Mikrobiologi Dasar

MIKROBIOLOGI
DASAR
PP.PERDALIN
www.perdalin.com | 2020
Pokok Bahasan
} Karakteristik dan Morfologi Bakteri

} Mekanisme Resistensi
} Multi-drugs resistant organisms
MIKROBA/MIKROORGANISME
VIRUS
Perbedaan Struktur Bakteri dan Virus

Prokariot dan Eukariot
Prokariot
DNA menyatu dalam sitoplasma: Bakteri:
Eukariot
Algae, protozoa, fungi, slime mold
Ukuran lebih besar
Terdapat mitokondria, inti sel
Morfologi Sel Bakteri
} Bentuk: Bacteria
} Batang
} Kokus
} Spiral
} Filamen G+ G- Acid Wall Intra
fast less cellular
} Populasi sel bakteri
Rod Cocci Rod Cocci Spiral
} Individual
} Diplo-
} Staphylo-
} Strepto-
} Filamen
Klasifikasi berdasar Struktur Dinding Bakteri
Pewarnaan Gram (Hans Christian Gram)
Pewarnaan Gram: Manfaat
} Pada spesimen
} Menilai kualitas spesimen, kecurigaan infeksi (lekosit)
} Membantu menentukan pilihan antibiotik empirik
(bila morfologi sel khas, mis. diplokokus)
} Tidak digunakan untuk semua spesimen (feses, usap
tenggorok) karena interpretasi sulit
} Pada isolat
} Kemurnian isolat
} Identifikasi untuk menentukan uji lanjutan
Klasifikasi Berdasarkan Kebutuhan O2
} Aerob obligat: O2 - 21%
} Anaerob obligat: O2 - 0-3%
} Anaerob fakultatif: ada O2 atau tidak
} Mikroaerofilik: O2 – 5-10%
Kurva Pertumbuhan Bakteri
} Tergantung nutrisi di lingkungan
} E.coli: waktu pembelahan sel 20-30

menit di dalam medium yang kaya
nutrisi
} M.tuberculosis : 16-24 jam
Analitik tanpa Otomatisasi
Hari 1
Hari 2/3
Inokulasi spesimen untuk Koloni dimurnikan
kultur bakteri aerob
Hari 4/5
Hari 3/4
Hasil identifikasi
Koloni murni diidentifikasi
Uji kepekaan antibiotik
Hari 5/6
Baca hasil dan Pelaporan
Analitik dengan Otomatisasi
Hari 2
Hari 1 1 koloni terpisah (dianggap
murni):
Inokulasi spesimen untuk
kultur bakteri aerob Uji identifikasi
Kultur Bakteri Aerob yang non- Hari 3

fastidious Pelaporan Hasil identifikasi
1st step: 2nd step:
Inoculum Inoculation, incubation,
preparation reading and interpretation
incubation
Steps done by the instrument and software:

§ MIC determination
§ Categorisation S - I - R
§ Interpretation of phenotypes by AES expert
Factors to consider When Determining Whether
Testing is Warranted
} The body site from which the organism was

isolated
} The presence of other bacteria and the quality

of the specimen from which the organism was
grown
} The host s status
Flora Normal
Contamination, Colonisation, Infection
Patel S.,Understanding Wound Infection and Colonisation, Wound Essentials, Vol.2;2007
Bakteri adalah prokariotik:
} lebih sederhana daripada
eukariotik
} Berkembang biak sangat Penanganan spesimen:
cepat
} Pengambilan
} kemampuan adaptasi pada
} Transportasi
pengaruh antibiotik atau
respon imun } Penyimpanan
sangat mempengaruhi
interpretasi hasil
Pre-analytical specimen management

in microbiology is CRITICAL TO ACCURACY
IDSA Guidelines. Clin. Inf. Diseases Advance Access published July 10, 2013
Pre-analitik
• Apakah penyakit pasien saya akibat infeksi mikroba? Jika YA, apa?
• Bagaimana kepekaan mikroba (bakteri) tersebut terhadap antimikroba (antibiotik),
Klinisi sehingga terapi yang dipilih tepat target?
Perawat
• Pengambilan dan Penyimpanan Spesimen
Kurir
• Transportasi Spesimen
Lab
• Penerimaan/Penolakan Spesimen
IDSA Guidelines. Clin. Inf. Diseases Advance Access published July 10, 2013
Hasil Pemeriksaan Mikrobiologi à
Tatalaksana Pasien dengan Infeksi
} Terapi antibiotik empirik berdasarkan antibiogram lokal
} Terapi antibiotik definit berdasarkan hasil identifikasi

mikroba dan uji kepekaan antimikroba
} Keterlambatan hasil à meningkatkan kemungkinan pasien

mendapat pilihan terapi empirik yang kurang tepat
Pemeriksaan Selain Kultur
} Molekular deteksi DNA atau RNA dengan Metode PCR

} Bakteri yang tidak tumbuh in vitro
} Bakteri yang tumbuh lama atau sulit tumbuh
} Virus
} Jamur
} Serologi untuk deteksi Antigen dan/atau Antibodi èakut

dan konvalesens
Struktur Bakteri – Kerja Antibiotik
Mekanisme Resistensi
} Bakteri menghasilkan enzim yang dapat menghancurkan
antibiotik sebelum terikat
} Pompa efluks: bakteri mengeluarkan molekul antibiotik yang

masuk ke sitoplasma sebelum terikat pada target
} Mengubah protein target tempat antibiotik terikat dan

bekerja
} Mengubah outer membrane protein channel yang

diperlukan antibiotik untuk masuk ke sel
Tenover, FC. The American Journal of Medicine
www.perdalin.com | 2020 (2006) Vol 119 (6A), S3–S10
Emergence of
Resistance
natural selection of result of induction of genetic

bacterial subpopulations determinants already present (or
acquired) in the bacterial population
that are activated
Araos, R., et al. Antimicrobial Resistance: Selection vs. Induction. In: Antimicrobial Stewardship: Principles and
Practice. CAB International. 2017.
Selection vs. Induction Paradigm
Araos, R., et al. Antimicrobial Resistance: Selection vs. Induction. In: Antimicrobial Stewardship: Principles and
Practice. CAB International. 2017.
Induction of Antimicrobial Resistance
} Most common examples: regulation of β-lactamase

expression in bacteria
} Production of β-lactamase in S.aureus: mediated by blaZ
gene.
} Absence of β-lactams, the expression of the β-lactamase is
almost undetectable
} Presence of β-lactams à increase the production of β-
lactamase enzymes and fully express the penicillin resistance
phenotype
Araos, R., et al. Antimicrobial Resistance: Selection vs. Induction. In: Antimicrobial Stewardship: Principles
and Practice. CAB International. 2017.
Bagaimana Bakteri menjadi Resisten?
} Intrinsik: sifat resisten didapat secara alami, merupakan sifat biologi

mikroba
} Didapat:
} Bacteria yang bersifat sensitif terhadap suatu antibiotik kemudian menjadi
resisten
} Terjadi akibat mutasi atau mendapatkan materi genetik baru
} Mutasi kromosomal dan seleksi: vertical evolution
} Mendapatkan materi genetik baru dari bakteri lain yang resisten: horizontal evolution
Tenover, FC. The American Journal of Medicine (2006) Vol 119 (6A), S3–S10
Hawkey, P. M BMJ 1998;317:657-660 www.perdalin.com | 2020
Bagaimana Sifat Resistensi Dipindahkan?
} Mendapatkan gen pengkode sifat resistensi dari sel bakteri
lain Horizontal Gene Transfer
Selective Pressure/Selection
Saling hidup
keseimbangan ekosistem
Selective Pressure
ANTIBIOTIK
Selective Pressure
ANTIBIOTIK
Selective Pressure
ANTIBIOTIK
Selective Pressure
kecuali Polymixin
Tigecyclin
Sumardi, 2016
MDRO penting : ESKAPE
Enterococcus faecium (Vancomycin-resistant enterococci:VRE)

Staphylococcus aureus (Methicillin-resistant S. aureus: MRSA)
Klebsiella pneumoniae
Acinetobacter baumanii
Pseudomonas aeruginosa
Enterobacteriaceae (Carbapenemase-resistan Enterobacteriaceae
CRKP/CRE)
Patogen Bacterial
Super Bug
VRE
ESBL producer
Enterococcus K pneumoniae P aeruginosa Carbamase producer KP
faecium
Bad Bug
Carbapenem resisten
A baumanii
MDR P aeruginosa
S aureus A baumannii Enterobacter
spp.
MRSA
MDROs
§ Gram positive organisms
• MRSA (Methicillin Resistant Staphylococcus aureus)
• VRE (Vancomycin Resistant Enterococcus)
§ Gram negative organisms

• ESBLs (extended Spectrum Beta Lactamase)
• CRE (Carbapenem Resistant Enterobacteriaceae)
• Pan Resistant Pseudomonas
• Pan resistant Acinetobacter
CDC: Management of Multidrug-Resistant Organisms in Healthcare Settings, Healthcare Infection Control

Advisory Committee, Jane D. Siegel et. al. pg 7-12
Staphylococcus aureus pada Manusia
} Flora normal
Kulit dan mukosa: anterior nares, oropharynx, axilla, umbilicus,
inguinal area, perirectal areas
} Patogen
Menyebabkan penyakit infeksi dengan klinis yang beragam dari
ringan à mengancam jiwa ( sepsis, deep abscesses,
pneumonia, osteomyelitis, infective endocarditis)
S.aureus àNasal Carriage
} Persistent carriers, intermittent carriers, non-carriers
} Berperan penting dalam epidemiologi penyakit
} 1931terbukti hubungan antara S.aureus pada karier

(hidung) dan penyebab infeksi (Solberg, 1965)
} HAIs kebanyakan bersumber endogen
Sumber Infeksi MRSA di Rumah Sakit
} Pasien yang terkolonisasi atau terinfeksi
} Tenaga kesehatan yang terkolonisasi atau terinfeksi
} Lingkungan yang terkontaminasi (permukaan)

Computer, floor next to patient s bed, bed linens, patient gowns,
over-bed tables, blood pressure cuffs, bedside rails, infusion
pump buttons, door handles, stethoscope, etc.
BUNDLES MRSA
1.Screening dan surveilans
Pada pasien yang akan dilakukan tindakan operasi rujukan dari RS lain,pasien dengan riwayat
rawat dengan MRSA, pasien imunokompromais dengan focus infeksi curiga SA,sebelumnya perlu
screening MRSA
2.Decolonization
Kasus MRSA ditemukan pada Nares,dapat dilakukan decolonisasi dengan memberi Mupirocin
selama 5 hari.Bila di Inguinal,Ketiak dapat mandi dengan sabun Chlorhexidin 2-4 %
3.Kewaspadaan transmisi kontak
Petugas ditetapkan agar tidak berganti ganti menghindari kontak pd banyak petugas
APD: gaun ,sarung tangan dan masker bila ada infeksi saluran napas. Gaun petugas dilepas
sebelum meninggalkan ruangan pasien, Hand hygiene sesuai 5 moment
Dekontaminasi terminal saat pasien pulang dapat dipakai Klorin 0.5% selama 10 menit biarkan
kemudian dibilas dengan air bagian permukaan sekitar pasien radius 1.8m dan benda mati yang
sering dipegang. JUga dapat dipakai H2O2 vapour/dry mist 5 -6%
4.Profilaxis antibiotic
Vancomycin ;Ceftaroline 2 – 3x 600mg
ESBL (Extended Spectrum Beta-lactamase)
} Enzim Betalactamase yang dihasilkan oleh bakteri

terutama golongan Enterobacteriaceae yang
menyebabkan terjadinya resistensi antibiotik TERUTAMA
cephalosporin generasi ke-3 (Ceftriaxone, Ceftazidim,
Cefotaxim, dll) dan aztreonam
Kepentingan Klinis MDRO
} Manifestasi klinis sama dengan infeksi akibat bakteri

yang sensitif
} Pilihan antibiotik untuk terapi sangat terbatas
} Pasien dengan infeksi akibat MDRO dirawat di RS lebih

lama à biaya meningkat
} Mortalitas yang meningkat
Faktor Risiko Infeksi MDRO
} Penggunaan antibiotik sebelumnya

} Perawatan di RS yang lama
} Penggunaan alat invasif (infus, kateter)
àKemungkinan pembentukan biofilm
} LOS lama di tempat perawatan diluar RS
} Praktik pengendalian infeksi yang tidak adekuat
à Penggunaan antibiotik dalam waktu yang lama
Simpulan
} Mikroba: bakteri, virus, jamur, parasit, amuba, cacing
} Pemeriksaan mikrobiologi:
} Isolasi memerlukan waktu, suasana dan kondisi yang beragam
} Identifikasi dengan metode bermacam-macam
} Uji kepekaan
} Kualitas hasil tergantung fase pre-analitik, analitik, pasca-

analitik
} MDRO meningkat di Indonesia dan Dunia


Mikrobiologi Dasar

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Deskripsi Asli:

Judul Asli

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

Mikrobiologi Dasar

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

MIKROBIOLOGI

} Karakteristik dan Morfologi Bakteri

Perbedaan Struktur Bakteri dan Virus

} Tergantung nutrisi di lingkungan

} E.coli: waktu pembelahan sel 20-30

} M.tuberculosis : 16-24 jam

Kultur Bakteri Aerob yang non- Hari 3

Steps done by the instrument and software:

} The body site from which the organism was

} The presence of other bacteria and the quality

} The host s status

Pre-analytical specimen management

} Terapi antibiotik empirik berdasarkan antibiogram lokal

} Terapi antibiotik definit berdasarkan hasil identifikasi

} Keterlambatan hasil à meningkatkan kemungkinan pasien

} Molekular deteksi DNA atau RNA dengan Metode PCR

} Serologi untuk deteksi Antigen dan/atau Antibodi èakut

} Pompa efluks: bakteri mengeluarkan molekul antibiotik yang

} Mengubah protein target tempat antibiotik terikat dan

} Mengubah outer membrane protein channel yang

natural selection of result of induction of genetic

} Most common examples: regulation of β-lactamase

} Intrinsik: sifat resisten didapat secara alami, merupakan sifat biologi

Enterococcus faecium (Vancomycin-resistant enterococci:VRE)

§ Gram negative organisms

CDC: Management of Multidrug-Resistant Organisms in Healthcare Settings, Healthcare Infection Control

} Persistent carriers, intermittent carriers, non-carriers

} Berperan penting dalam epidemiologi penyakit

} 1931terbukti hubungan antara S.aureus pada karier

} HAIs kebanyakan bersumber endogen

} Tenaga kesehatan yang terkolonisasi atau terinfeksi

} Lingkungan yang terkontaminasi (permukaan)

1.Screening dan surveilans

3.Kewaspadaan transmisi kontak

} Enzim Betalactamase yang dihasilkan oleh bakteri

} Manifestasi klinis sama dengan infeksi akibat bakteri

} Pilihan antibiotik untuk terapi sangat terbatas

} Pasien dengan infeksi akibat MDRO dirawat di RS lebih

} Mortalitas yang meningkat

} Penggunaan antibiotik sebelumnya

} Kualitas hasil tergantung fase pre-analitik, analitik, pasca-

} MDRO meningkat di Indonesia dan Dunia

Anda mungkin juga menyukai