Teknologi bioproses atau fermentasi adalah komponen penting dari proses bioteknologi yang paling

'lama' dan 'baru' dan biasanya akan melibatkan sel hidup lengkap (mikroba, mamalia atau tanaman),
organel atau enzim sebagai biokatalis, dan akan bertujuan untuk menghasilkan bahan kimia tertentu
dan / atau perubahan fisik dalam bahan biokimia yang berasal dari medium. Agar dapat bertahan dalam
konteks industri tertentu, bioproses harus memiliki keunggulan dibandingkan metode produksi yang
bersaing seperti teknologi kimia. Dalam praktiknya, banyak teknik pengolahan bioproses akan digunakan
secara industri karena merupakan satu-satunya cara praktis di mana produk tertentu dapat dibuat (mis.
Vaksin, antibiotik). Rekayasa biokimia mencakup desain kapal dan peralatan yang cocok untuk
melakukan reaksi atau transformasi biokimia tersebut.

Awal mula dari teknologi fermentasi, atau seperti sekarang lebih baik diakui, teknologi bioproses,
sebagian berasal dari penggunaan mikroorganisme untuk produksi makanan seperti keju, yoghurt,
asinan kubis, acar dan sosis yang difermentasi, kecap dan produk Oriental lainnya, dan minuman seperti
bir, anggur, dan arwah turunan (Tabel 4.1).

Dalam banyak kasus, proses produksi saat ini untuk produk tersebut masih sangat mirip. Bentuk-bentuk
bioproses ini telah lama dipandang sebagai seni atau kerajinan, tetapi sekarang semakin menjadi
sasaran berbagai sains dan teknologi modern. Sejalan dengan formasi produk yang bermanfaat ini
adalah identifikasi peran yang dapat dimainkan oleh mikroorganisme dalam menghilangkan limbah yang
menjengkelkan dan tidak sehat, yang telah mengakibatkan industri jasa di seluruh dunia terlibat dalam
pemurnian air, pengolahan limbah, dan pengelolaan limbah padat. Bioproses dalam banyak bentuknya
melibatkan banyak reaksi kompleks yang dikatalisis oleh enzim dalam sistem seluler tertentu, dan reaksi
ini sangat tergantung pada kondisi fisik dan kimia yang ada di lingkungan terdekatnya. Bioproses yang
sukses hanya akan terjadi ketika semua faktor penting disatukan.

Meskipun bentuk tradisional dari teknologi bioproses yang berkaitan dengan makanan dan minuman
masih merupakan bioproduk komersial utama, produk-produk baru semakin banyak berasal dari
fermentasi mikroba, mamalia, dan sel tumbuhan, yaitu kemampuan:

(1) untuk memproduksi berlebih metabolit primer esensial seperti asam asetat dan laktat, gliserol,
aseton, butil alkohol, asam organik, asam amino, vitamin dan polisakarida

(2) untuk menghasilkan metabolit sekunder (metabolit yang tampaknya tidak memiliki peran yang jelas
dalam metabolisme organisme penghasil) seperti penisilin, streptomisin, sefalosporin, giberelin, dll.

(3) untuk menghasilkan berbagai bentuk enzim yang berguna secara industri, mis. enzim eksoseluler
seperti amilase, pektinase dan protease, dan enzim intraseluler seperti invertase, asparaginase, restriksi
endonucleases, dll.

(4) untuk menghasilkan antibodi monoklonal, vaksin, dan produk rekombinan baru, mis. protein
terapeutik.

Semua produk ini sekarang menguasai pasar industri besar dan sedang

penting bagi masyarakat modern (Tabel 4.1).

Baru-baru ini, teknologi bioproses semakin menggunakan sel-sel yang berasal dari tumbuhan dan hewan
tingkat tinggi untuk menghasilkan banyak produk penting. Kultur sel tanaman sebagian besar ditujukan
pada formasi produk sekunder seperti rasa, parfum, dan obat-obatan, sedangkan kultur sel mamalia
telah memusatkan perhatian pada pembentukan vaksin dan antibodi dan produksi rekombinan molekul
protein seperti interferon, interleukin, dan eritropoietin. Pertumbuhan pasar masa depan dari
bioproduk ini sebagian besar terjamin karena, dengan pengecualian terbatas, sebagian besar tidak dapat
diproduksi secara ekonomis oleh proses kimia lainnya. Juga dimungkinkan untuk membuat ekonomi
lebih lanjut dalam produksi oleh organisme rekayasa genetika untuk produktivitas yang lebih tinggi atau
unik dan memanfaatkan kemajuan teknologi baru dalam pemrosesan.

Keuntungan memproduksi produk organik secara biologis dibandingkan dengan metode kimia murni
tercantum pada Tabel 4.2.

Tahap pembentukan produk dalam teknologi bioproses pada dasarnya sangat mirip tidak peduli apa
organisme yang dipilih, media apa yang digunakan atau produk apa yang terbentuk. Dalam semua
contoh, sejumlah besar sel ditanam di bawah kondisi terkendali yang ditentukan. Organisme harus
dibudidayakan dan dimotivasi untuk membentuk produk yang diinginkan melalui sistem penahanan
fisik / teknis (bioreaktor), dan komposisi medium yang tepat dan parameter pengatur pertumbuhan
lingkungan seperti suhu dan aerasi. Optimalisasi bioproses mencakup sistem bio dan teknis. Eksploitasi
yang tepat dari potensi suatu organisme untuk membentuk produk berbeda dari kualitas yang
ditentukan dan dalam jumlah besar akan membutuhkan pengetahuan rinci tentang mekanisme biokimia
pembentukan produk.

Bioproses dalam banyak bentuknya dikatalisis dalam setiap sistem seluler masing-masing oleh sejumlah
besar reaksi biokimia intraseluler. Substrat yang berasal dari media diubah menjadi produk primer dan
sekunder, makromolekul intra dan ekstraseluler, dan menjadi komponen biomassa seperti DNA, RNA,
protein dan karbohidrat (Gbr. 4.1).

Reaksi ini akan tergantung pada parameter fisik dan kimia yang ada di lingkungan terdekatnya. Peralatan
yang sama dengan modifikasi dapat digunakan untuk menghasilkan enzim, antibiotik, asam amino atau
protein sel tunggal. Dalam bentuknya yang paling sederhana, bioproses dapat dilihat hanya sebagai
campuran mikroorganisme

dengan kaldu nutrisi dan memungkinkan komponen bereaksi, mis. sel ragi dengan larutan gula memberi
alkohol. Proses yang lebih maju dan canggih yang beroperasi dalam skala besar perlu mengendalikan
keseluruhan sistem sehingga proses bioproses dapat berjalan secara efisien dan mudah serta secara
tepat diulang dengan jumlah bahan baku dan inokulum yang sama (organisme tertentu) untuk
menghasilkan jumlah produk yang persis sama . Semua proses bioteknologi pada dasarnya dilakukan
dalam sistem penahanan atau bioreaktor. Sejumlah besar sel selalu terlibat dalam proses ini dan
bioreaktor memastikan keterlibatan erat mereka dengan medium dan kondisi yang tepat untuk
pertumbuhan dan pembentukan produk. Ini juga harus membatasi pelepasan sel ke lingkungan. Fungsi
utama bioreaktor adalah meminimalkan biaya produksi suatu produk atau layanan. Contoh dari
beragam kategori produk yang diproduksi secara industri dalam bioreaktor disajikan pada Tabel 4.3.

4.2 Prinsip-prinsip pertumbuhan mikroba

Pertumbuhan organisme dapat dilihat sebagai peningkatan bahan sel yang diekspresikan dalam bentuk
massa atau jumlah sel, dan hasil dari serangkaian langkah-langkah biologis yang dikatalisis secara
enzimatis yang sangat rumit. Pertumbuhan akan tergantung pada ketersediaan dan transportasi nutrisi
yang diperlukan ke sel dan penyerapan berikutnya, dan pada parameter lingkungan seperti suhu, pH dan
aerasi dipertahankan secara optimal. Jumlah biomassa atau komponen seluler spesifik (X) dalam
bioreaktor dapat ditentukan secara gravimetri (berdasarkan berat kering, berat basah, DNA atau
protein) atau secara numerik untuk sistem uniseluler (dengan jumlah sel). Waktu penggandaan (td)
mengacu pada periode waktu yang diperlukan untuk penggandaan dalam berat biomassa sementara
waktu generasi (g) berhubungan dengan periode yang diperlukan untuk penggandaan jumlah sel. Waktu
penggandaan rata-rata meningkat dengan meningkatnya ukuran sel (Tabel 4.4) dan kompleksitas, mis.
bakteri 0,25–1 jam; ragi 1–2 jam; jamur cetakan 2-6,5 jam; sel tanaman 20–70 jam; dan sel mamalia 20-
48 jam.

Sekarang dimungkinkan untuk mengembangkan persamaan matematika untuk menggambarkan fitur

penting dari pertumbuhan organisme dalam bioreaktor. Persamaan matematika asli yang dijelaskan
oleh Monod (1942) memberikan pertumbuhan spesifik (μ) sebagai fungsi konsentrasi (S):

μ = μmax

Ks + S

S adalah konsentrasi substrat dalam medium, yang membatasi konsentrasi ketika dibandingkan dengan
nutrisi penting lainnya, μmax adalah laju pertumbuhan spesifik maksimum organisme sementara Ks
mewakili konstanta saturasi. Ks adalah konsentrasi substrat di mana μ = μmax / 2.

Pertumbuhan eksponensial akan terjadi pada tingkat pertumbuhan spesifik yang memiliki nilai antara
nol dan μmax jika konsentrasi substrat dapat dijaga konstan pada nilai yang sesuai, suatu faktor yang
akan penting untuk kultur berkelanjutan. Nutrisi penting untuk pertumbuhan bersama dengan kondisi
optimal yang diperlukan untuk pertumbuhan telah diidentifikasi dari sistem bioreaktor batch dan
berkelanjutan. Laju peningkatan konsentrasi organisme (dx / dt) adalah laju pertumbuhan sedangkan
laju pertumbuhan spesifik adalah laju kenaikan / satuan konsentrasi organisme (1 / x) (dx / dt). Ada
hubungan sederhana antara pertumbuhan dan pemanfaatan substrat. Dalam sistem sederhana, laju
pertumbuhan adalah fraksi Y yang konstan dari tingkat pemanfaatan media:

dx

dt

= −Y

ds

dt

(1)

Y adalah konstanta hasil dan selama periode pertumbuhan terbatas:

Y = berat sel membentuk berat substrat yang digunakan

(2)
Mengetahui nilai-nilai dari tiga konstanta pertumbuhan μmax, Ks dan Y, persamaan (1) dan (2) dapat
memberikan deskripsi kuantitatif lengkap dari siklus pertumbuhan kultur batch.

Dalam praktik normal, suatu organisme jarang memiliki kondisi yang sepenuhnya ideal untuk
pertumbuhan tanpa batas; alih-alih, pertumbuhan akan tergantung pada faktor pembatas, misalnya,
nutrisi penting. Ketika konsentrasi faktor ini turun, maka potensi pertumbuhan organisme juga akan
berkurang. Dalam proses bioteknologi ada tiga cara utama untuk menumbuhkan mikroorganisme dalam
bioreaktor: batch, fed-batch atau kontinu. Dalam reaksi bioreaktor dapat terjadi dengan kultur statis
atau agitasi, dengan adanya atau tidak adanya oksigen, dan dalam kondisi cair atau kelembaban rendah
(mis. Pada substrat padat). Mikroorganisme dapat bebas atau dapat melekat pada permukaan dengan
imobilisasi atau kepatuhan alami. Dalam kultur batch, mikroorganisme diinokulasi ke dalam volume
medium yang tetap dan ketika pertumbuhan terjadi nutrisi dikonsumsi dan produk-produk
pertumbuhan (biomassa, metabolit) menumpuk. Lingkungan nutrisi dalam bioreaktor terus berubah
dan, dengan demikian, pada gilirannya, mendorong perubahan pada metabolisme sel. Akhirnya,
penggandaan sel berhenti karena kelelahan atau keterbatasan nutrisi dan akumulasi produk limbah
beracun yang dikeluarkan.

Sifat kompleks pertumbuhan batch mikroorganisme ditunjukkan pada Gambar 4.2. Fase lag awal adalah
waktu tanpa pertumbuhan yang nyata, tetapi analisis biokimia aktual menunjukkan pergantian
metabolisme yang menunjukkan bahwa sel-sel sedang dalam proses beradaptasi dengan kondisi
lingkungan dan bahwa pertumbuhan baru pada akhirnya akan dimulai. Kemudian ada fase akselerasi
sementara ketika inokulum mulai tumbuh dengan cepat diikuti oleh fase eksponensial. Pada fase
eksponensial, pertumbuhan mikroba berlangsung pada tingkat maksimum yang mungkin untuk
organisme dengan nutrisi yang berlebihan, parameter lingkungan yang ideal dan penghambat
pertumbuhan tidak ada. Namun, dalam budidaya batch, pertumbuhan eksponensial memiliki durasi
yang terbatas dan karena kondisi nutrisi berubah, laju pertumbuhan menurun memasuki fase
perlambatan yang akan diikuti oleh fase diam ketika pertumbuhan keseluruhan tidak lagi dapat
diperoleh karena habisnya nutrisi. Fase terakhir dari siklus adalah fase kematian ketika pertumbuhan
telah berhenti. Sebagian besar proses batch bioteknologi dihentikan sebelum tahap ini karena
penurunan metabolisme dan lisis sel.

Dalam penggunaan industri, bets budidaya telah dioperasikan untuk mengoptimalkan produksi
organisme atau biomassa dan kemudian memungkinkan organisme untuk melakukan transformasi
biokimia spesifik seperti pembentukan produk akhir (mis. Asam amino, enzim) atau penguraian zat
(pengolahan limbah, bioremediasi). Banyak produk penting seperti antibiotik terbentuk secara optimal
selama fase diam siklus pertumbuhan dalam budidaya batch.

Namun, ada cara untuk memperpanjang umur kultur batch dan dengan demikian meningkatkan hasil
dengan berbagai metode pengumpanan substrat:

(1) dengan penambahan bertahap dari komponen nutrisi yang terkonsentrasi, mis. karbohidrat,
sehingga meningkatkan volume kultur (fed batch) - digunakan untuk produksi industri ragi roti

(2) dengan menambahkan media ke kultur (perfusi) dan penarikan volume yang sama dari media bebas
sel bekas - digunakan dalam budidaya sel mamalia.
Berbeda dengan kondisi batch, praktik budidaya berkelanjutan memberikan pertumbuhan hampir
seimbang dengan sedikit fluktuasi nutrisi, metabolit atau jumlah sel atau biomassa. Praktek ini
tergantung pada media segar yang memasuki sistem batch pada fase pertumbuhan eksponensial
dengan penarikan sel plus media yang sesuai. Metode budidaya berkelanjutan akan memungkinkan
organisme untuk tumbuh di bawah kondisi tunak (tidak berubah), di mana pertumbuhan terjadi pada
tingkat yang konstan dan dalam lingkungan yang konstan. Dalam sistem kultur kontinu yang sepenuhnya
tercampur, media steril dilewatkan ke dalam

bioreaktor (Gbr. 4.3) pada laju aliran yang stabil dan kaldu kultur (medium, produk limbah dan
organisme) muncul darinya pada tingkat yang sama menjaga volume kultur total dalam bioreaktor
konstan. Faktor-faktor seperti pH dan konsentrasi nutrisi dan produk metabolisme, yang pasti berubah
selama budidaya batch, dapat dipertahankan mendekati konstan dalam budidaya berkelanjutan. Dalam
praktik industri sistem yang dioperasikan secara terus-menerus terbatas penggunaannya dan hanya
mencakup protein sel tunggal (SCP) dan produksi etanol

dan beberapa bentuk proses pengolahan air limbah. Namun,

karena banyak alasan (Tabel 4.5) sistem budidaya batch merupakan bentuk dominan dari penggunaan
industri. Berbagai metode budidaya untuk mikroorganisme ditunjukkan pada Tabel 4.6.

Genetika mikroba terapan

Aspek penting dari bioteknologi mikroba berkaitan dengan turunan mikroorganisme produsen yang baru
dan lebih baik. Ini akan melibatkan pemilihan mikroorganisme dari sumber alami,

 dari koleksi budaya dan organisasi lain, atau dengan pengembangan lebih lanjut dari strain perusahaan
'in-house'. Berbagai macam teknik tersedia untuk memodifikasi, menghapus, atau menambah
pelengkap genetik suatu organisme. Kegiatan seleksi dan penyaringan tetap menjadi bagian utama dari
program bioteknologi. Skrining adalah penggunaan prosedur yang memungkinkan deteksi dan isolasi
hanya mikroorganisme atau metabolit yang diminati di antara populasi besar.

Mikroorganisme produsen harus dilestarikan dengan degenerasi minimum kualitas genetik, dan
biasanya diawetkan pada agar

sedang, dengan mengurangi metabolisme, pengeringan, pengeringan beku atau oleh suhu sangat
rendah. Genom dapat dimodifikasi oleh mutagenesis atau dengan berbagai jenis hibridisasi. Program
mutasi terutama ditujukan untuk peningkatan regangan, dan mutagen yang tersedia termasuk radiasi
ultraviolet dan ionisasi dan berbagai mutagen kimia. Hibridisasi antar mikroorganisme pada dasarnya
adalah prosedur yang memfasilitasi rekombinasi materi genetik antar mikroorganisme dan dapat
diekspresikan melalui mekanisme seksual dan parasexual. Teknik fusi protoplas telah digunakan dengan
banyak sel mikroba serta dengan sel tumbuhan dan hewan.

Laju fusi dapat sangat meningkat melalui fusogen polietilen glikol.

Teknologi DNA rekombinan memungkinkan isolasi, pemurnian dan amplifikasi selektif dalam sel inang
spesifik dari fragmen DNA atau gen diskrit dari hampir semua organisme. Teknologi dasar dijelaskan di
tempat lain. Bakteri dan jamur rekombinan digunakan secara luas dalam produksi enzim industri
tertentu, sementara garis sel mamalia semakin banyak digunakan untuk produksi protein rekombinan.
Manipulasi gen sekarang banyak digunakan untuk (a) meningkatkan hasil dan kualitas biomolekul yang
ada (mis. Metabolit, protein), (b) meningkatkan karakteristik produk yang ada dengan rekayasa protein,
dan (c) mengubah jalur untuk sintesis produk yang ada.

4.3 Bioreaktor

Bioreaktor adalah kendaraan penahanan dari setiap proses produksi berbasis bioteknologi, baik itu
untuk pembuatan bir, asam organik atau asam amino, antibiotik, enzim, vaksin atau untuk bioremediasi.
Untuk setiap proses bioteknologi, sistem penahanan yang paling cocok harus dirancang untuk
memberikan lingkungan yang tepat untuk mengoptimalkan pertumbuhan dan aktivitas metabolisme
biokatalis. Bioreaktor berkisar dari wadah terbuka sederhana yang diaduk atau tidak diaduk hingga
sistem terintegrasi aseptik kompleks yang melibatkan berbagai tingkat kontrol komputer tingkat lanjut
(Gbr. 4.4).

Bioreaktor muncul dalam dua jenis yang berbeda (Gbr. 4.4). Pada contoh pertama, mereka terutama
adalah sistem non-aseptik di mana tidak sepenuhnya penting untuk beroperasi dengan kultur yang
sepenuhnya murni, mis. pembuatan bir, sistem pembuangan limbah; sedangkan pada tipe kedua,
kondisi aseptik merupakan prasyarat untuk pembentukan produk yang sukses, mis. antibiotik, vitamin,
polisakarida, dan protein rekombinan. Jenis proses ini melibatkan banyak tantangan pada bagian
konstruksi dan operasi teknik. Bentuk fisik dari banyak bioreaktor yang paling banyak digunakan belum
banyak berubah selama empat puluh tahun terakhir; namun, dalam beberapa tahun terakhir, bentuk-
bentuk baru bioreaktor telah dikembangkan untuk memenuhi kebutuhan bioproses spesifik dan inovasi
semacam itu semakin menemukan peran khusus dalam teknologi bioproses (Gambar 4.4).

Dalam semua bentuk fermentasi, tujuan utamanya adalah untuk memastikan bahwa semua bagian
sistem tunduk pada kondisi yang sama. Dalam bioreaktor mikroorganisme disuspensikan dalam media
nutrisi berair yang mengandung substrat yang diperlukan untuk pertumbuhan organisme dan
pembentukan produk yang diperlukan. Semua nutrisi, termasuk oksigen, harus disediakan untuk
berdifusi ke dalam setiap sel dan produk limbah seperti panas, karbon dioksida, dan sisa metabolisme
dikeluarkan.

Konsentrasi nutrisi di sekitar organisme harus dipegang dalam kisaran yang pasti karena nilai yang
rendah akan membatasi laju metabolisme organisme sementara konsentrasi berlebihan dapat menjadi
racun. Reaksi biologis berjalan paling efisien dalam rentang optimal parameter lingkungan, dan dalam
proses bioteknologi kondisi ini harus disediakan pada skala mikro sehingga masing-masing sel disediakan
secara sama. Ketika skala besar dari banyak sistem bioreaktor dipertimbangkan, akan disadari betapa
sulitnya untuk mencapai kondisi ini di seluruh populasi. Di sinilah keterampilan proses atau insinyur
biokimia dan ahli mikrobiologi harus bersatu. Reaksi fermentasi adalah multifase, melibatkan fase gas
(mengandung N2, O2 dan CO2), satu atau lebih fase cair (media berair dan substrat cair) dan mikrofase
padat (mikroorganisme dan kemungkinan substrat padat). Semua fase harus dijaga dalam kontak dekat
untuk mencapai perpindahan massa dan panas yang cepat. Dalam bioreaktor yang tercampur sempurna
semua reaktan yang memasuki sistem harus segera dicampur dan didistribusikan secara merata untuk
memastikan homogenitas di dalam reaktor. Untuk mencapai optimalisasi sistem bioreaktor, pedoman
operasi berikut harus dipatuhi:

(1) bioreaktor harus dirancang untuk mengecualikan masuknya organisme yang terkontaminasi serta
mengandung organisme yang diinginkan
(2) volume kultur harus tetap konstan, yaitu tidak ada kebocoran atau penguapan

(3) tingkat oksigen terlarut harus dipertahankan di atas tingkat kritis aerasi dan agitasi kultur untuk
organisme aerob

(4) parameter lingkungan seperti suhu, pH, dll., Harus dikontrol dan volume biakan harus tercampur
dengan baik. Standar bahan yang digunakan dalam konstruksi fermentor canggih adalah penting (Tabel
4.7).

Teknolog fermentasi berupaya untuk mencapai pemaksimalan potensi kultur dengan kontrol akurat
terhadap lingkungan bioreaktor. Tetapi masih ada kurangnya pemahaman yang benar tentang kondisi
lingkungan apa yang akan menghasilkan hasil optimal dari organisme atau produk. Organisme dengan
ukuran sel besar, seperti sel hewan dibandingkan dengan bakteri, memiliki permintaan nutrisi yang
kompleks dan tingkat pertumbuhan yang lebih rendah. Di sisi lain kemampuan mereka untuk
menghasilkan protein yang rumit meningkat.

Bioproses yang sukses hanya akan terjadi ketika semua parameter terkait pertumbuhan spesifik
disatukan, dan informasi yang digunakan untuk meningkatkan dan mengoptimalkan proses. Untuk
operasi komersial yang sukses dari bioproses ini, deskripsi kuantitatif dari proses seluler adalah
prasyarat penting: dua aspek yang paling relevan, hasil dan produktivitas, adalah ukuran kuantitatif yang
akan menunjukkan bagaimana sel mengubah substrat menjadi produk. Hasil mewakili jumlah produk
yang diperoleh dari substrat sementara produktivitas menentukan tingkat pembentukan produk.

Untuk memahami dan mengendalikan proses fermentasi, perlu untuk mengetahui keadaan proses
melalui peningkatan waktu yang kecil dan, lebih lanjut, untuk mengetahui bagaimana organisme
merespons terhadap serangkaian kondisi lingkungan yang terukur. Optimalisasi proses membutuhkan
kontrol umpan balik yang akurat dan cepat. Di masa depan, komputer akan menjadi bagian integral dari
sebagian besar sistem bioreaktor. Namun, ada kekurangan probe sensor yang baik yang akan
memungkinkan analisis online dilakukan pada komponen kimia dari proses fermentasi.

Ada pasar besar di seluruh dunia untuk pengembangan cepat baru

metode pemantauan banyak reaksi dalam bioreaktor. Secara khusus, kebutuhan terbesar adalah untuk
desain mikroelektronik inovatif.

Ketika berusaha untuk meningkatkan operasi proses atau desain yang ada, sering disarankan untuk
mengatur model matematika dari keseluruhan sistem.

Model adalah seperangkat hubungan antara variabel dalam sistem yang sedang dipelajari. Hubungan
seperti itu biasanya dinyatakan dalam bentuk persamaan matematika tetapi juga dapat ditentukan
sebagai hubungan sebab / akibat, yang dapat digunakan dalam operasi proses spesifik. Variabel aktual
yang terlibat dapat luas tetapi akan mencakup parameter apa pun yang penting untuk proses dan dapat
mencakup: pH, suhu, konsentrasi substrat, agitasi, laju umpan, dll.

Konfigurasi bioreaktor telah banyak berubah selama beberapa dekade terakhir. Sistem fermentasi asli
adalah tangki dangkal yang diaduk atau diaduk oleh tenaga kerja. Dari sini telah dikembangkan sistem
menara aerasi dasar, yang sekarang mendominasi penggunaan industri. Ketika sistem fermentasi
dikembangkan lebih lanjut, dua solusi desain untuk masalah aerasi dan agitasi telah diterapkan.
Pendekatan pertama menggunakan aerasi mekanis dan perangkat agitasi, dengan kebutuhan daya yang
relatif tinggi; contoh standar adalah reaktor tangki berpengaduk terpusat (CSTR), yang banyak digunakan
di seluruh laboratorium konvensional dan fermentasi industri.

Bioreaktor tersebut memastikan perpindahan massa gas / cairan yang baik, memiliki perpindahan panas
yang wajar, dan memastikan pencampuran yang baik dari konten bioreaktor.

Poros vertikal CSTR akan membawa satu atau lebih impeler tergantung pada ukuran bioreaktor (Gbr.
4.4a). Berbagai impeler telah diselidiki untuk mengaduk dan menciptakan kondisi homogen dalam
bioreaktor. Impeler biasanya diberi jarak pada interval yang setara dengan satu diameter tangki di
sepanjang poros untuk menghindari jenis gerakan cairan yang berputar. Keenam impeller turbin flat-
blade (Rushton) digunakan di sebagian besar bioreaktor dan biasanya tiga hingga lima dipasang untuk
mencapai pencampuran dan dispersi yang baik di seluruh sistem. Fungsi impeller adalah untuk membuat
agitasi atau pencampuran dalam bioreaktor dan untuk memfasilitasi aerasi.

Fungsi utama agitasi adalah untuk menangguhkan sel dan nutrisi

merata di seluruh media, untuk memastikan bahwa nutrisi, termasuk

oksigen, tersedia untuk sel-sel dan untuk memungkinkan perpindahan panas. Sebagian besar organisme
industri bersifat aerob dan, pada sebagian besar fermentasi, organisme tersebut akan menunjukkan
kebutuhan oksigen yang tinggi. Karena oksigen jarang larut dalam larutan air (kelarutan CO2 dalam air
adalah sekitar 30 kali lebih tinggi daripada O2) fermentasi aerobik hanya dapat didukung oleh aerasi
media yang kuat dan konstan.

Pendekatan utama kedua untuk desain bioreaktor aerobik menggunakan distribusi udara (dengan
konsumsi daya rendah) untuk membuat aliran cairan paksa dan terkendali dalam daur ulang atau loop
bioreaktor. Dengan cara ini, isinya dikenai aliran daur ulang yang terkontrol, baik di dalam bioreaktor
atau yang melibatkan loop daur ulang eksternal. Jadi pengadukan telah diganti dengan pemompaan,
yang mungkin mekanis atau pneumatik, seperti dalam kasus bioreaktor pengangkutan udara.

Reaktor tangki yang diaduk secara terpusat terdiri dari bejana silindris dengan poros tengah yang
digerakkan motor yang mendukung satu atau beberapa agitator dengan poros masuk baik melalui
bagian atas atau bawah kapal. Rasio aspek (yaitu rasio tinggi terhadap diameter) kapal adalah tiga
sampai lima untuk sistem mikroba sedangkan untuk kultur sel mamalia, rasio aspek biasanya tidak
melebihi dua. Udara steril dimasukkan ke dalam cairan bioreaktor di bawah pendorong bagian bawah
melalui sparger cincin berlubang. Kecepatan impeler akan terkait dengan tingkat kerapuhan sel. Sel
mamalia sangat rapuh jika dibandingkan dengan kebanyakan mikroorganisme. Dalam banyak proses
bernilai tinggi, bioreaktor akan dioperasikan secara batch di bawah monokultur aseptik. Bioreaktor
dapat berkisar dari c. 20 l hingga lebih dari 250m3 untuk proses tertentu. Perluasan kultur awal
mikroorganisme akan dimulai pada bioreaktor terkecil, dan ketika pertumbuhan dioptimalkan maka
akan ditransfer ke bioreaktor yang lebih besar, dan seterusnya, hingga bioreaktor operasi akhir.
Sepanjang operasi seperti itu, sangat penting untuk mempertahankan kondisi aseptik untuk memastikan
keberhasilan proses. Bioreaktor biasanya disterilkan sebelum inokulasi dan kontaminasi harus dihindari
selama semua operasi berikutnya. Jika kontaminasi terjadi selama budidaya ini akan selalu
menyebabkan kegagalan proses karena lebih sering kontaminan dapat tumbuh melebihi monokultur
yang berpartisipasi.
Jumlah jenis bioreaktor yang berbeda sangat terbatas ketika diukur terhadap berbagai proses produksi
dan berbagai sistem biologis yang terlibat. Dalam praktik industri, dan lebih sedikit sebagai hasil dari
keunggulan khusus daripada sebagai kebutuhan akan fleksibilitas dalam peralatan produksi, CSTR
sekarang menempati posisi dominan dan secara virtual merupakan satu-satunya desain bioreaktor yang
digunakan dalam bioproses skala penuh.

Sejumlah besar air limbah organik dari sumber domestik dan industri diolah secara rutin dalam sistem
aerob dan anaerob. Proses lumpur aktif banyak digunakan untuk pengolahan oksidatif limbah dan
limbah cair lainnya (Gambar 4.4d). Proses tersebut menggunakan batch atau sistem bioreaktor terus
menerus untuk meningkatkan entrainment udara untuk mengoptimalkan pemecahan oksidatif dari
bahan organik. Bioreaktor ini berukuran besar dan untuk fungsi optimal akan memiliki beberapa atau
banyak unit agitator untuk memfasilitasi pencampuran dan pengambilan oksigen. Mereka banyak
digunakan di sebagian besar pabrik pengolahan limbah kota.

Bioreaktor atau pencernaan anaerob telah lama digunakan untuk menangani masalah limbah. Dengan
tidak adanya oksigen bebas, konsorsium mikroba tertentu dapat mengubah bahan organik tometana,
karbon dioksida, dan biomassa mikroba yang dapat terurai secara hayati. Digester anaerobik yang paling
umum bekerja secara kontinu atau semi kontinu.

Sebuah contoh luar biasa dari pembangkitan metana adalah program biogas Tiongkok di mana sejumlah
bioreaktor anaerob ukuran keluarga sedang beroperasi.

Bioreaktor semacam itu digunakan untuk pengobatan kotoran, kotoran manusia, dll., Menghasilkan
biogas untuk memasak dan penerangan dan sanitasi limbah, yang kemudian menjadi pupuk yang sangat
baik.

Di hampir semua proses fermentasi yang dilakukan dalam bioreaktor, pada umumnya ada kebutuhan
untuk mengukur parameter spesifik yang berhubungan dengan pertumbuhan dan lingkungan,
mencatatnya dan kemudian menggunakan informasi untuk meningkatkan dan mengoptimalkan proses.
Pengukuran kontrol bioreaktor dilakukan secara on-line atau off-line. Dengan pengukuran on-line sensor
ditempatkan langsung di dalam aliran proses sedangkan untuk pengukuran off-line sampel dihapus
secara aseptik dari aliran proses dan dianalisis.

Pemrosesan bioreaktor masih sangat dibatasi oleh kekurangan instrumen yang andal yang mampu
melakukan pengukuran on-line variabel penting seperti DNA, RNA, enzim, dan biomassa. Analisis off-line
masih penting untuk senyawa ini dan karena hasil analisis ini biasanya tidak tersedia sampai beberapa
jam setelah pengambilan sampel, mereka tidak dapat digunakan untuk tujuan kontrol langsung. Namun,
pengukuran on-line sudah tersedia untuk analisis suhu, pH, oksigen terlarut dan karbon dioksida.

Penemuan berkelanjutan dari produk-produk baru seperti obat-obatan terapeutik dari mikroorganisme
dan sel mamalia akan terus bergantung pada pengembangan sistem kultur eksplorasi yang inovatif, yang
mendorong biosintesis senyawa baru. Sistem inkubator miniatur baru yang dikendalikan komputer
dengan unit analisis otomatis kini tersedia sebagai unit tunggal yang dapat melakukan ratusan
percobaan secara bersamaan, sehingga menghasilkan banyak data dalam waktu singkat untuk
memfasilitasi kondisi fermentasi yang optimal untuk pembentukan produk.

Pendekatan baru dan cukup baru yang melibatkan biologi kombinasi menghasilkan produk-produk baru
dari mikroorganisme hasil rekayasa genetika. Fragmen atau gen DNA yang berasal dari mikroorganisme
tidak biasa yang tidak mudah diolah (mikroorganisme bandel) dapat ditransfer ke mikroorganisme yang
mudah diolah atau digantikan dan pencampuran dan pencocokan gen yang mengkode mesin biosintetik
kini menawarkan kesempatan untuk menemukan molekul atau obat yang dimodifikasi atau baru
dimodifikasi. . Ini bisa menjadi sangat penting dalam penemuan antibiotik.

Sementara sebagian besar senyawa bioteknologi bernilai tinggi seperti antibiotik dan protein terapeutik
diproduksi dalam monokultur di bawah kondisi asepsis yang ketat, kini ada jalan baru penelitian yang
mengeksplorasi pembentukan produk dari sistem kultur campuran. Sistem seperti itu dapat
menghasilkan pola metabolit yang berbeda atau bahkan metabolit baru sebagai hasil interaksi yang
dapat terjadi antara mikroorganisme yang bersaing. Karena kerumitan proses organisme campuran ini,
semuanya diabaikan oleh komunitas ilmiah. Monokultur dalam kondisi aseptik sama sekali tidak alami
dan jarang, jika pernah, terjadi di alam. Normalnya adalah agar mikroorganisme hidup bersama di
lingkungan dan bersaing

dan menanggapi ketersediaan media dan kondisi lingkungan yang berlaku.

4.4 Peningkatan

Sebagian besar proses bioteknologi akan diidentifikasi pada skala laboratorium, dan keberhasilan
komersial akhir akan bergantung pada kemampuan untuk meningkatkan proses, pertama dari
laboratorium ke tingkat pilot plant dan kemudian ke skala komersial penuh. Pencapaian peningkatan
proses yang sukses harus sesuai dengan berbagai batasan fisik dan ekonomi. Identifikasi beberapa
parameter pengendalian biasanya dapat dibuat dengan bioreaktor skala laboratorium (5-10 l) dan
kemudian dipindahkan ke tingkat skala pilot. Pada kenyataannya, sebuah pilot plant adalah sebuah
laboratorium berskala besar, yang telah dirancang untuk memberikan fleksibilitas untuk akomodasi
peralatan dan kemampuan beradaptasi untuk operasi proses.

Bioreaktor pabrik percontohan berkisar antara 100-10.000 volume total dan bioreaktor percontohan
yang lebih besar dapat, kadang-kadang, digunakan sebagai unit produksi. Bioreaktor industri skala
penuh dapat berkisar antara 20 000 l dan 400 000 l volumenya (Gbr. 4.5). Manajemen peningkatan
memerlukan investasi modal yang tinggi dalam pencampuran dan aerasi, dalam perangkat pemantauan
dan kontrol, dan dalam pemeliharaan sterilitas yang ketat.

4.5 Desain media untuk proses fermentasi

Air adalah pusat dari semua proses bioteknologi dan dalam banyak kasus akan menjadi komponen
dominan dari media di mana organisme (mikroorganisme, sel tumbuhan dan hewan) akan tumbuh.
Setelah proses fermentasi cair mencapai produksi optimal, pembuangan air merupakan faktor utama
dalam biaya pemulihan bioproduk dan pemrosesan hilir. Kualitas air sangat relevan karena
mempengaruhi pertumbuhan organisme dan produksi bioproduk tertentu. Di masa lalu, pusat
pembuatan bir tradisional didirikan di tempat-tempat di mana sumber-sumber alami menyediakan air
berkualitas tinggi tanpa harus menggunakan pra-perawatan yang ekstensif.

Dalam produksi media biasanya ada kontrol kualitas bahan baku.

Semakin disadari bahwa, berkenaan dengan volume, air adalah salah satu bahan baku terpenting dalam
banyak proses bioteknologi dan bahwa pasokan dan penggunaannya harus dipantau dan dikendalikan
dengan hati-hati.
Persyaratan nutrisi dasar mikroorganisme adalah sumber energi atau karbon, sumber nitrogen yang
tersedia, unsur anorganik, dan untuk beberapa jenis sel, faktor pertumbuhan spesifik. Dalam sebagian
besar proses bioteknologi, sumber karbon dan nitrogen lebih sering diperoleh dari campuran produk
alami atau produk samping yang relatif kompleks (Tabel 4.8).

Ketersediaan dan jenis nutrisi dapat memberikan kontrol fisiologis yang kuat atas reaksi fermentasi dan
pembentukan produk. Input bahan baku ke fermentasi akan sangat tergantung pada biaya bahan pada
waktu tertentu, karena harga pasar komoditas berubah dengan musiman dan variabel lainnya.

Jika biomassa atau produk yang terkait dengan pertumbuhan adalah tujuan fermentasi, maka diperlukan
media yang harus memungkinkan potensi pertumbuhan maksimum di seluruh fermentasi, sedangkan
untuk senyawa yang tidak terbatas pada pertumbuhan, mis. asam organik, antibiotik, dll., suatu medium
harus dirumuskan bahwa setelah fase pertumbuhan awal akan menjadi kekurangan satu atau lebih
nutrisi. Bergantung pada prosesnya, pembatasan fosfor, nitrogen, karbohidrat atau logam dapat
menyebabkan pembentukan produk. Dalam beberapa fermentasi, kadar glukosa yang tinggi dapat
menyebabkan represi katabolit, misalnya, sintesis enzim; ini dapat diatasi dengan menggunakan
karbohidrat lain yang bisa difermentasi secara perlahan atau dengan pemberian tambahan glukosa
secara terus menerus.

Praktik sterilisasi untuk media bioteknologi harus mencapai penghancuran maksimum mikroorganisme
yang terkontaminasi, dengan kerusakan suhu minimum untuk komponen sedang. Sebagian besar,
sterilisasi batch-bijaksana dalam bioreaktor masih merupakan metode yang paling banyak digunakan,
meskipun metode terus menerus mendapatkan peningkatan penerimaan.

Persiapan media mungkin tampaknya menjadi bagian yang relatif tidak menarik dari keseluruhan
bioproses tetapi sebenarnya merupakan landasan dari seluruh operasi.

Desain media yang buruk akan menyebabkan efisiensi pertumbuhan yang rendah dan pembentukan
produk yang buruk secara bersamaan.

4.6 Fermentasi substrat padat

Ada banyak proses bioteknologi yang melibatkan pertumbuhan mikroorganisme pada substrat padat
tanpa atau hampir tidak ada air bebas (Tabel 4.9). Substrat padat yang paling sering digunakan adalah
biji-bijian sereal, biji polong-polongan, dedak gandum, bahan lignoselulosa seperti sedotan, serbuk
gergaji atau serutan kayu, dan berbagai macam bahan tanaman dan hewan. Sebagian besar senyawa ini
adalah molekul polimer, tidak larut atau sedikit larut dalam air, tetapi sebagian besar murah, mudah
diperoleh dan merupakan sumber nutrisi terkonsentrasi untuk pertumbuhan mikroba.

Banyak dari fermentasi ini memiliki jaman dahulu dan dalam banyak kasus ada catatan yang berasal dari
ratusan tahun yang lalu. Di Timur ada berbagai macam fermentasi makanan, termasuk kecap dan
tempe, serta banyak proses enzim industri besar. Di Barat, proses fermentasi berpusat pada produksi
silase, budidaya jamur, produksi keju dan asinan kubis, dan pengomposan limbah tanaman dan hewan.
Fermentasi substrat padat menggunakan bahan baku yang dapat didaur ulang seperti jerami, kayu dan
bahan limbah lainnya dapat menjadi industri masa depan yang memproduksi etanol, metana, dan
biomassa yang dapat dimakan.
Komponen mikrobiologis dari fermentasi substrat padat dapat terjadi sebagai kultur murni tunggal,
kultur yang dapat diidentifikasi atau mikroorganisme asli campuran total.

Fermentasi substrat padat dengan menggunakan mikroorganisme asli terutama merupakan proses
pengomposan dan pengomposan. Ensiling adalah proses anaerob yang melibatkan bahan-bahan
pertanian, sebagian besar rumput, di mana bakteri Lactobacillus bulgaricus secara bertahap menjadi
organisme dominan yang memproduksi asam laktat, yang menghambat bakteri potensial pembusukan.
Produk akhir - silase - diproduksi secara besar-besaran di negara-negara beriklim sedang sebagai pakan
musim dingin untuk hewan ternak. Pengomposan diperiksa secara rinci di bab selanjutnya. Fermentasi
substrat padat yang melibatkan kultur jamur murni telah lama dipraktikkan dalam proses Oriental Koji
kuno di mana biji-bijian dan kacang kedelai difermentasi dengan jamur Aspergillus oryzae untuk
menghasilkan berbagai enzim, mis. protease dan amilase. Dalam produksi kecap, gandum adalah

difermentasi untuk menghasilkan enzim di atas dan kemudian mengalami fermentasi bakteri / ragi
amixed. Produksi inmushroom substrat berasal dari proses pengomposan, yang kemudian mendukung
pertumbuhan kultur murni dari jamur spesifik, mis. Agaricus bisporus. Sekali lagi, budidaya jamur
dengan fermentasi substrat padat adalah industri besar di seluruh dunia.

Bioreaktor Koji Jepang menyediakan lingkungan yang baik untuk pertumbuhan jamur dan pembentukan
produk, agitasi mekanis terkontrol, kontrol proses yang masuk akal, dan kondisi operasi steril. Sebagian
besar dioperasikan dalam sistem batch tetapi dapat semi kontinu atau kontinu.

Dalam banyak fermentasi substrat padat ada kebutuhan untuk pra-perawatan bahan baku substrat
untuk meningkatkan ketersediaan nutrisi terikat dan juga untuk mengurangi ukuran komponen, mis.
jerami bubuk, bahan sayuran parut, untuk mengoptimalkan aspek fisik dari proses tersebut.

Namun, aspek biaya pra-perawatan harus diseimbangkan dengan nilai produk pada akhirnya. Desain
bioreaktor untuk fermentasi substrat padat secara inheren lebih sederhana daripada untuk budidaya
cair. Mereka diklasifikasikan ke dalam fermentasi (a) tanpa agitasi; (B) dengan agitasi sesekali; dan (c)
dengan agitasi berkelanjutan. Keuntungan dan kerugian relatif dari fermentasi substrat padat bila
dibandingkan dengan fermentasi cair disajikan pada Tabel 4.10.

4.7 Teknologi kultur sel mamalia dan tumbuhan

Kultur sel mamalia

Dorongan utama untuk mencapai penanaman in vitro massal sel mamalia berasal dari awal 1950-an
dengan kebutuhan untuk memproduksi sejumlah besar vaksin polio. Virus polio dihasilkan dari sel yang
dikultur yang berasal dari jaringan saraf dan ginjal primata, dan vaksin virus polio dari sel ginjal monyet.
Tak lama kemudian, vaksin virus lainnya, gondong, campak dan adenovirus, diproduksi dari berbagai sel
hewan yang dikultur. Selama paruh kedua abad kedua puluh ada dorongan besar untuk
mengembangkan media dan praktik budidaya untuk menghasilkan kultur sel yang aktif dan berkembang
biak dari berbagai organisme termasuk mamalia seperti manusia, tikus, tikus, hamster, monyet, sapi,
domba, kuda dan, baru-baru ini, dari ikan dan serangga. Garis sel khusus telah diperoleh dari organ
manusia seperti hati, ginjal, paru-paru, kelenjar getah bening, jantung dan indung telur, bersama dengan
beragam garis sel kanker. Garis sel dapat dilihat sebagai populasi sel yang identik secara genetik (klon)
yang berasal dari sel induk tunggal.
Dalam sistem kehidupan, sel mamalia tidak ada dalam isolasi, seperti sel mikroba, tetapi diorganisasikan
dalam organ yang berfungsi (mis. Hati, jantung) dan akan memperoleh nutrisi yang diperlukan untuk
metabolisme dan pertumbuhan melalui sirkulasi darah. Untuk meniru kompleksitas suplai darah telah
menjadi bidang studi yang berkelanjutan, dan sekarang banyak formulasi media yang berhasil telah
dicapai yang akan bervariasi dalam make-up tergantung pada jenis sel. Kebanyakan mediab biasanya
akan mengandung campuran kompleks senyawa organik, seperti asam amino, vitamin, asam organik,
dan lainnya, bersama dengan buffering garam anorganik. Beberapa media masih mengandung serum
darah (5-20%) untuk persediaan faktor pertumbuhan, elemen pelacak, lipid dan faktor-faktor lain yang
tidak diketahui.

Namun, penggunaan serum menciptakan banyak masalah termasuk variabilitas kandungan nutrisi
antara batch, ketidakteraturan pasokan, dan sekarang baru-baru ini kekhawatiran bahwa serum dapat
terkontaminasi dengan virion atau partikel prion.

Ketika sel mamalia dikultur, mereka tumbuh sebagai organisme bersel tunggal, berkembang biak dengan
pembagian yang menyediakan nutrisi yang sesuai dan kondisi lingkungan yang benar tersedia. Sel-sel
tersebut berbeda dari sel mikroba dan sel tumbuhan dalam kekurangan dinding sel luar yang kaku,
membuatnya rentan terhadap gaya geser dan terhadap perubahan osmolaritas. Selain itu, mereka
sangat sensitif terhadap kotoran dalam air, terhadap biaya dan kontrol kualitas media, dan kebutuhan
untuk menghindari kontaminasi oleh mikroorganisme yang tumbuh lebih cepat.

Kultur yang baru saja diisolasi dari sistem mamalia dikenal sebagai kultur primer sampai subkultur. Pada
tahap ini mereka biasanya heterogen tetapi masih mewakili tipe sel induk dan dalam ekspresi sifat
spesifik jaringan. Setelah beberapa subkultur ke media baru, garis sel akan mati atau 'berubah' menjadi
garis sel yang berkelanjutan atau diabadikan. Garis sel tersebut menunjukkan banyak perubahan dari
kultur primer termasuk perubahan sitomorfologi, peningkatan tingkat pertumbuhan, peningkatan variasi
kromosom inn dan peningkatan tumorigenisitas. Transformasi in vitro terutama adalah perolehan umur
yang tak terbatas.

Sel mamalia dapat tumbuh baik dalam kultur suspensi tidak terikat atau melekat pada permukaan
padat. Sel-sel seperti sel Hela (sel yang berasal dari keganasan manusia) dapat tumbuh di kedua negara,
sel limfoblastoid dapat tumbuh dalam kultur suspensi, sedangkan sel diploid primer atau normal hanya
akan tumbuh ketika mereka melekat pada permukaan padat. Sebagian besar pengembangan komersial
masa depan dengan sel mamalia akan didominasi oleh penanaman jenis sel yang bergantung pada
penjangkaran.

Budidaya monolayer sel hewan diatur oleh permukaan tersedia untuk lampiran, dan pertimbangan
desain telah diarahkan ke metode peningkatan luas permukaan. Desain awal terutama mengandalkan
tabung roller atau botol untuk memastikan pertukaran nutrisi dan gas. Sistem canggih baru-baru ini
mendukung pertumbuhan sel dalam gulungan tabung Teflon yang permeabel dengan gas, setiap tabung
memiliki luas permukaan 10.000 cm2, dan hingga 20 gulungan tersebut dapat dimasukkan ke dalam
ruang inkubator. Berbagai macam sel telah berhasil dikultur dalam kondisi ini.

Kultur suspensi telah berhasil dikembangkan hingga volume bioreaktor yang cukup besar sehingga
memungkinkan semua keuntungan rekayasa dari bioreaktor tangki berpengaduk yang telah diperoleh
dari studi mikroba untuk digunakan sebagai keuntungan. Studi-studi semacam itu hanya dilakukan
secara batch-culture.
Kombinasi budaya lampiran dan budaya suspensi dengan menggunakan manik-manik mikrokarrier
berpori telah menjadi inovasi terbaru di bidang ini. Pada prinsipnya, sel-sel yang bergantung pada
penjangkaran menempel pada manik-manik DEAE-Sephadex khusus (memiliki luas permukaan 7cm2 mg-
1), yang mampu mengapung dalam suspensi. Dengan cara ini, keuntungan teknik dari bioreaktor yang
diaduk dapat digunakan dengan sel-sel berlabuh. Banyak tipe sel telah tumbuh dengan cara ini dengan
keberhasilan produksi virus dan interferon manusia. Keberhasilan yang tidak diragukan dari manik-
manik microcarrier akhirnya dapat menyebabkan kematian sistem monolayer konvensional. Desain
bioreaktor baru yang melibatkan konsep manik mikrokarrier pasti akan menciptakan pengembangan
komersial yang lebih luas dari jenis sel hewan dan manusia.

Sementara garis sel semacam itu telah memungkinkan studi ekstensif dalam biokimia sel mamalia,
aplikasi praktis utama telah termasuk produksi vaksin (polio, gondong, rabies, dll.), Penelitian toksikologi
dan farmasi dengan tujuan untuk mengurangi pengujian hewan, produksi organ buatan dan kulit, dan
penggunaan luas garis sel mamalia sebagai produsen protein untuk diagnostik (antibodi monoklonal)
(lihat nanti) dan untuk aplikasi terapi rekombinan (interferon, hormon, insulin, dll.). Antibodi
monoklonal adalah produk glikoprotein kultur sel mamalia yang paling penting dan menghasilkan
setidaknya seperempat dari pencapaian terapi dalam industri bioteknologi, dan dihargai hampir US $ 3
miliar pada tahun 2001, dan terus meningkat. Pengenalan gen asing ke dalam garis sel mamalia
sekarang relatif umum dan akan relevan untuk meningkatkan garis sel dalam banyak cara seperti
memperluas produktivitas, kemampuan untuk tumbuh pada serum-freemedia dan untuk meningkatkan
berbagai produktivitas molekul terapi manusia (lihat kemudian untuk perincian protein rekombinan).

Semua produk biologis yang digunakan untuk tujuan terapeutik dan di pasaran saat ini diproduksi dalam
garis sel mamalia atau mikroba. Garis sel mamalia (mis. Sel ovarium hamster Tiongkok yang diabadikan,
myeloma tikus, ginjal embrio manusia dan sel retina manusia) sekarang merupakan sistem yang
dominan untuk produksi protein rekombinan untuk aplikasi klinis karena mereka dapat mencapai
pelipatan protein yang tepat, perakitan dan modifikasi pasca-translasi. Sementara sebagian besar proses
kultur mamalia melibatkan budidaya suspensi, masih ada keragaman yang cukup besar dalam metode
pembuatannya, khususnya kultur sel yang patuh. Hampir semua proses dengan hasil tinggi yang
digunakan adalah kultur suspensi bets yang diperpanjang dimana komponen medium ditambahkan
dalam alikuot kecil atau semi kontinu. Produktivitas sel mamalia yang dibiakkan dalam bioreaktor telah
mencapai kisaran gram per liter dalam banyak kasus, lebih dari peningkatan hasil seratus kali lipat
dibandingkan dengan proses serupa pada pertengahan 1980-an. Peningkatan tersebut terutama
disebabkan oleh komposisi media dan kontrol proses.