Genetika dalam Autism Spectrum Disorder

Alifia Rahmawati
Jurusan Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi UIN Sunan Gunung Djati, Bandung
40614
e-mail: alifiarahah@gmail.com

Abstrak : Autism spectrum disorder (ASD) adalah gangguan seumur hidup yang dimulai
pada masa anak-anak yang berdampak pada perkembangan sosio-komunikasi dan juga
ditandai oleh kesulitan dalam, bergerak dan mempunyai pola perilaku ritualistik / berulang.
Pada saat ini belum ada penelitian yang dapat secara spesifik dapat merinci struktur genetik
yang dapat menyebabkan ASD. Dalam perkembangannya penelitian genetik pada autism
spectrum disorder (ASD) telah ada beberapa studi yang telah populer, yaitu studi kembar
dan keluarga, variasi genetik de novo dan juga variasi genetik umum.
Kata kunci: Autism spectrum disorder (ASD), genetik, studi kembar

PENDAHULUAN
Autism spectrum disorder (ASD) adalah gangguan seumur hidup yang dimulai
pada masa anak-anak yang berdampak pada perkembangan sosio-komunikasi dan
juga ditandai oleh kesulitan dalam, bergerak dan mempunyai pola perilaku ritualistik /
berulang. Hal ini terjadi pada 1％ jiwa dari populasi yang ada, dengan di dominasi
laki-laki 4 banding 1 perempuan (Anagnostou et al, 2014). Pada kasus-kasus yang ada
sekitar 50 ％ kasus mempuyai hubungan dengan kecacatan intelektual, dan
komorbiditas dengan gangguan perkembangan saraf dan kejiwaan sering terjadi
(Anagnostou E et al, 2014). Dalam beberapa kasus, ASD yang merupakan bagian dari
sindrom biasanya berkaitan dengan kelainan gen tunggal yang telah diketahui (Devlin
B et al, 2012). ASD dapat terjadi secara sporadis, tetapi seringkali bersifat keturunan,
dengan resiko terjadi lagi pada saudara kandung sekitar 10 hingga 20 kali lipat
( Sandin S et al, 2014)
Penyebab autisme sebagian besar masih belum diketahui, tetapi penelitian
kembar terus-menerus menunjukkan adanya peran genetik yang tinggi terhadap ASD.
Studi genetik molekuler telah mengidentifikasi lebih dari 100 gen beresiko pada ASD
yang membawa mutasi yang langka yang merusak juga penetran pada sekitar 10-25%
pasien (Huguet et al, 2013). Dalam perkembangannya penelitian genetik pada autism
spectrum disorder (ASD) telah ada beberapa studi yang telah populer, yaitu studi
kembar dan keluarga, variasi genetik de novo dan juga variasi genetik umum.

METODE
Metode yang digunakan dalam penyusunan artikel ini adalah studi literatur, dengan
mengumpulkan literatur dari berbagai sumber seperti buku, jurnal dan artikel yang
relevan dengan permasalahan yang dikaji.

HASIL DAN PEMBAHASAN

Studi pada Anak Kembar dan Keluarga di ASD
Berdasarkan lebih dari 13 studi pada anak kembar, yang diterbitkan antara 1977
dan 2015, para peneliti memperkirakan peran genetik dan lingkungan terhadap ASD.
Pada tahun 1977, studi kembar pertama autisme oleh Folstein dan Rutter melaporkan
11 kelompok kembar monozigotik (MZ) dan 10 kelompok kembar dizygotik (DZ).
Studi ini menunjukkan bahwa kembar MZ sebanyak 36% (4/11) lebih sesuai untuk
autisme, dibandingkan dengan 0% (0/10) untuk kembar DZ. Ketika fenotipe autisme
yang lebih luas digunakan, kecocokan meningkat menjadi 92% untuk kembar MZ dan
10% untuk kembar DZ. Sejak penelitian skala kecil pertama ini, penelitian kembar
terus-menerus melaporkan kesesuaian yang lebih tinggi untuk ASD dalam kembar
MZ dibandingkan dengan kembar DZ. Antara 2005 dan 2009, tiga penelitian kembar
dengan kelompok kembar yang relatif besar (hingga lebih dari 3000 pasangan kembar)
telah melaporkan kecocokan tinggi untuk ASD pada kembar MZ (77-95%)
dibandingkan dengan kembar DZ (31%). Menariknya, proporsi yang signifikan dari
kontribusi genetik untuk ASD dibagi dengan gangguan perkembangan saraf lainnya
seperti ADHD (> 50%) dan ketidakmampuan belajar (> 40%) ( Ronald et al, 2011) .
Singkatnya, ketika semua studi kembar diperhitungkan, kesesuaian untuk ASD
kira-kira 45% untuk kembar MZ dan 16% untuk kembar DZ.(Thomas B, 2016)
Studi keluarga juga mengungkapkan bahwa kesempatan utnuk memiliki anak
dengan ASD meningkat dengan proporsi genom yang dimiliki individu dengan satu
yang terkena ( Sandin S et al, 2014), resiko relatif untuk ASD (dibandingkan dengan
populasi umum) diperkirakan sebesar 153,0 (95% confidence interval (CI):
56.7–412.8) untuk kembar MZ , 8.2 (3.7–18.1) untuk kembar DZ , 10,3 (9,4-11,3)
untuk saudara kandung penuh, 3,3 (95% CI: 2,6–4,2) untuk saudara tiri dari ibu, 2,9
(95% CI: 2,2–3,7) untuk saudara tiri dari pihak ayah, dan 2,0 (95% CI: 1,8–2,2 )
untuk sepupu. Heritabilitas diperkirakan 50% (95% CI: 45-56), dan pengaruh
lingkungan yang tidak terbagi juga 50% (95% CI: 44-55). Anehnya, hanya komponen
genetik aditif dan lingkungan yang tampaknya bertanggung jawab atas resiko
pengembangan ASD ( Sandin S et al, 2014) . Singkatnya, studi epidemiologi telah
memberikan informasi penting tentang heritabilitas ASD. Namun, mereka tidak
memberi tahu kita tentang gen yang terlibat atau tentang jumlah dan frekuensi varian
mereka. (Thomas B, 2016)

Varian Genetik De Novo

Varian de novo yang muncul pada germline induk adalah penyebab yang
mendasari banyak kasus ASD. Peristiwa de novo pertama yang diamati di ASD
adalah copy number variants (CNV) yang besar. Menggunakan teknik sitogenetik,
penghapusan atau duplikasi besar, seperti duplikasi 15q , penghapusan 22q11.2,
penghapusan Xp22.3, dan duplikasi atau penghapusan 16p11.2, diidentifikasi sebagai
faktor resiko genetik untuk ASD (Gokul R, et al,2018). Dari perspektif ini, beberapa
CNV dapat bertindak sebagai faktor risiko genetik yang kompleks, dengan ukuran
efek menengah, penetrasi dan ekspresi variabel (Geschwind, D. H, 2011).
Whole-genome sequencing (WGS) mulai digunakan untuk mengidentifikasi
secara komprehensif semua varian de novo dalam kelompok ASD. Berbeda dengan
sekuensing exome, WGS dapat mengidentifikasi mutasi pada elemen regulasi
non-koding serta mutasi koding. Meskipun saat ini dituntut untuk memberikan
dampak fungsional dari mutasi nonkodin, informasi seperti konservasi evolusioner,
genomik fungsional, status kromatin, motif sekuens, dan lokus sifat kuantitatif
molekuler saat ini sedang diintegrasikan untuk memfasilitasi anotasi daerah genom
non-kode ( Ward dan Kellis, 2012 ).

Variasi umum dalam ASD

Dalam populasi umum, satu individu membawa rata-rata 3 juta varian genetik
dibandingkan dengan urutan referensi human genome. Sebagian besar varian (> 95%)
adalah apa yang disebut dengan varian umum yang dimiliki oleh lebih dari 5%
populasi manusia. Dengan menggunakan genetika kuantitatif, diperkirakan bahwa
varian umum berkontribusi pada proporsi yang tinggi dari kecenderungan ASD : 40%
keluarga insimplex dan 60% pada keluarga multipleks. Pada tahun 2014, studi tentang
Gaugler dkk. memberikan perkiraan heritabilitas (52,4%), yang hampir secara
eksklusif disebabkan oleh variasi yang umum, hanya menyisakan 2,6% dari
kewajiban untuk varian langka (T. Gaugler et al, 2014)
Kontribusi varian umum untuk ASD telah dipercaya, terutama menggunakan
studi asosiasi genom (GWAS). GWAS menggunakan genotipe keluaran tinggi dari
varian umum, yang di definisikan sebagai polimorfisme genetik, hadir di setidaknya
5% populasi. Untuk deteksi yang kuat dari alel risiko ASD umum, studi GWAS di
masa mendatang akan membutuhkan ukuran sampel yang jauh lebih besar untuk
mendapatkan daya yang memadai (Gokul R, et al,2018).

KESIMPULAN
Pada saat ini asih belum ada penelitian yang dapat secara spesifik mengenai struktur
genetik pada ASD. Meskipun demikian dalam beberapa dekade terakhir telah lahir
penelitian-penelitian yang menghasilkan pengetahuan yang lebih baik mengenai
struktur genetik ini. Diantaranya adalah studi kembar dan keluarga, variasi genetik de
novo dan juga variasi genetik umum.

Daftar Pustaka
Anagnostou E, Zwaigenbaum L, Szatmari P, et al.(2014). Autism spectrum disorder:
advances in evidence-based practice. CMAJ ; 186: 509–19.
Bourgeron, T. (2016). Les connaissances actuelles sur la génétique de l’autisme et
propositions pour la recherche future. Comptes Rendus - Biologies, 339(7–8),
300–307. https://doi.org/10.1016/j.crvi.2016.05.004
Devlin B, Scherer SW.(2012). Genetic architecture in autism spectrum disorder. Curr
Opin Genet Dev ; 22: 229–37.
G. Huguet, E. Ey, T. Bourgeron. (2013). The genetic landscapes of autism spectrum
disorders, Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 14 191–213
Geschwind, D. H. (2011). Genetics of autism spectrum disorders. Trends in Cognitive
Sciences, 15(9), 409–416. https://doi.org/10.1016/j.tics.2011.07.003
Geschwind DH, State MW (2015). Gene hunting in autism spectrum disorder: on the
path to precision medicine. Lancet Neurol 14: 1109–1120.
Ronald, R.A. Hoekstra. (2011). Autism spectrum disorders and autistic traits: a
decade of new twin studies, Am. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet.
156B 255–274.
Sandin S, Lichtenstein P, Kuja-Halkola R, Larsson H, Hultman CM, Reichenberg A.
(2014). The familial risk of autism. JAMA ; 311: 1770–7.
T. Gaugler, L. Klei, S.J. Sanders, et al.(2014). Most genetic risk for autism resides
with common variation, Nat. Genet. 46 881–885.
Ward L.D, Kellis M (2012). Interpreting noncoding genetic variation in complex
traits and human disease. At Biotechnol 30: 1095-1106