DATANG DI
PERKULIAHA
N BIOKIMIA
Apa itu Biokimia?
• Definisi:
– Webster’s dictionary: Bios = Yunani,
artinya “hidup” “Kimia mahluk hidup; Kimia
yang terjadi dan menjadi ciri kehidupan.”
– WebNet dictionary: “Biokimia adalah
kimia dari bahan-bahan dan proses-proses
yang terjadi dalam tubuh mahluk hidup;
sebagai upaya untuk memahami proses
kehidupan dari sisi kimia.“
Apa itu biokimia?
Pemahaman bentuk dan fungsi biologis
dari sudut pandang kimia
Bertujuan untuk memahami interaksi
molekul-molekul tak hidup yang
menghasilkan fenomena kompleks dan
efisien yang menjadi ciri-ciri kehidupan
serta menjelaskan keseragaman kimia
dari kehidupan yang beragam.
KONSEP DASAR BIOKIMIA
KIMIA BIOLOGI
Hubungan Struktur Mahkluk Hidup
Fungsi, Reaksi-Reaksi Pertumbuhan
Reproduksi
BIOKIMIA
Organisme, Reaksi Kimia
BIOMOLEKUL MINERAL
BIOKIMIA
Organisme, Reaksi Kimia
MINERAL
BIOMOLEKUL
Misalnya:
beras nasi
amilum glukosa
protein asam amino
lemak asam lemak
BEDA UNSUR, SENYAWA, DAN MOLEKUL
1. UNSUR: zat terkecil yang tidak dapat dibagi lagi
contoh: Na, K, Ca, Fe, O, C
1. OKSIGEN 65 %
2. KARBON 18
3. HIDROGEN 10
4. NITROGEN 3
5. KHLOR 0,20
6. BESI 0,006
7. SENG 0,003
8. TEMBAGA 0,001
9. KALSIUM 1,5
10. FOSFOR 1
11. KALIUM 0.35
12. BELERANG 0,25
13. NATRIUM 0,15
14. MAGNESIUM 0,05
KESIMPULAN: SENYAWA YG BANYAK TERDAPAT DLM JASAD HIDUP ADALAH
UNSUR ; O ,C ,H DAN N
0RGANISASI MOLEKULER SEL HIDUP
MISALNYA:
1. KITA AKAN MENGATUR MAKANAN YG AKAN
KITA MAKAN SEHINGGA KITA MEMPEROLEH
MAMFAAT DARI MAKANAN SECARA OPTIMAL
2. MENGHINDARI DAMPAK DARI LINGKUNGAN YG
TERCEMAR OLEH LIMBAH YG MEMBAHAYAKAN
KESEHATAN.
METABOLISME
ENERGI
ENERGI CO2 dan H2O
# Metabolisme menyangkut semua proses fisik dan kimia yg terjadi
dlm tubuh yg diperlukan utk mempertahankan kehidupan.
# Reaksi kimia yg terjadi memungkinkan tubuh mengeluarkan dan
menggunakan energi yg berasal dari makanan,mengubah suatu
zat menjadi zat yg lain dan menyiapkan sisa2 utk di ekskresikan.
# Ada kurang lebih seribu macam reaksi kimia yg terjadi dalam
suatu sel tubuh.
# Energi diperoleh dari zat2 gizi makro penghasil energi yaitu:
karbohidrat,lemak dan protein----zat gizi sumber energi ini
harus dipecah melalui proses pencernaan menjadi molekul2
lebih kecil yaitu;monosakarida,asam lemak bebas dan asam
amino.----molekul2 kecil ini diangkut melalui darah kejaringan
tubuh utk segera digunakan atau disimpan sebagai
glikogen,protein dan trigliserida.(simpanan energi).
# Dalam metabolisme energi, karbohidrat, lemak dan protein
saling berinteraksi.
# Sebagian besar vitamin dalam metabolisme berfungsi sebagai
KOENZIM.
# Sedangkan sebagian besar mineral sebagai KOFAKTOR
# KOENZIM dan KOFAKTOR membantu FUNGSI ENZIM.
# Metabolisme energi dikontrol oleh hormon-hormon terutama
glukagon,insulin dan tiroid.
ENZIM
• Enzim adalah senyawa organik atau katalis protein yang
dihasilkan sel dalam suatu reaksi. Enzim bekerja sebagai
katalis dalam tubuh makhluk hidup, oleh karena itu
disebut biokatalisator. Kamu akan mengetahui fungsi
enzim dalam proses metabolisme setelah mempelajari
subbab ini. Enzim bertindak sebagai katalis, artinya enzim
dapat meningkatkan laju reaksi kimia tanpa ikut bereaksi
atau dipengaruhi oleh reaksi kimia tersebut. Enzim ini
memiliki sifat yang khas, artinya hanya mempengaruhi zat
tertentu yang disebut substrat. Substrat adalah molekul
yang bereaksi dalam suatu reaksi kimia dan molekul yang
dihasilkan disebut produk. Misalnya, enzim protease,
substratnya adalah protein dan bentuk reaksinya
mengubah protein menjadi asam amino. Jadi, asam amino
disebut produk.
Enzim disintesis di dalam sel-sel hidup. Sebagian besar
enzim bekerja di dalam sel sehingga disebut enzim
intraseluler. Contoh enzim intraseluler adalah katalase
yang memecah senyawa-senyawa berbahaya, seperti
hidrogen peroksida pada sel-sel hati. Sedangkan, enzim
yang dibuat di dalam sel dan melakukan fungsinya di
luar sel disebut enzim ekstraseluler. Contoh enzim
ekstraseluler adalah enzim-enzim pencernaan, seperti
amilase yang memecah amilum menjadi maltosa. Reaksi
biokimia yang dikendalikan oleh enzim, antara lain
respirasi, pertumbuhan, perkecambahan, kontraksi
otot, fotosintesis, fiksasi nitrogen, proses pencernaan,
dan lain-lain.
• 1. Komponen Enzim
• Penyusun utama suatu enzim adalah molekul protein yang disebut Apoenzim.
Agar berfungsi sebagaimana mestinya, enzim memerlukan komponen lain yang
disebut kofaktor. Kofaktor adalah komponen nonprotein berupa ion atau
molekul. Berdasarkan ikatannya, kofaktor dapat dibagi menjadi tiga kelompok,
yaitu gugus prostetik, ko-enzim, dan ion-ion anorganik.
a) Gugus prostetik merupakan tipe kofaktor yang biasanya terikat kuat pada enzim,
berperan memberi kekuatan tambahan terhadap kerja enzim. Contohnya adalah
heme, yaitu molekul berbentuk cincin pipih yang mengandung besi. Heme
merupakan gugus prostetik sejumlah enzim, antara lain katalase, peroksidase,
dan sitokrom oksidase.
b) Ko-enzim merupakan kofaktor yang terdiri atas molekul organik nonprotein yang
terikat renggang dengan enzim. Ko-enzim berfungsi untuk memindahkan gugus
kimia, atom, atau elektron dari satu enzim ke enzim yang lain. Contohnya, tiamin
pirofosfat, NAD, NADP+, dan asam tetrahidrofolat.
c) Ion-ion anorganik merupakan kofaktor yang terikat dengan enzim atau substrat
kompleks sehingga fungsi enzim lebih efektif. Contohnya, amilase dalam ludah
akan bekerja lebih baik dengan adanya ion klorida dan kalsium. Beberapa
kofaktor tidak berubah di akhir reaksi, tetapi kadang-kadang berubah dan terlibat
dalam reaksi yang lain. Enzim yang terikat dengan kofaktornya disebut
haloenzim.
• 2. Cara Kerja Enzim
• Enzim mengkatalis reaksi dengan cara meningkatkan laju reaksi. Enzim
meningkatkan laju reaksi dengan cara menurunkan energi aktivasi (energi yang
diperlukan untuk reaksi) dari EA1 menjadi EA2. (Lihat Gambar 2.4). Penurunan
energi aktivasi dilakukan dengan membentuk kompleks dengan substrat. Setelah
produk dihasilkan, kemudian enzim dilepaskan. Enzim bebas untuk membentuk
kompleks baru dengan substrat yang lain.
• Cara kerja enzim dapat dijelaskan dengan dua teori, yaitu teori
gembok dan anak kunci, dan teori kecocokan yang terinduksi.
2) Inhibitor nonkompetitif
• Inhibitor nonkompetitif adalah molekul penghambat enzim
yang bekerja dengan cara melekatkan diri pada luar sisi
aktif enzim. Sehingga, bentuk enzim berubah dan sisi aktif
enzimtidak dapat berfungsi. Hal ini menyebabkan substrat
tidak dapat masuk ke sisi aktif enzim. Penghambatan
inhibitor nonkompetitif bersifat tetap dan tidak dapat
dipengaruhi oleh konsentrasi substrat.
• Selain inhibitor, terdapat juga aktivator yang
mempengaruhi kerja enzim. Aktivator merupakan
molekul yang mempermudah enzim berikatan
dengan substratnya. Contohnya, ion klorida yang
berperan dalam aktivitas amilase dalam ludah.
KARBOHIDRAT
1. MONOSAKARIDA
- MONOSAKARIDA MERUPAKAN KARBOHIDRAT YG
PALING SEDERHANA.
- MONOSAKARIDA TIDAK DAPAT DIHIDROLISIS MENJADI
KARBOHIDRAT YG LEBIH SEDERHANA.
CONTOH: GLUKOSA(DEKSTROSA/GULA ANGGUR)
2. DISAKARIDA
DISAKARIDA MERUPAKAN KARBOHIDRAT YG MENGHASILKAN
2 MOLEKUL MONOSAKARIDA JIKA DIHIDROLISIS.
CONTOH ; SUKROSA(GULA TEBU,GULA PASIR)
CONTOH : MONOSAKARIDA
1.GLUKOSA (DEKSTROSA ATAU GULA ANGGUR)
terdapat pada: sayur,buah,sari pohon.
2.FRUKTOSA(LEVULOSA ATAU GULA BUAH)/GULA PALING
MANIS. Terdapat pada madu.
3.GALAKTOSA.Terdapat dalam tubuh sebagai hasil pencernaan
laktosa.
CONTOH: DISAKARIDA
1. SUKROSA (GULA TEBU)
2. MALTOSA Terdapat dalam tumbuhan dan biji2an.
3. LAKTOSA (GULA SUSU)
3. POLISAKARIDA
CONTOH;
- AMILUM(PATI)
* TERBENTUK 500 MOLEKUL MONOSAKARIDA
* TERDAPAT DALAM UMBI2AN
- GLIKOGEN
* TERBENTUK DARI 1000 MOLEKUL MONOSAKARIDA
* GLIKOGEN MERUPAKAN CADANGAN KARBOHIDRAT
PADA HEWAN.
- SELULOSA
* TERBENTUK DARI 1000-3000 MOLEKUL
MONOSAKARIDA
* MERUPAKAN BAGIAN UTAMA DARI DINDING SEL.
FUNGSI KARBOHIDRAT
H3C - C - C - OH
SELANJUTNYA ASAM PIRUVAT===DIUBAH MENJADI GAS CO 2 DAN AIR/ H2O
DENGAN MEMBEBASKAN=== SEJUMLAH ENERGI DALAM BENTUK MOLEKUL
BERENERGI TINGGI DAN PROSES INI TERJADI DALAM PROSES
RESPIRASI.MOLEKUL YG BERENERGI TINGGI INI DISEBUT: ATP (ADENOSIN
TRIFOSFAT)=== ENERGI INI DIGUNAKAN UNTUK KEPERLUAN AKTIFITAS HIDUP.
PERANAN ENZIM DAN KOENZIM DALAM METABOLISME
1. GLIKOLISIS
GLIKOLISIS ADALAH JALUR PERTAMA YG DIGUNAKAN GLUKOSA
UNTUK MENGHASILKAN ENERGI.
GLIKOLISIS:PEMECAHAN GLUKOSA MENJADI PIRUVAT MELALUI SUATU
RANTAI REAKSI YAITU;
1. GLIKOLISIS TERJADI DALAM SITOPLASMA DAN TIDAK
MEMBUTUHKAN OKSIGEN/ANAEROBIK UTK MENGHASILKAN ENERGI.
2. PEMECAHAN GLUKOSA YG MEMILIKI 6-C MENJADI 2 IKATAN YG
MASING2 MENGANDUNG 3-C YG DISEBUT PIRUVAT ATAU ASAM
PIRUVAT.
3. 2 IKATAN PIRUVAT BERGABUNG MEMBENTUK 2-PIRUVAT.
4. PEMECAHAN GLUKOSA MENJADI PIRUVAT MENGHASILKAN 6-8
ENERGI ATP YG AKAN DIGUNAKAN SEL SESUAI KEPERLUAN DALAM
BERBAGAI BENTUK ENERGI.CONTOH: ENERGI
KIMIA,MEKANIS,ELEKTRIS,TRANSMISI SARAF DAN OSMOTIS
5. JUMLAH ENERGI TOTAL DALAM GLIKOLISIS=6-8 ATP.
RANTAI REAKSI SEDERHANA GLIKOLISIS :
GLUKOSA
C-C-C-C-C-C
C-C-C C-C-C
energi
2- piruvat
C-C-C
C-C-C
2. PIRUVAT MENJADI ASETIL KO A
C-C-C
C-C-C
2-PIRUVAT
2 KoA
2 CO2
NADH NAD+
2 ADP 2 ATP
C-C-KoA
c-c-KoA
2 asetil KoA
dilanjutkan…..
KETERANGAN PIRUVAT MENJADI ASETIL KoA SBB:
KE OTOT
METABOLISME
ANAEROB DI
DLM OTOT
PIRUVAT ===== SIMPANAN GLIKOGEN
GLUKOSA
ENERGI
KETERANGAN SIKLUS CORI
1. BILA OKSIGEN SEDIKIT MAKA PIRUVAT AKAN DIUBAH MENJADI ASAM LAKTAT
INI TERJADI PADA OTOT YG TIBA2 BERKONTRAKSI KUAT. CONTOHNYA KERJA
BERAT.
Asetil KoA
c-c-KoA
Oksaloasetat(c-c-c-c) Sitrat(c-c-c-c-c-c)
Siklus TCA
NADH
NADH
CO2
GTP
CO2 NADH
FADH2
KETERANGAN SIKLUS TCA / KREBS
H2
FMN REDUKSI
NADH
O2
FLAVOPROTIEN
SITOKROM
NAD H2 O
FMNH2 OKSIDASI
ENERGI ENERGI
RTE HANNYA DAPAT BERJALAN DLM SUASANA AEROBIK.KARENA NADH DAN FADH 2
HANNYA DAPAT DI UBAH MENJADI NAD DAN FAD MELALUI PEMINDAHAN
ELEKTRONNYA KE OKSIGEN.
ENERGI TOTAL YG DI HASILKAN DARI SATU MOLEKUL GLUKOSA DLM METABOLISME GLUKOSA
H adanya ion OH
akan bereaksi dgn H2CO3 OH
CO2
Adanya asam akan untuk menjaga agar kadar H2CO3
Bereaksi dgn ion HCO3 dalam darah tetap,maka diubah mjd
CO2 dan dibuang oleh paru2
SISTEM PENYANGGA FOSFAT
ASAM AMINO TERDIRI ATAS ATOM KARBON YG TERIKAT SATU GUGUS KARBOKSIL(-
COOH),SATU GUGUS AMINO(-NH2),SATU ATOM HIDROGEN (-H) DAN SATU
GUGUS RADIKAL(-R) ATAU RANTAI CABANG.ATAU
H C R (GUGUS RADIKAL)
- SIMPANAN LEMAK.
SIMPANAN LEMAK DALAM TUBUH TERUTAMA DILAKUKAN DIDALAM
SEL LEMAK DALAM JARINGAN ADIPOSA.
SEL2 ADIPOSA MEMPUNYAI ENZIM KHUSUS PADA PERMUKAANNYA
YAITU LIPOPROTEIN LIPASE(LPL) YG DAPAT MELEPAS TRIGLISERIDA DAN
LIPOPROTEIN,MENGHIDROLISISNYA DAN MENERUSKAN HASIL
HIDROLISIS KEDALAM SEL.DIDALAM SEL TERDAPAT ENZIM LAIN YG
MERAKIT KEMBALI BAHAN2 HASIL HIDROLISIS MENJADI TRIGLISERIDA
UNTUK DISIMPAN SEBAGAI CADANGAN ENERGI.
PENGGUNAAN LEMAK UNTUK ENERGI
ALIRAN DARAH
AMONIAK (NH3)
+ HATI
CO2
UREUM
UREUM
ALIRAN DARAH
UREUM
GINJAL