LAPORAN PROJECT

“Trimeresurus albolabris”
MATA KULIAH CODING AND BIG DATA

Disusun oleh :
Muhammad Bayu Rifqi (1304619057)

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS NEGERI JAKARTA
TAHUN 2021
1. Berapa jumlah DATA PubMed yang Anda peroleh?
Jawab : Jumlah DATA PubMed yang diperoleh yaitu 75

2. Berapa jumlah DATA Nucleotide yang Anda peroleh?

Jawab : Jumlah DATA Nucleotide yang diperoleh yaitu 561

3. Berapa jumlah DATA Taxonomy yang Anda peroleh?

Jawab : Jumlah DATA Taxonomy yang diperoleh yaitu 1
4. Bagaimana entrez menginterpretasikan query “fish” yang Anda masukan untuk data
PubMed ini? " fish "[MeSH Terms] OR " fish "[All Fields]
Jawab :

Entrez menginterpretasikan query ("trimeresurus"[MeSH Terms] OR Trimeresurus[Text

Word]) AND albolabris[All Fields]
5. Berapa jumlah DATA PubMed yang Anda peroleh sekarang?
Jawab : Jumlah DATA PubMed yang diperoleh yaitu 3
6. Apakah sama atau berbeda dengan jumlah DATA awal?
Jawab : Jumlah DATA awal dan terakhir berbeda, dari 75 menjadi 3
7. Bagaimana entrez menginterpretasikan query “fish” Anda sekarang? "fishes"[MeSH
Terms]
Jawab :

Enterez menginterpretasikan "Trimeresurus albolabris"[Organism] OR

Trimeresurus albolabris[All Fields]
8. Bagaimana entrez menginterpretasikan query “fish” "pada opsi MeSH Terms
Jawab :
 Enterez menginterpretasikan ("trimeresurus"[MeSH Terms] OR
Trimeresurus[Text Word]) AND albolabris[All Fields]
9. Berasal dari organisme apakah entry nucleotide tersebut? Berapa pasang basa sekuen
nukleotida pada entry tersebut? (Print screen full browser, lingkari bagian informasi)
Jawab : Berasal dari organisme Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Euteleostomi; Lepidosauria; Squamata; Bifurcata; Unidentata;
Episquamata;Toxicofera; Serpentes; Colubroidea; Viperidae; Crotalinae;
Trimeresurus.
Basa sekuennya sebanyak 681 pasang
10. Berapa jumlah DATA Taxonomy yang muncul/diperoleh?
 Jawab :

DATA Taxonomy yang muncul adalah 1

11. Berapakah jumlah DATA Protein yang muncul/diperoleh?
 Jawab :

DATA Protein yang muncul adalah 523

12. Berapakah jumlah DATA SNP yang muncul/diperoleh?
Jawab : DATA SNP yang muncul adalah 0
13. Berapakah jumlah DATA SNP yang muncul/diperoleh?
Jawab : DATA SNP yang diperoleh yaitu 53
14. Tulis kembali query yang tertulis pada kotak tersebut! ("Chondrichthyes"[Organism] OR
"Dipnoi"[Organism] OR "Actinopterygii"[Organism] OR "Hyperotreti"[Organism] OR
"Hyperoartia"[Organism] OR "Coelacanthimorpha"[Organism]) AND
biomol_mrna[PROP]
Þ Masih pada halaman nucleotide, klik pilihan [mRNA].
Þ Selanjutnya pilih tab [advanced]. Pada halaman advanced search builder, klik pilihan
“organism” di pull-down menu, dan ketik “fish” pada kolom pencarian.
Þ Selanjutnya klik pilihan “gene name” di pull-down menu, dan ketik “GFP” pada kolom
pencarian. Selanjutnya klik [search]
15. Berapa jumlah DATA yang muncul/diperoleh?
Jawab : Jumlah DATA yang muncul yaitu 53

16. Apa GenBank ID yang muncul pertama? (Print screen full browser, lingkari bagian
informasi
Jawab : MK494164.1