PROTEIN

ASAM AMINO, PEPTIDA DAN PROTEIN

PROTEIN

* MAKROMOLEKUL YANG PALING BANYAK DITEMUKAN

DALAM SEL (50% BERAT KERING BADAN ORANG DEWASA
ADALAH PROTEIN)
* SUSUNAN SEJUMLAH ASAM AMINO DALAM URUTAN YANG
KHAS MELALUI IKATAN PEPTIDA DENGAN FUNGSI YANG
KHAS PULA SEHINGGA PROTEIN JUGA DISEBUT SEBAGAI
POLIPEPTIDA.

• SANGAT BERVARIASI DIMANA RATUSAN JENIS PROTEIN

YANG BERBEDA DAPAT DITEMUKAN DALAM SATU SEL
DENGAN FUNGSI YANG BERBEDA PULA.

Jumlah residu as amino jumlah rantai

Insulin 51 2
Haemoglobin 574 4
Lisosim 129 1
Ribonuklease 124 1
 Protein terdiri dari unsur C(45-50%), H(6-
8%), O(19-25%), N(14-20%).
• Mempunyai berbagai peranan biologis.
• Ciri-ciri protein :
BM tinggi, terdiri bisa sampai 20 jenis
asam amino yang dihubungkan melalui
ikatan kovalen, struktur tidak stabil,
spesifik, reaktif, terdapat ik
ion,hidrogen,vanderwalls.
 Jenis protein : sederhana dan terkonjugasi
(glikoprotein, lipoprotein, metaloprotein dll)
 Protein dioksidasi dan disintesa setiap hari
secara terus menerus pada orang dewasa
(diperbaharui)
 Turn over protein 400 gr/hr  75-80%
dipakai kembali untuk sintesa protein.
• PROTEIN HARUS DIKOMSUMSI SETIAP HARI UNTUK MENUTUPI
KEHILANGAN SEWAKTU TURN OVER.
• NEGATIF NITROGEN BALANCE  PERTUMBUHAN ABNORMAL
• OVER  DISIMPAN DALAM BENTUK LEMAK (PEMBOROSAN)

NILAI GIZI PROTEIN:

-JUMLAH KOMSUMSI
-DAYA SERAP TUBUH
-KOMPOSISI ASAM AMINO
(ESENSIAL DAN NON ESENSIAL)

KEBUTUHAN PROTEIN DIPENGARUHI OLEH

BBRP SITUASI SEPERTI:
- MASA PERTUMBUHAN
- AKTIFITAS
- HAMIL DAN MENYUSUI,
- SAKIT,DLL
 KLASIFIKASI PROTEIN BERDASARKAN FUNGSI
BIOLOGI

1. SEBAGAI ENZIM/PROTEIN KATALITIK

* PROTEIN KHUSUS YG MEMPUNYAI AKTIVITAS

KATALISIS (BIOKATALISATOR)
* LEBIH DARI 2000 JENIS ENZIM SUDAH DIKETAHUI
DG FUNGSI YG KHAS.
EX : UREASE → UREA → AMONIAK + CO2

2. PROTEIN CADANGAN
→PADA TANAMAN / TUMBUHAN
EX : PROTEIN : JAGUNG, GANDUM, BERAS,
KACANG2AN,
 Pada hewani  OVALBUMIN, KASEIN
3. PROTEIN TRANSPORT

→ MEMBAWA MOLEKUL / ION SPESIFIK MELALUI DARAH

DARI SATU ORGAN KE ORGAN LAIN.
EX : LIPOPROTEIN
HEMOGLOBIN

4. PROTEIN KONTRAKTIL

→ PROTEIN YANG MEMBERIKAN KEMAMPUAN KEPADA SEL

DAN ORGANISME UNTUK BERKONTRAKSI, MENGUBAH
BENTUK / BERGERAK
EX : AKTIN DAN MIOSIN  KONTRAKSI OTOT/
KERANGKA
TUBULIN  PROTEIN PEMBENTUK MIKROTUBUL

5. PROTEIN PERTAHANAN

→ PROTEIN YANG BERFUNGSI UNTUK MEMPERTAHANKAN

ORGANISME DARI SERANGAN SPECIES LAIN ATAU LUKA
EX : FIBRINOGEN DAN TROMBIN, ANTIBODY, BISA ULAR
6. PROTEIN STRUKTURAL

→ MEMBANGUN STRUKTUR BIOLOGI, KEKUATAN , DAN

PROTEKSI
EX :PROTEIN SERABUT KOLAGEN TULANG
RAWAN/URAT,
KULIT
ELASTIN PADA PERSENDIAN  DAPAT MEREGANG
KEDUA DIMENSI
KERATIN  PROTEIN STRUKTURAL PADA RAMBUT,
KUKU, BULU BURUNG
FIBROIN  SUTRA, JARING LABA-LABA

7. PROTEIN PENGATUR
MENGATUR AKTIVITAS SELULER ATAU FISIOLOGI

EX :HORMON INSULIN METABOLISME GULA

HORMON PARATIROID  MENGATUR TRANSPORTASI
Ca++, P.
 ASAM AMINO
 STRUKTUR UMUM

COOH (karboksil)

l
(Amina) H2N – C – H (hidrogen)

l
R
R DIBEDAKAN :

- STRUKTUR (Gugus samping)

- KELARUTAN
- MUATAN LISTRIK
- UKURAN
 MEMPUNYAI ATOM C ASIMETRIK KECUALI – GLISIN –

COOH COOH

NH2–C – H H – C – NH2

CH3 CH3
L – ALA D – ALA

ISOMER OPTIK ( STEREO ISOMER )

- UMUMNYA ASAM AMINO YG ADA DI ALAM BENTUK L
- RASEMASI

 ASAM AMINO LARUT DALAM AIR TETAPI TIDAK LARUT

DALAM PELARUT NON POLAR
 DALAM LARUTAN DAPAT TERIONISASI
- SEBAGAI ASAM ( DONOR PROTON )
SENYAWA AMFOTER
- SEBAGAI BASA ( AKSEPTOR PROTON)

H H

R – C – COO - R – C – COO - + H+

NH3+ NH2

H H

R – C – COO - + H + R – C – COOH

NH3+ NH3+

SIFAT INI DAPAT BERFUNGSI UNTUK :

- MENENTUKAN ASAM AMINO PENYUSUN PROTEIN
- MEMISAHKAN ASAM AMINO PENYUSUN PROTEIN
 PENGGOLONGAN ASAM AMINO BERDASARKAN
POLARITAS GUGUS R PADA PH 7

1. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R NON POLAR

Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Phe, Trp.

2. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R POLAR TIDAK BERMUATAN

Gly, Ser,Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln.

3. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R BERMUATAN NEGATIF (-)

Asp dan Glu

4. ASAM AMINO DENGAN R BERMUATAN (+)

Lys, Arg, His
 1. ASAM AMINO DG R NON POLAR
( Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Phe, Trp )
2. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R POLAR TIDAK BERMUATAN
(Gly, Ser,Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln)
3. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R BERMUATAN NEGATIF (-)
(Asp dan Glu )
4. Asam amino dengan R bermuatan (+)
(Lys, Arg, His)
SIFAT ASAM BASA (MENGION) ASAM AMINO

Pk 2

pI

pK 1
BEBERAPA INFORMASI:
1. AS. AMINO ALANIN MEMPUNYAI 2 KUTUB YG DAPAT MENGION:
1. GUGUS KARBOKSIL PADA pH 2,34.
2. GUGUS AMINA PADA PH 9,69.

2. ASAM AMINO MEMPUNYAI 2 DAERAH BERDAYA BUFFER YANG

BAIK YAITU PADA DAERAH YANG RELATIF DATAR PADA GRAFIK
(Ph 2 – 3 dan Ph 9 – 10) DAN MEMPUNYAI DAYA BUFFER
TERBURUK PADA Ph 6,02 (PI)

3. PADA pH 6,02 MUATAN AS. AMINO = 0 (ZWITTER ION/

MENGION SEMPURNA). PADA SAAT INI A. AMINO AKAN
MENGENDAP. pH INI DISEBUT pH ISOELEKTRIK (PI).

PI = (PK1 + PK2)/2

pH DIBAWAH PI -- MUATAN A.AMINO + (POSITIF)

pH DIATAS PI -- MUATAN A.AMINO - (NEGATIF)
pH = PI ------- MUATAN A. AMINO (0) (NETRAL)

4. AS. AMINO YG BERBEDA DAPAT DIPISAHKAN DARI YG LAIN

ATAS KECEPATAN MIGRASI MASING2 AS. AMINO JIKA MOLEKUL
INI DITEMPATKAN PD SUATU MEDAN LISTRIK PD PH TERTENTU.
HARGA PK BAGI GUGUS MENGION ASAM AMINO
A.AMINO pK1 pK2 pK 3
(COOH) ( NH3+) (R)

GLISIN 2,34 9,6

ALANIN 2,34 9,69
LEUSIN 2,36 9,6
SERIN 2,21 9,15 13,6 (OH)
THREONIN 2,33 10,43
GLUTAMIN 2,17 9,13
ASPARTAT 2,09 9,82 3,86 (COOH)
GLUTAMAT 2,19 9,67 4,25 (COOH)
HISTIDIN 1,82 9,17 6,0 (NH+)
SISTEIN 1,71 10,78 8,33 (SH)
TIROSIN 2,2 9,11 10.07 (OH)
LISIN 2,18 8,95 10,53 (NH3+)
ARGININ 2,17 9,04 12,48 (NH3+)

1. ELEKTROFORESIS KERTAS
METODA PEMISAHAN
2. KHROMATOGRAFI PENUKAR ION
ASAM AMINO 3. AMINO ACID ANALYZER
 BEBERAPA REAKSI SPESIFIK ASAM AMINO
1. REAKSI PEMBENTUKAN IKATAN PEPTIDA

R1 O H H H20

H 2N – C - C + N – C – COOH -------

H OH H R2
H2O

R1 O H

H 2N - C - C - N - C - COOH

H H R2

 dipeptida, tripeptida, tetrapeptida, pentapeptida, oligopeptida, polipeptida.

Pembentukan ikatan peptida
 Peptida
 Asam amino dapat membentuk rantai karena gugus
amino (–NH2) AA dapat bereaksi dengan gugus
karboksilat (–COOH) AA lainnya. Molekul rantai yang
terbentuk dinamakan peptida, jika rantainya relatif
pendek (<10 AA) disebut oligopeptida, jika rantainya
panjang disebut polipeptida atau protein (50 - 2000
residu AA). Ikatan yang terbentuk antar AA dinamakan
ikatan peptida.
 Karena reaksi pembentukan peptida membebaskan 1
molekul air, AA penyusun polipeptida disebut residu.
 Penyebutan urutan AA dimulai dari AA yang memiliki
gugus –NH2 (residu terminal amino/ujung N) hingga
yang memiliki gugus –COOH bebas (residu termanal
karboksil/ujung C).
Contoh: pentapeptida
2. REAKSI WARNA DENGAN NINHIDRIN
AS.AMINO DG NINHIDRIN BERLEBIHAN MEMBENTUK SENYAWA
BERWARNA UNGU/BIRU

O O
H
l C OH C OH
R – C – COOH + C - C
l C OH C
NH2 ll ll H
O O

ASM AMINO NINHIDRIN NINHIDRIN

TEREDUKSI

+ NH3+ + CO2 + R – COOH + NINHIDRIN -- PIGMEN

WARNA UNGU/
BIRU
Ciri khas reaksi ini mengeluarkan gas CO2
 O O
ll ll
C C

C = N–C + 3H2O + H+

C C
ll l
O O -

Senyawa berwarna ungu/ biru

- MENENTUKAN / MENDETEKSI ASAM AMINO SECARA KUANTITATIF

- Dapat mendeteksi asam amino secara kolorimetrical
- Prolin dan Hidroksiprolin  kuning
- Asparagin  coklat
Contoh: tripeptida
H H

HOOC - CH – CH2 - CH2 - C - N - CH - C - N - CH2 - COOH

NH2 O CH2 O

SH

GLUTATION ( GLUTAMILSISTEINILGLISIN)

CONTOH LAINNYA:

INSULIN  2 RANTAI POLIPEPTIDA (51 RESIDU ASAM AMINO)

HAEMOGLOBIN  4 RANTAI POLIPEPTIDA (574 AS. AMINO)
GRAMISIDIN  10 RESIDU ASAM AMINO → ANTIBIOTIK

ENKIFALIN  10 RESIDU ASAM AMINO → OBAT BIUS (ANALGESIK)

Tyr – Gly – Gly - Phe – Met– Tyr – Gly – Gly– Phe – Leu

BRADIKININ  9 ASAM AMINO → PENGHAMBAT PEMBENGKAKAN JARINGAN

Arg– Pro – Pro- Gly – Phe – Ser – Pro – Phe - Arg

3. REAKSI PEMBENTUKAN SISTIN DARI 2 AS.AMINO
SISTEIN  IKATAN DISULFIDA

COOH COOH
l l
NH2 – C – CH2 – SH + SH – CH2 – C – NH2 ---
l l
H H

COOH COOH
l l
NH2 – C – CH2 – S - S – CH2 – C – NH2
l l
H H
IKATAN
DISULFIDA
 TEKNIK PEMISAHAN ASAM AMINO

1. ELEKTROFORESIS KERTAS

KERTAS FILTER YG DIBASAHI Spot mengandung campuran

BUFFER PADA pH tertentu asam amino

+ ANION o KATION -
------- -------
T1

........

T2
.. . .. . . SEMPROT DG
NINHIDRIN
COCOKKAN DG MARKER
 2.
CHROMATO
GRAPHY
PENUKAR
ION
 Kromatografi penukar ion
 Merupakan metode untuk
memisahkan,mengidentifikasi,menghitung jml asam
amino dlm larutan
 Kolom kromatografi mgd granula resin sintetik mgd
gugus bermuatan tetap.Resin dgn gugus anion (resin
penukar kation) dan resin dgn gugus kation (resin
penukar anion).
 Resin mgd asam sulfonat (-SO3-) diberi muatan Na+
 Lar asam (pH=3) camp as amino dituang ke kolom,
dibiarkan tersaring perlahan. As am berbentuk kation dg
muatan total positif, saat mengalir menukar ion Na+
berikatan dgn -SO3- pada resin. AA mu paling positif
menukar Na+ paling pertama,terikat paling kuat pada
resin,bergerak ke bawah kolom dg kecepatan plg
rendah.
Tingkatan struktur protein
 Tingkatan organisasi struktur protein
 Struktur primer

Urutan asam amino

penyusun protein yang
disebutkan dari kiri (N-
terminal) ke kanan (C-
terminal). AA bisa ditulis
dalam singkatan 3 huruf
atau 1 huruf.
Menyatakan deret asam
amino pada rantai
polipeptida dan letak ik
disulfida bila ada.
 Struktur primer protein
 Gly-Pro-Thr-Gly-Thr-Gly-Glu-Ser-Lys-Cys-Pro-
Leu-Met-Val-Lys-Val-Leu-Asp-Ala-Val-Arg-Gly-
Ser-Pro-Ala
atau
 GPTGTGESKCPLMVKVLNAVRGSPA
 Struktur primer terbentuk karena ikatan peptida
antar AA selama proses biosintesis protein atau
translasi. Urutan asam amino dapat ditentukan
dengan metode Degradasi Edman atau Tandem
Mass Spectrophotometry.
Rantai peptida biasa disebut “backbone” alias
tulang punggung sedangkan gugus R biasa
disebut gugus samping.
 Struktur sekunder protein
Hubungan ruang asam amino yg berdekatan dan
memberikan struktur berulang secara periodik
 Alfa helix
 Alfa-helix terbentuk oleh ‘backbone‘ ikatan peptida
yang membentuk spiral dimana jika dilihat tegak lurus
dari atas, arah putarannya adalah searah jarum jam
menjauhi pengamat (dinamakan alfa).
 Rantai polipeptida membelit,memadat, mengelilingi
satu sumbu.
 Satu putaran terdiri atas 3.6 residu asam amino dan
struktur ini terbentuk karena adanya ikatan hidrogen
antara atom O pada gugus CO dengan atom H pada
gugus NH (intra rantai)(garis oranye).
 Gugus R mengarah keluar
 Dapat diregang, bila diberi uap panas ik H rusak.
 Beta-sheet
 Struktur beta-sheet juga terbentuk karena adanya ikatan
hidrogen, namun seperti terlihat pada gambar sebelah
kanan, ikatan hidrogen terjadi antara dua bagian rantai
yang pararel sehingga membentuk lembaran yang
berlipat-lipat.
 Rantai polipeptida terbentang penuh
 Polipeptida yg berdekatan berjalan berlawanan 
antiparalel
 Gugus R ke atas dan
ke bawah bidang
 Tidak dapat diregang
 Struktur tersier
 Bentuk terlipatnya rantai
polipeptida membentuk
struktur tiga dimensi
 Pelipatan ini dipengaruhi
oleh interaksi antar gugus
samping (R) satu sama
lain, a.l.
Interiaksi ionik, ,ikatan
hidrogen, gaya dispersi Van
Der Waals, Jembatan Sulfida
 Struktur tersier
 Interaksi
ionik
Terjadi antara
gugus samping
yang
bermuatan
positif (memiliki
gugus –NH2
tambahan) dan
gugus negatif
(–COOH
tambahan).
 Struktur tersier
 Ikatan hidrogen
yang terjadi antar
gugus samping
akan membentuk
struktur tersier.
Karena pada
gugus samping
bisa banyak
terdapat gugus
seperti –OH, –
COOH, –CONH2
atau –NH2 yang
bisa membentuk
ikatan hidrogen.
 Struktur tersier
 Gaya Dispersi
Van Der Waals
Beberapa asam
amino memiliki gugus
samping (R) dengan
rantai karbon yang
cukup panjang. Nilai
dipol yang
berfluktuatif dari satu
gugus samping dapat
membentuk ikatan
dengan dipol
berlawanan pada
gugus samping lain.
 Struktur tersier
 Jembatan Sulfida
 Cysteine memiliki gugus
samping –SH dimana
dapat membentuk ikatan
sulfida dengan –SH pada
cystein lainnya, ikatan ini
berupa ikatan kovalen
sehingga lebih kuat
dibanding ikatan-ikatan
lain.
 Struktur Quartener
 Protein atau polipeptida
yang sudah memiliki
struktur tersier dapat
saling berinteraksi dan
bergabung menjadi suatu
multimer. Protein
pembentuk multimer
dinamakan subunit. Jika
suatu multimer
dinamakan dimer jika
terdiri atas 2 subunit,
trimer jika 3 subunit dan
tetramer untuk 4 subunit.
Struktur kuarterner
 Multimer yang terbentuk
dari subunit-subunit
identik disebut dengan
awalan homo–,
sedangkan jika
subunitnya berbeda-beda
dinamakan hetero–.
Misalnya hemoglobin
yang terdiri atas 2 subunit
alfa dan 2 subunit beta
dinamakan
heterotetramer.
 PENGGOLONGAN PROTEIN BERDASARKAN
BENTUK/STRUKTUR DAN SIFAT FISIK TERTENTU

1. PROTEIN GLOBULAR
2. PROTEIN SERABUT
1. ALPHA HELIKS
2. TRIPLE HELIKS
3. BETA PLEATED SHEET
1. BETA PLEATED SHEET PARALEL
2. BETA PLEATED SHEET ANTI PARALEL
 PROTEIN GLOBULAR

 PROTEIN YANG DITANDAI DG RANTAI POLIPEPTIDA YG

BERLIPAT DAN MELINGKAR MEMBENTUK GLOBULAR PADAT
DAN KOMPAK

TERMINAL
O R2
AMINO
NH3+ C C NH3+ COOH TERMINAL
KARBOKSIL

C NH3+ C C
R1 O R3 Dst, dst

S -S
S-S
 PROTEIN GLOBULAR
 SIFAT:
1. MEMPUNYAI KELARUTAN YANG TINGGI DALAM AIR
2. BANYAK DISUSUN OLEH ASAM AMINO POLAR
(HIDROFILIK)
3. JIKA ADA ASAM AMINO HIDROFOBIK TERSEMBUNYI DI
BAGIAN DALAM.
4. BANYAK MENGANDUNG PROLIN  PEMBEMKOKAN.
5. ASAM AMINO Ser, Thr, DAN Asn JUGA MENYEBABKAN
PEMBENGKOKAN
6. MEMPUNYAI FUNGSI SEPERTI: ENZIM, PROTEIN
SIMPANAN, HORMON, ANTIBODI TRANSPORT.

CONTOH :
* HAEMOGLOBIN  4 RANTAI POLIPEPTIDA DG 574 ASAM
AMINO (ALPHA 1 DAN 2 = 141 AA, BETA 1 DAN 2 = 146
AA).
* INSULIN (2 RANTAI DG 51 ASAM AMINO)
* ADENILAT KINASE  3 RANTAI
 Haemoglobin
Alpha2
Alpha1 ( 141 as. amino)
(141 as.amino)

Beta 2 (146 as.amino)

Beta 1 (146
as.amino

Ilustrasi 4 rantai polipeptida haemoglobin

A (21 AS.AMINO) B (30 as.amino)

S S-S
S
S S-S
S

ILUSTRASI LIPATAN 2 RANTAI

POLIPEPTIDA INSULIN
 PROTEIN SERABUT
PROTEIN YANG RANTAI POLIPEPTIDANYA MEMANJANG
MEMBENTUK SEPERTI SERAT DAN SALING MELILIT PADA
SATU SUMBU

SIFAT SANGAT TIDAK LARUT DALAM AIR SEHINGGA

ASAM AMINO PENYUSUNNYA LEBIH BANYAK DARI
GOLONGAN ASAM AMINO HIDROFOBIK.

 FUNGSI:
1. PROTEIN STRUKTURAL
2. PROTEIN PERLINDUNGAN LUAR
3. PROTEIN KONTRAKTIL

ADA 3 JENIS:
1. ALPHA HELIKS  ALPHA KERATIN (BULU BINATANG,
KUKU, WOOL, SAYAP, SISIK, TANDUK, KULIT PENYU)

1. TRIPLE HELIKS  KOLAGEN (TULANG, TUL RAWAN,

KULIT, URAT)

1. BETA PLEETED SHEET PARALEL  KERATIN

BETA PLEETED SHEET ANTIPARALEL  FIBROIN
a. Alpha heliks

b. Alpha heliks

c. Triple heliks
 BETA PLEETED
SHEET PRALEL

BETA PLEETED
SHEET ANTIPARALEL
 IKATAN KOVALEN DAN NON KOVALEN YANG
MEMPERTAHANKAN STRUKTUR PROTEIN

IKATAN KOVALEN: IKATAN NONKOVALEN

1. IKATAN PEPTIDA 1. IKATAN HIDROGEN

2. IKATAN DISULFIDA 2. IKATAN HIDROFOBIK
3. IKATAN ELEKTROSTATIK

R1 O H

H2N - C - C - N - C - COOH IKATAN PEPTIDA

H H R2

COOH COOH
l l
NH2 – C – CH2 – S - S – CH2 – C – NH2 IKATAN DISULFIDA
l l
H H
 IKATAN NONKOVALEN

1. IKATAN HIDROGEN
2. IKATAN HIDROFOBIK/INTERAKSI HIDROFOBIK
3. IKATAN ELEKTROSTATIK

 IKATAN HIDROGEN TERJADI ANTARA RESIDU GUGUS R PADA

SIMPUL YANG BERDEKATAN DIDALAM RANTAI ATAU ANTAR RANTAI.

RANTAI 1

RANTAI 2

RANTAI 3
 Ikatan nonkovalen
 IKATAN HIDROFOBIK  TERJADI
ANTARA RESIDU GUGUS R DARI 2
ASAM AMINO YANG SAMA-SAMA
HIDROFOBIK

 IKATAN ELEKTROSTATIK  TERJADI

ANTARA GUGUS DARI ASAM AMINO
YANG MUATANNYA BERLAWANAN.
 DENATURASI PROTEIN
 IKATAN-IKATAN NONKOVALEN YG MEMPERTAHANKAN
STRUKTUR PROTEIN DAPAT DIRUSAK OLEH BERBAGAI
MANIPULASI SEHINGGA PROTEIN AKAN KEHILANGAN
AKTIFITAS BIOLOGISNYA  DENATURASI PROTEIN

FISIK  SUATU PEROBAHAN KONFORMASI RANTAI

POLIPEPTIDA YANG TIDAK MEMPENGARUHI STRUKTUR
PRIMER.

 HAL-HAL YG DAPAT MENYEBABKAN TERJADINYA

DENATURASI:
 PANAS
 ASAM BASA KUAT
 LOGAM BERAT
 PELARUT ORGANIK (ALKOHOL, ASETON DLL)
 PENGGUNCANGAN YANG INTENSIF
 DETERGEN, UREA DLL
DENA
TURA
SI

RENA
TURA
SI
 HIDROLISIS PROTEIN
HIDROLISIS PROTEIN BERGUNA UNTUK:
1. MEMUTUS IKATAN KOVALEN PD POLIPEPTIDA
2. MEMISAHKAN ASAM AMINO YG ADA PADA RANTAI POLIPEPTIDA.

ADA 3 CARA UNTUK MENGHIDROLISIS PROTEIN:

1. HIDROLISIS DG ASAM.
 6 NHCl, PADA SUHU 110oC SELAMA 20 – 70 JAM, PADA TABUNG
REAKSI YG TERTUTUP RAPI SEHINGGA TDK ADA KONTAK DG
OKSIGEN.  TERJADI PEMUTUSAN SEMUA IKATAN PEPTIDA,
TETAPI BBRP ASAM AMINO MENGALAMI DEAMINASI (Trp, Ser,
Tre, Asp, Glu).

2. HIDROLISIS DG BASA
 2 – 4 N NaOH, SUHU 100oC, SELAMA 4 – 8 JAM.
 UNTUK MENDAPATKAN Trp YG RUSAK PADA HIDROLISIS
ASAM.
3. HIDROLISIS DG ENZIM

 TIDAK MEMUTUSKAN SEMUA IKATAN

PEPTIDA PADA RANTAI POLIPEPTIDA KARENA
ENZIM HANYA MEMUTUS PADA ASAM AMINO
TERTENTU (SELEKTIF).

TRIPSIN  Lys, Arg

KHEMOTRIPSIN  Phe, Trp, Tyr
SIANOGEN BROMIDA  Met
THERMOLISIN  SEBELUM Ala
PEPSIN  Phe, Trp, Tyr,Met,Leu
PAPAIN  Arg, Lis, Gli
4. MEMUTUS IKATAN DISULFIDA MENGGUNAKAN SENYAWA:

1. MERKAPTOETANOL
2. ASAM PERFORMAT
3. DITIOREITOL (DTT)

DTT (DITIOREITOL)
HS-CH2-CHOH-CHOH-CH2SH

ATAU
ASAM PERFORMAT MERKAPTOETANOL
(HCOO-OH) (HS-CH2-CH2-OH)