Topik Bahasan : 

Capaian Pembelajaran :
i) Mahasiswa mampu mengkritisi prinsip dasar penggunaan marka molekuler untuk kegiatan
seleksi karakter target,
ii) Mempercepat proses perakitan kultivar unggul serta
iii) Mampu menyusun desain seleksi untuk karakter yang diinginkan menggunakan marka
molekuler (mengaplikasikan MAS (Marker Assisted Selection) secara tepat dan sesuai dengan
permasalahan yang dihadapi.

Metode Pembelajaran (Bentuk Pembelajaran)

• Self-study (menjawab Guiding Questions)
• Discovery learning (dalam menyusun desain seleksi berbasis marka molekuler)

Media/Materi Ajar :

1) Brumlop S. and Finchk MR. 2011. Applications and Potentials of marker assisted selection
(MAS) in plant breeding Federal Agency for Nature Conservation. Unikassel. Germany.

2) Collard BC and Mackill DJ. 2008. Marker assisted selection: an approach for precision of plant
breeding in the twenty-first century. Philosophical Transaction of the Royal Society B.
363:557:572. doi:10.1098/rstb.2007.2170.

3) Animasi tentang MAS: el2.unl.edu/view/lesson/e2988952e395/2

4) Dan sumber-sumber dan media pembelajaran lain yang relevan.

Alokasi Waktu : Tutorial: 1 x 50 menit (1 kali)

Self study: 6 x 50 menit (3 kali)
Mengerjakan tugas: 2 x 50 menit (1 kali)

Tahapan proses pembelajaran :

1. Self-study
Mahasiswa menjawab Guiding Questions. Selanjutnya mahasiswa mendiskusikan hal-hal yang
terkait dalam Guiding Questions.
Aspek yang dipelajari (ruang lingkup)
1. Marka molekuler : pengertian dan prinsip dasar
2. Kelebihan dan kekurangan marka molekuler
3. Marka molekuler berbasis PCR dan non-PCR
4. Syarat penerapan seleksi berbasis marka (MAS)
5. Tahapan dan pertimbangan dalam melakukan MAS
6. Bagan MAS beserta marka-marka yang digunakan, kondisi PCR, dll
7. Pyramidisasi karakter (gen) berbasis marka molekuler (optional)

2. Discovery learning
Mahasiswa secara individu mengerjakan tugas menyusun concept map terkait aplikasi seleksi
berbasis marka molekuler
Batasan
Tugas :
a. Tugas individu : menjawab Guiding Questions terkait Penerapan MAS (di bawah ini)

b. Tugas individu menyusun penerapan seleksi (untuk karakter target) berbasis marka molekuler
atau aplikasi marker assisted selection (MAS) untuk merakit tanaman yang memiliki karakter
unggul.
Untuk menghindari overlapping antar mahasiswa, sebaiknya pemilihan komoditas tanaman dan
karakter target, wajib dikomunikasikan dengan Koordinator kelas.

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
----------------------------------
Guiding Questions

Materi: Penerapan Seleksi Berbasis Marka

Molekuler (Marker Assisted Selection
= MAS) guna Merakit Tanaman dengan karakter unggul

1)    Apa yang dimaksud dengan marka fenotipik dan marka molekuler?

2)    Apa perbedaan antara marka fenotipik dan marka molekuler?

3)    Apa perbedaan antara marka molekuler, gen, alil (allele) dan primer?

4)    Apakah marka molekuler itu selaluberkaitan dengan gen?

5)    Pada generasi mana marka dapat diaplikasikan? Mengapa?

6)    Marka molekuler dapat membantu proses seleksi karakter unggul. Mengapa demikian?

7)    Apa syarat suatu marka itu dikatakan realiable atau dapat dihandalkan?

8)    Apa perbedaan marka molekuler berbasis PCR dan non PCR?

9)    Bagaimana cara mencari kandidat marka yang berasosiasi dengan karakter target?

10) Apa keunggulan dan kelemahan seleksi berbasis marka molekuler?

11) Apa yang dimaksud dengan Marker assisted backcrossing (MAB)?

12) Apa perbedaan Foreground selection and background selection pada MAB?

13) Apa yang dimaksud dengan polimorfisme?

14) Apa yang dimaksud dengan co-dominant dan dominant markers?

15) Apa yang harus diperhatikan dalam memilih marka molekuler ?

16)  Bagaimana prosedur aplikasi marka yang berbasis PCR? Berikan penjelasan terkait
tahapannya.

17)  Seandainya anda bekerja pada perusahaan perkebunan, Anda diminta untuk mendesain
seleksi
berbasis marka molekuler untuk merakit tanaman kelapa sawit yang memiliki rendemen minyak
yang tinggi.

a.   Apakah karakter rendeman minyak termasuk ke dalam kualitatif atau kuantitatif karakter?
b.   Apakah karakter ini memiliki daya mewaris (heritabilitas) yang tinggi atau rendah?
c.   Seperti apakah tahapan yang harus dilakukan dan desain penerapan markanya seperti apa?

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
---------------------------------
Kriteria Penilaian :
1. Tugas menjawab pertanyaan: kemampuan menjelaskan secara tepat dan kelengkapan isi
jawaban
2. Tugas concept map: layout, detail dan kualitas isi (content)
Bobot
Penilaian : 1.Tugas individu (menjawab pertanyaan): 10 %
2. Tugas menyusun penerapan seleksi berbasis marka molekuler: 10 %
Total 20%

Selamat bekerja.