Makalah API 20E
Makalah API 20E
PENDAHULUAN
1.1 Latar Belakang
Anggota dari famili Enterobacteriaceae adalah bakteri Gram negatif
fakultatif anaerobik berbentuk batang yang dapat bersifat motil atau non motil;
strain bakteri motil mempunyai flagella peritrik. Semua spesies berkembang
biak pada media buatan dan mengubah glukosa, dimana mereka membentuk
asam atau asam dan gas. Bakteri-bakteri tersebut juga memproduksi enzim
katalase. Dengan beberapa pengecualian pada genus Erwinia, anggota dari
Enterobacteriaceae mereduksi nitrat menjadi nitrit. Komposisi antigeniknya
tendiri dari sebuah mozaik hubungan serologik yang saling mengisi diantara
beberapa genus. Famili ini termasuk saprofit, parasit hewan dan beberapa
parasit tanaman. Pengkajian homologi DNA telah menunjukkan bahwa
kebanyakan spesies dalam genus Enterobacteriaceae setidaknya 20 % saling
berhubungan satu dengan yang lain dan dengan tipe spesiesnya, yaltu
Escherichia coli. Hampir semua spesies mempunyai antigen enterobakterial.
Hanya sejumlah kecil genus yang mempunyai spesies yang menyebabkan
penyakit pada hewan. Bakteri-bakteri tersebut adalah Enterobacter,
Escherichia, Klebsiela, Proteus, Salmonella, Seratia dan Yersinia.
API-20E test kit untuk identifikasi bakteri enterik menyediakan cara
mudah untuk menyuntik dan membaca tes yang relevan kepada anggota
Enterobacteriaceae keluarga dan organisme terkait. Sebuah strip plastik isinya
dua tabung mini uji diinokulasi dengan suspensi garam dari kultur murni.
Proses ini juga rehydrates media dessicated di setiap tabung. Beberapa tabung
terisi penuh dan beberapa tabung yang dilapis dengan minyak mineral
sehingga reaksi anaerobik dapat dilakukan.
Identifikasi dengan Metode Analytical Profile Index (API) 20A Metode
API 20A ini terdiri dari 21 macam uji biokimia yang digunakan untuk
mengidentifikasi spesies dari bakteri anaerob. Uji biokimia terdiri dari uji
indol; urease; fermentasi glukosa, manitol, sakrosa, laktosa, maltosa, salisin,
xylose, arabinosa, gliserol, selobiosa, manosa, melezitosa, rafinosa, sorbitol,
1
ramnosa, trehalose; hidrolisis gelatin; hidrolisis esculin (ß-glucosidase);
katalase.
1.2 Rumusan Masalah
1. Pengertian Analytical Profile Index?
2. Prinsip Kerja dari Analytical Profile Index?
3. Apa Saja Peringatan dan Pencegahan dari Analytical Profile Index?
4. Bagaimana Kondisi Penyimpanan Analytical Profile Index?
5. Petunjuk Penggunaan Analytical Profile Index?
6. Bagaimana Pembacaan dan Interpretasi Hasil dari Analytical Profile
Index?
7. Bagaimana Cara Kontrol Kualitas Analytical Profile Index?
8. Apa Saja Keterbatasan Metode Analytical Profile Index?
9. Pembuangan Limbah dari Analytical Profile Index?
10. Apa saja fitur dan keuntungan dari Analytical Profile Index?
11. Apa gold standard dari Analytical Profile Index?
1.3 Tujuan
1. Untuk mengetahui Pengertian Analytical Profile Index
2. Untuk mengetahui Prinsip Kerja dari Analytical Profile Index
3. Untuk mengetahui Apa Saja Peringatan dan Pencegahan dari Analytical
Profile Index
4. Untuk mengetahui Bagaimana Kondisi Penyimpanan Analytical Profile
Index
5. Untuk mengetahui Petunjuk Penggunaan Analytical Profile Index
6. Untuk mengetahui Bagaimana Pembacaan dan Interpretasi Hasil dari
Analytical Profile Index
7. Untuk mengetahui Bagaimana Cara Kontrol Kualitas Analytical Profile
Index
8. Untuk mengetahui Apa Saja Keterbatasan Metode Analytical Profile Index
9. Untuk mengetahui Pembuangan Limbah dari Analytical Profile Index
10. Untuk mengetahui fitur dan keuntungan dari Analytical Profile Index
11. Untuk mengetahui gold standard dari Analytical Profile Index
2
BAB II
PEMBAHASAN
2.1 Pengertian
Analytical Profile Index (API) Sistem identifikasi untuk
Enterobacteriaceae dan batang Gram-negatif non-kritis lainnya. API 20 E
adalah sistem identifikasi standar untuk Enterobacteriaceae dan non-rewel,
Gram negative batang yang menggunakan 21 miniatur biokimia tes dan
database. Daftar lengkap mereka organisme bahwa adalah mungkin untuk
mengidentifikasi dengan sistem ini adalah diberikan dalam Tabel Identifikasi
pada akhir paket ini masukkan.
2.2 Prinsip
API 20 E jalur terdiri dari 20 microtubes mengandung substrat
dehidrasi. Tes ini diinokulasi dengan suspensi bakteri yang reconstitutes
media. Selama inkubasi, metabolisme menghasilkan perubahan warna yang
baik spontan atau dapat diketahui dengan penambahan reagen. Reaksi dibaca
sesuai dengan Tabel Reading dan identifikasi diperoleh dengan mengacu pada
Indeks Profil analitis atau menggunakan perangkat lunak identifikasi
2.3 Isi Kit API 20E
Kit untuk 25 tes (ref. 20 100)
- 25 API 20 strip E
- 25 kotak inkubasi
- 25 lembar hasil
- 1 clip seal
- 1 paket insert
Kit untuk 100 tes (ref. 20 160)
- 100 API 20 strip E (4X25 strip)
- 100 kotak inkubasi
- 100 lembar hasil
- 1 clip seal
- 1 paket insert
3
API 20E yang disajikan di sini adalah panel biokimia untuk
identifikasi dan diferensiasi anggota keluarga Enterobacteriaceae. Panel
API lainnya untuk kelompok lain bakteri, seperti stafilokokus dan
streptokokus, juga tersedia dalam format yang sama, tetapi tidak termasuk
dalam presentasi ini. Dalam API 20E untuk identifikasi anggota keluarga
Enterobateriaceae, strip plastik memegang dua puluh ruang mini-tes berisi
media dehidrasi memiliki komposisi kimia yang ditentukan untuk setiap
tes. Ini termasuk:
1. ONPG : Tes untuk enzim -galactosidase oleh hidrolisis
substrat o -nitrophenyl- -D-galactopyranoside
2. ADH : dekarboksilasi dari asam amino arginin oleh dihydrolase
arginin
3. LDC : decarboxylations dari asam amino lisin dekarboksilase
lisin oleh
4. ODC : decarboxylations dari ornithine dekarboksilase asam
amino yang oleh ornithine
5. CIT : pemanfaatan sitrat sebagai sumber karbon tunggal
6. H2S : produksi hidrogen sulfida
7. URE : tes untuk enzim urease
8. TDA : deteksi deaminase enzim triptofan
9. IND : produksi indol dari triptofan oleh tryptophanase
enzim. Indole terdeteksi dengan penambahan reagen Kovac ini.
10. VP : tes Voges Proskauer-untuk deteksi asetoin (asetil
methylcarbinol) yang dihasilkan oleh fermentasi glukosa oleh bakteri
memanfaatkan jalur butilena glikol
11. GEL : tes untuk produksi enzim gelatinase yang mencairkan
gelatin
12. Glu : fermentasi glukosa (gula heksosa)
13. MAN : fermentasi mannose (gula heksosa)
14. INO : fermentasi inositol (polyalcohol siklik)
15. SOR : fermentasi sorbitol (gula alkohol)
4
16. RHA : fermentasi rhamnose (metil gula pentosa)
17. SAC : fermentasi sukrosa (disakarida)
18. MEL : fermentasi melibiose (disakarida)
19. AMY : fermentasi amygdalin (glikosida)
20. ARA : fermentasi arabinosa (gula pentosa)
5
Reagen Lain Yang Mungkin Dapat Digunakan :
- API dari Medium (Ref. 50 110):Uji untuk penentuan fermentasi atau
oksidatifmetabolisme.
- API M Medium (Ref. 50 120):Pengujian motilitas bakteri anaerob
fakultatif.
2.4 Peringatan Dan Pencegahan
1. Untuk digunakan diagnostik in vitro dan mikrobiologi control.
2. Hanya untuk penggunaan profesional.
3. Kit ini berisi produk-produk yang berasal dari hewan. Bersertifikat
pengetahuan tentang asal dan / atau negara sanitasi dari hewan tidak benar-
benar menjamin tidak adanya agen patogen menular. Oleh karena itu
direkomendasikan bahwa produk ini diperlakukan sebagai berpotensi
menular, dan ditangani mengamati biasa. Tindakan pengamanan (tidak
menelan atau menghirup).
4. Semua spesimen, budaya mikroba dan diinokulasi produk harus
dipertimbangkan menular dan ditangani tepat. Teknik aseptik dan tindakan
pencegahan yang biasa untuk menangani kelompok bakteri yang diteliti
harus mengamati seluruh prosedur ini. Lihat "NCCLS M29-A,
Perlindungan Tenaga Kerja Laboratorium dari Instrumen hayati dan
Penyakit Infeksi Ditularkan oleh darah, Cairan Tubuh, dan jaringan;
Disetujui Pedoman - Desember 1997 "Untuk tambahan, tindakan
pencegahan penanganan, lihat "Biosafety di Mikrobiologi dan Biomedis
Laboratorium, HHS Publikasi No (CDC) 93-8395, 3rd Edition (Mei
1993)", atau peraturan yang sedang digunakan di setiap negara.
5. Jangan menggunakan reagen melewati tanggal kedaluwarsa.
6. Sebelum digunakan, periksa bahwa kemasan dari berbagai komponen
utuh.
7. Jangan gunakan strip yang telah rusak: cupules cacat, pengering sachet
terbuka, ...
6
8. Data kinerja disajikan diperoleh dengan menggunakan prosedur yang
ditunjukkan dalam paket insert ini. Apa saja perubahan atau modifikasi
dalam prosedur dapat mempengaruhi hasil.
9. Interpretasi hasil tes harus dibuat mengambil mempertimbangkan riwayat
pasien, sumber spesimen, morfologi kolonial dan mikroskopis dari saring
dan, jika perlu, hasil dari setiap tes lainnya dilakukan, khususnya
kerentanan antimikroba pola.
2.5 Kondisi Penyimpanan
Strip disediakan dalam kantong aluminium dengan sachet pengering.
Setelah dibuka (*), kantong harus kembali disegel menggunakan klip segel
(disertakan dalam kit) untuk melestarikan sisa strip dengan sachet pengering:
menempatkan ujung terbuka kantong sepanjang segel dan hati-hati klem
antara dua bagian. Strip kemudian dapat disimpan sampai 10 bulan setelah
kantong telah dibuka, pada 2-8 ° C (atau sampai tanggal kadaluarsa yang
tertera pada kemasan, jika ini datang sebelum).
(*) Direkomendasikan metode untuk membuka kantong : gunting
untuk membuka kantong di bawah segel sambil memegang pouch tegak,
untuk menghindari kerusakan pengering yang sachet.
7
Persiapan strip
1. Siapkan kotak inkubasi (tray dan tutup) dan mendistribusikan sekitar 5
ml air suling atau air demineral [atau air tanpa aditif atau bahan kimia
yang mungkin release gas (misalnya, Cl2, CO2, dll)] ke honeycombed
sumur dari baki untuk menciptakan suasana lembab.
2. Catat referensi ketegangan pada flap memanjang dari tray. (Jangan
mencatat referensi di tutup karena mungkin salah tempat selama
prosedur.)
3. Hapus strip dari kemasannya.
4. Tempatkan strip di kotak inkubasi.
Catatan :
API 20 E hanya boleh digunakan denganEnterobacteriaceae dan
atau non-kritis Gram negatifbatang. Organisme rewel setelah menuntut
gizipersyaratan dan membutuhkan penanganan yang tepattindakan
pencegahan (yaitu, Brucella dan Francisella) tidaktermasuk dalam API 20
E basis data. Prosedur alternatifharus digunakan untuk mengecualikan atau
mengkonfirmasi kehadiran mereka.
2) Persiapan inokulum
1. Buka ampul API NaCl 0,85% Sedang (5 ml) atauampul API Suspension
Menengah (5 ml) sebagaiditunjukkan dalam paragraf "Peringatan dan
Tindakan Pencegahan"paket menyisipkan untuk produk ini, atau
menggunakan tabung setiapmengandung 5 ml saline steril atau air
suling steril,tanpa aditif.
2. Menggunakan pipet atau PSIpette, menghapus wellisolated
tunggalkoloni dari piring isolasi. Inidianjurkan untuk menggunakan
budaya muda (18-24 jam).
3. Hati-hati emulsi untuk mencapai bakteri homogensuspensi. Suspensi ini
harus digunakan segera setelahpersiapan.
8
9
Catatan :
Sebagian besar spesies Vibrio adalah halophilous. Jika Vibrio
adalahdicurigai, menangguhkan bakteri dalam API NaCl 0,85%Menengah.
3) Inokulasi strip
1. Menggunakan pipet yang sama, isi kedua tabung dan beberapates CIT,
VP dan GEL dengan bakterisuspensi.
2. Isi hanya tabung (dan tidak pasangan) dari tes lainnya.
3. Buat anaerobiosis dalam tes ADH, LDC, ODC, H2Sdan URE dengan
overlay dengan minyak mineral.
4. Tutup kotak inkubasi.
5. Inkubasi pada 36 ° C ± 2 ° C selama 18-24 jam.
2.7 Pembacaan dan Interpretasi Hasil
1) Membaca strip
a. Setelah masa inkubasi, membaca strip dengan mengacuTabel
Reading.
b. Jika 3 atau lebih tes (tes Glu + atau -) positif, catatsemua reaksi
spontan pada lembar hasil dankemudian mengungkapkan tes yang
membutuhkan penambahanreagen:
10
- TDA Test: tambahkan 1 tetes reagen TDA. Sebuah
kemerahanwarna coklat menunjukkan reaksi positif untuk
menjadidicatat pada lembar hasil.
- IND Test: tambahkan 1 tetes reagen JAMES. Sebuah warna
pinkdikembangkan di seluruh cupule menunjukkan positifReaksi
dicatat pada lembar hasil.
- VP Test: tambahkan 1 tetes setiap 1 VP dan VP 2 reagen.Tunggu
minimal 10 menit. Sebuah warna pink atau merah
menunjukkanreaksi positif dicatat pada lembar hasil.Jika warna
sedikit merah muda muncul setelah 10 menit, yangReaksi harus
dianggap negatif.
Catatan:
Tes produksi indole harus dilakukanterakhir sejak reaksi ini
melepaskan produk gas yangmengganggu interpretasi tes lain padaStrip.
Inkubasi plastik tutup tidak harus digantisetelah penambahan reagen.
• Jika jumlah tes positif (termasuk tes GLU)sebelum menambahkan
reagen kurang dari 3:
- Inkubasi ulang strip untuk lebih 24 jam (± 2 jam) tanpa
menambahkan reagen apapun.
- Mengungkapkan tes yang membutuhkan penambahan reagen(lihat
paragraf sebelumnya).
- Untuk melengkapi identifikasi, mungkin perlu untukmelakukan tes
tambahan (lihat Identifikasiayat).
2) Interpretasi Hasil
Identifikasi diperoleh dengan profil numerik.
1) Penentuan profil numerik:
Pada lembar hasil, tes dipisahkan menjadi kelompok-
kelompok3 dan nilai 1, 2 atau 4 diindikasikan untuk setiap.
Olehmenambahkan bersama-sama nilai-nilai yang sesuai dengan
positifReaksi dalam setiap kelompok, 7-digit nomor profil
11
adalahdiperoleh untuk 20 tes dari API 20 E Strip. Reaksi oksidase
merupakan tes 21 dan memilikinilai 4 jika hasilnya positif.
2) Identifikasi :
Hal ini dilakukan dengan menggunakan database (V4.0)
Dengan Indeks Profil Analytical:
- Carilah profil numerik dalam daftar profil.
Dengan perangkat lunak identifikasi:
- Masukkan profil numerik 7-digit manual melaluiKeyboard.
Dalam beberapa kasus, profil 7-digit tidak diskriminatifcukup dan
tes tambahan berikut harusterbawa :
Pengurangan nitrat untuk nitrit (NO2) dan gas N2 (N2) : tambahkan 1
tetes setiap NIT 1 dan 2 NIT reagen ke Glu tabung. Tunggu 2-5 menit.
Sebuah warna merah menunjukkan reaksi positif (NO2). Reaksi
negatif (kuning) mungkin karena pengurangan untuk nitrogen (karena
kadang-kadang dibuktikan dengan gelembung gas): menambahkan 2
sampai 3 mg Zn reagen untuk tabung Glu. Setelah 5 menit, jika tabung
tetap kuning ini menunjukkan reaksi positif (N2) untuk dicatat pada
lembar hasil. Jika tes ternyata orangered, ini adalah reaksi negatif:
nitrat masih ada di tabung telah berkurang oleh Zinc. Reaksi ini
berguna ketika pengujian Gram-negatif, oksidase batang positif.
12
Catatan :
Untuk alasan yang sama seperti tes indol (lihat di "Membaca strip"),
nitrat Tes pengurangan harus dilakukan terakhir.
- Motilitas (MOB): Inokulasikan ampul API M Medium (lihat paket
insert).
- Pertumbuhan pada media agar MacConkey (McC): a Streak Plate agar
MacConkey (lihat paket insert).
- Oksidasi glukosa (OF-O): Inokulasikan ampul API darimedia (lihat
paket insert).
- Fermentasi glukosa (OF-F): Inokulasikan ampul API dari media (lihat
paket insert).
5
315 173 (57) Enterobacter gergoviae
13
2.8 Kontrol Kualitas
Media, strip, dan reagen yang sistematis kualitas dikendalikan pada
berbagai tahap pembuatan . Bagi para pengguna yang ingin melakukan tes
kontrol kualitas mereka sendiri dengan strip, lebih baik menggunakan strain :
1. Escherichia coli ATCC 25922 atau salah satu strain berikut
2. Stenotrophomonas maltophilia ATCC 51331
3. Enterobacter cloacae ATCC 13047
4. Proteus mirabilis ATCC 35659
5. Klebsiella pneumoniae ssp pneumoniae ATCC 35657
• The N2 (+) negara dapat diamati untuk strain ATCC 13047 dan strain
ATCC 25922.
o Profil diperoleh setelah 24-48 jam inkubasi untuk strain ATCC 51331,
menggunakan koloni tumbuh di Trypticase kedelai agar + darah.
o Profil diperoleh setelah 18-24 jam inkubasi untuk strain lainnya,
menggunakan koloni tumbuh di Trypticase kedelai agar + darah.
o suspensi bakteri disiapkan dalam API NaCl 0,85% Medium.
• Ini adalah tanggung jawab pengguna untuk melakukan Quality Control
sesuai dengan peraturan yang berlaku setempat.
2.9 Keterbatasan Metode
• API 20 Sistem E dimaksudkan untuk identifikasi Enterobacteriaceae
nonfastidious, batang gram negatif termasuk dalam database (lihat Tabel
Identifikasi pada akhir paket ini menyisipkan). Hal ini tidak dapat
digunakan untuk mengidentifikasi lain mikroorganisme atau untuk
mengecualikan kehadiran mereka.
14
• Perbedaan sehubungan dengan metode konvensional dapat diamati
karena berbeda prinsip-prinsip reaksi yang digunakan dalam teknik API.
Selain itu, variasi substrat ada yang juga memperhitungkan perbedaan
persentase.
• Pada kesempatan langka, reaksi glukosa untuk organisme seperti
Klebsiella atau Proteus dapat kembali dari positif menjadi negatif, di
mana misalnya warna hijau kebiruan adalah dilihat. Reaksi ini akan
disimpan sebagai negatif reaksi. Kejadian tersebut tercermin dalam
persentase yang ditunjukkan dalam Tabel Identifikasi.
• Jika Salmonella atau Shigella diidentifikasi, serologi identifikasi harus
dilakukan untuk mengkonfirmasi bakteri yang identifikasi.
• Yang digunakan harus murni organime tunggal.
15
2.10 Pembuangan Limbah
Ini adalah tanggung jawab masing-masing laboratorium untuk
menangani limbah dan limbah yang dihasilkan sesuai dengan jenis dan
derajat bahayanyauntuk perawatan dan membuangnya (atautelah digunakan
dan dibuang) sesuai dengan setiap peraturan yang berlaku.
Membaca Tabel
16
(1) A kuning sangat pucat juga harus dipertimbangkan positif.
(2) Sebuah warna oranye setelah 36-48 jam inkubasi harus dianggap negatif.
(3) Reading dibuat dalam cupule (aerobik).
(4) Fermentasi dimulai di bagian bawah tabung, oksidasi dimulai di cupule
tersebut.
(5) Sebuah warna sedikit merah muda setelah 10 menit harus dianggap negatif.
• Kuantitas menunjukkan dapat disesuaikan tergantung pada titer dari bahan
baku yang digunakan.
• cupules tertentu mengandung produk hewani, terutama peptones.
17
3. APIweb ™ adalah produk perangkat lunak yang berisi semua database
API untuk interpretasi otomatis yang dapat diandalkan hasil Strip API -
bila digunakan pada setiap workstation PC yang kompatibel.
4. APIweb cepat dan mudah digunakan - kunci dalam profil biokimia atau
numerik strip untuk mendapatkan identifikasi organisme. Perangkat
lunak ini memberikan laporan rinci yang ditampilkan pada layar dan
dapat dicetak
1. FERMENTASI KARBOHIDRAT
Mempelajari kemampuan mikroorganisme dalam
memfermentasikan karbohidrat untuk mengasilkan asam atau gas
Indikator yang digunakan :
BCP (Brom Cresol Purple)
Hasil pengamatan :
Warna asal : Ungu
Positif : Kuning
Negatif : Tetap ungu
Positif Gas : Tabung Durham + gelembung udara
2. UJI INDOL
Menentukan kemampuan bakteri dalam memecah asam amino.
Reagen penambahan :
Kovack’s
Hasil Pengamatan :
18
Positif : Terbentuk Cincin Merah
Negatif : Tidak Terbentuk Cincin Merah
19
Hasil Pengamatan :
Positif : Merah
Negatif : Bening/Putih/Kuning
20
6. UJI TRIPLE SUGAR IRON AGAR/H2S
Membedakan Enterobacteriaceae dan kelompok lain dari basil usus.
Hasil Pengamatan :
1. Lereng : Merah, Dasar : Kuning, Hanya memfermentasi
glukosa.
2. Lereng : Kuning, Dasar : Kuning, Hanya memfermentasi
Laktosa/Sukrosa
3. Lereng : Merah, Dasar : Merah, Tidak memfermentasi ketiga
macam gula.
4. Endapan hitam di bagian dasar : Pembentukan H2S
7. UJI OKSIDASE
Menentukan bakteri yang mempunyai aktivitas sitokrom oksidase.
Hasil Pengamatan :
Menggunakan Strip Oksidase
Positif : Ungu
Negatif : Tidak Berubah Warna
21
8. UJI KATALASE
Hasil Pengamatan :
9. UJI UREASE
Hasil Pengamatan :
Positif : Pink
Negatif : Putih/Kuning
22
10. UJI REDUKSI NITRAT
Bentuk : Cair
Hasil Pengamatan :
23
BAB III
PENUTUP
3.1 Kesimpulan
Analytical Profile Index (API) Sistem identifikasi untuk
Enterobacteriaceae dan batang Gram-negatif non-kritis lainnya. API 20 E
adalah sistem identifikasi standar untuk Enterobacteriaceae dan non-rewel,
Gram negative batang yang menggunakan 21 miniatur biokimia tes dan
database. Daftar lengkap mereka organisme bahwa adalah mungkin untuk
mengidentifikasi dengan sistem ini adalah diberikan dalam Tabel Identifikasi
pada akhir paket ini masukkan.
API-20E test kit untuk identifikasi bakteri enterik menyediakan cara
mudah untuk menyuntik dan membaca tes yang relevan kepada anggota
Enterobacteriaceae keluarga dan organisme terkait. Sebuah strip plastik isinya
dua tabung mini uji diinokulasi dengan suspensi garam dari kultur murni.
Proses ini juga rehydrates media dessicated di setiap tabung. Beberapa tabung
terisi penuh dan beberapa tabung yang dilapis dengan minyak mineral
sehingga reaksi anaerobik dapat dilakukan.
24
DAFTAR PUSTAKA
25