripsi). Hipotesa Crick memperkirakan bahwa inosin dapat berpasangan
(pada posisi goyangan) dengan adenin, alanyl-tRNA yang mengandung inosin (1)
pada posisi 5 'dari antikodon (Gambar 10.15) berikatan dengan ribosom yang
diaktifkan dengan GCU, GCC, atau trinukleotida GCA .
Kode Sejumlah besar data sekarang tersedia dari studi in vitro, dari penggantian
asam amino karena mutasi, dan asam nukleat berkorelasi dan pengurutan
polipeptida - semua menunjukkan bahwa kode genetik adalah sama atau sangat
hampir sama di semua organisme. triptofan menunjukkan bahwa kode genetik
sebagian besar universal Pengecualian utama terhadap universalitas kodon. UGA
adalah kodon terminasi dalam sistem nonmitochonal. Juga, di antara mitokondria
ragi, menentukan threonine alih-alih leusin biasa, dan, dalam mitokondria
mamalia, AUA menentukan metionin alih-alih isoleusin yang biasa. Dengan
mengecualikan ini dan beberapa pengecualian terkait, kode ini tampaknya univer
sal.
Karakter kode genetik :Kode genetik ini mempunyai banyak sinonim, sehingga
hampir semua asam amino dinyatakan oleh lebih dari sebuah kodon.Contohnya ,
tiga asam amino (arginin, serin dan leusin) masing-masing mempunyai 6 kodon
sinonim.Tetapi untuk banyak kodon sinonim yang menyatakan asam amino yang
sama, dua basa permulaan dan triplet adalah tetap sedangkan basa ketiga dapat
berlainan.Contohnya , semua kodon yang dimulai dengan SS memperinci prolin
(SSU, SSS, SSA dan SSG) dan semua kodon yang dimulai dengan AS
memperinci treonin (ASU, ASS, ASA dan ASG).Fleksibilitas dalam nukleotida
dari suatu kodon ini dapat menolong membuat sekecil mungkin akibat adanya
kesalahan.Tidak ada tumpang tindih, artinya tiada satu basa tunggal pun yang
dapat mengambil bagian dalam pembentukan lebih dari satu kodon, sehingga 64
kodon itu semua berbeda-beda nukleotidanya.Kode genetik dapat mempunyai dua
arti, yaitu kodon yang sama dapat memperinci lebih dari satu asam
amino.Contohnya, kodon UUU biasanya merupakan kode untuk fenilalanin, tetapi
bila ada streptomycin dapat pula merupakan kode untuk isoleusin, leusin atau
serin.Kode genetik tidak mempunyai tanda untuk menarik perhatian, artinya tiada
sebuah kodon pun yang dapat diberi tambahan tanda bacaan.Kodon AUG disebut
juga kodon permulaan, karena kodon ini memulai sintesa rantai
polipeptida.Beberapa kodon dinamakan kodon non-sens (tak berarti) karena
kodon-kodon ini tidak merupakan kode untuk salah satu asam amino pun,
misalnya UAA, UAG dan UGA.Kode genetik itu ternyata universal karena kode
yang sama berlaku untuk semua macam mahluk hidup.
Kode Genetik
Kode genetik adalah kode yang tidak tumpang tindih, dengan masing-masingnya
asam amino plus inisiasi dan terminasi polipeptida ditentukan oleh kodon RNA
yang terdiri dari tiga nukleotida.
Sifat-sifat kode genetik :
1. Kode genetik terdiri dari kembar tiga nukleotida. Tiga nukleotida dalam mRNA
menentukan
satu asam amino dalam produk polipeptida; dengan demikian, setiap kodon
mengandung tiga nukleotida.
2. Kode genetik tidak tumpang tindih. Setiap nukleotida dalam mRNA hanya
milik satu kecuali dalam kasus yang jarang terjadi di mana gen tumpang tindih
dan urutan nukleotida dibaca dua bingkai bacaan yang berbeda.
3. Kode genetik bebas koma. Tidak ada koma atau bentuk tanda baca lainnya
dalam daerah pengkodean molekul mRNA. Selama penerjemahan, kodonnya
adalah membaca secara berurutan.
4. Kode genetik mengalami kemunduran. Semua kecuali dua asam amino
ditentukan oleh lebih banyak dari satu kodon.
5. Kode genetik dipesan. Banyak kodon untuk asam amino dan kodon yang
diberikan Asam amino dengan sifat-sifat kimiawi yang mirip sangat erat
hubungannya, biasanya berbeda oleh nukleotida tunggal.
6. Kode genetik berisi kode start dan stop. Codon khusus digunakan untuk
memulai dan untuk menghentikan rantai polipeptida.
7. Kode genetik hampir universal. Dengan pengecualian kecil, kodon memiliki hal
yang sama artinya dalam semua organisme hidup, dari virus ke manusia.
Crick dan rekannya berpendapat bahwa mutasi asli adalah pasangan basa tunggal
yang mengalami penambahan atau penghapusan, mutasi supresor harus tunggal
penghapusan pasangan basa atau penambahan, masing-masing, yang terjadi di
sebuah situs atau situs dekat mutasi asli. Jika triplet nukleotida berurutan dalam
mRNA menentukan asam amino, maka setiap sekuen nukleotida dapat dikenali
atau dibaca selama translasi dalam tiga cara yang berbeda. Sebagai contoh,
AAAGGGCCCTTT urutan dapat dibaca (1) AAA, GGG, CCC, TTT, (2) A,
AAG, GGC, CCT, TT, atau (3) AA, AGG, GCC, CTT, T. Frame mRNA adalah
triplet nukleotida yang dibaca (diposisikan di ribosom) selama translasi.
a. Degenerasi parsial, terjadi ketika basa ketiga mungkin salah satu dari dua
pirimidin (U atau C) atau sebaliknya, salah satu dari dua purin (A atau G).
dengan parsial degenerasi, mengubah basa ketiga dari purin ke pirimidin, atau
sebaliknya, akan mengubah spesifik asam amino oleh kodon.
b. Degenerasi lengkap, dari empat basa dapat hadir pada posisi ketiga dalam
kodon, dan kodon masih akan menentukan asam amino yang sama. Sebagai
contoh, valin dikodekan oleh GUU, GUC, GUA, dan GUG
Sebuah Kode Genetik Hampir Bersifat Universal
Kode genetik hampir bersifat universal, yaitu kodon memiliki arti yang
sama (dengan sedikit pengecualian) di semua spesies. Pengecualian yang paling
penting untuk universalitas kode genetik terjadi pada mitokondria mamalia, yeast,
dan beberapa spesies lainnya. Dalam mitokondria manusia dan mamalia lainnya,
(1) UGA menentukan triptofan bukan pemutusan rantai, (2) AUA adalah kodon
metionin, bukan kodon isoleusin, dan (3) AGA dan AGG adalah kodon terminasi
rantai, bukan kodon arginin. Namun, karena pengecualian ini jarang terjadi, kode
genetik harus dipertimbangkan hampir bersifat secara universal.
INTERAKSI CODON-tRNA
Kode genetik adalah cara pengkodean urutan nukleotida pada DNA atau RNA
untuk menentukan urutan asam amino pada saat proses sintesis protein.
Sedangkan Informasi pada kode genetik ditentukan oleh basa nitrogen pada rantai
DNA yang akan menentukan susunan asam amino yang dibawa oleh RNA
mesenger ( RNAm).
Degenerasi parsial, terjadi ketika basa ketiga mungkin salah satu dari dua
pirimidin (U atau C) atau sebaliknya, salah satu dari dua purin (A atau G). dengan
parsial degenerasi, mengubah basa ketiga dari purin ke pirimidin, atau sebaliknya,
akan mengubah spesifik asam amino oleh kodon.