Nama : wafa ananda putri

Kelas : 3fa4

Npm : 11171154

Tugas validasi docking

1. Protein yang sesuai dengan jurnal HKSA

2. Kode protein dan kriteria nya

3. Preparasi ligan dan protein

 Ligan (autodock
  Protein (autodock) dengan penambahan hidrogen

4. Ukuran grid box dan grid center

5. Output gridbox

6. Pemilihan parameter docking (numb of GA runs dan max of evals)

7. Rmsd table
8. Kesimpulan validasi (ini harus valid)
Rmsd yang di peroleh ligan alami runing ke 26 adalah 0.91 dan bindng energi
yang diperoleh adalah -10,04 . Persyaratan Rmsd < 2 Amstrong. Dapat di
simpulkan bahwa sistem validasi GA memenuhi syarat dan dapat digunakan
untuk melakukan doking untuk senyawa uji.