JALUR ASAM AMINO AROMATIK

Fenilalanin, Tirosin, dan Triptofan

Keluarga aromatic asam amino meliputi fenilalanin, triptofan dan tirosin. Kunci penjelasan dari
jalur sintesis asam amino aromatik adalah dari beberapa pengamatan bakteri dengan mutasi
gen tunggal yang membutuhkan sebanyak lima senyawa untuk pertumbuhan: fenilalanin,
tirosin, triptofan, p - hydroxybenzoate, dan p -aminobenzoate. Senyawa ini semuanya
mengandung cincin aromatic, ketidakmampuan mutan tumbuh tanpa senyawa ini akan
dibatalkan pada saat shikimate tersedia. Hal ini menunjukkan bahwa metabolit ini merupakan
perantara dalam biosintesis semua senyawa aromatik. Chorismate, turunan dari shikimate,
adalah cabang dalam sintesis asam amino aromatik Jalur shikimate dimulai dengan kopling dari
fosfoenolpiruvat (PEP) dan D-erythrose 4-fosfat untuk memberikan tujuh karbon 3-deoxy-D-
arabino heptulosonic asam 7-fosfat (DAHP). Jalur dari shikimate ke chorismate melibatkan
fosforilasi shikimate, penambahan gugus asetil dari fosfoenolpiruvat, dan defosforilasi. Hewan
tidak memiliki enzim dari jalur chorismate. Mereka tidak dapat mensintesis chorismate dan,
akibatnya, tidak dapat mensintesis salah satu asam amino aromatik. (Horton.2006)
Dalam sintesis fenilalanin pada E. coli, chorismate bifunctional dehydratase mutase-prephenate
mengkatalisis penataan chorismate untuk menghasilkan prephenate, suatu senyawa yang
sangat reaktif. Selanjutnya, enzim mengkatalisis penghapusan ion hidroksida dan CO2 dari
prephenate untuk membentuk sepenuhnya aromatic phenylpyruvate produk, yang kemudian
ditransaminasi untuk fenilalanin. Sebuah chorismate bifunctional mutase-prephenate
dehidrogenase yang mirip mempercepat pembentukan prephenate dan kemudian 4-
hydroxyphenylpyruvate di cabang tirosin. Dan mengalami transaminasi perantara untuk
membentuk tirosin. Beberapa bakteri dan beberapa tanaman mengikuti jalur yang sama dari
chorismate ke fenilalanin dan tirosin sebagai E. coli meskipun mutase chorismate dan
dehydratase prephenate atau kegiatan dehidrogenase prephenate berada di rantai polipeptida
terpisah.
        Beberapa bakteri lain menggunakan jalur alternatif di mana prephenate pertama
ditransaminasi dan kemudian dekarboksilasi. Biosintesis triptofan dari chorismate
membutuhkan lima enzim. Langkah pertama, nitrogen amida glutamin ditransfer ke
chorismate; eliminasi dari gugus hidroksil dan piruvat bagian yang berdekatan dari chorismate
menghasilkan  aromatik senyawa anthranilate.
1. Jalur Asam amino Aromatik Umum
Pada umumnya asam amino aromatik seperti fenilalanin, tirosin, triptofan, dan lainnya
diproduksi melalui jalur umum yang dimulai dengan kondensasi eritrosa-4-fosfat (E-4-P) dan
fosfoenolpiruvat (PEP) untuk membentuk 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate
(DAHP). Enzim yang berpartisipasi dalam jalur aromatik umum antara lain: 1) glutamyl-Trna
sintase, (2) NAD(P)H glutamyl-tRNA reduktase, (3) GSA (glutamat-γ -semialdehid) 2,1-
aminotransferase, (4) PBG (porphobilinogen) sintase, (5) HMB (hydroxymethylbilane) sintase,
(6) UroIII (uroporfirinogen) sintase, (7) uroporfirinogen III dekarboksilase, (8) koproporfirinogen
III oksidase, (9) protoporfirinogen IX oksidase, (10) ferrochetolase, (11) ALA sintase. dan
cabang-cabangnya ke tirosin dan fenilalanin adalah DAHP diubah menjadi shikimate dan
kemudian menjadi chorismate.
Pembentukan banyak senyawa aromatik tambahan melalui cabang jalur ini menekankan
perlunya sistem regulasi yang kompleks. Meskipun ada banyak kesamaan dalam jalur asam
amino aromatik di semua bakteri dan jamur, ada beberapa perbedaan secara rinci mengenai
cara di mana triptofan, tirosin, dan fenilalanin terbentuk.
Dalam E. coli dan S. enterica, regulasi jalur aromatik umum dimodulasi melalui tiga gen yang
tidak terhubung yakni aroF, aroG, dan aroH, yang mengkodekan isozim dari enzim pertama,
DAHP sintetase, sensitif terhadap tirosin, fenilalanin, dan triptofan. Dalam S. enterica gen
struktural untuk sintetase DAHP yang dapat dihambat fenilalanin (aroH ) terkait untuk cewek.
Gen struktural untuk isozim terkait triptofan (aroF) terkait dengan aroE, sedangkan untuk
isozim yang dapat dihambat tirosin (aroG) terkait dengan pheA dan tyrA.
Pada beberapa bakteri, gen yang mengkode enzim jalur chorismate tampak tersebar di
kromosom. Namun, dalam B. subtilis, sekelompok gen yang berdekatan untuk biosintesis
triptofan mewakili operon polisistronik. Gen-gen yang mengontrol sintesis triptofan pada
bakteri enterik juga tersusun dalam sebuah operon.
Jalur menuju Tirosin dan Fenilalanin
Biosintesis dari L-tirosin dan L-fenilalanin dari chorismate dapat terjadi melalui rute alternatif di
banyak organisme salah satu contohnya pada Pseudomonas aeruginosa.
Gambar 15-18. Jalur alternatif untuk fenilalanin dan tirosin. Jalur yang ditunjukkan ada di
Pseudomonas aeruginosa. Berbagai organisme dapat mengekspresikan kombinasi jalur ini.
Dehidrogenase dapat berupa NAD+ atau NADP+ terhubung. Enzim-enzim tersebut adalah (1)
prephenate dehydrogenase, (2) prephenate dehidratase, (3) 4-hydroxyphenylpyruvate (4-HPP)
aminotransferase, (4) phenylpyruvate aminotransferase, (5) prephenate aminotransferase, (6)
arogenate dehidratase, dan (7) arogenat dehydrogenase.
T-prephenate dehydrogenase adalah enzim bifungsional yang dapat mengubah korismat
menjadi prephenate dan kemudian menjadi phenylpyruvate. Atau, prefenat dapat diubah
menjadi arogenat melalui transaminasi, dengan konversi berikutnya dari arogenat menjadi
tirosin (oleh arogenat dehidrogenase) atau fenilalanin (oleh arogenat dehidratase).
Pemanfaatan jalur alternatif ini sangat bervariasi dari satu organisme ke organisme lainnya. Di
E. coli, S. enterica, B. subtilis, dan bakteri umum lainnya, jalur prefenat ke fenilpiruvat dan
fenilalanin dan ke 4-hidroksifenilpiruvat dan tirosin adalah rute utama
2. p-Aminobenzoat dan Biosintesis Folat
Beberapa bakteri dan jamur termasuk E. coli, Streptomyces griseus, dan Pseudomonas
acidovorans, ubah chorismate menjadi p-aminobenzoate (PAB) melalui proses dua Langkah.
Langkah pertama chorismate diubah menjadi 4-amino-4-deoxychorismate (ADC) oleh ADC
synthase (PabA, PabB) dengan adanya glutamin. Dengan tidak adanya PabA dan glutamin, PabB
dapat mengubah chorismate menjadi ADC. ADC diubah menjadi PAB dengan menghilangkan
gugus piruvil dan aromatisasi cincin secara bersamaan oleh enzim ADC lyase (PabC) yang
mengandung PALP.
PAB kemudian dikondensasikan dengan 6-hidroksimetil-7,8-pterin pyrophosphate (DHPS) oleh
dihidropteroat sintase (SulA). Dihydropteroate yang dihasilkan kemudian diubah menjadi 7,8-
dihydrofolate dengan penambahan glutamat oleh dihydrofolate synthetase (FolC). Setelah 7,8-
dihidrofolat direduksi menjadi tetrahidrofolat oleh dihidrofolat reduktase, enzim sintase
kemudian berfungsi untuk menambahkan unit glutamat tambahan untuk membentuk
folilpoliglutamat.
3. Biosintesis Enterobaktin
Katekol siderofor enterobactin (enterochelin) adalah senyawa pengkhelat besi yang
memfasilitasi pengangkutan besi. Tahap pertama dari jalur ini adalah pembentukan 2,3-
dihidroksibenzoat melalui zat antara isokorismat dan 2,3- dihidro-2,3-dihidrobenzoat. Enzim-
enzim yang mengkatalis langkah-langkah tersebut adalah isochorismate synthetase (EntC), 2,3-
dihydro-2,3-dihydroxybenzoate synthetase (EntB), dan 2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate
dehydrogenase (EntA). Dalam E. coli delapan gen mengatur biosintesis enterobaktin dan
fungsinya. Gengen ini muncul dalam kelompok pada menit ke-13 pada peta hubungan E. coli.
Tahap kedua sintesis enterobactin dikatalisis oleh urutan enzim (EntD, EntE, EntF, dan EntG)
yang ada dalam kompleks multienzim. EntD memasangkan 2,3-dihidroksibenzoat dan serin
untuk membentuk 2,3- dihidroksibenzoilserin. Enzim yang tersisa mengkatalisis penggabungan
tiga molekul 2,3- dihidroksibenzoilserin untuk membentuk struktur enterobaktin siklis.
4. Jalan Menuju Ubiquinone
Ubiquinon (koenzim Q), satu-satunya komponen nonprotein dari rantai transpor elektron,
berfungsi dalam respirasi terminal. Dalam beberapa organisme tirosin dapat berfungsi sebagai
sumber 4-hidroksibenzoat melalui pembentukan perantara 4-hidroksifenilpiruvat. Gugus
oktaprenil (R8) ditambahkan oleh aksi UbiA (4-hidroksibenzoat oktapreniltransferase). Melalui
dekarboksilasi, 3- oktaprenil-4-hidroksibenzoat diubah menjadi 2-oktaprenilfenol. UbiB, UbiH,
dan UbiF mengkatalisis tiga langkah monooksigenase di jalur tersebut. UbiE, sebuah S-
adenosylmethionine:2-demethylquinol methyltransferase.
5. Menaquinone (Vitamin K) Biosintesis
Menaquinone (vitamin K2) adalah methylnaphthoquinone. Biosintesis menaquinone dimulai
dengan penambahan -ketoglutarat pada cincin chorismate dan bersamaan dengan
penghilangan piruvat dan CO2. Semua menaquinones alami memiliki trans-konfigurasi dalam
ikatan rangkap rantai samping prenyl. Menaquinone sangat penting untuk transfer elektron ke
fumarat selama pertumbuhan anaerobik E. coli.
6. Biosintesis Nicotinamide Adenine Dinucleotide (NAD)
Baik NAD dan NADP, bentuk fungsional asam nikotinat, disintesis dari triptofan pada mamalia,
N. crassa, dan S. cerevisiae. Bakteri Xanthomonas pruni juga mensintesis NAD dari triptofan.
Namun, sebagian besar bakteri menggunakan jalur yang sama sekali berbeda ke NAD yang
melibatkan kondensasi aspartat dan dihidroksiaseton fosfat (DOHAP) dan konversi selanjutnya
dari produk kondensasi (iminoaspartat) menjadi QA. Jalur dari QA ke NAD tampaknya identik di
semua organisme terlepas dari mode pembentukan QA. Bakteri enterik (E. coli dan S. enterica)
dan sebagian besar bakteri umum lainnya (termasuk M. tuberculosis) menggunakan rute
aspartat-DOHAP ke QA. Dalam kondisi anaerob, S. cerevisiae menggunakan jalur aspartat-
DOHAP. Perubahan ini kemungkinan besar terjadi karena beberapa langkah oksidatif dalam
jalur dari triptofan ke quinolinate membutuhkan oksigen molekuler.