CRITICAL JURNAL REVIEW

Disusun untuk memenuhi tugas mata kuliah Manajement Arsip Statis

Dosen Pengampuh : Dra. Sri Mutmainnah, M.Si
DI

Nurul Fazila
7183344010

PRODI PENDIDIKAN ADMINISTRASI PERKANTORAN

FAKULTAS EKONOMI
UNIVERSITAS NEGERI MEDAN
2020
 KATA PENGANTAR

Puji dan syukur atas kehadirat Tuhan yang Maha Esa Karena berkat dan rahmat-Nya
jugalah sehingga saya dapat menyelesaikan Critical Jounal Review ini. Yang mana dosen
pengampunya ibu “Dra. Sri Mutmainnah, M.Si” dengan Mata Kuliah Manajement Arsip Statis
Saya menyadari bahwa dalam penyelesaian CJR ini banyak sekali mendapatkan
bimbingan dan bantuan dari berbagai pihak yang tidak bisa penulis sebutkan satu persatu.
Ucapan terima kasih yang sebesar-besarnya atas segala bantuan yang diberikan, semoga
mendapat balasan yang berlipat ganda dari Tuhan yang Maha Esa. Akhirnya, dengan segala
kerendahan hati penulis menyadari bahwa penulisan makalah ini masih jauh dari kesempurnaan,
maka pada kesempatan ini penulis mengharapkan kritik dan saran yang membangun.

Akhir kata penulis do’akan semoga semua amal yang diberikan mendapat imbalan Tuhan
yang Maha Esa, dan semoga makalah ini bermanfaat bagi semua kalangan
mahasiswa/mahasiswi.

Medan, 17 Maret 2020

Nurul Fazila

BAB I
 PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Arsip adalah data atau dokumen dalam bentuk apapun yang mempunyai nilai historis,
hukum, dan kegunaan yang disimpan secara berencana dan teratur (agar bisa langsung digunakan
sewaktu-waktu).
Arsip sering disamakan dengan dokumen. Namun keduanya berbeda. The International
Standart Organization mendefinisikan records (dokumen) sebagai informasi yang diciptakan,
diterima, dan dikelola sebagai bukti maupun informasi yang oleh organisasi atau perorangan
digunakan untuk memenuhi kewajiban hukum atau transaksi bisnis.
1.2 Tujuan Penulisan
1. Mencari informasi tentang pengembangan arsip dalam jurnal arsip
2. Membandingkan isi jurnal yang disampaikan
3. Menyelesaikan tugas mata kuliah Manajement Kearsipan
1.3 Manfaat Penulisan
1. Dapat membandingkan jurnal
2. Dapat menyelesaikan tugas mata kuliah Manajement Kearsipan
3. Dapat memahami pengembangan arsip
1.4 Identitas Journal
A. Jurnal Utama
 Judul Artikel : SEA: a Super-Enhancer Archive (LAUT: Arsip Penambah-Super)
 Edisi Terbit : November 2015
 Pengarang Artikel : Yanjun Wei1,†, Shumei Zhang, dkk
 Kota Terbit : China
 Nomor ISSN :-
B. Jurnal Pembanding
 Judul Artikel : The Comprehensive R Archive Network(Jaringan Arsip R yang Komprehensif)
 Edisi Terbit : July/Augu st 2012
 Pengarang Artikel: Wiley Peridical
 Kota Terbit : Austria
 Nomor ISSN :-

BAB II
RINGKASAN ISI ARTIKEL

2.1 Journal Utama

ABSTRAK
Super-Penambah adalah kelompok besar dari transkripsional yang dianggap memiliki
peran penting dalam mengarahkan ekspresi gen yang mengontrol identitas sel selama
pengembangan dan tumorigenesis. Pembangunan database super-penambah lebar genom sangat
dibutuhkan untuk lebih memahami regulasi ekspresi gen yang diarahkan oleh penambah-super
untuk proses biologi tertentu. Di sini, kami hadir database yang dapat diakses web yang
dirancang khusus, Super - Enhancer Archive (SEA, http://sea.edbc.org). SEA berfokus pada
pengintegrasian super-penambah dalam banyak spesies dan menjelaskan peran potensial mereka
dalam regulasi ekspresi gen identitas sel. Rilis SEA saat ini mencakup 83 996 penambah super
yang dikomputasi atau secara eksperimen diidentifikasi dalam 134 jenis sel / jaringan / penyakit,
termasuk manusia (75.439, tiga di antaranya diidentifikasi secara eksperimental), tikus (5879,
lima di antaranya merupakan pengalaman yang diidentifikasi secara mental), Drosophila
melanogaster (1774) dan Caenorhabditis elegans (904). Untuk memfasilitasi ekstraksi data, SEA
mendukung beberapa opsi pencarian, dalam spesies cluding, lokasi genom, nama gen, tipe sel /
jaringan dan nama super-penambah. Respons tersebut memberikan informasi genetis (epi)
terperinci, yang memasukkan spesifisitas jenis sel, gen terdekat, situs pengikatan faktor
transkripsi, situs target CRISPR / Cas9, konservasi evolusi, SNP, H3K27ac, Metilasi DNA,
ekspresi gen, dan data seq TF ChIP. Selain itu, alat analitis dan browser genom dikembangkan
untuk pengguna untuk mengeksplorasi peningkat super dan peran mereka dalam menentukan
identitas sel dan proses penyakit secara mendalam.
Introduction
Penambah super adalah wilayah genom yang merupakan kelompok besar dari enhancer
transkripsional (1). Istilah 'super-penambah' digunakan untuk pertama kalinya oleh Chen et al.
pada tahun 2004 (2). Enhancer super berbeda dari ukuran enhancer khas, kepadatan faktor
transkripsi dan konten, dan kemampuan untuk mengaktifkan transkripsi (3). Sebagai pengatur
gen kunci, super-penambah dirangkai dalam tipe sel khusus, yang terkait erat dengan pengikatan
berbagai faktor transkripsi dan pengayaan H3K27ac (4,5).
Super-penambah dianggap sebagai pengatur identitas sel, pluripotensi sel induk dan
bahkan patogenesis tumor (6-8). Mereka telah dilaporkan mendorong ekspresi gen spesifik tipe
sel yang menentukan identitas sel selama perkembangan dan penyakit (9,10), seperti yang
ditunjukkan oleh peningkat super sel punca folikel rambut yang mendorong ekspresi gen reporter
in vivo (11). Dalam penelitian lain, CRISPR / Cas9 Strategi pengeditan genom mengungkapkan
bahwa penambah super bertanggung jawab atas lebih dari 90% ekspresi Sox2 dalam sel induk
embrionik tikus (12). Super-penambah memainkan peran penting dalam perkembangan normal,
meskipun mereka secara sembarangan dapat meningkatkan ekspresi abnormal gen kunci dan
berkontribusi terhadap beberapa penyakit termasuk penyakit Alzheimer, diabetes mellitus tipe 1
dan kanker (13). Sebagai contoh, onkogen klasik MYC diatur oleh super-enhancer di sebagian
besar kanker (1,14-16), sedangkan super enhancer terkait dengan gen yang mengkode transkripsi
transkripsi faktor RUNX1, FOSL2 dan BHLHE40 sangat penting untuk transformasi
mesenchymal tumor otak (17). Beberapa penelitian telah mengidentifikasi terapi kanker baru
yang diarahkan pada komponen super-enhancer dalam berbagai jenis tumor (18). Sebagai
contoh, onkogen tumor termasuk MYC dapat secara selektif dihambat dengan mengacaukan
peningkat-super pada kanker (18,19), sementara penghambatan CDK7 menekan transkripsi
onkogenik terkait-penambah super (20-22). Penghapusan konstituen super-penambah
menggunakan pendekatan berbasis CRISPR / Cas9 dalam sel kanker kolorektal sebelumnya
mengurangi ekspresi gen yang terkait, menunjukkan bahwa terapi kanker menargetkan
komponen super-penambah mungkin sangat efektif dalam sel tumor (9). Saat ini, ada beberapa
metode untuk menemukan super-enhancer, termasuk metode komputasi berdasarkan faktor-
faktor seperti Med1 (19), BRD4 (10) dan H3K27ac (1), dan teknologi eksperimental seperti
ChIA-PET (8), CRISPR / Cas9 (9), RT-qPCR (23) dan sebagainya.
Dari ukuran yang lebih besar dari super-enhancer, itu sulit dan memakan waktu untuk
secara eksperimental mengidentifikasi super-enhancer baru dari berbagai jenis sel / jaringan /
penyakit (12). Diketahui bahwa H3K27ac dapat mengidentifikasi sebagian besar super-enhancer
yang dibentuk oleh faktor-faktor transkripsi utama dan telah diprofilkan dalam berbagai sampel
dari berbagai spesies (4). Dengan demikian, H3K27ac dapat digunakan sebagai tanda pengganti
super-enhancer dan diimpor ke dalam perangkat lunak ROSE yang dikembangkan oleh Loven et
al. (19) untuk mengidentifikasi super-penambah dalam berbagai sampel dari berbagai spesies.
Secara singkat, ini menjahit penambah konstituen bersama jika mereka berada dalam jarak
tertentu dan memberi peringkat peningkat dengan sinyal input-dikurangi H3K27ac. Kemudian
super-penambah dipisahkan dari enhancer tipikal dengan mengidentifikasi titik ambang sinyal ac
H3K27 versus peringkat enhancer (4). Sebagai contoh, H3K27ac digunakan untuk
mengidentifikasi super-enhancer dalam lima garis DL-BCL manusia dan sampel amandel normal
(3). Zhou et al. juga menggunakan sinyal H3K27ac untuk karakteristik super-enhancer virus
Epstein-Barr (5). Hasil ini menunjukkan bahwa H3K27ac adalah penanda kuat super-penambah
dalam berbagai jenis sel, jaringan dan penyakit normal. Baru-baru ini, pengembangan beberapa
proyek epigenom, seperti ENCODE (24), mod ENCODE (25) dan Human Epigenome Roadmap
(26), telah memberikan lanskap genom luas H3K27ac di banyak jenis sel / jaringan / penyakit.
Ini meningkatkan kemungkinan mengintegrasikan set data ini untuk secara sistematis
mengidentifikasi peta komprehensif super-peningkat dalam berbagai spesies. Oleh karena itu,
pengumpulan komprehensif dan semakin banyak prediksi kandidat super-enhancers akan
berguna untuk eksplorasi sistemik peran potensial mereka dalam penyakit manusia atau proses
biologi (14,27). Untuk tujuan ini, kami mengembangkan database yang dirancang khusus, Super-
Enhancer Archive (SEA, http://sea.edbc.org), yang berfokus pada pengintegrasian super-
enhancer yang teridentifikasi secara komputasi dan komputasi dan menjelaskan peran potensial
mereka dalam regulasi sel. ekspresi gen identitas dalam cara spesifik jenis sel. Baru-baru ini,
database lain untuk super-enhancer dbSUPER di http: //bioinfo.au.tsinghua. edu.cn/dbsuper/
diusulkan oleh Khan et al. (28) Dalam con Trast to SUPER, SEA (i) saat ini menyimpan super-
enhancer terintegrasi dari empat spesies, termasuk manusia, tikus, Drosophila melanogaster dan
Caenorhabditis elegans; (ii) menampilkan kekhususan tipe sel / jaringan / penyakit super-
enhancer dengan analisis komparatif, yang berguna untuk analisis fungsi pengaturan super-
enhancer; (aku aku aku) mengidentifikasi gen terkait super-enhancer berdasarkan lokasi genom
yang ditunjukkan dalam jaringan online yang fleksibel; (iv) mengidentifikasi situs target
CRISPR / Cas9 super-enhancer, yang berguna untuk analisis fungsional lanjut super-enhancers
untuk bahwa nukleasi Cas9 dapat diarahkan oleh RNA pendek untuk menginduksi pembelahan
yang tepat pada lokus genomik endogen dalam sel organisme; (v) melengkapi klasifikasi
publikasi yang berkaitan dengan super-enhancer sesuai dengan konten penelitian; (vi)
menawarkan alat analitik online untuk analisis pengayaan wilayah genomik dan satu lagi untuk
analisis spesifisitas jenis sel H3K27ac; dan (vii) mengembangkan browser genom dan
mendukung tampilan yang disesuaikan dan ramah pengguna pada skala genomik. Singkatnya,
sebagai sumber daya super-penambah yang komprehensif, SEA menyediakan platform yang
ramah untuk menyimpan, mencatat dan dengan mudah menganalisis penambah-super.

GAMBARAN UMUM DAN PENGOLAHAN DATA

Dalam studi ini, kami mengambil keuntungan dari set data H3K27ac publik yang tersedia
dan daftar super-penambah yang diterbitkan untuk membangun daftar komprehensif super-
penambah dalam jenis sel / jaringan / penyakit mutiple dari empat spesies (Gambar 1).
Pertama, kami memeriksa peningkat-super yang diidentifikasi oleh Hnisz et al. di 86 tipe
sel manusia / jaringan menggunakan program ROSE dan berdasarkan pada set data H3K27ac
ChIP-Seq (1). Kedua, untuk tipe sel / jaringan lain pada manusia dan spesies lain, kami
memperoleh set data mentah H3K27ac yang diprofilkan oleh ChIP-Seq dari database SRA (29).
Bowtie2 (versi 2.2.5) (30) digunakan untuk memetakan bacaan ChIP-Seq ke referensi genom
yang diunduh dari UCSC Genome Bioinformatics(31), termasuk manusia (hg19), tikus (mm9),
D.melanogaster (dm6) dan C. elegans (ce10). Untuk setiap sampel, ROSE digunakan untuk
mendapatkan potensi super-penambah. Dan itu dijalankan dengan jarak jahitan 12 500 bp, mis.
peningkat diizinkan untuk dijahit bersama di dalam 12 500 bp. Selain itu, kami mengumpulkan
delapan perangkat tambahan yang telah diidentifikasi dan dikonfirmasi oleh para metode imental
dalam makalah yang diterbitkan.
SYSTEM DESIGN AND IMPLEMENTATION (SISTEM DESAIN DAN IMPLEMENTASI )
Laut dibangun berdasarkan tiga komponen perangkat lunak utama: server web Apache Tomcat,
database relasional MySQL, dan layanan komputasi berbasis Java. Program pemrosesan di belakang
panggung ditulis dalam Java, yang tersedia berdasarkan permintaan. Layanan web dikembangkan
dengan menggunakan Apache Struts2, kerangka kerja aplikasi web Java, dan iBATIS, kerangka kerja
persistensi yang mengotomatiskan pemetaan antara database MySQL dan objek di Jawa, yang keduanya
membantu menjamin kinerja tinggi dan stabilitas layanan web. Antarmuka berbasis browser tadinya
dibangun dalam HTML / JSP dan AJAX. Toolkit Apache Batik SVG digunakan untuk membuat,
menghasilkan, dan memanipulasi SVG secara dinamis. IE 9.0+ dan Firefox dengan 1440 * 900 (atau lebih
tinggi) lebih disukai untuk mencapai efek tampilan terbaik. SEA tersedia di http://sea.edbc.org.

PENGEMBANGAN MASA DEPAN

Untuk membangun basis data penambah super yang berfokus pada spesies, upaya
lanjutan akan dilakukan untuk memperbarui LAUT data dan meningkatkan fungsionalitas SEA-
browser dan basis data. Di tahun-tahun berikutnya, informasi super-penambah selebar genom
akan menjadi lebih cepat terakumulasi untuk banyak jenis sel / jaringan / penyakit pada lebih
banyak spesies, kami akan terus mengumpulkan set data terbaru untuk menjaga agar SEA tetap
terbaru. Saat ini, hampir semua super-enhancer di Asia Tenggara diprediksi dengan metode
komputasi berdasarkan H3K27ac. Super-peningkat yang diidentifikasi atau dikonfirmasi oleh
eksperimen adalah direkam ke dalam SEA. Dan lebih banyak informasi genetik dan epigenetik
terkait dengan super-penambah akan ditambahkan ke dalam basis data ini untuk studi lebih
lanjut. Kami berharap bahwa upaya berkelanjutan untuk mengembangkan dan meningkatkan
KLHS akan berkontribusi pada pemahaman kami tentang peningkat-super dan peran mereka
dalam menentukan identitas dan penyakit sel.
DATA PELENGKAP
Data Tambahan tersedia di NAR Online.
2.2 Jornal Pembanding
JaringanArsip R yang Komprehensif
a. Pendahuluan
Jaringan Arsip R Komprehensif (CRAN, http://CRAN.R-project.org) adalah 'kumpulan situs
yang membawa materi identik, yang terdiri dari distribusi R, ekstensi yang disumbangkan,
dokumentasi untuk R, dan binari '.1 Master CRAN berada di Wirtschaftsuniversit¨at Wien; saat
ini, ada 85 cermin 'harian' resmi, dengan mungkin lebih banyak cermin tidak resmi. CRAN
didirikan pada tahun 1997 oleh saya dan Fritz Leisch, dengan nama dan ruang lingkup yang
mengikuti semangat Jaringan Arsip TEX yang Komprehensif (CTAN, http://www.ctan.org/)
'untuk bahan yang terkait dengan sistem penyusunan huruf TEX' dan Jaringan Arsip Perl yang
Komprehensif (CPAN, http://www.cpan.org/),the'canonicallocationforPerl kode dan modul '.
Arsip-arsip ini menyediakan banyak materi dari satu tempat di lokasi yang berbeda (mirror),
dengan gagasan bahwa untuk mengurangi pengguna jaringan mengakses mirror yang terdekat
dengan mereka dalam hal kedekatan jaringan. Sifat terdistribusi dari pendistribusian materi
menyiratkan bahwa ia biasanya tidak mungkin untuk menentukan bagaimana file yang diunduh
dari (salah satu cermin) arsip.

b. SumberdanBinari
Versi R saat ini adalah 2.15.0 Rilis sistem basis R mengikuti skema versi x.y.z
major.minor.patchlevel. Rilis besar (x.0.0) dibuat untuk menunjukkan tonggak utama dalam
pengembangan. Fitur-fitur baru biasanya ditambahkan dalam rilis minor (x.y.0). Kapan saja,
selain versi rilis saat ini ada snapshot dari batang kode sumber R ('versi pengembangan R', 'r-
devel') dan cabang yang bekerja menuju tambalan berikutnya (xyz withz > 0) rilis ('r-ditambal').
Ketika mempersiapkan rilis newminor (ormajor), ada snapshots rilis umum. Semua varian
sumber data tersedia dari halaman web CRAN 'R Sumber'. (Secara teknis, sumber untuk versi
rilis saat ini dari R [danversi prerelease] didistribusikan secara fisik melalui CRAN [di
subdirektori src / base dan src / base-prerelease], sedangkan sumber untuk versi patched dan
devel tersedia secara fisik dari ftp: // ftp.stat.math.ethz.ch / Software / R, dan tidak
didistribusikan melalui CRAN.) RisbeingdevelopedfortheUnix-like, Windows dan Mac keluarga
sistem operasi, dengan sistem basis R sebagian besar diimplementasikan dalam C, Fortran dan R
itu sendiri. Untuk membangun R dari sumbernya, diperlukan perangkat pengembangan
termasukaCandFortrancompiler dan utilitas umum. Pada platform Windows dan Mac OS X,
pengguna R tidak serta-merta memiliki alat-alat ini tersedia, dan dimungkinkan untuk
menyediakan binari yang tidak bersatu. Dengan demikian, untuk platform ini, binari dari semua
varian sumber R saat ini tersedia melalui halaman CRAN ‘R Binaries’. Untuk platform seperti
Unix, alat yang diperlukan untuk membuat R biasanya tersedia dengan mudah, dan ada banyak
variasi dalam jumlah kombinasi CPU dan sistem operasi yang mungkin serta dalam format
kemasan. Selain itu, sebagian besar distribusi Linux menyediakan paket untuk sistem R dasar.
Kombinasi dari fakta-fakta ini menyiratkan bahwa saat ini, CRAN pada dasarnya tidak
menyediakan binari untuk sistem mirip Unix, dengan pengecualian yang disebut 'backports' dari
versi rilis saat ini dari R ke current dan mungkin juga rilis sebelumnya dari Debian dan Ubuntu.
(Karena distribusi ini tidak dapat melacak rilis baru R dalam versi yang sudah dirilis, backport
memungkinkan R tetap diperbarui menggunakan fasilitas manajemen paket sistem.)

c. Repositori paket CRAN adalah repositori paket terkemuka untuk R. Ini berbeda dari
repositori 'standar' lainnya (dalam arti dikenal dengan sistem manajemen paket R secara default):
repositori perangkat lunak, anotasi, dan data eksperimen Biokonduktor project3, http:
//www.bioconductor. org untuk analisis dan pemahaman data genom highthroughput dan
repositori Proyek Omega untuk Komputasi Statistik (http: // www.omegahat.org/) dan dua
platform pengembangan kolaboratif R-forge, R-Forge4, http: // R -Menempa. R-project.org/ dan
RForge (http://www.rforge.net/) dalam skala dan cakupan serta prinsip desain dan
pengoperasian. Mekanisme dasarnya adalah sebagai berikut. Ketika sebuah paket sumber
dikirimkan keCRAN, ia diputuskan oleh penjaga gerbang (pada dasarnya dengan menjalankan
versi ketatkecakapan5). Jika tidak ada yangdisingkirkan, paket tersebut diterbitkan pada CRAN
dengan memasukkannya ke dalam area paket utama yang berisi semua paketpaket yang saat ini
aktif, danmemutakhirkansepertiyangdisetorataupadatadata dengan baik. Versi sebelumnya
diarsipkan (dipindahkan ke area arsip paket), tetapi tidak dihapus dan karenanya masih tersedia
untuk diunduh. Jika memungkinkan, binari dibangun untuk platform Mac OS X dan Windows,
biasanya untuk seri R. saat ini, sebelumnya dan yang akan datang. Selain itu, pada setidaknya
satu platform, dependensi kebalikan dari paket yang dipublikasikan (yaitu, paket yang
bergantung pada paket untuk instalasi dan / atau memuat, atau untuk memeriksa) diperiksa ulang
untuk menilai dampak langsung dari publikasi pada repositori. Akhirnya, pemeriksaan penuh
dari repositori (dengan menginstal dan memeriksa semua paket) dilakukan secara teratur untuk
beberapa kombinasi versi R dan platform perangkat keras, yang juga menilai dampak perubahan
dalam lingkungan R dan sistem (dan 'dependensi' lainnya. ) pada repositori. Masalah yang
ditemukan (kesalahan atau peringatan yang dilaporkan oleh utilitas pemeriksaan) dilaporkan oleh
pengelola repositori CRAN ke pengelola paket yang terkena dampak yang diminta untuk
mengatasi masalah pada waktunya (yang membutuhkan tindakan bersama untuk masalah yang
dihasilkan langsung dari pembaruan paket). Jika diperlukan, pendingissuesardiatasi oleh
pengelola repositori CRAN, secara opsional dengan menyediakan NMU (pembaruan bukan
pengurus), tetapi biasanya dengan mengarsipkan paket yang terpengaruh. Khususnya, arsip
semacam itu dapat dihasilkan dari pengelola paket yang gagal mengakomodasi paket mereka
hingga perubahan dalam sistem basis R.

d. Repository paketcran
Repositori paket CRAN adalah repositori paket terkemuka untuk R. Ini berbeda dari repositori
'standar' lainnya (dalam arti dikenal dengan sistem manajemen paket R secara default): repositori
perangkat lunak, anotasi, dan data eksperimen Biokonduktor project3, http: //www.bioconductor.
org untuk analisis dan pemahaman data genom highthroughput dan repositori Proyek Omega
untuk Komputasi Statistik (http: // www.omegahat.org/) dan dua platform pengembangan
kolaboratif R-forge, R-Forge4, http: // R -Menempa. R-project.org/ dan RForge
(http://www.rforge.net/) dalam skala dan cakupan serta prinsip desain dan pengoperasian.
Mekanisme dasarnya adalah sebagai berikut. Ketika sebuah paket sumber dikirimkan keCRAN,
ia diputuskan oleh penjaga gerbang (pada dasarnya dengan menjalankan versi ketatkecakapan5).
Jika tidak ada yangdisingkirkan, paket tersebut diterbitkan pada CRAN dengan memasukkannya
ke dalam area paket utama yang berisi semua paketpaket yang saat ini aktif,
danmemutakhirkansepertiyangdisetorataupadatadata dengan baik. Versi sebelumnya diarsipkan
(dipindahkan ke area arsip paket), tetapi tidak dihapus dan karenanya masih tersedia untuk
diunduh. Jika memungkinkan, binari dibangun untuk platform Mac OS X dan Windows,
biasanya untuk seri R. saat ini, sebelumnya dan yang akan datang. Selain itu, pada setidaknya
satu platform, dependensi kebalikan dari paket yang dipublikasikan (yaitu, paket yang
bergantung pada paket untuk instalasi dan / atau memuat, atau untuk memeriksa) diperiksa ulang
untuk menilai dampak langsung dari publikasi pada repositori. Akhirnya, pemeriksaan penuh
dari repositori (dengan menginstal dan memeriksa semua paket) dilakukan secara teratur untuk
beberapa kombinasi versi R dan platform perangkat keras, yang juga menilai dampak perubahan
dalam lingkungan R dan sistem (dan 'dependensi' lainnya. ) pada repositori. Masalah yang
ditemukan (kesalahan atau peringatan yang dilaporkan oleh utilitas pemeriksaan) dilaporkan oleh
pengelola repositori CRAN ke pengelola paket yang terkena dampak yang diminta untuk
mengatasi masalah pada waktunya (yang membutuhkan tindakan bersama untuk masalah yang
dihasilkan langsung dari pembaruan paket). Jika diperlukan, pendingissuesardiatasi oleh
pengelola repositori CRAN, secara opsional dengan menyediakan NMU (pembaruan bukan
pengurus), tetapi biasanya dengan mengarsipkan paket yang terpengaruh. Khususnya, arsip
semacam itu dapat dihasilkan dari pengelola paket yang gagal mengakomodasi paket mereka
hingga perubahan dalam sistem basis R.
2.3 Kelebihan dan Kekurangan
Kelebihan :
Journal Utama:
Proses penemuan dan penyajian dapat dilakukan dengan cepat dan lengkap. Lengkap berarti
segala sesuatu yang diperlukan dapat diperoleh tanpa ada yang tetrlewatkan.

Journal pembanding
Penjelasan yang mudah dipahami oleh pembaca, Bahasa yang digunakan mudah dimengerti, dan
terdapatnya daftar pustaka dan bagian-bagian yang mempermudah memahami isi journal
tersebut.

Kekurangan :
Journal Utama
Pada Jurnal kedua ini, terlalu banyak kata-kata dan penjelasan yang terlalu panjang
sehingga pembaca sulit mengambil intisari dari jurnal

Journal Pembanding
- Kemungkinan adanya manipulasi atau perubahan informasi.
- Terbatas nya dayatahan media fisik penyimpanan arsip.
- Biayapengadaan system relative mahal.
 BAB III
PENUTUP

3.1 Kesimpulan

Hal- hal yang bersifat spesifik

dalam pengelolaan arsip simpan, baik fisik, seperti aturan-aturan
yang harus terpenuhi dalam membangun gedung/ruang arsip simpan maupun nonfisik seperti
jadwal retensi arsip
simpan dan lain- lainnya akan disusun dalam buku tersendiri.

3.2 Saran

Mengenai kekurangan pada setiap jurnal agar lebih di teliti lagi dan diamati lagi agar
mencapai hasil yang maksimal dan lebih baik lagi untuk karya selanjutnya. Dan di
harapkan agar penulis jurnal untuk mempertahankan kelebihan-kelebihan pada jurnalnya.

Daftar Pustaka
Wiley Peridical. The Comprehensive R Archive Network.2012. AUSTRIA
Yanjun Wei1,†, Shumei Zhang, dkk. SEA: a Super-Enhancer Archive. November 2015.China